3H4KA

Crystal structure of the wild type thioredoxin glutatione reductase from schistosoma mansoni in complex with auranofin
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
588
structure length
588
Chain Sequence
GTSQWLRKTVDSAAVILFSKTTCPYCKKVKDVLAEAKIKHATIELDQLSNGSAIQKCLASFSKIETVPQMFVRGKFIGDSQTVLKYYSNDELAGIVNESKYDYDLIVIGGGSGGLAAGKEAAKYGAKTAVLDYVEPTPIGTTWGLGGTCVNVGCIPKKLMHQAGLLSHALEDAEHFGWSLDRSKISHNWSTMVEGVQSHIGSLNWGYKVALRDNQVTYLNAKGRLISPHEVQITDKNQKVSTITGNKIILATGERPKYPEIPGAVEYGITSDDLFSLPYFPGKTLVIGASYVALECAGFLASLGGDVTVMVRSILLRGFDQQMAEKVGDYMENHGVKFAKLCVPDEIKQLKVVDTENNKPGLLLVKGHYTDGKKFEEEFETVIFAVGREPQLSKVLCETVGVKLDKNGRVVCTDDEQTTVSNVYAIGDINAGKPQLTPVAIQAGRYLARRLFAGATELTDYSNVATTVFTPLEYGACGLSEEDAIEKYGDKDIEVYHSNFKPLEWTVAHREDNVCYMKLVCRKSDNMRVLGLHVLGPNAGEITQGYAVAIKMGATKADFDRTIGIHPTCSETFTTLHVTKKSGVSPIV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Thioredoxin glutathione reductase
publication title Inhibition of Schistosoma mansoni thioredoxin-glutathione reductase by auranofin: structural and kinetic aspects.
pubmed doi rcsb
source organism Schistosoma mansoni
total genus 174
structure length 588
sequence length 588
ec nomenclature ec 1.6.4.5: Transferred entry: 1.8.1.9.
pdb deposition date 2009-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
A PF02852 Pyr_redox_dim Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, dimerisation domain
A PF07992 Pyr_redox_2 Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.390.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Enolase-like; domain 1 Enolase-like; domain 1 3h4kA04
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h4kA01
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA02
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3h4kA03
