3HLLA

Crystal structure of human p38alpha complexed with ph-797804
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
348
structure length
337
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase 14
publication title Structural bioinformatics-based prediction of exceptional selectivity of p38 MAP kinase inhibitor PH-797804.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 105
structure length 337
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-05-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3hllA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3hllA01
3MV5A 4E73A 1U54A 4J95A 3R22A 3RCJA 2XRUA 3NIZA 4AOIA 3PIYA 4TWCA 5J87A 2YCFA 1H24A 3PUPA 3O71A 2R2PA 3Q6UA 4RA5A 4XP0A 4U40A 4M84A 3RAHA 2RSVA 3S00A 4J8NA 4I5CA 2E9OA 4JRNA 1ZYDA 3COKA 3NW6A 2Z7QA 4M0YA 4RA4A 4TYEA 3R2YA 3SHEA 1H00A 1ZRZA 4PWNA 4ANQA 4BI2A 2GNIA 2R3LA 4K18A 3TV7A 2BDWA 5E91A 4DGMA 2P0CA 1XH8A 4AT4A 1UNLA 4CTBA 4I41A 3FZTA 4XNEA 3UIXA 4M14A 5C8KA 3V6SA 4OTGA 5F94A 2QOQA 3OTVA 2UW9A 5CENA 2R3KA 1MUOA 3D9VA 2BRMA 4AAAA 3KY2A 5AA8A 3BEGA 4KRCA 4JAJA 3OT3A 1YI4A 4KRDA 1YXXA 4QO9A 3P79A 3BGQA 4FV7A 2FUMA 3EFKA 3FMNA 3KA0A 4BDAA 3QKMA 1LUFA 2RG5A 3MFUA 2ITQA 3CXWA 4FBXA 4BVUA 3EL8A 2J0IA 2FSMX 3IOPA 2VWUA 5CNNA 4KIKB 4BDCA 5I3RA 5I0BA 4ITJA 5JZJA 1YDRE 3O51A 3FI8A 4FVRA 3R1NA 5L8LA 4USDA 2W99B 3Q6WA 4DCEA 4ENYA 5HO7A 4CFVA 3REPA 2X2KA 4C4JA 5FXRA 3TUDA 3ZU7A 5CEMA 3OY1A 1NT2A 3L8SA 3KFAA 4ZIMA 1BLXA 4WIHA 5HG8A 3R7IA 3MY0A 4JQ8A 4Z55A 1Y57A 1OKWA 3M2WA 4JG7A 2CKOA 3HECA 2VNWA 2EUFB 4EEVA 2WU6A 1OVEA 4LRMA 4R3CA 2A0CX 4FTLA 3HRCA 5E8YA 5T3QA 5FDPA 4LMNA 2HWPA 4ZTRA 1FGIA 2BZHB 3WBLA 2JIIA 4BZOA 3A4PA 3GQIA 1P5EA 5IKWA 4D58A 4RIWA 3P1AA 5HE1A 5TE0A 4HYIA 4MF0A 2IW9A 3N4VA 3ZO3A 4ZS4A 3QKLA 3IG7A 4O0YA 3TNHA 1ATPE 2PUNA 4JS8A 3NYOA 2PL0A 3P7AA 4GFOA 4I1ZA 4ZTLA 3W16A 3ZEPA 3QL8A 1IAHA 2WOUA 4HZRA 3TT0A 4QTEA 5LMKC 4FT3A 2I6LA 3AC2A 2VX0A 5E9EA 3LFCA 1E9HA 3KQ7A 3CTHA 2C6KA 5FWKK 5AUXA 1KE6A 4LFIA 