3H45C

Glycerol kinase h232e with ethylene glycol
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
500
structure length
500
Chain Sequence
EKNYVMAIDQGTTSSRAIIFDRNGKKIGSSQKEFPQYFPKSGWVEHNANEIWNSVQSVIAGAFIESGIRPEAIAGIGITNQRETTVVWDKTTGQPIANAIVWQSRQSSPIADQLKVDGHTEMIHEKTGLVIDAYFSATKVRWLLDNIEGAQEKADNGELLFGTIDSWLVWKLTDGQVHVTDYSNASRTMLYNIHKLEWDQEILDLLNIPSSMLPEVKSNSEVYGHTRSYEFYGSEVPIAGMAGDQQAALFGQMAFEKGMIKNTYGTGAFIVMNTGEEPQLSDNDLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGLRMIETSPQSEELAAKAKGDNEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGAVFGLTRGTTKEDFVRATLQAVAYQSKDVIDTMKKDSGIDIPLLKVDGGAAKNDLLMQFQADILDIDVQRAANLETTALGAAYLAGLAVGFWKDLDELKSMAEEGQMFTPEMPAEERDNLYEGWKQAVAATQTFKFKAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Glycerol kinase
publication title Structural characterizations of glycerol kinase: unraveling phosphorylation-induced long-range activation
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 169
structure length 500
sequence length 500
chains with identical sequence D, O, X
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 2009-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
C PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3h45C01
2AA4A 2YJEA 3BF3A 3KVGA 4FPBA 4BGBA 2GTDA 4BRHA 4JHDB 3A5LC 1Z05A 5KQ8A 5JICA 4BGAA 5AQOA 4BC2A 3GG4A 5EX5A 4HWIA 4CI6A 5AFUA 1BDGA 2P9IA 3VEOA 3H3OB 2FSKA 1KAXA 1ATNA 1XC3A 1V4TA 1QZ5A 2WUSA 3O1WA 1NBWA 1G99A 5AZIA 4FSVA 2HF4A 3AARA 1X3MA 3CI5A 2J4RA 1EQYA 4YDUA 5AQKA 3MDQA 2P9NB 1MWMA 2P9KA 1S3XA 1T44A 4FWPA 3VEVA 3FR0A 4JNEA 2P9SB 5AQJA 1NGCA 3MMVA 3MN5A 2D4WA 3B8AX 5ADXA 1JCEA 5F0XA 2GWJA 4ISEA 4IWVA 3UB5A 4GNIA 4DHYA 1NGGA 1MWKA 3U4LA 3A0IX 3F9MA 2P9UA 4B1UB 3W3DA 4BRLA 1NGBA 1WUAA 4I6MA 3AAQA 4RTFD 4LC9B 5AQLA 1XQSC 2E2NA 1DGKN 2QWMA 3DXMB 2D1KA 3ULEA 3WUHA 2V7YA 3CIPA 1GLLO 4K43A 3ZEUA 4H0TB 5AZJB 4RCHA 2HOEA 2YI1A 1RFQA 2QM1A 3DXKB 5AQXA 4XH1A 2FXUA 1NMDA 3U8XA 3ZX2A 1SZ2A 4WQ5A 1YUWA 4B9QA 2F9WA 2E2OA 2ASPA 2A41A 3UKUB 1QZ6A 4FOIA 1NGFA 4H0PA 1NGJA 3WXIA 1BWFO 1GLJO 4FO0A 3FZFA 3O8MA 2FLOA 3MN9A 1QQOA 3VGLA 5JMVA 4JD2B 4O8KA 4BG8A 5B8HA 2W41A 3H46O 1YVNA 2Q0RA 4IJAA 4B1VA 3D7EO 4BR9A 