2AAQA 4X0XA 1F6MC 3ZREA 3AYIA 4X1UA 1GERA 4AOSA 2YG7A 2L6DA 2LKUA 5KVIA 2DJ2A 3LZXA 2OADA 3AD9B 2QCUA 4TXVA 2YLWA 3RPNA 4OCEA 1A8YA 1SK2A 2PVQA 3GH6A 4H7UA 3IE3A 2V61A 1G6YA 2GQLA 5IQ4A 4TXOA 1TDEA 2AV4A 4ZBAA 4WCTA 3W6GA 5JWOB 2EQ7A 2X8CA 3SQPA 5CKUA 1WIKA 2XPDA 3AWIA 3Q9TA 4BPYA 4ZB9A 3KLJA 2H70A 5HXIA 4I6XA 4ZBBA 4JN9A 3SBCA 3SFEA 1GSSA 3VWVA 3D6IA 4CY8A 2AB6A 1M2AA 3F8DA 2DMMA 3FMWA 4GF7A 4Y4NA 4K7NA 2LJRA 2YLXA 2E7PA 5G30A 3IRAA 5D9VA 3NK1X 1BGNA 3LGCA 3SGLA 4D04A 3VWXA 4CY6A 1TRWA 3QSEA 5BUKA 1Y25A 4ZL8A 2TPRA 2GH5A 2H6ZA 1YQ3A 2WJUA 5J60A 4IA6A 3CPIG 2YG5A 3GMCA 3H79A 1J08A 4OO5A 1Q1RA 3DVWA 1DJNA 3NK2X 1OAZA 4APNA 2BACA 1E6EA 2DIYA 2GS3A 2BK4A 1TYTA 2GEWA 1EL5A 5GRTA 2YOIA 3LFLA 2C1YA 2CVDA 2V5ZA 1K0JA 3LZWA 2NPBA 1Q4JA 1VRQB 3GH9A 3HYPA 3TKRA 1RYIA 2PU9C 4NMUA 1D7YA 5EB4A 5AISA 2P0GA 1XHCA 4KNDA 3B3RA 1S3CA 4KDUA 2YLTA 4MH2A 4H4PA 4EM3A 3CSJA 2C64A 4K0GA 2FWGA 2FJAA 2H0GA 4YWOA 1GSNA 1CBOA 1CC2A 5DALA 3P90A 4J2FA 1CC4A 1DSBA 1TW9A 4IVOB 5HHFA 4WETA 4MF5A 4NEVA 1GRXA 3I69A 1V58A 5DJMA 4UP3A 2QAEA 4KW6A 3LXTA 5A5KA 5KWFA 1GRGA 2WHDA 1UC7A 4K9ZA 1THXA 1V98A 2F8FA 2C3QA 2PMTA 4F03A 2R45A 5CRDA 2NVKX 1OJCA 3G9BA 4CNJA 3CTYA 2X64A 3V76A 2BA9A 2MBSA 4PQIA 4DGKA 2HZFA 4G10A 1UKVG 4ADWA 4MCUA 1H83A 3AD8B 3KD0A 3ZTLA 3LYKA 4BVXA 2GB0A 4ID0A 1NEKA 1XBSA 3CSIA 1BWCA 4C3XA 3FYGA 1SD9A 4LIIA 5IIZA 1FB0A 3CGCA 3ZZXA 4K8DA 3HZ4A 4H2PA 1GUMA 3BBYA 2DIZA 4DSRA 1F3BA 2V2GA 2XVFA 2GZPA 2C65A 3GKMA 4A65A 2RM6A 1NHSA 3CNPA 5DQYA 3KP8A 4H4QA 3GYJA 3II4A 1AAZA 1ZZYA 1AUCA 3HY2A 2K18A 1ERUA 3QOUA 1TK5B 3F4TA 2KHPA 5INYA 1AXDA 13GSA 2B6MA 1JZRA 4G2EA 2BYBA 3AEDA 1EL7A 5F05A 5M0ZA 1A8LA 5C04A 4POBA 1ZYQB 2VAFA 3M9JA 4V1Ap 3RAZA 4K1FA 4LL4B 3M12A 4ULXA 1K3LA 3DK8A 5JCNA 1S2QA 1TRVA 5E4WA 5ECKB 2MBTA 2XLTA 1YDKA 1XWCA 3L9UA 2EIQA 3N5OA 4PNFA 5IPGA 1AW9A 4JDRA 2BCGG 5IOWA 3I6DA 2WULA 2G0FA 2P31A 2GMHA 1SEZA 1EP8A 2JB3A 1IUXA 4JZQA 3OR5A 1S3AA 1XPQA 5D73A 4TR4A 2BCPA 4PX1A 3ERGA 4GQFA 3QVRA 4OFMA 2VQ7A 3UMAA 3VWUA 2V1MA 3LORA 3HVXA 1OYJA 2FNOA 