3ZBXA 2P2HA 5EK7A 3R8PA 5CEQA 4L43A 1DI8A 3RWQA 4J7BA 2J6MA 2C6TA 4FI1A 5BVDA 3E88A 4L6QA 2OF4A 4CFWA 4R1YA 4M3QA 3HX4A 5HE3A 2HWOA 4H58A 4MKCA 2BR1A 3WIKA 4TTHB 5IEYA 3Q4ZA 4XV3A 4U81A 3D2KA 4IAAA 3NNWA 2BHHA 3G5DA 2HZNA 1XH5A 4XX9A 3ANQA 4I22A 1LPUA 4U9AA 4DBXA 1RDQE 1WBNA 2P33A 2VD5A 4IC8A 3LMIA 3PXKA 2R3QA 4L67A 4R7BA 4X3JA 4RX8A 2ITXA 4BDIA 2O2UA 2PWLA 4YU2A 5BNJA 1Q4LA 3W32A 2WKMA 4FG8A 2YIQA 2OBJA 3M42A 4C33A 4EH4A 2P2IA 3OCTA 3LOKA 4HYUA 4UZHA 2PUPA 3KRLA 3WYXA 3ODZX 4Q9ZA 3DLZA 4XOYA 1FINA 4Y85A 4QRCA 3C51A 4MXCA 5AR7A 2HELA 1XJDA 3B2WA 3FSFA 1I09A 1UA2A 3PIZA 1SNUA 5EM8A 3PY0A 4IVCA 5LVMA 4FTJA 2ERKA 1VR2A 4K11A 2JFLA 4DCAA 2W1ZA 2YACA 1XBBA 2YZAA 4DYMA 4C3FA 1ND4A 4GKIA 3AMAA 4RJ7A 1FQ1B 5HNBA 3QBNA 3A99A 3QTWA 4YJTA 1U5RA 3BKBA 4IAZA 2X6DA 4DH1A 5LVOA 3OF0A 3PWYA 3C0GA 2UZLA 5H8BA 2IW8A 3U4WA 4BCQA 3PPJA 3W55A 4NL0A 5CTPA 3U51A 4WHZA 4FSQA 4QPMA 1U54B 4EQCA 2QOHA 2YM7A 1YHSA 3C50A 2C5XA 2GMXA 3KN6A 3PP1A 4IX4A 4NTSA 4JLCA 5AV0A 2I0HA 2IW6A 2QVSE 3IECA 1YDTE 4XV9A 4LMUA 2CJMA 3GU8A 2YM4A 5JK3A 1OZ1A 2QODA 4TZRA 4IM3A 3TKIA 5IEVA 3S0OA 3GU7A 5AUZA 5AUYA 2H9VA 2BZIB 2NRUA 2OXXA 2XK7A 5B0XA 5DT0A 3NMUF 4CEGA 1YHVA 4XBRA 3U87A 2B1PA 2XIZA 4I5HA 4EK8A 3E5AA 4CKJA 3DJ5A 2C3LA 2X9EA 4RZVA 2PUIA 1VJYA 4R5YA 5EG3A 5KHWA 2UZNA 4I5MA 1W83A 3DU8A 4FNWA 3PE2A 4I20A 5EDQA 4CSVA 4BIDA 2G1TA 3V5TA 2PMOX 2IO6A 2WTKB 2CNVA 1GZKA 3CGFA 4JDHA 4NEUA 4V05A 5JRSA 4K0YA 3TEIA 1X8BA 2PVMA 4H1JA 3BRBA 4XS2A 2WMAA 4YPDA 4DGGA 4IB3A 5CU6A 4XP2A 4FL3A 2ITWA 5CU3A 3UGCA 1REJA 3FC2A 3CKWA 3P23A 5DNRA 2F2UA 4F7SA 4C57A 2OWBA 3SXSA 1IR3A 4O96A 3LFSA 5D12A 3RCDA 3CY2A 3F2AA 3MTLA 3LJ2A 3RNIA 3S95A 2YCQA 5HEZA 1XO2B 4TNDA 3W2PA 5CASA 4FIHA 4IE9A 4RIYA 3OXTA 2W05A 3TZ8A 2XBJA 3CGOA 3V5WA 4LL5A 4G3EA 4D55A 3K5VA 2YIXA 3FQEA 3KRXA 4FK3A 4O82A 2C6MA 4O86A 3QZGA 2WU7A 5DYJA 1JBPE 2HIWA 3GU4A 2W1CA 1G3NA 3P0MA 1OL1A 5K0XA 4ZY4A 1RE8A 4RIXA 4F7LA 3COMA 5DFPA 1QPCA 4PNIA 3QHWA 5HGIA 2XS0A 3F3UA 5JMSA 3BHHA 3DK3A 3FKNA 