3IMXA

Crystal structure of human glucokinase in complex with a synthetic activator
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
451
structure length
447
Chain Sequence
GPGSMVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAFETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESRSEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVACKKAC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
molecule keywords Glucokinase
publication title Investigation of functionally liver selective glucokinase activators for the treatment of type 2 diabetes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 167
structure length 447
sequence length 451
ec nomenclature ec 2.7.1.2: Glucokinase.
pdb deposition date 2009-08-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3imxA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 3imxA01
4YDUC 2P9LA 1J6ZA 3O4WA 4IJAA 4BR4A 1DEJA 3VENA 3IDHA 1YUWA 4BR7A 5F1XA 4HTLA 1NGJA 3MCPA 1RGIA 4A2BA 4PL8A 3FLCO 2FXUA 3QICA 4A2AA 4J8FA 3EKUA 1QQOA 2CGJA 5AZIA 2HF4A 4BR0A 3GE1A 2QWOA 4B1UB 3A0IX 2NZTA 2BTFA 3A5OC 1NM1A 4BC5A 1OKJA 3KHYA 3WUHA 1YVNA 4H0OA 1JCEA 2NLXA 5BPMA 3RSEA 3IMXA 1BU6O 3VEOA 5FPEA 1ATSA 4QS8A 5AQVA 5AZJA 4EFHA 4BRHA 3MDQA 3CI5A 1T6DA 1TYQA 2Q0UA 2P9SA 3D7EO 1GLAG 1ZC6A 2A41A 4AM7A 4FWOA 3DXKB 1ESVA 3QFPA 2CH5A 1CZAN 4MO5A 2CH6A 1Z6RA 2P9IB 1SAZA 3C7NB 3ENHA 3WT0A 1U6ZA 1MWMA 4BR9A 4O5FA 3ID8A 4FSVA 3FGUA 4CJ7A 2ASMA 4FPAA 3DAWA 2V7ZA 2Q31A 3LDLA 1NGIA 1QHAA 5AQKA 4EIAA 3QB0A 2VWBA 3CJBA 4Z94A 1T6CA 2HMPA 2AP1A 3CIPA 3IFRA 4PKIA 3VEWA 1BG3A 1IJJA 1QZ5A 5AQGA 1E4GT 3ATVA 5AQQA 5EX5A 3KVGA 3UKUB 1JCFA 2IIRA 4ISEA 2VYPA 1GLCG 1V4TA 3HTVA 3FZKA 1NBWA 4B1ZA 3QMLA 5ADXH 3AAPA 4BRPA 3A5LC 3J8AA 1X3NA 4H0YB 1QQNA 1P8ZA 3BF1A 2YHXA 1WOQA 2A40A 4XH1A 5AQJA 1NGAA 5EVZA 3ZETA 2P9NB 4RWTA 5AQWA 2CGKA 1RFQA 5AQZA 1DGKN 2P9UB 3U9DA 3VEYA 2D0PA 3W0LA 1XUPO 4BG9A 4MLEA 3ZEUA 4BRDA 4H5VA 1HUXA 4BRAA 4DHYA 4H0TB 4O8KA 3R6MA 4M7YA 3D2EA 4BRLA 2D0OA 4CZJA 5AQRA 1LOTB 3A8YA 3EZWA 4WQ5C 4BRKA 1KAZA 1NGCA 3BUZB 3VF4A 4JD2A 4GNIA 1K8KB 5TKYA 2P9PA 1NGEA 