3GNNA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from burkholderi pseudomallei
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
292
structure length
266
Chain Sequence
TIDAVSPLFADISREYGAAFDAAIARNVADALAEDVGSGLVPDGAPRRARVIVREDAVLCGVPWFDAVVRAVDPSIEVDWRHREGDRMSADSTVCELRGPARALLTAERNALNFLQLLSGVASATRQYVDRIADTRARILDTRKTLPGLRLAQKYAVRVGGGANQGVGEALDAAFALNVPVQIEVETLDQLRTALAHGARSVLLDNFTLDMMRDAVRVTEGRAVLEVSGGVNFDTVRAIAETGVDRISIGALTKDVRATDYSMRIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Burkholderi pseudomallei
rcsb
source organism Burkholderia pseudomallei
total genus 91
structure length 266
sequence length 292
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-03-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gnnA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3gnnA01
4JX5A 5HJLA 1KFBA 1KLYA 5FEXA 3P8IA 2AGKA 4BWLC 4WY0A 4FIQA 4OHQA 1W8SA 3TAKA 3QQ1A 2E5DA 3BLEA 2G95A 1XCFA 4MY8A 3I65A 3A9IA 1TPFA 3CB8A 4R33A 1I2QA 2QJHA 4AWTA 5I3FA 1LROA 1GVOA 1TTJA 3FKRA 1W5QA 4O13A 3V1PA 4LS1A 2J27A 1BWKA 4JEQA 2BZNA 4H3DA 3ABRA 1PHQA 1SUXA 4K6AA 2D73A 2XFWA 3NQFA 3S6DA 2CU0A 4OWGA 3KVJA 1VC4A 2R14A 4FNUA 1F74A 3L5LA 5KSWA 1GTHA 3DFPA 5EPDA 3G3MA 5FF3A 2X2GA 5AYYA 1SZNA 4YCPA 4O12A 1YDVA 3BW2A 1A5AA 4Z0JA 2DZUA 3MHUA 3KFTA 4TMCA 1SZEA 1U5JA 1OFQA 4DPPA 2C14A 3P7YA 2CLFA 5F4XA 2V2CA 5H2ZA 4NVTA 3W1LA 1HL2A 1WXJA 3NQVA 3W1QA 3LCXA 3CHVA 4NJJA 2C1HA 3O8AA 1TB3A 2GUUA 4UNKA 1I2PA 1EIXA 3HGSA 4DF1A 4QIUA 4OV9A 3R89A 1O5KA 3O63A 1LZOA 4UTIA 4LVBA 2V0TA 3G1VA 4N9BA 3BLFA 4K7YA 4CNNA 4FX7A 3T78A 2O7QA 4NT0A 4LUJA 4LV9A 1W5OA 4LNYA 2BX7A 3W1UA 2R91A 4O1DA 2GOUA 1RVGA 4FNPA 3EKLA 3GR8A 1HO1A 5L9FA 3SSJA 3STGA 4EWND 3E9AA 3VNDA 1EB3A 1GZGA 4B5NA 1I2NA 3QMSA 1T99A 1OYCA 4IX0A 1Z42A 3CWOX 4O0KA 3B8DA 3GLCA 3LBMA 1B3OA 1TRIA 3W7PA 3KOFA 3RNDA 3PBYA 4QISA 2CLKA 