3H30A

Crystal structure of the catalytic subunit of human protein kinase ck2 with 5,6-dichloro-1-beta-d-ribofuranosylbenzimidazole
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
333
structure length
333
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLYQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Casein kinase II subunit alpha
publication title The CK2alpha/CK2beta Interface of Human Protein Kinase CK2 Harbors a Binding Pocket for Small Molecules
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 108
structure length 333
sequence length 333
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-04-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3h30A01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3h30A02
5AP2A 4M97A 1JPAA 4CTCA 3IW8A 1SZMA 4LL0A 4EH5A 4UB7A 5HE1A 5A4LA 3PJ1A 3NVKI 2Y6MA 4EC8A 4RVTA 3FI3A 2JEDA 4IIRA 1ZYCA 3TNWA 4ZJJA 2X1NA 3JUHA 3ZYAA 1B39A 3QTRA 3LJ1A 5HHWA 2Y4IB 2W5BA 4U7ZA 2F4JA 4HZRA 5DT3A 3T9TA 4UN0C 1OBGA 3QRJA 5AUVA 2XF0A 4FSWA 4JT3A 4ZS4A 4E20A 2C6OA 3SGCA 1PXLA 2XH5A 4IWOA 2VTMA 5IA5A 3JY9A 3BE2A 1R0PA 3PVBA 2XUUA 3JS2A 1JKTA 4EUUA 3R0TA 5L6OA 3SG8A 4BTKA 4DEBA 4BIEA 1J7IA 4FTOA 5I5ZA 2W1FA 1PW2A 3GVUA 1OKWA 3I0QA 4CFFA 5F9EA 1OL2A 4GL9A 3QZIA 3AMYA 3RCDA 4CVAA 4O7YA 3R83A 3Q4TA 3OCGA 2VTRA 4IAFA 5BUJA 4ZTQA 4NU1A 3F6XA 3VQUA 4EH6A 2HELA 4PPAA 2GNJA 3HMNA 3G2FA 3QZFA 3IG7A 3SDJA 3B8RA 3M11A 3O8TA 1PXKA 1ZRZA 3AGMA 3KL8A 4XG9A 3RM7A 4FVRA 4BKYA 3HYHA 1SYKA 2VRXA 4A9RA 4U41A 1JSUA 4E5WA 5IMEA 3PVUA 3LFSA 3KXMA 3DBDA 1ZARA 3ET7A 4X3FA 4ZTMA 4RVLA 3O23A 4XBUA 3ZC5A 4I0RA 2XNOA 3QKMA 4QD6A 4XRJA 3UOLA 4APPA 2JKKA 2G2HA 2XIYA 3GFEA 3H9FA 4JLCA 4R3PA 4W4WA 3VUHA 5GZAA 4MXZA 5E1EA 1XBBA 4YJNA 4ACHA 1Y6BA 5DWRA 5E90A 4NW6A 4M8TA 5F4NA 2H6DA 3PA3A 1M52A 4TPTA 2PMNX 5LMAA 1WBPA 1UU9A 4X6QC 4O7VA 1YOMA 1JOWB 2JBOA 4IZAA 5D11A 2IZRA 2AYPA 1U59A 3DKFA 4N0SA 5HVJA 4FEUA 1KSWA 4ZTRA 4JQ8A 3DAJA 4NM0A 2WQEA 4GK4A 4Y73A 2C4GA 4I6HA 5BUIA 3CD8A 4AT5A 1BI8A 1OL7A 3BQRA 4YHFA 2WU7A 