3HHGA

Structure of crga, a lysr-type transcriptional regulator from neisseria meningitidis.
Total Genus 69
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
69
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
KTNSEELTVFVQVVESGSFSRAAEQLAMANSAVSRIVKRLEEKLGVNLLNRTTRQLSLTEEGAQYFRRAQRILQEMAAAETEMLAVHEIPQGVLSVDSAMPMVLHLLAPLAAKFNERYPHIRLSLVSSEGYINLIERKVDIALRAGELDDSGLRARHLFDSRFRVIASPEYLAKHGTPQSTEELAGHQCLGFTEPGSLNTWAVLDAQGNPYKISPHFTASSGEILRSLCLSGCGIVCLSDFLVDNDIAEGKLIPLLAEQTSDKTHPFNAVYYSDKAVNLRLRVFLDFLVEELG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transcription regulator
molecule keywords Transcriptional regulator, LysR family
publication title The structure of CrgA from Neisseria meningitidis reveals a new octameric assembly state for LysR transcriptional regulators
pubmed doi rcsb
source organism Neisseria meningitidis serogroup b
total genus 69
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00126 HTH_1 Bacterial regulatory helix-turn-helix protein, lysR family
A PF03466 LysR_substrate LysR substrate binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain 3hhgA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA03
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 3hhgA02
2QMWA 1R1TA 3LQQA 5JTYB 3PFIA 4AD9A 1WRJA 3DKWA 3MAMA 3PUWE 1J7KA 3OO8A 2HAUA 1GV8A 4G77A 5I2NA 1Y4CA 2FYIA 3SZTA 5KK1A 5I84A 1ON1A 4LGWA 1DPEA 1FQAA 1BM9A 5KDTB 4LVQA 3CUOA 1T2KA 2HXWA 2D1HA 2V6CA 5CVRA 5EEHA 5DUKA 4YMAA 4F3BA 4XKQA 2NUVA 2F35A 1BTJA 1SYIA 4NQWA 3S4UA 3VODA 1XDUA 1MM6A 2MD5A 3R0AA 2PLYA 3O29A 1NKXA 3DV8A 4L9VA 3U1DA 3H4ZA 4X1DA 3VVFA 1U5TC 2YLNA 2XASA 2W57A 3B6WA 3ZKLA 1J2XA 2EFNA 5TP9A 1JNFA 1MY0A 3ECRA 4YKIA 1GXPA 3CUQC 5E20A 2XKOA 4IHSA 3HOTA 1N0TA 3IB1A 4M73A 1G3YA 4H6DA 5L9OA 3J7AO 1LEAA 2JSCA 3FD3A 4FE8A 1IZ1A 1ELJA 4YB5A 5E1ZB 1O3TA 2XRNA 1DOTA 4HBLA 3G3GA 3MBPA 1FQCA 2FEZA 3GFMA 4WX9A 1ZRDA 1SW2A 2ZJ2A 1YCJA 5K5RA 4EF2A 2RKMA 3FMRA 4M74A 1EH8A 2FBKA 3V8JA 4OIPF 2O7UA 3S2WA 4N9HA 3RUMA 1HKTA 1IITA 1OMIA 1U3EM 3TTMA 3V7RA 3BFUA 3WU1B 1XD7A 3M3KA 2PVUA 2FA5A 4G6DA 3S9MC 3ZN0A 1Q35A 1W7PD 3TMGA 1IN8A 1XSVA 4OMZA 3JAMZ 