3HM8A

Crystal structure of the c-terminal hexokinase domain of human hk3
Total Genus 157
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
157
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
SRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTGVQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFSSLVAATVRELAPRCVVTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Hexokinase-3
publication title Crystal structure of the C-terminal Hexokinase domain of human HK3
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 157
structure length 441
sequence length 441
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2009-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3hm8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3hm8A01
3A5MC 3CHWA 4BR7A 3QFUA 5AQWA 2I7PA 3VESA 3CQXA 2HF3A 3CJBA 4GY2B 2NZTA 3R6MA 3U8XA 5B8HA 1E4FT 1RGIA 1SZ2A 2Q97A 4BGBA 1WOQA 4IJAA 5AZJA 4FWMA 3QFPA 3CJ1A 1U2VB 3MDQA 2E1YA 4DHYA 2V51B 2D1KA 3J8AA 5AQLA 1TUYA 2F9WA 2PAVA 2H3GX 2QWOA 3EKSA 1D4XA 1NGFA 3H46O 3O08A 4FWNA 5AQVA 3IDHA 3R8EA 1ATSA 2EWSA 4BC2A 4I6MA 4GNIA 2Q2RA 3FGUA 5BRDA 2AP1A 4PL8A 3VEZA 1HUXA 2P9IA 3VEWA 5KPZA 4H5NA 1BU6O 3MN7A 1JCGA 4BC4A 4FPAA 1DGKN 1G99A 2Q0RA 4K42A 4A2BA 3AAQA 3MMVA 4WQ4C 2QWMA 2PBDA 3P4IA 4BRIA 5F0XA 4BREA 4CZIA 1XQSC 4BRGA 5BREA 2P9LA 3JS6A 3B8AX 3C7NB 3C7NA 3FFKB 3HSCA 5JLFA 2ZGZA 3HI0A 2GUPA 4JD2B 3MN6A 3VEYA 4CZFA 4CBWA 4JN4A 4FWKA 2CGKA 4DB3A 2E2PA 3BF3A 2YHXA 4BR2A 3GBTA 3LDPA 3L0QA 5EOYA 1YXQA 4A62A 2D4WA 2KHOA 3LDNA 1C0FA 3VGKA 5BPNA 4WQ5A 3VPZA 5AQRA 4CZLA 4BR4A 4H0OA 2P9PB 2P9PA 3JXUA 1P8ZA 2A6AA 5AQOA 3WXLA 4BRNA 1ZBSA 3MN5A 3QB0A 2E2OA 2W41A 4EIAA 1GLFO 4KBOA 1HKBA 5BR9A 3S41A 1KXPA 1GLEG 3AARA 4H0PA 1KAZA 1HPMA 4FWQA 3BUZB 5EVZA 5JLHA 2V7ZA 3GG4A 5I9EB 3CERA 3IMXA 3UKUB 3UKUA 1BA1A 4ISEA 3R9PA 5JICA 2YHYA 4CD1A 5AQHA 3W3DA 5AQZA 1GLAG 3A5NC 1QQMA 2HOEA 5AR0A 5KQDA 5AQYA 1KAXA 2E1ZA 1QQNA 2P9NB 3FZFA 4H0YB 4FWLA 3H1QA 3O5BA 2A3ZA 4MO4A 2HF4A 4DCHA 1HJOA 2AA4A 3CJ9A 3SLCA 3WQUA 4PL7A 4FWSA 4BRHA 2QW9A 3QBXA 4BR5A 3AY9A 