3GNIB

Structure of strad and mo25
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
388
structure length
304
Chain Sequence
AHHHHHHMENLYFQSSFLPEGGCYELLTVIGKGFEDLMTVNLARYKPTGEYVTVRRINLEACSNEMVTFLQGELHVSKLFNHPNIVPYRATFIADNELWVVTSFMAYGSAKDLICTHFMDGMNELAIAYILQGVLKALDYIHHMGYVHRSVKASHILISVDGKVYLSGLRSNLSMISHGQRQRVVHDFPKYSVKVLPWLSPEVLQQNLQGYDAKSDIYSVGITACELANGHVPFKDMPATQMLLEKFSPHFHHFVEQCLQRNPDARPSASTLLNHSFFKQIASEALPELLRPVTPITEVDDWEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Signaling protein/signaling protein
molecule keywords Protein Mo25
publication title ATP and MO25alpha regulate the conformational state of the STRADalpha pseudokinase and activation of the LKB1 tumour suppressor
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 304
sequence length 388
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3gniB02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3gniB01
2W1GA 3AT4A 4JX7A 4TYGA 2VRXA 4II5A 3FQSA 3HKOA 4NCTC 3CGFA 3RCJA 4IC8A 2Z8CA 3OXTA 3GB2A 4K9YA 4L53A 3G15A 4QMUA 4U40A 5M09A 4JR3A 1TQIA 4N0SA 4CFXA 5CLPA 2OFVA 3HA8A 4QP1A 2X9EA 3COIA 2PVLA 4G5JA 4J52A 4E1ZA 3QKKA 2ZM4A 1EH4A 4O38A 4PPBA 3ZRMA 4DTKA 3QA8A 4ERKA 2XYUA 4O7SA 4L46A 3MV5A 3R04A 3ERKA 5L6PA 3ORPA 4EH3A 3NYOA 4O2ZA 4E6CA 5J9LA 1VR2A 4LGHA 2DYLA 2O64A 3V6SA 3EYGA 3R22A 4TNDA 2R7IA 3QGWA 3UPXA 1JPAA 3TXOA 3P9JA 5BVFA 4FZFB 5CNOA 3KB7A 4TXCA 4G6OA 2XNNA 4YTHA 3FHIA 1R78A 4QP3A 4EOMA 4O84A 2FUMA 3D94A 1M17A 3BRBA 4BTKA 4GUBA 2OICA 1J7IA 1R0PA 4QTBA 1E1VA 4RRVA 4I4FA 4CRLA 4HGEA 4ENXA 1I09A 3RNIA 1ZYLA 3LHJA 1JKLA 2WTKC 3UIXA 1HCLA 4I0SA 3RGFA 3G33A 1ZXEA 4ITHA 5FBOA 4G17A 4IWOA 4OTDA 4EWHA 5IEXA 3CPBA 4FTJA 1Q24A 3Q6WA 2GQSA 1DAYA 3AC4A 3Q3BA 3OCSA 3ZRKA 1Q61A 3MH0A 4FT0A 4AZSA 5HG5A 1Y6AA 4PRJA 4TWOA 5AUXA 5JZNA 3LFFA 4YC8A 4EL9A 2PWLA 2RFSA 4FOBA 2J4ZA 3KXNA 4FGBA 4LMUA 3QGYA 3MH1A 4IB0A 5F94A 3MVMA 3V3VA 3AT2A 3R2BA 1H07A 3OEFX 4GS6A 4NM0A 3A99A 3K3IA 4IX4A 2W7XA 4JQEA 3I79A 4ZTMA 4AA0A 4GYIA 2YCSA 3NR9A 4JT3A 2VTAA 4PTGA 4R7HA 4RQKA 4JI9A 3U9CA 5LVPA 4BIDA 2R3PA 5JQ5A 