5FLFA 4YP8A 3RPYA 3ATTA 2QO2A 5CVFA 5EG3A 4HVIA 3Q4CA 2J0IA 3FKNA 2J0MB 2YAKA 4PTEA 3O7LB 3BGZA 3HDNA 3P79A 5CEMA 4NYEA 5EQEA 2VTTA 4X3FC 4BY9E 2RSVA 4E7WA 1M2RA 1CSNA 2HZ0A 2DWBA 3DA6A 3LXPA 3EQRA 3KN6A 4MX9A 3MPMA 4X2FA 2ZV7A 2BFYA 5E4HA 3V51A 3FMLA 4JNWA 5K4JA 2R3NA 2R3QA 3H30A 4C37A 3WIGA 4I23A 3VRYA 3A99A 3K3JA 2Q0NA 3GFWA 4DINA 2WMBA 2QG5A 2YFXA 3I1AA 3L8SA 5AJQA 5BMMA 5IISA 4ZTLA 4ZAUA 4NL0A 1OKYA 3BBTB 3ORTA 4W9WA 3FYJX 4B6LA 3TIZA 4DG0E 3Q04A 4G5PA 3OCTA 2YLFA 5CEKA 2GHLA 1FGIA 2XYNA 2W5AA 3E92A 1IG1A 1PXPA 3I6UA 3KXNA 3TN8A 2ZM4A 3D14A 3MIYA 2JC6A 3CS9A 4P4CA 1PKGA 2RFDA 2YAAA 2NRYA 3QTUA 2R9SA 2BRNA 4FV3A 1XH5A 4CFVA 2PYWA 3Q9ZA 4C8BA 2BDJA 2VX3A 2F49A 5CWZA 4UWCA 3PVGA 2RG5A 4AG8A 1SVHA 2OU7A 2V62A 4C0TA 2AC3A 2VTQA 3PY3A 3AQVA 3QWKA 4WRSA 3I79A 5FTQA 4F1MA 5FDPA 3FL4A 3MN3A 4BWKA 4JBQA 4D9TA 3N4TA 2QU5A 2B52A 3QCQA 4W8EA 2HY81 2UVYA 5JK3A 4LGHA 5KNJA 3C9WA 3BYMA 3TL8A 2IZUA 3H9RA 3HV5A 4IWPA 4RBLA 2F2CB 2UW5A 3O51A 5DG5A 3W2SA 4RGJA 3EQDA 5B2MA 2C3IB 4R3RA 3HUCA 4J53A 3OW4A 2PUIA 4M0ZA 5HCXA 1GIHA 2JKQA 4WUAA 4K2RA 3TUDA 5G6VA 5F20A 4HNFA 2PTKA 1GZNA 4BIBA 2C6TA 2GHGA 3BBWA 2O5KA 2J5EA 1OVEA 3AC4A 2VWXA 3HDMA 5KO1A 2B9JA 2GQGA 2C5OA 3MW1A 2ZB1A 1OL1A 3OF0A 3I5ZA 2DS1A 3RWPA 3ZZWA 4B9DA 4F6WA 2Y7JA 3GBZA 3U54A 2ACXA 3BU3A 3WE8A 3DB8A 4FEVA 3Q32A 2RGPA 4X6RA 4IEBA 4PPCA 4ONAA 1XH4A 5IH6A 3EFJA 2JDTA 3WF8A 1ZY5A 2BR1A 3L8PA 3E8NA 3QCSA 2IVSA 4UYNA 1IAHA 2ETKA 3QKLA 5IQAA 3DJ7A 3TKHA 3UIUA 1PF8A 5J9ZA 4P7EA 2CHLA 2WEVA 3QU0A 4PNIA 2YCRA 4KB8A 3RGFA 3KRXA 4NT4A 4FNZA 4G3CA 3HL7A 4YBKA 2IG7A 4IADA 4YURA 1Z5MA 4QT1A 3ZU7A 5LQFA 3VW8A 4TYEA 4E3CA 3PY1A 3GI3A 3HV6A 4H1MA 3FWQA 2GU8A 4YC6A 2GDOA 3OUNB 4O6LA 2XK3A 3RAWA 3LFCA 2YWPA 4PNKA 1P5EA 4RZWA 1IEPA 2Y9QA 5DA3A 5IPJA 4EBVA 2BRBA 2X2MA 4RX5A 5FUTA 4FTJA 3ZHPC 4DEHA 4EOJA 4GU6A 3ODZX 5AV1A 4RFZA 5E8WA 4BVUA 1Q8UA 4D28A 2C0OA 2J7TA 2C6MA 2J4ZA 2X4FA 4MXYA 4EH2A 4IAYA 4FUXA 3CGOA 3U6HA 2V5QA 3PA4A 4ZOGA 4A9TA 4ZMEA 5HIBA 4FTTA 3UYTA 1P14A 3IONA 5L8JA 4E73A 3MESA 3GC8A 