3IVUA 3S8HA 2WO5A 4HSNA 4RZ4A 4O8RA 2WKJA 5K9DA 3W1NA 2QCCA 1RPXA 3NNTA 4X9SA 3UYCA 3HF3A 3U8GA 4NJGA 2QJGA 3I7RA 3MMTA 3FFSA 4M6QA 4RZ5A 4Z1CA 3MWAA 4CCEA 4JGDA 1NFBA 2FFCA 4UFIA 1AG1O 2DZWA 3W1RA 4M7SA 4DPQA 3HPXA 3RLVA 2X30A 4JTKA 3FKKA 1LOLA 2NX9A 3RU6A 3S1XA 1QR7A 1W5MA 2J9XA 5D32A 2PRMA 3NL6A 2A7PA 4UXDA 1YPIA 4CNPA 2YZRA 3ABSA 1UBSA 3CEPA 3P84A 3BVJA 1SFLA 3IIPA 2H3DA 4JYFA 5F2LA 3W83A 3HMJG 4JY9A 1JUBA 1ONRA 4DF0A 4Z1AA 4UMAA 3F1QA 2WV8A 5D09A 4DELA 4MY1A 3M7WA 5IBXA 2F7FA 1TIMA 4JDBA 4IGHA 3W88A 5SWUA 2R8WA 4WY0F 4LVAA 5AHFA 3HIJA 2V5BA 2ALDA 1GG0A 4MLJA 2QCHA 3S0CA 1VYPX 3NAVA 4HIBA 1W54A 4H6KA 4GJ1A 3YPIA 3GNNA 2ISSA 1SW3A 4ADTA 8TIMA 4EVZA 2Q8ZA 3O15A 4FXSA 4ZMGA 4KFNA 4Q4KA 1EPXA 5LNUA 3NG3A 1QPNA 4WD0A 5U4NA 3SGZA 3IIZA 1NF0A 1G6CA 2ZZ4A 5AYZA 3TC6A 2GVLA 1N8FA 1FQ0A 1GYNA 1S5TA 2VENA 5HMSA 4YMZA 3FA5A 4WOZA 4UTTA 3O16A 4NJKA 3Q58A 4I7VA 4HSOA 3IIXA 5F4SA 2JGYA 4K37A 3O1NA 2AAMA 3UWZA 4BI5A 4RCXA 3RFAA 3FLUA 4OQVA 3ZFHA 3LHZA 4TIMA 1LLWA 2CZDA 3TX9A 4DEFA 2A5HA 3LTSA 4E2DA 4EOUA 1KM6A 5K9XA 2QDGA 3W7JA 3L9CA 2PCQA 4O15A 1YADA 3P74A 3W2KA 1TPB1 4TO8A 3W1XA 3INPA 3B4UA 3O6DA 2IQTA 4GUHA 1T96A 2FJKA 2NWSA 5U7SA 1WAUA 1WOAA 4Z1BA 4IMEA 1UB3A 1H7RA 1TSIA 3P67A 3HGRA 1WDWA 3TJLA 2Z6IA 1X7FA 1M6JA 4QM1A 3NM3A 3SR7A 1FCVA 2ATSA 1F73A 2HS8A 4WQ6A 1ICPA 4MZ1A 3L0NA 3W87A 3M5XA 4RJEA 3L67A 3TA6A 3C2EA 1OF8A 3TQKA 3LB0A 1NSJA 4OT7A 1K7EA 1FDJA 3TJXA 4O17A 2FB2A 3UXDA 1I8JA 3NQCA 3N3MA 5CPLA 4LC6A 3N14A 2B4GA 3FEMA 2Y89A 1LOQA 4LS2A 2X1RA 1S5WA 1JJKA 1PE1A 3MW7A 4R53A 5D04C 1HUVA 3LCFA 4PL2A 4UTWA 3TW7A 5K9CA 3Q37A 1AL7A 3C2VA 4UTJA 2GVGA 1JR1A 2FLIA 2RH9A 5LNRA 4NU7A 1HO4A 5AHNA 4O11A 1B9BA 1H50A 4UC5A 2QR6A 4CLMA 4JIPA 1GOXA 5KMYA 4UR7A 5CPNA 4LVDA 3BARA 4M7TA 5T26A 3C61A 2QCMA 1FX6A 1KM2A 1EWEA 3QH2A 3HQ1A 3DFSA 2CZ5A 3K30A 4LWWA 3S1VA 2EGZA 5AN7A 3CU2A 