3IUCA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 5 (bip/grp78) atpase domain in complex with adp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
379
structure length
379
Chain Sequence
GTVVGIDLGTTYSCVGVFKNGRVEIIANDQGNRITPSYVAFTPEGERLIGDAAKNQLTSNPENTVFDAKRLIGRTWNDPSVQQDIKFLPFKVVEKKTKPYIQVDIGGGQTKTFAPEEISAMVLTKMKETAEAYLGKKVTHAVVTVPAYFNDAQRQATKDAGTIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKREGEKNILVFDLGGGTFDVSLLTIDNGVFEVVATNGDTHLGGEDFDQRVMEHFIKLYKKKTGKDVRKDNRAVQKLRREVEKAKRALSSQHQARIEIESFYEGEDFSETLTRAKFEELNMDLFRSTMKPVQKVLEDSDLKKSDIDEIVLVGGSTRIPKIQQLVKEFFNGKEPSRGINPDEAVAYGAAVQAGVLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70kDa protein 5 (Glucose-regulated protein, 78kDa
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 113
structure length 379
sequence length 379
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 3.6.4.10: Non-chaperonin molecular chaperone ATPase.
pdb deposition date 2009-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3iucA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3iucA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3iucA04
2J4RA 5TKYA 3VERA 5LJWA 3D2EA 5AQHA 3JS6A 3VESA 4BC4A 5AZJB 1IJJA 4CZKA 2ASPA 1GLFO 2P9UA 4XEIA 2YHYA 3U4LA 4BR2A 1BUPA 2E88A 4LC9B 5B8HA 3GG4A 1NGBA 2P9SB 3U8XA 2AP1A 3EN9A 5AQOA 3B8AX 3HM8A 2W40A 5AQRA 1T6CA 3LDLA 4CZMA 1DKGD 1MWMA 1S22A 3SLCA 1ZBSA 3L6QA 3ULEA 4CI6A 4CBWA 3P4IA 3M6GA 4K42A 4ISGA 3CQXA 2BUPA 2FLOA 2I7NA 2P9LB 1U2VB 3ZX0A 2D1KA 4CBXA 4H0VB 4DHYA 1KAXA 3ZETA 5AQUA 1RGIA 5KPTA 4I6MA 4H5RA 5AFUA 4XH1A 5AQZA 5AQLA 4M63C 3ID8A 2CGKA 4O5FA 1BOTO 3FZMA 3BUZB 1E4GT 1V4TA 5AR0A 1J6ZA 4BQLA 5JMVA 2QM1A 3HZ6A 2F9WA 5AZIB 1NBWA 2P9KB 5FPEA 3MN5A 4L3QA 4FPBA 3WQTA 4BC2A 1NM1A 3CIPA 4BR9A 4WYBA 3H3OB 2Q2RA 3DXKA 3TU5A 4BR4A 5EY4A 1SQKA 4HWIA 4BRAA 1LCUA 3IDHA 4YDUA 3QBXA 3I33A 3R6MA 3VPZA 2GWJA 3UB5A 2NZTA 2IIRA 3VENA 2P9PB 1T6DA 3CHWA 