3GYEA

Didydroorotate dehydrogenase from leishmania major
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
312
structure length
299
Chain Sequence
MSLQVNLLNNTFANPFMNAAGVMCTTTEELVAMTESASGSLVSKSCTPALREGNPTPRYQALPLGSINSMGLPNNGFDFYLAYAAEQHDYGKKPLFLSMSGLSMRENVEMCKRLAAVATEKGVILELNLDFDAMRQCLTAVSEVYPHSFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNEFPKVQFITCINSIGNGLVIDAETESVVIKPKQGFGGLGGRYVLPTALANINAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALQEEGPSIFERLTSELLGVMAKKRYQTLDEFRGKVRTL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, putative
publication title Crystal Structure of Leishmania major Dihydroorotate dehydrogenase
rcsb
source organism Leishmania major
total genus 105
structure length 299
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.3.1: Transferred entry: 1.3.98.1.
pdb deposition date 2009-04-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3gyeA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3gyeA01
4LS1A 4WJEA 1KFJA 2GJNA 3CPRA 3UWUA 5DN1A 1OFPA 3R13A 3PY2A 3TFCA 3QEZA 1D3HA 2X1UA 3EKZA 3P7YA 4LVGA 4RX0A 5DY2A 4Z0JA 1OF8A 3N2XA 3HQ1A 4IJBA 2O7QA 1NAL1 2Z6IA 1JQVA 3I6RA 5TBOA 4K7YA 4WUIA 2H3DA 1HFBA 2CU0A 3HGOA 1AW2A 4MJMA 2V8ZA 2H90A 2YCEA 4KFNA 4ADTA 2A2IA 3O06A 1TV8A 1HG3A 3PAJA 3SSJA 4FB7A 4JIQA 5FESA 4DF1A 5AYZA 2DZUA 4O13A 5LHFA 2O7SA 3W3OA 3IVSA 4ICNA 3TH6A 2BTMA 1PVNA 3DHDA 3LB0A 3OA3A 3QPZA 3S42A 2FJKA 2WNZA 2NXIA 3IIXA 3KVJA 1LDCA 2NUXA 4FNSA 4O50A 2HSAA 5KITA 2AQWA 2DZWA 3T40A 4ZVJA 5CZ0A 5CZSA 2V30A 4ZQCA 3RU6A 3CIWA 4UTHA 3LHWA 3Q58A 3T44A 1QO2A 1YDOA 3CT7A 4AB4A 2ZZ5A 2PRLA 3BG3A 1LBMA 1TCDA 3CEUA 3LHYA 2QCFA 1R47A 3C56A 3FYOA 1VJIA 3QF0A 4JX4A 3TQ0A 1JCNA 3THAA 4UXDA 1J2WA 2YX0A 5EA9A 2WNNA 3MHFA 3N9SA 5D05A 5HULA 4MIMA 3M0ZA 5F4WA 1EUAA 2JK2A 1MEHA 3WK1A 3P84A 2OMAA 3H53A 3TQVA 1K7FA 4O28A 3KVKA 4D2JA 4N2YA 2Q8LA 3W6YA 1YTDA 4RZ4A 3EX6A 5K9XA 3W7JA 1JCYA 5EPDA 1OHLA 2VENA 1SPQA 3IIOA 1QPOA 3DI0A 1H51A 2J27A 5HR6A 3G24A 4XUGA 1FWNA 1WXJA 2ZZ3A 4MZ1A 1VCVA 3NQGA 4CCDA 2EGZA 2H3BA 3CC1A 3LCFA 4JTKA 3EWXA 2GJLA 5LNWA 