3IEOA

The coumarin-binding site in carbonic anhydrase: the antiepileptic lacosamide as an example
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title The coumarin-binding site in carbonic anhydrase accommodates structurally diverse inhibitors: the antiepileptic lacosamide as an example and lead molecule for novel classes of carbonic anhydrase inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-07-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3ieoA00
5G01A 3M2NA 1A42A 5DSMA 2FW4A 1DMXA 2CBCA 2GEHA 4N16A 1G0FA 4QTLA 1XQ0A 4Q07A 5AMDA 1Z93A 1CALA 5EHWA 3DD8A 1H4NA 5FNMA 1AZMA 1TG3A 1Z97A 1ZGFA 3F8EA 5JESB 4MDGA 4HU1A 4E3DA 5BRUA 1THKA 4COQA 1TG9A 5DRSA 4YGLA 3N3JA 5DSOA 2FMGA 3W6HA 4Q87A 4BF6A 1I9NA 5FNIA 4Q7SA 4FVOA 1IF9A 4QY3A 3BETA 2IT4A 3JXHC 4M2UA 1LUGA 4QK1A 3RYXB 1BNMA 4FRCA 1BICA 1CNHA 4ZWIA 2NWOA 2WEOA 4HEWA 1DCBA 1KOQA 4XIWA 1IF7A 4ZAOA 3IEOA 3MYQA 3S74B 1OKLA 3V3HB 4E9OX 5EH5A 4WR7A 3EFIA 2HNCA 4ZX1A 4Q8ZA 4TWMA 4WW6A 5DSPA 1CAZA 4YHAA 1HCAA 1FR7A 1Y7WA 2CABA 4RN4A 4KNNA 4RUXA 4ZX0A 4YX4A 1LG5A 1UGGA 2F14A 1RAZA 3OYQA 4Q7VA 4WUQA 3CAJA 1IF6A 3JXGA 3SAXA 5BRWA 4IWZA 3MNKA 2AW1A 2FOQA 5JGSB 4RIVA 4DZ7A 4HEZA 1ZGEA 4Z1KA 1OKMA 3DCCA 1G1DA 1CAOA 2Q1BA 3MHLA 5SZ4A 5SZ7A 1I9OA 2NN7A 3MNIA 4E3HA 3T5UA 2HL4A 4PZHA 3PYKA 1CNYA 3S75B 3CA2A 2HFWA 4ITPA 3HFPA 3R17B 3RJ7A 1HEAA 1TE3X 5CLUA 3UYQA 1I9PA 1YDCA 2NWPA 1F2WA 4Q81A 4QK2A 5J8ZA 2VVBX 4RUYA 3RGEA 4JSZA 1T9NA 3CZVA 4Q8YA 4QJOA 1MOOA 5JDVB 5E2KA 1ZH9A 1KEQA 1JD0A 3MNAA 5CA2A 1BNQA 3MHMA 3DC9A 3U47A 1CVFA 3LXEA 5SZ0A 2CA2A 1CCSA 1V9EA 4K1QA 4K13A 4QIYA 1HCBA 5SZ5A 1AM6A 3K7KA 4RH2A 1KWRA 2NXSA 4QSBA 3RG3A 4FU5A 5FNJA 3T84A 5BYIA 2CBEA 1BN3A 2Q38A 3MNHA 2OSFA 3OIMA 4M2RA 3ZP9A 5JG5B 3V7XA 3S8XA 5HPJA 1HUGA 1G53A 5EKMA 3BL0A 5E2SA 1CAKA 1CNGA 1CILA 1JV0A 2NWZA 2HKKA 3IBIA 4QSJA 2NNSA 4K0SA 1G45A 4CNVA 3N0NA 3PJJA 2HD6A 3MWOA 3DD0A 4E4AA 1CVDA 4Q06A 3M5EA 1URTA 1I90A 5FLQA 1FQRA 4K0ZA 3N4BA 1CAIA 3NJ9A 1H9QA 1YO1A 3DC3A 4CNRA 6CA2A 3K2FA 5G0CA 2POVA 2WD2A 1UGCA 1FLJA 2NMXA 5DSRA 1CNBA 3HKNA 1TEQX 5SZ1A 3S71B 3S77B 3V2JA 1IF4A 3S76A 4KUWA 1BZMA 3M5SA 2HOCA 1UGAA 3P3HA 4KUVA 1BNNA 3KLDB 4YGKA 4L5UA 1DMYA 5BNLA 5BRVA 3P3JA 4RUZA 3T83A 3D92A 4ZWYA 5E5UA 1HEBA 5AMLA 3B1BA 1LZVA 3N2PA 4KP5A 4PYYA 4MO8A 3M5TA 1CAHA 1UGBA 1ZSCA 2QO8A 3IBNA 4QSAA 3OILA 3KS3A 4KNJA 2NXTA 1KWQA 3NB5A 3RZ8A 3ZNCA 4Y0JA 3SBIA 4C3TA 3P58A 5E5RA 3OYSA 3M14A 3HLJA 1RJ5A 4KAPA 3VBDA 1FQLA 1CAJA 1LGDA 4KP8A 5EHEA 4DZ9A 3P4VA 12CAA 3Q31A 4HBAA 5CJFA 3ML2A 4PYXA 3UYNA 4ZWZA 4Q0LA 2X7SA 1MUAA 4MDLA 3V3JA 3KIGA 3M2XA 4XZ5A 4XFWA 3IBUA 1CNXA 4G0CA 