3IBUA

The crystal structure of the human carbonic anhydrase ii in complex with an aliphatic sulfamate inhibitor
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Carbonic anhydrase inhibitors. Comparison of aliphatic sulfamate/bis-sulfamate adducts with isozymes II and IX as a platform for designing tight-binding, more isoform-selective inhibitors
pubmed doi rcsb
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ibuA00
1G46A 3HS4A 3OYQA 4ZX1A 5E2MA 3MHLA 3MHOA 3UYQA 2ZNCA 4HBAA 4RUXA 1F2WA 3M5TA 4Q81A 5SZ6A 4QJPA 1JD0A 3S9TA 5J8ZA 4PYXA 5CA2A 5JQ0A 5L6KA 3U45X 5IPZA 4Q7WA 4HF3A 4LP6A 5FL5A 4WW8A 3V3HB 1G4JA 3R17B 4CQ0A 1CRMA 1CVCA 4QIYA 3V7XA 4Q9YA 5JGTB 3DVCA 1G3ZA 3CA2A 1CNJA 3MNAA 5DSOA 1KOQA 1DMXA 5BRVA 5FL4A 1TG9A 4K13A 3M2NA 3KLDB 4Z1EA 1TE3X 4Q6DA 5DOGA 4Q49A 3DVBA 4QTLA 5EZTX 1RZDA 3C7PA 4Q07A 3V3JA 4M2VA 1CVBA 1LG5A 1HUHA 2OSMA 1ZE8A 2X7SA 5E2NA 4L5WA 1MOOA 1BN3A 2NXRA 4DZ9A 2NWOA 4Q7PA 4R59A 3HKNA 2GEHA 4G7AA 5EOIA 4KUYA 2HNCA 4JS6A 3N2PA 4Q87A 3OKVA 4Q8XA 4MLTA 5DRSA 3Q31A 1CNHA 2FMZA 3MWOA 1FQLA 4M2WA 4Q7SA 4E4AA 4IWZA 1BICA 2QOAA 5FDIA 1CA3A 1JCZA 3GZ0A 2WD3A 3RZ5A 1BCDA 3S77B 2NNOA 3CYUA 2NNSA 5G01A 1BNQA 2CBEA 3T84A 3S72B 1HEDA 3RG3A 5E28A 3RZ1B 1CAOA 2NXTA 3MDZA 3MNKA 5G0CA 3DA2A 3IBLA 3W6IA 3BL0A 1KEQA 1LGDA 1RZAA 3OYSA 4E3HA 4Q06A 3BETA 4TWLA 7CA2A 3V3FA 5DSIA 3S73B 1CNYA 5G03A 3V2MA 3MNIA 1CVHA 5EKMA 4CNVA 4ILXA 1G48A 1UGDA 4Q8ZA 3S75B 4KNMA 5DSMA 1IF5A 1BV3A 1TEQX 1CNKA 3QYKA 4YX4A 5FNMA 3T82A 4PZHA 2ABEA 4Q78A 4MDGA 3RYVB 1G6VA 5DSNA 3M5EA 1CNGA 3RYJB 1CAJA 4KV0A 4M2RA 1BNVA 3K2FA 4G0CA 4QIZA 5FNIA 4FIKA 4Q8YA 4CA2A 5E2SA 1TBTX 5E2RA 1IF6A 1ZSCA 1FLJA 4QSBA 3MHCA 4QK1A 3JXGA 4Q90A 3K34A 1FR4A 2NN1A 1UGCA 2CBCA 3HLJA 4R5AA 1CNBA 4TWMA 5SZ0A 3F8EA 4Q0LA 5FLQA 1TTMA 4CNRA 4MLXA 1TB0X 3VBDA 4KP5A 3D9ZA 3EFIA 1BNWA 1OKLA 4Z1JA 1KWRA 3F4XA 3DC3A 3DVDA 4N16A 1AZMA 3PYKA 3FE4A 3HFPA 2W2JA 1H4NA 3M14A 1BZMA 3KKXA 1T9NA 4K0TA 3RYYA 4XIWA 5EH5A 3SBIA 5FNGA 3JXFA 2HL4A 4FVNA 4JSWA 4X5SA 4YGJA 2NWZA 1RZBA 1YDBA 2NXSA 12CAA 3PO6A 1I91A 4WUPA 5E5RA 2NNGA 3S74B 3T85A 