3HN1A

Crystal structure of hcr/t complexed with gt2 and lactose
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
450
structure length
442
Chain Sequence
NLDCWEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Tetanus toxin
publication title Gangliosides as high affinity receptors for tetanus neurotoxin.
pubmed doi rcsb
source organism Clostridium tetani
total genus 118
structure length 442
sequence length 450
ec nomenclature ec 3.4.24.68: Tentoxilysin.
pdb deposition date 2009-05-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07951 Toxin_R_bind_C Clostridium neurotoxin, C-terminal receptor binding
A PF07953 Toxin_R_bind_N Clostridium neurotoxin, N-terminal receptor binding
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 3hn1A01
2.80.10.50 Mainly Beta Trefoil Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) Trefoil (Acidic Fibroblast Growth Factor, subunit A) 3hn1A02
3VT2A 5BQUA 3AP5A 4Z8BA 3H6RB 5EG6C 1MACA 5AVAA 4YGBA 3BTAA 4YW4A 1HWMB 4Y24A 1G9FA 1QQLA 5BXRA 2HWMA 1FMMS 2RG9B 1HQWA 1C1FA 5GZCA 1V6LA 4J2SA 1LOCA 5DZGA 2EALA 1MS9A 3BA5A 3ZXJA 3WUDA 4P6AA 1LOAA 1SACA 1PUUB 2GO2A 3UD8A 1CESA 4GWMA 5T5OA 2JD4A 7I1BA 1AJOA 1N1TA 5F90A 1Q56A 1MVEA 4Q8KA 2NYYA 5DG2A 1TFMB 4YW1A 3SH5A 4YLZA 1DHKB 1HWOB 5GZGA 3Q7YA 1W6QA 4M3CB 1AJKA 3FJDA 4EFRA 4BQ1A 1IRAX 2R9KB 3CNAA 4EEEB 4I0YA 4XFTA 1YYNA 1LGCA 4F83A 2DWRA 3FJJA 3H0OA 1FGAA 3OJMA 1S1AA 1Q1UA 1JHNA 1ISYA 3PVNA 4Q9GA 3OPZA 1Q04A 5BVPI 1DQ0A 2J3PA 4GOVA 4OEEA 4AGRA 2VSEA 3WDUA 5GLUA 3QCWA 4XKIA 4YFZA 1B09A 1KNMA 1TP0A 3UJ4A 4IHZA 1VAMA 1SLCA 1SBEA 5T52A 5DZUA 3D7WB 2WT1A 3RQ0A 2A3XA 5DZFA 2CYFA 4A7KA 2P3KA 4FPYA 1V6UA 1DGLA 3LTQA 2X2SA 3VKFC 4M3CF 3ZX7A 3V0BB 1KITA 