5EKJA 3OIKA 3M1JA 1FR4A 4QJMA 4Q49A 1HEDA 4E3GA 3DAZA 4Z1EA 3S73B 3SBHA 4QJPA 3M98A 1I91A 3TMJA 1CZMA 1G48A 4QIZA 4Q90A 3GZ0A 4ETQC 5DOGA 3FE4A 4YGFA 4Q9YA 3MNJA 1HECA 4RFDA 2POWA 1V9IC 1YO2A 5E2MA 3V3GB 2EU2A 1CNKA 2NNVA 3OKUA 4QK3A 3U7CA 3KOKA 1G0EA 1RZBA 3D93A 4Q09A 4WL4A 5FL4A 4MTYA 2NWYA 1XEVA 4HEYA 3M1KA 5JEPB 1XEGA 1I9QA 1YO0A 2ZNCA 4YXOA 1ZE8A 1CVHA 2FOVA 3M2ZA 5FLPA 2QP6A 4YXUA 3U45X 3DA2A 2Q1QA 7CA2A 5FNHA 3T85A 4Q6EA 2WEGA 5DSIA 1ZNCA 4HT2A 1OQ5A 3B4FA 5FLSA 1RAYA 4ZWXA 3RYJB 5SZ2A 5FL6A 1LG6A 1CRAA 2NN1A 1CANA 4Q99A 5G03A 1UGFA 5FNGA 3MHCA 5FLTA 1EOUA 3HKQA 3RZ0B 2ILIA 3IBLA 4Q83A 1ZFKA 2FNNA 3DVBA 5EH7A 4R5AA 3PO6A 4Z1NA 4L5VA 3D9ZA 3M67A 3KWAA 4M2WA 3HKTA 4IDRX 3D0NA 2WEJA 1ZSBA 3F7UA 3RZ7A 2X7UA 5A6HA 4PQ7A 3ML5A 4ITOA 4KV0A 5FDCA 2O4ZA 1ZSAA 3FW3A 3DCWA 3DVDA 3TVNX 4N0XB 1BN1A 3V3IB 3HKUA 1BNTA 3M2YA 4YWPA 1G46A 3M96A 1TTMA 3W6IA 4CA2A 3MZCA 4Q78A 4QJXA 4E49A 5C8IA 4MLXA 5CACA 1BNUA 3U3AX 2WEHA 1UGDA 3HS4A 4UOVA 5JQ0A 5FLRA 1CVEA 1CVBA 1I9MA 3RZ1B 4ILXA 1BN4A 5E2RA 1RZDA 1CVAA 3M40A 1CNJA 4Q08A 4WUPA 1Z9YA 2NNOA 4XE1A 1G3ZA 3MDZA 1FSNA 1TH9A 4PXXA 5A25A 1TBTX 1FQNA 1CVCA 4WW8A 2VVAX 3V3FA 4QJWA 4Q6DA 1UGEA 3MHIA 3OY0A 1OKNA 5DSNA 4LU3A 1XPZA 2FOUA 5JG3B 3P44A 4YGJA 5G0BA 3RYZA 3R16A 1AVNA 2OSMA 3RYVB 1TB0X 5SZ6A 4Q7WA 3T5ZA 4YVYA 4TWLA 3P5LA 4R5BA 3DVCA 3S97A 2GD8A 2FOSA 4E5QA 4Z0QA 2CBDA 4KNIA 5L3OA 4BCWA 5DSJA 1CCTA 1I9LA 4JSAA 2FNMA 5JGTB 1BV3A 4K0TA 2H15A 3DCSA 3MHOA 1FSRA 3KKXA 4QEFA 4MDMA 1H9NA 4M2VA 4CNXA 3M04A 5AMGA 1RJ6A 4E3FA 3DBUA 3F4XA 1FSQA 4LHIA 2QOAA 5JEHB 1RZAA 1G4OA 3S9TA 4KNMA 1CA2A 5E2NA 5DOHA 3S78B 3QYKA 2FOYA 5EIJA 2H4NA 1CRMA 4RFCA 4RIUA 1G6VA 1YDDA 1CA3A 3RZ5A 2FMZA 9CA2A 3M1WA 5LMDA 1FQMA 5SZ3A 4KUYA 3MMFA 4Q8XA 4Z1JA 4QJ0A 3S72B 5FDIA 3V2MA 1CAMA 3M3XA 4GL1X 4X5SA 3P5AA 5DSKA 4BF1A 5EH8A 1J9WA 3M1QA 3RG4A 3JXFA 2NNGA 4XIXA 2EZ7A 4HF3A 4L5WA 4FIKA 1BNVA 4HT0A 3KOIA 8CA2A 1HVAA 3IGPA 1YDBA 4JSWA 4R59A 1IF5A 5EOIA 4FPTA 3CYUA 5L6KA 3P55A 5FNKA 1TEUX 3K34A 4YXIA 5E28A 1CCUA 3RLDA 1G52A 3MNUA 2FNKA 1BCDA 4QSIA 5EHVA 1I8ZA 3DV7A 4CACA 3FFPX 5DSQA 4MLTA 1CNWA 4JS6A 1CNIA 5FLOA 1DCAA 1HUHA 4FL7A 1RZEA 1JCZA 3IAIA 1ZFQA 4CNWA 4YGNA 3V5GA 1CINA 3SAPA 2AX2A 4LP6A 2WD3A 1CIMA 5EKHA 1G4JA 2ABEA 3C7PA 3NI5A 5EZTX 3T82A 1BNWA 5DSLA 2CBBA 2NXRA 2W2JA 2POUA 4FVNA 4YYTA 1CAYA 1CNCA 4Q7PA 3EFTA 1KOPA 3KNEA 4JSSA 5DVXA 3TVOX 5FNLA 1IF8A 4CQ0A 3OKVA 3L14A 3BL1A 4G7AA 5JEGB 5JQTA 2EU3A 1RZCA 3F7BA 5IPZA 3KONA 1G54A 3D8WA 1YDAA 5FL5A 2X7TA 3RYYA 2CBAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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