3IGHX

Crystal structure of an uncharacterized metal-dependent hydrolase from pyrococcus horikoshii ot3
Total Genus 190
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
190
sequence length
483
structure length
483
Chain Sequence
SLKALINGTIYTSFNPLKKVSGLVISHGKVIYAGDSEVAKKIVELSGGEIVDLKGKYVMPAFFDSHLHLDELGMSLEMVDLRGAKSIEELIQRLKRGKGRIIFGFGWDQDELGEWPTRKELNAIDKPVFIYRKCFHVAVANDKMLELLNLTPSKDFDEDTGIIKEKSLEEARKVINERVLTVEDYVYYIKRAQEHLLDLGVKSVSFMSVNEKALRALFYLEREGKLSINVFAYVTPEVLDKLESIGLGRFQGNRLTIAGVKLFTDGSLGARTALLSKPYSDDPSTSGQLVMEREELIRITEKARSLGLDVAIHAIGDKALDVALDVFETTGFPGRIEHASLVRDDQLERVKNLKVRLSVQPHFIISDWWIVERVGEERVKWVYRFKDLMKVAELGFSTDSPIEPADPWLTVDAAVNRGKGKVKLYELTKDQALDIKDALHSYTYGSARVSLASDIGKLEPGFKAEYIILDRDPLVVKEGHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
molecule keywords UNCHARACTERIZED METAL-DEPENDENT HYDROLASE
publication title Crystal Structure of an Uncharacterized Metal-Dependent Hydrolase from Pyrococcus Horikoshii
rcsb
source organism Pyrococcus horikoshii
total genus 190
structure length 483
sequence length 483
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-07-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF07969 Amidohydro_3 Amidohydrolase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.40.10 Mainly Beta Roll Urease, subunit C; domain 1 Urease, subunit C, domain 1 3ighX01
3.10.310.70 Alpha Beta Roll Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 Diaminopimelate Epimerase; Chain A, domain 1 3ighX03
3.20.20.140 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Metal-dependent hydrolases 3ighX02
1V4YA 2GWNA 4R88A 2GZXA 1V79A 2P9BA 1NDVA 2D2GA 4DLFA 2AQOA 1A5OC 1RJRA 3ID7A 4NP7A 2G3FA 4AC7C 3GIQA 2RAGA 3ISIX 3K2GA 4RZBA 1KRCC 4RDVA 3IV8A 2IMRA 2R1KA 1M68A 4CQBA 2DVTA 3KM8A 4LAKA 4QS5A 4C6NA 4C65A 2GOKA 2HNHA 3MTWA 1FWAC 1EJTC 1RA0A 2VM8A 3O7UA 3V7PA 4H9UA 3D6NA 4CQDA 4TQTA 3DCPA 4PBEA 2ICSA 4BJHA 1UIOA 3MPGA 4GX9A 2FTYA 3PNZA 4G2DA 3LY0A 4MUPA 2VHLA 4XD6A 4E3TA 2OQLA 4C60A 3JZEA 1RK6A 1QXLA 4EPEC 1ZZMA 3T81A 4I6VA 4G7EA 3SO7A 3E0LA 4C6EA 2GWGA 4EPBC 5FSEC 4WVXA 2D2HA 1RJPA 