1HG3A 5HWMA 3UQNA 2P1FA 2E77A 2TMDA 3PG8A 1DQWA 5BRBA 1G7UA 1J2WA 2XN1A 1EA0A 3NZ1A 3G3DA 3TSBA 3PS7A 2WNNA 1KV5A 1X8FA 2HMCA 3WK2A 4O16A 4NX5A 1VYRA 5E93A 3G1HA 3OHIA 5F1VA 3UNDA 4JXCA 3W72A 3AJXA 2VFDA 4HNVA 4IMGA 5D37A 4ZQRA 3HPZA 3TXZA 1Q6QA 3MUXA 1JULA 1C8VA 3GYEA 4FIRA 3IGUA 2VELA 1SPQA 4CQ9A 4CQ8A 5I3JA 2QUVA 5D33A 3TV8A 3NQ2A 4HN4A 3I6RA 4AF0B 2Y61A 1GVSA 4UMBA 3RMJA 3VI2A 3L5MA 3KRUA 1H7XA 1SO5A 1WBJA 1DV7A 1J5TA 4U28A 3C3NA 4GWEA 5G1YA 4O0ZA 2VXNA 3N73A 4MJMA 3EWYA 1W3TA 3WFAA 2FB3A 5D2WA 1FCBA 5K7JA 1GG1A 3GAKA 1OFEA 4JR5A 3IGSA 3HOJA 4GC4A 4OBTA 1LRNA 4CQAA 1OX5A 3EX4A 3L68A 3EXSA 3ANYA 1WA3A 3CC1A 3L65A 1VCGA 5F1UA 3ABQA 1ICSA 1TCDA 3LOTA 3G0XA 3W1TA 4DO6A 4GNJA 2QKFA 2JKPA 5D2TA 1OFDA 2C18A 3TE9A 1XXXA 3O06A 1PIIA 3PF3A 3M41A 2Y63A 1YDOA 5FEWA 4O52A 3LCWA 3F4WA 3MYPA 2YX0A 3TQ0A 4EIVA 3NQEA 2XN2A 1GVQA 3KVMA 2OMAA 1GQNA 2CLMA 3PM6A 1FDYA 3WJYA 3ATYA 4IMFA 1K3UA 1TTIA 2B7QA 2EF9A 4AVFA 5D02A 4JX6A 2NX3A 2V82A 3B0PA 5LNWA 1ZAIA 3R8RA 1L6WA 2ISWA 3BGGA 3O6YX 4I7WA 3S5OA 3OEXA 4X3ZA 4UFKA 3V75A 4MYAA 4I7UA 4JTEA 1ZHAA 2ZCGA 4AWSA 1O94A 4FEZA 3FS2A 3WK0A 3QPYA 2V30A 3A5FA 1GEQA 2E6FA 3WK3A 3GNDA 1PS9A 2J9ZA 2J9YA 1LLZA 5G2HA 1IIGA 4M6PA 1UCWA 4O28A 3BLIA 4MIMA 3G22A 2DJXA 1XBXA 4J9JA 3DU0A 2GQ8A 3W7QA 3ABOA 2I14A 1XBZA 4Q32A 4JX4A 1WOBA 3EX2A 3I68A 4MZ8A 3G0UA 1AW1A 5AC8A 2DZXA 1GPWA 1TPDA 3TMLA 2VOMA 3W2UA 4JTSA 2Y7EA 3DHFA 1BKSA 1PHWA 1O60A 5HR7A 4JTTA 1Q6RA 3B04A 4DO4A 3TXVA 3TQVA 1IGSA 3E96A 3QM3A 3KXQA 3TR2A 1ZAHA 4GRSA 1UASA 4UCGA 4HPJA 4UTHA 4FXRA 1Y0EA 3QPZA 3S5YA 3OVRA 3LLFA 4ZZ9A 2Y6ZA 3A24A 3W70A 3OIXA 3TK7A 1GWJA 4RKAA 3GIYA 1EUNA 2GVJA 2HSAA 4O1AA 4LVFA 4TU1A 3RF9A 3QW3A 1G69A 1T0OA 1F6PA 5LZLA 1H61A 3PUOA 5CSSA 1G67A 3M6YA 4FX8A 5J5RA 1JUKA 2YFOA 4MKNA 1MXSA 3QRHA 4CCCA 4S1FA 1FWSA 1YTEA 1ZY9A 3NQMA 5CZJA 5FF2A 1CW2A 3C2FA 2QCLA 4HT3A 