3HV8A

Crystal structure of fimx eal domain from pseudomonas aeruginosa bound to c-di-gmp
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
247
structure length
242
Chain Sequence
GDVIAILQQALETNSFRLLFQPVISLRGDSHENYEVLLRLLNPQGQEVPPAEFLHAAKEAGLAEKIDRWVILNSIKLLAEHQTKLFVHLSSASLQDPGLLPWLGVALKAARLPPESLVFQISEADATSYLKQAKQLTQGLATLHCQAAISQFGCSLNPFNALKHLTVQFIKIDGSFVQDLNQVENQEILKGLIAELHEQQKLSIVPFVESASVLATLWQAGATYIQGYYLQGPSQAMDYDFS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Protein FimX
publication title Structural analysis of the GGDEF-EAL domain-containing c-di-GMP receptor FimX.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus 80
structure length 242
sequence length 247
ec nomenclature ec 3.1.4.52: Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase.
pdb deposition date 2009-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 3hv8A00
3PJWA 3HV9A 3S83A 3PFMA 4HU4A 4Q6JA 3U2EA 4RNJA 4LYKA 4F48A 4ES4A 3PJXA 4HU3A 3GFZA 4Y9OA 3SY8A 3N3TA 4FOKA 4Y9MA 2BASA 5M1TA 3PJUA 5MF5A 5MKGA 3GFXA 4AG0A 2W27A 4HJFA 4RNHA 4LJ3A 4KIEA 3PJTA 4Y9NA 4RNIA 3HV8A 2R6OA 4FOUA 3TLQA 4Y8EA 4J40A 5MKGB 4F3HA 3GG1A 3KZPA 4AFYA 3GFYA 4Y9PA 4FOJA 4RNFA 3GG0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LZLA 4JTEA 1K8ZA 1GK8A 5DELA 1IEWA 1PV8A 5C7HA 3T7VA 1BAGA 5KZEA 5I06A 1JR1A 1LJYA 4KEZA 3SECA 3DG6A 5C9WA 3ITTA 4DJEA 1EIXA 2B7NA 4GI8A 4B92A 4I7UA 4H01A 2DZBA 1K8CA 3T08A 2D3NA 1D7KA 3CO4A 5FEZA 3BC9A 4JICA 3LERA 2PU1A 3SW6A 3UP8A 3WLRA 4KEMA 4KPLA 3SJ3A 3IS4A 3KWXA 1IR1A 1K70A 5FL0A 4E6MA 2ZBTA 2ZC1A 5T9CE 4HOWA 4B5UA 1FWAC 3IGUA 3IIPA 3UXKA 1XWYA 2WSKA 3QQ0A 1O5QA 2P0IA 1U5HA 3KOWA 2ACRA 2X0HA 4WY0A 1VCGA 1KBKA 3CUFA 3HG4A 2V2DA 4FB7A 3URAA 3VGBA 4WVXA 3AS1A 6REQB 2VOTA 4IUGA 3ZMRA 3PZGA 4O10A 3GNNA 3LBOA 1LBFA 1MEIA 1OCBA 2G97A 4ZGYA 1JCXA 2Z1KA 3R5EA 1FTXA 3U0HA 3LCWA 4HZ7A 2IW0A 3QY7A 4JD4A 4PCSA 2PZ0A 2E6FA 1M9HA 3FNDA 4HCHA 3L5AA 4E5TA 2HWGA 4ZQRA 4KETA 3IPWA 4KIRA 4NJHA 2GPTA 4HMEA 4QS6A 1UBSA 4PMUA 3LMZA 1FP9A 1C8YA 2XIQA 2YCEA 3H2NA 1VJZA 4TTUA 4DM1A 3MO7A 3GG8A 3NGFA 4L4MA 2WCAA 3SBFA 3I6TA 3PJUA 2PTWA 3K4WA 4AMAA 4LS1A 4ICMA 3TN6A 2R24A 