1HZYA 3CS2A 4L9XA 1ADDA 1NDWA 4CNSA 1M65A 3GTFA 4J5NA 4XAGA 4C6OA 2Z27A 4RE0A 3TNBA 2YB4A 1EJUC 1I0BA 3S2MA 1UIPA 5G4HC 4H9VA 1POKA 3RYSA 2A3LA 4GXWA 2OOFA 4CNUA 1PTAA 3AU6A 1O5RA 4GOAA 1YBQA 4H01A 3OODA 4BY3A 4WGXA 4CQCA 2ZC1A 3RCMA 3MDUA 3GTIA 4KEZA 2HBVA 3ICJA 1IE7C 3PBMA 4IG2A 4IH3A 3UR5A 4B91A 3EGJA 4INFA 2R1MA 4ERGA 4HK6A 1UMLA 3NURA 1J6OA 3UBPC 4LANA 4BKNA 4DLMA 3QY8A 3S2NA 3G77A 1W1IE 4KIRA 4NG3A 4UB9A 5HMFA 1ONXA 3MVTA 2QVNA 3GU2A 2W9MA 4DYKA 3URBA 1A5LC 2R1NA 3LS9A 4CEXC 3MDWA 3E0FA 3FDGA 1YNYA 3PNUA 3N2CA 1P6BA 4C6QA 2Z7GA 1KRBC 2UZ9A 4HJWA 4DI9A 4R85A 1EF2A 1XRTA 4GBDA 3WZ0E 3OJGA 3K5XA 1KRMA 2Z2AA 2I5GA 4H9XA 4HA0A 3PAOA 4KEUA 4LFYA 2PLMA 4QTGA 1WXYA 2HPIA 3MSRA 4EP8C 4IFKA 4C6LA 2Y1HA 2Z29A 4F0SA 1V7AA 1O12A 4DZHA 4IGMA 4C6DA 1YRRA 2FTWA 2KAUC 4Z42C 4M51A 5HMEA 2EG6A 3FEQA 3TN3A 5E5CA 2PGRA 2GSEA 1XGEA 1FWEC 1JGMA 4GYFA 3DUGA 1KRAC 3FDKA 3LSCA 2F6KA 3B0XA 3E3HA 2DVXA 1K6WA 3F2CA 4LCRA 2E1WA 2D2JA 3TN4A 1FWJC 4WHBA 4HK7A 4DNMA 3OU8A 3URNA 1KCXA 3GUWA 4F0LA 1FKWA 2R1LA 3B0YA 4C6KA 3C86A 2CZVA 3HTWA 4ICMA 1I0DA 2YB1A 3MKVA 4C6MA 1P1MA 4IF2A 3GG7A 4DO7A 4L6DA 4OFCA 1EJWC 2Z26A 4DI8A 4QSFA 2ANUA 1ONWA 2Z2BA 4RDYA 4D8LA 3F4DA 1FWBC 1DPMA 3IACA 1A4LA 4C6CA 3MVIA 1RAKA 3TN6A 4H9ZA 3GIPA 4XD3A 2WJDA 4GY1A 4C6IA 4B90A 2EG8A 3UPMA 3EWDA 4H00A 3UF9A 4V1XA 3MJMA 1R9XA 1NDYA 1A5KC 4QRNA 3LU2A 2EG7A 4H9YA 4CNTA 1J6PA 3IGHX 2E25A 3T8LA 1WXZA 2P53A 3QGAC 1P6CA 3TN5A 2I9UA 4H9TA 4LCSA 2PGFA 1EJRC 3GU9A 1BF6A 4C6FA 1NDZA 2WJFA 1FWFC 4G7EB 1FWGC 3LGDA 2Z4GA 3F2BA 3DC8A 1EYWA 2DVUA 1FWHC 4KERA 4ZSTA 1EJVC 4ZSUA 1EJSC 4KF1A 3RHGA 4C6JA 4KQNA 1J5SA 3K4WA 2OODA 1J79A 2Q09A 4F0RA 4R7WA 2WM1A 4IQJA 3AU2A 4PE8A 5HMDA 4XD4A 2YZ5A 1K1DA 2Z00A 3GTXA 3IJ6A 4LCQA 4DZIA 3OOQA 3GTHA 5AKQA 5FSDC 2FVMA 4LALA 1A5MC 1YBQB 4PBFA 4XD5A 4J35A 1E9ZB 4J2MA 3F4CA 4JOMA 2Q01A 1FWIC 3GRIA 3S4TA 3F2DA 1EZ2A 3A3WA 4IG2B 3CJPA 4C5ZA 2R1PA 2HQAA 2FVKA 3A3XA 4P5UA 4XAYA 1M7JA 3URQA 3LA4A 2O4QA 3QY7A 2PUZA 1PSCA 4GY0A 1POJA 3OVGA 2Z28A 4XAFA 4B92A 2VC7A 2YXOA 3O0FA 3T1GA 2FFIA 4LH8A 4GK8A 4KETA 1V77A 4DIAA 4YIWA 2VC5A 3E2VA 1QW7A 3NEHA 4IFOA 