3HKRA

Crystal structure of glutathione transferase pi y108v mutant
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
208
structure length
208
Chain Sequence
PYTVVYFPVRGRCAALRMLLADQGQSWKEEVVTVETWQEGSLKASCLYGQLPKFQDGDLTLYQSNTILRHLGRTLGLYGKDQQEAALVDMVNDGVEDLRCKYISLIVTNYEAGKDDYVKALPGQLKPFETLLSQNQGGKTFIVGDQISFADYNLLDLLLIHEVLAPGCLDAFPLLSAYVGRLSARPKLKAFLASPEYVNLPINGNGKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords Glutathione S-transferase P
publication title Influence of the H-site residue 108 on human glutathione transferase P1-1 ligand binding: structure-thermodynamic relationships and thermal stability.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 208
sequence length 208
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-05-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3hkrA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hkrA01
2AAWA 1Y6EA 4ZL7A 4EE0A 1XIYA 5F06A 2FA4A 3A2WA 4MP4A 3HD5A 3I69A 2GTUA 4RUVA 3IOSA 1ZYQB 1U6TA 4N30A 2FA8A 4J56E 3BJ5A 3FW2A 4PX1A 3GV1A 4NV2A 1T4ZA 1A0FA 3TUEA 1R4WA 3LWAA 3FZ4A 2LV3A 3TJKA 5AISA 4HU9A 2FWFA 3GX0A 2DLXA 4L0WA 4TW5A 5GSSA 1K0BA 2GLRA 3ISOA 5ELGA 4G0KA 4OFMA 4GSTA 2MMNA 2P5RA 1QK8A 3CTGA 3D4MA 4V2LA 2H6YA 2KHPA 3HYPA 4CDOA 1T8EB 2WB9A 2YV9A 3VURA 3VFIA 4GLTA 3DYRA 3ZREA 3M3MA 3IXRA 1MTCA 3ERGA 3UBKA 4O7HA 2C0GA 1ZGNA 1GSEA 4Q5FA 1I5GA 2VM1A 2RUFA 2C0DA 4EXJA 1KBNA 2HT9A 3TJBA 3HVVA 4PURA 4KGIA 1GWCA 1G7EA 4ACSA 1YJ6A 4POMA 4K0GA 1PQNA 2IMDA 1ERUA 5ECNB 4XCSA 2AYTA 4MF7A 4FO5A 4HQZA 4X1UA 2DMLA 3L78A 3LYKA 4G9HA 2LRTA 2EIOA 1WPIA 1FVKA 5EL8A 3BCKA 1AUCA 3E9JB 3IHQA 4RI6A 5L71A 2FCHA 8GSSA 3A3TA 4XS4B 4TR1B 1LBKA 3H4KA 1GSQA 1X5DA 3IC8A 4BVYA 3EU4A 2GSRA 