The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
170
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structure length |
170
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Chain Sequence |
ALMNSDGLTGLSNRRHFDEYLEMEWRRSLREQSQLSLLMIDVDYFKSYNDTFGHVAGDEALRQVAGAIREGCSRSSDLAARYGGEEFAMVLPGTSPGGARLLAEKVRRTVESLQISHDQPRPGSHLTVSIGVSTLVPGGGGQTFRVLIEMADQALYQAKNNGRNQVGLME
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Signaling protein
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| molecule keywords |
WspR response regulator
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| publication title |
Determinants for the activation and autoinhibition of the diguanylate cyclase response regulator WspR.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Pseudomonas aeruginosa
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| total genus |
58
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| structure length |
170
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| sequence length |
170
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Alpha-Beta Plaits |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4ZP6 A; 3LAM A; 1HNV B; 3IGV A; 1BQN B; 2JEG A; 2C28 A; 2WON B; 2WOM B; 3I5A A; 5C42 A; 3H40 A; 3DLG B; 5KT2 A; 4GC7 A; 4RW4 A; 2HNZ B; 3LP2 A; 4EYI B; 1S1X B; 2IJN A; 3QID A; 4NCG A; 5KFZ A; 4RW8 B; 3CWJ A; 3EZU A; 3E01 B; 1HAR A; 3KHL A; 2R8I A; 4DL4 A; 4J9M A; 4IG0 A; 3DYA A; 3V6K A; 4DL6 A; 2VG7 A; 2B6A A; 2UUW A; 5J2Q A; 3LP1 A; 2V9W A; 2GC8 A; 3EPG A; 4QWA A; 4WFX A; 2IC3 A; 2BR0 A; 1N56 A; 1TKT A; 4NYZ A; 5KT6 A; 5KFF A; 3JSM B; 4F4W A; 5HLF B; 2BQR A; 4G1Q A; 4JUZ A; 1EP4 A; 5EWF A; 3HVT A; 2FJV A; 1S9E A; 2IBK A; 4I7F B; 5L9X A; 3OL6 A; 3FFI A; 2W9C A; 1FK9 A; 3DM2 A; 3GIK A; 2XI3 A; 2XGP A; 3H5X A; 1TL1 B; 2YNI A; 4K4W A; 3UDL A; 1TQL A; 3CJ2 A; 5DG8 A; 1HNI A; 1KLM B; 3PR4 A; 3IS9 B; 3OSN A; 3GIJ A; 5KFI A; 3ICL A; 3QLH B; 4K4Y A; 3M9N B; 4ZP7 A; 1HYS A; 4RU9 A; 4ED0 A; 1DLO B; 5F8J A; 2O5D A; 5KG4 A; 1S0O A; 3MTK A; 4TLR A; 1IKV A; 4MFB B; 1C0T B; 1JKH B; 1LW2 A; 