2XM8A 2HAKA 3EQRA 4QMNA 3E8NA 2FH9A 4QQ5A 3VVHA 4C3PA 4IM3A 5DEWA 5IA5A 5HLNA 4F4PA 3EOCA 3D9VA 4EOSA 1VJYA 3I1AA 3IS5A 4C4HA 3G90X 4BYIA 4BKYA 1LP4A 4B8MA 4JR7A 3QQUA 3QX2A 4IC7A 3VW8A 5CU2A 5J1VA 1TQMA 4H3PA 4A07A 4QMXA 4Y5QA 5BX0A 4IZYA 3RTPA 4YJOA 3UOJA 1YXVA 4M66A 2VO3A 5IH4A 4M15A 4RLKA 3O51A 3C4WA 3R00A 5JGDA 5A4EA 2O63A 2QO2A 3VS1A 3GBZA 4HVGA 1GIIA 4BWPA 4RG0A 2ITNA 3VF9A 4HZRA 4JBOA 4ASXA 2XKFA 4KD1A 1BYGA 2JD5A 2XZSA 4ACMA 4F6UA 2PZRA 3W2OA 4IAYA 3QRIA 2PE2A 4QQTA 4APCA 4L3PA 4O27B 3BLHA 2P2HA 4R5YA 3RAIA 3NWWA 4HGTA 2OJIA 4QMWA 5EYKA 3C7QA 3PWDA 3PXZA 3ZZWA 2CN8A 4AS0A 5BVDA 3DOGA 3AC8A 4EH8A 3SXRA 5L2WA 1URWA 3WF5A 4RC3A 4J71A 4L8MA 5HNGA 4AGUA 3NZ0A 4AU8A 1OIRA 2QVSE 2XNMA 3FKNA 5L8JA 1WCCA 4IX6A 3RM7A 4A9SA 2R2PA 2WTVA 2ITWA 2IW9A 2RL5A 2I7QA 3TKHA 3MB6A 3UVRA 2VX3A 4CSVA 4KUJA 3MW1A 1Q8UA 3WE8A 1STCE 4KABA 5A3XA 4HVSA 4XNEA 4U80A 5FEQA 4RA5A 1IR3A 3LPBA 5CF4A 5IQHA 1H8FA 4FIGA 2XRWA 2Q0NA 5DYJA 3R71A 5IMEA 2GHGA 3Q4CA 5DT4A 5GJGA 3WYYA 2GSFA 4RMZA 4L44A 1J3HA 2C69A 2WTDA 3OY1A 5HESA 2BZJA 2IVSA 5FTQA 3CSVA 4WG3A 2BHHA 1KE8A 4IM2A 3DS6A 3TV7A 2CDZA 1T45A 4NFMA 4XG3A 5C27A 3F66A 5FGKA 4IWPA 3QRUA 1F0QA 5HVYA 4C4IA 3FEGA 5GINE 4TYJA 3D7TA 2C5VA 3TEIA 2JAMA 4MQ2A 3ZH8A 4GVAA 3DB8A 3W10A 4DBNA 2CGWA 3R21A 1X8BA 3QTIA 5HNIX 4EJ7A 1L8TA 2R3NA 2WEVA 2BKZA 4OT5A 3UC4A 4JX3A 3C5IA 5E91A 4O7RA 4EC8A 3ZS5A 2X4FA 4F9AA 1B6CB 4RGJA 5IA4A 4O83A 2UZOA 3R6XA 4IJPA 4AW5A 3MH3A 5AJQA 4X21A 3HMIA 4ZAUA 3O23A 5EQPA 3I5NA 3OOMA 3H0YA 4NT4A 4TWPA 4G16A 3BCEA 3DAJA 3FSFA 3LFCA 3WI6A 4UXQA 4D5KA 1H24A 2J0IA 4YTIA 4D2VA 4YSJA 5CU0A 3NNWA 4BCKA 2J51A 5HU3A 5DEYA 3QTRA 5AP6A 4MBLA 2CPKE 3EQFA 3HL7A 3MY1A 2AC5A 4XX9A 4M0YA 3TV4A 4FV6A 3COMA 3OWPA 4CCBA 4YJRA 3ZFXA 4CRSA 5CXZA 4GT5A 4BTFA 3QL8A 4GG5A 3DZOA 3KXGA 5HZNA 3NUYA 3DNDA 3FQHA 4WD5A 3DTCA 2ZV7A 4NM5A 4I92A 3JXWA 1OL7A 2E9PA 3BYVA 2VTNA 3NGAA 4DEGA 3Q52A 1CKJA 1GIJA 2C0TA 4X2NA 2HIWA 3IGOA 3IW6A 3ZYAA 3HGKA 5JFXA 3A61A 2XK3A 3K3JA 1YHVA 4FSWA 1GZ8A 3EJ1A 2C6DA 4FTIA 5EYCA 4OTIA 3QTZA 4OR5A 3P7BA 4FSNA 3SV0A 3C4CA 