4MJCA 5CRWA 4K7OA 4BVXB 1AXDA 3IC4A 2GQLA 5IMAA 3ZTLA 3VWVA 5G31A 1PGTA 1NHOA 1XFLA 2CAQA 3DKSA 4KCEA 5CRDA 1TK8B 4WF5A 3VK9A 3UIWA 3QAGA 3GH9A 4V1Ap 2GSSA 3KMNA 2CAIA 5D9VA 2JZRA 2H1DA 5ID2A 4JBBA 3D21A 5D8IA 1Z3EA 2R3XA 4XHMA 5AIVA 3ERWA 1GSSA 2H30A 2DC5A 2YWIA 3U6VA 4WXTA 1GNWA 2L4QA 3TKPA 3UL3A 3GKXA 1V58A 1X5CA 3JCML 2J23A 2ON5A 4KSOA 4EC0A 2HRNA 2C1YA 1LJRA 3TJFA 2HSHA 3KM6A 1NM3A 2A2RA 5D9TA 1AW9A 2JU5A 1OKTA 5ECKB 1XPVA 2ALBA 3L9SA 1E6BA 4ULXA 4HDEA 2RM5A 5DAKA 3VI7A 4F9ZA 10GSA 4I6XA 2QSIA 4WEYA 1M9BA 1F2EA 3TKQA 3AY8A 5J3RA 3ZL5A 3FRCA 2VCQA 3FZAA 1JHBA 4MPGA 4K2DA 1O81A 3F4TA 3KP9A 3F3QA 1WE0A 2NTOA 5GAPD 1OVNA 2X8GA 4O92A 2IWTA 5H5RA 3RHBA 2YWOA 2FLSA 3QMXA 3UARA 4ILFA 3KZQA 3MDKA 2RIIA 3QAVA 5A4UA 3D22A 2GZZA 3SWLA 4ZXGA 3KEBA 2UZ8A 3G7IA 2O7KA 4WETA 2FGXA 5CO3A 3GKMA 4IN0A 1GTIA 1TRSA 2KP2A 1TXXA 3ME7A 2IMEA 2X99A 2H71A 5H5SA 4IHUA 2E2MA 1XW6A 4F0BA 2AV4A 1YKAA 4O5RA 4G2EA 2YZHA 4WF4A 1GRXA 2F51A 3ZFBA 4PUFC 4KW6A 22GSA 3M9KA 3Q6OA 2LEGA 1ZOFA 1OE7A 1B48A 2B7KA 4ZB6A 2NPBA 4N0VA 5ECHB 1K3YA 1WWJA 2DBCA 5E4WA 1EGRA 4ECCA 3MWHA 19GSA 2TRXA 2I3YA 4ZIJA 2ZNMA 2GSTA 3HJMA 2MZCA 4XS4A 4TR1A 1PKWA 2YANA 1NSWA 5IPHA 5EVOA 2JZSA 3KTLA 5EPFA 1ML6A 2P31A 3A5WA 2OBIA 3FEUA 5GZZB 5D96A 2RUEA 1O8XA 4GSNA 4TR0A 3DRNA 5DBQA 3APOA 5ELAA 5G1LA 3FKFA 1ZMAA 1SKWB 2OACA 4ID0A 1M9AA 1MD4A 3QCPA 1YZXA 5CRHA 1DE2A 3E0UA 1PA3A 1UC7A 3GYKA 5HQPA 5FT3A 2DJ3A 1U88A 4XS6A 2R6KA 4HUAA 2GDRA 2CA8A 1EZKA 1SL1B 5DVBA 2OA7A 2VD1A 3QFBC 2YN1A 5G5FA 5IMCA 2KLXA 5ENUA 1Z9HA 1SKSB 3TRPA 2B3SA 4NAXA 4V1Ag 1TK5B 5ECIB 3TKSA 3CSJA 1Q4JA 1RK4A 2PGTA 4MJEA 3GTUB 2KP1A 3GH6A 2JSZA 4FYCA 1YEXA 3PH9A 2O87A 4X0XA 2WDUA 3NIVA 5F8BA 3IV4A 1VF1A 4POBA 1O73A 4DSQA 