3IHGA

Crystal structure of a ternary complex of aklavinone-11 hydroxylase with fad and aklavinone
Total Genus 164
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
535
structure length
535
Chain Sequence
MNDHEVDVLVVGAGLGGLSTAMFLARQGVRVLVVERRPGLSPYPRAAGQNPRTMELLRIGGVADEVVRADDIRGTQGDFVIRLAESVRGEILRTVSESFDDMVAATEPCTPAGWAMLSQDKLEPILLAQARKHGGAIRFGTRLLSFRQHDDDAGAGVTARLAGPDGEYDLRAGYLVGADGNRSLVRESLGIGRYGHGTLTHMVGVIFDADLSGIMEPGTTGWYYLHHPEFKGTFGPTDRPDRHTLFVEYDPDEGERPEDFTPQRCVELIGLALDAPEVKPELVDIQGWEMAARIAERWREGRVFLAGDAAKVTPPTGGMSGNAAVADGFDLAWKLAAVLQGQAGAGLLDTYEDERKVAAELVVAEALAIYAQRMAPHMAEVWDKSVGYPETLLGFRYRSSAVLATDDDPARVENPLTPSGRPGFRGPHVLVSRHGERLSTVDLFGDGWTLLAGELGADWVAAAEAVSAELGVPVRAYRVGAGLTDPESAVSERYGIGKAGASLVRPDGIVAWRTDEAAADAAQTLEGVLRRVLDR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Flavoprotein, oxidoreductase
molecule keywords RdmE
publication title Structural basis for substrate recognition and specificity in aklavinone-11-hydroxylase from rhodomycin biosynthesis.
pubmed doi rcsb
source organism Streptomyces purpurascens
total genus 164
structure length 535
sequence length 535
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.14.13.180: Aklavinone 12-hydroxylase.
pdb deposition date 2009-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.9.50 Alpha Beta 2-Layer Sandwich D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 D-Amino Acid Oxidase; Chain A, domain 2 3ihgA02
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ihgA03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 3ihgA01
5IPYA 3IF9A 3UKAA 1TDNA 3V76A 1X31B 1VRQB 2AR8A 3P4QA 2FJDA 3AE9A 2B9XA 3CPJG 3NKSA 4NEVA 4U2SA 4U8MA 4CBQA 4PABA 5DBJA 3V3OA 3QVRA 2WBAA 4K5RA 4H7UA 2BACA 3SQPA 3FIMB 4U8LA 2Z5YA 4YT0A 1GPEA 1B4VA 1MXTA 3M13A 1YY5A 1Y0PA 1OJ9A 4H2NA 1NG4A 1ZP0A 1S3EA 2JB1A 2TPRA 1F3PA 2WDRA 4ZN0A 5J7XA 1KSSA 1PS9A 1D4CA 2TMDA 3KLJA 3C96A 3M12A 2YG4A 1PJ7A 4LIIA 