1XC3A 2ASPA 5E84A 5AQPA 3DXMB 2Q0UA 3DXMA 3H45C 2GELA 4B1WB 3ATVA 2P9UB 2P9UA 1ATNA 2IVPA 4FWRA 3QICA 1C0GA 3ZX2A 4Z94A 3DXKB 4YDUA 4H0TB 4H5RA 5AQMA 2BUPA 5LY3A 1X9JA 3EKUA 2ZWHA 1LOTB 4BR9A 4PKHA 5ADXA 4B1YB 2CGJA 5AQQA 4H5WA 4BROA 4ISGA 4O5FA 3IUCA 4B9QA 4BRPA 4BRDA 2GTDA 5AZJB 1WUAA 1K8KB 1K8KA 1HKGA 3ZEUA 2FXUA 3EZWA 3I33A 5AQSA 3A8YA 4B1ZA 3VF6A 5BPMA 4M63C 4BRFA 4BC3A 4K41A 5LJVA 4PKIA 4H0VB 4I6MB 1BUPA 5KQ8A 2NRHA 1DKGD 2A5XA 3O6WA 3AAPA 1BWFO 2P9IB 3BEXA 1MWMA 2F9TA 5AFUA 3ZETB 3ZETA 4BQLA 1S3XA 2W40A 3F9MA 1GLJO 2GEMA 5AQNA 2YCHA 1V4SA 2GWJA 2QWPA 2YJEA 4BVOA 2FSNA 4IWVA 3VF2A 1GLBG 2P9LB 4YDUC 4DQ8A 1MA9B 3M3ZA 5AZIA 3VENA 4XEIA 4BRCA 2QXLA 1BA0A 2E2QA 3LM9A 2D0PA 3LDOA 4BVPA 4MLHA 3VF4A 3VEVA 2P9SB 2P9SA 3L6QA 3VOVA 1SQKA 3WQTA 1QHAA 1ZXOA 3ULEB 3ULEA 4LC9B 3WXKA 3M6GA 1NM1A 4A61A 3FE1A 2FF3B 1HLUA 4EAHD 1U6ZA 4EHUA 2A42A 4RWTA 3FZMA 5AQTA 3VGMA 2VCPA 5KPRA 1HKCA 1OKJA 4XH5A 4L3QA 2J4RA 3U9ZA 5TKYA 4BC5A 5F2RA 1CZAN 4CBUA 3FZHA 3G25A 1RFQA 2E8AA 5FPDA 5FPNA 3D2FA 3KHYA 2FF6A 4AM6A 1BDGA 1QQOA 2P9KB 2P9KA 4BQZA 3HZ6A 2ASMA 1LCUA 4FWPA 1NMDA 1R59O 3O1BA 2BTFA 3O8MA 4HWIA 3WXIA 2OANA 1T6CA 3A5LC 4BR0A 4NB4A 4CZEA 3CJAA 3O4WA 1ATRA 2FSKA 1GLLO 3H3NO 1H1VA 3IFRA 2NLXA 2DPNA 2Q31A 4IO8A 4WQ5C 4B1VA 4CBXA 4CZHA 1TYQA 1S22A 3ID8A 4FSVA 4M7XA 4B1UB 4CJ7A 2IVNA 1NGBA 2V7YA 4RTFD 4E1JA 4H5VA 3A5OC 4XH1A 2D0OA 3LM2A 4JHDB 1NBWA 4JHDA 3M1FA 4HTLA 3DAWA 4AM7A 4CZJA 3GDQA 3H1VX 5AQIA 1GLCG 3CIPA 3UB5A 3SMSA 4B1XB 1HX1A 3FZLA 3ENOA 3WEEA 1QZ5A 3ATUA 4BG8A 4WQ4A 1IJJA 3FZKA 5FPEA 4H5TA 3ZEUB 3HTVA 1DEJA 4M7YA 5E26A 2FLOA 1Z05A 2QM1A 3HBTA 4BRQA 4JAXA 4IXCA 4XH4A 5AQKA 1Y64A 4FWOA 3WT0A 4H0XB 1ESVA 2CH6A 4EHTA 5BPLA 3O80A 2YJFA 5ADXH 1U2VA 4FO0A 1KAYA 3H3OB 3SMPA 3UE5A 3DWLA 3VETA 2YHWA 3U9DA 1Z6RA 1J6ZA 3WUHA 3TU5A 5AZIB 2ZGYA 3QBWA 1GLDG 3ZX0A 1BG3A 4BRKA 1NGHA 4RCHA 3LDQA 4JNEA 1X3MA 4FL9A 2I7NA 3EO3A 5AQXA 2VYPA 3LL3A 1X3NA 1SAZA 2YI1A 4IJNA 5EX5A 3BF1A 3C0BA 4CZGA 4K25A 5AFUH 5FPMA 3ZX3A 3D7EO 1E4GT 5CE3A 5KPTA 5EXWA 3VEXA 4BRAA 2VWBA 3GE1A 3QDKA 1XUPO 2CGLA 4FPBA 