The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
EGYQYRALYDYKKEREEDIDLHLGDILTVNKGSLVALGFSDGQEARPEEIGWLNGYNETTGERGDFPGTYVEYIGRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Protein binding
|
| molecule keywords |
Phosphatidylinositol 3-kinase regulatory subunit alpha
|
| publication title |
Structural studies of the phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K) SH3 domain in complex with a peptide ligand: role of the anchor residue in ligand binding.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
77
|
| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B, C, D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-07-06 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1JXM A; 2BTT A; 2DRM A; 2EVR A; 2DMO A; 3EGU A; 1PKT A; 2J7I A; 3CQT A; 1UTI A; 2DLP A; 1VA7 A; 2KRN A; 1VYV A; 2YDL A; 4GBQ A; 4RUG A; 2MCN A; 2DRK A; 4J9E A; 3NHN A; 1SHF A; 1UUE A; 2GTO A; 2PNI A; 1E6H A; 1CSK A; 1X27 A; 1YWO A; 1PRM C; 2DL8 A; 4CC2 A; 3EG2 A; 3NGP A; 3EHQ A; 1M3B A; 1WI7 A; 1NEG A; 1MUZ A; 2DBK A; 2X3X D; 2KRS A; 1NYF A; 2EBP A; 5I11 A; 5IH2 A; 3EG1 A; 1CKA A; 1IO6 A; 1QWE A; 3I9Q A; 1Z9Z A; 4LN2 A; 3ULR B; 2BZY A; 1H92 A; 2JM9 A; 1WDX A; 2DL3 A; 4HCK A; 1V1C A; 3EG0 A; 2JS2 A; 1AD5 A; 2K6D A; 1T3L A; 2DX1 A; 2EYX A; 2EGC A; 2GGR A; 1VYT A; 2GBQ A; 2M0Y A; 2K3B A; 3PVQ A; 1A0N B; 2DE0 X; 1HJD A; 1RLQ C; 4R0K A; 2CH4 A; 1AVZ C; 2BZX A; 2E5K A; 4Z88 A; 4Z89 A; 3M0S A; 3JV3 A; 1OV3 A; 2RPN A; 1ZLM A; 3M0Q A; 2JM8 A; 4JPB W; 1CKB A; 2VKN A; 3TVT A; 3RBB B; 3SEM A; 1X2Q A; 4LE9 A; 1FMK A; 3NMZ C; 2GQI A; 2KXD A; 1AWW A; 2AKL A; 2W0Z A; 2V1R A; 1SHG A; 1NLP C; 2NUZ A; 1M3A A; 1YWP A; 4AG2 C; 5IHN A; 1M8M A; 2LCS A; 1UJY A; 2XMF A; 2O88 A; 1ARK A; 1RI9 A; 1AEY A; 4QT7 A; 4OML A; 2DJQ A; 1NLO C; 2C0T A; 1RUW A; 2EGA A; 2RQU A; 2GTJ A; 1UEC A; 