3H1VX

Human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
446
structure length
446
Chain Sequence
MVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title The design and optimization of a series of 2-(pyridin-2-yl)-1H-benzimidazole compounds as allosteric glucokinase activators.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 172
structure length 446
sequence length 446
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h1vX02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3h1vX01
4RTFD 5B8HA 4PL7A 4BRMA 3L4IA 1NGFA 2J4RA 5BREA 2CGKA 4ISFA 4FWRA 4XH4A 4GY2B 3FZHA 1X9JA 5AQSA 1BU6O 1K8KB 2V52B 2Q2RA 1Y64A 4CD1A 2E8AA 3D7EO 3O6WA 3H1VX 1T44A 2A5XA 3VGLA 4E1JA 2E20A 1YUWA 3OHRA 1Q18A 1OKJA 1V4SA 4FWOA 3S41A 3VGMA 4Z94A 1S3XA 3RSEA 2AP1A 3CERA 3EN9A 4H5RA 1U2VA 1ZXOA 3CJ9A 4H0XB 4I6MA 2CH5A 2VYPA 2CGJA 1Z6RA 1LCUA 2W40A 2E1ZA 3IDHA 3LDLA 3MN6A 4H5VA 4EIAA 3JXUA 2IIRA 4RWTA 5BRHA 4WQ4C 5AFUA 1NGGA 2PBDA 4AM6A 3AAQA 4XH1A 3ATUA 4FWNA 4IJAA 4BG9A 4PKHA 3P4IA 1NGJA 1ZBSA 1G99A 2HMPA 1K8KA 5LY3A 3H1QA 1WOQA 2CGLA 3UKUB 5KPTA 3MN7A 3DAWA 3KVGA 1YAGA 5AQGA 3O1BA 1QQNA 3TPQA 4FWMA 4RCHA 3H6EA 4M7YA 4CBUA 4A2AA 3LDNA 4MO4A 4H0VB 1SAZA 3EL2A 2YI1A 3J8AA 3VEWA 1SZ2A 1QZ6A 4NO7A 3D2FB 1KAZA 2IVNA 4BVOA 2D1KA 2H3GX 3ID8A 2A3ZA 1GLDG 3GDQA 4FL9A 5KPRA 1BOTO 2ZWHA 3IMXA 1BDGA 4F9OA 5EX5A 4CZHA 4BRAA 2QWPA 4DB3A 3SMPA 3BUZB 3UKUA 3LDOA 3ZETB 4BRHA 4IWVA 5BPLA 4BRKA 4B1WB 1HJOA 1QQOA 1BA0A 3FGUA 1NGCA 5F0XA 3WQUA 2OANA 3VGKA 4JD2B 5AQUA 3MDQA 3SMSA 4B1YB 3F9MA 3D2FA 1GLEG 5AQZA 3FLCO 3WUHA 4XEIA 4BRCA 2NLXA 3U9DA 3C7NB 2YJFA 1NMDA 3ATVA 3HBTA 4H0TB 1V4TA 3EO3A 2Q36A 2KHOA 3CQYA 3TU5A 1X3MA 4CBWA 3U8XA 2I7PA 3C0BA 2FSNA 4XH5A 5FPMA 2QWMA 3VF4A 3ZETA 4WQ4A 1HLUA 4NB4A 3CIPA 3DWLA 3H3NO 3EKUA 2ZGYA 