3IV3A

The structure of a putative tagatose 1,6-aldolase from streptococcus mutans
Total Genus 129
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
129
sequence length
329
structure length
329
Chain Sequence
MILSQQKYNYLAKVSDSNGVISALAFDQRGALKCLMAQYQMKEPTVAQMEELKVLVSEELTPYASSILLDPEYGLPAAQARDREAGLLLAYEKTGYDANTTSRLPDCLVDWSIKRLKEAGADAVKFLLYYDVDGDPQVNVQKQAYIERIGSECQAEDIPFFLEILTYDETISNNSSVEFAKVKVHKVNDAMKVFSAERFGIDVLKVEVPVNMVYVEGFAEGEVVYSKEEAAQAFREQEASTDLPYIYLSAGVSAELFQETLVFAHKAGAKFNGVLCGRATWAGSVQVYMEEGKEAARQWLRTSGLQNINELNKVLKTTASPWTEKVSVG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
publication title The Structure of a putative tagatose 1,6-aldolase from Streptococcus mutans
rcsb
source organism Streptococcus mutans
total genus 129
structure length 329
sequence length 329
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2009-08-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3iv3A00
1PV8A 3NEVA 3MHUA 4NX0A 1SU5A 3PB0A 4LWWA 1LYXA 2ZTJA 5GVJA 3W1AA 3W7LA 1Q6RA 4UR7A 1K7FA 5I3IA 5AHIA 3TDFA 1WOAA 5K2ZA 3TJLA 2G97A 4K38A 3NZRA 3LM7A 2CZDA 2VFEA 4TO8A 4BFAA 4HNVA 1TPUA 4IPIA 1OYAA 2RDUA 1NF0A 5G1YA 3BGJA 2V81A 3TFXA 4OHQA 4KWWA 3EWZA 1ALDA 2O7SA 1H60A 2JKEA 1LZOA 1UUOA 1ZCOA 3DFPA 3C2FA 3GKAA 1F74A 4UFJA 2FIQA 5G5IA 3P80A 2ZBTA 1YXDA 4QJ1A 1QDSA 5HUPA 1FUYA 1K02A 4Q33A 2A5HA 3PS7A 3CIWA 1H61A 4TIMA 4CCCA 2VELA 3PR2A 1VPXA 3CIXA 5F1UA 3C4UA 4OU1A 3UD6A 1X1OA 3VKJA 3SY5A 4WXYA 4X3ZA 2D73A 1Z42A 2CU0A 2QAPA 3W7CA 2A6NA 1W37A 2NWRA 5BRBA 3DI0A 4JTLA 3DKLA 3EX2A 2AAMA 4Z1CA 4EOUA 3TSMA 3DENA 3TC6A 3BLEA 4JYEA 5BW6A 5LHEA 4I7UA 1GQNA 3B0UX 4YMZA 4TU1A 3TK7A 1OX6A 3DZ1A 5G4WA 2UV8G 5DBTA 5K9XA 2YYUA 3VI2A 1EPXA 3A5FA 3N34A 1EA0A 4AMAA 3WJZA 4R33A 3IGXA 5BMXA 5D2XA 2AQWA 2QJGA 1R2TA 4RZ5A 1JULA 3LCHA 2RDWA 4BWLA 5LNWA 3LOTA 4UCGA 5HWJA 3KRUA 4RV8A 3MP3A 2ZZ4A 3SZ8A 3UWQA 2NUWA 1GG0A 4N9DA 4MJMA 2QUUA 3E49A 3PWAA 4O11A 3LDVA 3NQ2A 4AHOA 4PEKA 1AL7A 4GC4A 3UNDA 1ZJIA 1LRNA 2CLMA 2ALDA 4KFOA 4O10A 4LOCA 4P61A 3TXZA 4LUJA 2Y62A 3G1DA 4JTKA 1AW2A 5U4NA 4KWVA 4OV9A 