1DBTA 1FHDA 3MVTA 3HQOA 4PTMA 5A5WA 4W85A 3M0JA 2BOGX 1IT7A 1RCQA 5AHEA 3S5OA 2I7GA 4UNKA 2P88A 1JIBA 4AXNA 3R10A 1J5TA 1E4NA 3K1DA 1PSCA 3I10A 3CL7A 3GXIA 5A8MA 2AKZA 3IIZA 3WNNA 4JFSA 3RDKA 1GQNA 4LUSA 3WQOA 3CS2A 3E0VA 4UR9A 1VIWA 3EX1A 4HHLA 3S5NA 5H6HA 1B3OA 1KRMA 4X2RA 3M7WA 4Q7NA 2QV5A 3C52A 3UXLA 1TCDA 1VEOA 4PTXA 1A47A 4WSJA 4MLJA 1WZMA 1RK6A 1REQA 1PX3A 1ZSXA 4HN4A 5HBFA 1IV8A 1XLIA 5C9RA 1RJPA 2FVKA 4H83A 4QE5A 3G1VA 1FHUA 1UWQA 1AW1A 3HB9A 5LYRA 3PC0A 4P7RA 1CENA 2W27A 3UESA 4BF9A 3F4DA 3GVWA 3F4WA 3GDKA 2J78A 3GRIA 2HNHA 3LXBA 2QDEA 3CIXA 2DUZA 5I24A 2Q6ZA 4DJEC 1MW1A 4XG1A 1GYNA 1KM6A 3GQYA 4LYKA 1VFMA 3HA1A 2H8XA 3M43A 3ZT7A 4C5YA 1EO7A 4CVWA 1GQKA 3WZ0E 5DFAA 3SSZA 1BKSA 2W9MA 4IPPA 2PAJA 4YVPA 1KXTA 2IQ0A 1E72M 1XCFA 4M6PA 4ZXLA 5BW6A 2XU2A 3FXGA 2FPTA 4CD6A 3CBWA 5TF0A 4H9UA 2YL9A 4C6QA 4C6LA 1D3GA 4JIHA 3C3UA 2WWDA 2D73A 4PN2A 4UTTA 5I23A 4QQUA 1PTAA 3PTMA 3QPYA 4X61A 1SFTA 3SFKA 2WKJA 3NNTA 4M24A 1WKFA 1QNOA 1V3KA 4XKMA 3OODA 1R85A 1OZQA 3W2UA 4K39A 4O18A 1WE5A 5DY2A 3IJLA 4RZ6A 4ZOCA 4A4AA 4A2RA 2QJMA 1J96A 3WQFA 4GISA 3IK4A 2PDHA 4CCEA 2FGBA 4JTRA 4YTSA 2VR2A 4DO5A 3ZWSA 3K8KA 2X1TA 1V7AA 3E12A 1ZZMA 4JHZA 1GVYA 2AMGA 4RKAA 1Z48A 4FZIA 5D33A 4MAVA 3A9BA 1SU5A 1RP8A 5C2GA 3SCVA 1E5JA 3APGA 1AQHA 1PDZA 2QPXA 4R9OA 3ARXA 1JPDX 4J9JA 2OX1A 4HYRA 3MDUA 4OU1A 1W6TA 4GK8A 3S1GA 3EMCA 1M41A 1O5RA 3Q37A 1E51A 4AB4A 1UD2A 5I02A 3MV01 3QW4B 4V28A 3B8WA 2F7FA 2B7PA 4Y8EA 2VZOA 4JTJA 1CTNA 2EQDA 3GYEA 3NL5A 4MDOA 2FLIA 4AG0A 1AL7A 4IGNA 3MHUA 2Y5JA 4MYAA 3H53A 1Y0EA 1A5UA 4KKXA 3TYCA 4JYDA 2QXWA 5BYWA 1O1HA 4FNRA 3BG9A 3I6RA 2FDSA 3LRLA 2CW6A 3WMLA 1D9EA 1WUFA 1U1JA 2F6UA 1LUCB 3TC7A 2WCSA 3AISA 3QHMA 5ABTA 5DBTA 3F1QA 1GGOA 1L2QA 4DBUA 3L68A 5CSRA 3LUTA 4NVTA 3UG4A 1UD3A 3N17A 4DYEA 4FF7A 4JTDA 2C19A 2DQXA 4LXFA 4JL1A 3LHYA 5A8OA 1ZJIA 2JKPA 3UXIA 3B3DA 3WLSA 2WSPA 1VFHA 4GO8A 4DEFA 1QNSA 1UD4A 3BLPX 2E0PA 4MOZA 5FJIA 9XIAA 1K1DA 1W3NA 4L56A 4N02A 1SW0A 4UTTC 2NSXA 3SFWA 1ZY9A 4AZGA 3MP5A 2VELA 2AQWA 1L2UA 3CHCA 3SURA 1ZUAX 2GQ3A 3S1VA 3BCFA 3KDNA 4AF0B 3OA5A 3B8IA 1HL2A 1V4YA 3SZ8A 4XVDA 3B06A 1MEHA 3S9ZA 4C6PA 3QW3A 2J8GA 