4NTDA 3GYIA 4OPUA 3GMCA 2B7SA 2VQ7A 4FX9A 4EM4A 4JQ9A 3IHGA 2W0HA 3F8DA 2IIDA 4B66A 3KKJA 2V3BA 3AECA 4KPRA 4B63A 4H4SA 4DSHA 2NVKX 4CRTA 3FBSA 1ZY8A 1GTEA 4FK1C 3RNMA 1ZX9A 4YSZA 3AEDA 4TM0A 2X8CA 1S2QA 4AOSA 3NYFA 4H4WA 4DNAA 2YLTA 3GYJA 4AP3A 2BC0A 2GMJA 4X4JA 5C3JA 3CGEA 3UKPA 2CDUA 4H2PA 2DKHA 1O94A 3P4SA 1IUVA 1LVLA 3AEAA 5C2TA 1P2EA 1QJDA 4A9WA 4CCQA 4O5UA 2EQ8A 4BK3A 1GSNA 2J3NA 4IV9A 4Y4NA 3P9UA 2QCUA 1KFYA 1IUWA 1H86A 4WCTA 2UZZA 3V3NA 2V61A 2R0PA 3E1TA 1D7LA 2IVDA 4C74A 1AOGA 1YKJA 2Q7VA 1ZMCA 1Q9IA 1K0LA 1LTXR 1E1LA 1IUSA 2Y6RA 4ZCCA 3KU9A 5JCKA 4K5SA 1PBFA 2OA1A 3KD9A 4H4TA 4YKFA 1PXCA 1YQZA 2R9ZA 1FOHA 1VG0A 2YLWA 3FG2P 4PAAA 4GF7A 3FPZA 3CTYA 1IJHA 3KA7A 4C3YA 2NPXA 2R46A 3UKLA 4X9MA 1D4EA 2YLRA 3DJJA 2Z5XA 5U1OA 1NHSA 4RSLA 3GMBA 2JKCA 3BNMA 2GB0A 4M52A 4GDPA 3IC9A 4BV6A 2GVCA 1F8WA 4A99A 4CY6A 4Z44A 3NTAA 2GQWA 1F6MA 3QJ4A 4IA5A 4JY2A 3Q6JA 4GRTA 5BULA 2BYBA 3UTFA 2WP9A 1PN0A 3ALJA 2YAUA 3KVEA 1PDHA 4Z25A 4A5LA 4DGKA 3CGDA 3NN6X 2BXRA 4ZCDA 1GNDA 4C3XA 2GR1A 2ARDA 2YM1A 2WPEA 3UTGA 1GETA 1BF3A 4B68A 1FL2A 2Q0LA 1UKVG 1COYA 2WOIA 3QSSA 5IQ1A 3EF6A 2OLNA 3NYCA 3K7TA 3AEFA 2XLPA 4EIPA 3DGZA 1RYIA 3I3LA 3JSKA 1JNRA 4OPLA 2B7RA 1GREA 2VOUA 4HB9A 5JCMA 5KXJA 2YR4A 2OLOA 2YG5A 3AB1A 2QA2A 3RHAA 2GAHB 1N4WA 1EBDA 3CNDA 2APGA 2V60A 3CPIG 3LXDA 4RG4A 1O95A 1OJDA 4Z26A 1EL5A 2VVMA 4U8PA 4NEWA 3VRAA 1S2YA 4NZHA 5CQFA 5ER0A 3DA1A 2YR6A 5FS8A 2GRTA 2B9WA 2FJBA 4K7ZA 3AWIA 4EQXA 1PXBA 3CN8A 3K30A 2XFUA 2X50A 3EAOA 1F8RA 4BK1A 3UKHA 3FMWA 5EBKA 3HZLA 3CPHG 1NPXA 3QFBA 1CJCA 1QLBA 3UOZA 1D7YA 1KF6A 2GQFA 2Q6UA 3AYIA 2JAEA 1XHCA 4Z2UA 4EQRA 2E4GA 1PXAA 5KOXA 3F8RA 4CNJA 4TLZA 1GALA 1CJ4A 1EL9A 4A7AA 2WU2A 4U8IA 4CY8A 3QSEA 2R0GA 4EQSA 4B64A 2WU5A 2YLSA 4YWOA 2C64A 5BUKA 3AXBA 2VVLA 3SM8A 4U2TA 5KRQA 1Y56B 2VRLA 3UTEA 4J57A 1H82A 3ALLA 3AD9B 3Q9TA 4I59A 4XXGA 4ECHA 3NN0X 4FK1A 4JNAA 1H7WA 5BRTA 3NLCA 2BA9A 2WOVA 1XPQA 1V59A 3OC4A 1H84A 4RG3A 