1N3XA 2FBIA 4YKPA 1BIBA 4G7HF 4KQPA 2GZWA 1YS6A 4MTEA 1NNTA 3KN3A 3TTNA 1P4AA 2F78A 2NRAC 2UZKA 3M8UA 3F3XA 3E6CC 4GO1A 4F2QA 5TPAA 1ZREA 3QXMA 3F8BA 1WI9A 4LQ5A 4XLNF 3KP3A 2YSRA 5FFZA 4N07A 2DW4A 1G6NA 2O0YA 3KCCA 3KN8A 4POXA 1BI2A 4BHBA 3ECHA 1XHYA 3JSPA 3SERA 4XBFA 4G68C 4PETA 4U4SA 2O03A 2YR2A 1FOKA 1BLFA 1FY7A 2EB7A 2F5EA 2MLKA 4Q47A 1MXZA 4GVOA 1V4RA 5I56B 5I57A 1U5TA 2Q2EA 1TNSA 3I71A 3GZ6A 4JQFA 1TFDA 5FFXA 3A09A 2MH2A 1PDNC 4Q4ZF 3FXQA 2DLLA 1QKBA 4KYSA 2ZKZA 1KYWA 3CUQA 1NNPA 4M71A 1YIOA 3RKXA 4F7ZA 2V1UA 2OQRA 1A04A 1NH7A 4A5NA 4LONB 2OCUA 1B58A 4I0BA 5DVJA 3VVEA 3I4PA 4ON0A 4BH9A 3M3LA 3OOAA 3E6BA 4RB3C 3ODBA 1FW0A 2DE4A 4BDLA 3RYPA 5F6FA 3O6HA 4AB6A 2ZFWA 2Z5UA 5DVFA 1H76A 1OYWA 3TYHA 5BPDA 4U1OA 3H7MA 3MZHA 1P1WA 4NF8B 5I58A 4OFJA 5ICTA 4O3CA 3BJAA 1G3WA 4MLVA 5LGTA 3SHFA 1IEJA 3OOPA 2DVZA 2NNNA 1GVJA 5K2XA 2XX7A 2ESHA 4KIBA 1LFIA 1NH8A 4ZEFA 5A5XB 4F29A 3MZBA 3TGNA 3C18A 5L3BA 1YG2A 3EPEA 3EDPA 3BOQA 5FD6A 3QAXA 2HKXA 3IC7A 5AA2D 2D5WA 1XSXA 1IXSB 5AIQA 4TOZA 1SI1A 2Y84A 1ZG3A 3C33A 3LUYA 4FJPA 4PFUA 1FBUA 5L3CA 3OV8A 5AIPA 3QRFF 4ZZDA 1U8RA 1HW5A 3IO6A 5HLHA 1XMAA 2DT5A 3IAZA 3PPRA 3VV5A 1SW4A 2B3BA 1B1BA 4Z2YA 4OIQF 3HSEA 1IN7A 4GL8A 1PBPA 4G68A 1B52A 2HQ0A 4NE4A 2A5SA 4G8MA 3K2ZA 3HHHA 1OYYA 1SD4A 1DPPA 2QMXA 1IW7F 2QS4A 2P7CB 3OD7A 2OQGA 1RUNA 4IO7A 3ZMZA 3JSOA 5DYMA 3TO7A 4WXCA 4HF1A 2STWA 1TT1A 4ESBA 3V89B 2AXLA 1B51A 2ZYKA 4DDDA 4GD5A 2HR3A 3FVKA 5FLXK 1XGOA 2JTVA 3L9FA 3FGSA 4H0WA 2REJA 4EQBA 3SFZA 2V3UA 3ABTA 1MY4A 3HSFA 1MY3A 2O6GE 2DK8A 2EA4A 2VT3A 1FQBA 4MLQA 1Y1MA 2CZLA 1BIYA 2IA1A 3E3KA 5BUUA 5HS9A 3U72A 3V8LA 1OVTA 1ZAOA 4M9ZA 3HRTA 4G94A 2Z22A 4ZZAA 1UIUA 4HF0A 2UYFA 2OA4A 3G3ZA 2P5LC 5CMKA 2RF1A 2YU3A 1S8NA 4EDPA 3CSBA 4GXSB 1TQIA 4HZFA 4Q8RA 1J9IA 1Z9CA 3T1BA 2GA1A 2DSFA 4L0ZB 1P1UA 3JW4A 1LFHA 2A61A 1KA8A 4LD5A 5FGMA 1FYLA 3Q29A 1HKQA 4U0YA 2DQVA 1IXRC 3HRMA 4KA4A 3DP4A 3J81Z 2XXWA 5ISUA 5I2NB 2MBFA 3L6GA 3TDJA 4EXKA 3LQRA 3RKYA 4ENKA 3R6UA 3ECOA 3I5OA 5JFRA 4AIHA 2V25A 1J0RA 2KRFA 1ZG5A 1Q1HA 5E8GA 1UQWA 2HZKA 3CIJA 2G7UA 3CO7C 3IOWA 3VXBA 3HUGA 1B9NA 2P6TA 2QQBA 4HV5A 3ROUA 4IRHA 5H8QA 4FT8A 5DCMB 4IJAA 