3NAH A; 4RW6 B; 4ZHR B; 4EEY A; 3FDS A; 3MF5 A; 3LAK A; 5DQI A; 1RT1 A; 1LWE B; 2OPQ A; 5KFC A; 3OHB A; 1RTH A; 1HQU A; 4KAI A; 4MIB A; 2JEJ A; 3DMJ B; 1KLM A; 4ZVH A; 2YNH A; 4EO8 A; 1JLG A; 4KFB B; 3T19 A; 4Y2C A; 3DOL A; 2V0N A; 3I5C A; 2C22 A; 3PW4 A; 1RTJ A; 1RYS A; 1JX4 A; 1QE1 A; 1RT3 A; 2HND A; 4F4Z A; 1J5O B; 4HYK A; 4K4Z A; 1MML A; 3IG1 A; 5DLG A; 3KJV B; 5DGB A; 4R8U A; 3TQ1 A; 1JLB A; 4RUA A; 1KHW A; 4KE5 A; 3D5M A; 4DG1 A; 3CO9 A; 3G86 A; 2VG6 A; 1RDR A; 1S9F A; 2IAJ B; 4TQR A; 1VRT B; 2CJQ A; 3HVA A; 1HMV A; 2D7S A; 1UWB B; 2YKN B; 1LWC B; 2I5J B; 2R8J A; 1TKX B; 3V81 A; 1SH3 A; 1RTD B; 4MIA A; 4R0E A; 4YP3 A; 3FQK A; 2E9T A; 3H5U A; 5I42 A; 2AQ4 A; 4X2B A; 3ITH B; 5C25 A; 5J2P B; 5KFH A; 1RT7 B; 2OPS A; 4XPE A; 2FJW A; 3MR2 A; 4K4V A; 2R2R A; 1BQM A; 3KK3 A; 1FKO A; 5EUH A; 3KLH A; 2AGP A; 3QO9 A; 4KV8 B; 3GIL A; 1ZTT A; 4ZVE A; 1RT5 A; 1DTQ B; 5EDW A; 2YKM A; 1RT4 A; 1DTT B; 3FQL A; 1TV6 A; 3NBP B; 2UVV A; 3MED A; 2GIR A; 3IGN A; 4URQ U; 4QWD A; 5L1K A; 2ZD1 B; 1T03 B; 2J6U A; 2D3Z A; 3SFU A; 3NKY A; 3N6L A; 4QW9 A; 4LSL A; 3CJ5 A; 2AGO A; 1S0N A; 3H59 A; 4IOB A; 5EWG A; 3H5Y A; 4H4M A; 2BQU A; 3OSP A; 3I0S B; 2D41 A; 2RKI B; 5CYM A; 2QE5 A; 2JEF A; 1IKX A; 3KK2 B; 4K4S A; 5JUM A; 1CSJ A; 2JLE A; 1JLQ B; 3T5L A; 1RYR A; 4B3O B; 2R2U A; 1SV5 B; 5HRO B; 4IDK B; 3DRS B; 4H54 A; 2V4R A; 2IM3 A; 5HP1 B; 4O4G A; 1OS5 A; 1S1T B; 5HBM A; 4WYL A; 5FDL A; 3BJY A; 4IG3 B; 5F8N A; 3KLI A; 3QIP B; 2OPR A; 4O44 B; 1S1U A; 4IFY A; 2JC1 A; 4IRK A; 2HMI B; 1GX6 A; 2GIQ A; 1RT2 B; 2ILY A; 4O3P A; 1JLA A; 4KHR A; 1QUV A; 4ECY A; 4IR9 A; 1C1B B; 5DQG A; 5KFP A; 5F8L A; 3QYY A; 3BQ2 A; 3RBE A; 5J2N B; 2FVQ A; 4ICL B; 1LWF A; 2FVR A; 1VRU A; 3MEG B; 2VA2 A; 3MEC B; 4KO0 B; 2V4Q A; 4R5P A; 1IKY A; 3RB3 A; 1RT6 B; 4WZM A; 3BRE A; 1TVR A; 1C2P A; 5KFG A; 4WE1 A; 4URG A; 1EET A; 4TQS A; 4H4O B; 3CJ4 A; 4IH7 A; 4ED2 A; 4IRC A; 3GV7 B; 3BSC A; 2WHO A; 1S1V B; 3V6D B; 3BGR B; 1JLF B; 4MK8 A; 5KT7 A; 2B43 A; 4WXW A; 1S9G B; 4KKO B; 2XI2 A; 4KBI A; 4O4R A; 5C5J A; 4EBC A; 3PZP A; 3RBD A; 3V4I A; 4QPX A; 3KK1 B; 4KO0 A; 