The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
21
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sequence length |
70
|
structure length |
70
|
Chain Sequence |
EEEELVDPLTTIREHCEQTEKCVKARERLELCDARVSSRSHTEEQCTEELFDFLHARDHCVAHKLFNKLK
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxidoreductase
|
| molecule keywords |
UBIQUINOL-CYTOCHROME-C REDUCTASE COMPLEX CORE PROTEIN I, MIT
|
| publication title |
Electron Transfer by Domain Movement in Cytochrome Bc1
pubmed rcsb |
| total genus |
21
|
| structure length |
70
|
| sequence length |
70
|
| chains with identical sequence |
U
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-04-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1NTK H; 1KB9 F; 1L0N H; 3CWB H; 3L71 H; 1SQV H; 1BGY H; 1L0L H; 2A06 H; 1PP9 H; 3H1I H; 3CX5 F; 3L73 H; 2BCC H; 1BCC H; 3BCC H; 4U3F H; 1EZV H; 1NTZ H; 5KLV H; 1SQB H; 3L70 H; 1BE3 H; 1SQP H; 3H1K H; 3L72 H; 1NTM H; 4D6T H; 3L74 H; 1SQX H; 3H1L H; 4PD4 F; 1P84 F; 2IBZ H; 3H1H H; 1NU1 H; 3TGU H; 3CXH F; 1PPJ H; 1KYO F; 2FYU H; 3L75 H; 1SQQ H; 3H1J H; #chains in the Genus database with same CATH topology 1UJW B; 2YUA A; 2ILM A; 2D2C B; 3H1I H; 1QNM A; 1GMG A; 2JGD B; 5A2Q N; 3G6B A; 3CE2 A; 4LF7 B; 1PKX A; 4LFA O; 4W4L A; 4O4J A; 1ARO P; 4KHP B; 1GN3 A; 4JYA O; 1Q82 W; 4X1K A; 2ZNI A; 2YEV A; 1VMG A; 1NS1 A; 2LQT A; 1VQL V; 5IE9 A; 1SC5 B; 1PD3 A; 1O9G A; 1D2D A; 3JAL B; 3J80 N; 3K57 A; 1IVS A; 1AP6 A; 3J81 N; 1PL4 A; 1NH2 D; 3H1L H; 2BOB C; 3FX7 A; 1NR7 A; 1Q6U A; 2GV9 A; 1XIL A; 1WAZ A; 1VIB A; 1QQC A; 1HP8 A; 1SQG A; 1S5L Z; 1W0J G; 3K08 A; 4RQE A; 5JCO C; 4X64 O; 4QE7 A; 4J7Z A; 4LR3 A; 4H13 B; 4TQF A; 3CXC U; 3F7V C; 4BAY A; 1XUQ A; 2F66 C; 3B77 A; 2QTO A; 3RVY A; 4PI0 A; 4MVQ A; 2NN4 A; 4GKK B; 1XNQ B; 4B3T O; 1MZF A; 5HFL A; 5L3B A; 2HKO A; 2OT5 A; 1BT8 A; 2NR5 A; 4WFG A; 3H1K H; 3EVK A; 1K4C C; 3WB0 A; 4L8J A; 3K0G A; 4FLW A; 3ZRV A; 2X7R B; 1M9N A; 4TQD A; 5TIS Z; 5IWA B; 4GKJ B; 3QF7 A; 4DV2 O; 3K59 A; 1JX9 A; 5LHG