5E59A 1LJ1A 4IJ3A 3P4PA 1UA5A 2GLRA 1PSQA 4GUVA 3K30A 3PVCA 1T4ZA 2FCHA 3ZYWA 2VD1A 3UARA 4F2IA 3AE8A 3LJPA 1G0TA 1RW1A 5IMDA 11GSA 1PBBA 2WPFA 1V9WA 1PX6A 6GSSA 4BV6A 1YF1A 1XZOA 5IMVA 4U2SA 5D96A 5A4WA 2CX4A 1TRUA 3J7Yb 4U8MA 2C72A 1GSUA 1XW9A 4BJZA 2XBIA 4Z26A 3P4RA 4TM4A 2Z9SA 1TTZA 3GYIA 1OKDA 3IHGA 1K0CA 4B68A 3PINA 3LEFA 4IVFA 1PD21 1H7XA 3LOVA 2GSTA 1B4VA 3S61A 4JY3A 2HQMA 1GP1A 5ENUA 3TJGA 3UKKA 1FOVA 3M3MA 1D4EA 3G5RA 4Q5FA 5ECPB 3TB2A 3KEBA 1MD4A 3ITJA 4IA5A 4AF2A 1H84A 2PN8A 14GSA 4HQZA 4TM3A 1KSSA 4OPIA 2Y6QA 1LJRA 4KPRA 3FW2A 5KEJA 2HYXA 1O7UA 2UZZA 4ZB8A 1WMJA 5JCIA 1MTCA 2C3CA 1TYPA 1GSFA 2QC7A 3ALLA 4MF6A 4I8BA 3FK8A 3LJRA 2OACA 4IKHA 1K3OA 2ZUPA 2GT5A 2HZEA 3VQRA 3M0OA 4IW9A 2IFQA 5EY6A 4E8EA 5IPYA 3NOFA 5IPHA 3P8WA 4PAAA 3F4SA 1ZX9A 2VRLA 4BJYA 2WOVA 2YV7A 2GVCA 4LMWA 1FEAA 1LBKA 3EE2A 2F3MA 5KN2A 2GSRA 4JE1A 1TDKA 1FCDA 5ABRA 4ML6A 4NV2A 3KJYA 4I58A 3VR9A 5J7XA 2GR1A 3GD3A 2PPTA 3I6AA 1GALA 2RUFA 2VLUA 3KTLA 3PH9A 1GRBA 2B7SA 5JCMA 4BVYA 4OFNA 4AJ7A 3HA9A 2WRTA 4XXGA 2HLSA 3U6VA 1M2BA 5C2TA 3RHCA 3A3TA 5B7CA 2B1KA 4AJ6A 1CL0A 4L0WA 3GKXA 4NTDA 1V2AA 2GAHB 2QA2A 6GSUA 1SYRA 3QFAC 2R4JA 1T1VA 4H4VA 4KX4A 4EKZA 5KVHA 2AYTA 3NT6A 4K5SA 4U8OA 1SKWB 4O7HA 1TRSA 1GRHA 2R6KA 3DWVA 3M8NA 1BEDA 4GDEA 3IDVA 3UOZA 2YM1A 4KAEA 3CGEA 2EIOA 3I3LA 1QUWA 3G5QA 2MMAA 1SU9A 2JSYA 2TRXA 3ED3A 3GMBA 4BK2A 1O73A 4Z2RA 1L9DA 2C4JA 3NYFA 5DJLA 1S3EA 4C77A 1I5GA 4BA7A 3UAPA 2K8VA 3EC3A 2VOUA 3ZFLA 3KGKA 3TCOA 3F9UA 4TR0A 1PJ6A 1PBFA 1ERTA 1D7LA 2EIRA 4PQHA 1JEHA 4GR1A 2YLZA 4K5RA 1M0UA 1SJIA 4NHZA 1Z3EA 4MPFA 4WEYA 1B5QA 1COYA 1FECA 3NTDA 4I2UA 2MYGA 1AQXA 1U3IA 3F3QA 4EL1A 2R4VA 4HB9A 2V6KA 4WKWA 2H1DA 3QR6A 4I59A 4AOXA 4RSLA 1YQZA 3MNGA 3JSKA 5HYMA 2B9XA 4B69A 5ECLB 4JR4A 1CF3A 1AC1A 3ZVJA 3DJDA 4OPDA 2WDRA 3UOMA 1DE1A 1O95A 5B6MA 1DODA 2QSIA 2RGJA 4J2WA 3GSSA 1NSWA 2ON7A 1LQTA 2GV8A 3ALJA 1Y6EA 1SJ6A 2BMXA 3BCKA 2FWHA 