3CJ3 A; 1QAJ A; 3KLF A; 2ZE2 B; 4HKQ A; 4IFV B; 4J9N A; 1HNV A; 4WFZ A; 1BQN A; 4QWC A; 3Q8S B; 2R2S A; 4NLS A; 2WON A; 2WOM A; 3UR0 A; 1C1C B; 4EYH B; 3DLG A; 2RDJ A; 3OL9 A; 5DQH A; 4NLR A; 4KHM A; 2HNZ A; 4NLO A; 3QGH A; 5KFL A; 1S1X A; 1JLC B; 5KFU A; 1S9G A; 3PVX A; 3DDK A; 4RW8 A; 1HQE B; 4TYA A; 3TAM B; 4WXO A; 3E01 A; 4QWE A; 2IM2 A; 3MEE B; 1N5Y B; 1HPZ B; 3Q8P B; 4DL2 A; 3PW7 A; 4IRD A; 1S49 A; 1FKP B; 5C24 B; 5KFR A; 2YNG B; 1QAI A; 4WFY A; 3N6M A; 2ILZ A; 3KHH A; 3JYT B; 3JSM A; 5HLF A; 4URS A; 2RF2 B; 4I7F A; 4Q44 A; 2W9B B; 3LAN A; 2XC9 A; 4LSN B; 4ECV A; 1SUQ B; 2VA3 A; 2C2D A; 5JXS A; 3DLE B; 1TL1 A; 4MH8 A; 1XR5 A; 3C6T B; 4NRU A; 4Y3C A; 3NGD A; 1ZTW A; 2FLN A; 1REV B; 1RTI B; 4OL8 A; 5KFY A; 3IS9 A; 4ED3 A; 4MKB A; 3QLH A; 4TY9 A; 1DLO A; 4TXS A; 2R2T A; 4ZVF A; 4MFB A; 4ID5 B; 1C0T A; 1JKH A; 2F8E X; 4RW6 A; 4ZHR A; 4ZPB A; 5L1J A; 1LWE A; 2ASD A; 4KB7 A; 4ECR A; 3BSA A; 2WCX A; 4O3S A; 5CYQ B; 2IM0 A; 4RNH A; 3DMJ A; 1S1W B; 3C6U B; 4KFB A; 4RNO A; 4RNN A; 3QZ7 A; 4YR2 A; 4XPC A; 4NZ0 A; 1J5O A; 3M8Q B; 3KJV A; 5KFM A; 4GC6 A; 3V6J A; 3T5K A; 5F8M A; 4ECW A; 2BE2 B; 4O3N A; 2IJF A; 5J2M B; 1T05 B; 3KHR A; 5D3G A; 4TN2 A; 4PUO B; 4ECU A; 2E9R X; 3BR9 A; 3HKW A; 4JV0 A; 4ZMM A; 2FLL A; 3GV5 B; 4NLG A; 3KLE B; 5F9L A; 4ECS A; 3KHG A; 3GYN A; 1XR6 A; 4NLQ A; 3BSO A; 4ED1 A; 1R0A B; 2IM1 A; 2IAJ A; 3DI6 B; 3H2L A; 1VRT A; 2BAN B; 1NND A; 1D1U A; 4MKA A; 2ZKU A; 3I5B A; 5F8I A; 1N4L A; 1UWB A; 3DRP B; 3CVK A; 2YKN A; 5J1E B; 1LWC A; 2I5J A; 3GQC A; 1TKX A; 3QGG A; 4NLY A; 3FRZ A; 1TKZ B; 5KFE A; 2W8L A; 4RUC A; 3TVK A; 3OLA A; 1RTD A; 1MU2 B; 2XCP A; 1JIH A; 3IN5 A; 1S0M A; 3PR5 B; 3ITH A; 3Q8R B; 4PWD B; 5J2P A; 1RT7 A; 3NAI A; 1LW0 B; 5T14 A; 2OPP B; 4IQX A; 5I3U B; 2VG5 B; 3G6X A; 2R8K A; 3T5J A; 2AU0 A; 4EO6 A; 4KV8 A; 2CKW A; 5L1I A; 4KSE B; 4EBD A; 3IRX B; 4TY8 B; 5KG3 A; 4Q0B B; 1DTQ A; 3PW5 A; 3QZ8 A; 3FSI A; 5DGA A; 3DRR B; 2FVP A; 3BQ1 A; 1DTT A; 3DLK B; 4JV2 A; 3NBP A; 2HNY B; 4O3Q A; 4I2P B; 4NLX A; 3I0R B; 3VQS A; 3LP0 B; 2ZD1 A; 1T03 A; 3GV8 B; 3MR6 A; 4RW9 B; 4NRT A; 4NLP A; 