3IGS | Genus

Total Genus 81

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	81
sequence length	230
structure length	230
Chain Sequence	AMSLLEQLDKNIAASGGLIVSCQPVPGSPLDKPEIVAAMALAAEQAGAVAVRIEGIDNLRMTRSLVSVPIIGIIKRDLDESPVRITPFLDDVDALAQAGAAIIAVDGTARQRPVAVEALLARIHHHHLLTMADCSSVDDGLACQRLGADIIGTTMSGYTTPDTPEEPDLPLVKALHDAGCRVIAEGRYNSPALAAEAIRYGAWAVTVGSAITRLEHICGWYNDALKKAAS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
molecule keywords	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase 2
source organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus	81
structure length	230
sequence length	230
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.1.3.9: N-acylglucosamine-6-phosphate 2-epimerase.
pdb deposition date	2009-07-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04131	NanE	Putative N-acetylmannosamine-6-phosphate epimerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3igsA00

3A21A 1AMKA 3GKAA 3IVUA 1SU5A 1AW5A 1H63A 2DZVA 2QCCA 3F03K 3W71A 3FEMA 4PL2A 4MPQA 4A29A 1W3NA 2G97A 3CIXA 1H62A 3NZ1A 4Z0SA 1EP1A 1Q3NA 1LM1A 1AW1A 5D09A 1R47A 2RDUA 3TJXA 4O12A 3QYQA 3PC0A 3KRZA 4JTGA 3G0UA 2YYTA 1JUEA 3T4CA 3UYCA 4BR1A 3B0PA 4UR7A 3M0ZA 5I3GA 1B9BA 4JIQA 1G4TA 1P1XA 3CIWA 4CQ8A 1KM5A 3IGSA 3PBUA 3UQNA 2AAMA 4IGHA 4WY0F 4FIQA 1J5TA 5DBUA 2OT1A 3LBCA 1WX0A 4ADUA 3NPWA 3N14A 3HJZA 4I7UA 4I7WA 5CSRA 3BGGA 4WY0B 4YL2A 1W54A 3QPYA 3NQAA 3NA8A 3O1NA 2V82A 4MY8A 2A5HA 5IBXA 2DU2A 1WOBA 4OWGA 3NDOA 2GQAA 4NU7A 4JNMA 3DFSA 4FNUA 1X6UA 4JIPA 3MI6A 3CWOX 4ZL1A 4BWLA 5K9DA 2QUVA 3GKFA 1XI3A 1JUBA 4PCFA 1AG1O 2PURA 4NUWA 5K2ZA 2YCEA 3LTSA 3B03A 3EWBX 5BW6A 3E96A 4LU0A 2DZSA 3UPBA 4HKPA 3EWUA 1LTDA 1YDVA 2X1SA 4RV8A 2QAPA 4DO5A 1KV8A 4Z1BA 1ME8A 3MP3A 3IVSA 5LZLA 1VRDA 2R14A 4Q32A 4RJEA 1VYPX 1C9DA 2GOUA 2CZDA 4O16A 2VOMA 1G6CA 2E6AA 4XZ9A 3UD6A 1I2NA 2Y7FA 3ABOA 1FWWA 4AVFA 1KTNA 2ABAA 5G4WA 5I3HA 1LORA 3TQKA 3EKLA 1GT8A 4ZQOA 1K7XA 4LVFA 1W31A 3T7VA 4GUHA 1H7NA 1AK5A 2Q3OA 1HTIA 4OHQA 5KZMA 3KVMA 3QQ1A 3P8JA 2CWNA 2QJGA 1SO4A 3QMSA 2B7OA 3LXAA 3KAOA 4AF0A 