2G97A 3O05A 3Q94A 3QC3A 3O6CA 4NX0A 2Y62A 3M5ZA 3HGJA 4BI7A 1ML1A 3SFKA 1G4TA 2PURA 5HULA 5GVJA 1P5BA 1P0NA 3R12A 5LGXA 3VCRA 2A85A 2YSWA 1ZJIA 2YFNA 2ZRUA 2VEMA 2B7PA 1I2RA 5F4WA 1LTDA 4O19A 4XTDA 2DZVA 2ATMA 3W2NA 2X16A 4KWVA 1WV2A 3MI3A 3T55A 2NV2A 2C19A 2NLIA 2OT0A 5C2XA 3HPSA 5J5DA 1KM4A 3NEVA 3M0ZA 3EB2A 4N02A 5BNKA 4O53A 1Z41A 3LRKA 3TMQA 3CQ0A 2ZA2A 5FESA 1TRDA 3VE7A 3OA3A 1F5ZA 3G1YA 4NZJA 3GDLA 5DBUA 3SW6A 2Q3RA 4LS0A 1FDZA 5LGZA 1K8XA 1OK6A 5BOOA 4PTNA 3L5AA 1FWNA 3A21A 1H7NA 4UTTC 5MHBA 5KITA 1QAPA 2GPTA 3DI1A 3NQAA 4M19A 3PBVA 1W56A 4I9AA 1DORA 5EYWA 2NWRA 3SZ8A 5DN1A 3B05A 1QMLA 1ADOA 3P5YA 2RHGA 3PUDA 3DZ1A 3LTPA 3N2XA 3RLUA 3W71A 3STFA 4IOTA 1I45A 2OJPA 1F76A 1G4SA 2FDSA 1VRDA 1GTEA 1ALDA 4RX0A 2ZRYA 2A4AA 2HS6A 3C56A 5HUPA 4YWIA 3PBWA 3DAQA 1OG0A 3I7SA 1THFD 1XBVA 3LTYA 4NXSA 2ABBA 1J4EA 2LLEA 3M1ZA 1R2SA 1JCNA 2CFFA 4LRSA 4E38A 3PY2A 3G1DA 2X1TA 4KWWA 3NL2A 1VHNA 3HG2A 1A53A 5K2ZA 2GJLA 2CW6A 4AH7A 1F2JA 5ABTA 4O4VA 1SO3A 2ZFAA 2JK2A 1NVMA 4N9DA 1Z44A 2PRHA 2TSYA 4Y8FA 3P82A 3B03A 3PULA 1V5XA 3HB9A 2YDAA 4NNCA 1OJXA 3PG9A 1X1OA 2ZTJA 2HTMA 5H91A 5EBUA 3PSVA 3Q2DA 1KTNA 2V5LA 2FPVA 3W7OA 5KZDA 4O14A 3UY7A 1TPUA 3NPWA 3PUEA 3M5VA 5KINA 4JYDA 4JTUA 2YR1A 2A1YA 3OVQA 3BV4A 3G1FA 1NEYA 4M6VA 1TPC1 3T44A 3FYPA 4KFPA 4OE7A 3W1PA 2BXVA 2V81A 3W1MA 4NXKA 1KFEA 3KRZA 4DF2A 4BFAA 4TMBA 4ZQPA 3CIXA 3ZWTA 2Y88A 1SW7A 5AFDA 1VZWA 1XM3A 2CLIA 2VEKA 1YDNA 2ZRVA 2E1DA 1RV8A 4MJZA 1JRCA 5AOUA 4HNTA 1SO4A 5DLCA 3GDRA 1K8YA 3L2IA 2H8ZA 4Y9AA 4K38A 4X22A 3W7HA 4GFSA 5E1QA 4MZYA 3STEA 2GJNA 3GR7A 3G0SA 3TKFA 3QSTA 2VFFA 2WPBA 1W31A 1R46A 1VHCA 5I3KA 4Z08A 1ME9A 1H1ZA 1MEIA 1VCVA 2ISVA 4IPJA 1UUMA 1TTPA 2Z6JA 3GB6A 4G1KA 3LERA 3LI0A 2YYTA 3D0CA 3JRKA 4JY8A 3W76A 3LHYA 4WXZA 4O54A 5EMUA 4QJ1A 1OX4B 2RDWA 2WNZA 5DBTA 2EHHA 4ADUA 4PCFA 2X1UA 4NUWA 3M5YA 3T40A 5K4ZA 