1SENA 3LG6A 2YV7A 4LMWA 2LJKA 3LQ7A 2V2GA 1GUMA 2DIZA 4N0ZA 3IK7A 3C7MA 1AC1A 4IGJA 3D0ZA 4OO5A 4KH7A 3H79A 2L57A 4IP6A 4AJ7A 11GSA 2LUSA 2XBQA 1S3CA 3C73A 1TKDB 5CRGA 4ZB8A 3QDNA 4PNFA 4ISDA 4G10A 5AIXA 3ZMKA 1HD2A 3BCIA 4TN8A 4Z7XA 4PXOA 5LNKe 5B8BA 1XWGA 3UVHA 3HJOA 4X43A 4OWYA 2LNTA 1QFNA 1ERWA 2GSQA 2OADA 1M2BA 1TI1A 1BG5A 5AN1A 2H19A 2L5LA 4I2TA 4KDXA 1X9MB 4E8EA 1OKDA 1DBYA 1Z7PA 1U3IA 3U5RE 3IE3A 4OCFA 3CRTA 3TCOA 2B7JA 3UEMA 5CNWA 4MK3A 2HFDA 2PUKC 2PVQA 5IO2A 3FY7A 2HQTA 4ZL8A 1JZOA 1AIUA 4O32A 2AJQB 1XZOA 3FR3A 4KAEA 3GKNA 3G9BA 3HA9A 3MAKA 3M8NA 4KB3A 4HU7A 1JZRA 2GS3A 1ZYEA 3LXTA 1UVZA 1PD21 4USSA 4BWSA 2C3QA 2L59A 2YNXA 1VRSD 3DXBA 1G0TA 12GSA 2WS2A 3GFKA 4J57E 1J9BA 2PVOC 3LEFA 1TK0B 4GWRA 1ZL9A 3A2VA 4XS1A 1XW5A 4GSSA 2GZYA 3F8UA 4KF9A 4GCIA 3KTBA 3HDCA 1K0AA 2NVLA 4EKZA 3R2QA 3CTFA 5ABRA 1A8YA 1GSYA 4MH2A 3CRUA 3EYTA 2HZFA 3KH7A 4DSSB 3G7YA 1XWAA 4KUNA 1A23A 1ACVA 2H6XA 2HSNB 2DJ2A 2C3TA 3QPMA 2VLTA 2WFCA 2LKUA 3CXGA 1HYUA 2VOCA 5IMZA 2K6VA 2FHEA 2GVPA 1SKRB 4L0UA 1GUHA 3ZITA 4MA9A 3IK9A 2M46A 3GA4A 3KIJA 1XOAA 3IDVA 1IYIA 2H73A 1SK0A 1QXHA 1H75A 3GKKA 1C72A 1MDIA 3TRQA 2H8LA 2RLIA 2C4JA 5IMFA 1A24A 5F05A 3QAWA 1WRYA 4LL4B 3HY2A 4KX4A 1K0OA 3F6DA 1GULA 4ZB9A 1OC3A 2DIYA 2FWHA 1T00A 1K0NA 3ZFLA 2VO4A 1URMA 3GTUA 2YOIA 4XRAA 3L4NA 1F3AA 5G30A 1QUWA 1A2MA 2K18A 1F37A 2WZ9A 2HLSA 3LSZA 4FYBA 4NHZA 4Q5QA 4N10A 5B7CA 1AQWA 2YP6A 4OO4A 3TDGA 6GSVA 5HFGA 3LFLA 1TTZA 4MF5A 3UOMA 1G6YA 2GT6A 4JRRA 3KGKA 1XXUA 3E3EA 3DD3A 4OD7A 4MF6A 3RAZA 3N9JA 3F4SA 1GNEA 2YJ7A 3FHKA 2C80A 4RI7A 2ES7A 2GT5A 2HRKB 3DEXA 2MBSA 2PU9C 2PERA 1FHEA 4QL7A 5G1KA 4GQCA 2KOKA 3FR6A 1PL1A 5E59A 2VCVA 3KMOA 4ZL9A 4IW9A 2HZEB 2QC7A 1K0MA 4GQFA 3P90A 1HNCA 