3GOIA

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 171
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
448
structure length
448
Chain Sequence
TLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Discovery of novel 3,6-disubstituted 2-pyridinecarboxamide derivatives as GK activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 171
structure length 448
sequence length 448
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-03-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3goiA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3goiA01
3LDPA 5EY4A 1KAYA 3EZWA 4MO4A 4K25A 2AP1A 5BRDA 4JN4A 4MO5A 1QZ5A 2FSNA 4B9QA 1BG3A 3L0QA 4BG8A 5I9EB 2HF3A 2P9SB 3JS6A 4J8FA 2A41A 3VESA 3U9DA 1GLFO 1E4GT 2BTFA 2FF6A 3D2FA 2P9IB 1BA1A 1U6ZA 3O6WA 5BPLA 3C7NB 4M7XA 4BRFA 3CJ7A 3M3ZA 3SJHA 1NM1A 4FWNA 1HKGA 1JCGA 3CETA 4DB3A 1YVNA 2YHXA 1HX1A 3QBXA 4DHYA 4EHTA 5AQNA 3OHRA 5AQYA 4WYBA 5AQWA 4ISGA 1T6DA 3HSCA 3MN6A 1U2VA 4ISEA 3AY9A 4JAXA 1MA9B 1NGCA 4A2AA 4PL7A 1MWMA 1BOTO 3EKSA 4FWKA 1YUWA 2ITMA 4FWSA 3JXUA 1Z6RA 3FZMA 3EN9A 5AQHA 2HOEA 1OKJA 3GOIA 1NGDA 1JCFA 3HI0A 2DPNA 4BRCA 2VWBA 4YDUC 3MN9A 4CZJA 3KVGA 2A42A 2FSKA 4CZIA 2YJEA 2E8AA 2A3ZA 5AFUH 2W40A 1DEJA 3VF6A 4RWTA 3FFKB 3R9PA 1WUAA 4BR9A 3UKUA 4BC2A 4GNIA 3CJBA 4EIAA 1QZ6A 3D2FB 4CZMA 1EQYA 2Q36A 2YHYA 1GLJO 3BF1A 3VEOA 5AQFA 2CH5A 2CGLA 5F2RA 2IVNA 2Q0UA 4B1ZA 4DCHA 1ATRA 4LC9B 4BR4A 2QWRA 1ATNA 4H5VA 2Q97A 3FZLA 5KPZA 3MN7A 1T44A 3BF3A 3IMXA 4QS7A 4FSVA 4JNEA 3VEWA 1X9JA 3WQUA 4PKHA 1U2VB 3VEZA 4MLEA 3ID8A 3R8EA 2OANA 3FZFA 5ADXH 1TUUA 1ZXOA 4FWOA 3G25A 5FPMA 5AFUA 2A6AA 4FWRA 3MCPA 1NGFA 4H0VB 2QWMA 3H45C 3S41A 2P9UA 3WUHA 3A8YA 5AZIA 3SMPA 5AQMA 2H3GX 2IIRA 1NWKA 2D0PA 4PKIA 1MDUB 3DAWA 4BVPA 1QQNA 3H3NO 4CBUA 3L6QA 1NMDA 2E2NA 5EVZA 5AQLA 3ZX3A 3ULEA 3ZX2A 4B1VA 3D7EO 4YDUA 4CZFA 3CIPA 4WQ5A 4O8KA 3UE5A 5AQTA 1H1VA 4RTFD 5BRFA 2GWJA 2V7YA 4H0XB 3UKUB 3CQXA 1HKCA 2BUPA 2E1YA 5BPNA 1V4TA 4BC3A 3SK3A 4CBWA 3BP8A 2E88A 1DKGD 3HZ6A 3WXJA 4H03B 5BPMA 