2EGE A; 2ROL A; 1Z9Q A; 3SHW A; 4DEX A; 1WLP B; 3QWY A; 1GBQ A; 2RQT A; 1H3H A; 4EIK A; 2JW4 A; 2O31 A; 1WXT A; 2OJ2 A; 1Y0M A; 5HCK A; 1N5Z A; 2JTE A; 1ZSG A; 5IXB A; 1YN8 A; 1ZUU A; 4LUD A; 1I07 A; 1OOT A; 1GRI A; 1NYG A; 2CRE A; 1WIE A; 1GL5 A; 2AK5 A; 2B86 A; 5I22 A; 1SSH A; 2LQW A; 4J9B A; 5FWB A; 3M0T A; 4JJB A; 1PWT A; 1WYX A; 3VS1 A; 4M4Z A; 2CSI A; 2F2W A; 1OPK A; 1NG2 A; 2DL5 A; 2EYZ A; 4AFZ C; 1U5S A; 2KE9 A; 2L2P A; 1WA7 A; 1X69 A; 2O9S A; 2ABL A; 5FWC A; 1SEM A; 1TG0 A; 2M51 A; 3H41 A; 4J9C A; 1GCQ A; 1JQQ A; 2YSQ A; 1T0H A; 2K7A A; 4CC3 A; 1ZBJ A; 2RNA A; 2ED0 A; 4J9D A; 3ZL7 C; 2DF6 A; 2ECZ A; 2J6F A; 1ZX6 A; 1WXU A; 3UA7 A; 2HSP A; 2VVK A; 2A36 A; 2YT6 A; 2CSQ A; 2LNH B; 1UJ0 A; 4A63 B; 3VS3 A; 2L3Q A; 1ZUK A; 2EYY A; 1ABQ A; 1W6X A; 2JXB A; 3PVL A; 1K0S A; 4ESR A; 2GNC A; 5IHK A; 2YUN A; 2C0I A; 3I5R A; 3I5S A; 2KRO A; 4HXJ A; 1X6B A; 2ED1 A; 2RQR A; 2JMC A; 2FPD A; 1JU5 C; 1QKX A; 4E6R A; 1AZE A; 1K1Z A; 2X3W D; 4RTU A; 4Y92 A; 1YP5 A; 4OMM A; 1HD3 A; 4J9G A; 1AZG B; 3C0C A; 2LX7 A; 1JO8 A; 2HEQ A; 2DBM A; 2A28 A; 1UGV A; 1M27 C; 1BU1 A; 3VRZ A; 4HVW A; 4AFQ C; 1GCP A; 4RTT A; 2L3P A; 2KBT A; 3REB B; 1PHT A; 2O9V A; 3EHR A; 1YNZ A; 4AG1 C; 2FRW A; 2J6K A; 2RQV A; 3TSZ A; 1TUC A; 1BK2 A; 3LH5 A; 2MOX A; 2D8H A; 2PTK A; 2ESW A; 2CH4 W; 1GBR A; 2RF0 A; 2PZ1 A; 1NEB A; 1X43 A; 3UF4 A; 3H0H A; 1QCF A; 4FSS A; 4K11 A; 4JZ4 A; 1WX6 A; 1Y57 A; 1AOJ A; 5L23 A; 1NM7 A; 3M0R A; 3VS7 A; 2KGT A; 2EKH A; 1GCQ C; 1ZUY A; 1AWJ A; 4RTW A; 2EPD A; 1JEG A; 4AFU C; 2FEI A; 2VWF A; 2J6O A; 2J06 A; 2FRY A; 2OAW A; 3O5Z A; 1HSQ A; 3H0F A; 3UA6 A; 2V1Q A; 1U3O A; 2KYB A; 4ZNX A; 1B3Q A; 4RTX A; 3A98 A; 1QLY A; 4J9F A; 1VYU A; 1M3C A; 3KFV A; 2LZ6 B; 3R6N A; 2FG0 A; 4Z8A A; 4OMO A; 3I35 A; 3H0I A; 2CUD A; 2SEM A; 2CT3 A; 1GFC A; 2ROT A; 1LCK A; 1W1F A; 1SRL A; 