3HTVA

Crystal structure of d-allose kinase (np_418508.1) from escherichia coli k12 at 1.95 a resolution
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
300
structure length
279
Chain Sequence
KQHNVVAGVDMGATHIRFCLRTAEGETLHCEKKRTAEVIAPGLVSGIGEMIDEQLRRFNARCHGLVMGFPALVSKDKRTIISTPNLPLTAADLYDLADKLENTLNCPVEFSRDVNLQLSWDVVENRLTQQLVLAAYLGTGMGFAVWMNGAPWTGAHGVAGEETNCSGMALRRWYEQQPRNYPLRDLFVHAENAPFVQSLLENAARAIATSINLFDPDAVILGGGVMDMPAFPRETLVAMTQKYLRRPLPHQVVRFIAASSSDFNGAQGAAILAHQRFLP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
molecule keywords D-allose kinase
publication title Crystal structure of D-allose kinase (NP_418508.1) from ESCHERICHIA COLI K12 at 1.95 A resolution
rcsb
source organism Escherichia coli k-12
total genus 82
structure length 279
sequence length 300
ec nomenclature ec 2.7.1.55: Allose kinase.
pdb deposition date 2009-06-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00480 ROK ROK family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3htvA01
1BUPA 3QBXA 5BPNA 4CBWA 2CH6A 3WXLA 3WEEA 5KPRA 4BGBA 5BN8A 4K42A 1K8KA 3LDQA 4JD2A 4DHYA 5JICA 1T6CA 1NGAA 1JCFA 3GOIA 3WXIA 4FWKA 4L3QA 3I33A 5AQGA 4BR7A 3VERA 4DB3A 3L4IA 1YAGA 3CQYA 2P9IB 3ATUA 3L6QA 3VGMA 4E1JA 2D1KA 3SLCA 5FPNA 4M7YA 2QWRA 2P9NB 2FLOA 2VWBA 5KQDA 5ADXH 2ITMA 2QWPA 5EXWA 3CJAA 3AY9A 4MLHA 5AQFA 4BRMA 4ISFA 3LDNA 5JMVA 4M63C 3CETA 4FO0A 4IJNA 4H5TA 4BRKA 3BF3A 4WQ5C 1TUYA 5BRFA 1BDGA 3EO3A 3GDQA 2E88A 4H0TB 4BRFA 2ZWHA 4BC5A 1IJJA 4B1YB 4BG9A 2Q1NA 4IXCA 2CGJA 2QWQA 3S41A 4I6MB 3UE5A 1MWKA 1U2VA 2H3GX 5EX5A 3KHYA 1BA0A 2A5XA 2P9KA 2YHYA 3O1WA 2FF3B 3WEEB 1NGFA 2FSNA 5LY3A 4RCHA 2PBDA 1K8KB 2A40A 4JD2B 4B1ZA 3M6GA 1HPMA 1NBWA 1BOTO 2AP1A 4CJ7A 1WOQA 3R9PA 2ASOA 2E2QA 3WUHA 3C7NB 5I9EB 2QWMA 2ASPA 3G25A 4O5FA 5AFUH 4BRPA 5BR9A 5AZJA 2P9PA 4FPAA 3EZWA 3UKRA 1CZAN 1OKJA 3CJCA 4WQ4A 4H03B 4QS9A 4H0YB 5AQYA 3CI5A 5AQSA 4PKIA 4A2BA 3U4LA 2Q31A 2E20A 4BRQA 2A6AA 3MDQA 5AQRA 1E4FT 2P9SA 3IUCA 4H0OA 3VEZA 4BRNA 3EKUA 3MN7A 1C0GA 2VYPA 3C0BA 4CZIA 2GUPA 3D7EO 1ESVA 2WUSA 3A5NC 3MMVA 5BRHA 2Q2RA 3BEXA 4A2AA 3VGLA 3LL3A 1KXPA 4C23A 3AAPA 4BRLA 