1L0VA 2XLRA 3BI2A 2WQYA 3NGCX 1K0IA 2BXSA 2GR3A 5M0ZA 4N9XA 4B67A 3IWAA 2E1MA 2BS3A 1NDAA 2WPCA 4H4RA 3O0HA 3AE2A 2GMHA 2CFYA 5CKUA 1DODA 5FS9A 2XVJA 4B1BA 1XANA 2VZ2A 2BCGG 3L8KA 5JCIA 1VG9A 1Y56A 4BJZA 1E1NA 2HQMA 1L9DA 3GD4A 5U25A 3LOVA 2C66A 4BJYA 3BNUA 2A8XA 2PYXA 2XFQA 2ZZCA 1GESA 3NNEA 4UDRA 2VQBA 2DKIA 2XLSA 4H4XA 4E0VA 3L1RA 1DJNA 2RABA 4UP3A 4USQA 3CNTA 2C70A 4YSXA 3UKQA 3II4A 3VR9A 1N4VA 1TYPA 1OJAA 2EQ6A 4YTNA 1CC2A 4UDQA 4CCRA 1TDOA 1B5QA 2BS4A 1O5WA 2IVEA 3COXA 2YLXA 5GSNA 3EANA 4EMIA 1H81A 4U8JA 3ICRA 4LA1A 3OZ2A 1DNCA 1LQTA 2YVGA 1TYTA 5EB5A 3GRTA 2Q0KA 4AT0A 4K2XA 1SEZA 1CJ2A 5EB4A 1DOEA 2CULA 4H4PA 1JRYA 3GWFA 4GCMA 3NT6A 2BK3A 4P9SA 1BZLA 4AT2A 4OPTA 3UOVA 1DOCA 1NENA 5FMHA 1PBBA 4YXDA 3AE8A 2GR2A 3PS9A 3DMEA 2X8HA 3P1WA 2X99A 3VRBA 5KOWA 2YVFA 3ABVA 2E5VA 3AE5A 4EM3A 3VR8A 2GV8A 4J36A 4U2LA 2JK6A 3PO7A 1BKWA 1XDIA 2WDQA 3SFDA 4IVOB 3NK0X 5HHFA 5EOWA 3UOYA 1Z6LA 2AQJA 1PBCA 3QSMA 1PHHA 1D4DA 5U63A 2GEWA 1GEUA 1JOAA 1H7XA 1F8SA 1P2HA 3DK4A 4A65A 3VQRA 3D8XA 3NIXA 3S61A 3UTHA 3GWDA 1JRZA 1ZMDA 2EQ7A 2BCPA 2WHDA 4K22A 1DXLA 2B76A 2C3CA 1ZDLA 1NG3A 1K0JA 4OPGA 3C4AA 3LZWA 2X8GA 1JRXA 2ZBWA 4WX1A 1JU2A 1CHUA 2XYOA 5BVAA 2F5ZA 4A6NB 3CNPA 4EMJA 4JN9A 3D1CA 4D04A 3CGCA 1TRBA 4IA6A 4MJWA 3IHMA 4H4YA 4BURA 2EQ9A 2VVLG 1PBDA 2YG7A 4J33A 2XDOA 3UP4A 2OALA 3CGBA 1OJTA 2C65A 2PHHA 3EPTA 3GDNA 4H2QA 3LZXA 2FJAA 1N1PA 4FDCB 1M6IA 2O9ZA 2YG6A 2C73A 3UKFA 4Z2TA 3PVCA 3I6DA 5JCLA 3ALMA 1GRHA 1W4XA 1REOA 1GV4A 4H2RA 2VRMA 2C7GA 3AYLA 2V6OA 3GDPA 4EQWA 1FEAA 3REDA 2ZZ0A 4B69A 2AAQA 3H8LA 4OPIA 4YKGA 1H83A 2H88A 1GOSA 1IUUA 2GF3A 3LJPA 2JBVA 1LQUA 2BABA 2WPFA 2R4JA 3BHKA 1HYUA 4H50A 1IUTA 2WP5A 2C76A 2XVFA 5FS7A 5HY5A 1GRBA 1ZKQA 3S5WA 3B3RA 4AOXA 3DK8A 2QA1A 3RP8A 4H4QA 2YM2A 4D03A 5JCNA 4H4ZA 4EIQA 2YG3A 1GTHA 3DH9A 2WOWA 3SFEA 1GERA 3ATQA 2R4EA 3G5RA 4A79A 4EMWA 2I0ZA 2X3NA 5L46A 2XLTA 4GR1A 3AE7A 1GRAA 4B65A 4TM1A 2YR5A 3T37A 1MO9A 1BGNA 