4F9BA 4IJPA 2GS7A 3I7CA 5HIDA 2V0DA 3VJOA 2QI8A 3VRYA 5IDNA 4QP7A 5M56A 3DAEA 2JKOA 3NCGA 2XM8A 2YERA 2IJMA 4MK0A 4AE6A 5J9LA 4KUJA 4A07A 1IAJA 3LFEA 2J5FA 3KMWA 2PU8A 2JDTA 1DAYA 5BVEA 3PPKA 1H0WA 3EKNA 3OZ6A 3QA0A 4L46A 3BYVA 2I40A 4ACGA 1OKVA 5AA9A 4IX6A 1H08A 5HNGA 4F0FA 2XK6A 1BX6A 3P5KA 1K3AA 1ZYSA 4BCKA 4L8MA 3CPBA 4FKOA 3RGFA 3OWJA 5M07A 3VC4A 1M14A 1P14A 3ZO1A 5CVHA 4JIKA 5JKGA 3LPBA 1QPDA 4CMUA 3O8UA 2B9IA 1B39A 3UIBA 4I6QA 3EQRA 3PY3A 4AZWA 5LQFA 3RVGA 2CSNA 2BFYA 3PZHA 3F7WA 3SX9A 3UE4A 5BVOA 3F69A 4J8MA 4D2WA 3TACA 2FH9A 2PSQA 4DLIA 2NO3A 3OBJA 5LOHA 1Q5KA 3E62A 4G5PA 4NW6A 4IH8A 1ZY5A 5AP6A 4BICA 5KBQA 3KRWA 3V5PA 4K9YA 3FMMA 2BDJA 2WD1A 5I4NA 1M17A 1SVEA 2ZM3A 5EHOA 2PZ5A 4BDDA 3U54A 3OOGA 3JR1A 2WMSA 4FV6A 3EZVA 3T3UA 5CALA 4FTUA 5ANOA 1Q41A 4EC8A 3K3IA 4LM5A 4S34A 3NIEA 4EHEA 5L2TA 3SW4A 3ALOA 4GU6A 3WF9A 3JS2A 5IMXA 1WBTA 4DH3A 4LGDA 2IZSA 4ORKA 1U4DA 4R1VA 2YM3A 4L7FA 4II5A 1XH6A 2QHNA 3QQHA 4HCTA 4UXQA 2BIYA 1QMZA 2JEDA 3PSCA 5CSHA 3SOAA 4KKGA 4AT3A 3LXNA 4S33A 2CGXA 3FZ1A 2QD9A 5C26A 2IPXA 4WUAA 4D1SA 5HU3A 2UZVA 3PY1A 1J7UA 1FMOE 3I5NA 4IZ7A 4FZFB 4OT5A 2E9UA 4QT1A 4XG2A 4BCJA 4F6WA 4LG4A 1NVRA 4HVHA 2VNYA 4BY9E 4O2ZA 3HV3A 1UV5A 3W10A 2QOIA 1R78A 3VULA 3UDBA 4W4WA 3ZMMA 4DA5A 3EN5A 2BVAA 5HD7A 3QLGA 4YLJA 4D0XA 3OUKA 3CLYA 1XWSA 2Z8CA 3BHUA 3A61A 3E87A 4FTIA 4OBPA 3QCYA 1LEWA 4NFNA 4E6DA 2XK9A 4FIJA 2A19B 3ULZA 4PP9A 3AD4A 2WNTA 3AMYA 1GZ8A 4PMSA 5E8WA 5GIOE 4FUXA 3QUEA 2RG6A 4UWYA 4ASDA 4QMXA 5AR2A 2XIXA 1S9JA 3H0YA 3OS3A 4IXPA 4G3DA 2OIQA 4CRLA 5FTOA 4TWOA 1JLUE 1YI6A 2HW6A 2RFNA 3HA8A 3QCXA 4FL2A 2X8DA 5HO8A 4MBJA 4FSZA 2OFVA 3QD0A 2YCSA 3FQSA 4ALWA 4CFUA 3DBFA 1S9IA 2OFUA 4H36A 4P5ZA 5DGZA 4AW5A 2VRXA 1SVGA 2IVVA 4FSMA 4M0ZA 4TT7A 1ZOEA 5JQ8A 2H6DA 4CYJA 2OICA 3R0TA 4P4CA 5CI6A 1GZNA 2GTNA 4RVMA 1Q8YA 4FKRA 3ITZA 4L00A 4BDFA 4RJ6A 3ATSA 3KB7A 2BIKB 4C4EA 3QGWA 2I0YA 4GUBA 3RK9A 2BFXA 4FKWA 4JG8A 3BCEA 3ZLYA 2ITTA 4QQ5A 4JOAA 1LR4A 2XJ2A 1MQBA 3GBZA 3GOKA 