1XH8A 4I5MA 4MVFA 5HE2A 4FKIA 5A4TA 5HG8A 5C26A 4GT5A 5AP0A 1OL6A 2R3JA 5J8IA 4FT3A 2LAVA 4OTQA 2CGVA 3JVSA 5C27A 3DNEA 3LMIA 4GJ3A 4KRCA 3THBA 5DPVA 2GFSA 4FSRA 2BCJA 4ALVA 2C6DA 2WEIA 1RQQA 4F0IA 4II5A 4W4YA 5CANA 2XZSA 4TXCA 4HVHA 3SD0A 5M4IA 1OI9A 3R9DA 4PTGA 4H3PA 4RLLA 2XKEA 1UWJA 2PVJA 4JQEA 2WTWA 3TUCA 4NEUA 5C4LA 4KBAA 3E63A 3KRRA 1PMUA 4FG9A 4GT3A 3EL7A 4LOOA 4XG3A 3QRKA 4D2WA 1W8CA 4OAVB 4ZY4A 1FVTA 4BFMA 4GUBA 4GVJA 2GS6A 2C1BA 3QD0A 4TRLA 1YOLA 4EQUA 5AP1A 4E8AA 4O7ZA 5HTCA 1F5QA 4ASDA 1GOLA 4EORA 5HD7A 5AV2A 3UPXA 4Q9ZA 2BAJA 3T3VA 2OIQA 5C8NA 3M1SA 1U5QA 4PWNA 5EW9A 2C3JA 1ZAOA 4F9YA 4ERWA 4EYMA 1UKHA 4JVGA 3Q6WA 5CYIA 1URWA 1V1KA 4G6OA 3P08A 4BIDA 3G9NA 3QXOA 4IBMA 3E93A 3KXGA 3TZ7A 3Q4ZA 3ZCLA 4KIKA 2C1AA 2WQBA 2QOOA 4UY9A 4EH8A 1U54B 3LQ8A 4RJ4A 2RG6A 3ZBXA 4AGUA 4F70A 3QQFA 3ZXTA 3LXNA 2OF2A 4RC2A 5H9BA 3R71A 1NA7A 2F7EE 2J6MA 5HNGA 4QYHA 1ERKA 3IGOA 4MF0A 4D1ZA 3DLZA 4ZJIA 5HD4A 1WVWA 2ITVA 4BZNA 3FLNC 4LUDA 2HWPA 3O96A 3IW6A 4D1XA 4CG9A 4R7BA 3Q9YA 4NWMA 3DB6A 4A4OA 3ORNA 5EI8A 3KMMA 4ARKA 2OBJA 1W82A 4FL1A 3UNZA 4AE6A 3VUIA 3ZM9A 4BI1A 1W83A 3DT1A 2WMWA 2QOQA 3IDBA 3QXPA 4X3JA 4PL3A 1A06A 2FO0A 4RJ8A 4EWHA 4EWQA 2KTYA 3O7LD 3VC4A 3AMAA 3KREA 5EYDA 4PF4A 5CAPA 3DNDA 5A6OA 2V22A 5KCVA 4LMUA 3ENHA 4QMMA 1CKIA 3ANRA 5FQDC 5CXHA 1H00A 1XBCA 4FL2A 4QYEA 4BBFA 4XOZA 4DITA 3W1FA 3SOAA 1FMKA 3NW6A 3SXRA 3UOKA 5FM3A 3IOPA 2GNFA 3A4PA 2CJMA 5ETCA 5CX9A 5AAGA 2G2IA 2VTIA 5I9WA 1GZOA 3MJ2A 2QOCA 4NFNA 1H0WA 3M42A 3WIKA 1FVVA 4MQ2A 3QKKA 4JL9A 2QHMA 5I9UA 1YW2A 2CN5A 4J97A 3OCBA 4ACCA 4YTCA 2DYLA 5BVDA 5CT7A 3NX8A 3OBGA 3O71A 4F08A 5JFSA 5L4QA 4DCEA 3R21A 5HVYA 3R7YA 5DR9A 3FQHA 2XRUA 4PMMA 5AM6A 3TJDA 2WTKB 2JITA 2CLQA 4M69A 1XKKA 4J95A 3RINA 1BI7A 3PRIA 3SRVB 4LGDA 4AZSA 1MRYA 3QTXA 4CKIA 2P0CA 3EQHA 3A62A 3R7VA 5FD2A 4D4VA 3A7IA 1BYGA 1W7HA 4O0SA 4QRCA 3TG1A 3PJ2A 2PZ5A 4Y5QA 5HESA 3DK7A 3R1SA 3LIJA 2A1AB 3BLQA 4D4YA 3FAAA 2PVRA 1GJOA 3MBLA 3NUNA 2ITNA 3FZ1A 4X7QA 1XO2B 4AXAA 5J9YA 5K5XA 3QHWA 4EQCA 4GJ2A 2NNWB 