3FFSA 3GXTA 4S2CA 1KV8A 3BLEA 1KTNA 1O60A 2ZRYA 4IXXA 1OYAA 3KFTA 2BX7A 2A85A 3GDTA 1ME8A 1DOSA 5IBXA 1PL9A 4DF2A 1DJNA 3G1YA 3TX9A 4OWGA 3UPWA 3SIZA 5HWNA 3TQKA 3KVMA 5K7JA 4MVAA 1DHPA 4IMFA 3LTSA 4O16A 1W3TA 4O1CA 4DBEA 1LRTA 5HQEA 3M7WA 3WJWA 3C2FA 2TMDA 3W7KA 5EBUA 1ZFJA 3UXAA 3OG3A 3LV6A 4MY1A 4JNMA 5L6UA 5AHMA 3GR7A 3PBYA 1GOXA 1B3OA 1T0OA 1SO3A 3UWVA 2W6RA 3NQ8A 5H2ZA 2ZQ0A 1JR1A 5LNUA 2VELA 3LCLA 4GBUA 4GUIA 3E02A 2TYSA 2CZEA 1F76A 3G8EA 2ZFAA 1RVGA 4HNTA 4X22A 4LTSA 1SZFA 5F2MA 1T96A 3QFEA 3ANYA 1TPEA 2Q8ZA 3W85A 3G8RA 1CX9A 2E09A 3L21A 1BWKA 1ZHAA 3PF3A 5FF2A 3LXBA 3BPWA 1YXYA 3FJLA 1D9EA 3G3DA 4LU0A 4ZQRA 2QCGA 3CEPA 4GUGA 4DELA 3N9RA 4O11A 1K03A 3NM3A 3TV8A 4CNPA 4BI7A 4U28A 5FEPA 1AW5A 1ME7A 3L0NA 3MMTA 3RF9A 5J5DA 2V81A 4WXZA 3W7GA 1SQ7A 4MLJA 2DZSA 2ZA3A 3TSMA 1UUOA 1O95A 4EOUA 1LBFA 3WJXA 1G4PA 1YXDA 4TR9A 3LCGA 4JS3A 4WZHA 5DCDA 3L5LA 3LHZA 1AW1A 1F73A 5FI8A 2WKJA 1AG1O 4P61A 5CG7A 4YCPA 1Z42A 2VEMA 2ATSA 4GWEA 3DFQA 1B57A 1TRIA 4BWLA 2X2GA 3GAYA 1D3GA 1H7XA 4DQWA 1FCQA 2DZTA 1GVRA 2Z0IA 3EXSA 2C14A 4UFHA 5KINA 1F05A 1MXSA 1VH7A 2JKPA 2R94A 3KAOA 3W75A 1DVJA 1OX6A 1TMHA 1XUUA 1DKWA 1LBLA 1H61A 3KX6A 1YYAA 2F7FA 1TQXA 1CW2A 4JICA 2I14A 3G1HA 3P5YA 4EVZA 4AAJA 4LY8A 4GUFA 3R5EA 1SR9A 1ZNNA 2Y6ZA 5C55A 4O10A 1TPB1 3PUDA 1PHQA 4JTHA 4NQ1A 5HWJA 4JTUA 2VFEA 1KV5A 3C6CA 1TJPA 3S5OA 3S8HA 4O1DA 4BF9A 1KFKA 1YPFA 4K39A 1XBZA 2ABBA 3AO0A 1C29A 4TIMA 1AK5A 1YXCA 3L66A 3SGZA 2YW3A 2WNQA 5AHLA 5GVJA 3NA8A 3EWYA 1H7WA 1OJXA 3BG9A 4HNUA 3RK8A 1L6YA 1RD5A 5D38A 5G4WA 3NZ1A 3S5NA 2J88A 3R2GA 4QSHA 2FFCA 3W7EA 5AYXA 2C18A 3JR2A 4MYXA 2NV2A 4NX0A 2CZFA 3KRUA 3QMTA 4TU1A 1S5VA 1Q6LA 3TMQA 2DZXA 2NX3A 4YL2A 3I7QA 1JCJA 2WOQA 4MYAA 1B4EA 2ZZ6A 1JCLA 1RZMA 3MP5A 1HO1A 1K7XA 2ZZ1A 2ZTKA 3GVGA 1EX5A 1LRQA 4K6AA 4LOCA 5D2TA 3S1VA 4JY9A 4UTMA 1ZAIA 4GJ1A 3CWOX 4PL2A 2DZVA 2EAWA 4K8HA 3B0UX 4FIQA 4PTNA 2CLMA 1BEUA 4K38A 5CGQA 3DGRA 4W9TA 4LWWA 2J9ZA 1LOQA 5D30A 1J5TA 3GKFA 1K7EA 1GVQA 3QPYA 1IXNA 2NLIA 1Z48A 4PA8A 3KOFA 1VHNA 3W74A 4Y90A 3LERA 2NV1A 1QPQA 3R8RA 4FX6M 3VE7A 2DJXA 1YTEA 