1RFQA 4BRAA 5ADXA 2E2QA 1MWKA 2WUSA 3I33A 4ISFA 3VENA 3VOVA 4BQZA 2ZWHA 5KQ8A 4FPAA 2NRHA 3IFRA 3A5OC 2V52B 3VPZA 2YI1A 2E20A 4CI6A 1ZBSA 4H0YB 2E2OA 2NLXA 4F9OA 5AQUA 4BRNA 4B1WB 2YHWA 2QXLA 3WXKA 4WQ4A 3QBWA 3QFPA 3RSEA 4I6MA 5BRHA 5E84A 1IJJA 5JICA 2P9UB 1XQSC 5AZIB 2P9PA 1QQOA 4EFHA 1KAXA 4FOEA 2FLOA 2P9NA 2F9TA 3QICA 3VEYA 2V51B 3EKUA 5AQKA 1BUPA 2QWPA 1HUXA 3DXKA 3ULEB 4BGBA 1BU6O 2ZGYA 2QWOA 4FO0A 3U4LA 3VF2A 3CI5A 1XC3A 3ENHA 4M63C 4BROA 5CE3A 4Y0WA 5LJVA 1BWFO 4PKGA 2HMPA 2VYPA 1GLDG 5BN8A 3I8BA 3HM8A 2IVOA 2QWLA 4B1UB 3FZKA 4FL9A 2PBDA 1GLEG 1RGIA 3U8XA 3ZETA 3O08A 3WEEB 4MLHA 3HTVA 2UYTA 4BGAA 2QM1A 4IJAA 1X3MA 1P8ZA 1TYQA 3U9ZA 2EWSA 4O5FA 1DGKN 4FWQA 4L3QA 3H3OB 3F9MA 5ELZA 4CZLA 5AQPA 4QS9A 4BG9A 4H0PA 1LCUA 3DWLA 3LDQA 4H5RA 5AZJA 2Q31A 5LJWA 2GELA 3O4WA 5FPNA 3LL3A 3AAPA 3DXMA 3KHYA 4IO8A 5E26A 3RSEB 1KAZA 4I6MB 4IZ9A 3H46O 4XH1A 3LM2A 5EXWA 3WQTA 3VETA 3CHWA 1SAZA 2P9PB 1QQMA 3VGMA 3R6MA 2P9NB 3H1VX 4CJ7A 2I7NA 3M1FA 5EX5A 3DXKB 1SQKA 4BC5A 4NB4A 5FPDA 2GUPA 3QB0A 2FSJA 3GE1A 3CJ9A 3TU5A 2FXUA 3WT0A 1CZAN 3FZHA 1KXPA 5KPRA 5F0XA 2VCPA 1XUPO 3MMVA 5AR0A 1NGEA 2D0OA 3GDQA 3ZETB 1SZ2A 4XH4A 1BO5O 4KBOA 4HWIA 1NGJA 1GLCG 2YJFA 2CH6A 1HPMA 5LY3A 5BN9A 1C0FA 1TYQB 2E2PA 4BVOA 3D2EA 4IXCA 1WOQA 1Y64A 4EHUA 5AQGA 3FLCO 3WEEA 2ASOA 3AAQA 1NGAA 5AQOA 3VGLA 1HKBA 4H0TB 3ZX0A 5B8HA 2NZTA 1YXQA 5AZJB 2CGKA 4FWMA 4AM6A 4CZKA 2YCHA 2CGJA 4FWPA 4K41A 1K8KA 3DXMB 4NO7A 3FR0A 3H1QA 5JLHA 1S3XA 1QHAA 1C0GA 4CZEA 2Q1NA 1X3NA 3CJ1A 1D4XA 2ASPA 3LDLA 4DQ8A 1Q18A 1NGHA 3B8AX 4CZGA 1ZC6A 5TKYA 4PL8A 5AQVA 4BRMA 2J4RA 5FPEA 3HBTA 4CZHA 3ATUA 2GWKA 3QMLA 2GTDA 1NGBA 1NLVA 2A40A 3ZEUA 3VF4A 3O1BA 5AQXA 2P9LA 4BRHA 2P9KA 3MN5A 2D1KA 1E4FT 4B1XB 3P4IA 1HJOA 3GL1A 4XH5A 4JD2A 3ENOA 2IVPA 1YAGA 2W41A 3DJCA 4BRKA 2Q2RA 3LDNA 4BRGA 5AQSA 3CJAA 3UB5A 5KPTA 5BR9A 3GBTA 2F9WA 4BR7A 4FOIA 3BEXA 3EL2A 1LOTB 1TUYA 4H5NA 3H6EA 3SMSA 3A5LC 5F1XA 5AQIA 2Q0RA 3D2EB 2I7PA 4JHDA 1JCEA 1V4SA 3WXIA 4A62A 3UKRA 3C0BA 5AQJA 4RCHA 1K8KB 4M7YA 3J8AA 