The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
25
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sequence length |
81
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structure length |
81
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Chain Sequence |
SAEGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRKKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
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| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
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| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
25
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| structure length |
81
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| sequence length |
81
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DMO A; 2H8H A; 2ED1 A; 2PNI A; 4R0K A; 1A0N B; 1OOT A; 1ZSG A; 1MV3 A; 1WYX A; 4J9F A; 1Y0M A; 1AWW A; 2FG0 A; 2FO0 A; 4JZ4 A; 2X3W D; 5IHN A; 1N5Z A; 2RPN A; 4CC3 A; 4D8K A; 3I5S A; 3PE0 A; 4CC2 A; 4QT7 A; 1S1N A; 4RTV A; 1H8K A; 3H41 A; 1H92 A; 1VYT A; 1NLP C; 1UUE A; 2PZ1 A; 2EPD A; 1ABO A; 5FW9 A; 2V1R A; 1T3S A; 2EYY A; 2D8H A; 3VS2 A; 2A37 A; 1CKB A; 2RQV A; 2JT4 A; 4IIM A; 2KR3 A; 4OML A; 4F14 A; 3EGU A; 2CH4 W; 4J9C A; 1RLP C; 2KRN A; 4D8D A; 1H3H A; 2DVJ A; 1YCS B; 1VYU A; 2RQR A; 1EFN A; 2LP5 A; 2OAW A; 3A98 A; 2GNC A; 3JV3 A; 4Z89 A; 1X27 A; 3M0P A; 2JW4 A; 2RQT A; 2K6D A; 4JJB A; 1M3B A; 4J9B A; 2JM8 A; 2F2W A; 1AWX A; 4IIO A; 2LQN A; 4LNP A; 1GCQ C; 2YUN A; 2CSQ A; 1UHC A; 4Y92 A; 4Z88 A; 2EQI A; 2O9V A; 4HCK A; 4FSS A; 2HSP A; 3TSW A; 4AG1 C; 1CKA A; 2EGE A; 2EGA A; 4HVW A; 1AOJ A; 2RF0 A; 1AZG B; 1K1Z A; 2YT6 A; 3THK A; 1QWE A; 1Z9Q A; 2J06 A; 4OMM A; 2J6K A; 4J9D A; 1BBZ A; 2YSQ A; 4JJD A; 3FJ5 A; 2J6F A; 2A28 A; 2NWM A; 1RLQ C; 1X43 A; 1YWO A; 2XMF A; 4GBQ A; 4HVV A; 4HXJ A; 2LJ3 A; 2CSI A; 2KEA A; 3VS6 A; 4RTU A; 2A08 A; 1I07 A; 1YWP A; 5IHK A; 1ARK A; 2DL5 A; 1I0C A; 1E6G A; 3PVQ A; 2DL4 A; 1T0J A; 2AZV A; 1NG2 A; 2CH4 A; 2L2P A; 2C0O A; 2J6O A; 1JQQ A; 2FRY A; 2GBQ A; 4F16 A; 2L3P A; 2YUO A; 3EG0 A; 4LE9 A; 1K76 A; 1MUZ A; 1KFZ A; 2AK5 A; 1TUC A; 1X2Q A; 1M27 C; 4ZNX A; 2OI3 A; 4E6R A; 1BB9 A; 4CC4 B; 