2V0TA 3C2VA 3FKRA 2W0UA 5LSMA 5D33A 3B8DA 4UTJA 3H53A 4E2BA 3S9YA 1PCWA 2TYSA 3TXVA 3T40A 4GXMA 3I68A 2HSAA 1XC4A 1OABA 4Z1BA 4MYXA 1XUUA 4RJEA 5EY5A 1FXPA 1VYRA 1ICSA 4K7VA 1TPB1 2GQ9A 1RPXA 2VOMA 4IPJA 4EVZA 5D2TA 3G1HA 5FESA 2FB2A 2XN1A 1EUAA 5KINA 3N9RA 4PA8A 3W7KA 4HSNA 2FTPA 3GNNA 2EGZA 3ELFA 4MKNA 2WNZA 1WQ5A 3W7OA 1SO6A 2Z6JA 3W73A 1SZGA 4JTJA 3TIMA 5FEWA 3PULA 4G1KA 3NQ7A 3WK2A 1S5VA 3WJYA 3U8GA 1GVFA 1LOQA 3L66A 3NVTA 3IIVA 4FB7A 2DZVA 5KSWA 3GDRA 3GR7A 4WQ6A 4R34A 3THQA 3TNOA 2E6DA 2J9YA 1Z41A 4M7TA 4TMCA 2YR1A 1JCJA 1JR1A 2ISVA 1WAUA 5EYWA 6TIMA 3MMTA 4WY0B 2QCEA 1FCBA 5CSRA 1N8FA 1TTJA 1LDCA 2C6QA 1UBSA 4UTTA 1KV5A 1YTDA 3G1FA 3R8RA 1AW5A 3L0KA 2EKCA 3LCIA 4UTUA 5AYXA 1M5WA 3KVLA 1H62A 4BR1A 3GZ3A 3N14A 1D3HA 4ONVA 4N9CA 1LOLA 3UY7A 3A22A 4UTWC 4CQ9A 4NXSA 3HG5A 5CZJA 3TUUA 3NG3A 3MYOA 5AHEA 3IGUA 4JDBA 4LS2A 1VLIA 2TMDA 3IVUA 1I2OA 4AF0A 4HPXA 1EP2A 3LRLA 4JX4A 2PURA 3RFAA 1JCXA 5BMWA 2E09A 4TMBA 1KLYA 1WX0A 3HMJG 4FNRA 1T0OA 4MZYA 3CTLA 3SFKA 3GXTA 3E0IA 1OYCA 3UY8A 1LBLA 2GJNA 3IIZA 3O06A 4MJZA 3EX6A 3G1VA 4WOZA 3B04A 2PRHA 3B4UA 3IEBA 4FF7A 1KFBA 1KTCA 1VCFA 3CB8A 3I7QA 1TRIA 3SSJA 5C5YA 3HB9A 3ZWSA 3DFOA 2ABBA 1W3NA 1FCVA 1FCQA 3MWAA 2VEKA 4O14A 4FX7A 1KM4A 2VFHA 4IMFA 4XBKA 1FY6A 3W6YA 1MEIA 3EEGA 4M6PA 2WPBA 2ATMA 3TQKA 3DGRA 3NR0A 1THFD 5K4XA 2WJZA 4K37A 5IBXA 1GEQA 3SI9A 3LHTA 3ZFHA 4WY0A 4IGHA 3ZR4A 4JIQA 1IIGA 5I3GA 5CZTA 1I8JA 3LRKA 5AC7A 1QCWA 3QF0A 1GTEA 1VH7A 3F4WA 4TX9A 1Q6QA 5LNRA 3W07A 3W9ZA 3LCGA 2CLKA 1FX6A 3NM3A 3O1NA 4LS0A 1UB3A 1TPH1 5AFDA 1EUNA 3P8JA 2C3ZA 1WOBA 1EIXA 4QIUA 3SIZA 4ORIA 1R30A 1FCUA 3Q58A 1VR6A 1E51A 4PODA 3G8EA 2QAFA 3GK0A 4LS1A 4QQ3A 2V2DA 1F05A 3W84A 5E1QA 3CWNA 3TROA 3G1YA 1D9EA 4RCXA 3EKZA 4Z0JA 2DZPA 1DJQA 1DQWA 3HPSA 3GX9A 4PCFA 4WXZA 3ATZA 1JCMP 3LV5A 3S42A 1DHPA 1ML1A 3KVMA 3FJLA 1EWEA 4HNUA 3EB2A 2XN2A 3RU6A 5CGQA 1G7VA 5HNRA 3S5NA 1H1YA 1SFLA 4CCDA 1U83A 1O5KA 3LBMA 1TYGA 1FBAA 1OF6A 3Q37A 3LI1A 1XM3A 2LLEA 2Y7GA 3W83A 3W2UA 1XCFA 2C15A 5G4EA 2B4GA 3VE9A 1ME9A 4QITA 2NZLA 3DBPA 1TMHA 1X6UA 3G8RA 3NPWA 