4H0YB 4B1XB 3H45C 3FLCO 4O8KA 1BA1A 1R59O 1LOTB 1SAZA 3VGMA 3AY9A 4ISFA 4FSVA 2A41A 3IMXA 1D4XA 5AQMA 4WQ4C 4NO7A 5BRDA 3O6WA 3VGLA 1NGEA 3WXJA 4E1JA 4FWMA 3CJ7A 5FPMA 4BROA 1GLEG 1T44A 3AAPA 1TUUA 3MN6A 1YUWA 5EVZA 3J8AA 4B9QA 1HKBA 2YCHA 2V7YA 4CD1A 4CJ7A 3UKUB 1HJOA 3D7EO 1K8KA 3LM2A 1Z6RA 2ASOA 4FWOA 5AQWA 3A8YA 2YJFA 3H6EA 3GBTA 2F9TA 1BO5O 4PL8A 3EKSA 4BGBA 1WUAA 4FOEA 4MO4A 1TYQB 3FFKB 3VEWA 3ZEUA 3C7NB 3A5MC 4EHUA 2VWBA 3DAWA 5EX5A 2PBDA 4DB3A 2FF3B 3KVGA 1NLVA 1HKCA 5FPNA 2FSKA 1BG3A 2P9NA 3L4IA 2HF3A 3RSEA 2D0PA 2CGJA 3VEVA 5F2RA 2E1ZA 2QWQA 3R8EA 3WUHA 3MN9A 1NGGA 1ATSA 4FO0A 5BPNA 2A5XA 2CH6A 4BQZA 4IJNA 3D2FA 5JICA 4K41A 1BA0A 2CH5A 4CZGA 4PL7A 2E2NA 1GLLO 2P9KA 1XC3A 2A3ZA 4QS8A 3BF1A 1BWFO 2BTFA 4GNIA 1KAZA 1RDWX 4BRHA 3GL1A 4H5NA 4BRCA 5BRHA 2QWPA 2Q31A 4AM7A 1V4SA 4CZHA 3GE1A 3MDQA 1P8ZA 2GWKA 3F9MA 2Q36A 1X3NA 4BGAA 3UKRB 5FPDA 4BR5A 4FWSA 1GLBG 3WEEB 2HF4A 3H46O 1NGCA 1ATNA 5AQQA 4XH5A 2A42A 4H5WA 2IVNA 2P9PA 3ZX3A 1QZ5A 1S3XA 4FWRA 5EXWA 3O1BA 4F9OA 5BR9A 3CI5A 5AQTA 3CJ1A 3QICA 4RWTA 2E2OA 2ZGYA 4BRIA 2ZWHA 3HSCA 3VEOA 3EO3A 3L0QA 5KPRA 4YDUC 3D2EB 3EKUA 4JHDB 4B1VA 4BC3A 1YVNA 3KZBA 2HMPA 3MCPA 4C23A 2P9UB 3S41A 5AQSA 4K25A 5ELZA 4JN4A 4CBUA 2P9IA 2Q1NA 3LL3A 4PKIA 4B1YB 4BRGA 3WXKA 3UKUA 4H5VA 2YHWA 2DPNA 2QWLA 1GLCG 3BP8A 3LDPA 3DJCA 1NGIA 2QWNA 3LDQA 1HPMA 3FZLA 4BR0A 4BVPA 4IZ9A 3CJBA 4ISEA 4BRDA 4DCHA 2UYTA 1WOQA 3O80A 3ULEB 2QWMA 2FF6A 1TYQA 5E26A 5CE3A 5F1XA 3C7NA 1JCEA 2D4WA 2V51B 3H1VX 4A61A 3FR0A 4H03B 1ZXOA 2HOEA 4GY2B 4B1ZA 5AZJA 3FZHA 3QMLA 3SMPA 3ZETB 4H0TB 1NWKA 2CGLA 3G25A 4BG8A 2GELA 3W0LA 3A5NC 2ZF5O 5F0XA 4B1WB 2ZGZA 4I6MB 4QS7A 1NGDA 3ATUA 3JXUA 1JCGA 4RCHA 2P9SA 2VCPA 2Q0UA 3WXIA 1QQMA 1QZ6A 5BN9A 2ITMA 1BU6O 2A6AA 4IO8A 3O4WA 4BRNA 2E20A 4EAHD 3O5BA 4H0XB 4IJAA 1QQOA 1G99A 5ADXA 3AAQA 1ATRA 4JAXA 3QB0A 5AQIA 1NGJA 4JD2B 4QS9A 1RFQA 5E84A 4BR7A 3A0IX 3CERA 3ENOA 4MO5A 4BG9A 2QWRA 2QWOA 3A5OC 4CZJA 