3ID8A

Ternary complex of human pancreatic glucokinase crystallized with activator, glucose and amp-pnp
Total Genus 169
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
169
sequence length
453
structure length
450
Chain Sequence
NLYFQGMKKEKVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title The active conformation of human glucokinase is not altered by allosteric activators
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 169
structure length 450
sequence length 453
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-07-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3id8A02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3id8A01
3WQTA 2A5XA 5FPDA 5E84A 3ENHA 1K8KB 2ZGYA 1NWKA 2P9PB 1WUAA 3MN5A 5EOYA 3ZEUB 4MLEA 2IIRA 3O1BA 1RFQA 2D0PA 2D0OA 2J4RA 3FE1A 3IDHA 2UYTA 4DCHA 1T44A 1NGGA 1GLEG 2FSJA 4YDUA 2P9LA 4IJNA 5AZIA 1R59O 5LJWA 3WXKA 5KPTA 4PKIA 5I9EB 3DXMA 3G25A 4WQ4C 3U9ZA 2W40A 5AQRA 1HKBA 3EN9A 3QDKA 1WOQA 3P4IA 5LY3A 2HOEA 4IWVA 1GLCG 3L4IA 2Q0RA 4RTFD 1QQNA 5ADXH 4FPAA 4IZ9A 3ATUA 4L3QA 3CETA 4I6MB 4JHDB 4JD2A 5AQXA 3LDPA 3D7EO 1QQOA 3DXKA 4FWKA 3A0IX 2P9KA 3C7NA 1NGFA 4CZEA 1NGHA 4FWLA 1DKGD 4B9QA 3LDLA 3UKUA 2FXUA 3WXJA 5F1XA 1ATNA 3SMPA 3CJ9A 4FOEA 3A5MC 1YAGA 3BF1A 1SZ2A 4QS9A 3O80A 3QMLA 2QXLA 4BRKA 5AQNA 5BRHA 3CJAA 3HZ6A 1K8KA 5EXWA 1EQYA 2P9PA 1SAZA 4CJ7A 5KQ8A 3ZEUA 4H5NA 2I7NA 1X9JA 4YDUC 4JNEA 4EAHD 1XQSC 2EWSA 4H0YB 1V4TA 4J8FA 3L6QA 3EKUA 2F9WA 1DGKN 3HTVA 3KHYA 3R6MA 3VERA 4MO4A 4CD1A 1ESVA 5BN9A 3H3OB 2Q0UA 4FWQA 1V4SA 5E26A 1KAZA 2WUSA 2P9NB 2YJFA 3QFPA 4B1UB 3MN9A 3EO3A 3O5BA 4WQ5A 1XUPO 4EHUA 2VWBA 1Y64A 3VEVA 3HBTA 3U9DA 4I6MA 4JHDA 4QS8A 3WEEB 2QWRA 4IO8A 3UKRB 4CZFA 3DWLA 1S3XA 1NGAA 1QQMA 3AAQA 3H1QA 3H6EA 2P9SB 4BRIA 1U6ZA 1SQKA 1ZBSA 3CJ7A 2V51B 4CZKA 2D4WA 2CGLA 4Y0WA 4BRCA 1HJOA 2QWQA 4NB4A 3LDNA 4BRPA 2QWOA 4CZIA 1QHAA 5F2RA 1J6ZA 4XEIA 4BG9A 1TYQB 2YHXA 4CZMA 1ATRA 1NGBA 2ITMA 5AQGA 4A2AA 1GLJO 3SK3A 2W41A 4XH1A 4BGAA 1NLVA 4A61A 2NRHA 2GWKA 2P9IB 4LC9B 5JICA 2KHOA 4FWNA 4BRDA 