3IS5A

Crystal structure of cdpk kinase domain from toxoplasma gondii, tgme49_018720
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
272
structure length
260
Chain Sequence
NLYFQGTIDDLFIFKRKLGSGAFGDVHLVEERSSGLERVIKTINKDRSQVPMEQIEAEIEVLKSLDHPNIIKIFEVFEDYHNMYIVMETCEGGELLERIVSAQARGKALSEGYVAELMKQMMNALAYFHSQHVVHKDLKPENILFQDTSPHSPIKIIDFGLAELAGTALYMAPEVFKRDVTFKCDIWSAGVVMYFLLTGCLPFTGTSLEEVQQKATYKEPNYAVRPLTPQAVDLLKQMLTKDPERRPSAAQVLHHEWFKQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Calcium-dependent protein kinase
publication title Crystal structure of CDPK kinase domain from toxoplasma Gondii, TGME49_018720
rcsb
source organism Toxoplasma gondii
total genus 76
structure length 260
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 2.7.11.17: Calcium/calmodulin-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2009-08-25
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3is5A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3is5A01
4KRDA 3VQUA 4QQTA 4AW0A 3UIMA 2P3GX 4KKEA 4FIJA 4X3JA 5CLPA 4F0FA 1JAMA 3F3TA 3PFQA 3L9MA 1YQJA 4K11A 3JVSA 2C3LA 5CY3A 3WF7A 3M11A 4QPMA 4BCHA 4EOQA 3E8EA 4TWNA 3MPAA 3NAYA 1H0VA 2FH9A 3F3VA 5CEMA 5L8LA 5JEBA 3HAMA 3FMMA 3EJ1A 3UC3A 4A9SA 5KE0A 3O2MA 3ORNA 4WKQA 2BFYA 4USFA 1MP8A 5JGBA 3DS6A 4AW5A 3U8WA 1B6CB 4I3ZA 2ETMA 1W8CA 1XWSA 4RIOA 4GIIA 4IB0A 5CZIA 1T46A 4F65A 3BWJA 1J91A 4D58A 1YDSE 5JFXA 2CLXA 3AT3A 3EB0A 1KWPA 4U43A 3ZLWA 3PZHA 1YWNA 4QP4A 3NUYA 5FG8A 3U51A 5HLWA 4F9BA 5J7BA 2W06A 3DKOA 2G2IA 5KUPA 5T68A 3KMMA 2EB2A 4FT7A 2C4GA 1YKRA 5FEEA 3UO6A 3JY9A 4YC3A 2BAQA 1WCCA 5A4CA 4FR4A 3NUUA 5HNGA 5A14A 4C8BA 4NU1A 1WVWA 4QP7A 1HOWA 4H3QA 4F7NA 5HX6A 2XYUA 4LI5A 2ITUA 1CKIA 3UVPA 3FMJA 5KBRA 4HVIA 1QPEA 1OMWA 2OXXA 5DT3A 3ZDIA 4DYMA 3E3PA 3IECA 3VBTA 2V7AA 4ZXTA 5HORA 4CFVA 1LR4A 2OKRA 3AGMA 3ITZA 3KREA 1TKIA 4JDKA 2UZWE 3TZ9A 2WD1A 1XH5A 2C5NA 4R7HA 3VBWA 4PDYA 3UOJA 4CV8A 2VX1A 2ITYA 4M69B 3UMWA 4IWOA 3W2SA 2HW6A 2R7BA 3IO7A 4BICA 5C8NA 2PZIA 4BTMA 5C4KA 3QLGA 2XP2A 3SA0A 2J7TA 4O91A 3ZBXA 3B2WA 4DEHA 4BDGA 5FWKK 2C0IA 