4J9S A; 4ECX A; 3MFI A; 3I0S A; 1D0E A; 4Q8F A; 2RKI A; 4ZPC A; 1S6P B; 5KFJ A; 3KK2 A; 4U7C A; 4RW7 B; 2FVC A; 1JLQ A; 4B3O A; 2AX1 A; 3DOK B; 1SV5 A; 1JXL A; 3M8P B; 4IDK A; 4NLW A; 5K14 B; 5HRO A; 3DRS A; 5KFA A; 2B5J B; 2HAI A; 5HP1 A; 5DLF A; 1K1Q A; 1S1T A; 4J9O A; 3KNA A; 1I6J A; 4G3I A; 1GX5 A; 4IG3 A; 3KLG B; 1C0U B; 1YVF A; 3QIP A; 4O44 A; 1IKW B; 2AX0 A; 1JLE B; 2HMI A; 5KFO A; 5KG6 A; 4QWB A; 2W7P A; 1RT2 A; 2BRL A; 4F50 A; 5C42 B; 4F4X A; 1C1B A; 3RB0 A; 4FBT A; 4IH5 A; 5KFD A; 3BSN A; 2JC0 A; 2WTF A; 5J2N A; 4ICL A; 4RW4 B; 3MEG A; 3LP2 B; 2AGQ A; 3MEC A; 4NCG B; 2I1R A; 4J9L A; 4J9K A; 5DG7 A; 1RT6 A; 5KG1 A; 2HWI A; 4IG0 B; 3DYA B; 4ECT A; 5J2Q B; 2VG7 B; 2B6A B; 2R8G A; 3CDW A; 3LP1 B; 1S48 A; 4QW8 A; 4H4O A; 2W7O A; 3N6N A; 3V6D A; 1S1V A; 2IC3 B; 4M95 A; 3BGR A; 1JLF A; 3MR5 A; 4YR0 A; 1TKT B; 3KMQ A; 2JEI A; 3PW2 A; 4G1Q B; 4YQW A; 4KKO A; 3NMA A; 1EP4 B; 5F9N A; 3HVT B; 4U6P A; 1S9E B; 1U09 A; 4Q43 A; 3G6Y A; 4DL5 A; 1NHV A; 3FFI B; 1FK9 B; 4YR3 A; 3DM2 B; 2W9C B; 3KK1 A; 4WZQ A; 4K50 A; 2YNI B; 2ZE2 A; 4NLD A; 2FLP A; 3OLB A; 4NLU A; 3KLV A; 3M9M B; 4IFV A; 1HNI B; 4K4U A; 1N6Q B; 3QGI A; 4O3O A; 1C1C A; 2FVS A; 3MR3 A; 1HYS B; 4YME A; 3M9O B; 1IKV B; 1JLC A; 1LW2 B; 1SH2 A; 5D3G B; 3GII A; 5F8G A; 3H5S A; 1HQE A; 4IR1 A; 3TAM A; 3BQ0 A; 1RT1 B; 3SFG A; 4MK9 A; 2OPQ B; 3MEE A; 1N5Y A; 2WB4 A; 5EWE A; 1HPZ A; 2XWY A; 1RTH B; 5KFT A; 2ATL A; 4Q8E A; 1HQU B; 4K4T A; 3HHK A; 4NLV A; 5KFN A; 1FKP A; 3PJW A; 5C24 A; 3UQS A; 2R8H A; 2YNG A; 1XR7 A; 1TL3 B; 2YNH B; 1JLG B; 1N6Q A; 2UVW A; 4IKA A; 3DOL B; 3JYT A; 1RTJ B; 2RF2 A; 1QE1 B; 1RT3 B; 2HND B; 4ED6 A; 5KT3 A; 3IG1 B; 2W9B A; 2AWZ A; 4DL7 A; 4J9P A; 4R8U B; 4LSN A; 1SUQ A; 4EBE A; 1JLB B; 3ISN D; 3DLE A; 3C6T A; 4DG1 B; 1REV A; 1RTI A; 4XO0 A; 1NHU A; 1S4F A; 2VG6 B; 2ALZ A; 2WK4 A; 3ISN C; 3H4D A; 2J6S A; 4NLT A; 4ED7 A; 1W25 A; 3D28 A; 4ECQ A; 3PJX A; 5KT5 A; 1HMV B; 1TL3 A; 3PW0 A; 4DL3 A; 2W8K A; 3T5H A; 2ASJ A; 4ID5 A; 3V81 B; 2J6T A; 4I2Q B; 2WRM A; 4Y2A A; 4K4X A; 2RDI A; 1K1S A; 5I42 B; 3OHA A; 2EC0 A; 2BRK A; 1RAJ A; 2ASL A; 