1YDAA 4KNIA 5EHEA 1XPZA 3R16A 4CNXA 1KWQA 1CNIA 1I9NA 4KNJA 3NB5A 3F7BA 1HCAA 3DCSA 3IBIA 4LU3A 1CNWA 1RAYA 3DCCA 3KOIA 1H9QA 1I9PA 5FLSA 1UGEA 5C8IA 3P3HA 3SAPA 1CA2A 1Y7WA 3HKQA 5FLPA 1FQNA 3JXHC 2FOUA 4HEYA 3ML5A 4RN4A 1YO2A 1BNUA 2H4NA 2IT4A 4YVYA 5A6HA 3DD8A 3KOKA 1Z93A 4KNNA 4RIVA 2QO8A 2FNKA 4E3DA 1IF8A 3N4BA 5DOHA 3S78B 4YGLA 1CINA 3MHIA 4Z1KA 4ZWYA 1G53A 1CIMA 4YHAA 3P4VA 1G4OA 1FSRA 4YXUA 2FW4A 2WD2A 4QSJA 4BF6A 4E5QA 1A42A 1HECA 3ZNCA 5FLOA 3OIKA 5SZ1A 4IDRX 5JG5B 4RFDA 3RG4A 3RLDA 1IF7A 2X7TA 2O4ZA 3BL1A 4ZAOA 4FVOA 5EHWA 4E3FA 2NNVA 3T5UA 1XEGA 5G0BA 3DD0A 1TEUX 4RIUA 3IBUA 1I9OA 1OKNA 3FFPX 3S71B 3RYXB 5SZ5A 3P44A 1ZGFA 5E5UA 1JV0A 3RGEA 1Z9YA 3P5LA 3M67A 5JQTA 4Z0QA 1KOPA 4FL7A 4FU5A 2Q1QA 2NMXA 3CAJA 4KAPA 3B4FA 3OKUA 3DBUA 1G52A 2EU2A 1CANA 5BYIA 1CAZA 3ZP9A 4Z1NA 3S8XA 5FDCA 5SZ4A 1AVNA 3M1KA 3M1QA 3MNJA 5JG3B 1G54A 3MYQA 5DSKA 9CA2A 4Q08A 1CAMA 5AMGA 4QJOA 1J9WA 5FNJA 3M04A 4HU1A 3D92A 5JGSB 2HD6A 3HKUA 3KNEA 3IBNA 1CRAA 3T5ZA 3M3XA 1CVDA 1CVFA 4YXOA 2FOSA 3SAXA 1TH9A 3KWAA 4ZWIA 5BNLA 2CBDA 3KS3A 2AW1A 2NN7A 3K7KA 3MZCA 4XZ5A 5DSPA 3DC9A 1V9EA 5JEGB 4QJXA 1ZSBA 3D8WA 2FOYA 1BNMA 1ZFKA 1G1DA 5L3OA 3RZ7A 2H15A 4RFCA 4HT0A 2FNNA 2OSFA 2WEGA 4ZWZA 1LZVA 1THKA 5FNHA 3MMFA 3EFTA 5DSRA 4WW6A 4Q09A 4HEWA 4QSIA 2FOVA 3M2XA 4BCWA 1CCTA 4E9OX 2Q38A 5AMLA 5EHVA 3M2YA 4WR7A 1CAKA 1BN1A 4QJWA 4MDLA 5FNKA 1RJ6A 5CLUA 5DSJA 2NWYA 1HEBA 2CBBA 2GD8A 3NJ9A 1G0FA 3MHMA 3TVNX 4L5VA 3ML2A 5DSQA 5BRWA 1HEAA 3U7CA 6CA2A 3M96A 4RH2A 5CACA 1CNXA 1TG3A 3P3JA 4FPTA 4ZWXA 4LHIA 3MNHA 4MDMA 1EOUA 1UGGA 5A25A 4C3TA 1ZH9A 3IAIA 1DCAA 1I9LA 4Q7VA 3N3JA 1XQ0A 4HEZA 3M1JA 3OILA 4QEFA 1BNNA 2HFWA 3F7UA 3V2JA 2POUA 5JESB 4CACA 3SBHA 1RAZA 5JEHB 2WEOA 5E2KA 2VVBX 3S97A 3T83A 1YO0A 1H9NA 3V3IB 4K1QA 2VVAX 3P58A 3CZVA 5DSLA 3N0NA 3DV7A 1I90A 4PQ7A 2QP6A 4JSSA 2FOQA 1OKMA 4YWPA 4XE1A 4FRCA 4JSAA 1IF9A 4XIXA 1YDCA 4QK2A 1DCBA 3RZ8A 1CAYA 3TVOX 5BRUA 4CNWA 1XEVA 3UYNA 5AMDA 1YDDA 1ZGEA 3M40A 4Q99A 3PJJA 5FLRA 4E49A 3DAZA 2CABA 4KUWA 1CVAA 1UGAA 2F14A 2CBAA 1BNTA 4M2UA 3RYZA 3U3AX 1AM6A 4Q83A 2FNMA 3P5AA 