4EHVA 4DA5A 3R2YA 2J4ZA 5I4NA 2ZOQA 4FKPA 5IG1A 3PSDA 1Y8YA 4M69A 4FK3A 4EJ7A 3A7HA 4U81A 4QMPA 4UZDA 2VTNA 4QT1A 4BDBA 4HZRA 2OJ9A 3TIYA 4RVMA 4U3ZA 2VNWA 2Z2WA 3QTWA 4QYFA 3QQGA 4W4YA 3RM6A 3WZUA 4U41A 3FLZA 3QTXA 2C30A 3NS9A 5E8SA 3R9OA 2W0JA 3CPBA 3EN7A 4ASZA 1CSNA 4TYHB 3BEAA 5EW9A 2OXDA 4BCOA 4NYEA 4CG8A 5J9ZA 3SLSA 2RFSA 4E6CA 2YM5A 4QYYA 4EOMA 1Q61A 1U5RA 4CCBA 3D0EA 5L8JA 4A9UA 3Q2JA 3OVVA 3P9JA 3PXKA 2UZEA 3HZTA 4E4LA 3I7CA 5CSPA 3L1SA 2W1HA 4RBLA 1URWA 5GIPE 3ALOA 5BVOA 3MFRA 2X0GA 3GGFA 4YU2A 5H8EA 3A2CA 4YJOA 3G5DA 4B8MA 3DT1A 4K33A 4JDJA 3NYOA 4Q5HA 4NEUA 3O96A 5EM6A 3TNQB 2QG5A 1UNGA 4Y5QA 2VAGA 1J7UA 4J95A 2O63A 1OIQA 3QRIA 3BIZA 2VTQA 4MD8E 5AP3A 5FLFA 5KZIA 5CWZA 2PK9A 3EQIA 2JDSA 3KA0A 5CT7A 5AR7A 5BQ0A 5M4IA 1Z57A 4FSWA 4E26A 1ZYDA 4O38A 5AV1A 4XLVA 3CTHA 3HKOA 4KBCA 4LG4A 4LMNA 4GYGA 5TE0A 4U6RA 2J5EA 2JFLA 3RPOA 1YOLA 2B52A 2Z7SA 4KIPA 5HE2A 5L2IA 4DEDA 3IONA 1VYWA 2J0KA 2PMNX 3QA8A 3HMNA 5TO8A 2YCRA 3UE4A 4YR8A 5BUIA 3NNXA 4Y5HA 4DH5A 5E91A 4DLIA 3H9RA 4W9XA 4ZY4A 1IEPA 4E4MA 2PULA 3FZOA 4DH3A 3R1SA 1JSTA 2XRWA 1H26A 1J1CA 3MS9A 4RT7A 1Q41A 3GFWA 3NUAA 4QPAA 4CKIA 3R7IA 3QKLA 3D2KA 3ZEPA 1I09A 1Z5MA 3Q9ZA 4S2ZA 4X0MA 3TUDA 1W0XC 2HCKA 2Y6OA 3BHUA 2CNVA 3QUDA 4V0GA 4EH7A 3U9NA 3PLAE 2H34A 4XHKB 4OTDA 2ZDUA 2HOGA 2A1AB 5EI8A 3PJ2A 4EK8A 3VUKA 4QMQA 3LFAA 4I4FA 3R8UA 4LV8A 1XQZA 3TEIA 2EUFB 3JS2A 4FTRA 4IVAA 5F4NA 3VC4A 4RVLA 3PVBA 4D1XA 2WU7A 3Q5ZA 3DXQA 3MFSA 5D11A 1H28A 4EQUA 2YDJA 3DZQA 4NTTA 5AUZA 5FP6A 3LMHA 4NJDA 5KMNA 1H4LA 2HXLA 3POOA 3S00A 4DH1A 3R0TA 2PMIA 5CU0A 4YJQA 4CCUA 5I3RA 1NW1A 2UW9A 5AIRA 2XBJA 1UU8A 5K5NA 1OKWA 2YCSA 3BGQA 3KRLA 3QKKA 1YDTE 3LIJA 3R1NA 3AC1A 3UZTA 4JJRA 5CAVA 2XNBA 5ETIA 3BE2A 3MTFA 4JQ7A 5JN2A 3PP1A 2UZUE 3ZLXA 1H0WA 3HDMA 5G6VA 5LARA 4GRBA 2QU6A 4A9RA 1FGIA 1KE6A 3D15A 1U4DA 5DH3A 3LFQA 4YJNA 4F7SA 4GFOA 5TKDA 3FLQA 2XKFA 4EH3A 4DEAA 4J8NA 1JKKA 3Q5IA 3UIUA 3UPZA 4WG5A 4C4JA 1GIHA 4O27B 4CFNA 3ORKA 4OBOA 5A9UA 1DI9A 3D7ZA 4NH1A 4X2KA 4QOXA 4BI1A 4IVDA 3LCTA 4W4XA 1SVHA 3EYGA 4RJ3A 5DR9A 3II5A 5K0XA 2CGUA 5H8GA 3PTGA 