3FLCO 5AQZA 4BRNA 4WYBA 4M7YA 5AQMA 3QFPA 4GY2B 2CGLA 3HSCA 1K8KB 3MN6A 2QWRA 3G25A 3ID8A 3AAPA 2I7PA 3JS6A 5AQTA 2HF3A 2NZTA 3L4IA 1T6DA 3L6QA 3O1BA 3QBWA 4MO4A 1U2VA 2A42A 4BRPA 2P9NA 4BR2A 3SLCA 1TYQB 4NO7A 3VEWA 4XH4A 3QFUA 3WQUA 3D2EA 5EXWA 4CZKA 4L3QA 2A6AA 2P9SA 1X9JA 3D2FB 1ESVA 2GWKA 2Q97A 4IJNA 5AQGA 1GLBG 3CQYA 1MDUB 3R9PA 4K25A 4EHTA 5BN9A 4H0YB 4BG9A 3U9DA 3ENOA 3ZETB 2A40A 2CH6A 3C7NB 5JLFA 4HTLA 1YXQA 1HKBA 2IVNA 3QBXA 5BPMA 2VYPA 1GLCG 2QXLA 2E1ZA 3VGKA 5FPEA 2E8AA 1ZBSA 3DWLA 1D4XA 2Q31A 2A5XA 3VF6A 4EAHD 4CD3A 3DXKA 3CJ1A 2D0OA 2YCHA 1LOTB 5AQYA 5FPNA 3SMPA 3VEXA 5BRFA 3DAWA 1GLAG 4M63C 3UKUA 1J6ZA 2W40A 3JXUA 4CZGA 2BTFA 3KHYA 5BREA 3GDQA 4AM7A 2IVPA 1XUPO 1Q18A 1E4FT 4EHUA 1BG3A 1HX1A 4CJ7A 4EFHA 4BC4A 3WEEA 2GELA 1RGIA 4WQ4A 2CGJA 3EN9A 1BA0A 4BRDA 3LDQA 4H5NA 1TUYA 3IMXA 4BRMA 4BQLA 4Y0WA 3LM9A 4AM6A 2PBDA 4BVPA 3CJBA 1KXPA 5EOYA 2ASOA 4H0XB 3FE1A 4A61A 3EZWA 4BR0A 1BU6O 4BQZA 2HMPA 4F9OA 3QB0A 2P9LB 2VCPA 3HZ6A 4BC3A 1TYQA 2QWOA 5LJVA 3QDKA 3RSEA 3QMLA 3MCPA 3UKRA 3J8AA 1NGEA 1R59O 1QQMA 3R8EA 4BVOA 3D2FA 2A3ZA 4JN4A 2Q36A 2V51B 3CHWA 5KQDA 1NGHA 1OKJA 3LDLA 5AFUH 4FWQA 5FPDA 1QQNA 1BOTO 2E20A 4H0VB 3ATUA 5ELZA 2P9PA 4BROA 4Z94A 5AQQA 4H03B 3ZETA 4QS8A 2E2QA 2UYTA 4CZMA 2OANA 4H0OA 5BRDA 2PAVA 3WXLA 1IJJA 4JHDA 3LDNA 2YHYA 3VGMA 1SAZA 4B1XB 3H45C 3FZHA 2P9IB 4FWRA 4FWMA 2YHWA 2V52B 5E26A 3WT0A 1ZXOA 1GLFO 1HKGA 2Q0UA 4H5RA 1HJOA 1HLUA 5JLHA 4CZFA 3WXKA 4PL8A 5AZIB 2KHOA 2IVOA 2F9TA 4MLEA 3FZMA 4FWOA 5EY4A 4BR5A 5ADXH 3IFRA 5TKYA 1BA1A 4YDUC 3FFKB 2CH5A 4BREA 2P9KB 5BRHA 5I9EB 2ITMA 2CGKA 3AY9A 3VPZA 5BN8A 4B1YB 3GBTA 3WQTA 3SMSA 2V7ZA 4BRFA 4BRAA 4PKIA 2QWNA 3HM8A 3HBTA 2E2PA 4PKGA 1LCUA 5AQFA 1HKCA 1YAGA 4CD1A 5LY3A 3QICA 2YJFA 3H6EA 4FOEA 3M1FA 4H5WA 5AR0A 3R6MA 3GOIA 4I6MB 2P9LA 5EVZA 4K41A 1ATSA 4FPAA 3CJAA 5BR9A 3C0BA 1ATRA 4FWLA 3DXMA 3FZLA 5FPMA 3M6GA 1Z6RA 3ZEUB 3CQXA 1IG8A 3VEZA 5AZJA 3MK6A 1GLEG 3O5BA 4FL9A 4DQ8A 2ZWHA 1NGAA 2ZGYA 3MN7A 1U6ZA 2FSNA 2VWBA 5BPLA 3VF2A 3OHRA 2GUPA 3TU5A 2ASMA 4BRGA 5AQWA 4CZLA 1NGDA 3HI0A 3A8YA 3W0LA 3ENHA 1RDWX 4BRQA 3BF1A 4CBWA 2I7NA 4JD2A 1H1VA 3CJCA 5AQRA 5AQSA 5E84A 3TPQA 3H3NO 1GLDG 1DEJA 4BRIA 1JCFA 