4JD2A 5BRFA 2E20A 3GL1A 3WXJA 1EQYA 4BRMA 5JMVA 1NGCA 2Q36A 3KZBA 4WYBA 2E88A 2HMPA 3ENHA 3SK3A 4FOIA 1T44A 1TUUA 2A41A 4A2AA 1NGAA 5ELZA 1BO5O 1NWKA 3H6EA 5LJWA 1V4TA 2ITMA 3VEOA 2FSJA 4MLEA 2Q1NA 3D2FB 1BOTO 3CI5A 4FOEA 4PKGA 1YAGA 1YVNA 5EY4A 2QWLA 2IIRA 3VERA 3DJCA 2ASOA 3U4LA 4ISFA 1NLVA 5BRHA 3FLCO 3VGLA 3MCPA 4Y0WA 3D2EB 3D2EA 3BP8A 1NGDA 1MDUB 3L4IA 1T6DA 4NO7A 3CETA 3GOIA 4O8KA 3RSEB 3RSEA 2ZF5O 2QWRA 5AQGA 1JCFA 4QS8A 2IVOA 3UKRB 2E2NA 2UYTA 3UKRA 3FR0A 1TYQB 4H03B 1IG8A 3CJCA 2GWKA 3CQYA 3SJHA 1Q18A 1RDWX 3HM8A 1NGIA 4CI6A 4CD3A 3O1WA 3W0LA 4CZKA 3QMLA 3EL2A 1ZC6A 2CH5A 3EN9A 5F1XA 2P9NA 3OHRA 5AQJA 4BG9A 3CJ7A 3KVGA 3I8BA 1QZ6A 4BGAA 1NGGA 2QWNA 1YUWA 2A40A 2QWQA 5BN9A 5BN8A 4MO5A 3TPQA 1MWKA 4QS7A 3LDLA 4C23A 2WUSA 3WEEB 1NGEA 4IZ9A 4J8FA 4F9OA 4EFHA 4BRLA 5AQUA 4K43A 1NGJA 2V52B 5AQFA 3A0IX 3MN9A 4CZMA 1JCEA 3MK6A 4QS9A 3DXKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HYVA 3VESA 3CQXA 4GY2B 2NZTA 4TSXA 3U8XA 1E4FT 1RGIA 3K57A 1EP4A 4IJAA 4FWMA 2ZJPL 3THWA 3E9OA 3MDQA 4J2BA 2D1KA 4E7JA 2F9WA 2PAVA 2H3GX 3CG7A 2QWOA 3EKSA 1YITN 3T1YK 3R8EA 4B3OA 3ZT1A 1VQLN 4I6MA 3DLEA 4GNIA 1A5WA 3SBTA 4FM2A 1K73O 3FGUA 3TSUA 4MDBA 4B9UA 3WNHA 4H5NA 1JCGA 1LAVA 1DGKN 2B6AA 4F3TA 3AAQA 1OH6A 1IBMK 4DFPA 1NKCA 2HHVA 3PO4A 4BREA 4EP4A 1KFDA 4DU1A 4FJ5A 3B8AX 1C0TA 3C7NB 3FFKB 3HSCA 4OJRA 5JLFA 3HXMA 4OO1J 3CYMA 3V9WA 4DF8A 4OGEA 3MN6A 4CEBA 3VEYA 4CBWA 4FWKA 5KGWA 3VQCA 2KZZA 2YHXA 4A5BA 4BR2A 4DV1K 2O8DA 1NNEA 3LDPA 1YXQA 4A62A 2D4WA 4LF8K 4M42A 4WQ5A 5LMNK 4H0OA 3PSIA 2P9PA 2HBLA 4FJ8A 1HJRA 3WXLA 1SKSA 1N36K 1ASVA 1GLFO 3HP9A 4W5OA 1RTJA 4OPJA 4ILHA 2W6KA 1VSEA 3AARA 3OBWA 4DUZK 4DTSA 2NUBA 4IG3A 4JI3K 3DMJA 3O4NA 3OYBA 5EVZA 4IOAL 4FJGA 3GG4A 1OVQA 3IMXA 3UKUB 3ZLJA 4ISEA 5I3UA 3A5NC 1ASUA 4FVMA 4DG1A 3R3LA 1XMOK 2NRXA 5FROA 4UY8O 4IO9L 1N32K 4HVJA 3FZFA 5DM7L 4H0YB 3M8SA 1RT1A 1RT2A 4CGIA 1HJOA 1KLMA 3I8DA 4OX9K 3CJ9A 5M1OA 4BRHA 3AVMA 3DXMB 2Q0UA 3H45C 4B1WB 3KLIA 4FZXC 1ATNA 4H0TB 5AQMA 1J53A 3NMUA 3EKUA 4CEOA 2ZWHA 4JKHA 4LF5K 2GBZA 4BROA 3M5RA 3IUCA 4BRPA 