2QDHA 1VS1A 3GNDA 1A5BA 4HNNA 5G4EA 1FXQA 2HMCA 5FESA 3W2KA 3FFSA 3JR2A 1X1OA 4CCDA 3W22A 1NAL1 3LXCA 3ATYA 3F4WA 3BW3A 5FEZA 3ZS4A 3W72A 4JYEA 2Y62A 1K8XA 5CKSA 4TX9A 1ICQA 3HPZA 3Q58A 4LC6A 3GXPA 3QMTA 2Y88A 3FYPA 3ELFA 4YCOA 1MZHA 2J6XA 4UTTA 1GPWA 3EWXA 4A2SA 1GEQA 4Y9AA 5SWUA 2C13A 2QUTA 5FEXA 3V1PA 3HF3A 3P81A 3WJWA 4O17A 5H2ZA 1SO6A 2J24A 2EF9A 2RDTA 2BLEA 1G69A 4QJ1A 3DENA 4JDBA 3B0VC 5LNVA 1H1ZA 1ADOA 2X30A 2E68A 1OFDA 1PCWA 1RZMA 1S3HA 5DXYA 5I3KA 1QDSA 3N2XA 4UTLA 2FPYA 1WXJA 3DKJA 1Z44A 3MJYA 4X9SA 3S6DA 3CEPA 4O50A 3S1UA 3NQ2A 2PRHA 1OFBA 3TFCA 4ZQCA 2A85A 4FF7A 4JS3A 1WBHA 1FQ0A 5G2WA 3P5YA 1F7BA 5AC6A 3O8AA 4UNKA 3PVFA 2HTMA 1LBFA 4UTWC 2CLMA 4A2RA 2FJKA 1YPIA 1GVQA 5U7SA 1GQNA 1W5MA 2QUUA 3W2UA 2E5CA 1DKWA 1W3IA 2ZRZA 3W86A 1ZNNA 2WNQA 4QSHA 5D04C 3PF3A 4O11A 3M5ZA 3F1QA 3HGSA 4RZ5A 5I3IA 3DU0A 3L9CA 4ML9A 1LOSA 3HQ1A 3LCHA 4DPPA 3HGJA 4R34A 2Y89A 5BNKA 1HO1A 4OE7A 4UC5A 2CLOA 5D2YA 4IMDA 4KKXA 3W7LA 2ISVA 3QF0A 4O15A 3NZRA 1I2RA 3GDRA 4IMEA 3W1TA 3P7YA 1HG3A 4YMZA 4LRTA 3B06A 3P74A 4RCXA 3TSMA 5L9FA 1OFEA 4XQ6A 3C2OA 1I4NA 1G7UA 2VELA 3MUXA 3DXIA 3L2IA 4R33A 3W1AA 5D05A 4WXYA 1WAUA 3AO0A 3QEZA 5D03A 3OVPA 4QIUA 4DPQA 4MKNA 4MJZA 2ALDA 4IMCA 2FDSA 3MO7A 4PFMA 1L6YA 4AH7A 2VFFA 1MO0A 4WXZA 1JUKA 2VEIA 3C2RA 4NJIA 2EPHA 3W2NA 4RK8A 1OVDA 1TJPA 3W74A 1EB3A 3P5ZA 4NT0A 4JTIA 4Y6GA 3HO8A 3K30A 1RD5A 3VFLA 2ZDRA 5DCDA 1VH7A 4JTLA 2ZQ0A 3QW3A 4JTTA 1FWTA 3KFTA 1D9EA 2X16A 2WPBA 4K36A 2YYUA 5LNSA 4A22A 1S5VA 2TMDA 1CW2A 1G7VA 4RZ6A 3LM7A 1Q6OA 4LY8A 2CZEA 4CQ9A 3GDLA 3PSWA 3HIJA 3UWZA 5A5WA 3G1AA 1T96A 3D0CA 4LC8A 4GUFA 4O1BA 1A53A 5K4ZA 3KHJA 1Z41A 3CWNA 4MZ1A 3DFTA 2Y6ZA 4JTJA 4MLRA 2QCDB 4FX6M 1XUUA 3W7CA 1OFQA 3EB2A 1T99A 3M5XA 4N02A 1FUYA 1JCMP 2DP3A 2G96A 4M7TA 1LOQA 1OF6A 1XKYA 4BI5A 1PS9A 5TIMA 3L0NA 2V2DA 4DEFA 1LOLA 4GUGA 3A9IA 1V7YA 2H6RA 3FYOA 1OYAA 1VGAA 2JGYA 1I2PA 1B57A 4LS2A 1H51A 1QR7A 3M41A 3TNOA 1I45A 1TPWA 3SW6A 3BARA 4C1KA 2ZA1A 2NWSA 4GC4A 1OFPA 1TB3A 5AYXA 4QNWA 4ONVA 3M43A 3PAJA 1X1ZA 3C56A 3EKZA 3OG3A 5F1UA 5A8GA 3CEUA 1AL8A 2YW4A 