5J60A 1CC4A 4Z43A 1CL0A 4AP1A 1JNZA 4HA6A 2C67A 2WP6A 3B6DA 5M10A 4Y4LA 2R45A 1CC6A 3DGHA 4YSHA 2FBWA 1KNRA 3K7MX 3VRDB 3DK9A 1E6EA 4H4VA 1L9CA 4JY3A 3CIRA 3DJGX 3AEBA 4CNKA 4XWRA 3GRSA 4OPDA 2CVJA 2GAGB 1ELIA 1RP0A 4J2WA 1ZOVA 4BK2A 5KWFA 3NK1X 1ZK7A 4APNA 3ZYXA 1E7PA 3NH3X 4ICYA 2V5ZA 3SGLA 1E1KA 1FEBA 1GT8A 4OCGA 3G5SA 1EL7A 2WETA 2GR0A 4ADWA 3GD3A 3ICSA 2BK5A 1LJ1A 2RGJA 4TM3A 4DSGA 1KDGA 3DJDA 4NTEA 4Z2RA 4KX6A 4U8KA 4LU6A 2RGHA 3NHOX 4X9NA 1YQ3A 3CNSA 1B37A 2QAEA 2XFOA 1FCDA 1RSGA 1DOBA 1ZOYA 1KNPA 2XFNA 2YLZA 4GDEA 4TLXA 2WDVA 3NG7X 3UKKA 2R0CA 1NHRA 1LPFA 1VDCA 4JDRA 4C77A 1NHPA 1S3BA 2FJEA 1VQWA 5HYMA 4C5OA 1K4QA 3AE3A 3UP5A 2C3DA 2H89A 3F8PA 1TDEA 1NAAA 1NEKA 3BHFA 1YQ4A 2ZZBA 4U8NA 1PJ6A 3AE6A 1M64A 4K8DA 3RP6A 4O5QA 4U8OA 1KSUA 1NHQA 3H8IA 4OVIA 4YSYA 2XVHA 1GRFA 1L9EA 3BI5A 1IUXA 3K7QX 4H4UA 3AYJA 1BGJA 4J56A 5IQ4A 3AE1A 3ICTA 4YTPA 1Q1WA 3CNJA 3ZDNA 2JB2A 1TDKA 3H4KA 3KPFA 3NYEA 4YTMA 1TDFA 2BK4A 3AD8B 1PJ5A 3LADA 3GSIA 1OJCA 2XVEA 1CF3A 2C72A 2YQUA 2BC1A 2GH5A 3ATRA 4UDPA 5KVHA 2A87A 2WESA 2XLUA 3P4RA 5GRTA 3R9UA 3WE0A 4GUVA 4J31A 2RGOA 3BI4A 5KVIA 5HXIA 2YWLA 1GRGA 3RP7A 2C75A 3C4NA 1Q1RA 3NTDA 4NTCA 5LV9A 2ACZA 1QO8A 4REKA 4XWZA 1CJ3A 1GRTA 1EL8A 4JNQA 3AE4A 4J34A 5TR3A 3LB8A 3URHA 3DJEA 2OAMA 1JEHA 2XCGA 3G5QA 3UOXA 1MOKA 3ITJA 2A89A 1H6VA 2Y6QA 4TM4A 2WEUA 3AEEA 3M0OA 1LV0A 1D5TA 1PBEA 2WS3A 3NRNA 1N4UA 1E1MA 2XVIA 3AD7B 3P4PA 1FECA 3ADAB 3AEGA 1E39A 4A6NA 2JB3A 4I58A 5FS6A 3UCLA 4USRA 2XFPA 1ONFA 1CBOA 1BWCA 2YVJA 2B9YA 3QVPA 1GXFA 4OPCA 4Y4MA 1DJQA 3ISHA 4IVMB 3QFAA 2V3AA 3NK2X 1B8SA 2BS2A 4Z24A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3IF9A 2LV3A 2IPAA 4MJAA 3T14A 1TDNA 5JCWA 1X31B 2GSSA 2FJDA 3AE9A 3CPJG 2WJUA 4U2SA 4G9HA 3V3OA 4KUNA 5A4WA 2WBAA 4NAXA 1LJRA 2BACA 3FIMB 2Z5YA 1GPEA 4IS0A 2QSIA 3TDGA 1NG4A 2PPTA 1ZP0A 2WDRA 4KNDA 1KSSA 5FWGA 4I8BA 5DAKB 3CBUA 1PKZA 3KLJA 1QGVA 5HR3A 3GMCA 3M1GA 5DALB 2CVKA 2W0HA 