3ARYA 2W3ZA 4Y8FA 1S2WA 3GNRA 4H7CA 5T26A 4IP7A 3TJIA 3TFCA 5AHLA 4ROPA 4HGXA 3H23A 2XN1A 4HHPA 4PTWA 4OBTA 3TE9A 1QI0A 1TE1A 5DANA 3QOMA 4B3ZA 3R89A 4L1WA 1XGEA 4GZEA 3MV11 1X1OA 1P7TB 1W56A 3WMBA 3MZNA 4G7EA 2MNRA 3VKDA 5BROA 4IPJA 3HPFA 3MUZ1 1RH9A 2ACQA 4U3CA 2YLLA 1Y65A 2E28A 3P2VA 3K2GA 5M1TA 1PBGA 1BXCA 1NFBA 1E71M 5HWMA 3CNYA 4HNCA 3PPHA 2B7QA 3POHA 1ZCCA 3ZJ8A 4HVXA 3CJPA 2FZDA 4N9BA 1VJSA 3SIZA 5CZJA 2ZZ7A 2HBVA 4UC5A 2JF7A 3FA3A 3WK2A 4M19A 1YNPA 4DF0A 4QLLA 4PRRA 4EIVA 1YBQA 1R47A 4F48A 3L5LA 4K8EA 3V5OA 3GNOA 1E56A 3ANYA 4QE4A 1C7TA 3KW3A 3ZJKA 3LCFA 3ID7A 2J79A 3GDTA 2ADAA 1GW1A 2VVSA 1IT8A 4HB7A 5E6ZA 3P6LA 3C0LA 4BKNA 2Y62A 1QOXA 4FF5A 2X0YA 3IIOA 3WFLA 4CQCA 5FF3A 1C8VA 4URIA 1AZ2A 3GHTA 3NJ3A 3SN1A 5IFTA 4XAYA 1G4EA 2R6OA 2WMKA 3QZ6A 3IJIA 4JEQA 4XD5A 4LANA 2PURA 2VM8A 3C5QA 2FMNA 2ZDRA 3WQ4A 4FXSA 1EB3A 4GNKB 4WJXA 3TKFA 1RLDA 1WDQA 3SJNA 1J11A 3GIPA 5G1YA 4FR6A 4CNOA 2E40A 4D6FA 3GDBA 2OQLA 2Y89A 4GX8A 1MI3A 4CN6A 4N7QA 1D3HA 4AY7A 3WLHA 3FHQA 3GVGA 4QLKA 4QSFA 3R0DA 3N9RA 4YYFA 2P5NA 2YCLB 3F5LA 3PJXA 1CB2A 4XAFA 1TIMA 4HNVA 3E49A 2OLAA 4RE0A 3WJSA 2PDXA 1A5BA 3V4BA 2QCDA 2BODX 2D22A 4K8HA 1F2JA 2BBFA 4DWSA 1B9ZA 3L4ZA 2QCGA 3ZR4A 1CGYA 1NDVA 1SO4A 3ITOA 4AD2A 5FOOA 3W7RA 2QJIA 2BGQA 2XISA 2YCJA 1K9EA 3T2PA 4UIOA 1XDJA 1H1ZA 2OYKA 4DWDA 4FO4A 1YTEA 3LZ5A 1UG6A 3MZ2A 3QVQA 4V33A 3W87A 4O4WA 5E93A 5DCDA 4HZ6A 4NL1A 5G2HA 2NX9A 2WQDA 3PAJA 4RZ4A 2P3EA 3BDKA 2Z29A 4DNHA 6XIAA 4HNTA 4BHYA 3S5SA 1DTUA 3REQA 4O8AA 2OGJA 5D30A 1P43A 5D2YA 3W27A 5LNRA 1NWRA 3LHUA 3RM9A 4J3SA 2DFAA 1WBJA 1VHCA 3PJWA 2ISDA 3MKCA 3OVQA 1XV8A 3GVVA 2CBVA 4C1NA 2Y63A 2YDQA 3MVIA 5J5RA 3UERA 3QY8A 1B3YA 1NFGA 2GSEA 3TSMA 4TR9A 3WF1A 2A6NA 4RV8A 4Z0JA 1VS1A 1JQXA 1I45A 1H50A 2VEPA 1NP2A 3PZ9A 1TX2A 1MYRA 1CIUA 1Q7QA 1H51A 4CEUC 2C1HA 1N2VA 3DFQA 5GNXA 5A6BD 3KCJA 3UJ2A 4F0KA 2C14A 4Z2GA 4E4UA 1JD7A 1TELA 5I09A 3AIUA 2O92A 3LTSA 4PSRA 2QJHA 3W0KA 1XGZA 1EC7A 4MWAA 2VQTA 2JF6A 3N04A 3T1GA 3UCQA 1XKYA 2A2IA 3GYCA 2BWGA 4HOZA 4JGDA 3MUXA 3V35A 4GY7A 5MKGB 4EACA 1A4LA 4BI6A 1FA2A 4HP5A 3TVAA 1ADDA 1JI1A 1NVMA 2GVEA 3KCLA 3DENA 5A6LA 4MNKA 1UKSA 1Z8AA 