4DTPA 4BRDA 2GTDA 5AZJB 5GADP 3QESA 3RMDA 2KLAA 3BZKA 1K8KA 1Z26A 3AVAA 4B1ZA 4F2SA 4M63C 3O9SA 5GAEP 3MAQA 1O13A 3OA9A 4PKIA 2G8HA 4IEEA 3MCAB 4H0VB 3ZSZA 4FK4A 3RR7A 1RT6A 1BUPA 4CF9A 4YOTA 3O6WA 3AAPA 1BWFO 2F9TA 2HNZA 1S6QA 3O9QA 3P83D 3IRXA 1ZBLA 4JKFA 5AQNA 4KTWA 3MEDA 3RR8A 2YJEA 3EYZA 4H4OA 1WAFA 4BVOA 3E9LA 3SUNA 1CXUA 4Z4FA 3O3FA 3CCLN 2F8TA 4FJLA 1IKVA 4R5PA 3PSFA 4IBNA 4BVPA 1VQ9N 3VOVA 1SQKA 4DSKA 3LDSA 4DQRA 1YVUA 4LF6K 4LC9B 1MU2A 1NM1A 4PHTX 3SQ1A 4A61A 2IOCA 4N56A 2FF3B 2OCEA 4CJWA 1BCOA 4RWTA 3QERA 4ELVA 2PYLA 2X74A 3NH0A 4XH5A 2B4JA 3U9ZA 1WNSA 2BH1A 3HOSA 4E1MA 4CF0A 2QI2A 2O8EB 3D2FA 1UA1A 4NCBA 4HCCA 2P9KB 4RW7A 4KTZA 1LCUA 3VMFB 4GVMA 3O8MA 4HWIA 1RDUA 3J7AP 1EETA 2O8BA 1T6CA 3N4PA 1LWEA 1S1TA 1ATRA 4AF1A 1QHTA 3PY8A 3MWPA 3ZSXA 2ZD1A 4O8UA 3SQ0A 5KI6A 4B1VA 3FFIA 4WQ5C 3WXMB 1TYQA 5GIOA 4KHSA 5CYMA 4Z4HA 2KTQA 4CJ7A 4FZZA 4H5VA 4XH1A 4HHTA 1JXEA 4U7BA 3M1FA 1DLOA 4AM7A 3H1VX 5AQIA 3SMSA 5AJ3K 3ZSQA 4GKJK 4BWJA 4DV6K 1KD1O 3FZLA 2E6LA 3LALA 3WEEA 3ID6A 4WQ4A 4CJKA 3DOKA 3ZEUB 3K59A 3HTVA 5M1FA 4NXNK 4CVNE 4DMNA 4PY5A 3L3UA 1F21A 3ZSOA 1M1KO 3HBTA 4CEQA 3ZSVA 4CJUA 4JK9A 5JS2A 1Y64A 5BPLA 2CH6A 4EHTA 2I5JA 2DTUA 4FO0A 4GV3A 4Z4CA 4K0KK 4NLBA 1Z6RA 1J6ZA 4CHPA 1WBBA 4ZTJA 3VQEA 4G9ZA 1NJZA 1WSIA 1NOYA 2ZGYA 4JK8A 4BRKA 2XY6A 1ITGA 1BISA 3AA5X 1VQNN 5AQXA 4B8CA 4AHRA 2RN2A 3LL3A 2XY8A 2GUIA 2YI1A 4IJNA 3BF1A 3C0BA 2X6SA 3JSMA 1S5JA 4K25A 3NBPA 3M8QA 2QEXN 5KPTA 4LF4K 4CJ4A 3GE1A 4JK7A 4E19A 3HK2A 3NCIA 1HNWK 3THVA 2E20A 3SUQA 2YNHA 1UA0A 3G0ZA 4CFAA 2QKKA 2Q36A 2E88A 4FOIA 1B92A 1TVRA 4I9QA 4RW6A 2IC3A 1L5UA 3KKRA 2FBTA 5D3GA 3T1HK 3I56N 1VSFA 4DTXA 4YOVA 4FOEA 1YAGA 2A1RA 5EY4A 2VG7A 3K0SA 1IKXA 1W2BM 4M3WA 3NVMA 2IIRA 3VERA 3OYGA 3NVKA 3CC7N 2WONA 3DLRA 3KD5E 3RMAA 3MCPA 4JI5K 3D2EA 2HSTA 5FLXO 1IBLK 4CK3A 3L4IA 3B6PA 4CEAA 5KGXA 3RSEA 1FXXA 2QWRA 1VRTA 5AQGA 4KREA 2HHQA 5HLFA 3FR0A 5CZ2A 3CJCA 2WC9A 3CQYA 1B9DA 1NJXA 2HNDA 3PUFA 5EU7A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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