5KT4 A; 3UPF A; 5C25 B; 2OPS B; 5CYQ A; 1S1W A; 5KG7 A; 3Q8Q B; 2C2E A; 3C6U A; 2C2R A; 3CJ0 A; 1BQM B; 3KK3 B; 1FKO B; 4RNF A; 3E51 A; 2DPJ A; 1T94 A; 3KLH B; 3QO9 B; 2YNF B; 3M8Q A; 5KG0 A; 2QV6 A; 5KFQ A; 3EPI A; 5F8H A; 3V6H A; 4ECZ A; 3PHE A; 2BE2 A; 5J2M A; 1T05 A; 4PQU A; 1RT5 B; 1KHV A; 4PUO A; 2YKM B; 4I2Q A; 4FS2 A; 1RT4 B; 2UVR A; 3KLE A; 1TV6 B; 1R0A A; 4ZP9 A; 3MED B; 2IA6 A; 3DI6 A; 1RA6 A; 2BAN A; 1SH0 A; 2OH2 A; 4PQU B; 1S10 A; 1TP7 A; 3RAX A; 2BQ3 A; 4LSL B; 1IM4 A; 3DRP A; 4ZVG A; 3NL0 A; 4MK7 A; 5J1E A; 5KFB A; 3KMS A; 4H4M B; 1T3N A; 3GIM A; 3RB6 A; 4M94 A; 1TKZ A; 2YNF A; 5KFS A; 5CYM B; 1MU2 A; 3H4B A; 1N48 A; 5KFW A; 1IKX B; 3MFH A; 2D3U A; 3OL8 A; 4TYB A; 1WNE A; 2XGQ A; 4PWD A; 3CDE A; 4RZR A; 4ZPA A; 2HWH A; 4FBU A; 1LW0 A; 4J9Q A; 2OPP A; 4J9R A; 5I3U A; 2VG5 A; 3G6V A; 2E9Z A; 4ZPD A; 3T1A A; 2IMW P; 4O4G B; 4WYW A; 5HBM B; 5FDL B; 3KLI B; 3IRX A; 2OPR B; 4TY8 A; 2W9A A; 1S1U B; 4Q0B A; 3CDU A; 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1Q7L B; 2HG4 A; 1G6B A; 3EXC X; 1UWB B; 1FRH A; 4LRC A; 4K0K J; 1YJT A; 2HHW A; 1EAR A; 2FZC B; 1HWJ A; 4OYW A; 4WP9 A; 3KK3 A; 4CCH A; 3ET6 A; 4C98 A; 1FJC A; 3QQC D; 2DGW A; 3JQM A; 4WK1 A; 2JEF A; 1WC0 A; 2BAC A; 4YB6 A; 1Q95 G; 2KT2 A; 2NXC A; 3HX9 A; 2WAQ D; 5B0G A; 5HP1 B; 1ZH5 A; 1F5A A; 4WYL A; 2XB2 D; 1T9Y A; 2DCU B; 3D6T B; 2IBO A; 2HVE A; 1WC6 A; 2GIQ A; 2BM0 A; 5J2N B; 4ZIT A; 3BEG B; 2I38 A; 2VA2 A; 4KO0 B; 2YQ1 A; 2QA4 G; 4WZM A; 1UVM A; 1FJG F; 2HAF A; 3V6D B; 1WEL A; 5A8R B; 4LT6 A; 2AV5 A; 3PZP A; 5C5J A; 2OI2 A; 2JSX A; 1AZS A; 3MPW A; 3S6E A; 4OZ5 A; 2PEH A; 3US5 A; 4NLO A; 3TJA A; 1T11 A; 3LOU A; 1HQE B; 4TYA A; 3SZ2 A; 4DL2 A; 4IRD A; 4A8S A; 2XC9 A; 4J7C A; 2LQ5 A; 1FEH A; 1KEK A; 1RWK B; 3J7A N; 1JKH A; 1UJ4 A; 3FZB A; 4D3G A; 2PO4 A; 3S1T A; 4EUV A; 4XPC A; 1HA1 A; 1NKE A; 5AXN A; 1E6V B; 4TN2 A; 3QRR A; 3BR9 A; 4RR5 A; 1N32 J; 4ECS A; 1H0H B; 1VRT A; 5BYQ A; 3NGU A; 3DRP B; 1S0M A; 2GHV C; 3G8T A; 3G9C A; 2EFG A; 5I3U B; 3AD7 C; 2FB0 A; 4NZ6 A; 2WVC A; 4OX9 F; 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