4JK1X 1ZLKA 3S2VA 1N3WA 3PPNA 1D3YA 3IWFA 4PFWA 3KSXA 4H0EA 2QM3A 4PGGA 4HCWA 2G9WA 3KLOA 2EJRA 2GWRA 1N7XA 2EWNA 1FCKA 1WQ2A 5L3EA 3I59B 4WKMA 3V4GA 2Z23A 2IJLA 1I1GA 4CHUA 3H6TA 1Z6TA 1LFGA 2GH9A 3I64A 1XN7A 3SETA 4KD5A 4HTGA 2FNAA 1UHMA 5ILVA 3IRRA 3P9IA 4GL0A 3KZZA 2XAQA 1ZLJA 3MP1A 5EEGA 4UV8A 3EHTA 4ZEDA 1LDJA 1DTZA 1QJMA 5ICFA 1IXIA 2PJPA 3V7CA 1AIVA 1B1XA 4XLPF 1Z05A 1KQ9A 5FTIA 4EJWA 3UP9A 1K78B 3PUYE 4QFPA 5ITPA 4RK9A 4P9FA 1WVJA 3WTTC 4HF2A 4NF5A 1SI0A 3FHZA 4FIMA 2BYVE 3E9XA 4WCGA 4KT5C 1LCTA 4IO4A 4Q0CA 4PCQA 3FM5A 3O9PA 4ZEIA 3UGWA 1NL5A 3PPQA 1B59A 3SQNA 4YU0A 1SDXA 1B9MA 2L01A 3T5XA 3RGYA 4EM0B 3CO6C 3HN0A 3LBSA 3M8FA 4FORA 5BS6A 1LAFE 2QJEA 1AOYA 1FPQA 1I6AA 2MLGA 2YX4A 3QU6A 3KP5A 4LFUA 1ZN2A 2XHDA 5I2KB 5I57B 1U5TB 1P6RA 2ADUA 1W7PA 3HYIA 1A54A 4NB5A 1MDMA 1NNFA 5LHIA 2ZBKA 3MC2A 1T38A 3IWZA 4R72A 4IGTA 1ONVA 3LR1A 3CUQB 3SEUA 3DFGA 4BNCA 1T0FA 5K5QA 3O2AA 2VBXA 2V3TA 3FXUA 3EETA 1J5YA 4N9IA 3U2RA 4QRZA 3LSTA 2EA2A 2A3SA 1W5TA 3LSFB 4G8XA 5L8DA 5D6EA 4R8HA 3F6OA 1YFHA 1OIBA 3N97A 4U4XA 1OYIA 1JEUA 3K9TA 3PV0E 2IVMA 2V1XA 3F23A 4RNSA 4MQVA 3MWBA 2WKYA 4A0ZA 5HDNA 4CXFA 2Q2AA 1YW7A 1DPUA 3TQNA 4HA8A 3CDHA 4LZ8A 3L00A 3GWZA 2HQNA 2OZUA 4PFYA 5K5OA 2Z9OA 1RI7A 2Z8DA 1P92A 2OJTA 3FMQA 3H3UA 1MXUA 5D8LB 1U2WA 2ZNUA 3RJPA 2UXAA 3FVOA 3G3JA 4F31B 1LLSA 2PYYA 2XROA 3RYRA 3TZAA 5E18F 2A5TA 1LEBA 4XRFA 4DCXA 4WK8F 1PP8F 4AQ4A 4KUMA 3SESA 3T96B 1KYZA 4IGRA 4R2BA 2Q8JA 1B7ZA 5L9MA 2E1NA 1WSUA 2CWEA 1DTGA 4G68B 2GXGA 4EGZA 4EUOA 4LQ2A 4AIJA 4ZYGA 3RDIA 3H92A 5D8KB 2QPQA 3DEUA 3F21A 3K6UA 3PUXE 4H5FA 1MDQA 3FV1A 4KNYA 2CMOA 3E97A 2ZYNA 5HLGA 3BJ6A 1QBJA 3FM3A 3F11A 1XVYA 3VB2A 3ZMTA 1MKMA 2R71A 4R79A 4G8HA 4C1TA 4ZDMA 5AA2A 2QLZA 3LAPA 1Y0UA 3PMXA 1FYKA 2XD2A 5JK4A 2GFEA 4MHGA 5H6RA 3M1EA 1QGPA 1N7WA 4OU0A 1O3QA 2E7WA 3EYYA 4CZZA 2O84X 2RVCA 4DNCA 1FWZA 2PMUA 4K2EA 5F7VA 5LEKA 2M5WA 4GQOA 2HKOA 1XGSA 2LF8A 4F3SA 2DQRA 3BPXA 3WTXC 4IY5A 4E70A 3QU3A 4A2UA 1FTMA 4UXNA 1FX7A 3N26A 1RIOH 1REPC 2ZNTA 4ZECA 5CM6A 2WTEA 3SEXA 4A5MA 1OMPA 2P8TA 4YAHX 2A6EF 4X1BA 2I0CA 5DUIA 3IO4A 3PUVE 3K1NA 3WAFA 2PQ8A 4IRIA 4NF6A 2MH9A 3QPHA 1KGSA 1QW0A 3F8NA 