3M5ZA 3UNDA 1BYAA 3IEBA 2JGQA 1OABA 2DDXA 4ROQA 2VFFA 1RA0A 2XVPA 1OGGA 2FB3A 2GDUA 3PNZA 1TO3A 1M7XA 3GC5A 4CNNA 1TIWA 3KS6A 1P0KA 1O12A 4NZFA 5BRBA 3MSYA 5CGMA 3VK5A 2CWNA 2D69A 3R58A 3UVAA 1M7OA 3LRMA 3M5VA 3AHTA 3G0XA 4P7OA 4DWSC 3GG7A 1XS2A 3H55A 2QDDA 2ZXBA 4RLIA 4XO6A 4JYFA 4Q6XA 3ABXA 1GG0A 2UV8G 1ENUA 1WDRA 4LNYA 3WLJA 2Y8VA 2VRJA 3P0XA 3GZ3A 3RAOA 1XLAA 4JOMA 4A8IA 3FJLA 1E6SM 3K5XA 4LB3A 5D8ZA 2PTXA 5AYYA 2W91A 4HK6A 4UTHA 5FSDC 3O16A 4QE1A 2NVCA 3WLQA 3EOOA 4L64A 4JPGA 4U31A 1H4PA 1XSIA 4C6EA 1HXJA 3W74A 4C65A 2RDXA 2QCFA 2WHLA 5FEXA 3R6IA 4E3VA 1CZ1A 1GOIA 3CTLA 1K8YA 2A3LA 3G1SA 1HJSA 4DZ5A 1C9DA 1NIUA 3WQWA 3T9PA 2OQYA 3E5BA 1SPQA 4QJ3B 4S3JA 2ODOA 3WDRA 3OGRA 4U10A 3AXKA 3LSCA 2AL1A 3OLGA 1PIIA 3GFXA 4C6KA 2IKIA 4FAMA 2DT0A 4S23A 5C71A 5I3DA 3S6DA 4EANA 5CG0A 4YPJA 2GWGA 4W7WA 4CNPA 4C1LA 3M0YA 5I03A 4NXKA 4FX7A 1FKXA 2OO0A 4M5PA 4Q8OA 5HUOA 3FJ4A 1SZNA 1R3RA 2X1RA 1GYMA 4AHQA 5LIWX 1XINA 4S2CA 3S42A 2A3EA 4D72A 3EDJA 4JY8A 1FWTA 1DQWA 3L9CA 4EWJA 1NELA 3L12A 3NDOA 1EXPA 3W3OA 3QM3A 3ZSTA 3AYTA 3EDFA 5HMEA 1IE7C 2IPGA 2EF9A 3ZR6A 3AJXA 1NQKA 1NOUA 1PHQA 1OX6A 3LBCA 2GZXA 3AHYA 2PA6A 2O9RA 1FWDC 4MADA 2H8ZA 2CERA 1CGUA 1EJSC 4Y90A 1GOOA 1EC8A 5CC7A 1LOLA 3MUIA 1SJCA 1Q4NX 4R7WA 1B54A 1XRTA 3TTYA 4B9YA 2PRLA 5G4WA 4E2VA 2F2KA 2VEKA 4JIQA 3AS2A 2OX4A 1V0KA 1R3TA 2V3DA 2AGTA 2C6QA 3ABZA 2DIKA 1QASA 5C8BB 4HMNA 4HNNA 5ENLA 3HO8A 4DXVA 4GE8A 1KWKA 1I2RA 3TQVA 1X38A 3TIMA 3IVSA 3STCA 4MZ8A 2YFOA 1S2UA 4RW3A 1JYNA 2UY5A 4L4PA 1TWZA 2DSWA 1NFPA 5KSWA 4AWSA 1RK5A 3UXDA 2HVNA 5K9XA 1QNVA 2R1PA 3KRZA 2FFCA 3FAWA 2PWDA 1OSEA 1RQEA 1H7NA 1LCOA 3VE9A 3LM7A 1DJZA 1C9WA 2J7EA 1Q6LA 3ENLA 1FCQA 3PZIA 1OY0A 2V2HA 1G94A 1GVQA 4RXGA 4U28A 4UBPC 3SSJA 4X63A 4DPQA 3RU8X 3AZTA 4IQEA 1J12A 4YTTA 4FNSA 1GKRA 1FCVA 4B90A 2FMOA 2VNCA 3CO8A 4B5WA 1H1YA 2Y4SA 2R1NA 4QLJA 4FX8A 4BEQA 3PS7A 2XFFA 2Y2WA 3A4JA 4AVOA 4B91A 5IDZA 3FYYA 4LGXA 4W5ZA 1A3XA 4NF7A 1E3ZA 1VCVA 1DXIA 4P8XA 3UZWA 4DO4A 1VH7A 1B3ZA 3LPGA 4Y9AA 3U6WA 3RHGA 4X60A 1LQAA 1KQYA 1W17A 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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