2YCHA 5FPEA 2NZTA 3ULEB 4BR4A 4QS9A 5LJWA 2P9NB 4JD2A 1RDWX 2E2QA 1HUXA 4C23A 2P9IB 3FZKA 3L6QA 4IJNA 1ATNA 1NGIA 3R9PA 3VOVA 3WXJA 4HTLA 3A5OC 2P9PB 4MLHA 4O5FA 3W3DA 3WXKA 4BRDA 1XUPO 4FO0A 3ENHA 3LDQA 5AQTA 5AZIB 2GWJA 5ELZA 5EXWA 2QWNA 3C7NA 4BR9A 3UE5A 4BRGA 4DQ8A 4K41A 5EY4A 1XC3A 4BR0A 1TYQB 5JLFA 1BO5O 1S22A 1NGAA 5FPDA 1T6DA 3ZEUB 2P9UB 1NGDA 3H3OB 1C0GA 1MDUB 1GLJO 4JNEA 4FPAA 5E84A 2UYTA 1X3NA 3BEXA 3ULEA 3IUCA 3FR0A 3O80A 1TUUA 4Y0WA 4BGBA 4BRFA 3H46O 5AZJB 2VCPA 2I7NA 2P9NA 1CZAN 1NGEA 2P9IA 3QFUA 4B1UB 4H5TA 4BQLA 4JHDB 2P9PA 2P9KB 4LC9B 5AR0A 2A6AA 1SQKA 4FPBA 5AZIA 2ASPA 2BUPA 3ZX2A 2E2PA 3BF3A 2HOEA 1TYQA 3H45C 2GWKA 5AQHA 2QXLA 3MCPA 3ZEUA 3CJ7A 1ESVA 2P9UA 1MWKA 4WQ5C 3CHWA 4BQZA 4CZMA 5AQPA 2HF3A 3FZMA 5AQQA 2V7ZA 3UB5A 2HF4A 5TKYA 3A5LC 1TUYA 5E26A 5AZJA 1HX1A 4IO8A 3U4LA 3L0QA 3LDPA 2Q31A 1ATSA 3FZLA 3AY9A 4H0OA 4JHDA 3KHYA 5BRDA 3O1WA 4M7XA 1BG3A 2P9KA 4H0PA 1GLBG 3BP8A 4BROA 2V51B 2GELA 3CQXA 5AQIA 2QWRA 4H03B 4BREA 4YDUC 3LM9A 4FWQA 3WXIA 3AAPA 3GG4A 2F9TA 4BVPA 1ATRA 5ADXH 3QFPA 2QWOA 3ZX3A 4BRIA 5BN9A 3O4WA 5AQOA 3QMLA 4BC4A 2D0PA 5AQNA 3GBTA 1E4GT 5I9EB 1GLFO 2ASOA 2IVPA 5AQYA 4CBXA 4EHUA 2EWSA 3EKSA 4BC2A 4CZFA 3I8BA 4J8FA 1NLVA 1HPMA 4FOEA 3LM2A 2ZGZA 3O08A 2QWQA 4B1XB 1J6ZA 1BWFO 3GOIA 1BA1A 1LOTB 1JCGA 3A5MC 3JS6A 1QQMA 3VEVA 2D4WA 4QS7A 3MMVA 3B8AX 2F9WA 4GNIA 5BN8A 1NBWA 3CJBA 4BGAA 2A41A 5EVZA 2YHXA 1NGHA 2E2OA 3I33A 3WQTA 4H5WA 1JCEA 3SLCA 3MN9A 4BRNA 4EHTA 3A8YA 4WQ5A 1JCFA 4JAXA 3CJAA 3VF6A 2FLOA 4IXCA 3SJHA 5JMVA 2Q97A 1HKGA 4BRPA 5BPNA 4BR7A 4CZLA 2IVOA 5AQMA 2FSJA 5AFUH 2YHYA 5FPNA 3FZFA 4CJ7A 1RFQA 3R8EA 3QBWA 3O5BA 5F2RA 1RGIA 4YDUA 1D4XA 5KQDA 2CH6A 4BC5A 4BG8A 2ITMA 1NWKA 3BF1A 4B9QA 3CETA 4CD3A 3M3ZA 2GEMA 3VETA 1P8ZA 5EOYA 3QICA 4WYBA 1DGKN 1T6CA 4H0YB 1DKGD 