4ML1A 2H0GA 4TOPA 1AAZA 2VCWA 2F8AA 3HXSA 4EO3A 5J9CA 4ZBBA 3P2AA 2B5EA 5IIZA 2CT6A 3L0HA 2HI7A 4AJ8A 2XHFA 1PSQA 1XVWA 2V1MA 2LSTA 5C04A 3VWUA 4K0NA 1K0CA 2R2JA 3I43A 2MMZA 3IR4A 4MABA 1FB0A 2LRCA 2M72A 3RHCA 3WT2A 2YJHA 1M0UA 4XTSA 3L9UA 4QL9A 3ZIJA 2IN3A 1Z5YE 1BAYA 1A0RP 3O76A 4I2UA 2B5XA 4J2FA 1FOVA 4L5LA 3HZ8A 4L8EA 3HKRA 3PINA 3PR8A 3W8JA 5J4UA 2AUVA 3GHAA 1GLQA 4NHWA 2WCIA 4HJ2A 4PUAA 4G19A 2CV4A 1DUGA 4CHSA 2ON7A 1WJKA 2LJRA 2BMXA 4ECJA 3ZZXA 2H1AA 3RDWA 4K1FA 2VCZA 3WGDA 2VCXA 1THOA 2MMAA 2G0FA 1F3BA 5GAND 1V98A 4DSSA 3DIEA 3D6IA 4AF2A 4HEA2 3F4RA 1OC8A 3QR6A 2V6OA 2F9SA 2YPMA 3QFAC 2O89A 3VWWA 5IOWA 4MJAA 1U87A 3IRAA 2BTOT 2HSMB 4NMUA 5B6NA 1M7TA 6GSTA 5EY6A 5FWGA 2JL4A 1SJ6A 1R7HA 4P3YB 4ECBA 4KDYA 2N5AA 2CQ9A 9GSSA 3TKSC 5AGYA 4F03A 2B5YA 1SD9A 3K8NA 3EU3A 3KXOA 1GH2A 1PN9A 1GL8A 2X8CA 5DQSA 1THXA 13GSA 1HNAA 4Q5NA 1EWXA 1LU4A 5KN0A 4YQUA 4JE1A 5CP1A 2H72A 2FNOA 2EC4A 3UBLA 1GUKA 1B4PA 4YQMA 2WULA 5J9BA 4L5OA 2OE1A 3H1NA 2YCDA 3LJRA 3TOUA 4HZ2A 5A4WA 2REMA 4N11A 4NPBA 4CW9A 2H1GA 4LLRA 3VLNA 3R3EA 1KEBA 3CYNA 1GTAA 2H1BA 5DALB 2DJKA 4AGSA 3GNJA 1TRUA 3LYPA 1X9SB 2HRKA 1WMJA 2LNSA 2LJAA 2H0HA 5CAXA 2VL9A 3J7Yk 3RPPA 5IOXA 4PGTA 1TW9A 3ZYWA 1RQMA 2HZEA 2O8VB 2HXKA 1SL2B 2HE3A 1A8LA 1QMVA 2F8FA 3IBHA 1TOFA 4KE3A 1GP1A 2RM6A 2H6ZA 1PL2A 3DVWA 3WT1A 1KTEA 3ERFA 5G2ZA 1PMTA 2LTKA 5KN3A 1X9WB 2V6KA 5HFKA 2AHEA 1T4YA 4IBPA 4MZBA 1FO5A 3KCMA 4POLA 7GSSA 1SJZA 4XIHA 3O3TA 1XCCA 4V2MA 1BYEA 1YF0A 3V1WA 5F0GA 5FHIA 5F07A 3I9V2 4Q5RA 4IQ1A 2H75A 2JZTA 1YKCA 2X64A 2K8VA 1TP9A 4GRFA 1ILOA 2VUPA 1VGLA 2A2SA 6GSYA 2KUCA 1XBSA 3HJPA 3EURA 1F9MA 4KCAA 5HR0A 4NV5A 16GSA 3VPQA 2IIYA 2B1LA 4BWQA 4GF0A 4PTSA 5JCUA 1ON4A 1SU9A 1GTUA 4JZQA 