4DBDA 4HSOA 2NUXA 3NEVA 2C1HA 3TK7A 1KM1A 1SZGA 4UMCA 5HNRA 5EA9A 3HOJA 3FKRA 4S2BA 1YXCA 3H54A 4JYDA 1OX6A 3W7OA 1QOQA 3G18A 4JX4A 2CLKA 3EWZA 2B7PA 3LX9A 3OA3A 3W7IA 1XC4A 3W85A 3OIXA 2FB3A 5CPLA 4O10A 3G3MA 3W88A 4NZFA 4JTKA 2YDAA 4JYFA 3QRHA 3S1WA 2QF7A 2GUUA 3QZEA 5LNWA 1SO5A 1EP3A 2QKFA 4UR8A 3QPZA 3TROA 4UTHA 3DHDA 2YZRA 3KOFA 4O18A 4FNTA 3LLFA 1LRQA 4YXGA 3CU2A 2BSLA 3BG9A 1N8FA 5AFDA 4X2RA 1OFRA 4MVAA 3PB2A 5D2XA 3W7EA 2DZUA 3B05A 5HJLA 4I9AA 5FF4A 1JULA 3A23A 1BEUA 2E5DA 5D2WA 4HNTA 1LLZA 1R2TA 1TTQA 2TPSA 2YW3A 3I68A 1W56A 3W87A 3LHYA 3IIPA 1UCWA 4MOZA 5J5DA 4LVBA 5FF2A 4DQWA 3UNDA 2Z0IA 3IV3A 5FI8A 2NX9A 3PBWA 4JY8A 2E09A 2WSRA 5CGQA 1TPFA 5I3JA 2P1FA 3PBYA 2NXHA 3I7SA 1GG0A 1XUZA 1JVNA 4Q4KA 2OZ0A 1ZAJA 2OCZA 1TJRA 3W7MA 3T78A 3LHUA 3TAOA 2HS6A 3TJLA 5F2IA 3UPWA 2VEPA 4KFOA 2NWRA 3LI0A 1H7WA 1QPOA 3C6CA 4CNOA 1G67A 2QJIA 3WJXA 2OMAA 4RXFA 4DBEA 3SJ3A 3B8DA 3QFEA 3NQDA 2A7RA 4S1FA 3U8GA 1H61A 4XTDA 3LOTA 4XWUA 3OVQA 1UASA 3UWWA 1F73A 1OFAA 2Z6IA 5HUPA 3O06A 5AOUA 1W5PA 4TO8A 1IXOA 4MY1A 4NJGA 3QW4B 4N9CA 3ANYA 1R30A 4HHPA 1XDLA 4NJKA 3OHIA 2B4GA 5LHFA 1W5NA 1TCDA 5AYZA 6ALDA 3BLFA 3NPUA 2VEMA 4TMBA 4U28A 4RZ4A 3S1XA 1KFEA 3LHTA 1H7RA 1QMLA 1TIMA 3G8EA 3IIOA 3W1RA 2C0AA 1FWSA 3MYOA 1EUAA 4AWTA 3W84A 3BK0A 1P5BA 3EX1A 4LRSA 1YLVA 4O57A 3BV4A 3MHUA 5LGZA 4AHPA 2A2IA 3PM6A 2X2GA 3TW6A 4CCCA 5IM51 1MSSA 4PA8A 1EWDA 2Y61A 1SFJA 1DJQA 2A6LA 3IEBA 1XXXA 3E12A 3W7HA 1ONRA 3FS2A 4JTSA 1EP2A 2C18A 4NNCA 3KRSA 4LT9A 1H60A 4DF2A 1IF2A 5FF7A 5TQLA 2E6FA 4WJEA 3LERA 1VLWA 4MYXA 2WSYA 4MUZA 1JRCA 3EX3A 1DHPA 1O4UA 1VC4A 4Q33A 5LGXA 4FX8A 4ZQMA 3E0IA 3WJSA 1KM3A 5EKYA 1YTDA 3O16A 4AAJA 2WNZA 3LB0A 4LUJA 4B5NA 1BKSA 4GUJA 3RU6A 4K8HA 3DAQA 3HG4A 4Z1CA 4JR5A 3FIGA 1E51A 2PC4A 3EWYA 5HWMA 5E93A 1A50A 4QNEA 2ATMA 1HO4A 4ZQNA 1DL3A 3UY8A 3W7DA 3YPIA 4UIOA 2QCGA 4GUIA 4DF0A 3RLUA 4NQ1A 4Z0JA 1KFCA 1FCQA 1SSGA 4OU1A 2FB2A 1TTPA 5FF3A 3CHVA 2DJXA 2CFFA 4O53A 3L65A 1A5AA 1T8XA 5K7JA 5LNRA 2Z1BA 3G3DA 4IXHA 4MIMA 2OJPA 4ZZ9A 5C5YA 4Y90A 3P8IA 4FNPA 4K37A 4FX7A 2FIQA 3G8RA 4LS1A 3L68A 