3QB0A 3WEEB 5JICA 1WUAA 4FWLA 3VENA 5CE3A 4ISGA 3VEYA 2FXUA 4AM7A 3A5NC 3QBXA 3CI5A 4BC3A 4CZGA 5AQFA 3WXLA 4PL8A 5LJVA 1HKCA 3IFRA 2P9LB 2P9SB 2ASMA 2YJEA 3AARA 3FE1A 3WT0A 4FWSA 4FWKA 1NM1A 5KQ8A 2AA4A 1U6ZA 4FWPA 4CZEA 5BRFA 4PKIA 2FF6A 2QWLA 5AQLA 2QM1A 1YXQA 3M6GA 4JN4A 4MO5A 2E2NA 2NRHA 4EFHA 2QW9A 3WEEA 2FSKA 3GE1A 5BR9A 1KAYA 3EZWA 2BTFA 3HM8A 1BUPA 3HI0A 4ISEA 2ZF5O 4MLEA 4CZIA 2VWBA 1EQYA 4CZJA 4DCHA 1IJJA 4L3QA 2Q0UA 4A62A 3UKRB 2P9LA 3D2EB 3VESA 2P9SA 1XQSC 2FF3B 2PAVA 4PKGA 3DJCA 3QDKA 4KBOA 5AQKA 3VF2A 3DXMB 5KPZA 3A0IX 2E88A 3R6MA 2A40A 4FOIA 3VERA 3W0LA 3DXKB 5AQRA 1ZC6A 3SK3A 1E4FT 3ENOA 1HKBA 4BRLA 1YVNA 3HTVA 4K42A 1KAXA 4A61A 1MWMA 3MN5A 3CJCA 1MA9B 4M63C 3HSCA 2GUPA 2E1YA 2V7YA 5AQWA 3M1FA 4CI6A 1GLAG 1IG8A 2Q0RA 3UKRA 4B1VA 4DHYA 1Z05A 3D2EA 3VPZA 2DPNA 5BPMA 4H5NA 4EAHD 3MK6A 2GTDA 2WUSA 1KXPA 4BR2A 3VEXA 4K25A 3HZ6A 5F1XA 3DXMA 1H1VA 3G25A 5ADXA 1R59O 2D0OA 4O8KA 1GLLO 3DXKA 4QS8A 1QZ5A 4A2BA 4BRQA 4HWIA 4IZ9A 3U9ZA 5AQVA 3VEOA 3GL1A 4BR5A 3VEZA 3O8MA 3CJ1A 1QHAA 3KZBA 4B1ZA 1DEJA 4CZKA 1NGBA 2A42A 5AQJA 1GLCG 3LL3A 2Q1NA 2YHWA 3RSEB 3ZX0A 1U2VB 4K43A 4FSVA 2W41A 1C0FA 4I6MB 5AQXA 5JLHA 3FFKB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5B8HA 4PL7A 1CXUA 4M3RA 1OH7A 4W5RA 1NGFA 5BREA 2CGKA 4FWRA 4N76A 4KREA 1RT6A 4GY2B 1T8EA 4C8OA 2NRWA 1K8KB 4CF0A 2V52B 2Q2RA 2E4LA 3AO1A 1T44A 3HT3A 3DLEA 3I55N 3EE9A 1YUWA 3J7YP 4BDZA 5IWAK 1RT3A 2IDOA 4H5RA 1B9DA 1NJZA 2WTUA 1XWLA 4I6MA 4WE1A 1LCUA 3QEPA 2E1ZA 4J2EA 4M3ZA 3DYAA 2OTJN 3VQ9A 3AAQA 1IKWA 3NVMA 4BDYA 3SBGA 5J1EA 2GX9A 3PV8A 1KFSA 1G99A 2HMPA 3H1QA 1J5OA 3AGKA 3G0ZA 3UKUB 5GIPA 4DKWA 3O1BA 1N36K 4FWMA 4FJ7A 3LPTA 4CBUA 5GADP 1KRPA 1J5EK 3OYCA 4DSKA 1CZ9A 1SZ2A 3OYJA 4FJ8A 2NUBA 2A1SA 2O8DB 2R7YA 5DMRA 3CCRN 1GLDG 4DG1A 