1J08A 2OJLA 4MZCA 4EVMA 2DJJA 3NOFA 4MLYA 1ERVA 2OE0A 3PGTA 3LORA 2I81A 5G5EA 6GSSA 4D73B 1SK2A 6GSWA 20GSA 4ML6A 2DSAA 2FUG2 4IQAA 2JSYA 3ZIVA 5JWOB 1AQVA 2M80A 3A2XA 5D9WA 1DE1A 2LQQA 2IFQB 2HSMA 5DDLA 4FH8A 3GUSA 3EE2A 1B9XC 2DJ0A 4TKYA 3GN3A 2PN8A 1W89A 3RBTA 2ZCTA 1EOGA 1TI3A 3M0FA 3Q19A 1G7OA 1K0DA 3CBUA 2XPEA 2CZ2A 1EGOA 4WR5A 4MZWA 2I9HA 4K8MA 3WGEA 2XC2A 4HOJA 3ME8A 1NHYA 2YWNA 1A2LA 3CSHA 5BMUA 4IS0A 3QD9A 2E0QA 3GRXA 4AJ6A 3NZNA 4IELA 2V32A 1MDKA 2D2ZA 3FZ5A 4FQUA 3IA1A 2C8UA 5H5QA 1SYXA 2L6CA 4GXZA 1EP7A 1USBA 5DCHA 1DSBA 1Z6NA 4MCUA 1PX6A 1PX7A 4FIWA 4IVFA 4BL7B 5DALA 2FWGA 3GL3A 3F63A 5ECRB 5KEJA 1X0RA 3DMLA 4NXIA 5COHA 4ZBAA 2IMKA 1EV4A 3GL5A 2J9HA 1QGVA 5IMVA 2TRCP 5CYYA 5DJLA 3LGCA 1VF2A 4TRXA 1XWBA 1U3AA 3EMXA 1ZCPA 4YAVA 3APSA 3MNGA 3TJJA 5B6MA 2ZUPA 1CQGA 4YQVA 1OC9B 3CSIA 1SK1A 4POKA 3TJGA 3HZ4A 4PQIA 2NBSA 2QKEA 5ECMB 3W6GA 3DGQA 1EEJA 5HR2A 2OBKA 3KD0A 1VF4A 3BBYA 4RQXA 1OAZA 4XRDA 1BEDA 2YWMA 3H93A 5C00A 1PKZA 1HNBA 1YY7A 3QOUA 3VI5A 2GQMA 2BJXA 1UN2A 5DCGA 6GSXA 2I1UA 2GGTA 1W4VA 4YAPA 2TIRA 4WBRD 3KJYA 1JFUA 4BA7A 1WIKA 4HJMA 2JADA 3HHVA 3IAM2 1S3AA 1V40A 1F6MC 3O6TA 2L6DA 2VL2A 2N5FA 2CX3A 2HNLA 1EV9A 3HVSA 1I9DA 4D73A 2GQKA 4EDZA 5LD0A 5IO0A 3F3RA 1N2AA 4F0CA 3APQA 1TU7A 1EP8A 2PMTA 5IM9A 2H70A 1FAAA 2IFQA 1JLWA 2H0IA 2VD0A 3HVXA 5IQYA 1OYJA 4TVEA 1TU8A 3Q74A 3ED3A 1SYRA 2MBTA 3WGXA 4LMVA 5ECSA 1YQ1A 2V41A 3G7JA 2H66A 3DWVA 2VAFA 2H01A 2P5QA 3ZVJA 4EDYA 2MYGA 2WGRA 3ZRDA 1GSFA 5JWRB 1CQHA 4EF0A 3I6AA 1KNGA 2OKAA 3GSTA 3FYGA 1K3OA 3VPTA 3J7Yb 1V2AA 1V57A 5HFIA 1UA5A 1TDIA 1FG4A 2N5BA 1O7UA 3PPUA 3EC3A 1SL0B 3EWLA 3F0IA 3UVTA 2C0EA 5D9XA 1J0FA 4ECIA 1XWKA 2PPTA 3L9VA 1TRWA 5D93A 3KH9A 2HSYA 4BL7A 4WKWA 