3D4KA 1S0EA 3IN9A 4FQZA 3QYDA 5FRAA 3SNMA 1IOBA 3O4OA 1DQOA 1LOGA 1WBCA 3AJ6A 4TLPA 2JDZA 4W65A 1AVAC 2DTWA 3BIWE 3FLTA 5KXBA 4I37A 5GAQA 1N3PA 1X50A 5EC5A 4LBJA 3E8LC 1GANA 2ZQNA 1I3HA 4I4VA 2DVAA 4I3NA 1BXHA 1GZ9A 2ZMKA 3AKGA 5DUYA 2DTYA 1ENSA 3WDTA 4ZKTB 1UMZA 4HJJA 4Y20B 3OJVA 1UZZA 3BAGA 1M16A 2GDFA 3OJBA 1FN0A 1GZWB 1IKQA 1XYFA 3A23A 2D3RA 3SH4A 1HCEA 2DUQA 4JP0A 4I4PA 1K5VA 3O5WB 1AVBA 5DSSB 4ZFUB 1LEDA 1FAYA 3MW4A 2K4AB 3VKLA 1BASA 1LGNA 5F5QA 2HW9A 4L8QA 4OEFA 5F9TA 3W58A 3AH4A 4FPGA 1YF8B 4CTEA 1S0LA 2BEBA 4HR6C 2VY0A 4BLJA 3AJZA 3CU1B 4I2SA 3QLQA 4ZBVB 3ZXGA 4DENA 4XHBA 2RHPA 2P39A 5IK7A 1LODA 1GYKA 1VCLA 1MS1A 3T2TA 4KEIA 2AENA 3ILNA 3TB0A 4Q26A 4LO2C 2VH9A 1AF9A 3OJ2A 2UU8A 1UPSA 1BA7A 1V6KA 4G9MA 1H9WA 5D61A 1W6OB 3OYWA 3S8KA 3NBCA 2DU1A 4H04A 3WV6A 2V5YA 2AYHA 1LHVA 1SLTA 3RS6A 4LBLA 4I4RA 1XG6A 3WDXA 5DUVA 5JOZA 4YM3A 2PHUA 1QNYA 2ZGMA 3UJOA 1I1EA 2DVFA 3V64A 2BFHA 1AZDA 1MZ5A 1WW6A 3UL2A 5L73A 4LO2A 1WW4A 3AYCA 1HKDA 4L4IA 1MZ6A 1ULDA 5FREA 3USUA 4OW4A 3BAUA 3R4SA 4QO3A 5E8AA 4BLIA 3C9ZA 1LHNA 3AZYA 4ZOTA 1DYPA 1F31A 3VKOA 2WRYA 2D22A 2H0BA 2P2KA 2Y9GA 4JAWA 5T5JA 2VUAA 1DLLA 3AH1A 3GALA 5DVHA 5BOWA 4J23B 1FNZA 2Q9XA 5BXPA 1CONA 2ZBJA 3B00A 3PHZA 3OBTA 3FJ9A 2CL2A 2VXTI 1I1BA 1DBNA 4JQ0A 2KH2A 4GWNA 4FP3A 4I4OA 4SLIA 3FLPA 2R0HA 1U0AA 1W6QB 2VSAA 5IK5A 5GZEA 1FMZA 41BIA 4Y1XA 2JE9A 4GAIA 3ZSKA 2UWAA 2GALA 1V6MA 1N4KA 2D44A 1RZOB 3T1LA 1L2HA 1JW6A 2ENRA 3CQAA 1APNA 1WBLA 1ABRB 2Q5TA 5HCFA 1CVSA 3ZPYA 1KRIA 2YROA 1RIRA 4BMEA 3N35A 3POWA 3WHUA 1LGBA 1LCLA 1JUIA 2NN8A 4WZFA 3WCSA 3WA1A 4LO7C 4WVWA 1A3KA 3BA7A 1BARA 2UURA 3VSZA 2ZGSA 4HL0A 1WD3A 3Q9OA 4YW3A 3OGFA 3AP7A 3FJHA 5FZUA 2JECA 4MYEA 3CA3A 1T9FA 2DUOA 4M3CE 1SZ6B 