4FL9A 3VA0A 1K73O 1BOTO 3THVA 3S3NA 4N56A 3IMXA 4JKHA 1KVBA 3LDOA 5BPLA 4R79A 4B1WB 3DLRA 1QQOA 1NGCA 2O8FB 4PY5A 3WQUA 2OANA 3CM6A 3M8RA 2JGUA 1BCOA 4CIEA 3MDQA 5C42A 3NF7A 4DQQA 4GKKK 5AQZA 3F73A 3U9DA 3VQ6A 3HBTA 3AA4A 3ATVA 4ZTJA 2RN2A 5KRSA 3PUFA 1X9WA 4BE2A 2PFUA 1QE1A 1U4BA 1O1WA 3ZT4A 3DWLA 4CJVA 2ZGYA 5FPEA 3KJVA 5CYQA 4FZXC 5LMUK 1HR0K 4JD2A 3FZKA 4IJNA 1ATNA 3R9PA 4DSJA 2ETJA 4M3XA 4IG0A 4CHOA 3DLGA 4BRDA 3RMAA 1VHXA 1KCFA 3WXKA 4F2SA 2OZMA 1XUPO 3U6FA 4O8UA 2X6SA 4CIFA 5AZIB 2GWJA 3C7NA 4H4OA 4BR9A 4CHYA 2HB5A 1LAVA 4K41A 1TYQB 4AHVA 4CJFA 3DOLA 4CEAA 3BY5A 5JVGL 4DV2K 2BH1A 5DM6L 3HXMA 1LW0A 4KO0A 2P9UB 4DMNA 1XC9A 4AHUA 1RDAA 4DS4A 3ULEA 3O80A 1TUUA 1XNRK 5AZJB 4CGHA 1YI2N 2G8IA 4GMJB 1CZAN 4FCYA 2YKMA 3OBYA 1KQSM 4DV4K 3OW2M 1VQ7N 2P9KB 4LC9B 2JWLA 1SQKA 3QINA 3E1YA 2E2PA 4O44A 1HYSA 3BF3A 3P31A 5AQHA 5BR8K 3ZEUA 3CJ7A 2UU9K 3CC4N 1YT3A 1LWEA 3CHWA 4TSXA 2GUIA 4OLBA 5AQQA 2V7ZA 2HF4A 5TKYA 3A5LC 1WNSA 5E26A 5HLFA 3OA9A 4IO8A 1U49A 2HHHK 2VG7A 1N5YA 4H0OA 3MWTA 4JHDA 4DTUA 3CMAN 3O1WA 4O0IA 4H0PA 1GLBG 1FKPA 4HTUA 3PIOL 2V51B 3THWB 3CQXA 5M1NA 4LH4A 1K9MO 4B3MK 3CFRA 4YDUC 3TAFA 2XRIA 3WXIA 3NE6A 3GG4A 2F9TA 5ADXH 3QFPA 5C10A 1JL2A 3MXJA 3O4WA 3E9PA 2D0PA 4DSIA 3TI0A 3ZT0A 3C95A 3M8SA 1GLFO 2ASOA 1MU2A 4CBXA 4CJQA 4EHUA 4BACA 1BCMA 4O5BA 4M3TA 4M41A 1TL3A 2BGGA 3EZ5A 4LY7A 1Q82O 4B1XB 1J6ZA 4EZ9A 1BWFO 1D9DA 3GOIA 4KHNA 2VG6A 3NH1A 1LOTB 3A5MC 2FBXA 4J2DA 2VWJA 3AVBA 4JKGA 3VEVA 1IBMK 3OYDA 4QS7A 2F9WA 3RR8A 3L8BA 4E7JA 1NBWA 2IOCA 4KV8A 3ZCMA 2A41A 1NGHA 2E2OA 3SLCA 4EHTA 4FZZA 2WONA 3CCQN 2UXBK 4W5OA 4JAXA 3CJAA 3KK1A 2FLOA 1VSJA 4LFCK 2O8EB 1HKGA 1NK7A 1GOCA 4BR7A 2IVOA 4I7FA 4DFJA 4OJRA 4DU4A 3RRHA 1FK9A 5F2RA 1S6QA 1KLMA 3ID6A 1RGIA 4YDUA 2G8HA 4CF8A 4L8RB 1VSHA 1XHXA 3SAFA 4B9VA 4CEBA 