5I22 A; 2DYB A; 4GLM A; 1B3Q A; 1AEY A; 2DF6 A; 2JMC A; 1UTI A; 2JS2 A; 4X1V A; 5IH2 A; 1X6B A; 4RUG A; 1QCF A; 1NM7 A; 2FRW A; 4RTT A; 1M3C A; 3I9Q A; 2RMO A; 2X3X D; 3REA B; 1YP5 A; 1QKW A; 1ZUU A; 2CUD A; 2VVK A; 2M0Y A; 5L23 A; 1RI9 A; 1AWJ A; 2KRM A; 3U23 A; 5FWC A; 5EC7 A; 1V1C A; 2RN8 A; 5IXF A; 2LJ1 A; 3ULR B; 1NYF A; 2AKL A; 2KXC A; 1U3O A; 1GFC A; 2SRC A; 2ECZ A; 2DRK A; 2KBT A; 5IXB A; 2D0N A; 5IHI A; 2JTE A; 2BZ8 A; 1BU1 A; 4LUE A; 1AD5 A; 2QDL A; 3UAT A; 2DL8 A; 2JMA A; 2DBK A; 3R6N A; 2NUZ A; 1PWT A; 3EG1 A; 3RBB B; 2KYM A; 1UJ0 A; 3REB B; 5HCK A; 3TSZ A; 4ORZ A; 3M0U A; 2JS0 A; 4EIK A; 1OV3 A; 2FPD A; 4AFQ C; 4J9G A; 4KRT A; 1SSH A; 2K3B A; 2KT1 A; 1PHT A; 4JJC A; 1NLO C; 4AFU C; 2HCK A; 2OJ2 A; 4F17 A; 2W0Z A; 1NYG A; 1TG0 A; 4M4Z A; 2LNH B; 4OMP A; 4JZ3 A; 1E6H A; 1UJY A; 1KSW A; 3I5R A; 1TUD A; 2ABL A; 2KGT A; 2PTK A; 2LX7 A; 2KRS A; 1WIE A; 3KFV A; 1NEG A; 1X2K A; 2L0A A; 1E7O A; 2FEI A; 1AWO A; 2YDL A; 1FYN A; 4RTW A; 2O88 A; 2DLP A; 2B86 A; 1JU5 C; 4DEX A; 2GGR A; 2O31 A; 2VKN A; 1AVZ C; 1U5S A; 2CUB A; 1OEB A; 2CDT A; 1M30 A; 2L3Q A; 4ESR A; 2F2X A; 3SEM A; 1PRM C; 3PVL A; 1KIK A; 1SEM A; 1ZUY A; 2YUQ A; 3NGP A; 4OMQ A; 2EBP A; 3UF4 A; 1PRL C; 2MCN A; 3H0H A; 2O2O A; 2J7I A; 2ROT A; 2BTT A; 2KT8 A; 2AKK A; 2CRE A; 2LQW A; 1NEB A; 2DM1 A; 4LUD A; 2P4R A; 1ZLM A; 2HBW A; 1J3T A; 1OPK A; 1HJD A; 4LN2 A; 2DNU A; 4HVU A; 1B07 A; 2EKH A; 3VS7 A; 1AZE A; 2CT3 A; 1I1J A; 2G6F X; 2MIO A; 2O9S A; 1HD3 A; 1UEC A; 2DJQ A; 1YN8 A; 3QWY A; 2W10 A; 2D1X A; 2F2V A; 4K11 A; 1K9A A; 1UGV A; 1QWF A; 2DIL A; 1RUW A; 1W70 A; 2GQI A; 1UE9 A; 2ENM A; 1GRI A; 4JPB W; 3SHW A; 3M0S A; 1PNJ A; 1WXT A; 1W1F A; 3UA6 A; 2EW3 A; 1GBQ A; 3TVT A; 3NMZ C; 1KJW A; 2K9G A; 5I11 A; 1Z9Z A; 2KNB B; 1T3L A; 2RQU A; 1K0S A; 1ZBJ A; 1QLY A; 1WDX A; 4RTY A; 3RNJ A; 2ESW A; 2CT4 A; 1SRM A; 1SHF A; 2D8J A; 1JXM A; 1WLP B; 3H0I A; 3M0T A; 2KRO A; 1SPK A; 2J05 A; 1G83 A; 2L3S A; 5GJV B; 2LZ6 B; 4Z8A A; 1SHG A; 1WFW A; 1WX6 A; 1WI7 A; 5ECA A; 3VS5 A; 1JXO A; 1SRL A; 2FPF A; 2JM9 A; 1UDL A; 2DL7 A; 2HDA A; 2RNA A; 3VS0 A; 2LCS A; 2C0I A; 5GJW B; 1IO6 A; 1WXB A; 1Y57 A; 4J9E A; 2DE0 X; 1K0X A; 4AFS C; 2GTJ A; 2EYX A; 2RQW A; 2I0N A; 2M51 A; 1X6G A; 1XOV