3IFRA 2W40A 3HBTA 3CJ7A 3WQTA 1U2VB 1LCUA 5AQMA 5AQJA 4FPBA 4IO8A 5AZIA 1JCGA 3HTVA 1DEJA 2FF6A 4GY2B 1SAZA 2YHWA 1D4XA 3FZFA 5E84A 4BC2A 4WQ4C 1H1VA 4JN4A 1X3NA 2IVNA 5AQZA 2AA4A 3QB0A 4BRAA 4HTLA 2BTFA 4EFHA 5BPLA 3EKSA 5B8HA 2I7NA 4K25A 3CJ9A 3R8EA 3A5OC 2FXUA 1V4TA 2CGLA 1DKGD 1KAYA 3H46O 5FPMA 5AZJB 2P9PB 4AM6A 2Q97A 3R6MA 3UKRB 4B1VA 3ENHA 4IWVA 5AQNA 2IVOA 4NO7A 5EY4A 5KQ8A 4PKGA 2D0PA 3QBWA 2D4WA 2E2OA 2P9SB 3J8AA 1GLAG 2UYTA 3C7NA 3H1VX 4B1XB 5LJVA 2E1YA 3WQUA 3GE1A 1V4SA 3SJHA 3MCPA 3VF2A 1SZ2A 3CERA 3EL2A 4BR4A 5JLHA 4CBXA 4FWOA 2HF3A 1NGJA 3VGKA 4PL7A 5BPMA 3ULEA 3RSEA 4J8FA 1ZBSA 2V7YA 3VF4A 1HX1A 3AARA 4LC9B 5F2RA 1ATSA 3HSCA 4CD3A 4FWQA 1XUPO 4PKHA 3H3NO 4XEIA 1GLCG 5AZIB 4RWTA 4BRGA 1S22A 3AAQA 2QWOA 4FWPA 1HKGA 3MK6A 4BQZA 1T44A 4FWRA 4MO5A 3SK3A 3B8AX 3O6WA 4O8KA 3ZX2A 5AR0A 2HMPA 4FL9A 4FOEA 4MLEA 5AQUA 2ZGZA 2I7PA 2GEMA 2YCHA 3CJ1A 1Y64A 2QM1A 4MO4A 1C0FA 1RDWX 4FWNA 3U9DA 5EVZA 3L0QA 3LM9A 3QMLA 1ZXOA 1DGKN 1NM1A 5FPDA 2ZF5O 4QS7A 3ZEUA 3LDLA 1GLJO 4K43A 1HLUA 3UB5A 4CZKA 3CHWA 5AQLA 2ZGYA 2YHXA 3HM8A 3DAWA 3LDOA 3CIPA 2V51B 2E2NA 2V52B 3LM2A 3VEXA 3TU5A 4BQLA 4H0XB 3O8MA 3IMXA 3FZHA 1KAXA 1NWKA 1YVNA 2A3ZA 1ATRA 3GG4A 3FZLA 3ULEB 3RSEB 5ELZA 2A41A 1E4GT 3KZBA 5BN9A 2D0OA 3A5MC 1IG8A 1LOTB 4CZMA 3KVGA 5BRDA 4FWMA 1HJOA 5KPTA 4FWLA 3A5LC 1P8ZA 1SQKA 5CE3A 3FZMA 4BRDA 2GWKA 4Z94A 1KAZA 4BC4A 4B1WB 3SMPA 3ZX3A 4BG8A 3M1FA 3U9ZA 2YJEA 4CI6A 2GTDA 4A62A 4XH5A 1T6DA 1U6ZA 5AQVA 3FZKA 1RGIA 4A61A 4CZGA 1HKCA 2F9TA 4AM7A 3ZETA 4BRIA 1YUWA 2A42A 4XH1A 1JCEA 3HZ6A 2FSJA 4BC3A 1GLLO 4M7XA 3WXJA 4CZJA 1XQSC 4BR0A 3JS6A 3ZEUB 2Q0UA 2IIRA 1BO5O 1NLVA 1GLFO 4BROA 4F9OA 3VF6A 4RTFD 4B9QA 2GWJA 4H5NA 4CD1A 3O1BA 5FPEA 3TPQA 4DCHA 3FE1A 2HOEA 3QFPA 4H5WA 2EWSA 3UKUA 4B1UB 2CH5A 4EHTA 1NGCA 4H5VA 1MDUB 1QZ6A 3O5BA 2QXLA 4JHDA 2KHOA 4ISGA 4WQ5A 3F9MA 1G99A 1WUAA 1GLBG 4QS8A 1X9JA 3DXKA 5F0XA 3ZX0A 2YI1A 3H6EA 4BVOA 4CZHA 5AQXA 5LJWA 4BRCA 5ADXA 3HI0A 2V7ZA 3WXKA 3FGUA 4HWIA 1BA1A 5AQKA 3WT0A 1Z6RA 3A0IX 3CQXA 1NGGA 3ZETB 1QQMA 3EN9A 4BR2A 3MN9A 3W3DA 2QW9A 1BWFO 3VETA 3H45C 2E1ZA 4FOIA 4JAXA 3VOVA 2VCPA 2QWNA 1EQYA 