2P4R A; 2A08 A; 1X2K A; 4OMN A; 1QKW A; 1G83 A; 4WCI A; 2DIL A; 4F17 A; 2KXC A; 4ORZ A; 3VS0 A; 2EW3 A; 3REA B; 3VRY A; 1PNJ A; 2F2V A; 1MV3 A; 2DL4 A; 2O2O A; 1M30 A; 3FJ5 A; 2I0N A; 2CT4 A; 4RTY A; 2CDT A; 5IHI A; 1J3T A; 2C0O A; 1SRM A; 2HCK A; 2KEA A; 4HVV A; 2KRM A; 2L0A A; 2DM1 A; 5GJW B; 1WXB A; 1QWF A; 2NWM A; 4JJD A; 5IXF A; 2LP5 A; 3IQL A; 2F2X A; 1U06 A; 1UFF A; 3RNJ A; 1S1N A; 2LMJ A; 3THK A; 2FPF A; 2G6F X; 5GJV B; 2DA9 A; 2YUQ A; 1T0J A; 1AWX A; 2HDA A; 1T3S A; 1TUD A; 2D1X A; 4GLM A; 1UG1 A; 4F14 A; 4D8K A; 3TSW A; 1KJW A; 2LQN A; 4OMQ A; 1SPK A; 1E7O A; 1X6G A; 4KRT A; 2CUB A; 2A37 A; 1MV0 B; 2DNU A; 2K2M A; 2JMA A; 4J9I A; 1I0C A; 1OPL A; 1YCS B; 2AKK A; 2BZ8 A; 2EQI A; 1KIK A; 2J05 A; 2LJ3 A; 4HVU A; 1UDL A; 1KSW A; 4D8D A; 1K76 A; 2KR3 A; 2W10 A; 3U23 A; 2MIO A; 4OMP A; 1B07 A; 4CC4 B; 2DYB A; 3VS2 A; 1BBZ A; 4J9H A; 2D0N A; 2ENM A; 1G2B A; 2KT1 A; 2L3S A; 1EFN A; 1PRL C; 4LUE A; 2SRC A; 1OEB A; 2YUP A; 2JT4 A; 2LJ1 A; 3M0U A; 2RN8 A; 1XOV A; 1UHC A; 4RTZ A; 1UE9 A; 2QDL A; 1ABO A; 1E6G A; 2LJ0 A; 3QWX X; 2EYW A; 2FPE A; 4DEY A; 5EC7 A; 3GBQ A; 2YUO A; 2KYM A; 4F16 A; 4AFS C; 1GFD A; 2KT8 A; 1K4U S; 2JS0 A; 1BB9 A; 1K0X A; 3VS5 A; 1W70 A; 4IIM A; 2RQW A; 1K9A A; 1FYN A; 2KNB B; 3VS6 A; 4RTV A; 3PE0 A; 2H8H A; 2IIM A; 5ECA A; 4CC7 A; 2FO0 A; 1JXO A; 3VS4 A; 2OI3 A; 4LNP A; 1UHF A; 3EG3 A; 1KFZ A; 2K79 A; 1H8K A; 2AZV A; 2K9G A; 1AWO A; 2DL7 A; 2HBW A; 3M0P A; 1RLP C; 4JJC A; 4X1V A; 5FW9 A; 2DVJ A; 2RMO A; 3NPF A; 1PKS A; 1I1J A; 1WFW A; 4IIO A; 2AZS A; 4JZ3 A; 2D8J A; 3UAT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3EGU A; 1PKT A; 2RI3 A; 3CQT A; 2L8D A; 1W2B P; 2KRN A; 1SF9 A; 2YDL A; 4GBQ A; 3HRU A; 3CME Q; 3HSB A; 4DBR A; 3VV0 A; 2DL8 A; 3M54 A; 1S72 A; 3EHQ A; 1WI7 A; 3FJP A; 5A0D A; 1UGQ B; 1MUZ A; 2X3X D; 4KGZ B; 3OYM A; 