A; 2A36 A; 3H0F A; 4AFZ C; 1YNZ A; 3ZL7 C; 2SEM A; 4DEY A; 3IQL A; 1OPL A; 1WXU A; 2LMJ A; 1UHF A; 2ED0 A; 1ZUK A; 2E5K A; 2HEQ A; 1PKS A; 1T0H A; 1ZX6 A; 4A63 B; 1ABQ A; 3M0R A; 3NHN A; 1HSQ A; 4RTX A; 2BZY A; 3GBQ A; 1X69 A; 3LH5 A; 3VS4 A; 3CQT A; 1GCP A; 2K7A A; 2AZS A; 4WCI A; 2V1Q A; 2K2M A; 2K79 A; 1JO8 A; 2KXD A; 1LCK A; 3EG3 A; 1M8M A; 2KE9 A; 4CC7 A; 3M0Q A; 1CSK A; 3VRZ A; 3O5Z A; 4OMN A; 2ROL A; 3VS3 A; 1MV0 B; 3EHR A; 4J9I A; 1GL5 A; 2EYZ A; 2C0T A; 4RTZ A; 2DA9 A; 1PKT A; 2YUP A; 1UG1 A; 3UA7 A; 3EG2 A; 3I35 A; 1W6X A; 1QKX A; 2EVR A; 4OMO A; 1BK2 A; 1GFD A; 1M3A A; 2FPE A; 3VS1 A; 2DX1 A; 2GTO A; 1JEG A; 2LJ0 A; 1UFF A; 2EYW A; 5FWB A; 1K4U S; 4J9H A; 2DBM A; 2JXB A; 3VRY A; 1G2B A; 1WA7 A; 2DRM A; 3QWX X; 1U06 A; 3NPF A; 1FMK A; 1GBR A; 2DL3 A; 2BZX A; 1VYV A; 2KYB A; 2MOX A; 4AG2 C; 1GCQ A; 1VA7 A; 3C0C A; 2IIM A; 2EGC A; 3EHQ A; 2VWF A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3OMG A; 2H8H A; 2VYT A; 2LVM A; 5M9O A; 3RER A; 1Q86 U; 4PFP A; 1AWW A; 1RL2 A; 1VIF A; 2FO0 A; 2X3W D; 1JJ2 P; 1KD1 U; 4VUB A; 4D8K A; 1LPL A; 4RTV A; 1H92 A; 2FVU A; 3RMS A; 1VYT A; 4J6Y A; 2QEX Q; 2V8J A; 2DXT A; 2EPD A; 5FW9 A; 5LL6 S; 1M90 U; 1BCM A; 1KC8 C; 4M7D E; 2PUK B; 2BKD N; 1IXD A; 2QAS A; 1VQ5 Q; 1RAG B; 3VS2 A; 1M1K U; 4M7D G; 2NLU A; 2X35 A; 3M4G A; 3DKM A; 5LJ5 g; 3QBY A; 3JB9 I; 3M53 A; 2DIG A; 2KR3 A; 4JUV A; 2HQH A; 2QTX A; 3EGU A; 5KCO A; 3I55 Q; 4PNO A; 4D8D A; 2DXC A; 4JLI A; 2RQR A; 2DD5 A; 2EFI A; 2OAW A; 3A1P A; 3A98 A; 2JW4 A; 2RQT A; 5LJ5 h; 5J26 A; 2JM8 A; 1NBE B; 2F2W A; 4IIO A; 4LNP A; 3M58 A; 2XID A; 3OS2 A; 3CC2 T; 4Y92 A; 4CRI A; 1Y7X A; 1KQS P; 1N8R C; 3LW5 E; 2MWP A; 1UGP B; 2HSP A; 3TSW A; 4AG1 C; 3CCL Q; 2RF0 A; 4QKU A; 1AZG B; 3QDF A; 3THK A; 1Z9Q A; 2HL5 C; 4LDY A; 2OTL A; 1BBZ A; 1TUG B; 3NTI A; 2CZ7 B; 5GAN 4; 5C0M A; 2MF2 A; 4LD6 A; 5LJ3 h; 2A28 A; 2DZC A; 2NWM A; 1BI3 A; 1YWO A; 4GBQ A; 1B34 A; 3JB9 F; 4HVV A; 2P84 A; 3MJX A; 1VQP Q; 4N4G A; 3M57 A; 1ZSZ C; 4HKE A; 4II1 A; 3L2Z A; 4JRK A; 2JTF A; 1I07 A; 1Q86 C; 3OYE A; 4FYV B; 1M4Z A; 2JJ9 A; 1RI0 A; 3V7C A; 1QP3 A; 1T0J A; 1KD1 C; 1JBM A; 2RI5 A; 3G71 T; 2CH4 A; 4C5H A; 1PG5 B; 2QQA A; 2CP2 A; 2FRY A; 3PT9 A; 4PJL A; 3EG0 A; 1X2Q