3ATZA 4AAJA 5FF7A 4N4PA 1DQXA 1B4EA 3GZ3A 1WX0A 1AL8A 5DXXA 3TROA 4GUFA 2A21A 3JS3A 4Y96A 3GXPA 1H62A 3NQDA 2EAWA 1K7FA 2ZRXA 4X2RA 3H54A 1XI3A 1JCXA 4MLRA 7TIMA 2CLOA 3H53A 2Z1BA 1M7OA 2NXIA 1W0MA 3FYOA 1WYIA 5AHEA 1YXDA 1VR6A 5EL1A 3T4CA 1ME7A 3STCA 3LXCA 2BLEA 1JQVA 5FEZA 4TR9A 3SGUA 3BG9A 3ZS4A 2DP3A 3BPWA 4RZ6A 4ORMA 4BI6A 4NNAA 4XKYB 2J24A 1PVNA 5HWNA 3GDMA 1JRBA 4Q33A 3GXNA 1FCQA 1TTQA 2Q8LA 2Y7FA 1RQHA 2Q3OA 1XBYA 3MI2A 1KTCA 3UZJA 3NQ8A 3W7GA 3BG5A 2QUUA 1VLIA 4XZ9A 4HNNA 1BWLA 5HWJA 1TJRA 4HPXA 3GKFA 2FPTA 1EEPA 2ZZ1A 3IIVA 1RR2A 5BW6A 4DBDA 2A2IA 1XUUA 3E12A 5BMXA 5HINA 4JTLA 4ZQMA 3S5NA 3PWAA 2WJZA 1A5SA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1JPI A;  3CNY A;  4LV9 A;  1EDG A;  1FWC C;  4XV0 A;  1QHZ A;  2BX7 A;  2GQ3 A;  2R91 A;  3ISI X;  3EA1 A;  2GOU A;  3F4C A;  5C7V A;  4FNP A;  1Y5W A;  4IG2 A;  2WVT A;  3GR8 A;  4DZA A;  3BZG A;  4HPG A;  3CMF A;  3SUV A;  2HIS A;  1WUE A;  4YVV A;  2VX6 A;  1I2N A;  3WQE A;  3UR5 A;  2CZV A;  3UJE A;  3R25 A;  3B8D A;  3B8I A;  3GLC A;  1B3O A;  1TRI A;  2R1N A;  5A2C A;  1R9Z A;  3NIY A;  3RND A;  5MF5 A;  4B9Y A;  1UHV A;  4RZ4 A;  3AU6 A;  4O8R A;  2WKJ A;  3PJW A;  1PX4 A;  1U22 A;  2ZUU A;  3NNT A;  3M46 A;  3FSU A;  4IUG A;  2J62 A;  1S38 A;  4GH3 A;  1M7X A;  3I7R A;  3BLO A;  4AD5 A;  4JTA A;  1UWQ A;  3MWA A;  3EOU A;  4JGD A;  1C7T A;  3WUF A;  3NJ3 A;  1AG1 O;  3VKD A;  4C6P A;  5FOO A;  3W1R A;  4M7S A;  4INF A;  1P43 A;  3EAU A;  3KRB A;  1V08 A;  4DPQ A;  4ZA0 A;  1FH8 A;  4AEF A;  3VNL A;  3FKK A;  4AZB A;  1JI2 A;  4WLC A;  1S1P A;  3AHT A;  3ALF A;  4IIH A;  3M6D A;  1DYS A;  5DMN A;  1KCX A;  2PRM A;  3VD5 A;  3VKC A;  2YZR A;  3OJG A;  2OGY A;  3W4R A;  3CEP A;  3P84 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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