3RMCA 4JS5A 2KQ2A 4FVUA 5HRSA 3KD5E 1VSFA 2DY4A 3M3ZA 4HUFA 3VETA 1P8ZA 5J2QA 3QICA 1S72N 1NJXA 3WEEB 5JICA 4FWLA 1EWQA 4IDHA 2XY5A 3C65A 4DR2K 2NNWA 3D45A 2UXCK 3SUQA 3WXLA 4PL8A 3QESA 4CESA 4HUEA 2ASMA 1EX4A 3U3GA 1NM1A 2AA4A 5HROA 1U6ZA 1REVA 2KLAA 4FLWA 1L3SA 4CZEA 3SQ2A 2O8CA 4PKIA 5AQLA 1M1KO 1YXQA 4F3TA 1S1XA 3AVFA 4AHTA 2KZMA 1YHQN 1NK4A 4YNQA 3AO3A 1ZBLA 3ZSZA 4CK2A 2YX6A 1S9GA 4ISEA 3V9XA 2F96A 4MLEA 4IFYA 4Z4IA 2VWBA 4E7KA 3T1AA 5JS1A 4G9ZA 4DCHA 1CZBA 1Y97A 3AVMA 2O8BB 3UKRB 1WAJA 4AF1A 1VQ9N 4FJKA 3CD6N 2FF3B 4DQRA 1RCHA 3DJCA 3QDKA 4OLAA 1C0UA 3CCEN 1D9FA 5GINA 1RT2A 5KPZA 3W0LA 1HRHA 3NGIA 4BRLA 4DQIA 1YVNA 1NJYA 3OY9A 2XHBA 3L2VA 2Z1HA 4KTWA 3VQCA 1MWMA 2OPPA 3WXMB 1A5WA 2V7YA 3M1FA 1KLNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1DTT A;  2HVI A;  2P9S A;  4CGG A;  4W5Q A;  4DTR A;  4ZHR A;  4CJK A;  4IOC L;  3OS1 A;  3DXM B;  3OBW A;  1ASV A;  2DFH A;  3R6M A;  4FOI A;  3NBP A;  3ZLJ A;  3ZSW A;  3CCV N;  1E4F T;  3CCJ N;  3M8Q A;  2EX3 A;  4NYN A;  2G8V A;  1KAX A;  2XO7 A;  4A61 A;  3HL8 A;  3CJC A;  4CJ3 A;  4RW8 A;  2E1Y A;  3S3M A;  2PZS A;  3L3V A;  1HQE A;  2ZJQ L;  1RBV A;  1GLA G;  1IH7 A;  2Q0R A;  4B1V A;  3D2E A;  1DTQ A;  3K9J A;  4JRQ A;  4DLG A;  4KB0 A;  4B9T A;  4DLE A;  4B9U A;  2ZM6 K;  1SL1 A;  3KWG A;  4CF2 A;  4JI6 K;  3VEX A;  4MQ3 A;  5F1X A;  1D8Y A;  3OJS A;  4A5A A;  3Q7C A;  1R59 O;  1I39 A;  2D0O A;  4O8K A;  1GLL O;  1QZ5 A;  4Z0U A;  3SJJ A;  1GOA A;  4CER A;  1QTM A;  3CJ1 A;  3TSU A;  2VQE K;  5K14 A;  4GV9 A;  3V1R A;  1S9E A;  3JYT A;  5M1F A;  3RSE B;  1L3V A;  3NVK A;  3NFA A;  4FSV A;  1C0F A;  4IG3 A;  5AQX A;  3FFK B;  2YNF A;  4G1Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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