3GDQA 1C0FA 3MCPA 4WQ5C 2ASPA 4CZHA 3TPQA 3CIPA 3S41A 5ADXA 1NGJA 5AQSA 2P9UB 1IJJA 3M3ZA 5AQOA 4O5FA 3JXUA 3M6GA 4BR7A 4BVPA 3UKRA 4BRMA 4BR2A 3FZLA 2FSKA 5BR9A 5ELZA 2P9SA 2ZF5O 3HSCA 4MLHA 1ZXOA 1BWFO 1BG3A 3IMXA 3R9PA 3H46O 3H1VX 5BPMA 1BA1A 2E88A 2CGJA 2QWPA 1X3NA 2DPNA 4BVOA 1P8ZA 4DB3A 2E1YA 5EY4A 2E1ZA 3SJHA 5AQIA 1KXPA 4DQ8A 4H03B 1KAYA 4FPBA 1TYQA 3VF6A 2E2NA 5BRDA 1Z6RA 2D1KA 1YXQA 3D2FB 1Q18A 4K42A 5BRFA 5BN8A 2YCHA 2A6AA 3QBWA 3D2EB 3RSEB 3VEOA 2QWMA 1XC3A 4EIAA 1GLFO 3EL2A 3BEXA 3VF4A 3ZETB 3GOIA 1BA0A 2YHWA 4H0OA 3F9MA 3W3DA 3I8BA 3FFKB 4M7YA 4BRHA 1Z05A 1JCGA 2QW9A 3WT0A 5EVZA 5CE3A 3FZFA 4PKHA 3C0BA 2P9UA 4B1VA 4A62A 4IXCA 4FWMA 3WUHA 4BC5A 3VESA 4BR5A 1MDUB 5JLHA 3VEXA 2IVOA 1NGDA 2E2PA 4BR4A 3CJCA 2F9TA 1BU6O 3DAWA 2FF6A 3FGUA 4CI6A 4FWRA 4XH4A 3WQUA 4H0XB 4BC4A 1HLUA 2CH6A 4EHTA 3FZMA 4FWSA 3QB0A 3ULEB 2GEMA 2HF4A 3FR0A 4IJAA 2FSNA 3VGMA 2A40A 5BREA 1HUXA 2AA4A 3CJ1A 3DJCA 4CBXA 1MWKA 3SLCA 4DHYA 4EFHA 5F0XA 4GY2B 4HWIA 4A2BA 3A8YA 5AQPA 3ZX3A 3CQYA 5AZJB 3VF2A 2IVNA 3GBTA 5AQWA 3RSEA 3D2EA 2HF3A 3FZHA 3EZWA 1NGIA 5AZIB 3H3NO 1NM1A 2A41A 2E2QA 1JCEA 3O8MA 3VEZA 3AAPA 4Z94A 3ZX2A 2GWJA 2NZTA 4FOIA 2IVPA 3VPZA 2Q97A 3WXIA 5AQZA 3QICA 3QFUA 3W0LA 4JAXA 3OHRA 2CH5A 4AM7A 1BO5O 2PBDA 4WYBA 2QM1A 2ASOA 3B8AX 4CZJA 4HTLA 3WXLA 2YI1A 5KQDA 2ZGZA 3CHWA 2BTFA 2YJEA 3VGKA 5EX5A 4H0PA 4ISFA 3VETA 3ZX0A 4BREA 2P9NA 5AQHA 5KPZA 4B1ZA 2VYPA 3UE5A 3LM9A 3I33A 1H1VA 4H0TB 1TUYA 3H45C 4BQLA 1TUUA 3ULEA 5AFUA 3WEEA 2VCPA 3M1FA 4MO5A 3MN7A 4CBWA 1MWMA 4JN4A 2GELA 3ID8A 5BPLA 1U2VB 3MN6A 3A5LC 1HKCA 1CZAN 2OANA 3O6WA 2A42A 4F9OA 5AZJA 2YHYA 5AQKA 5AQYA 4BQZA 4H5VA 5AQJA 1QZ6A 2Q31A 5AFUH 3LL3A 1GLAG 5AQMA 4CD3A 2A3ZA 1NGEA 5JLFA 4BRLA 2V52B 5LJVA 3LDOA 4PKGA 3ENOA 3O08A 1YUWA 3CQXA 3UB5A 4K25A 4BC2A 4FL9A 3SMSA 2QWNA 3GG4A 4O8KA 2QWLA 3A5OC 2P9IA 4BRNA 5AQTA 3CI5A 3IFRA 1BOTO 4RCHA 1X3MA 4BGBA 1HX1A 2GTDA 5AQQA 3L0QA 2Q1NA 2BUPA 5FPMA 4BRGA 3JS6A 1RGIA 3VOVA 3BP8A 2PAVA 3TU5A 1LCUA 1HPMA 4KBOA 2E8AA 1BUPA 4H0VB 5B8HA 1GLBG 1LOTB 3HM8A 4BRAA 