3ZDNA 2B5YA 4WXTA 4E8HA 1GNDA 2C67A 1A24A 2V3AA 1MXTA 3FEUA 2XLPA 4I5QA 2V6OA 4YTNA 4TKYA 4E0VA 2MMOA 5A4UA 1LVLA 1XDIA 3K7QX 4BK3A 4H4XA 4YH2A 1B48A 3RP6A 2MMNA 1JZDA 2REMA 3APOA 3BI5A 2G2QA 2OE0A 1EL9A 3IA1A 3Q19A 4H4TA 4EC0A 3E1TA 2C0GA 2LRNA 4IP6A 2CX3A 2WB9A 1FOHA 2FHEA 4JU5A 4USRA 1TRBA 4H4YA 4IQ1A 2YWMA 1D4CA 1MDKA 8GSSA 2BC1A 4PUFC 5JCLA 4FK1A 1GSYA 5DVBA 4TLZA 3CN8A 4HDEA 4XRDA 2CZ2A 4IV9A 5LNKe 2C0EA 1RK4A 1V59A 5HR0A 3SM8A 4KSOA 4ECCA 3DXBA 3UJ1A 3ZRDA 3IPZA 4P3YB 1ZDLA 4I97A 4O5UA 3H93A 2JACA 2BS4A 1K4QA 3EAOA 4IGJA 3PS9A 4J34A 2AAWA 4D73B 2WU5A 2J23A 2B9WA 1GT8A 2VIMA 1HNAA 3VPQA 16GSA 2GTUA 3AEBA 3M0FA 4QL9A 1GTEA 4L8EA 5D93A 4L5OA 2GRTA 4Y4MA 2MMZA 3G7YA 5D9XA 3KMNA 1Z5YE 3NN0X 2IMEA 3CTFA 3A5WA 4GDPA 1U6TA 3T37A 4H2RA 2JBVA 5M10A 4N9XA 5FS7A 4GSSA 3KU9A 2I9HA 1WP0A 3P4SA 3DJEA 1IYIA 3AXBA 2BXRA 4NAXA 3I9V2 3UOYA 2WDVA 1PKWA 2XFNA 5KOXA 2K6VA 1K0MA 2IMIA 1Z6MA 3M9KA 3CNTA 3LB8A 4Z25A 4L5LA 3L8KA 3FIMB 3GHAA 1TP9A 3HKRA 2BC0A 2VCXA 2BABA 2IVDA 2QKEA 4U8LA 3QSMA 4G9HA 1JZWA 5FWGA 2YZUA 3UOXA 2C0DA 4Q5QA 2H0HA 1BX9A 1RQMA 2RGHA 3LSZA 4YAPA 12GSA 1K3YA 5IQYA 4JEDA 1ZGNA 3FRCA 1LTXR 5KOWA 4N10A 4QQ7A 4NHWA 4EUYA 1H7WA 4RG4A 4DSSB 1GSDA 3QAGA 3DRNA 1JRXA 2VVMA 4Z44A 3UKAA 2LJKA 3TKSC 3AE1A 1Z6NA 5G5FA 2B9YA 4ZILA 4CNKA 2EQ8A 4H50A 4J57E 3N9JA 3BCIA 4N0ZA 4WF5A 3CPHG 3KD9A 4ECBA 1QGVA 1ZKQA 1H81A 3REDA 3AE6A 4EF0A 3GMFA 5IO2A 4YSXA 3S9FA 3ME8A 4IN0A 1MEKA 3CMIA 1F37A 3SWLA 2KP2A 1TDIA 3DD3A 3MDKA 1VF1A 4BWSA 2E4GA 4ECJA 4REKA 2I3YA 3GL5A 4NZHA 5KRQA 2BJXA 4YTMA 1Q9IA 1DOEA 4RUVA 3PO7A 1XPVA 2YJHA 2TMDA 1REOA 2EQ6A 2IIDA 2E2MA 1PS9A 2NDOA 3GSIA 4MH3A 4EDYA 2EC4A 3Q74A 3V3OA 1OJTA 4J56A 3AE5A 4XWZA 2N5AA 4O5RA 3VRDB 1NM3A 5JCUA 3UBLA 2YP6A 1R7HA 1X5EA 1OJAA 3FPZA 3UL3A 1NHRA 4MA9A 5ECSA 1THOA 1GUHA 1SK0A 1USBA 3FHKA 2ZBWA 5J5NA 3KH9A 5GZZB 1F3PA 3HXSA 3HCZA 5GSTA 2ZZ0A 3CIRA 2IIYA 2NVLA 2KUCA 4A6NB 4CRTA 2Y6RA 