1WYIA 1XUZA 3L2IA 3NG3A 3EX4A 4JX5A 3HGJA 5HR7A 3A24A 3O6YX 4UR8A 1F6KA 3VNDA 5I3GA 3HG5A 3EX3A 3F03K 4R34A 3DXIA 1K8YA 3P8JA 4PODA 5D09A 2X16A 2G5WA 1TJRA 3UWYA 1LTDA 1QDSA 4LS0A 2PRMA 2CWNA 1OX5A 1X8FA 5C5YA 1RQBA 2GVLA 3NQ6A 4O15A 3QSRA 1I2OA 1OFOA 3M43A 4A2SA 1KTBA 5H91A 1S5TA 1JCMP 2FB3A 3E9AA 3A21A 4QAIA 5K4ZA 3KRZA 3NXFA 3NPXA 4JTGA 4Z0SA 2Y7FA 3EKLA 4TMBA 1H1YA 4TX9A 3WJZA 1T99A 1VYRA 3LRLA 4GE8A 3E12A 1EA0A 1TTQA 5E1QA 1XDMA 3W1AA 3TAOA 3MBDA 2A6LA 1IIHA 1GVFA 2H6RA 3ELFA 1JVNA 3N34A 4UTWC 3BLFA 1WOAA 3C8FA 2Y89A 5KZDA 1OF6A 1BKSA 1R46A 3AJXA 3QQ1A 3M1ZA 4LVBA 5G1YA 3NL3A 3FKRA 5G2HA 2XN0A 4LW7A 3F4WA 3SR7A 1EPXA 2EHHA 1TV7A 4ZZ9A 3S1WA 4Y9AA 1NF7A 4NVTA 4AHOA 4MZYA 2E5CA 4UTTA 4QITA 5FEWA 3DI1A 5F1VA 4IX0A 2JKEA 4O53A 3DAQA 3MI3A 2V2HA 3EB2A 1L9WA 1A5BA 4DO5A 4HIBA 6ALDA 4M6QA 4LV9A 5FF0A 2E77A 4N4PA 2W0UA 4RXGA 1W0MA 3ATZA 3FYPA 4JDYA 4JN6A 1LOLA 2FDSA 1KTCA 1W5NA 4ZQNA 3GX9A 4JTFA 3BW4A 3NQ7A 3CU2A 1TREA 3VI2A 3MHUA 4IMGA 2QAPA 4PC8A 3Q94A 1JQXA 1OX4B 4FNTA 1A5SA 3QYQA 3G3MA 4JYEA 1WQ5A 5AB3A 3QMRA 2FQIA 3S1UA 2GQAA 1GEQA 5C2XA 2GPTA 1P0KA 4OV9A 2YW4A 3NOEA 1LCOA 3LHVA 1SW7A 3NQCA 3STFA 2EPHA 1SO6A 1H7RA 3YPIA 3O63A 4AHPA 4UTUA 3TUUA 3W7OA 3STGA 4QISA 5L9FA 3I68A 3R89A 4BK9A 1PV8A 2OT1A 4UUIA 1MEIA 1P5BA 4PFMA 1RR2A 2H8XA 4R53A 4A3UA 5I3HA 3A23A 3G1XA 2A1YA 4HPJA 4XQ6A 4XBKA 5D2YA 1VLIA 3OIXA 3LLDA 4M19A 3CLMA 1XM3A 2VFDA 3HPSA 5DLCA 1ZY9A 4EF9A 1KA9F 4RXFA 1G7VA 4POCA 2XN2A 4UFJA 3RLUA 5LKYA 4QQ3A 4LC8A 4PH6A 3W1UA 4FEZA 3M6YA 4BI5A 3IIZA 3LTYA 4DF0A 5F4XA 1EEPA 3DFOA 4WOQA 5U7SA 4JYFA 3HG4A 5AYYA 5LGZA 3P80A 3W1NA 3HB9A 2GVGA 4NXKA 2A7RA 2KZHA 2CLHA 5I3FA 1NFBA 3KHJA 3TAKA 4UTKA 2EF9A 1IIGA 5J5RA 1SSDA 3VE9A 3TDFA 1X1OA 2NZLA 2P10A 3G1SA 4ALDA 4DXVA 4O18A 3W1XA 4XTIA 4FXSA 3UYCA 3F4NA 3TC7A 1N8FA 1KM2A 3G0UA 3NDOA 3G0XA 2YZRA 4OBTA 4JTLA 2DP3A 3GAKA 5AHEA 5I3JA 2I1OA 4YWIA 2V9DA 5I3KA 1GPWA 2ZCGA 4CCEA 3GNNA 4EF8A 1WAUA 3P62A 4MUZA 1N7KA 1GT8A 1LYXA 3I65A 4AH7A 5U4NA 2ZA1A 4JTSA 3PC0A 5D37A 3UPBA 3WFAA 3M16A 2NUWA 4IUOA 4JTEA 1DL3A 2V2CA 5IM51 2VFIA 3IRDA 4O8RA 