3M1FA 2P9LA 4FPAA 4PKHA 4H5TA 1U2VA 4BC5A 3UKRA 2FXUA 5KQ8A 1NGHA 1MA9B 1HKGA 2AA4A 4CZIA 3WEEA 5KQDA 1NGFA 5AQFA 3UE5A 3MMVA 4CZEA 4EHTA 1GLDG 1SZ2A 1ZC6A 3MK6A 4BVOA 1TUYA 1EQYA 5JLHA 3SJHA 3H3NO 2EWSA 2Q97A 3U9DA 5AZIA 3IUCA 5AQGA 4JHDA 1GLAG 4BRLA 3DXMB 3QDKA 4WQ5A 3CJCA 2E1YA 3ATVA 1DEJA 3GOIA 3WXLA 3CJ9A 2Q0RA 1YAGA 1HLUA 3U9ZA 1Q18A 5I9EB 2D0OA 3FGUA 4MLEA 3R9PA 2WUSA 3EL2A 3O1WA 4H0PA 1JCFA 4H0OA 2W41A 4FWLA 3GDQA 1X3MA 3VGKA 5ADXH 1K8KB 1IG8A 4FOIA 4HTLA 1MDUB 3KHYA 3O08A 3QBWA 5AQYA 1NGAA 1BDGA 1KXPA 3ENHA 4FWQA 3C0BA 3ZEUB 4Z94A 3HTVA 2E8AA 4RTFD 2FSNA 4A2AA 5BPMA 3HI0A 3HBTA 2IVPA 2V7ZA 3SMSA 3QFPA 4K43A 1KAYA 4J8FA 2P9NB 3RSEB 4BRQA 3M3ZA 4BREA 1C0FA 1HX1A 4EFHA 3BF3A 5BREA 4KBOA 3WQUA 4PKGA 4Y0WA 5LY3A 5BN8A 1XUPO 4IXCA 3VF4A 4JNEA 3BEXA 3LM9A 4MLHA 3FE1A 3O8MA 3D2FB 3LDOA 1NMDA 5BPLA 4JD2A 5LJVA 2QW9A 1CZAN 4IWVA 5AQJA 3MN7A 4BRMA 1OKJA 3VEZA 2NRHA 5AQNA 3VF2A 1H1VA 3A5LC 5AQPA 4FWKA 3OHRA 3VOVA 1QQNA 5EOYA 4BRKA 3CETA 4FWPA 1YXQA 4BRFA 4A2BA 2PAVA 4A62A 3VEXA 2E2QA 3CQYA 4XH4A 5JLFA 2QXLA 2VYPA 4CD3A 3WT0A 2IVOA 3TPQA 3EZWA 3DWLA 3VF6A 4FL9A 3IFRA 5AQKA 1DGKN 1MWKA 4DQ8A 3DXMA 3I8BA 4BRPA 4M7YA 3W3DA 2V52B 4CZLA 2A40A 4CZFA 2KHOA 4NB4A 2GEMA 2H3GX 2YJEA 1C0GA 4FWNA 4B1UB 5AFUH 2E2PA 1GLJO 2OANA 4AM6A 2P9IB 1QHAA 1ESVA 5BRFA 3DXKB 3SK3A 3VETA 3ZX2A 5AQXA 4EIAA 1XQSC 2NLXA 3FZFA 1X9JA 5AQVA 4WQ4A 3LDNA 1Y64A 3AARA 2I7PA 1HUXA 4WQ5C 2ASMA 1U6ZA 3CJAA 3QFUA 2GUPA 5KPZA 3H1QA 3VEYA 1E4FT 3FZKA 2GTDA 1Z05A 4M7XA 2YHXA 2YI1A 2FSJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VERA 3G71N 3VESA 2QTDA 3CQ8A 3PO5A 4CZKA 2O8EA 3CC7N 4CFCA 2YHYA 4O5BA 3CFRA 2ZD1A 2ASCA 4LFAK 1T0ZA 2P9SB 1JLQA 2AP1A 3PLAA 4JRQA 3R2VA 1U48A 2QA4N 4M3RA 3ZT1A 3OBYA 1ZYWA 3HM8A 5AQRA 3BY5A 2HW3A 3LDLA 1MWMA 3SLCA 4AF1A 4CI6A 1ZBSA 5I3UA 3JSMA 4KV8A 1SKSA 1KVAA 3OYMA 2XY7A 2PFUA 1N36K 1HNIA 1Y97A 1VQLN 2I7NA 2P9LB 3ZX0A 1WSEA 2D1KA 4G9ZA 2LI7A 4E0DA 