4Y1UA 3HMYA 3O5SA 2ESUA 2C9AA 1Q8OA 2WT0A 1AX0A 3O4DA 1DIWA 4Y22A 4G9NA 5E89A 2FHRA 5T50A 4AGVA 5BXTA 3VWCA 1IRPA 5GLZA 1GKBA 2PHTA 2D7IA 5CNAA 3AZVA 1DQ5A 1ISXA 3NV2A 1ONKB 1AXKA 2PHRA 4Y1ZA 4XIKA 2NMOA 1V6IA 1JLYA 2VW1A 4X3AA 3PMEA 1ILR1 4DRRA 5GZDA 1R1ZA 5JDBA 3NV4A 3ZXEA 3FJFA 3AYAA 1BLAA 4XDQA 3AFKA 1LECA 3A07A 2XOAA 2FDBM 2A6WA 3VEQA 4ITCA 2D6KA 2ARBA 1W3GA 2CWSA 2AAIB 4OUJA 4J2YA 1EV2A 2D3SA 1N1SA 4DPNA 1PWAA 4LO8B 2QYIB 5T5PA 3OGGA 3O0VA 1GBGA 2A6VA 3HR9A 1DZCA 1BFCA 3TAYA 1HCDA 1ITBA 2YMZA 4D8HA 1QU0A 3WG1A 4I6IA 1N3OA 2W52A 2GMEA 3RTIB 3HOMA 3O4CA 1BYHA 2FGFA 1AXZA 3FLRA 3Q7WA 3BRGC 3I8TA 1TWEA 4BM8A 3MPPG 4USOA 3KM5A 3WNXA 1MS0A 3F62B 4EFPA 3OYWB 4GKYA 3WMUA 3A21A 5IT6A 5HPZA 1GLHA 1ZM1A 3WO4A 2WSVA 4CJMA 3A0KA 3A22A 5DXDA 3UD9A 1G82A 3WG3A 4R9CA 3UJ0A 2Z42A 1FNYA 4JKQA 2DU0A 2VLCA 1LOFC 5H9RA 1SCRA 2R1BA 3MW3A 4ASMB 5KXEA 1R8OA 4I4UA 3S8JA 2GNDA 1IOAA 1WLDA 2AREA 4DCKC 4KEKA 4A7ZA 2AFGA 4YZ1A 3IAGC 4FPOB 3O12A 1LEMA 2D23A 3C2UA 3ASIA 2QN4A 3USUB 1WW7A 4LBKA 1T4QA 2GMMA 1KDMA 1LHUA 2WBCA 3AJ5A 4FPFA 3FUQA 1SLIA 2D43A 2A3YA 1QXMA 1LOFA 5FNWA 1ULEA 3BODA 2FO1A 3R05A 4QBCA 3POYA 4XBQA 5CB7A 4I4XA 4P9YA 1S0BA 5LK5A 3QR5A 1LU2A 3V65A 1XHBA 2ES3A 2UWCA 2Q3NB 2A70A 3ILFA 1A8DA 1S0FA 1XQNA 4G6MA 3AYEA 1BFFA 1OQ1A 5BYNA 5CBLA 4R9BA 5CAZA 1QKQA 3WVJA 3O4AA 1N1YA 1FWVA 4BPZA 2ZGQA 2PHWA 3SNVA 3ZSMA 3VUOA 1R8NA 5GM0A 21BIA 1DQ2A 4JRAA 4P0JA 2EAKA 4I4YA 2YV8A 1IILA 5T55A 4ZXKA 3BAVA 4L4HA 2ZACA 4PCRA 1FYUA 1CJPA 1H30A 1IS5A 2NZ9A 3RRDA 4QKRA 3AJYA 1DYKA 1XZZA 4EB2B 3SLIA 1G86A 3MEPA 2IHOA 1V6VA 3WO3A 3ZYPA 2F2FC 1SFYA 3IM5A 3P6IA 2DVBA 3FFZA 3JRRA 1O4YA 4BOWA 4IYBA 4UW4A 2Y9FA 5T5LA 3GNEA 3VV1A 5SV8A 31BIA 3N7JA 1UZYA 1GNHA 1DQ1A 3AKIA 