3UKRB 5KPTA 4BRQA 5BRDA 4BR2A 3EN9A 2NRHA 3A5MC 4GY2B 3P4IA 3MK6A 4L3QA 5B8HA 3M1FA 2ZF5O 2P9KB 3F9MA 1GLEG 4BGAA 3LDNA 3EL2A 2E20A 2HF3A 2IVNA 2Q97A 4F9OA 3I33A 3MN9A 5E84A 3CJ1A 3GL1A 4FWKA 4ISGA 4FWMA 1NGFA 4H5TA 3FZFA 1KXPA 3VETA 3MMVA 5LJVA 4IXCA 5AZIB 4E1JA 3FE1A 2V52B 2FSKA 3H6EA 5KQ8A 1RDWX 4FL9A 5F2RA 1T44A 3DXMA 2E88A 2ZGZA 3U8XA 3B8AX 3C0BA 3SMSA 2E8AA 4ISFA 5I9EB 1SZ2A 1C0FA 4K41A 1GLFO 1NMDA 5JLFA 2DPNA 1TYQB 3H3OB 1S3XA 4RTFD 4CBUA 2OANA 4CZEA 2J4RA 5LJWA 4A62A 5AQHA 3O1BA 1DKGD 4CZKA 4IWVA 5E26A 1NLVA 3MN7A 5AQIA 1GLLO 1Q18A 3EKSA 1E4FT 4WYBA 3QBXA 3VERA 5FPMA 5BR9A 2W40A 4CD3A 3EO3A 2YCHA 3ATUA 4JN4A 5KPRA 3GOIA 3D2FB 3CJCA 3CQYA 2ITMA 5AQTA 2QWMA 2P9IA 4BRMA 4KBOA 2A3ZA 3C7NA 4FWLA 4IJNA 1HKBA 2I7NA 3BF3A 4CBWA 1HLUA 5KPZA 1BDGA 1GLDG 3AAQA 4WQ4C 5AR0A 4B1VA 4H03B 2D1KA 3CJ7A 4Y0WA 4NB4A 1SQKA 3DJCA 4H5WA 4EHUA 4FWSA 2QWLA 2QWQA 4CZIA 3A5NC 2E2NA 4FO0A 3VPZA 5AFUH 3VEXA 4BROA 3UB5A 3MN5A 1BA0A 4BGBA 3H3NO 4FWNA 4MLHA 3QDKA 5LY3A 1HKCA 3WXLA 5BPLA 2QWRA 1S22A 2F9WA 3ULEB 2KHOA 3FFKB 1NGBA 4FOIA 2QM1A 4C23A 4CZGA 2WUSA 3WEEB 3KZBA 3VGMA 2E2OA 4JHDB 3ZETB 1YXQA 3ENOA 4FWPA 4BR5A 4FWQA 3QFUA 3MN6A 3HSCA 2QWPA 5EY4A 3U9ZA 5AQLA 1U2VB 3O6WA 4K25A 2ZGYA 4K43A 1BA1A 1BUPA 1GLBG 4JAXA 2P9NA 3D2EB 4CZFA 5KQDA 1IG8A 3SJHA 2YHYA 4NO7A 5BRHA 2P9UA 1TUYA 3VOVA 1V4SA 4M63C 3I8BA 4BQZA 4BRFA 3VF6A 2FSJA 3O8MA 2W41A 2QWNA 4H0XB 5AQUA 2YJEA 3CQXA 3VEVA 2V51B 1MWKA 4B1XB 4PL7A 2P9LB 4BC4A 3DWLA 1R59O 3JS6A 2FSNA 4I6MA 4QS9A 3WXKA 3UKRA 4BRIA 2VCPA 2BUPA 4FPBA 3FZLA 3VGLA 1X3MA 2A6AA 1MDUB 3ZX2A 4FWRA 1GLJO 2E1YA 3BEXA 2FF6A 4LC9B 3VGKA 2P9KA 4WQ5A 3O5BA 5EOYA 4CBXA 3GBTA 1ATNA 1XC3A 4A61A 4BC2A 4DQ8A 2IVOA 3CJ9A 1KAXA 4QS7A 5ADXA 2GUPA 3ZX3A 4XH5A 4B1YB 4BG8A 4CZLA 3H46O 4H5NA 5AQFA 3R8EA 1ZBSA 4CI6A 2GTDA 2D4WA 4YDUA 4XH4A 3DXMB 4JNEA 3RSEB 3TU5A 1G99A 5AZJB 5AQMA 1NGGA 2E1ZA 2AA4A 2ASOA 1KAYA 2P9SB 2IVPA 2CGLA 5AQOA 3U4LA 4PKGA 4CD1A 3AARA 2UYTA 3S41A 5F0XA 3VEZA 1QZ6A 4BC3A 1X9JA 2GWJA 3WXIA 2E2QA 2Q1NA 4EHTA 3CJAA 1EQYA 3VF2A 1HKGA 4BVPA 3L4IA 2A42A 3VESA 3HI0A 4BRCA 4IO8A 4BREA 