3CERA 4PL7A 4MO5A 1C0FA 2Q1NA 3O6WA 1K8KA 2YHXA 1U2VB 5KPRA 3H1VX 3P4IA 4H5VA 5LJWA 4BRCA 4CZJA 1T6CA 3D2EB 3IUCA 4ISGA 3UE5A 1BUPA 3HTVA 3LDPA 3BUZB 1HUXA 3A5MC 3LM2A 3CJ9A 1V4SA 4FWNA 4QS7A 3H1QA 4BC5A 3EL2A 4PKHA 4M7XA 4BRKA 3VOVA 1QHAA 3C7NA 3FZKA 2QWQA 4DCHA 5CE3A 4CZIA 4IXCA 3SK3A 4CBXA 1NWKA 3O08A 4B1ZA 1TUUA 3ATVA 4CZEA 1P8ZA 1CZAN 2Q2RA 5F2RA 3A5NC 4A2AA 3VENA 2AP1A 1HPMA 4H5TA 1SQKA 3VERA 3KZBA 5AQNA 2H3GX 4KBOA 1MA9B 2GEMA 2ZF5O 3FGUA 5KPZA 5AQVA 2BUPA 4A62A 2NRHA 1C0GA 4EIAA 3WXJA 3CETA 3L0QA 4XEIA 3WEEB 4A2BA 1DKGD 3O80A 3IDHA 4J8FA 3VEYA 1JCGA 3CJ7A 5F1XA 4WQ4C 2FF3B 3SJHA 3U9ZA 4DB3A 2FF6A 3I8BA 2NLXA 5AQUA 2QWLA 1WOQA 4FWSA 3LDOA 3EO3A 4BR4A 1ZC6A 4ISFA 1BO5O 2E1YA 3M3ZA 5AQIA 3GL1A 3ZX3A 4CZHA 2P9UB 4IZ9A 3BEXA 4E1JA 4C23A 3A5OC 4FWKA 3EKSA 2DPNA 5KPTA 1NGIA 3VF4A 2QW9A 4MLHA 5AQPA 3RSEB 1KAYA 1KAZA 4QS9A 3VETA 3GE1A 4O5FA 3ULEB 4XH5A 2EWSA 1X3NA 3UKRB 4IO8A 3EKUA 2E88A 4BR7A 3S41A 5BPNA 3BP8A 4K42A 3O4WA 2D0PA 5AQHA 1S22A 3I33A 4B1WB 1Y64A 1E4GT 4CBUA 3VESA 1NM1A 2FSJA 2QWPA 3ZX0A 2P9PB 4RWTA 2ZGZA 2IIRA 4NB4A 3DJCA 3LL3A 4WQ5C 4JAXA 1NLVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YJNN 4BRHA 4CF2A 4ELUA 2KLAA 1ITGA 4JK8A 1RDDA 3B6PA 4CI6A 3HT3A 4FW2A 1BDGA 5AFUA 2P9IA 3SQ0A 3VEOA 1BI4A 3C65A 2YNGA 5J2QA 2O8EA 4LH5A 3LPTA 1HMVA 3OYAA 4E0DA 5AZIA 4DU1A 5FRMA 2VG7A 1ASWA 2HF4A 5HOOA 3AVIA 5AQKA 1EQYA 1VRUA 1HR0K 3CPWM 2P9NB 4JRQA 1S3XA 1T44A 1IG9A 4FWPA 3P38A 3FR0A 3SUQA 4JNEA 4DLEA 4DTMA 5AQJA 1NGCA 3MMVA 1NK4A 3MX5A 1KQSM 2HHSA 3K9JA 3QERA 3IAYA 5HRNA 5J1EA 3CYMA 5DK5A 3LP0A 3U4LA 3A0IX 1RTJA 3F9MA 3LAMA 4I6MA 1D9DA 4IFVA 1OH8A 5IT9O 1BCMA 3ULEA 1IKWA 2D1KA 3R1XA 3WUHA 5HRRA 3M8PA 2HHVA 4K43A 1EX4A 1T3VA 2NRVA 3HPHA 2HOEA 1WN7A 3E1YA 4LSLA 3NAEA 1NOYA 1M90O 5AQXA 1SZ2A 4CIGA 2F9WA 3AVGA 5CYQA 4CERA 3NGYA 1NGFA 4I9LA 2XY6A 4X62K 5D3GA 5GIOA 4CGDA 4ELTA 3O8MA 3S3OA 3IRXA 3BZKA 2OZSA 4O8KA 4OPKA 2O8BA 5EU7A 4KFBA 3K59A 2NNWA 4E1NA 3AVLA 4E7LA 1K8KB 3DM2A 3MN6A 4JKGA 2QWRA 3G25A 2YKNA 3AAPA 3JS6A 4M3WA 2NZTA 3L4IA 3QBWA 4MO4A 4CHNA 3JAMO 4BRPA 1VAZA 1RDBA 1S1VA 1N5YA 3HO1A 4FLXA 2UUBK 2A6AA 4DR1K 3C94A 4OPJA 2NRRA 3CXCM 1BGXT 1GLBG 2KZMA 1I94K 1RDAA 