1KLZA 1W3NA 1IXQA 2A0NA 1TRDA 2QCDA 3HIJA 3RLVA 3TW6A 3P60A 2WSYA 2P0OA 3ZS4A 3MP4A 3DKLA 4XKYA 5K9CA 2QJGA 2TRSA 3F1QA 1Q6QA 4MPQA 3HJZA 2BXVA 4O12A 5AHIA 1AL8A 1HL2A 3MI6A 1LLZA 4Z1DA 1CI1A 4PEKA 2VC6A 4M5PA 1KFBA 1WV2A 2ISWA 2E6FA 1ZENA 3VFLA 3GDKA 1VYPX 3S9YA 3ZWTA 2CLIA 1DQXA 2CLOA 3ATYA 4OV4A 1AL7A 4XBSA 1ZAHA 4K37A 4ADSA 4JR5A 2FIQA 4UMBA 4UTLA 1S3HA 2YR1A 1KM5A 1QCWA 3PWAA 2QKFA 5DCEA 3QQ0A 1Q45A 3LM7A 1PCKA 2PCQA 4R7JA 4XZ9A 2CZDA 4NJHA 3MW7A 3PB2A 2QCMA 2R8WA 1JULA 5DELA 4RK8A 1W31A 1O4UA 3WK2A 2NUYA 5G2IA 1GYLA 4YLWA 4DBDA 3BV4A 4OHQA 3T7VA 5HNRA 5E93A 1DV7A 2Q3RA 3O07A 3NNTA 5BOOA 1VC4A 1H60A 3ZR4A 1GTEA 1QMLA 3USBA 3W2KA 5DBUA 1ONRA 3B06A 3CQ0A 3LI1A 4GUHA 1O5XA 5KZEA 1RV8A 3S1XA 2FB2A 2Y7DA 3NQEA 3W7HA 1QOQA 1ICPA 3QZEA 3QW3A 3PS7A 3G22A 2GVJA 3B4UA 3MHGA 1JRBA 4CNNA 3TR2A 5EY5A 3TKFA 1Q3NA 4LVFA 1LRNA 2ATMA 4A29A 3DFPA 3NYZA 2TSYA 3B03A 4IMEA 1WBHA 4Q4KA 3ZWSA 2NX9A 1G4EA 3NM1A 3W84A 3IIPA 3S5YA 5D2WA 2QCNA 2A5HA 1R2TA 3NVTA 4UCGA 3C2EA 3U8GA 1I2QA 2JBMA 4RJEA 1H5YA 3FA5A 4FO4A 3HMJG 3W1PA 4FX8A 4NZJA 1QWGA 2I9EA 3ABSA 1A5CA 3E49A 1YLVA 3W88A 1FWWA 3GB6A 4LV4A 3W71A 3LRKA 4HPXA 3PULA 3BVJA 3M5VA 3LHUA 1ICQA 1KFCA 3EEGA 1RQHA 4WOZA 4UMAA 2B7NA 1ML1A 1SZNA 2Y70A 3NPVA 2GQ8A 4Z1AA 5EKYA 1GJPA 1KM1A 2B0MA 3S0CA 1UASA 1BWLA 4OGZA 3BGGA 4IXHA 4YMZA 2AAMA 3CHVA 5FEZA 4EIVA 2ZRXA 3PM6A 1XFBA 3NL5A 1Z41A 3EWWA 4AF0A 3BARA 3G18A 3PBVA 3QMSA 3U2OA 5MHBA 3LDVA 1FX6A 3FLUA 3LCXA 3TW7A 5HJLA 2G95A 3NL2A 4GUJA 2J9XA 1JCXA 4LVDA 4FF7A 1U83A 4NNAA 3HGSA 2WSRA 4IGHA 1TPWA 4A2RA 3GKAA 2YDAA 4O52A 1C9DA 3HGRA 4UTIA 5HUPA 1K8XA 3W1QA 1THFD 5HMSA 4AWUA 4IQLA 4JX6A 4NNBA 2YSWA 3LV5A 3NO5A 3W7IA 1VYSX 3SJ3A 2A7PA 3SW6A 3W7DA 1HO4A 2GUUA 3M5XA 1EWDA 2F84A 3MYOA 5E0KA 1EUNA 3CIXA 2ZRUA 4QJ1A 5F2GA 1FWRA 2VEKA 2V5BA 4Q33A 4O0KA 1GVOA 4ONVA 5KTLA 3P67A 4JTJA 3TU9A 3NQFA 2RH9A 5BW6A 2ZYFA 3C61A 4DPQA 3CB8A 1C8VA 4Y96A 2CLFA 4H6KA 3M47A 4DEFA 4O1BA 3NQAA 2B4GA 3VCRA 5A5WA 3W7NA 3GDLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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