1KAXA 3O4WA 2Q2RA 2H3GX 3HI0A 3MK6A 4RWTA 3VEYA 4K41A 4BROA 4BG8A 1E4FT 1OKJA 1U2VA 3A5NC 2Q36A 4GNIA 2E20A 3AARA 4E1JA 5KPRA 4B1YB 3GE1A 5FPNA 1YVNA 1RDWX 1BDGA 3KVGA 4BR9A 4CZLA 1NBWA 3AY9A 2CGKA 3FZKA 1NMDA 2HMPA 1NGCA 4CBUA 1G99A 3CERA 3FLCO 3R8EA 2FLOA 5AQVA 1MA9B 3ATVA 3MMVA 2I7PA 4ISGA 4PL8A 3MDQA 3D2FA 3O1WA 1T6CA 3U4LA 2ASMA 5FPEA 2P9LB 2GUPA 4H5RA 3LDQA 5AQLA 3DXMB 2E2OA 3VENA 5TKYA 3ZETA 4BRFA 3J8AA 1D4XA 4AM6A 4FO0A 4M7XA 4PL7A 1T6DA 4WQ4A 4NO7A 3LM2A 2V7ZA 4H5WA 1E4GT 4BRQA 3EKSA 4B1XB 2AP1A 3QBXA 1IG8A 3CJBA 3IUCA 3BUZB 3VEWA 1JCFA 4CZGA 1DEJA 1GLLO 5AR0A 5AQFA 5BPNA 2NLXA 2V7YA 3U8XA 4H5TA 3GL1A 4JD2B 4FWPA 1ATSA 1GLDG 4BC3A 3DXKB 1QZ5A 2P9KB 3C7NB 1ZC6A 4M63C 4B1WB 4XH5A 1S22A 4ISEA 3UKUB 4FSVA 4BR0A 4C23A 1C0GA 4QS7A 3BF3A 3KZBA 4FWOA 5JMVA 2FF3B 5AQUA 2ZWHA 4K43A 1HKGA 3VGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3N4PA 2A5XA 3VQBA 4YNQA 1XI1A 3ZSQA 2Y1JA 4KTZA 5EOYA 5C0YA 3OYJA 4CJVA 1RFQA 3J80O 4W5TA 1SV5A 3EE9A 3ISNC 4B08A 3LPUA 3AA2A 2P5OA 4FJ8A 2FSJA 2P9LA 5AZIA 3NH0A 2E5LK 4HCCA 4FK4A 3AO1A 4KH4A 4CF8A 1HKBA 3O9SA 3P4IA 5LY3A 4B9UA 1BIZA 1T03A 1RDCA 2ATQA 2ZJRL 3J81O 4B3TK 1HYZA 3OBWA 5M1QA 4L3QA 3CETA 3NF9A 4KHSA 4JHDB 4ICLA 3MEGA 4KREA 3T3FA 4DSJA 5AQXA 4ILGB 3LP1A 3MEDA 1U45A 1ZBFA 2HNZA 3DOLA 3KLGA 5HP1A 4DTOA 3QNNA 3U3YA 3O9QA 4B9SA 3LDLA 3M8QA 3WXJA 3P1GA 3SMPA 3WNEA 1YAGA 1W0HA 3O80A 3ZSRA 4I2PA 5AQNA 5BRHA 1KRPA 1JLFA 1LWEA 4DSKA 1K8KA 4CGFA 1EQYA 3THXB 1RDBA 2P9PA 5KQ8A 3DRSA 3ZEUA 4FXDA 4BE0A 2Z1GA 2R7YA 2HHQA 5GAHP 3OTOK 1DGKN 3R6MA 2GBZA 4B9NA 4CD1A 3H3OB 3LAKA 4YHHK 3JAMO 3KKRA 5E26A 2WUSA 1IG9A 2P9NB 2O8EA 1A5WA 3MN9A 1S5JA 2QTDA 2VWKA 4DMNA 3DLRA 1XUPO 2VWBA 3TAMA 4QOZB 5DMRA 4I6MA 3D6RA 4DSLA 3DMJA 4KH5A 3K9JA 2UUAK 3AAQA 3L8BA 1RDAA 4CFDA 1Q82O 3BDPA 3HT3A 1VQ5N 1NK9A 2VQFK 2RE2A 4B9TA 1O1WA 2QWOA 3PSIA 3CCMN 1O13A 1QHTA 4BG9A 4CGJA 4OPKA 4A2AA 4CGGA 1GLJO 5M1NA 3V9WA 4LD0A 3NF6A 5HRSA 2KHOA 4FWNA 2PFUA 3MCPA 4CZHA 4GMJB 5ADXA 3VQ7A 4PUOA 1NK5A 4GKKK 1VQ4N 3EY1A 2NRRA 4M3WA 4F3TA 4CJEA 