2OGJA 3NQBA 4QROA 1RA5A 4ERAA 3S2LA 2OB3A 1FKXA 3PANA 1YIXA 4AQLA 1R9ZA 4PCPA 3ITCA 4B3ZA 3LNPA 3CAKA 2BGNE 3UR2A 1EJXC 3HM7A 1VFLA 3IARA 3RN6A 3EWCA 1RK5A 4IFKB 3LSBA 4NI8A 1PB0A 4RDWA 4QS6A 4C6PA 3LGGA 2VUNA 4GC3A 4C6BA 3GGMA 1YMYA 4V1YA 4RDZA 2Z25A 4C5YA 3QGKC 3E38A 4I6KA 3IPWA 5CH9A 2AQVA 2PAJA 1R9YA 4UBPC 3HPAA 4LEFA 1UBPC 1A5NC 1XRFA 1ITUA 3URAA 3ORWA 2QT3A 4LAMA 2VR2A 1E9YB 4KESA 1GKPA 2HBXA 3OQEA 4EPKA 3R0DA 4GY7A 1K70A 1S3TC 4IFRA 4EPDC 3GU1A 1GKRA 2Z24A 4GX8A 3B40A 2HPMA 2QS8A 2WJEA 2AMXA 1V51A 1GKQA 3S2JA 1ITQA 3WMLA 3WYZA 3BE7A 4KEVA 1PO9A 1RJQA 3A4JA 4GZ7A 2QPXA 1NFGA 3SFWA 1FWDC 5A6TC 4IGNA 3IRSA 2P50A 4HK5A 1A4MA 3E74A 3AUOA 2BB0A 2O4MA 4LAOA 4PCNA 3QY6A 4H9MA 4ERIA 2XIOA 1XWYA 1FWCC 4XAZA 4CEUC 2ADAA 5LXXA 2UBPC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
8RUCA 2HK1A 2BXZA 4CVWA 1R3YA 2WANA 2JIEA 1JYWA 3C3NA 3EOLA 5E0FA 1SO3A 4EANA 1SJAA 1W9VA 3F4WA 2H3BA 4FLRA 1E4MM 5BCAA 3TOYA 4IPIA 1CXLA 2PDIA 2ZZ3A 1I60A 4P7NA 2HJPA 1AMKA 3O9NA 4J2PA 1XS2A 1VIWA 4L4OA 1VF8A 2HNHA 1YHTA 4LVGA 4JX5A 3G1XA 1HO1A 4WSKA 4LUTB 3QOKA 4JV2A 4AY8A 1GQKA 1FWRA 2QV4A 4MUZA 2GJXB 1GT8A 4RZRA 1GYLA 1K9FA 3ZVHB 4FNRA 4S3DA 2V5DA 1JR1A 1K4GA 4JTIA 3QR0A 2NQHA 1AL7A 4PTMA 4ECWA 1U5VA 3S5ZA 5A2AA 4M0XA 2IW4A 1OVDA 2YGYA 2CLFA 3EYPA 4DAIA 2OSYA 1A47A 5D38A 1BKHA 2XH2A 1F7BA 3IEBA 1YE6A 4IMGA 3CS2A 4L9XA 4XAGA 4C6OA 3QKEA 3K4DA 4GE8A 2W91A 3AI0A 1UIPA 5G4HC 9XIMA 4O3NA 3SRKA 3TQ0A 3CV7A 1KFJA 1EC8A 3TP4A 4ECUA 4F0MA 1O5RA 3G22A 1F61A 3WIJA 1XPGA 3DOPA 1KKRA 3SEPA 2WYSA 3CL7A 2J66A 2V4QA 4JX6A 4KWWA 1EYEA 3MDUA 5AZ1A 1SDJA 1IEXA 3EX1A 3MHUA 1S1RA 1UWIA 3W1TA 4TX9A 3P2VA 4JY9A 2ASHA 1OGSA 1QOQA 1X96A 3PFRA 2NV9A 3G77A 3ZLHA 3H7RA 4Q8EA 5HMFA 1MDRA 5HANA 1Y5XA 5KFOA 1ZAHA 3SN4A 1C92A 3R8HA 1VJSA 1CLXA 2YX0A 1UR0A 2DFAA 2HSAA 1X8FA 3EAUA 2OVLA 1V5XA 1CXFA 3STFA 8TIMA 3HFYA 3ABXA 4W88A 4V33A 5AHMA 2Z7GA 2WHJA 3VNYA 4O15A 3LUTA 4ZQRA 5FF2A 1J0ZA 3HF3A 1EA0A 1WZAA 1XYFA 1YRRA 5BW6A 5KFXA 2D0FA 4MWAD 1Q7QA 2YCLB 4GYFA 4A3HA 1NELA 1GZGA 3UJ2A 1K6WA 3IVTA 3RGTA 4ROQA 3TJIA 1M41A 1WKYA 3PB0A 1NFBA 3A22A 1BXBA 3MMTA 3T0BA 5CZ0A 