A; 4ZNX A; 3OYL A; 1VQK T; 4E6R A; 3FEO A; 1M90 C; 4JRP A; 3GP8 A; 5GAO l; 3H6Z A; 1B3Q A; 8AT1 B; 4M7D A; 4E7Z A; 2WSC E; 4ZTF A; 1M1K C; 2YRV A; 3M55 A; 1QCF A; 1ZSZ B; 2GF7 A; 3EAE A; 1NM7 A; 4BE1 A; 4J6X A; 2E41 A; 4MZP A; 1Q7Y R; 4ATO A; 3EGX A; 2CP5 A; 4M7D F; 2X3X D; 3REA B; 1QKW A; 5GAN j; 3VYG A; 2OX7 A; 2VVK A; 2CGH A; 1VQ9 A; 2HKN A; 5L23 A; 2MPX C; 4Y28 E; 3CCJ A; 5FWC A; 2EKO A; 5KYU B; 3JCM V; 5IXF A; 4E7H A; 1NYF A; 2ZGW A; 3SB2 A; 2KXC A; 1U3O A; 4PJN A; 3MP8 A; 2DRK A; 2QDY B; 2KBT A; 4QVD A; 3CMA A; 1F1B B; 1AHJ B; 3OY9 A; 2BZ8 A; 1BU1 A; 1NPR A; 2CS7 A; 2PVG B; 3OYM A; 4LUE A; 4BAC A; 2Z0W A; 1PWT A; 3EG1 A; 4PLL A; 4ZGD B; 5LJ5 f; 4XTW A; 3JB9 D; 1NPP A; 1ZQ1 A; 3REB B; 5HCK A; 2RD1 A; 3PNW C; 4BI8 B; 3CD6 Q; 1M1G A; 4ORZ A; 4EIK A; 3NFC A; 2FPD A; 4J9G A; 4KRT A; 3JCM d; 2FB7 A; 3G6E T; 1PHT A; 4AFU C; 2HCK A; 2OJ2 A; 4RKU E; 4ZN1 A; 3OSV A; 3CCM T; 3EFO B; 1YJW Q; 1UJY A; 1KSW A; 3I5R A; 5CO7 A; 4EMK B; 5LJ3 f; 5GMK h; 4WTO B; 5HKC A; 2PTK A; 4E7L A; 2LX7 A; 1WIE A; 4M78 C; 1NEG A; 2YLB A; 3A5Z B; 3JCM c; 5D6Y A; 2DVE A; 1FYN A; 1S72 Q; 4DEX A; 3DLM A; 2LRQ A; 4OB3 B; 4F7U G; 2CUB A; 3M4Y A; 4M7D D; 1W4S A; 3ZFJ A; 1U1T A; 3X20 B; 3SEM A; 4KT0 E; 3PVL A; 2YUQ A; 3MEU A; 2EBP A; 4OB2 B; 2X4X A; 3H0H A; 4DBF A; 2YRD A; 2BIV A; 2LQW A; 2FHD A; 2P4R A; 1ZLM A; 3JAM E; 1OPK A; 4M7A C; 2E3I A; 2DNU A; 4PJO E; 2CT3 A; 2G6F X; 1M2V A; 4X9D A; 2MIO A; 3HL8 A; 4M78 B; 3QWY A; 4PJO G; 2W10 A; 4K11 A; 3HRT A; 3CCU T; 1K9A A; 2HNI A; 2HD0 A; 2JN0 A; 3LWH A; 3LGF A; 1W70 A; 1R8O B; 4ELY C; 4OGE A; 2ENM A; 3SHW A; 3M0S A; 5D7U A; 1WJR A; 1W1F A; 4FW1 A; 4E2F B; 2A7Y A; 1U8R A; 5GAN g; 1WHM A; 2K9G A; 1Z9Z A; 1T3L A; 2ZPH B; 1K0S A; 1PC0 A; 1QLY A; 3JSC A; 1NJI R; 4M7A B; 2DTH A; 1SRM A; 3C12 A; 5CKH A; 4HA8 A; 1WLP B; 5GAN h; 1IHV A; 2NUP B; 4O5V A; 2L3S A; 1VQL A; 3QUI A; 1PD1 A; 4L6V 5; 3FJP A; 1WFW A; 1WX6 A; 1WI7 A; 4OB1 B; 3I55 T; 2E10 A; 1R77 A; 3VS5 A; 4DA4 A; 1JXO A; 2JM9 A; 1WGS A; 1IO6 A; 1WXB A; 1Y57 A; 3HRS A; 2P0P A; 2R58 A; 4F7U A; 4ZGE B; 2EYX A; 2DK3 A; 4M75 E; 2KI7 A; 4OVA A; 3H0F A; 3LWI A; 2FZG B; 2SEM A; 3PIO A; 3CCL T; 4M75 G; 4F7U F; 2O01 E; 3IQL A; 1OPL A; 1FWZ A; 1VQN A; 3E2U A; 1RAF B; 1YHQ T; 