4GJ3A 3ZO3A 5CEMA 4F0IA 5BQ0A 4JG6A 4GIHA 4FKQA 4U44A 4Q5HA 2EB2A 1PMUA 4JAIA 4ENYA 4QP7A 3MIAA 4I21A 4IW0A 4O7ZA 4IDTA 2V7AA 4J96A 2R3QA 1QCFA 4MVFA 2C3LA 4YO6A 3N4VA 4NJ3A 3E3BX 2YM3A 3BU6A 3BQCA 2WIHA 5KKRB 1YWVA 4G6LA 4IB5A 4LI5A 3UMXA 2YISA 4NEUA 2XIXA 4F0FA 5J7HA 3QCQA 4V01A 4MBIA 3FWQA 3KRJA 3E87A 3LCSA 3GT8A 3TJDA 4F6SA 4K18A 3IOPA 3I81A 4XP2A 4E3CA 2X8EA 2R64A 4LL0A 3C4XA 2BROA 3NW6A 2ZDTA 3ACKA 2J7TA 3QU0A 3I0OA 4O7NA 3ORIA 3WZEA 2WMSA 1UVRA 3GCSA 3R02A 4UALA 4ERWA 5I9YA 4YZ9A 5ANIA 2BDWA 4C2WA 5HCXA 2XIRA 1O6KA 4DG0E 3LCKA 2O2UA 3C4FA 2XNOA 4S34A 4I24A 4ZLZA 5AR3A 4X2JA 1PKDA 4LV8A 4XV1A 1A48A 3ZM9A 3LM0A 1KSWA 4TT7A 3H30A 4EHZA 3ET7A 3VQUA 3L9MA 5J5SA 2W1CA 5CQUA 4O86A 3QXPA 2YFXA 3D5UA 4DFNA 3TDVA 1PF8A 2OWBA 2XYNA 3P86A 4XHKB 3HUCA 3T3UA 5M4FA 2R3MA 4C61A 5DN3A 2OFUA 4UMQA 3CQUA 3PXQA 4RFZA 5EW9A 4ZTLA 4ARKA 1PMVA 3AC2A 2XK4A 2QODA 4ZTRA 5AMNA 4Z9LA 4F7LA 4WUAA 4JDKA 2REIA 4GU9A 3R2YA 2O5KA 2OU7A 4KS8A 3W55A 4CFNA 2R3RA 3G9NA 5HKMA 3MY0A 3UPZA 3KMWA 3OW4A 2HZ0A 5M44A 5HG8A 4ACGA 3D7TB 1GZNA 5JRSA 1YW2A 3KF4A 4O0YA 2R3KA 3GI3A 3KCFA 3R9NA 3KFAA 4PPAA 5I3RA 4JLCA 5CAUA 4RWIA 5ANEA 3F82A 2PMNX 4UWBA 3R30A 5C03A 2HY0A 2PUPA 4A4XA 1HCKA 2CN5A 3P79A 3CTHA 4U8ZA 4D2TA 1YXXA 5IZFA 2YAAA 3FYJX 4O0WA 4UMRA 3FZ1A 4CVAA 4O7WA 3ZFMA 4XG7A 3KF7A 1F5QA 3FLZA 5AAEA 2VGOA 3VS6A 5FM2A 3C0GA 4FT3A 4YURA 2CSNA 1PYEA 3KQ7A 3MJ1A 2UW6A 5DRDA 3RPOA 3E8DA 4RPVA 4KBAA 3WF9A 3DBCA 3KU2A 4JDJA 4AN3A 4CFMA 2QOLA 5CX9A 2EU9A 5AAGA 2B9FA 4MXAA 4OAUC 2QO7A 5JFVA 2OI4X 4OW8A 4IAZA 5CEIA 4YHFA 4MXYA 1JSUA 4GG7A 4CYIA 3QTQA 4ZTHA 4QP6A 1HOWA 3I7BA 1QPJA 3I60A 3K5UA 5JFSA 3O7LD 4QMOA 3ULIA 4QTAA 4FEWA 3DBFA 5KZIA 3MB7A 2PVHA 5CNNA 4BWXA 1LEWA 5CU6A 2F7EE 4IM0A 4PQNA 3CD3A 3DBQA 3GC8A 4TYIA 4LOPA 2ETRA 4F70A 3Q9XA 4W8DA 5HIBA 3D5VA 4XV3A 2UW8A 3DGKA 4ZZNA 5B2LA 2I40A 2C6OA 4B4LA 4ZMEA 2B9HA 3KVXA 3LCTA 4WNMA 4ZSJA 2BRNA 3U51A 4FOCA 2B1PA 4JL9A 4KBKA 3Q96A 5CAOA 3D5WA 5HTBA 4W9WA 2X2KA 3LLTA 2UVYA 3Q5IA 2IPXA 2VX1A 2W0JA 4AN2A 3SRVA 5BVWA 3COKA 3E93A 1FGIA 4XV2A 3R7OA 3SC1A 2OIQA 