3SUQA 4O5FA 4HUEA 3UKRA 4CJFA 2YNHA 3P39A 3LWLA 3JSMA 5E41A 4FVMA 4A57A 3L2RA 3ID6A 2LSNA 2Q3SA 5C25A 1EO1A 1CLQA 1QSSA 5T7BA 1BA1A 5C15A 4CHNA 2DPNA 4BVOA 4GKJK 2ZE2A 1VQON 5AQIA 2YKMA 4HCBA 3I8DA 1N32K 4C8LA 2BH1A 4DQ8A 4H03B 4B8CA 1KAYA 2VG5A 1TYQA 3VF6A 3SQ2A 3AO4A 4DR2K 3PV8A 1J5EK 4LY7A 4K42A 5BN8A 2G8IA 1JLGA 3LALA 2QWMA 1XC3A 4DR7K 1T3VA 5TKWA 1RDDA 3EL2A 3BEXA 4DV0K 2GUIA 3DLBA 5CYMA 4DQQA 3GOIA 3K58A 3V9ZA 3W3DA 1FK9A 4BRHA 1Z05A 3WT0A 4WFNL 3FZFA 4ILJA 1WSFA 1IKWA 1GOBA 4E89A 1VSDA 2GX9A 4A62A 4FWMA 3HPGA 4BC5A 3L3VA 5HRPA 4FW2A 3VESA 3OA9A 4OX9K 3VEXA 1NGDA 2E2PA 4B8AB 3CCQN 3CJCA 4DLGA 1BU6O 4CI6A 2FF6A 5CZ1A 3HYFA 2P51A 4PY5A 5HOOA 3QB0A 1C0UA 3FR0A 4IJAA 3V9SA 1VSEA 3NE6A 2A40A 1HUXA 3ZT3A 3NVMA 3WXMB 4M41A 1OH7A 3L2UA 4JK9A 3SV3A 5C24A 4J2DA 1OVYA 4WCEL 5AZJB 4X64K 5M1FA 3GBTA 3CXCM 3HOSA 4ZTJA 3FZHA 4CCHA 1D8YA 4JKAA 3OJUA 2E2QA 4CHOA 4RW6A 4RW8A 1S1VA 3ZX2A 3DLHA 3NAEA 2D5RA 4JAXA 3OHRA 5D3GA 3NFAA 3KLEA 3TAEA 1D9DA 1XHZA 1Q9YA 1WAJA 4CZJA 4HTLA 1HR0K 2ZGZA 3CHWA 4YOTA 1TK0A 2YJEA 4IG0A 3ZX0A 3VETA 3T1YK 3CMAN 4FCYA 2HNDA 4C8MA 4YFUA 5AQHA 1UA1A 1ASWA 4KO0A 4HTUA 3HP6A 3RR8A 3VQ6A 4FM1A 4YORA 4H0TB 4DUZK 3F9KA 3H45C 3ULEA 5FRNA 4K8XA 4E1MA 3M1FA 1Z25A 4DU1A 1N8RO 1C6VA 1U2VB 3MN6A 1HKCA 3O6WA 2HBKA 4AF1A 1FW6A 1HRHA 2YHYA 4TSXA 3PIOL 3OS1A 3C6UA 4KHNA 3SJJA 1VQLN 1T8EA 5C2DA 1QVGM 2FBYA 2HVIA 1GLAG 2A3ZA 1NGEA 1N36K 5JLFA 4JKGA 4PKGA 3CQXA 3EYZA 3UB5A 4K25A 2XHBA 3CPWM 1NK7A 4IOAL 2KFZA 1SKRA 2UXDK 2NRWA 1DTTA 5AQTA 4BGBA 1Y97A 4QAGA 2Q1NA 3MXJA 4R5PA 3OYCA 5FPMA 1ZBUA 3M8PA 1GOCA 1JLAA 3HOTA 4DLEA 4BWMA 1SKSA 4KBOA 2O8BA 1W7AA 3QEVA 1JKHA 5B8HA 4E19A 1KAXA 3DLGA 2H3GX 3THWA 1QTMA 3P5JA 1VSKA 4V19S 1NOYA 1LW2A 1IKVA 3CD6N 2Q36A 3VQ8A 5CR4A 3UIQA 3VTHA 4B1YB 3GE1A 2B6AA 3SQ0A 1BDGA 2G8VA 3O4QA 4JI8K 5C10A 1VAZA 4LH5A 2O4IA 4YOXA 1NMDA 1NGCA 1DTQA 1NJIO 4PL8A 3MDQA 4Y1CA 2ASMA 5FPEA 5KRTA 4FZYA 1BCOA 5C12A 3AGKA 1YTAA 1NG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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