3MO7A 3EKLA 4DELA 3TAOA 1H7XA 1ME7A 4NJHA 4PL2A 4LRTA 4O15A 4LT9A 5C54A 1IXPA 5G1TA 4O28A 4UIOA 5I3JA 3NQ6A 4BWLC 1RQBA 1YPIA 4ZZ9A 4MFDA 1XBYA 2NX1A 3I7SA 3W74A 3FIGA 2YW3A 2I14A 4LU0A 3BO9A 3MHGA 1UCWA 3ZWTA 2WSYA 1FQ0A 3TW6A 3YPIA 3EWUA 1KW1A 2QF7A 4UMCA 5A5WA 4NJGA 2ZRWA 4P2VA 1L6WA 3IIPA 1ME8A 1ZAIA 1VLWA 3W88A 2YFNA 2BXVA 1OFQA 1H63A 4AWTA 5DXXA 1I2QA 3LHUA 2ISWA 4M6QA 4AXKA 2YXGA 2OX1A 2V9DA 2ZZ1A 3MYPA 1BWLA 1IGSA 1P0KA 2QDGA 1S3HA 1B4KA 3M1ZA 1W5OA 3A21A 8TIMA 3UXAA 5E93A 5FF4A 5CG7A 5AB3A 3HO8A 1QR7A 2BWGA 4ZQRA 5KZEA 1TPFA 1EX5A 3QPYA 2J27A 3KRZA 2J24A 3L0NA 1JQXA 4EF8A 1W8SA 2QKFA 3QMSA 4RLIA 1B9BA 2CFFA 1W54A 1OFPA 3PBWA 3SR7A 2DZSA 3HGRA 4KFNA 4NXKA 2V82A 1SSGA 3B0PA 4NU7A 3M7WA 4HHPA 2JK2A 2FQIA 3PUOA 2ZRXA 3R12A 1F6KA 2Y7EA 1OFRA 4AH7A 1U5JA 1LORA 3I7RA 3N2XA 4FXRA 1W1ZA 1O94A 4RX0A 5F2GA 3DHDA 2FFCA 4JTTA 4UMAA 4DBDA 3EX1A 4JNMA 2VFFA 2GJLA 3IGSA 3CEUA 2TSYA 5HWMA 2PCQA 2J9ZA 2V2CA 3KVJA 1JQVA 4QNWA 4NNAA 1K7EA 3LV6A 1UUMA 2R8WA 1BEUA 4GUIA 4DO5A 3TMQA 2EHHA 1L6SA 4IWWA 3TSDA 3QMRA 4DEFA 3B06A 1G7UA 5F4XA 3HBLA 2ABAA 2X1TA 1W5PA 4LVAA 3KAOA 4AHPA 4YCOA 2YW4A 1TPVA 2GVGA 4UC5A 1JJKA 4Y6GA 1KV8A 2QEZA 3BVJA 3G0SA 1GOXA 3JS3A 5A8GA 4O54A 2Y85A 4Q32A 2W6RA 1KFLA 5F4WA 4MZ8A 2Z0IA 1PCKA 3W7IA 1YPFA 4JIPA 4BI6A 2QJHA 4KFPA 1M6JA 3N73A 4IMEA 3LCFA 1WV2A 3G22A 3NM1A 1CI1A 4L4MA 1KTBA 4N2YA 4RKAA 1ZHAA 1VHNA 1OX4B 2V30A 4GWEA 4LC6A 4DO6A 4CLMA 3EXTA 4LNYA 4UTLA 3ABRA 1YLVA 5K4ZA 1SZEA 2YCEA 3L21A 3MP4A 2GUUA 2Q3RA 1BWKA 2I9EA 3A9IA 2H90A 3G1SA 1G67A 1C8VA 1I2PA 2EF9A 1S5TA 3O63A 4FXSA 1OFDA 3NQVA 4WUIA 4ORMA 3P62A 4IUOA 5L6UA 1OK6A 3LHVA 2DJXA 3RK8A 1TV5A 1R2SA 5HQEA 3DH7A 4M5PA 4JY9A 5L9FA 2YDAA 3BG5A 1WA3A 1F2JA 2ZRUA 1A53A 4I9AA 3G24A 1L6YA 1P5BA 2BZNA 2VFDA 4ZQCA 4UTKA 4NZJA 2G96A 2ZA1A 2DZWA 1ZAHA 4AAJA 2Z6IA 5IBXC 5KZDA 4UMBA 5DN1A 3W7RA 5I3KA 1OYBA 4JTHA 4UFLA 3C2EA 4NJIA 3UZ5A 4DPQA 3LX9A 3JRKA 4RR4A 3P8IA 5J5DA 3HG4A 4ADUA 2DU2A 5KMYA 3NQFA 4MZ1A 4H6KA 1J5TA 1DV7A 1EB3A 4PTNA 2YSWA 3HJZA 3P7YA 2CLHA 1XBXA 3LLDA 5EPDA 1N55A 4HNTA 2GPTA 1W5QA 3W23A 