4M68A 5TOZA 1L8TA 3G6GA 3ZHPC 4DFBA 3PXZA 3R8MA 2JD5A 3OTUA 4M67A 5GZAA 2HK5A 1JSVA 3UOLA 4FX3A 3QC4A 4TWNA 2OGVA 2OJGA 4CV8A 4OTPA 5CT0A 4RIYB 5AP4A 5BUEA 4KNBA 2PVKA 1JOWB 3A7HA 2X8IA 4U44A 4Y5QA 3ZOSA 4E4XA 3I6WA 3PJCA 2E9PA 1UU7A 2C0TA 3OW4A 4YJUA 4GYIA 3OBGA 4S30A 4J71A 3RPVA 3ORZA 4PTCA 1Q97A 3CCNA 2C3JA 1WBSA 2JDVA 2XNOA 3B2TA 1OI9A 4FT5A 4H39A 4RIXB 5E4HA 4GIHA 4FKUA 1MRVA 2VTSA 4TYJA 2UZTA 4AA4A 4O21A 2VWBA 1KUTA 5IQDA 4YR8A 3O8TA 3PDTA 5IH4A 4GG5A 5DG5A 3QFVA 3VS1A 5A14A 5AP3A 4FICA 1JQHA 4B4LA 4ZZNA 1K2PA 2YABA 5KO1A 4GFMA 2HYYA 3ORPA 4NM3A 3EFWA 4H05A 2VN9A 2ZAZA 2C4GA 2OJJA 2QHMA 2F7ZE 3EN7A 4HCUA 4NJ3A 4QP3A 5AV4A 4QTCA 4LOQA 3C0HA 4D2TA 5IQCA 1H4LA 4X3FB 2PPQA 4NZWB 3A7GA 3BV3A 3V3VA 5M53A 2ZV7A 5M4UA 3W1FA 4ZJIA 5KE0A 4EZ5A 3G9LX 2XJ1A 4AA5A 3ORNA 4H1MA 2YWVA 5IF1A 3W8LA 2CNQA 4AGWA 4CFFA 4EQUA 1PMNA 3HRBA 4FKQA 4TL0A 2J51A 3VIDA 3UYSA 1OPLA 5CEKA 3CR0A 3R1QA 4G5JA 2J9MA 4YC6A 1SMHA 3AC3A 4ALVA 3JVRA 4LOPA 5IQEA 1YVJA 4QP6A 3FC1X 4LGGA 2QOCA 3LFAA 4YLKA 4E4LA 4UV0A 3U4UA 3KK9A 4LUDA 2OZAB 2QR8A 1H28A 3AC8A 3PJ3A 4QNYA 2QG7A 2GS6A 1JSTA 1LEZA 3ORXA 1ZYLA 3DXPA 4NK9A 4HPUE 2ITPA 1BKXA 4FOCA 4ZOGA 5FG8A 2HZ4A 4LRKA 3COHA 2E2BA 3MVMA 4AW1A 4HVDA 3ATTA 3KF7A 4IAFA 4N70A 5EKOA 3A7FA 4Q5HA 2VTOA 5EYKA 4CKIA 4XV2A 4QTBA 4RWKA 4K8AA 3JY9A 5D1JA 5FRIA 5AUWA 4EWHA 5M51A 4AE9A 4K2RA 3W8QA 4KSQA 3QWKA 5BPYA 4DEEA 3FKOA 4DFZE 3RI1A 3NCZA 3RK7A 1PXLA 5A6OA 4U41A 4U79A 5FGKA 5ACKA 5IA4A 5AJQA 4EOIA 4BIEA 3HEGA 2A4LA 2VWZA 3NW7A 3PZEA 4YZDA 4EZ3A 4GJ3A 5HCZA 2WFYA 3TL8A 3QCQA 3VVHA 3VAPA 3WE4A 4YO4A 2XK3A 2I0VA 3N4UA 3W2QA 3HNGA 4USFA 3S3IA 2R7IA 2HXQA 3EJ1A 4QP4A 4QD6A 3Q2JA 5DT4A 4D2RA 5A4QA 2OXYA 2WQEA 3DAKA 2EVAA 1KE7A 3H4JA 4MD8E 1UNHA 4XEYA 4Z3VA 4G31A 3FDNA 4YTIA 3OFMA 5K4IA 3QQLA 5LMBA 4MF1A 4C4FA 3QZFA 5L8KA 4C36A 3RAKA 4KSPA 4O38A 2UZWE 2WELA 3FV8A 4TN6A 5HG9A 4C4GA 2C5NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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