3IONA 5JZJA 2UZEA 1U4DA 5A54A 3ZSHA 2W1EA 5IQEA 4YZNA 4RIYA 2C1BA 4DG2E 3H3CA 3E8CA 3VULA 2BRBA 4YMJA 4KIQA 4U6RA 5FXSA 3AD6A 3R7GA 4ZLOA 1PXJA 2B9IA 3UZPA 3QYZA 4IZAA 3GU8A 4R6VA 4NUSA 3NNVA 1DAWA 4KKEA 2BVAA 4K0YA 3ZUUA 2CGVA 1Q8TA 3F5GA 4FTTA 4X6QC 4DG3E 3FPMA 3EFKA 2ZV8A 1XH7A 3PY1A 4PY1A 1IAHA 5LMKC 3ITZA 1TQPA 3EQDA 3LFEA 5AX9A 3TIYA 5DFPA 2ZM3A 3CY3A 4FV3A 4EONA 2HZIA 2C30A 4YPDA 2Z7RA 3KULA 2PZIA 3BGZA 3KK9A 4FV8A 4F1OA 3QTUA 5A4CA 2Z7QA 2RIOA 3L9PA 2YWVA 2QOCA 5DT3A 4FTQA 3CTJA 3FYKX 2GDOA 5TT7A 4IADA 4C8BA 5LJJA 4D9UA 3RK7A 4KRCA 3SGCA 1J1CA 1QPEA 1O6LA 4IB3A 4AZEA 4O81A 4DC2A 3O96A 3U55A 5KMLA 1CM8A 4XBRA 5KMIA 2ITOA 4RJ5A 4R1YA 5ITAA 4Y46A 4L43A 3OHTA 3OEZA 5AUVA 3KMUA 3L9LA 4CKRA 3OG7A 1E9HA 4ZZOA 4F9CA 4USEA 3FLWA 2J5EA 5K3YA 5E9EA 3ODZX 2YIQA 1KE7A 1PXOA 3LZBA 5I9XA 3F7ZA 2W1DA 1L3RE 3DKGA 2BPMA 4FTOA 4C58A 4UXLA 1LEZA 3SVVA 5LVMA 2WTIA 5JT2A 3QYWA 1QPCA 4DT8A 1OB3A 3LMIA 4N70A 5B2KA 1Y8YA 3BYUA 2EVAA 1WVXA 4DH8A 2W1FA 2VWXA 4PTEA 4M69A 3UVPA 3VBVA 3UYSA 4NU1A 2C6TA 4EEVA 3OBJA 3FZTA 3L8XA 3FC1X 2P55A 2A1AB 2HZNA 5M4IA 1IA8A 4J95A 3WZUA 4WNKA 4NM3A 5IISA 4TNBA 4JRNA 4V04A 3NPCA 1JLUE 2JBPA 4KIPA 2CKOA 5BPYA 2BRMA 3C1XA 3QCSA 4NSTA 2A4LA 3FKOA 1M2QA 3KXMA 1WMKA 1OGUA 1OKVA 4YJTA 3NUUA 4BC6A 1P2AA 3T8OA 3CQEA 5HCYA 2PVJA 3KRLA 3LXLA 3ORLA 4ORKA 3TG1A 2JKQA 1PJKA 4FT7A 3POOA 5IA2A 3EWHA 3SHEA 4O82A 3EMGA 1Q8ZA 4J98A 5HU9A 2OZOA 4FR4A 2BAJA 3DV3A 4XJ0A 5DR6A 4CT1A 3CR0A 4JG8A 1XH5A 4GSBA 4RSSA 4TZRA 4XG2A 4FKVA 1CSNA 4PNIA 4O21A 5FP6A 1MRYA 4HJOA 5EHLA 4DGLC 4GV1A 2WGJA 3KKVA 3IGGA 4ZK5A 5IQIA 1T46A 2VWUA 2Z2WA 2YWPA 5JQ8A 4IB1A 4W8EA 2OGVA 1ZOHA 2EB3A 3GFEA 2JFMA 3JY9A 4IFGA 2J2IB 3PA5A 4KNBA 1PXPA 3ZFYA 1CDKA 2I1MA 3RM6A 3EN5A 5EM5A 3A7HA 3LQ5A 3V5PA 4HGSA 3ZU7A 2ZYBA 2VU3A 2WD1A 3E8EA 3QZFA 4ZS4A 1CTPE 3RP9A 2EWAA 4EK4A 5E8WA 1XBBA 3SRVB 3OROA 3QQHA 3FJQE 3VS3A 4E4LA 1NW1A 2IZUA 5CU4A 1Q62A 3E7OA 2RFNA 3IK3A 3TTJA 4E6QA 4EKKA 3UE4A 1XH4A 4RIYB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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