A; 4LNU B; 4DV0 O; 3JAT A; 4JZ2 A; 4ZHQ A; 2WAM A; 3SYA A; 5LXT B; 1O9H A; 1FD9 A; 1V54 C; 3K04 A; 3MD0 A; 4JI4 B; 1OJH A; 4DV4 B; 1N34 B; 5JCO A; 2BCC H; 1F4N A; 3WB1 A; 1K8A W; 2PZS A; 1NT2 B; 2Y4T A; 4R50 A; 3L72 H; 5LA6 A; 1MOF A; 1V54 B; 4UB8 Z; 1K9M W; 1PNK A; 4LFB B; 2IU3 A; 3DXR B; 4OX9 O; 3OGI B; 4PA7 A; 1W2B U; 1Q7Y W; 1OHH G; 1YJ9 V; 4LC1 A; 2UXD O; 4UUJ C; 4N23 A; 4JI5 B; 2BTQ A; 1DGS A; 1QCE A; 2QKS A; 4DR4 B; 4MTX A; 1BHA A; 2LGW A; 4NVP A; 4I50 A; 3Q4H B; 4B3R O; 1VAR A; 4JI8 B; 5GTI Z; 4PA3 A; 1WLE A; 1ZAU A; 5LXT A; 4FLY A; 3RFR A; 5JJN B; 1AJQ A; 3G6E V; 1W0K G; 2B1G A; 5DN6 G; 1H2N A; 1H8H G; 3R65 A; 2ZCE A; 4YJ3 B; 2QWR B; 2EIM C; 4CC5 A; 2ODM A; 3ZMV A; 2H3O A; 4FLX A; 3JD3 A; 5EK0 A; 4K8X A; 2Q69 A; 3WG7 B; 2GSM B; 3ZRW B; 2UXC B; 4I4T A; 3L71 H; 2P5O A; 1GN4 A; 1BGY H; 5ITZ B; 1BHB A; 4YHH O; 4DR6 B; 1N0J A; 3T1Y B; 3ZHR A; 4I9Q A; 2K1E A; 2WLM A; 3NR7 A; 4O4I A; 1NBM G; 4QJF B; 4PDR A; 1NQT A; 3JYC A; 2DE0 X; 4X66 B; 1YSC A; 1VQK V; 1NU1 H; 2Y0P A; 2QDO A; 5DM6 V; 1R1B A; 4C7U A; 5BR8 O; 4LF5 B; 3CX5 F; 1SS3 A; 4NXN O; 4FFK A; 1HW7 A; 3ABT A; 4JI2 B; 2XAG A; 1YVW A; 3ZED A; 1Y66 A; 3ASO C; 4J7K A; 1K33 A; 4TV9 B; 5L3F A; 5EC2 C; 5CN0 A; 4KHP O; 1KP2 A; 1K4D C; 3PN1 A; 4J42 A; 3ZHT A; 3E86 A; 1H8E G; 3X2Q C; 5LMN O; 5JJJ B; 1N33 B; 3RT3 C; 4JPR A; 5ITZ A; 1KKC A; 3F5T A; 4UVA A; 3NXS A; 1E79 G; 3ASO B; 1JJO A; 1IBL O; 2ETN A; 1KC8 W; 5GTH Z; 1IUR A; 1Y67 A; 1G8M A; 4JZG A; 5EBL C; 4CBC A; 3X2Q B; 3RYC B; 4CC6 A; 2IJI A; 1WJZ A; 3M99 B; 3SDL A; 1GO3 F; 5IJ0 B; 2R9I A; 2ZR2 A; 1EM1 A; 1EZV H; 1K92 A; 1SF9 A; 3CCU V; 1S5H C; 3EFF K; 5B1N A; 1GRJ A; 3STL C; 1SER A; 1HNW O; 2ZE8 A; 4ICG A; 3CSX A; 2X6A A; 1FKA O; 4I9W A; 1QR9 A; 3JAM N; 4W4K A; 4B3S O; 5EBM C; 5EZY B; 2GDS A; 3ZMT A; 1OZ0 A; 3LSU A; 4J9Y B; 1VF5 B; 1NZ6 A; 4JF3 A; 2QGN A; 2AGA A; 2AZ2 A; 3A8T A; 2RN9 A; 3B2E E; 4WFE A; 1Z5V A; 1YHQ V; 5FLX N; 3C90 A; 3CCR V; 5KHI A; 2JJ1 G; 1EFR G; 3JSN A; 4JYA B; 1V55 C; 1GN6 A; 3A0B Z; 4FVM A; 1H2S