1TQXA 1HL2A 4PC8A 3HOJA 3W2KA 5FF7A 3W1UA 4CNPA 1LTDA 3HPXA 4MYAA 2QCNA 1TSIA 2FDSA 3DU0A 3A24A 2QCLA 2F7FA 3GDMA 1AK5A 3GKFA 2OMAA 1VCGA 2XN0A 1OX4A 4QAIA 4ZMGA 3ABOA 3LTYA 3H54A 3MI2A 2E6FA 2DZUA 2WNQA 5D04C 2CLEA 1K8ZA 1FWNA 3ABSA 4GFSA 4DF1A 3TW7A 1TPEA 3OA3A 3MUXA 1PHQA 5F4SA 3DFTA 2RDTA 2CZFA 3JR2A 3PF3A 3W86A 4XZ9A 4CQAA 1RQEA 3E96A 3WK0A 5ABTA 2WO5A 2WV8A 3G0UA 5F1VA 4FHAA 3L2IA 3CPRA 3I65A 1XBVA 3W1XA 2C14A 3STCA 3E02A 2HMCA 5FF0A 3LBCA 3W71A 4O17A 2VC6A 2WKJA 3THAA 4WY0F 1SZFA 1SZNA 4FX8A 3W7NA 4H4IA 4JTGA 3U6WA 1ONRA 3NZ1A 3R13A 2ZA2A 3S5OA 1WXJA 1QFEA 4E2DA 5LZLA 1KM1A 1NFBA 3CWOX 1P0NA 2C13A 1L2UA 4OT7A 3L9CA 3NA8A 4AVFA 1VC4A 4O50A 1OVDA 2YFOA 3GIYA 2HS6A 1I2NA 3QQ1A 5CPMA 2Q3OA 5FEXA 5G2WA 1TV8A 5BNKA 3NL3A 3HF3A 1XUZA 1XBZA 1F5ZA 3W7PA 2ZA3A 5H2ZA 4MIMA 1SW3A 4LUIA 5EKYA 4ZQPA 4HN4A 5KITA 3PG8A 4FNSA 1XL9A 3MHFA 3CEPA 1AG1O 2Q8ZA 2WOQA 4WOQA 4CCEA 4FNQA 4RK8A 3P84A 4JEQA 3M5ZA 1MXSA 3W2LA 3WK3A 4UTMA 4JTIA 2A0NA 5D32A 2C16A 1SO5A 1G4TA 1TO3A 3W2JA 5LKYA 2OCZA 4JX6A 2A21A 1H7OA 4S2BA 1GVSA 1P1XA 1AMKA 2QUTA 1RQHA 3I6RA 4AHQA 2CLLA 4M19A 1WYIA 3QZEA 5F2IA 4A22A 1LROA 4BI5A 2CLIA 5K7JA 4O0KA 2Y7DA 3PUDA 1DL3A 1T8XA 4ZQOA 2PRLA 3QMTA 5EBUA 1TJRA 3NL5A 2HS8A 3GLCA 3QW3A 5TQLA 3LHYA 3TV8A 4K39A 4Y96A 1JRCA 1KM3A 3BG9A 5HMSA 4O19A 3G1XA 2QJIA 3BW4A 4PL1A 4S1FA 3QRHA 2X2GA 1MSSA 4N4PA 5D2YA 1CX9A 5D37A 1TJPA 3LXAA 4O1AA 4UNLA 3BGGA 4UXDA 4FEZA 4N4QA 2P1FA 5AHNA 3LHWA 2R94A 3MP5A 2QCDB 5MHBA 1VYSX 4JGDA 4O8RA 1H5YA 3O6DA 4BF9A 2PC4A 3N3MA 4XUGA 4JICA 4WD0A 3S5YA 5U7SA 3D0CA 1KM6A 1RD5A 1AW1A 4LTSA 3IVSA 1VHCA 5C55A 1F6PA 2B7NA 3T78A 1OF8A 5LNUA 1VJIA 3L5MA 3P82A 3W1PA 2A7NA 5DY2A 5D09A 3T7VA 1EP1A 1H51A 3DFSA 1ICPA 1H7RA 3QH2A 1TCDA 3DAQA 4NT0A 5AOUA 5DLCA 1XKYA 2V5BA 3NQGA 3INPA 3EWWA 3A23A 2A1YA 2ZZ7A 3C52A 3O6CA 4NNCA 3LXCA 5D03A 2O7QA 2QUVA 3W7QA 3OEXA 3HGOA 5DXYA 5F2MA 3LB0A 1SO4A 2CW6A 2P0OA 3TFCA 5HINA 3C8FA 1TV7A 1JUKA 2A4AA 1T99A 4OWGA 3NPXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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