3WJZA 1V5XA 3LGEA 1W0MA 1KFKA 3O05A 4E0CA 8TIMA 2C14A 4AXKA 3VE9A 1SO3A 2DORA 1KBIA 1LYXA 1K7EA 1OF8A 1ZENA 2XFWA 3W2MA 1OX5A 3H55A 3G1FA 4UTUA 3NAVA 2W79A 3L66A 4BF9A 2BWGA 3NYZA 5DBTA 4FNSA 2OT0A 1TPC1 2QCEA 4EOUA 1C29A 1XDMA 1OYBA 4JX5A 2JKEA 3EX2A 3VCRA 1FCVA 4DO6A 1OX4B 1RPXA 2ATSA 3TMQA 1F5ZA 3W7GA 3BW2A 3C0JA 5MHBA 2O7SA 1OK4A 4WD0A 3H53A 4NX0A 1VYRA 2PE4A 3DZ1A 3QQ0A 4UXDA 3RF9A 5AC8A 2YPIA 3I65A 5CG7A 3EWWA 3GX9A 5C54A 4LUIA 5AN7A 3E49A 1K7FA 1F2JA 3MYPA 1GVFA 3TU9A 5EL1A 3NG3A 1PE1A 3QJAA 2QAFA 2A6NA 3ZR4A 4LWWA 2Q8LA 3TIMA 3NR0A 4UFLA 4KWVA 1G4SA 1EWEA 4NXKA 3NPXA 3NGJA 4NJJA 4Y96A 1OK6A 5LKYA 2XN2A 5EY5A 3STEA 1Z42A 5HQEA 3DBPA 3GDKA 5BOOA 5HWJA 2H3BA 3WK2A 1FDJA 3I6RA 2YX0A 3ABRA 4H3DA 4PEKA 2NX3A 4C1LA 4GFSA 4OT7A 4PL1A 3N19B 1N55A 4WZHA 1TV7A 5K4XA 2RDWA 4EIVA 1KFJA 2ZRYA 5AB3A 4U4MA 1LBLA 3TX9A 1P0NA 4JXCA 3W2LA 3GXTA 1WV2A 4CCEA 4UMBA 3EX4A 1O5XA 2NUYA 1TPUA 5KZEA 3TDFA 3O6YX 3MBDA 7TIMA 4UTIA 4KFPA 3P67A 3G1DA 3QSTA 4MZYA 4ALDA 1ML1A 1XBXA 5DELA 3UWVA 2R94A 3MMTA 4XBKA 3SGUA 4AHQA 3WFAA 3GR8A 2J27A 4IQLA 3E02A 5AC7A 3R13A 2QCFA 4YWIA 3PUOA 1VR6A 2BX7A 4UTJA 4J9JA 4HNVA 3ABQA 5F4WA 2H8ZA 5F2LA 2ZZ4A 3LV6A 4WOQA 1KV5A 4MZ8A 3V75A 6TIMA 3SECA 3LDVA 2Q8ZA 3LCIA 2FPVA 4EWND 1CI1A 5CZJA 1IGSA 3TSDA 5KZDA 1GOXA 2Y7GA 4Y8FA 1H50A 3MBFA 5D37A 3SSJA 4Z08A 2E5BA 1TTJA 1VHCA 3WJYA 1DV7A 2CU0A 3W76A 2PRLA 2VFHA 2ZZ6A 3L5LA 4MYAA 4KWWA 1J4EA 2BXVA 1MEHA 3GNNA 3CLMA 2JGQA 2Y7EA 5TBOA 1TQJA 3W1NA 3TQVA 1H5YA 3JRKA 5EBUA 2CW6A 3NM1A 3TFXA 3UXDA 2FFCA 1RR2A 1F76A 1QCWA 1GVRA 2GVLA 3C2VA 1QPQA 3P84A 4O1CA 2ZA3A 2E6DA 3SY5A 1ZJIA 3ZWSA 4IMFA 3NQ8A 4KFNA 3RK8A 3PULA 2AQWA 5C2XA 2GQ9A 2LLEA 3W7JA 1IXNA 2ABBA 3WK3A 3R8RA 3OVRA 2ZRXA 3W7NA 4OV9A 5DN1A 4ADTA 5T26A 1YDOA 3TV8A 5IBXC 3M7WA 4N2YA 1KM6A 3UZJA 2QCHA 3RLVA 3TAKA 4ORMA 2ZRVA 3B04A 2QCNA 2WSQA 2NLIA 2EHHA 4BWLC 2WKJA 2EAWA 3NO5A 4QAIA 1LRNA 3CC1A 2DZTA 3GXNA 5L6UA 2NX1A 3W1QA 4DELA 4JTHA 3TA6A 3TQ0A 1SR9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3IGSA

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