B; 3CWB H; 2WLI B; 5J2U A; 3E8G A; 3N2K B; 3RYC A; 3W7S A; 3QO8 A; 3AK1 A; 5IWA O; 2UUC O; 5KLV H; 4GKJ O; 3CP1 A; 1RSO A; 4I5S A; 3CPW U; 5F2V O; 2JIZ G; 4CH5 A; 2WSS G; 1V55 B; 1FXK C; 4ZIB A; 4CS4 A; 4J7J A; 2Z0A A; 1K73 W; 1D5A A; 3LDC A; 2DJV A; 2WLH A; 4FZ1 A; 4JI4 O; 4QIW F; 3FAV A; 3VBB A; 5C8Y B; 4DV4 O; 1FFT B; 4AHC A; 1N34 O; 3VQY A; 1SA0 A; 2HP8 A; 2Q0A A; 4KP4 A; 2P22 C; 2PGG A; 1SQP H; 2Q68 A; 1ZWI C; 4D7T A; 2UUA O; 1P84 F; 2F93 B; 1HNZ B; 4QE9 A; 2Q7E A; 4B3T B; 2ZNJ A; 2DOS A; 4LH7 A; 2WLI A; 3N2K A; 3UM7 A; 4JI5 O; 5IYB O; 2DYR C; 3ZRX A; 2LJ2 A; 2UXX A; 2W6I G; 4JAA A; 4BIO A; 4DR4 O; 1VF6 A; 1VP7 A; 3OM3 B; 3PJS K; 2UUB O; 3H1J H; 4JI8 O; 3OR6 C; 4I7Z B; 1FS0 G; 1M57 C; 3W7W A; 1QU7 A; 1Q6I A; 3AG3 C; 4FM2 A; 3ZHS A; 2CUG A; 4UV9 A; 4PA9 A; 4DV0 B; 5CA0 A; 1MSD A; 3CCM V; 1FXK A; 2ZIN A; 1Q5O A; 4ZBM A; 1D5N A; 2F95 B; 4I55 A; 3CCJ V; 3SYQ A; 2A79 B; 1H2M A; 3AG3 B; 2F4V O; 3ETQ A; 2E5L B; 3HR0 A; 2E75 B; 2YS8 A; 1XOU A; 2BE3 A; 2L6L A; 4DR6 O; 1URF A; 3D36 C; 1TVK B; 2RQ6 A; 5CMU A; 3OUS A; 1M5I A; 2KB1 A; 3AEI A; 4NTW A; 1YJW V; 4AI8 A; 4WFB V; 4LF9 B; 2YID A; 1M90 W; 4JI7 B; 2CTQ A; 4I0X A; 3APO A; 1N36 B; 5B3S C; 3LNN A; 3VQX A; 4Z2W A; 3L73 H; 1SES A; 4LF5 O; 4DV7 B; 3DGE A; 1K5Q A; 3W7U A; 4JI2 O; 2WA4 A; 4B08 A; 5GW7 A; 3SPH A; 1BQZ A; 2ZT9 B; 3H1H H; 2X6C A; 5D5P A; 4JV5 B; 3MHH C; 4UV8 A; 3SPI A; 4P9P A; 5CBF A; 2YSU B; 4X9Q A; 5EBW C; 5L3C A; 2ZXW C; 2AHZ A; 3B09 A; 3SYP A; 4UCR A; 2YDE A; 5BY1 A; 1NTZ H; 1SQF A; 5LMU B; 1TVK A; 1Q8I A; 4ZOL B; 4H37 A; 2P90 A; 2VWJ A; 1R6K A; 4X20 B; 2ZD9 A; 3I55 V; 3VOU A; 4YHH B; 1K97 A; 1MMM A; 3DC6 A; 1AR4 A; 3D36 A; 5FPR A; 2V4D A; 1SRY A; 1COW G; 1M93 A; 1AI4 A; 1GM7 A; 2Q9L A; 2JRI A; 1FJG O; 5LOV A; 3HKE A; 4WCE V; 3N2G B; 1GN2 A; 2P67 A; 2DYS C; 5L3E A; 4P2Z A; 1I7F A; 3K3W A; 3HKC B; 3SPG A; 3ZN0 A; 5BR8 B; 3P3N A; 1FPO A; 3MAQ A; 4MVZ A; 4NXN B; 3E89 A; 3ZHU A; 1X4T A; 3QTC A; 3BEH A; 4YY3 O; 1SQB H; 2HVJ C; 5L3D A; 4WBN B; 2DYS B; 2R70 A; 4HAM A; 