1HXD A; 1EX4 A; 3OYB A; 2QQ9 A; 4M7A G; 1PSE A; 4J8O A; 3MET A; 1QWE A; 3I9Q A; 4LN2 A; 1M1G A; 1V1C A; 4KGV B; 1AD5 A; 1KHC A; 1WQ7 A; 2QYZ A; 2DXU A; 4B6M A; 4A53 A; 2EGC A; 1VQO Q; 1Q82 C; 3CPW P; 2M0Y A; 3PIP A; 4LXC A; 1A0N B; 4M7D E; 1Q86 R; 1PCX A; 3LGF A; 3CCV T; 1AVZ C; 2DEQ A; 1JB0 E; 3VJP A; 4ELZ C; 2P0K A; 2P4T A; 3X26 B; 4Y28 E; 3QKJ A; 1WHM A; 4RKU E; 2VKN A; 2ZZD A; 1UGR B; 5HK0 A; 3RBB B; 3HKS A; 4ZTF A; 3R6O A; 1X2Q A; 3X24 B; 3C94 A; 1MMD A; 4M7D F; 1NJI U; 3M4Y A; 2OAU A; 5LJ3 h; 2P0Q A; 3CEY A; 2ZPI B; 5IHN A; 4J5Y A; 4DA4 A; 2LCS A; 2O88 A; 1AEY A; 2JUF A; 5CQY A; 4OML A; 1FMV A; 2EGA A; 3QG1 A; 1PC0 A; 4YTL A; 2QEX T; 2EGE A; 3L2R A; 4F7U B; 1GBQ A; 2RQT A; 1H3H A; 1I5O B; 2JW4 A; 2O31 A; 4N4H A; 1MMN A; 1WXT A; 3PT9 A; 1Y0M A; 1ZSG A; 1XTD A; 4FW1 A; 5IXB A; 1YN8 A; 4JDS A; 3EG9 B; 3UT1 A; 2RM4 A; 1GRI A; 5L8R E; 2ZGW A; 3QII A; 1GL5 A; 4EMH A; 2LVM A; 3JCM d; 4M75 B; 2JOY A; 5GAN 4; 2YHT A; 3F70 A; 1WYX A; 3VS1 A; 4M4Z A; 1MHN A; 2CSI A; 5FU6 B; 1OPK A; 2DL5 A; 4AFZ C; 2KE9 A; 2HQH A; 3CME T; 2L2P A; 3CCR A; 1X69 A; 3OSV A; 3JCM W; 1TWB A; 5GMK i; 3CC4 A; 2EKO A; 3GP8 A; 4C92 C; 4FT2 A; 1JQQ A; 3AT1 B; 1MNE A; 2RNA A; 3OQ5 A; 3V7C A; 2ED0 A; 3ZL7 C; 2NUT B; 4QKU A; 3UA7 A; 2HSP A; 4RG2 A; 4XTZ A; 1X75 C; 2ZAE A; 3VS3 A; 2BIV A; 2L3Q A; 1S72 Q; 2OTL Q; 1ABQ A; 2ZPH B; 4M77 E; 1BIA A; 3MJX A; 1W6X A; 4P5N A; 1UGP B; 4L5G A; 2X4X A; 2X51 A; 5CKD A; 3P8H A; 5LJ3 f; 1ZHI A; 2K5F A; 3PTA A; 1VQO T; 1U8R A; 3CCL T; 1BI2 A; 2JMC A; 4ATO A; 3JB9 F; 3CBM A; 2E6Z A; 4E6R A; 4PJO C; 1X01 A; 1AZE A; 3J81 E; 2E3I A; 3C4S A; 1N6A A; 2MI6 A; 3OMG A; 4C5I A; 5GAO l; 3D7S B; 4C0D B; 4RG8 A; 2JNG A; 1Q81 C; 4KUI A; 2LC4 A; 1GCP A; 4QW2 A; 2KBT A; 3REB B; 1PHT A; 2O9V A; 5DM7 R; 3CCM A; 1YNZ A; 4AG1 C; 2J6K A; 1QVF P; 1TUC A; 4E7J A; 1H64 1; 4J6W A; 3LH5 