3AX4A 2ZMLA 4XJZA 1A78A 4XJWA 4YGDA 3PVEA 3OBRA 4P9WA 5JOXA 4FQ4A 2F2FA 3ZXDA 1HWNB 5D62A 4GOYA 2CY6A 3ZC8A 4ZFYB 1HDKA 2P3JA 1TEIA 1ISVA 4Y22B 3HSMA 3WO2A 4ENDA 4XJ9A 2A6ZA 1Q8VA 3FBYA 5H9SA 1ISZA 4Z9WB 3BB2A 1W0PA 5HCBA 4LO7B 1VIWB 3JU9A 3WLUA 5JOWA 1AFCA 1HLCA 2JKBA 2ZMNA 5EYYA 1G8WA 2LIQA 4QC4A 6I1BA 1FWUA 4RA0A 4YZ2A 2MC2A 4EKXB 3CRHA 1G9CA 5GLVA 5GALA 2OUJA 1WLCA 3NWKA 5KXDA 4I1EA 5F8YA 1CR7A 3POSA 1TIEA 3P53A 2KI6B 3AK0A 2ZA9A 2KLLA 1Z0HA 2Y9WC 1V6JA 4YM1A 3ZVXA 1LOEA 3AZXA 4AVTA 1CE7B 4X39A 4K1YA 1G9BA 1MS8A 4HA2A 4UW6A 4OWKA 1N47A 3CRGA 2EXKA 4P0LA 1UX6A 3ZXFA 2D24A 3WMVA 4GXLA 5JLVA 2VW0A 2DURA 1LOBA 1W3AA 1SBDA 4Q1RA 1QOOA 1LENA 2E53A 4XXPA 3FJKA 4LBOA 3EF2A 4FGFA 2A75A 1GGPB 3FJEA 3POKA 2D7RA 4C1WA 4AWDA 4CRQA 1YTOA 1IHKA 3IPVA 4DRVA 5GZFA 3CA0A 1UAIA 1JN2P 1ULGA 4LBNA 4DFSA 1DZQA 1PZ7A 5H9QA 1CPNA 3VT1A 4FPCA 1AVUA 4IY9A 2EIGA 2XB6C 1LESA 4Z8SB 1JT7A 3AP9A 4OZXA 1VAVA 3M3EA 1PZ8A 3W59A 3B3QE 2TEPA 4XJAA 1W6PA 1Y7BA 3ILAA 4IY8A 1DQ6A 3IM7A 3NJ5A 2EXJA 1Z78A 3ZSJA 3AKFA 3WHTA 2ZKNA 3OY8A 5DUWA 4F34A 1IJTA 3M1HA 3RMYA 1E0OA 1MR5A 3BRFA 3K1XA 4G1RA 1OFSA 4NO4A 4M01A 4FPKA 1C1LA 1V00A 3TC2A 2E6VA 1HQLA 1AXMA 3I29B 3V79C 2ZGKA 4I7IA 2DUPA 1MS5A 2NTDA 3WOGA 4YG6A 4Q9PA 4XHXA 3CA6A 3APBA 4FPLA 1Q03A 2B7YA 2A7AA 1ISWA 1JTCA 1V6WA 1ONAA 4FOWA 1YXWA 1BFBA 1O4ZA 5BXSA 1J1TA 2GNTA 3UJQA 1FX5A 5JVVA 4ATFA 5EWSA 1JT4A 4DS0A 2WT2A 2Z48A 3N7MA 3N7LA 1RINA 4XFUA 2OW4A 5FZYA 2W08A 2F8XC 3UDAA 2ZAAA 3MALA 2VXRA 4Q91A 1NUNA 4FP2A 2RQ9A 1BKZA 2IWTB 4AN6A 2HWAA 3WG2A 3WDWA 4BMBA 1QGLA 3IM0A 2ZHNA 2E4MC 1W0OA 4ZFWB 4LBQA 1V6NA 5D63A 1GNZA 3BX1C 2L5XA 3V0AA 1TWMA 4YGEA 1AVXB 3LSEA 2AR6A 4IZEA 2NMNA 4X38A 3HBWA 1JXNA 1EVTA 2UWBA 4LBMA 3L2YA 1FQ9A 