3FSTA 2YOCA 4FEZA 4AVFA 1PZ0A 4DF1A 2VWTA 3GVRA 2R82A 4LYPA 1BHGA 1TWIA 2XH7A 4CLMA 4BQ3A 5LIKX 1BPLB 4J7RA 2HROA 3MUZ1 3PUEA 4GIYA 3CZ8A 4BZYA 3HGRA 1W17A 4RDYA 3C4UA 1XV8A 3GWQA 3H12A 4LAUA 5JH1A 3J7HA 1TWDA 1UWUA 3K8MA 3LI1A 4C7GA 4DJED 4V1XA 2IKHA 2CLIA 3MJMA 2BHZA 5JBEA 4IIGA 2C22A 5A6KA 2X7VA 2PC8A 3RCNA 1CNVA 3KCOA 1XLDA 3T8LA 1H7RA 1JUKA 2G41A 3DFNA 3IJDA 1E6PA 3W76A 2WJFA 1FWGC 3LGDA 1EUNA 3DI1A 2XPKA 3DC8A 4GYPA 3RO6A 3AIVA 3GV8B 4Z0JA 3AS3A 1Q6EA 5F2IA 2CBIA 2G0WA 3UG5A 5REQB 5KINA 3UZXA 3QGVA 1SZFA 3A6OA 3W6YA 3CAWA 4ZMGA 5DO8A 1NOUA 5C9ZA 1YTEA 3WMSA 2PRLA 2QJMA 3OOQA 1NOFA 3TXVA 5KG1A 1GTEA 3QKZA 1A5MC 2XIMA 2OKTA 1E9ZB 4IICA 1J0KA 1HT6A 5AC4A 2OQHA 4WR3A 4C7FA 1IXOA 1T6KA 2J6UA 3WUBA 4AD3A 2ZXRA 3KHRA 3LG3A 4RZ4A 4QAWA 2NV1A 4YR2A 4DELA 4IXXA 2RDUA 4AYGA 3W1XA 1U2YA 1VEPA 4ZOAA 1XYBA 1FY6A 2VI0A 5BRQA 5M1TA 2Y5JA 1DJQA 1XSIA 4HNLA 2X1RA 2X0HA 4GK8A 1FCQA 4GH3A 1F8MA 3AMLA 5DLCA 4B5VA 2XHYA 4MB5A 1IF2A 1GEQA 5CPSA 4UIOA 3UCCA 5LIXX 1GK8A 1ODUA 3DERA 3UJRA 1UR8A 4ORMA 4URIA 4B3ZA 1A5SA 2ISVA 4ACZB 3VNZA 3HJZA 5GNXA 3PR4A 2GKJA 4RDWA 1H63A 5CPNA 1Q6QA 3LGGA 2RH9A 1O60A 5HQLA 1R3VA 5MHBA 4JV1A 3VZZA 5C0QA 2GJPA 2J8TA 1HO4A 4J9XA 3I3BA 1G9HA 2C14A 1JPIA 4XSLA 2AQVA 3W7KA 1OCJA 3IANA 2A85A 3ECQA 1TZ7A 4NZCA 1NWTA 2HDJA 2C18A 1IZCA 1JUEA 1UWSA 2GDVA 4WY0F 2WZHA 4LJ3A 4MAVA 3CMGA 3KBJA 2D3NA 1K70A 4O1CA 1LROA 2J27A 4MKVA 3W4RA 4NILA 4RE3A 4JTUA 1GKQA 1K4HA 4ED7A 1MXDA 2PI6A 1RQBA 5I3JA 3WQFA 2HZGA 3SIMA 1JZ3A 5KG4A 2QPSA 5G2HA 1US3A 1UKPA 4EIVA 3QFEA 4N6FA 5FJTA 4ZEPA 1IWPA 4HPNA 4FNSA 1LG1A 3FHQA 2ABBA 4JY8A 1P1XA 2EXOA 1EC7A 4JTKA 4DWDA 2V9WA 4E4UA 3B97A 3W22A 1JPDX 1LWJA 2FLLA 3P5ZA 4AC7C 3EA2A 3V36A 5EGRA 4UFMA 2W92A 1OD0A 2WVTA 1M68A 2YJQA 2A7RA 2DVTA 1VFSA 3PSVA 4HU3A 2J7GA 4S38A 2BXVA 4YS1A 1JCNA 4QM1A 2ZX5A 4LGXA 1UUMA 3EPOA 2OCZA 1C9WA 2BOFX 2ZRXA 3U57A 1H09A 2OQLA 4O0ZA 3W7PA 4DUOA 1JEZA 2DSUA 4H1ZA 1QW8A 3BLFA 3CYVA 4OECA 1MUMA 3AROA 4I6VA 3BC9A 5AC7A 3CV1A 2GWGA 3NJ3A 5GJMA 5E09A 2XFWA 5BXTA 4WVXA 5GNYA 2NQJA 3GM8A 1OFQA 1JZ2A 1RZMA 4MY1A 2NQLA 3TSMA 2DIKA 4GGHA 2QDGA 4NYUA 4CN6A 1U22A 