2KQX A; 3QVN A; 4DV5 B; 5IY5 C; 4ZOL A; 3E22 A; 5IT9 N; 4UCS A; 1HNX B; 4X20 A; 3OGC C; 2JEX A; 2AZ0 A; 3ABK C; 5LMN B; 2IJK A; 3CCL V; 3KCY A; 2HG5 C; 1J95 A; 1IBL B; 5IY5 B; 4TUY B; 2CH7 A; 4KFM A; 4DRX B; 2A3Q A; 3BPZ A; 1CPY A; 3ABK B; 3N2G A; 5KX5 A; 5GON A; 3UT5 B; 2PI5 A; 3HKC A; 2UXB O; 3OTO B; 1Y76 B; 3ZJZ A; 1FXH A; 1Q90 D; 1XEQ A; 3OEH G; 4U3F H; 1E1R G; 1JR9 A; 2XOK G; 1FYJ A; 2KKW A; 2JGD A; 4GLX A; 3RYI B; 1HNW B; 1ZSP A; 2Y48 A; 2W6J G; 3JAW B; 1P4R A; 2IJJ A; 4WBN A; 4X88 A; 4PD4 F; 4DR1 O; 4H33 A; 1RPO A; 3M7M X; 3G80 A; 2E76 B; 4B3S B; 1HNZ O; 2DWD C; 2Z5U A; 3A0H Z; 3ETD A; 3BFR A; 2OIG A; 2HJD A; 1US6 A; 1QLN A; 4JAU A; 1DK1 A; 1XRE A; 2HHH B; 3OFN G; 2W0F C; 3CHX A; 4HNA B; 5AG2 A; 3ZCC A; 3FB8 C; 4FIP C; 3JAL A; 4TUY A; 3MDS A; 1R3K C; 5D5Q A; 1OCO C; 3CRC A; 4DRX A; 1HR0 O; 3P30 A; 5KA5 A; 3CXH F; 4CS2 A; 1R73 A; 3CC2 V; 3OTF A; 1K34 A; 2DMX A; 4UXN A; 1B6Q A; 3CEI A; 3WU2 Z; 1KMI Z; 2UUC B; 4FM0 A; 3KKY A; 1AP5 A; 1OCO B; 5LGN A; 3O9O A; 1NVP B; 3RYI A; 3K5O A; 4LP8 A; 4DR2 O; 2UU9 B; 1CP9 A; 3JAW A; 3J7A U; 2B5U A; 3D3I A; 1VQM V; 1KKD A; 4X65 O; 4H44 B; 3BHP A; 4TSF G; 1QHT A; 2PY5 A; 1FAF A; 4J41 A; 4MTO A; 2P7T C; 2QTS A; 3OUF A; 5H5N A; 2E5L O; 4EFB A; 1U97 A; 3OT7 A; 4HZ3 A; 2UUA B; 3B8N A; 4HNA A; 4G27 B; 1WPX A; 1K7D A; 1KYO F; 4LF9 O; 4LWS B; 1B06 A; 2OCC B; 4JI7 O; 2QKA A; 1A32 A; 1Z5W A; 5C93 A; 2HLD G; 3K5M A; 2OCH A; 1THZ A; 2QWQ B; 1N36 O; 4IYH A; 3A0R A; 4CH6 A; 4LF8 O; 5L3G A; 4DV7 O; 1YIJ V; 2FML A; 1IDS A; 3CYO A; 3KZI Z; 1E1Q G; 4LNU A; 4PA4 A; 2UUB B; 1XHX A; 3ZBH A; 1VEW A; 4X89 A; 1VQP V; 4DR7 O; 4XDK A; 1PNL A; 1KB9 F; 1R6T A; 2QWP B; 4JV5 O; 1Q81 W; 1H2G A; 1KBH A; 1OCZ B; 2QM8 A; 3WG7 C; 4TWK A; 2QWN B; 2Y0I A; 1JFF B; 3C3T A; 2EIL C; 1ZUQ A; 2V1D A; 1AJN A; 1AVM A; 2HFE C; 5KHH A; 4BW5 A; 5LMU O; 1F7Y A; 2QM7 A; 3GWK C; 4XDJ A; 1H38 A; 1QLE B; 3T2M A; 3DXR A; 2XTA A; 3JCU Z; 2F4V B; 1BL8 A; 4LWS A; 5LHH A; 4CZZ A; 2EIL B; 3ABL B; 1XBL A; 2WPD G; 3RYH B; 4DK1 A; 2WLL B; 