1RFQA 4Y0WA 5KPZA 1BG3A 3VESA 4K41A 5AQWA 1TYQA 2NRHA 3O08A 2P9LB 5TKYA 3FR0A 4CZLA 3QICA 3D2FA 4BR9A 3U8XA 1NGEA 3P4IA 3UKUB 4FSVA 1MWMA 4H5RA 2CGKA 3O4WA 3GL1A 3BP8A 2W41A 3FLCO 1QZ5A 4JHDB 4BVPA 1HUXA 3DXMA 1J6ZA 3VEYA 4IJAA 3CJBA 5AQTA 3VPZA 2P9UA 2E2PA 3IDHA 3O80A 2YJFA 2PAVA 3DXKB 5AQHA 3ENOA 3D2EA 1GLEG 2ASMA 2Q36A 1X3MA 1MA9B 3W0LA 3VENA 2NLXA 5AQOA 2BUPA 5AFUA 3DWLA 2Q0RA 4BREA 1QQNA 3ATVA 3MN5A 3JXUA 4PL8A 2OANA 3A8YA 1XC3A 5BREA 2NZTA 4WYBA 5AQQA 4H0VB 2GELA 2J4RA 4BGAA 1S3XA 3VEOA 1GLDG 4JNEA 4EIAA 3ID8A 4IZ9A 1QQOA 4YDUA 3GBTA 3M3ZA 1YXQA 5AQPA 4GNIA 4EHUA 1Z05A 2P9IA 5F1XA 2IVPA 2QWLA 3SMSA 3BF1A 4XH4A 4EAHD 3VEVA 2DPNA 3FFKB 1NMDA 2P9NA 3QFUA 1TYQB 4BR5A 3QDKA 4CBUA 3D2FB 3OHRA 5E26A 3DJCA 1TUUA 4DQ8A 4NB4A 1R59O 3LDPA 1NGBA 1NGHA 1Q18A 2FSKA 1ZC6A 4BRHA 4KBOA 5AQIA 3BUZB 5EOYA 1ATNA 3DXMB 4H0PA 2P9KB 4CZFA 2P9LA 2F9WA 3H1QA 3I8BA 1NGDA 2P9UB 1QHAA 4FWSA 4CZEA 4ISEA 1BU6O 5JLFA 3D2EB 3MN6A 1NGIA 4YDUC 2E8AA 4I6MA 2HF4A 1HKBA 3VEWA 3H3OB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QBXA 5BPNA 1U4BA 4KHUA 3WEEA 1VQMN 4DTSA 3ZT1A 4F2SA 1T6CA 3O4QA 1JCFA 3E66A 4CGDA 4CHYA 5KGXA 3DI6A 4NXMK 4WF9L 3VGMA 4E1JA 2D1KA 4CEDA 2UUAK 2VQEK 2VG6A 5ADXH 3S3MA 2QWPA 1RBRA 5EXWA 1WSEA 4B8AB 1HYZA 2HBMA 5JMVA 1WN7A 4IJNA 4JYAK 4H5TA 3M5RA 3P38A 3HVRA 2B6AA 1VQNN 4CEQA 2ZWHA 3MCAB 4IXCA 3NH2A 4CFBA 3AGRA 3RRGA 1BCOA 3LAKA 3ENBA 4CEEA 4E3SA 1YF5L 4I6MB 1IG9A 1EP4A 1MWKA 1QE1A 5EX5A 4Z4GA 2YHYA 4CJQA 3WEEB 4RCHA 3NF7A 2PBDA 4GV9A 4B9VA 1XHZA 3M6GA 4Z4EA 1BOTO 2HBLA 2G8UA 2F96A 4CJ7A 4E7KA 2R7YA 1RTHA 3HRGA 3C7NB 5I9EB 1HNWK 1KTQA 4IEIA 4O5FA 1YT3A 5AFUH 5C12A 3PUFA 2NRXA 4CE9A 3KLIA 1L5UA 2GV9A 2P9PA 2HSTA 5C10A 4KI4A 4B3MK 4WQ4A 5AQYA 4BDPA 5AQSA 1QS4A 3THWA 2PYJA 1IH7A 3QETA 2A6AA 5AQRA 1E4FT 3VEZA 2HHTA 3V9SA 1X9MA 4J2AA 3PSFA 1VSJA 3OS0A 2VYPA 1KLMA 1ESVA 1TAQA 1VQ8N 5FRNA 3QINA 4DQSA 2WBNA 3CM6A 1QVFM 3CC7N 4CJLA 3AAPA 4BRLA 2BGGA 1VSFA 1VRTA 3OYGA 1JJ2M 4CVNE 4JKFA 1YHQN 5AQJA 3V1OA 5AZIA 3D45A 4Z4CA 4M41A 1W97L 4GY2B 3C65A 2KFZA 3IAYA 1D4XA 3CM5A 4BC2A 1H1VA 3RRHA 4K0KK 1SL2A 4TSXA 1XC9A 2OZMA 2AA4A 3BZCA 2X74A 