2KHPA 3M8NA 2V3BA 3AECA 1LU4A 4ISDA 4H4SA 5D8IA 1ZY8A 4FK1C 2K8VA 5ECKB 4YQUA 1ZX9A 1SL0B 2QC7A 4AOSA 4H4WA 1Q98A 2YLTA 3FYGA 5J41A 2E82A 4X4JA 2AV4A 2V32A 3CGEA 4H2PA 1O94A 1EEJA 1LVLA 5C2TA 2GZZA 1GH2A 3IAS2 1XW9A 2LEGA 2H66A 4POMA 2J3NA 4GRFA 2DJKA 2PVQA 4Y4NA 2DJJA 4USSA 1YF0A 1QFNA 1IUWA 2IMDA 1DAOA 4WCTA 1H86A 3V3NA 3GYKA 1U87A 1YKCA 1AOGA 2NPBA 1YKJA 4KCAA 3TB2A 3LYPA 1LTXR 2LRNA 5JCKA 3ZMLA 4K5SA 3KD9A 4PAAA 4GF7A 3SZFA 4TXOB 1Z7PA 3G7JA 4C3YA 2R46A 1T4ZA 4XCSA 3DJJA 4MLYA 4DVCA 2Z5XA 3BD2A 2CA8A 4GWRA 3LJRA 2GB0A 2LNTA 4GDPA 2GVCA 2VM2A 4A99A 2N5AA 3TOTA 1F6MA 4JY2A 1GP1A 4GRTA 5BULA 5ENUA 2H1BA 3C8EA 1ZYQB 2WP9A 3IR4A 1PN0A 2KOKA 1PDHA 1R4WA 1XWKA 1PFOA 1Z3EA 2YV7A 1ZL9A 3NN6X 1NSWA 2IWTA 2VCVA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3IF9 A;  2LV3 A;  2IPA A;  4MJA A;  3T14 A;  1TDN A;  5JCW A;  1X31 B;  2GSS A;  2FJD A;  3AE9 A;  3CPJ G;  2WJU A;  4U2S A;  4G9H A;  3V3O A;  4KUN A;  5A4W A;  2WBA A;  4NAX A;  1LJR A;  2BAC A;  3FIM B;  2Z5Y A;  1GPE A;  4IS0 A;  2QSI A;  3TDG A;  1NG4 A;  2PPT A;  1ZP0 A;  2WDR A;  4KND A;  1KSS A;  5FWG A;  4I8B A;  5DAK B;  3CBU A;  1PKZ A;  3KLJ A;  1QGV A;  5HR3 A;  3GMC A;  3M1G A;  5DAL B;  2CVK A;  2W0H A;  2KHP A;  3M8N A;  2V3B A;  3AEC A;  1LU4 A;  4ISD A;  4H4S A;  5D8I A;  1ZY8 A;  4FK1 C;  2K8V A;  5ECK B;  4YQU A;  1ZX9 A;  1SL0 B;  2QC7 A;  4AOS A;  4H4W A;  1Q98 A;  2YLT A;  3FYG A;  5J41 A;  2E82 A;  4X4J A;  2AV4 A;  2V32 A;  3CGE A;  4H2P A;  1O94 A;  1EEJ A;  1LVL A;  5C2T A;  2GZZ A;  1GH2 A;  3IAS 2;  1XW9 A;  2LEG A;  2H66 A;  4POM A;  2J3N A;  4GRF A;  2DJK A;  2PVQ A;  4Y4N A;  2DJJ A;  4USS A;  1YF0 A;  1QFN A;  1IUW A;  2IMD A;  1DAO A;  4WCT A;  1H86 A;  3V3N A;  3GYK A;  1U87 A;  1YKC A;  1AOG A;  2NPB A;  1YKJ A;  4KCA A;  3TB2 A;  3LYP A;  1LTX R;  2LRN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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