1B4ZA 2EK5A 1BC7C 4OVJA 4WEPA 1UCRA 2NOOA 3FWEA 2AYSA 2A68F 4I62A 2A07F 1ZRCA 3K0VA 5H8QB 4HS7A 1R7JA 5JHUA 2FXAA 2DWJA 3HHFA 4EJUA 1B32A 5LRSA 2AIXA 4PE5B 2RKHA 4BHCA 4YIFA 3KP2A 1ZGAA 2VODA 1KWHA 3O2PE 1R9LA 4DE8A 4XKNA 3WTZA 5CVUA 5KVRA 4I01A 3IKVA 1IQ7A 1US5A 2Y7PA 1D8KA 3V83A 2ANJA 4IY6A 5CBRA 2Q89A 4IPAA 5DEXB 1EH6A 2RC4A 4CO8A 4ZYEA 3ZMSA 1URDA 2VE9A 3RY3A 3T9XB 3ZQ7A 2ZYOA 4BLAA 1LBBA 3OO6A 1D4NA 3F22A 2DK5A 1P1OA 3Q26A 1L5TA 4MBPA 1AOVA 2Q2CA 2A6HF 4OIOF 4C0RA 2V84A 3ERED 1XSDA 1AMFA 3NQOA 1R6ZA 4QFNA 4HDVA 1A8EA 2FA7A 1MQIA 1BN5A 3DPLC 1LB9A 1Z6RA 4G8NA 3RT8A 5DYHA 3MP8A 1XVXA 5AA3A 2DE2A 3MUQA 1J75A 4KI0E 5L3GA 3E3VA 1GGGA 5LEJA 4NEDA 3RLFE 1YLFA 4XKRA 2MC3A 4TLLB 2ZXJA 3NRVA 3LSXA 3MFKA 1I6XA 4LK0F 2VC1A 1XT8A 2LNBA 4HQEA 2CG4A 1IXCA 1H9TA 1S9TA 1IN4A 2BGCA 2O51A 4ONYA 4UV9A 2L02A 5DD8A 2ACJA 4QFLA 3GF2A 3OEMA 5D5UB 5JR3A 1MXYA 1W7PB 2RV8A 1IRFA 5CVIA 1B3LA 1B2HA 2KIFA 4JB7A 2FMYA 3SEYA 4YG2F 2L54A 4R74A 1BKAA 1AH5A 1MY2A 4I02A 1K6OA 2FRHA 3WTVC 2P4WA 1D9YA 3U92A 2DU9A 2FU4A 1D5VA 4L5JA 2UYEA 5H8HA 1ZIUA 2M30A 2IRFG 5KCJA 4XSZF 3VVDA 1B7HA 3SDFA 4UACA 2Y75A 1Y1ZA 4BDNA 1M5EA 4LUBA 5DT6A 3FX3A 3FV2A 3C4MA 4R9GA 3VDFA 3RQTA 3IHUA 4MEXF 4H67A 1LNWA 4QF9A 2XXUA 3RT6B 4GXOA 4IVNA 3IORA 1B3FA 1LCFA 3Q5FA 3KG2A 4EF1A 1HW1A 4OHNA 4JDFA 3JTHA 3GZ5A 2REGA 4F3GA 3DXJF 2G93A 1FQDA 2F6PA 3S9EA 3I6VA 2UVHA 1A7LA 3ZMDA 1ZARA 1UTHA 4OOIA 3K1MA 1SD5A 5IT3A 3V5AA 1IXHA 2A5TB 4LZ5A 2W25A 1B3HA 5DVIA 3Q25A 2F5CA 1XOCA 1M5CA 5LGUA 1LBCA 4OTEA 4MH5A 4EGYA 1F9NA 2ZMEA 3T8RA 1QKAA 1OVBA 1R1VA 2I6EA 3DP6A 4JBZA 5FHMA 3CFLA 3DM0A 2QS1A 1RUOA 4HX7A 1SD6A 3H3GA 3W9VA 4EVIA 4N0BA 1TQPA 2CO5A 2CSOA 1HQCA 1JVYA 5JVTA 2V93A 4OWDA 3BKIB 1MJAA 1MPDA 2VHAA 2IT0A 2H5YA 3LA2A 3ZP5A 1MXVA 1ZJLA 2RCBA 2VXZA 5EHSA 3KN7A 2I3VA 4M9XA 1YAEA 2ALUA 4U1ZA 3CLOA 1DDNA 5AA2B 2BEOA 2KKOA 4P9UA 4R6KA 4NHJA 5FO5A 1JW4A 4P96A 1OLCA 3G7WA 4O6JA 3MPKA 4X48A 1FNNA 2H6BA 5HVQC 1LJ9A 3BBRA 5ITOA 1S50A 2M87A 4OFOA 1VFDA 1FP2A 3S9LC 3KP6A 2ONRA 3HSTA 1JHFA 2HQRA 1YW8A 3K1PA 1WODA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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