1A0FA 4LL1B 3W8SA 4A7AA 2Z5YA 2JB1A 3G5SA 1KNRA 6GSVA 4DVCA 2GQFA 3D22A 4OPUA 1GREA 3AYJA 2AHEA 4H4ZA 1ZP0A 3VURA 1EBDA 1TDOA 2PERA 1XW5A 2Q7VA 1BQ7A 3DA1A 5JCKA 1K0AA 5FHIA 1H86A 5TR3A 2XFQA 2JZSA 2X8GA 4H4RA 3G7IA 3O6TA 2EQ9A 4EQSA 3NZNA 3KTBA 4KE3A 1PKZA 3LXZA 3ICTA 2MZCA 2APGA 5ECOB 2L4QA 4GTUA 2GQWA 2IWTA 1QO8A 2X8HA 2B76A 1CJ3A 1U88A 2OALA 4LLRA 1TK8B 5HR2A 5BRTA 2CVBA 1JU2A 1FVJA 3BI4A 1DUGA 6GSWA 3APQA 2IMDA 2P5RA 1FG4A 1XVWA 3UTFA 3CBUA 3IAM2 1W4VA 3DGZA 3QFAA 3FR3A 4Q5RA 20GSA 5EL8A 3TRQA 1YEXA 1YKAA 3C1RA 4Z2UA 4UDQA 1FO5A 1KDGA 1XWAA 2C70A 3U5RE 5J3RA 2BK5A 2YVGA 5ECHB 1DOBA 1KSUA 1M64A 5C3JA 6GSYA 1EWXA 1BG5A 4PABA 4A79A 1ZMCA 1GEUA 2C0FA 3QJ4A 2GQMA 2L5LA 2VO4A 2E5VA 3F8PA 4U8NA 1WJKA 1X9WB 4TOPA 1BYEA 5B8AA 4HJ2A 1XVQA 3UKPA 4J57A 1OC8A 4USQA 4RG3A 4HA6A 2CDUA 4GCIA 1FAAA 3DK4A 2B7RA 3DEXA 2FUG2 1SKRB 2R46A 4DSHA 4ZL7A 1GWCA 2R2JA 1JLVA 1SL2B 4C3YA 3NIVA 2M80A 4IP1A 2F5ZA 2DLXA 2JSZA 4F9ZA 1E1MA 3RDWA 1N4WA 3DIEA 3TKSE 1E1NA 1BAYA 1TK0B 4LU6A 4V1Ag 2Q6UA 4BWQA 3ATRA 3IF9A 5JCGA 1GPEA 5J9CA 4KA0A 5AIVA 3CNSA 1GSEA 2E2GA 3DJGX 3ZFBA 3RP8A 1VF4A 4KDXA 1QMVA 4JR6A 4PXOA 4XRAA 2ZNMA 3IBHA 1PRXA 2IMFA 1W4XA 5IOXA 4U8JA 3UEMA 3ZMKA 2LRTA 1EV9A 1L0VA 2YVFA 1A2LA 1K0OA 4OFTA 1HYUA 5CNWA 1A2MA 2FJEA 4OCGA 2GVPA 2B7KA 2L5OA 2DJ1A 5U1OA 2H66A 3UKFA 1T3BA 5HR3A 3WD6A 5AN1A 2CV4A 3KM6A 1N1PA 3IHMA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3D5J A;  4K6X A;  4NXI A;  3FR6 A;  2NBS A;  4ZCD A;  2XC2 A;  1SJC A;  5ECI B;  3F8U A;  2R9Z A;  5DAK A;  17GS A;  3PWG A;  2H88 A;  4EIQ A;  1PL1 A;  2HRF A;  4GRT A;  1YJ6 A;  3LQ7 A;  4FO5 A;  3KA7 A;  5F07 A;  2I0Z A;  2OJL A;  4BVY B;  5ECQ B;  4YSY A;  4JBB A;  3F6D A;  3QVP A;  3DFH A;  3WT2 A;  1BGJ A;  1Y56 A;  1KN0 A;  3PGT A;  2VVL G;  1TXX A;  2N5B A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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