2BE9 B; 1VQ4 T; 1UHF A; 3FIF A; 1ZUK A; 4XTX A; 2HAX A; 4N0A C; 2E5K A; 2CP6 A; 4FL6 A; 2QQR A; 1T0H A; 2XDB A; 4A63 B; 1ABQ A; 3M0R A; 4RTX A; 4C92 G; 1VQP T; 4PJO A; 4BY6 B; 3LH5 A; 3VS4 A; 2G3R A; 3CC7 Q; 4LDX A; 1GCP A; 3AT1 B; 5IAY A; 2AZS A; 1RAI B; 3HFN A; 2V1Q A; 3EG9 B; 4L5G A; 3M0Q A; 3CCQ Q; 2K5L A; 5D6X A; 1QVF A; 5FU7 B; 2K5F A; 1MV0 B; 2C0T A; 4RTZ A; 2YUP A; 1QCN A; 3UPU A; 3OW2 A; 3I35 A; 2P0K A; 1GFD A; 2GTO A; 3LYI A; 1QVF P; 4C8Q G; 3CCR A; 1RAA B; 1K4U S; 1G3S A; 2RHI A; 1WA7 A; 2D0Q B; 1GBR A; 3QZ5 B; 3E1S A; 2CKK A; 1GCQ A; 2X4W A; 4C5E A; 2DER A; 4N0A A; 2FZC B; 1ZA1 B; 5J3B A; 2PNI A; 4E7J A; 1A0N B; 2WSE E; 1YJN Q; 1WYX A; 4J9F A; 1VQM Q; 1MHN A; 5GAN f; 4C0G A; 2HQE A; 2RPN A; 4M75 A; 3I5S A; 3UDC A; 4MZT A; 1VQ7 Q; 3H41 A; 4R55 A; 3GF5 A; 1Q86 R; 1NLP C; 3SWN C; 1UUE A; 3HKS A; 4C5G A; 2QEX A; 1ABO A; 2LNV A; 2RI3 A; 3HPW A; 1X01 A; 1T3S A; 1VQ5 A; 4LD9 K; 2D8H A; 4C92 A; 2A37 A; 2JNG A; 3ASK A; 5CAI A; 3CD6 T; 3QJ6 A; 1U1S A; 4F14 A; 2DTO A; 1ZHI A; 4C92 F; 1YCY A; 3EGD A; 3EFR A; 3I55 A; 2E6Z A; 2DVJ A; 1YCS B; 1Q81 R; 3JV3 A; 3M0P A; 2RI2 A; 3D7S B; 4JJB A; 1R0C B; 4J9B A; 2QAZ A; 4A53 A; 2OTL T; 2YUN A; 5LJ3 j; 1OQK A; 2CSQ A; 1WJQ A; 4FT2 A; 3SWN B; 2RH2 A; 4CI0 C; 2COZ A; 1SF9 A; 2EQI A; 2DFU A; 3CPW S; 2QTV A; 3PFS A; 4C8Q A; 2EGE A; 4HVW A; 3CCL A; 4E7I A; 5GMK l; 2KK4 A; 2YT6 A; 3NTH A; 2J06 A; 4OMM A; 4JJD A; 2YSQ A; 4LXC A; 3FJ5 A; 2NYS A; 4C8Q F; 5CK9 A; 2VGM A; 2XMF A; 5GAN 5; 4JDS A; 4LDU A; 3JCM h; 4HXJ A; 3JCM J; 1YFN A; 1IRE B; 1VQP A; 5FU6 B; 3OW2 S; 4RCC A; 2A08 A; 2LTO A; 4NOY A; 1ARK A; 4L59 A; 4BB7 A; 4XU1 A; 2DL5 A; 2B8A A; 1I0C A; 2DL4 A; 2AZV A; 1SKU B; 1NG2 A; 2C0O A; 2J6O A; 3CCV Q; 4FT4 A; 1YJ9 Q; 1SSF A; 3JCM W; 4F16 A; 2DD4 A; 2YUO A; 3C4S A; 2AK5 A; 1TUC A; 1M27 C; 3C95 A; 4M75 D; 1BB9 A; 2QA4 Q; 1Y96 A; 3M54 A; 4NS5 A; 4XTV A; 2LT4 A; 1VQ9 T; 2JMC A; 1UTI A; 2O4X A; 4QQ6 A; 4RUG A; 4MDW A; 4KBM B; 4EDU A; 3CCJ T; 2XD0 A; 2R57 A; 1M3C A; 4C92 D; 3J80 E; 1YP5 A; 3UT1 A; 3CME Q; 3CMA T; 2LQK A; 5CR2 A; 2DEQ A; 2M0Y A; 3LX7 A; 5HY6 A; 1D0X A; 1RI9 A; 4B6M A; 1QVG A; 1WNL A; 2DO3 A; 2NUT A; 2KRM A; 1ZBX A; 1YIT Q; 4C0Z A; 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