5HPJA 3B1BA 2NWPA 4QY3A 4QJMA 8CA2A 3U47A 1HVAA 1ZSAA 3HKTA 3M98A 4UOVA 4K0ZA 1I8ZA 5SZ3A 5EH7A 3V3GB 1FQRA 1CAIA 4RUYA 5DVXA 4MTYA 4YGKA 1CZMA 3RZ0B 3M1WA 3OIMA 5JEPB 4Y0JA 1CALA 3LXEA 4DZ7A 1I9QA 4PYYA 1CVEA 5EKJA 3V5GA 3M5SA 4Q6EA 3IEOA 4ITOA 5FL6A 1LG6A 1V9IC 4L5UA 4RUZA 2HKKA 4YXIA 4ETQC 4QSAA 4ITPA 4COQA 5FNLA 2EU3A 1MUAA 1YO1A 1Z97A 4N0XB 5EIJA 4YGFA 3W6HA 4YYTA 2Q1BA 4HT2A 3S76A 5FLTA 1DMYA 5SZ7A 1CNCA 3OY0A 2WEHA 4QK3A 4WL4A 4BF1A 4YGNA 3D0NA 3L14A 1CILA 4KUVA 2HOCA 1G0EA 2ILIA 5EKHA 3DCWA 1CCSA 5SZ2A 1OQ5A 2POWA 4E3GA 1ZNCA 1UGFA 1IF4A 2EZ7A 1CCUA 4K0SA 1FR7A 5LMDA 4XFWA 1I9MA 3D93A 1HCBA 2FMGA 1LUGA 4WUQA 2WEJA 4KP8A 3P55A 2X7UA 1FQMA 1RJ5A 1RZCA 1UGBA 1RZEA 4GL1X 3IGPA 3FW3A 2CA2A 3KIGA 1BN4A 4MO8A 1FSQA 4JSZA 4QJ0A 5JDVB 1HUGA 3M2ZA 5EH8A 4ZX0A 3RJ7A 2POVA 3NI5A 1G45A 1URTA 1FSNA 3MNUA 4R5BA 3KONA 4PXXA 1CAHA 2AX2A 3TMJA 5CJFA 1ZFQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1G46 A;  3HS4 A;  3OYQ A;  4ZX1 A;  5E2M A;  3MHL A;  3MHO A;  3UYQ A;  2ZNC A;  4HBA A;  4RUX A;  1F2W A;  3M5T A;  4Q81 A;  5SZ6 A;  4QJP A;  1JD0 A;  3S9T A;  5J8Z A;  4PYX A;  5CA2 A;  5JQ0 A;  5L6K A;  3U45 X;  5IPZ A;  4Q7W A;  4HF3 A;  4LP6 A;  5FL5 A;  4WW8 A;  3V3H B;  1G4J A;  3R17 B;  4CQ0 A;  1CRM A;  1CVC A;  4QIY A;  3V7X A;  4Q9Y A;  5JGT B;  3DVC A;  1G3Z A;  3CA2 A;  1CNJ A;  3MNA A;  5DSO A;  1KOQ A;  1DMX A;  5BRV A;  5FL4 A;  1TG9 A;  4K13 A;  3M2N A;  3KLD B;  4Z1E A;  1TE3 X;  4Q6D A;  5DOG A;  4Q49 A;  3DVB A;  4QTL A;  5EZT X;  1RZD A;  3C7P A;  4Q07 A;  3V3J A;  4M2V A;  1CVB A;  1LG5 A;  1HUH A;  2OSM A;  1ZE8 A;  2X7S A;  5E2N A;  4L5W A;  1MOO A;  1BN3 A;  2NXR A;  4DZ9 A;  2NWO A;  4Q7P A;  4R59 A;  3HKN A;  2GEH A;  4G7A A;  5EOI A;  4KUY A;  2HNC A;  4JS6 A;  3N2P A;  4Q87 A;  3OKV A;  4Q8X A;  4MLT A;  5DRS A;  3Q31 A;  1CNH A;  2FMZ A;  3MWO A;  1FQL A;  4M2W A;  4Q7S A;  4E4A A;  4IWZ A;  1BIC A;  2QOA A;  5FDI A;  1CA3 A;  1JCZ A;  3GZ0 A;  2WD3 A;  3RZ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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