1GY3A 4MCVA 5A46A 1FOTA 1URCA 3A7FA 4YGAA 5AIKA 4ENYA 1YHSA 3V6SA 2UUEA 2R3FA 5EYMA 4ACGA 1K2PA 1KE8A 1AD5A 4YHTA 4FSNA 5KMOA 1TQPA 2BZKB 3OUKA 4HZSA 2HAKA 2BTSA 5FTOA 3PA5A 2HW7A 4L7SA 2YM5A 2OLCA 2J5FA 4QP9A 4BBEA 1X8BA 3ERKA 5CAOA 5AUXA 3RHKA 4DYMA 5HBJA 4RQVA 3RZBA 5C8MA 5LXMA 4FTKA 5HBEA 3DXQA 2CNUA 2QKWB 4M14A 4O84A 4WD5A 4FODA 2XNPA 5E8ZA 3FZTA 3RPOA 4IZ7A 2XK6A 2PE1A 1H1PA 3N4VA 3NRMA 3C4EA 2R0UA 5JRQA 3CKXA 3KVXA 5AP7A 4C3PA 1DAYA 3OY1A 2UZOA 1Y6AA 2WAJA 2XVDA 3E7OA 4RSSA 4RIYA 3UBDA 4C59A 1JAMA 3OCSA 4O1PA 4BKZA 4O0TA 3E8DA 3KQ7A 4DEAA 3HRFA 3PSDA 4D2TA 3DJ5A 3S2PA 3ULZA 4F0FA 2W9ZB 1KV2A 2B9IA 2ITQA 3DCVA 2UW7A 4CZTA 5HO7A 4KSPA 4X2NA 4L42A 2IN6A 3BHVA 2RFEA 4ZSGA 1Y8YA 2R3OA 1YKRA 3QQUA 4GVAA 2BDWA 2OJFE 4G3EA 4A4LA 4Z3VA 3HV4A 4BDEA 4EZ7A 2WFYA 3LFFA 1BX6A 4GK2A 3VHKA 2P2IA 4CFNA 4YR8A 4PUZA 4ASXA 4USEA 4WNOA 2I0VA 3OTUA 1KE6A 3C4ZA 2I0YA 4RX9A 3VBTA 3GCPA 3WZKA 4HYUA 2ITYA 4QP3A 5AR7A 3IGGA 2X4ZA 5FWKK 3BZ3A 4DFLA 3OFMA 4WT6A 4RT7A 4L44A 1JVPP 5F95A 4JRNA 4CXAA 4HNIA 4DGGA 1UU7A 2ZDUA 3GU6A 2A0CX 2O65A 2JIVA 4FKTA 3BV2A 3E3BX 4FTQA 4J1RA 4DEGA 4EZ5A 3QQKA 4YLKA 3DU8A 5EFQA 5EHOA 3LJ2A 2VZ6A 4XV3A 2HK5A 3R8VA 4OBOA 3COKA 2XJ1A 5AUWA 5A6NA 2UZUE 3LW0A 5GNKA 4ACDA 4FTIA 2XB7A 4L53A 2OFVA 3ZRKA 1Y57A 3MH1A 4ZY6A 5HU3A 4KD1A 1PRYA 4MXOA 3QC9A 4FSYA 3V8WA 2HIWA 2VWBA 3C0IA 1YI4A 3DLSA 5E9EA 3DDPA 3OVVA 2VO6A 1VYZA 4FBXA 1Q3WA 5AR3A 2FB8A 4EL9A 4U44A 2OWBA 2JGZA 5M07A 3ZSGA 4JI9A 2O0UA 3F2NA 2QO9A 3PSBA 4M12A 2BRGA 4GKHA 3UPZA 2FA2A 4L6QA 3PG3A 3B2TA 3DK3A 4F64A 4XJ0A 4AGWA 2BUJA 3F88A 5C01A 4YZMA 2PWLA 4JS8A 3PXKA 5CT0A 1QPEA 4DBNA 3R8UA 3VBVA 3AT3A 3ZZEA 2OZAA 4JG7A 5E1SA 3NIZA 4CCBA 3FLZA 2XM8A 3FHIA 3UC3A 3OW3A 2XKCA 3WZEA 4YJRA 4KNBA 2R3KA 3IW7A 4J8MA 4QPSA 1YDRE 4XOYA 5FEEA 5M4UA 3JY0A 2XNEA 3RHXA 4JG8A 3DXPA 4DF3A 4QMUA 3PXQA 3V8TA 3MFTA 4XLIA 5KE0A 5AEPA 3EYGA 4DEDA 3LPBA 5IEVA 3KXZA 3QF9A 4OTDA 4YJQA 4YPSA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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