A; 3VYH B; 3S3M A; 3CD6 T; 3KXT A; 3S6W A; 2MOX A; 2HNI A; 2CH4 W; 3LGL A; 3C95 A; 2K5I A; 1QVG S; 1VQK T; 1D0X A; 3H0H A; 3CC2 Q; 4OB0 B; 4R56 A; 3FC3 A; 2KGT A; 1RAA B; 3EH1 A; 5KYY B; 3JCM c; 4M7D C; 3RES A; 3QJY A; 4OMF B; 2O4X A; 2LCC A; 2J06 A; 4HT9 A; 5LL6 S; 1B7T A; 1WHL A; 2XDP A; 1VQ7 Q; 2PVO B; 1W2B S; 3H6Z A; 3A98 A; 3CXC A; 4J9F A; 4PJN A; 2CZ6 B; 3QHS A; 2OX7 A; 1VYU A; 2LZ6 B; 2C06 A; 2FG0 A; 3MEA A; 3FLG A; 2QI2 A; 2ROT A; 3JB9 I; 1W1F A; 4OGE A; 1X2K A; 3OYH A; 1QKW A; 2HBP A; 4ORZ A; 2CZ0 B; 3SFM A; 3MEV A; 4RMO A; 3GNF B; 3EFS A; 1Q81 R; 2DTH A; 2QK0 A; 4XK8 E; 2DL4 A; 2PU9 B; 2K2V A; 3SWN C; 3FJ5 A; 5CR2 A; 3M9Q A; 3CC4 Q; 4RTY A; 2DZ9 A; 2OTL T; 2QA4 Q; 4BY6 B; 1VQP A; 2DM1 A; 1PD0 A; 4IUQ A; 1QWF A; 3CPW S; 2NWM A; 5CAI A; 4JJD A; 5IXF A; 1QQJ A; 2LP5 A; 2F2X A; 3RNJ A; 4C8Q D; 3THK A; 2CZ7 B; 2BE9 B; 5DLQ E; 3E9F A; 4JLG A; 2CKK A; 2V26 A; 4M7A E; 1UG1 A; 3TSW A; 1KJW A; 3TCJ A; 4DBQ A; 1FXX A; 4MZM A; 3ER0 A; 2VC8 A; 3OS0 A; 2DNU A; 2WSF E; 1I0C A; 2BZ8 A; 2EQI A; 5LJ3 e; 2A7Y A; 4IUR A; 2CGH A; 4ZN3 A; 4HVU A; 1IRE B; 2HMA A; 4D8D A; 2DPP B; 4PL6 A; 3U23 A; 4C92 A; 3OS1 A; 3G71 Q; 2DTI A; 1PRL C; 2SRC A; 2WAC A; 1UGS B; 1OEB A; 2E70 A; 5KE2 A; 3M0U A; 2RN8 A; 1UHC A; 1G3W A; 2HL5 C; 4DOW A; 5CCA A; 1ABO A; 4KT0 E; 1OI1 A; 3QWX X; 3CC2 T; 3DB4 A; 2EYW A; 3OYA A; 3OBY A; 5EC7 A; 1KQ1 A; 4BE0 A; 3VU3 C; 2VB6 A; 4DOV A; 1PSF A; 1YJN A; 1K4U S; 1MMA A; 2JS0 A; 4LD9 K; 1G3S A; 2NYS A; 3VS5 A; 2MAM A; 2PVG B; 4PJO A; 4BUG A; 3G4S Q; 1N27 A; 4IKF A; 1BI0 A; 5GMK m; 1VQ7 T; 1KC8 C; 1FYN A; 1K9A A; 4C0F A; 2QEX A; 2COW A; 1R0B G; 5CKB A; 3VS6 A; 4B9W A; 2HAX A; 2MK5 A; 1JXO A; 3EG3 A; 1KFZ A; 2K79 A; 2AZV A; 2K9G A; 1VQL Q; 2HBW A; 3LYI A; 1MND A; 4FIB A; 4HCB A; 4LDX A; 1I1J A; 2DIG A; 4LDV A; 3V8J A; 4IIO A; 5EG2 A; 2AZS A; 4JZ3 A; 4AMC