3TABA 3AVMA 3WNGA 4I6MA 4H5RA 4W5RA 3RRGA 1BRZA 4XH1A 4B3MK 3CYGA 3SV3A 4KKOA 3KHWA 2CGKA 1OH8A 3LDSA 3BZCA 4LSNA 2A1RA 4X64K 3LP2A 3DLGA 3L3UA 3HZ6A 1I2VA 2WFBA 1OVYA 4L3QA 1DLOA 4NYFA 1VQKN 5EU7A 3WQTA 4BC2A 5JS1A 1RBVA 1PE4A 2YILA 4KFBA 1LQQA 3AO2A 3K9JA 5EY4A 3QNOA 1NK8A 1SQKA 1SUQA 4E7JA 4BRAA 3MX5A 1LCUA 1OZZA 3I33A 1J53A 4A57A 1BQMA 2GWJA 2NZTA 1YVUA 3ALYA 3P5JA 5GIOA 5JVGL 4O0JA 2P9PB 3CHWA 4FK4A 4MDBA 4DSEA 2HVIA 1LOTB 1QSYA 1EP4A 3I55N 2B6AA 1D4XA 3CMEN 5BRDA 4F2SA 3THYB 1NGEA 4FWMA 3HPGA 4JI5K 1GLEG 1S1UA 2W00A 1K73O 3E9LA 1T44A 3AAPA 2YCHA 3LANA 2DTUA 2HHWA 3CPWM 5LMUK 3S3MA 2KPYA 1HNVA 3OTOK 1HR0K 1NKCA 2KQ2A 3GBTA 1N33K 1BO5O 3EKSA 2FBVA 5C12A 1TYQB 4CJ4A 2E6LA 3A5MC 4EHUA 2VWBA 4HVJA 3DAWA 3I0RA 1I6GA 4BDYA 1VAZA 1HKCA 4KO0A 1YHQN 2O8DA 3L4IA 4JEPA 1KFSA 2HF3A 5CZ2A 3RRHA 1Q82O 2E3FA 4DSKA 4KHSA 4CK1A 2CGJA 4Q5VA 4CJRA 3MN9A 1NGGA 2BANA 2CH6A 2C1GA 1LAWA 3O9TA 2KBHA 4BE1A 2OTLN 4B9VA 4YHHK 4ELUA 3MXMA 3ISNC 1C55A 3V6DA 1RT5A 4IBNA 4BE2A 1GLLO 4PA1A 2A3ZA 4QCLA 3DRRA 2HHSA 1VK0A 2WOMA 1KFDA 1IKXA 1NPIA 2VGMA 4UADE 1XRSB 1ZUTA 3KWGA 2NRVA 4CZHA 2A7TA 3MDQA 1P8ZA 2Q36A 4L8RB 4BGAA 3UKRB 5FPDA 3AA3A 1OVQA 1KQSM 3H46O 3KP0A 5AQQA 3NAEA 2P9PA 3ZLJA 2D5RA 4FLXA 1QZ5A 3ZSXA 3IKMA 2B3CA 4FJ5A 3CCEN 4DR5K 2HBKA 4F9OA 3L2QA 5BR9A 3CI5A 3T1YK 3QICA 2E2OA 2ZGYA 4NXMK 4CEBA 4PHTX 3HSCA 3P31A 3CD6N 3VQQA 3THYA 2NRZA 2VQFK 4CFAA 3KD5E 3D2EB 4B08A 3KZBA 4B9MA 1HQUA 4OJRA 2OCEA 4B8AB 3S41A 3VQ9A 4JN4A 2YHAA 3DOLA 4O0IA 2YHWA 2DPNA 5MLCQ 2FBYA 3LDPA 4FYDA 1HPMA 3FZLA 1QS4A 4BVPA 2KFZA 3HSTB 3RMAA 2LN8A 1FW6A 3ULEB 3MAQA 2QWMA 4ZTJA 4IO9L 1LAVA 1TYQA 2D4WA 4KREA 4I2QA 2E3GA 4H03B 4FVMA 2OA8A 2JDQD 5DK5A 5AZJA 3QMLA 2NUBA 3SMPA 3SQ2A 1UOCA 4JLHA 3G25A 1Q86O 3W0LA 2ZF5O 4B1WB 1NGDA 4O8UA 3JXUA 4X66K 3SPYA 2ZJRL 2Q0UA 1QZ6A 4JKGB 1ZFUA 3HYFA 1T8EA 2D0AA 3O4WA 4BRNA 5HP1A 3TSPA 1G99A 1P0AA 5CZ1A 4C8NA 4KHPK 2M8BB 3QB0A 3VQPA 4KI6A 4HHTA 4QS9A 1RFQA 