3O5BA 4FPBA 3QFUA 3O80A 4BQLA 1T6CA 5AQRA 2KHOA 4BC4A 4HTLA 3MDQA 3M6GA 1RDWX 3LDOA 4WQ5C 4BRIA 2A5XA 2QWNA 3IDHA 4BRDA 3A5NC 3FE1A 3CJCA 2ZF5O 4GY2B 2FF3B 5BREA 3L4IA 2PAVA 3AARA 3LM9A 3O8MA 3ATVA 4C23A 3QDKA 5JMVA 5EOYA 3W0LA 3ZEUB 2AA4A 2P9LB 2P9KB 4XEIA 3TPQA 1GLLO 2ZGZA 4JD2B 3VEVA 1NGGA 4B1YB 4BRPA 4IWVA 2P9SA 4Z94A 3KZBA 4EAHD 1G99A 3CERA 2QW9A 2GEMA 2P9IA 2E1ZA 3MK6A 4BRQA 3C7NA 4H5TA 4CD3A 4JHDB 5AQQA 4WQ4C 4K43A 3IUCA 3VERA 1HLUA 3SLCA 4CD1A 4E1JA 5JLFA 4H0OA 1ATSA 4H5WA 3UKRB 4K42A 4BREA 4AM7A 1Z05A 3A0IX 1GLBG 2V7ZA 1S22A 1NBWA 2ASMA 3WXLA 3VGKA 4FWLA 4A2BA 4A61A 3A5MC 1GLAG 3FGUA 3CQYA 5KQDA 3W3DA 1BA0A 3EO3A 3O1WA 4BR2A 1IG8A 1BDGA 3GG4A 2QWQA 5AQZA 2D4WA 4CBXA 1R59O 4BR5A 1J6ZA 4QS8A 4BRLA 1ESVA 2HF4A 4BR0A 3VEXA 4IJNA 3BUZB 1NGIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L3SA 3OYNA 4X64K 1VRUA 4MO4A 2AJQA 4K25A 1VSJA 4A5AA 4GKJK 3ASMA 1Q9YA 4B9QA 1BG3A 3KK2A 3MX2A 1RT2A 3Q7CA 2HF3A 3VESA 4GVEA 5CYQA 3U9DA 2HVIA 4B9VA 1VQMN 5BPLA 2DFHA 4KH4A 2YKMA 4CGGA 3AVAA 3U3YA 4ELTA 1I94K 3IAYA 4E7LA 2OA8A 4NLBA 2RHKA 3SUQA 1NJYA 3THXA 4ZHRA 1QSYA 4K0KK 4DQPA 1RDAA 3PX0A 2YV0X 5AQWA 4JI6K 3HSCA 3T3FA 3HP6A 4YFUA 4CEDA 3LP0A 4PL7A 2HHXA 1BOTO 1TKTA 4TSXA 4DTJA 4DV1K 3U6FA 3DMJA 3THWA 3KD5E 3JXUA 1Z6RA 5J2NA 5KTQA 3NVKA 3GOIA 1NGDA 3OYGA 2DPNA 1TVRA 4I2PA 1YJWN 3LZIA 3E9OA 1Q9XA 3RR8A 5AFUH 3VF6A 4BR9A 3UKUA 1IBMK 3QLHA 1QZ6A 1L3VA 4U67L 2Q36A 3VEOA 3M8QA 5AQFA 3O3GA 2Q3SA 4AHUA 1QVFM 2QWRA 1ASUA 3HPGA 5KPZA 3MN7A 4JNEA 4KREA 1X9JA 4EZ9A 3WQUA 4AHSA 3VEZA 4B3OA 3FFIA 2IC3A 4ICLA 4YOYA 1ZBFA 3N4QA 5FPMA 3T1YK 2A6AA 1NGFA 2QWMA 3WUHA 2BGGA 3DLRA 3K58A 3DLLL 4FJNA 5AQMA 3J7AP 2IIRA 3QIOA 1TKDA 1NWKA 4JI5K 2QI2A 3CCVN 3LZJA 3TAQA 3RVCA 1QQNA 1NOZA 4OVLA 2HHTA 3VMFB 1VQ5N 4F8RA 4X66K 3L2VA 3CIPA 4O8KA 3HM9A 3CD6N 3ZCMA 3SUNA 3TAFA 1B92A 1YT3A 4CW7B 5HOOA 1VQKN 1HKCA 1X9SA 2UXBK 1T03A 4BC3A 5C10A 2FBYA 3KLHA 3BP8A 3HZ6A 2HNDA 3H08A 4BRAA 1NG9A 3O3HA 1K73O 3VOVA 1I3AA 3LPTA 2NRHA 1SKWA 1OH7A 3VQ7A 4XIUA 1RBVA 