2MLLB 1SCSA 4AN7B 2ET2A 4IQPA 2E4MA 4GAFA 2I2SA 2CTVA 4PQ9A 3BAQA 4XYXA 4LO3C 2P23A 4TZDA 3HN1A 1WUVA 1CQ9A 1YRZA 1W6NA 2A3WA 4YZ5A 3ZC9A 2E7QA 1AVWB 2E51A 1WD4A 4XXAA 4R9AA 1URXA 2ERFA 1ULCA 2PHXA 2D20A 1FATA 3N3HA 4RL7A 1IS3A 5I1BA 2GN7A 2AGSA 1GV9A 1IS4A 1PZ9A 2Z49A 3BOPA 4Y26A 2ZABA 4PC4A 1W3FA 3I2AA 1WLWA 3DGTA 2DREA 2R49A 4LO3A 4ZLBB 1SBFA 2R16A 4USPA 4AYUA 3UK9A 4P9XA 1WCSA 3NV3A 2HZ9A 4D69A 4NOTA 2GZBA 2E7TA 1BLDA 5CA6A 3ATGA 3M3QA 1KJLA 1OKQA 5JMCA 2WJSA 1YIFA 1EPWA 2WSUA 4C1XA 3A4UA 3O0WA 2ZHLA 4R9DA 4XOGA 5IUQA 3W9TA 1GICA 2EF6A 4XMIA 4XTPA 4FOYA 1NLSA 3CA1A 2XG3A 4OWJA 3PVOA 1V6XA 2D6MA 3F1RA 3B9UA 3AZWA 3NV1A 3PG0A 2W39A 1GZCA 1F5FA 4JCKA 5B2HA 4XBNA 3N36A 1FV3A 1QDCA 1ENQA 3KQRA 1KDKA 4H9WA 3IPVB 4ISRA 1JLXA 2ZHKA 4P0KA 4JKXB 4FOQA 2W68A 1M2TB 2GMPA 4I1BA 4GA9A 3P6JA 4GP0A 1QOSA 3BAHA 2M49A 2D6LX 1YBIA 1UN1A 2I1BA 4I4SA 1IS6A 1MVQA 4YM0A 1W6PB 4J2KA 1QNWA 2ZHMA 1N3QA 3FUOA 2ZR1B 2ZGUA 3I4IA 2DRYA 1RITA 1KJRA 1WBFA 3ZSLA 2VW2A 4LO0C 1JBCA 1GSLA 2A6XA 3CAHA 3O4BA 1JYCA 1S0GA 3OY8B 1JY0A 1BQPA 3B01A 8I1BA 2ZZJA 1ULFA 5DUXA 5IK4A 5E24E 2ZGLA 1SLBA 2DVGA 2DYCA 3WCRA 1W6MA 1WBAA 2P37A 2SLIA 4WV8A 2ERMA 4IONA 4P14A 1LHWA 1ENRA 2ZQOA 1PC8B 2FFVA 1S0JA 4WVVA 5GLTA 3MW2A 2D3PA 2NM1A 2MIBA 2AXMA 3FJBA 1JT5A 4R6UB 3INAA 4LO0A 4D0ZA 3N0KA 2YUGA 4M00A 4AVVA 2A5ZA 5IK8A 3AXEA 4ZGRB 5E88A 4AVSA 1AX1A 1TTUA 2ZGRA 1DJSB 3LCPA 4XE9A 2D6OX 3IIRA 4TYSA 4OWLA 2GN3A 1JOJA 4XFSA 3H6SE 2DV9A 1D0HA 2EXIA 2DS0A 3FJIA 5EYXA 1H9PA 4GALA 4YW5A 1ZA4A 1QQKA 3BRDA 1P63A 3U4XA 3M2MA 3VKMA 2AH2A 4QD2C 1N1VA 5EHAA 4XJUA 4LBQB 4I4QA 1MS4A 4I8MA 1CVNA 3V0AB 2RSTA 2JJ6A 1MD6A 3WZ1A 1AXYA 4PBOA 2LALA 4YG0A 2AQZA 4Y1YA 3T8SA 1G9AA 1HKNA 3IMNA 2WQZC 4II0A 4XTMA 4YZ4A 