4JG8A 3HMMA 3CLYA 3DV3A 3S95A 3EN9A 4WNMA 5ANKA 3ORMA 2OO8X 2WMSA 3P1AA 4FZFB 3O7LD 5EHLA 4EJNA 2VWYA 2HWPA 3KRRA 3TXOA 4LUDA 2GNFA 3QRJA 3NRMA 4QQ5A 4ZJJA 4R3CA 2NNWB 4GKHA 4CG9A 4U0IA 3HLLA 3RCDA 3AD5A 2GS7A 3COKA 5FTGA 3CBLA 3NUSA 4PDSA 3WZJA 4H39A 4NW6A 1AD5A 3OW4A 3DB8A 2XKEA 3E7OA 2PVKA 3PXZA 2A19B 5AADA 4TYJA 4FV2A 4QYHA 1QMZA 5AAGA 5GJFA 5C9CA 4QMTA 3VUMA 3UVRA 1Q3WA 2NPQA 3BPRA 4M0ZA 1VYZA 2ZDTA 4EZ7A 1OL5A 2IVUA 4M13A 3TKIA 5KMIA 1NT2A 4O83A 4EQMA 1BMKA 3ATTA 3VN9A 4D28A 4S32A 3W2PA 4OTRA 1ZRZA 5AP5A 4RIYB 2PE0A 4MD9E 3LJ0A 4IX5A 3RGFA 4YO4A 3QD0A 4EQCA 2LAVA 4MXXA 5IH4A 3FBVA 4TNBA 3DKCA 1H8FA 3PLSA 4YZ9A 3R7UA 2PL0A 2IZRA 4Q9SA 3ZO1A 5CEKA 3TNHA 4FIFA 4EKLA 2GTNA 4TWPA 4DFZE 3MN3A 4UMPA 3N4UA 4FODA 1R3CA 4O6EA 4UB7A 1QPCA 2ONLA 4RIYA 4GK3A 5CQUA 3H10A 5HI2A 4KRCA 4EH9A 3A4PA 4HNFA 3R7OA 1E1VA 3NCGA 3DAKA 5E1SA 4F1TA 4O1OA 4ALVA 3R71A 2I0EA 4O0UA 1OL6A 4M3QA 3TV7A 4F7JA 5FGKA 2WELA 3OT3A 5CSWA 3NAXA 3G51A 5CVFA 4KIQA 5CU6A 3GFEA 4D2VA 2UZOA 3K2LA 1GAGA 2BZIB 4O0TA 3F7ZA 5AUWA 5D9HA 2PVLA 2R3LA 3PIZA 4BWPA 3OWLA 3HGKA 4IACA 2FGIA 4R6VA 3DY7A 3QQLA 4BKYA 4ZZNA 2GNIA 2O8YA 4OUCA 2VTOA 3UDBA 1KE5A 2UW3A 2YLEA 4KNBA 4NM5A 1PYXA 2F9GA 2JEDA 3E7VA 3KVXA 3LXNA 5EK7A 2W1GA 4DFNA 5AUUA 5CSXA 3G9LX 5IQAA 5I0BA 3CTJA 4AZFA 4GT3A 4UMTA 5J1VA 1V0PA 2UVXA 4TXCA 3C5IA 3TCPA 1DM2A 4FV9A 3O8UA 4HPTE 2XZSA 4MVFA 2WQOA 4AN2A 2BUJA 3VQHA 3BELA 3HRCA 4AG8A 2RG5A 5EKOA 2QHNA 3KULA 3ZMMA 2C3JA 5DFPA 1R39A 1GZKA 3OTUA 3ZCLA 4PP9A 4X7QA 3PVGA 2OJIA 2QHMA 5HE0A 4EORA 1Z9XA 4YURA 4IHPA 2ZM4A 4L52A 3DPKA 4PY1A 5AM6A 4UYNA 2XEZA 4ZLOA 5FP5A 3QX4A 4EC8A 3NZ0A 3IS5A 4ZZMA 4CT2A 4RA4A 3FXZA 4C38A 2GHLA 1EH4A 5HGIA 1ZMWA 2CNUA 4DFBA 1ZWSA 3GCUA 5IUHA 3VS5A 4BB4A 3AMAA 3G33A 3I0QA 4LGHA 4D5HA 1TVOA 4D2TA 1M17A 2YIRA 2R3GA 3RWQA 4F6WA 2X9FA 3R00A 4AGWA 2XIZA 3FC1X 2QONA 4ZMFA 3Q9WA 3UNZA 2F7XE 1OIUA 3LMIA 2LGCA 5M07A 3LOKA 5JZNA 4CVAA 3MH2A 2H8HA 3R22A 4RX9A 3UP2A 4CZYB 4AGDA 2QO9A 1E1XA 1NA7A 3AMBA 4MH7A 1OGUA 3RWPA 4Y73A 3PSBA 4OGRA 5IQGA 2VWUA 2HWOA 1Q4LA 3CKXA 4XYFA 1HCLA 3RM7A 1UU3A 3NNVA 1UV5A 