1M1BA 3V6KA 4XZHA 3VK5A 4GQ0A 3HU7A 2A3LA 2PWFA 1VHNA 3BW2A 2PTYA 5DELA 2CXEA 5HUOA 2PSNA 2F6XA 1I2OA 1NSJA 2WMFA 3V6HA 3P14A 1UWRA 3L4UA 3H2OA 4RCXA 4O4VA 3GH5A 5LGZA 2PF8A 3WH5A 3EXRA 4P7RA 2DZVA 4IH3A 2XIQA 4ZOBA 4BA0A 3B0VC 1UMLA 2VDIA 1CGWA 4UUIA 3VGFA 1UR9A 2PDKA 2V5LA 3S9IA 3GS6A 2WM0A 1DJWA 3GXFA 1ONXA 5L1LA 1WA3A 4L56A 3M0JA 3W02A 1GNXA 3CH0A 4PMOA 2VELA 3AHVA 2F6UA 3MA8A 1P0KA 4PB4A 5M47A 4Q43A 1QAPA 2J77A 1OGBA 1EP3A 1TV4A 5A6LA 3WCZA 3UCQA 4A8LA 5DANA 1KLYA 2WVVB 4NKCA 4H2HA 3BZJA 3ALFA 4GI9A 1WAWA 4K7VA 3P74A 1RSCA 3B9OA 1LDCA 4LFYA 4W86A 4C6LA 3CTTA 3PSWA 4U28A 5ECVA 1V7AA 2WVSA 4XIMA 2GYIA 1K7XA 3V4BA 4FS2A 3TONA 1TA3B 1JD7A 1H1NA 1OABA 3RG6A 1U1HA 1SFLA 4RW3A 2D2OA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1FRB A;  4Z2G A;  3W37 A;  1ZBW A;  3N9R A;  4V2X A;  3IUD A;  1ZU8 A;  3EPN A;  2F2K A;  2WMG A;  3TYU A;  1SR0 A;  3CM4 A;  4PUL A;  3LBO A;  3CEU A;  2D73 A;  5K7J A;  2BQ3 A;  3M0M A;  3TJ4 A;  2GDU A;  3ITT A;  4KRZ A;  4Y9O A;  3A3X A;  2ONE A;  3GAY A;  3M0Y A;  3SRF A;  5KT6 A;  3QY7 A;  5C5Y A;  4H19 A;  5J5D A;  3B06 A;  3GZ3 A;  3MKK A;  4C90 A;  4PEK A;  4AIS A;  3KL5 A;  3T5H A;  2C16 A;  2WKL A;  2OR2 A;  4OIF A;  1ZQ5 A;  4DF0 A;  1OC5 A;  1XID A;  1XKY A;  4I7V A;  3ART A;  3WDH A;  3PAN A;  3EZ4 A;  2WLZ A;  4G8T A;  1LCO A;  3IVS A;  3RU8 X;  4M80 A;  3W7O A;  1VFO A;  2A79 A;  1EJX C;  1PHQ A;  4QG9 A;  2X1I A;  1Q8J A;  5KT2 A;  3VMP A;  4O57 A;  5F2L A;  5G2I A;  2ACU A;  5EY5 A;  1S0O A;  3M16 A;  4O0Q A;  2FDM A;  1IIG A;  1SQ7 A;  1SVD A;  4WIW A;  3UG3 A;  5E0C A;  3QH2 A;  2JGY A;  1XRF A;  1TTI A;  2BP1 A;  3NUK A;  4EXA A;  5D8Z A;  4AWU A;  5AB3 A;  1SR9 A;  4A6G A;  1PCW A;  1E6R A;  3W1U A;  1FFR A;  2JEF A;  3P67 A;  3GH7 A;  1JCL A;  3UZZ A;  2WJE A;  3NYD A;  4JEQ A;  2V67 A;  4QSH A;  3FJN A;  1Z8A A;  1FA2 A;  1TA3 A;  4CU8 A;  1A0C A;  4NVT A;  4FAL A;  2W79 A;  3LK6 A;  3W1M A;  3UA4 A;  3MI6 A;  3L0N A;  4AD5 A;  2HCV A;  2ADA A;  7PTD A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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