1Q8QA 3PJQA 1VLNA 4Q1PA 3WUCA 3AKHA 3FJAA 2WKKA 2X2TA 4DQAA 3AP6A 1LTEA 4XILA 4YOLA 3UD7A 4CZSA 3NBEA 4ZA3B 1J0SA 1W6NB 5KXCA 2P34A 1QOTA 1PUMB 1SLAA 4FPEA 4LBQD 3ZYRA 3FJCA 3H6RA 2NP0A 3LLPA 2DVDA 4PF5A 1HIBA 4XZPA 4JPZA 2SBAA 4GKXA 4IZXA 3WDVA 1II4A 3ILRA 5FNXA 1Z2VA 4GP3A 2GNMA 3SISA 3JUTA 1PZZA 1IKPA 3SITA 1S0IA 5F8SA 1C4RA 3IKWA 1DQGA 4KEJA 4YW2A 2PHFA 2HYKA 4I96A 2OUHA 5FZZA 3AYDA 2YY1A 2CNAA 3WDYA 3M3OA 3T1MA 1C57A 3Q7XA 4AGGA 4XMAA 4H55A 4A7YA 4YGCA 4YFWA 1KQRA 2KM2A 1EYLA 3ENRA 3M3CA 1DFQA 3RMXA 1CN1A 2LIEA 3BADA 4M3CA 3AH2A 2AUYA 2K8RA 9ILBA 3H6QA 1BJQA 5GLWA 2BEAA 1BZWA 2Y9XE 3RSJA 4PBPA 1LJ7A 4FPJA 1JYIA 2DRZA 5HCAA 2LTNA 1Z4SA 1UL9A 4D0TA 3LSDA 4YG3A 1K5UA 3VSFA 3AP4A 3O49A 4Q27A 2OVUA 1AX2A 2EXHA 3NBDA 3I2XA 3KMVA 2R0FA 1MS3A 2WNEA 4QBVA 2GNBA 4FOVA 1DFCA 1LHOA 3B9CA 4K21A 4YM2A 4QALA 1S0CA 2ZGNA 5DG1A 1SLLA 2FFUA 5GJ6A 3V0BA 3PUBA 2PELA 3WG4A 5JOYA 4YZ3A 3HALA 1QMJA 1G7YA 3D6EA 1NXD1 5EXOA 1S0DA 4FPHA 1OQLB 5F8WA 1W6MB 1RMLA 3ZXLA 1RY7A 2G4IA 3WINC 2VU9A 5DZEA 4HANA 4K20A 3ZXKA 3O44A 4U2AA 2FMDA 4J2XA 2YXSA 3A0NA 4XJ8A 1Q8PA 2K43A 4ATEA 4DEPA 2D7FA 4I30A 3CA4A 3FGMA 5BP5C 2KI4A 1QF3A 2JE7A 3R4UA 3NBNA 1UKGA 2ZGOA 2V73A 5H9PA 4UW3A 2UUSA 3CA5A 1CIWA 4X37A 4LO1C 1Q8SA 3WINA 4Y20A 4EFQA 3RG0A 2ZGPA 3BAOA 1JQZA 2A6YA 1CPMA 3CRIA 1HWPB 3N7KA 2A71A 1GZWA 3B69A 4Y1VA 4Q2FA 3AXDA 2BQPA 2R1DA 3BA4A 4KBBA 1SR4C 3O0XA 4OEGA 1D2SA 1IT0A 5BP5A 3VT0A 1V6OA 4XBLA 2NVHA 1JT3A 1G9DA 4U36A 1QDOA 3DUIA 4FVVA 1VALA 4KC3A 3VKNA 3RTJB 2D1ZA 3IM6A 1YO8A 4Q8LA 1DQ4A 4LO1A 1YI7A 3D5OA 2ZGTA 3O3QA 4XIOA 1F9KA 2D6NA 3SH3A 4G6JA 2D6PA 5BQUC 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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