2DMMA 4TXOB 1EEMA 4OFTA 3EINA 1TRVA 4JR6A 2MMOA 4OCEA 4HS1A 3ZVJD 2LRNA 1MD3A 2I4AA 5JWQB 5IPGA 1H4OA 4DEJA 3FK8A 5DJMA 4FYUA 1OC9A 5D73A 2HRFA 4EL1A 1IYHA 3CMIA 1SJIA 2VLUA 3SBCA 2IJYA 3GMFA 3UMAA 3EVIA 2WRTA 1NW2A 4MPFA 5KN2A 2C3NA 5ECLB 4OFNA 1GSDA 4BPYA 1X5EA 3MSZA 1V9WA 4V2NA 1Z7RA 3N5OA 3D4TA 2AB6A 2F3MA 2HYXA 3M1GA 1GLPA 3M9JA 5HR1A 1AQXA 2VL3A 1M99A 4OMVA 4MH3A 2JACA 3WD6A 4YH2A 4JU5A 4RQRA 5J5NA 3UJ1A 1GTBA 5A5KA 2C0FA 2IL3A 2IMFA 1B4QA 2WJUA 5DQYA 3GIXA 2EIQA 2FWEA 1BQ7A 3TKRA 4QQ7A 4ZILA 4IP1A 5ECOB 2L5OA 3TB2A 2XPDA 2PBJA 1FW1A 2A4VA 3IAS2 5A4VA 2FY6A 4LA1A 3FZ9A 3GURA 4KSMA 2O85A 1FB6A 3DVXA 5J41A 1JLVA 1MEKA 4LL1B 1M2DA 1WOUA 1FVJA 1Z6MA 3GSSA 4BVXA 1M2AA 1XWCA 3FR9A 2Z9SA 4H86A 4JEDA 1E2YA 5CREA 2NDOA 1BJXA 1SD8A 2G2QA 3C71A 2HRAA 1TJDA 5IMDA 1JZWA 2K8SA 5KN1A 4I5QA 2IPAA 3VWXA 3TRXA 2E7PA 1R5PA 3P7XA 4F82A 1O6JA 5INYA 1R5AA 4K9ZA 3TGZA 1A2JA 3ZLPA 5B8AA 17GSA 3Q18A 4PQHA 2R37A 1Y25A 4IJIA 2CX4A 5LCZA 3P8WA 1O8WA 1O85A 2R5GA 4EUYA 1T7PB 3US3A 1B9YC 1PRXA 3BOAA 3KP8A 2E2GA 1G6WA 3C1RA 3HCZA 4HZ4A 1Q98A 4K7NA 1XVQA 4F2IA 2LS5A 1ABAA 4KDUA 3BD2A 2VCTA 5GSTA 4HQSA 4TR3A 2VIMA 3EMPA 2P0GA 5JCWA 1S3DA 2B1KA 2GZPA 4IJ3A 2VLVA 2K9FA 1WP0A 2CVBA 5JCGA 1ST9A 4K6XA 4MJBA 1GSUA 3WYWA 1K3LA 4TXOA 4ZBDA 2OE3A 2R4VA 1BX9A 4HI7A 3C1SA 2FD3A 1XOBA 1VF3A 2XBIA 1T3BA 4WR4A 4BVYB 4G0LA 4PQ1A 4TXVA 5ECPB 3D5JA 4GTUA 1ZZYA 4WBJA 4PNGA 2B6MA 2H76A 3C8EA 4MDCA 4KNDA 3ZMLA 18GSA 1HQOA 4E8HA 2VM2A 1T1VA 2QGVA 2DJ1A 1EOHA 4DSRA 3TKSE 3F6FA 3GX8A 4IKHA 5ECQB 1QQ2A 3IPZA 2YZUA 1N8JA 1R26A 2H74A 4NWYA 5ID2B 3TOTA 3S9FA 4I8BA 1ERTA 3UAPA 2L4CA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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