1MSW D; 3TK1 A; 5BZB A; 2B1I A; 4MVO A; 1SET A; 4JYC A; 3W7X A; 4GX2 A; 1BE3 H; 3RYF B; 2ATK C; 5FPO A; 1Y74 B; 1S72 V; 4JI6 B; 1JPX A; 1SZT A; 4TV8 B; 3T1H B; 1SQQ H; 3Q4H A; 5LL6 Y; 3E8H A; 2EZO A; 3JAR B; 4RUE A; 3IC9 A; 5CBH A; 1WNS A; 2B9Z A; 1PNM A; 4L87 A; 4BWA A; 4DYL A; 3L70 H; 1JFF A; 3BRC A; 1GK9 A; 1QVF U; 2D3O W; 4YXW G; 4YJ3 A; 1QBZ A; 1MA1 A; 4DV5 O; 1FFX B; 4LFC O; 2QM4 A; 2MK3 A; 3CJH B; 1HNX O; 5B1A C; 4CH4 A; 4YIP A; 3ZRW A; 2YI8 A; 5KHG A; 3RYH A; 1N8R W; 3G71 V; 2HEP A; 2ITD C; 2Y4U A; 3FFQ A; 2ARH A; 4NR1 A; 3RYF A; 3CCS V; 3OMI B; 1XHZ A; 5B1A B; 3ABU A; 2Q8V A; 1Y74 A; 4HYO A; 2LGQ A; 3CRA A; 4DUZ B; 2QWO B; 3OTO O; 3JAR A; 1U96 A; 1GKF A; 1FJG B; 4D6T H; 4LF6 B; 1TAE A; 3U11 A; 4CH3 A; 2JGU A; 2V7Q G; 1XL4 A; 1FFX A; 4UCV A; 1V9P A; 1EZJ A; 4TV9 A; 1UFI A; 3TJT A; 5CA1 B; 1B3Q A; 5BXZ A; 2F43 G; 3F5W C; 4YY3 B; 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4DR2 B; 1I08 A; 4FLZ A; 1WP8 A; 3RN4 A; 4X65 B; 4OPH A; 3T1C A; 3P3P A; 1L0N H; 2PTM A; 4YIO A; 4IIJ B; 1YEW A; 4JI0 O; 1K5S A; 4ZKI A; 4Q6G A; 4U7N A; 1RPR A; 2LP7 A; 3QNE A; 2QE7 G; 1S76 D; 1YCI A; 2GHY A; 3RWR D; 3VQW A; 4G2K A; 4U3J A; 5KA6 A; 4DR5 B; 1KUQ A; 4JI6 O; 4FLV A; 2AXT Z; 3T1H O; 3U10 A; 5JH7 A; 3IC7 A; 1Q86 W; 1S5J A; 4MS2 A; 4LF8 B; 4QPK A; 1N32 B; 4RAI A; 4IGG A; 4PDL A; 4X1Y B; 2M6Y A; 1XMQ B; 5KAF Z; 4E4E A; 4DO2 A; 4F6E A; 4JTD B; 2CDY A; 1I94 B; 2IM9 A; 4XBF A; 3CB2 A; 2OYQ A; 2A7W A; 3SJA C; 1PM9 A; 3B40 A; 4ABM A; 4DR7 B; 2E3C A; 1NH2 B; 1TGO A; 3CC4 V; 4BW9 A; 2EIN C; 4LF4 O; 4IIJ A; 3DSQ A; 3ZIA G; 1AI7 A; 2LFS A; 5IJ9 B; 2Q4P A; 4OPA A; 2ZDI A; 2ZM6 O; 2EIJ C; 5FNV B; 3S3X A; 2XAJ A; 2WWW A; 3H01 A; 1BZK A; 4DUY B; 3DTU B; 1R3I C; 2NLJ C; 4JI3 O; 2EIN B; 4DV1 B; 4RWU A; 4K3A A; 4UB6 Z; 2C2A A; 2EIJ B; 2WLJ A; 4DUZ O; 4GCZ A; 2YI9 A; 3RBZ A; 4G28 B; 3SJB C; 4WFA V; 4O4J B; 1ORQ C; 3ZRS A; 4FPP A; 3HB3 B; 4X1Y A; 2PF4 E; 4X1K B; 2OIE A; 4LF6 O; 2QJ1 A; 1R6N A; 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