5E84A 4BR7A 4GV6A 1W7AA 3KD1E 1LQHA 1VQ7N 3CERA 2KZZA 1JL1A 3L8BA 3HPOA 2HNDA 2N2RA 3A5OC 1N32K 4PKHA 4BC5A 3DYAA 1TAUA 3UKRA 2FXUA 1HKGA 4FCYA 4O55A 4NCAA 3ASMA 4DTOA 4OVLA 4LY7A 5AQFA 3UE5A 3V9WA 2BE2A 3MMVA 4CZEA 4EHTA 4DR6K 4DR2K 1ZC6A 5J2MA 5JLHA 3LP0A 3SJHA 3A2FA 2YC1C 4DS4A 1ASUA 3SUOA 4X65K 4H8KA 3CYMA 3C95A 4CF9A 1OH5A 4CJ5A 3CCJN 5AZIA 1GOCA 1RT6A 3KLFA 1TK0A 5AQGA 4BRLA 3DXMB 2HHXA 1RTDA 4WQ5A 2UUBK 4KH5A 1YAGA 1E3MA 3KC6A 4MLEA 3TAEA 4DSIA 3IAYA 1JCFA 4FZYA 3RWUA 1X3MA 2YV0X 3EE9A 3OS2A 2QKKA 1UA0A 4HTLA 1MDUB 2ZJQL 3KHYA 3O08A 2Z1GA 1KXPA 1BDGA 3ENHA 4AHVA 4CF8A 4CEZA 3KLGA 4C8OA 3KIOA 4JI3K 2FSNA 2O8FB 4IDHA 5M1OA 2IVPA 3ZSYA 2GBZA 2V7ZA 4DTSA 2JWLA 4K43A 4B9UA 4KHUA 4CJKA 4GMJB 4HTUA 4KBOA 3SAHA 4CHPA 4C8KA 1D5AA 4E7KA 2AJQA 4WFAL 3VF4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3VER A;  3G71 N;  3VES A;  2QTD A;  3CQ8 A;  3PO5 A;  4CZK A;  2O8E A;  3CC7 N;  4CFC A;  2YHY A;  4O5B A;  3CFR A;  2ZD1 A;  2ASC A;  4LFA K;  1T0Z A;  2P9S B;  1JLQ A;  2AP1 A;  3PLA A;  4JRQ A;  3R2V A;  1U48 A;  2QA4 N;  4M3R A;  3ZT1 A;  3OBY A;  1ZYW A;  3HM8 A;  5AQR A;  3BY5 A;  2HW3 A;  3LDL A;  1MWM A;  3SLC A;  4AF1 A;  4CI6 A;  1ZBS A;  5I3U A;  3JSM A;  4KV8 A;  1SKS A;  1KVA A;  3OYM A;  2XY7 A;  2PFU A;  1N36 K;  1HNI A;  1Y97 A;  1VQL N;  2I7N A;  2P9L B;  3ZX0 A;  1WSE A;  2D1K A;  4G9Z A;  2LI7 A;  4E0D A;  3TAB A;  3AVM A;  3WNG A;  4I6M A;  4H5R A;  4W5R A;  3RRG A;  1BRZ A;  4XH1 A;  4B3M K;  3CYG A;  3SV3 A;  4KKO A;  3KHW A;  2CGK A;  1OH8 A;  3LDS A;  3BZC A;  4LSN A;  2A1R A;  4X64 K;  3LP2 A;  3DLG A;  3L3U A;  3HZ6 A;  1I2V A;  2WFB A;  1OVY A;  4L3Q A;  1DLO A;  4NYF A;  1VQK N;  5EU7 A;  3WQT A;  4BC2 A;  5JS1 A;  1RBV A;  1PE4 A;  2YIL A;  4KFB A;  1LQQ A;  3AO2 A;  3K9J A;  5EY4 A;  3QNO A;  1NK8 A;  1SQK A;  1SUQ A;  4E7J A;  4BRA A;  3MX5 A;  1LCU A;  1OZZ A; 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