2GX9A 5GADP 2A1RA 2HHSA 3E01A 1UA0A 1NKBA 2FXUA 1V4TA 4O55A 4Q0BA 4B3RK 1KAYA 3H46O 2Y1JA 2P9PB 1VSLA 3PX0A 4ELTA 3R6MA 3ENHA 2RE2A 4DTPA 3EE9A 3HSTB 3THWB 3TARA 4NO7A 3T3FA 2BDPA 4DF4A 4PKGA 3C6AA 2E2OA 4O44A 1GLAG 4B1XB 5LJVA 1LWCA 4UQGA 1NOYA 2ZJRL 3SJHA 4IOAL 3MCPA 3CMAN 1YITN 1QVGM 3CERA 3EL2A 5GIOA 4FW1A 1U47A 4PL7A 3KK1A 3U3YA 4J8FA 4KH6A 4O0IA 2Q3SA 3AARA 4LC9B 1ZBIA 1ATSA 2HHXA 3OYEA 5AZIB 3MECA 5M1PA 3AAQA 1IV0A 2JGUA 3HM9A 2G8HA 4F8RA 3HO1A 2IAJA 3SPZA 1RT7A 1RDCA 3SK3A 3ZX2A 1JKHA 1VQLN 3HPOA 2I5JA 2ZD1A 2HMPA 4OPHA 1VAZA 2ZGZA 1C6VA 3MEDA 3CJ1A 2QM1A 3U9DA 4W5OA 3EYZA 1ZXOA 3SBTA 1EWRA 4AILC 3SUNA 4DTUA 4W5TA 1GLJO 4K43A 1HLUA 3UB5A 1U45A 4CFDA 5AQLA 2YHXA 3HM8A 4E7HA 3DAWA 1WAJA 4CGHA 3S3OA 2E2NA 2V52B 1DT9A 4KH5A 3LM2A 4H0XB 3O8MA 3LANA 3E1YA 3AA3A 4KREA 4YOXA 3FZHA 3PX4A 1NWKA 1YVNA 3BDPA 1ATRA 2ETJA 1HNIA 3J7AP 3C94A 3B6OA 5SZTA 3NGZA 4FK2A 5CR4A 3A5MC 1IG8A 4LH5A 4CZMA 3MWTA 1WSJA 1ZBUA 2EX3A 4FWMA 1DTQA 4CECA 3QEVA 5D3GA 3IKMA 3F9KA 3CCLN 4WFAL 1HNXK 1CZBA 2HNZA 5J2MA 1KAZA 4BC4A 4B1WB 3SMPA 3ZX3A 5H1SQ 3TSUA 4KHYA 3OYMA 3MXIA 1A5WA 4A61A 3RMDA 4JI3K 4DSIA 1WAFA 3ZETA 4BRIA 3OS1A 4H4MA 4KTQA 4BC3A 4Z4HA 1NU0A 4CHZA 3CCRN 3SQ1A 2HW3A 1J54A 3JS6A 3TAMA 2NRTA 1CZ9A 4F4KA 3L2UA 2IIRA 1NLVA 1HYSA 1SUQA 4CJPA 1VQ5N 3LP2A 4RTFD 2P1JA 4MDBA 3DLBA 1NK4A 4IKFA 3TPQA 3FE1A 2HOEA 4FYDA 3OYDA 4JKEA 3LWLA 1RDBA 1DLOA 3O3HA 2ZM6K 4BDYA 4YOWA 5FDLA 3O5BA 2QXLA 4JHDA 1Q9YA 4OJRA 2KHOA 3DLKA 3CXCM 3SAFA 4OVLA 4OGCA 3F9MA 1GLBG 4IEEA 4FVUA 1W2BM 4CIFA 2KFNA 2VG5A 4PWDA 2YI1A 1J53A 3VN5A 4BVOA 4ELVA 2UU9K 3WT0A 5AQKA 3ZETB 3UIQA 4DV1K 3MN9A 3W3DA 2X6SA 5KTQA 1TKZA 3G71N 3H45C 3HP6A 4UY8O 3U6FA 1EQYA 1RFQA 4FW2A 4Y0WA 5KPZA 1FXXA 3VQBA 1J9AA 1VQ7N 4ICLA 3SBGA 4A5AA 3O08A 2P9LB 3KWIA 3QICA 1ASWA 3CMEN 4BR9A 3K5NA 1NGEA 3P4IA 4CERA 1MWMA 4GV6A 5GAEP 3TAGA 4IFYA 3GL1A 3HYFA 4AQYK 4HUEA 1Y97A 3FLCO 4JHDB 1LW2A 1HUXA 1VSMA 2OTLN 1T3VA 4NYNA 3VPZA 2P9UA 2Y1IA 5M1QA 5AQHA 1X3MA 1Z25A 2HMIA 1S6PA 1QQNA 3RR7A 2X78A 3JXUA 3KK3A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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