3SLCA 3DXKA 3CETA 3HZ6A 5AQPA 5JICA 2Q2RA 2HOEA 2Q36A 3O08A 1BO5O 5JLHA 3CHWA 3WQTA 4FOEA 4BQLA 4HWIA 2QW9A 3O80A 3AY9A 2I7PA 1NGDA 2GWKA 4H5RA 5CE3A 2ASPA 3HBTA 1C0GA 3SMPA 3D2FA 5JMVA 3WXJA 4DCHA 1BWFO 2FF3B 3G25A 3GG4A 4H0PA 3FZHA 4CZHA 4PKHA 3FZMA 3UKUA 3LM9A 5AQYA 5FPDA 4XEIA 3L0QA 3LL3A 3LM2A 2FLOA 2GEMA 3QBWA 3L6QA 3UE5A 2ZWHA 3H45C 3IUCA 4BRGA 3LDOA 4B1WB 4DB3A 5ELZA 1ZXOA 4WQ4A 5AQXA 1ATRA 2EWSA 3H1VX 2YHWA 3SK3A 3TPQA 3O1WA 3ZEUB 3ULEA 2V7YA 2A5XA 4EAHD 4B9QA 2GELA 3CERA 5BREA 1QQMA 2YI1A 4H0VB 5AQNA 3WEEA 5BN9A 4CZMA 2Q0RA 5EXWA 1HPMA 4JHDA 1BOTO 2E2PA 1MA9B 4JD2B 5AQSA 1TUUA 1NGHA 2P9PB 2F9TA 3ZX0A 3BP8A 1U2VA 4BVOA 3OHRA 5BRFA 2H3GX 3FR0A 4MO4A 4AM6A 3M3ZA 1D4XA 3H1QA 2PAVA 5FPNA 1HX1A 2QXLA 4K42A 1K8KA 1LCUA 1Z05A 1XQSC 1JCGA 2PBDA 3W3DA 3GDQA 1YAGA 4I6MB 1H1VA 4RCHA 3HM8A 4IZ9A 3JXUA 3R9PA 5BPNA 1NWKA 1HJOA 3WQUA 4M7XA 5BN8A 3LDPA 1WUAA 1Y64A 3LDQA 5AFUA 3M6GA 2YJFA 4BRNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5JVHL 1J6ZA 4IJAA 1VQ6N 1DEJA 3HP9A 3K9KA 3O4QA 1W0HA 5F1XA 1HNVA 4HTLA 2IGIA 3CXCM 3TTDA 3ISNC 1QQOA 1M1KO 5AZIA 2HNDA 2HF4A 1HYZA 1Q81O 4BR0A 4M3RA 3GE1A 1RILA 2BTFA 3A5OC 3OYMA 1NM1A 2RPIA 1TKXA 1VQKN 1YVNA 4H0OA 2NLXA 1WSGA 3G71N 4WFAL 2ZJQL 1LW0A 5FPEA 5AQVA 3QESA 3AVHA 4Z4GA 4YY3K 1TYQA 4CK1A 2G8WA 2D0BA 5AJ3K 1MU2A 3U3GA 1GLAG 3LAKA 4FLYA 1ESVA 2G8VA 1CZAN 4MO5A 2CH6A 4AHCA 1QS4A 4DSJA 3ID8A 5I42A 3FGUA 4CJ7A 4FPAA 3DAWA 1NGIA 2NRTA 4B8CA 4JI0K 3SBTA 4E1MA 3QINA 1HNIA 3CIPA 4O55A 2QK9A 1QZ5A 4KTQA 1S9GA 3OYDA 3ATVA 5AQQA 4MQ3A 4FVUA 3UKUB 3CCUN 2IIRA 4M3ZA 4KFBA 1GLCG 3LWLA 1V4TA 3HTVA 2O8BA 3FZKA 3ZT4A 2WFBA 4DV2K 3QMLA 4BRPA 3A5LC 1S1TA 3V81A 3OYFA 4JK7A 1P8ZA 3K9JA 1WOQA 4XH1A 4CEDA 1TKTA 5EVZA 3DLHA 4IEIA 3ZETA 3EZ5A 2YNIA 3DLEA 4DQRA 3VEYA 4YNQA 1VSKA 4GKJK 2O8CA 3VTHA 3OTOK 4E7JA 4FVMA 4BG9A 1Q7YO 4MLEA 3ZEUA 3ZSVA 2Y1IA 1L5UA 2GX9A 1C6VA 3D2EA 4BRLA 4CZJA 2Q3SA 1LOTB 5AQRA 3EZWA 4WQ5C 3ID6A 3I8DA 3TTCA 4FM2A 2VWKA 1Q8IA 2HBLA 4PHTX 4FJGA 2ZJPL 4GNIA 1K8KB 3THWA 3TAQA 3NF6A 1KLNA 3UKRB 4BRQA 4BR2A 3HOTA 5FDLA 2NRHA 4CJTA 3P4IA 4L3QA 4CJ3A 5GADP 