5BN9A 4DV2K 1QSSA 3HPGA 4AILC 2CH6A 3SUPA 4CGJA 3MECA 5JLFA 4KO0A 4FLVA 3NH2A 1KTQA 1YXQA 2DFFA 1N36K 1HPZA 4GKKK 1SL1A 1GLCG 1D9FA 3VMFB 2O8CA 4AHRA 1CZBA 5FPEA 2E8AA 4OJRA 4JI5K 1A5XA 3DWLA 3LAKA 3VEXA 5BRFA 3MX2A 1J6ZA 3JXUA 4CZGA 4KHNA 1QQCA 4DR5K 3SPYA 3DLRA 1BG3A 3RTVA 1HX1A 3K5MA 4IOXA 1R0AA 1X9WA 2WFBA 1Y97A 4H5NA 3IMXA 3IS9A 4BQLA 1S1WA 3LM9A 3VQ4A 3CJBA 3G10A 1RT5A 4MDAA 1S9EA 4FW1A 1OH5A 3NF6A 4HVJA 1S72N 3EZWA 4HCCA 4F9OA 3Q7CA 4FJLA 3ZSVA 4LSNA 1TYQA 2NRXA 4AHVA 4I9QA 4KHUA 3OYBA 3J8AA 3OBYA 1D8YA 1QQMA 3R8EA 1WB9A 2A3ZA 4KHSA 2HBJA 3NF7A 1Q9XA 3BZCA 2V51B 3KKSA 2ZJQL 2HBMA 3S3MA 1BOTO 3CCRN 5I42A 1IKXA 1QSYA 4CJRA 4QS8A 4RW6A 4H0OA 3DLGA 2PAVA 4CESA 4FM0A 4LFCK 4A59A 3H45C 4WFBL 4DV5K 4FLZA 4B9UA 3DI6A 4GV9A 3VQQA 4X66K 1ZXOA 2HHHK 4CHPA 1HLUA 3NHGA 4CZFA 3KLIA 4PL8A 4CJQA 2P5GA 3CFOA 2KHOA 3G0ZA 2JGUA 3OW2M 5EY4A 4BR5A 5KRTA 5ADXH 4DSFA 3IFRA 5TKYA 1HRHA 2PFUA 3WXMB 5HRSA 1L3UA 4DU3A 1TKTA 1JL1A 3V9SA 3GBTA 1Q82O 2V7ZA 3T1YK 4BRFA 4V19S 3K2PA 4PKIA 4CJKA 4IEEA 3O9SA 5FROA 2IOCA 3PSIA 3N4QA 5AQFA 1HKCA 2YJFA 3H6EA 4FOEA 1YF5L 1T8EA 1NMNA 3THVA 2F4VK 4FZYA 2G8IA 4FPAA 3CJAA 2FC0A 3C0BA 4FWLA 4I7FA 5FPMA 4DTNA 3ZEUB 3PIOL 1F21A 1C1CA 4F3OA 3LDSA 3E9OA 3D6RA 4GVMA 3KJVA 1XWLA 2ZWHA 4LF8K 3K5LA 3MN7A 1WBDA 4H4MA 3TU5A 2ASMA 2XO7A 5H1SQ 3DOLA 5J2NA 4DF4A 4XIUA 3AA3A 4KPYA 1XC9A 1VRTA 3QNOA 1NGDA 4M3XA 4C8LA 3D0PA 3ENHA 4BRQA 4Z4IA 3T69A 2X74A 3I56N 1H1VA 5AQRA 4X65K 2QEXN 2KW4A 4YY3K 4FK2A 1YTAA 2KFNA 4B3MK 3KD5E 4CGHA 1JLCA 3J7ZO 1ZBLA 3CERA 2Q1NA 1K8KA 3E9PA 2YHXA 1RCHA 1KFDA 1U2VB 5KPRA 1BL3A 3CC2N 4KI4A 4NXMK 4RG8A 4E7KA 5CYMA 2EHGA 5LJWA 3VQCA 4HUGA 1VQ5N 3AA4A 3PV8A 4BWMA 3HRGA 2QI2A 1BUPA 3HTVA 4PUOA 3AO3A 4FLYA 3A5MC 3HVTA 4R79A 5GAGP 4FLUA 4JI8K 1M1KO 1BHLA 5C42A 4E7HA 1KVBA 1NK7A 3VQPA 3NF9A 3EL2A 3RRHA 2XY5A 2NRWA 4F3TA 4Z4EA 5GAHP 4B9LA 2VG5A 2QWQA 4DCHA 2ZQBA 4CBXA 1NU0A 4CIEA 2O4IA 3RVCA 4BWJA 3O08A 3MXIA 4F2RA 1BI4B 4JKBA 4IEIA 1Z26A 2G8KA 1SS6A 4G1QA 2X78A 3A5NC 4A2AA 4H5TA 4IBNA 4CJ3A 3VQ9A 2GEMA 2GUIA 3FGUA 1X9SA 1HYSA 3WNFA 3L0QA 2AJQA 4JYAK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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