A; 3G6E Q; 2XID A; 3HFN A; 3M56 A; 4HCZ A; 2LT4 A; 4L59 A; 2YRC A; 5GAN d; 3OYI A; 2DRK A; 3NTI A; 4J9E A; 1UUE A; 2GTO A; 2PNI A; 1E6H A; 2QDY B; 3QUI A; 4XU0 A; 2R5M A; 4CC2 A; 3NGP A; 3E19 A; 2QA4 T; 3M58 A; 3KUF A; 2CZ1 B; 2ZPE B; 3TEE A; 1NEG A; 4M7D A; 1VQ8 A; 1M2V B; 1V29 B; 3OBW A; 3EFR A; 3MCA B; 1CKA A; 4F7U E; 2DZC A; 1H92 A; 1YBY A; 2JM9 A; 2DL3 A; 3MP1 A; 8ATC B; 2F5T X; 1KG1 A; 4N4I A; 1M4Z A; 3T9N A; 2DX1 A; 1YJW A; 4M75 D; 1YJ9 A; 2JJ9 A; 4J6X A; 1QVF S; 1LPL A; 2GGR A; 2M02 A; 2GBQ A; 3OA6 A; 3QPH A; 4J83 A; 3VUZ A; 2CH4 A; 2EJG A; 1NPR A; 4F7U F; 2BZX A; 1TTH B; 2X4Y A; 4EMK A; 3RMQ A; 4Z89 A; 1JJ2 P; 3M0S A; 3JV3 A; 1VQ5 T; 1DJ7 B; 4MZP A; 3M0Q A; 5CK9 A; 2NUP B; 3WVD B; 1QCO A; 1KHI A; 2MMP A; 1WZO A; 1VQM A; 3SWN A; 1XQH A; 3EFO B; 3SEM A; 4TVR A; 4LE9 A; 1FMK A; 5HKC A; 1VQ4 Q; 1KD1 C; 2COZ A; 2MWP A; 2K3X A; 4KH0 B; 4M75 F; 3INZ A; 1YIJ A; 4M7A C; 1PM3 A; 2LT1 A; 4BD3 A; 2NUZ A; 3CD6 A; 4IUT A; 4AG2 C; 1M8M A; 2KDS A; 1VQN T; 4ZTJ A; 3HTR A; 1UJY A; 2XMF A; 2CP0 A; 3CCU A; 4QT7 A; 4CRI A; 2DJQ A; 2E64 A; 1VQK A; 4DQ2 A; 1NLO C; 2P84 A; 5GAN e; 1Q86 C; 1WGS A; 3N5B B; 3SHW A; 4E7S A; 4C8Q B; 4BI8 B; 3CXC P; 4MZT A; 3CCQ T; 2OJ2 A; 4J6Y A; 1K9M U; 2YRD A; 2HD0 A; 1VQL T; 1ZUU A; 4B9X A; 2M16 A; 1I07 A; 4OGC A; 3GOX A; 5LJ5 d; 3S3N A; 9ATC B; 2EQK A; 2FZC B; 4J9B A; 5GAM g; 3G6E T; 2WSE E; 1PWT A; 4M77 A; 1K8A U; 2F2W A; 2RH2 A; 2EYZ A; 2DYI A; 2FYK A; 5CVI A; 5HK3 A; 2QQB A; 3FDR A; 1LOJ A; 2O9S A; 3DLM A; 2I2L A; 3GPL A; 1TG0 A; 2L5Q A; 2JTF A; 1GCQ A; 1QCN A; 2OTJ A; 1BCM A; 3P8B B; 2ECZ A; 2E1H A; 4QQG A; 3RKY A; 2A36 A; 4C8Q G; 2CSQ A; 2LNH B; 2EIF A; 1UJ0 A; 1O75 A; 5KYU A; 3OYG A; 2EYY A; 1KD1 R; 2GF7 A; 3G7Z A; 3DB3 A; 1K0S A; 4ESR A; 2GNC A; 4JLI A; 3SDZ A; 1YHQ A; 4HCC A; 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