3FZ1A 1CDKA 5AEPA 4RX7A 5LOHA 5IA4A 4NKSA 3GXLA 2WOUA 3R8MA 2XK8A 3QCYA 4A4OA 2O0UA 3MVJA 1Q8WA 4I21A 5EQPA 4G9RA 3LXKA 4JXFA 5FTQA 3KB7A 3C4FA 4F99A 1B38A 2YM6A 1STCE 4FKOA 4RIXA 4GUBA 4ZTLA 3ZRKA 2HW7A 3BCEA 4U8ZA 3RPVA 5IDNA 2AUHA 2UW6A 3JPVA 1WBWA 3L8PA 4XG2A 2ITQA 4WD5A 4FOBA 4FE2A 5C01A 4F0GA 4QTCA 5AUXA 3QQFA 5I9ZA 4TZRA 3LZBA 3CQWA 5CYIA 5JGAA 4X2NA 4IB3A 2XK7A 2ITVA 4HOKA 4EOIA 1CKJA 4FKQA 3L9PA 4I4EA 4FUXA 4TPTA 2J0MB 4ZOGA 5IMXA 2UW4A 3DJ5A 1U54B 2XJ0A 3NUPA 3WF6A 4Z3VA 4E1ZA 1VR2A 4D2SA 5FEQA 1OL1A 3ZFYA 1V1KA 4K0YA 4JIKA 4AA5A 3OBJA 4CQEA 4M84A 1IA9A 4L7FA 4GKIA 4IDTA 4JDIA 4S30A 1BI8A 2QI8A 2XNOA 3CC6A 1ZY5A 2WTVA 5CX9A 1U54A 4J7BA 4DBNA 4XRJA 2O2UA 2OF2A 1JWHA 4L67A 1XH9A 3QD4A 5LVNA 2ZV9A 3FZTA 3ORIA 4I41A 3ERKA 3RK5A 2H9VA 3R6XA 3W2RA 4DTAA 5J8IA 4FSYA 4C33A 1NVQA 1JPAA 2YJSA 3AXWA 4BCKA 1ZZ2A 4ZZOA 5J5TA 5T3QA 5F9EA 1J3HA 5CASA 1U5QA 4MWIA 4Y95A 2ITZA 5D7AA 4O7ZA 1QPJA 5ANGA 5ACKA 3VRZA 2V22A 4YSMA 2ERKA 4UXLA 4F6UA 1OPKA 4K6ZA 3QUPA 2CHLA 1FVTA 3FEGA 2WOTA 1GOLA 1F0QA 3PA5A 5FD2A 5K4IA 4FBXA 4GK2A 4FVRA 1OM1A 2BRNA 3KY2A 4XX9A 4F9YA 5FM3A 5IQHA 2C6DA 5CXZA 4FGBA 4MXAA 3UG2A 1YW2A 3CEKA 4MAOA 5HG5A 3TTJA 3TKHA 4MBJA 5CF5A 1PXJA 2G9XA 1R0EA 3E92A 5AP0A 3DBCA 2EXEA 2GHGA 4L53A 2WB8A 1H07A 1XBAA 4M66A 2R0UA 4OTGA 4QMLA 4BCJA 4MKCA 5IU2A 3AGLA 3SOCA 4TL0A 1QCFA 3C7QA 4CT1A 2VX0A 3OUNB 3IDCA 1NVSA 3IKAA 3M42A 2UW7A 5CEPA 2FSTX 3HNGA 2V62A 4X6RA 5A4LA 2ZMCA 1IA8A 2C5YA 4A9TA 4ZIMA 2B55A 2R3IA 4HCTA 4IM0A 3IW8A 4GUEA 4C2WA 2P4IA 4HGLA 4AOTA 1BLXA 2KULA 4GU9A 4BBEA 4EYMA 2X8DA 3GT8A 4FI1A 4D0XA 4BDCA 2ITXA 5TOZA 3VJOA 3OTVA 1OL7A 4D4RA 4KINA 2HZ0A 4HYSA 4TYEA 4ERWA 3OBGA 2CLQA 4PMTA 5FRIA 4FTKA 4CFXA 3PIYA 2I1MA 5KBQA 2VTAA 3QALE 4PRJA 3ZUTA 3TACA 1PY5A 3CTQA 4ZP5A 1IAJA 3ALNA 5J9LA 1H24A 4J98A 3ZXZA 4EH6A 4FT9A 3GCSA 3MJ2A 2RFDA 3FQEA 2OZAB 3QBNA 4I5MA 4YZCA 4BWXA 2XBAA 1DI8A 4FV0A 2W4KA 3UOKA 3QHRA 4GVJA 4JRVA 2BVAA 1JSUA 2R3HA 1SM2A 2VU3A 3ZBFA 4XP2A 2UZVA 3K5VA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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