4H0YB 1EETA 1TGOA 1JLQA 4FLUA 5AQUA 4UY8O 3BZKA 5LMUK 4B1WB 2B6AA 5FLXO 1JL2A 3KWIA 2NUBA 3PUFA 3LALA 2XHBA 3CF5L 5E84A 1UAXA 2G8KA 3CPEA 1BCOA 4JK7A 1QQOA 1KAXA 5HLFA 4KHWA 4FOEA 2P9NA 3CFPA 2F9TA 3VEYA 1BUPA 4DSEA 3HVRA 4CHQA 2ZGYA 3U4LA 1JLBA 3P31A 4BROA 3HYFA 2HMPA 1GLDG 2KKZA 3I8BA 4CK1A 2IVOA 4EP4A 2QWLA 4B1UB 3FZKA 3ZETA 4E19A 3K5MA 1W9HA 3V1OA 1JLCA 2P5GA 2UYTA 3QNOA 4BGAA 1X3MA 3C6AA 4CHZA 1Q86O 2FBTA 1DGKN 4DV5K 3ZSWA 2KZMA 3C6TA 3H3OB 4O0JA 5ELZA 2Y1IA 5AQPA 4BG9A 4FLVA 1LCUA 3DWLA 4KHNA 5CR4A 2O4IA 5J1EA 2Q31A 5LJWA 4WF9L 2GBZA 4OX9K 1IBLK 2JWKA 1J53A 3LM2A 3VETA 4H4MA 3V9WA 3AVMA 4DQSA 2P9PB 3RMAA 1QQMA 3NFAA 3DYAA 1NJIO 2I7NA 3CCMN 4IKFA 3J80O 5H1SQ 4IFEA 2PZSA 3QB0A 4CGDA 1D9FA 4IBNA 3WT0A 4V19S 1RT4A 2O8EB 1FKPA 1XUPO 3MMVA 5AR0A 5IT9O 1SZ2A 4XH4A 3MECA 3AGKA 2GX9A 4JKFA 4FJ5A 4FXDA 4IOXA 1KD1O 4JKEA 3T7ZA 1T3VA 1BI4A 3CFOA 2E2PA 1VQPN 4BVOA 4EZ6A 2EHGA 1Y64A 3K59A 4DS4A 3OYIA 1VSDA 5AQOA 1HKBA 5B8HA 3TSUA 4FJGA 1E3MA 4AM6A 4FWPA 5JVHL 1RDCA 4NCGA 4HCCA 1CLQA 4M45A 3EE8A 3LDLA 4FK2A 3CCSN 2J4RA 5FPEA 4CZHA 4GVMA 3SNNA 2HB5A 3KK3A 3NE6A 3SQ2A 1IKYA 1NGBA 4B9SA 5HRNA 1IV0A 4IEIA 2A40A 3AVKA 5KI6A 2P9LA 4LH4A 4CE9A 3K5LA 3P4IA 3TARA 2G8FA 4Y1CA 1YAGA 3CC2N 3Q7BA 2Q2RA 1D9DA 4CESA 3EZ5A 2G8WA 5AQSA 5KPTA 1J5EK 2F9WA 4Q0BA 3EL2A 1TUYA 4H5NA 3SMSA 5J2QA 3PLAA 1RDDA 5AQIA 1YIJN 3D2EB 4CGFA 1N33K 1JCEA 3O3FA 1RNHA 1KVAA 4E1NA 5AQJA 5CHIA 1IG9A 3VQ9A 3L3VA 1FKOA 4YOTA 4RCHA 4I2QA 1K9MO 3J8AA 3O5BA 4FPBA 2HHSA 4CFBA 3TWHA 3VQDA 5CY4A 3MDQA 4JI0K 1RDWX 2F96A 4BRIA 1O1WA 4OLAA 4E7IA 4AHVA 2ZF5O 3AO4A 3SPZA 4O44A 3HK2A 1XNRK 3M8SA 2PAVA 3I56N 4C23A 2NRVA 3QDKA 1U04A 1YITN 2AA4A 4CJRA 4XEIA 3TPQA 4DTPA 5M1KA 3OYBA 2ZJQL 3S3NA 4KKOA 1NGGA 3VEVA 4B1YB 4BRPA 4MQ3A 3M8PA 1OH5A 1G99A 4M3YA 3K9JA 1QSSA 4Z4GA 2IOCA 2E1ZA 4RG8A 3MK6A 5LL6Z 5C25A 4IG3A 4GKKK 4JHDB 3SV4A 1ZBUA 2KFNA 1HLUA 3SLCA 5JLFA 3UKRB 1BGXT 4AM7A 1J5OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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