3RTVA 3QNOA 3U6FA 1WSIA 3C6AA 4LD0A 3D6RA 3OW2M 4LFAK 1WLJA 5E84A 3CJ1A 4FWKA 3HXMA 3SPYA 3LAMA 4FWMA 4MFBA 2RF2A 3C94A 4EP4A 3TANA 2IS3A 2OZSA 3OYJA 4FLXA 4FJNA 3V1OA 2AJQA 1T44A 1X9MA 3DXMA 4DTRA 3SJJA 2HHUA 3DYAA 3C0BA 1VSIA 2E8AA 1BIUA 3V9XA 1TL1A 2QEXN 3QO9A 1C0FA 1TK5A 1NMDA 1Z26A 4CJEA 3AA4A 1M90O 4E89A 3H3OB 3CCSN 4RTFD 5LJWA 2J4RA 5AQHA 4O44A 3O1BA 1QSLA 4IWVA 1NLVA 5JS1A 1E4FT 3DLGA 3QBXA 4N41A 2PY5A 2W40A 2YKNA 3K57A 4KB0A 3VQBA 3GOIA 4CJVA 4N76A 1W2BM 4BRMA 2E6LA 2A3ZA 1TL3A 3ZSZA 4LSNA 1HLUA 5KPZA 4CEOA 4WQ4C 4DQQA 3QEPA 3RRGA 4B9LA 4HTUA 1XMOK 4EHUA 4KHYA 4C1NI 3A5NC 4FLWA 1JXEA 1CXQA 3TTFA 1HYVA 3VEXA 4M3XA 3T19A 1KLMA 5HOOA 3DOKA 3MN5A 4FWNA 1O1WA 4K0KK 3OY9A 3WXLA 5DK5A 3FFKB 4FOIA 4W5OA 2QM1A 2YNGA 4C23A 1VSMA 5DM6L 3EE8A 4CEEA 5CYMA 1KCFA 2E2OA 3QERA 1K9MO 3RMBA 4CFDA 1TV6A 3QFUA 1RTIA 1IH7A 3U9ZA 3O3GA 3NH1A 3OS0A 4NLCA 4K43A 1NK5A 4Z4HA 3NGZA 1U49A 1BQMA 4NO7A 5BRHA 1TUYA 3VOVA 1V4SA 2YNHA 1ILYA 1WSFA 3L2QA 1KSPA 5DMRA 4CW7B 2DFFA 5AQUA 4CK2A 3VEVA 3HPOA 3CF5L 1RBTA 3RMCA 4AQYK 4B1XB 4BC4A 1C0UA 3UKRA 1X3MA 3THYA 5IT9O 4F3OA 3ZX2A 5GIOA 1GLJO 1FKOA 2E1YA 4A5BA 2VGMA 3A2FA 4WQ5A 4F2SA 2F4VK 4GKKK 5LL6Z 4DQ8A 1KAXA 2G8IA 4F2RA 2F8SA 4CF1A 3AGKA 3VQCA 1ZBSA 4Z4FA 3AO1A 1FKPA 2B4JA 4JNEA 3L3UA 5AZJB 1RCHA 5AQMA 3TWHA 3LP2A 5T7BA 4ILJA 3NH0A 1KAYA 1S1UA 3HP6A 3AARA 1L3UA 2UYTA 3S41A 1QZ6A 4BC3A 2GWJA 4CECA 3WXIA 2Q1NA 3G4SN 1IKVA 4PQUA 2A42A 4LF4K 4BRCA 1W7AA 4IOXA 4BREA 3V9UA 4YHHK 4CGDA 4G1QA 3NF7A 5MLCQ 4BWMA 3HZ6A 4DQIA 5JICA 2Q2RA 3O08A 4JYAK 4AILC 1ASUA 3LPUA 4BQLA 1BHLA 4E7LA 3SAGA 3UIQA 4H5RA 5CE3A 1U47A 4WF9L 1A5VA 4JS4A 4CGFA 4DCHA 4I7FA 4LF8K 3HPGA 3GG4A 4H0PA 1RT6A 3FZHA 5DM7L 4DTXA 1I94K 3J81O 4E7KA 5FRMA 3IRXA 4CHNA 3L8BA 1WAJA 3L0QA 3LL3A 1OH5A 2FLOA 4DR3K 3Q7CA 1RTHA 2ZWHA 3ENBA 4CJFA 5GAHP 4F4KA 4Z0UA 4DB3A 3LDOA 3CG7A 4WQ4A 4KH4A 1ATRA 2EWSA 1TK0A 4ILHA 3TPQA 3MXMA 3HL8A 3LALA 4QOZB 2A5XA 1ASVA 2NRXA 4FJ9A 3CERA 4RW4A 5AQNA 4CZMA 2BDPA 2Q0RA 3CC7N 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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