3JXUA

Crystal structure of the human 70kda heat shock protein 1a (hsp70-1) atpase domain in complex with adp and inorganic phosphate
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
AAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILM
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 kDa protein 1
publication title Crystal structures of the ATPase domains of four human Hsp70 isoforms: HSPA1L/Hsp70-hom, HSPA2/Hsp70-2, HSPA6/Hsp70B', and HSPA5/BiP/GRP78
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-09-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3jxuA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3jxuA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3jxuA04
3CJ1A 5LY3A 4BR9A 2EWSA 4MO4A 5EOYA 4FWQA 1T44A 3CIPA 2E2QA 3D2FB 4ISFA 4M63C 5B8HA 3VEWA 4BRNA 3O8MA 4B1UB 1GLAG 3DWLA 4HTLA 3H1VX 3CI5A 2CGJA 3IMXA 3MMVA 1HKBA 3D2EA 3SJHA 5I9EB 4DB3A 1GLCG 3UB5A 2VYPA 5AQKA 2ASPA 3VEZA 1V4SA 1YXQA 3ID8A 4EHTA 5AQMA 4QS8A 4B1WB 4BC2A 3LM2A 3W0LA 1GLLO 3C7NA 4PKHA 2YCHA 1YUWA 3ZEUA 3I8BA 3EKUA 4BRPA 3QDKA 4EFHA 3KZBA 4H0OA 3L0QA 3LM9A 3ENHA 2BTFA 3ENOA 1KXPA 5FPEA 5AFUA 2NZTA 1KAZA 5AQJA 2P9NA 3O5BA 2QM1A 4BVOA 5E84A 4F9OA 4FWPA 3FFKB 3MK6A 2V7YA 1U6ZA 4FOEA 1NBWA 3FZFA 5AR0A 1NGBA 2NLXA 1TUYA 3CHWA 4CZIA 1BO5O 2ZWHA 5JMVA 4B9QA 1ZBSA 2D1KA 4FOIA 3VEVA 3DXKB 4CZMA 3FE1A 4FWNA 5ELZA 1HX1A 5KQ8A 3RSEB 4A2AA 4FPBA 4NO7A 4BRIA 4O5FA 1WUAA 5JLHA 2YHYA 4H5VA 1WOQA 1HJOA 3FR0A 4RTFD 2D0OA 3AY9A 5AQPA 3VGKA 4Z94A 3U9DA 4FWLA 1QQNA 1GLDG 2GUPA 3H3NO 4BR4A 2GEMA 3I33A 3WQTA 3AAPA 4H5NA 3U9ZA 4XH1A 2Q0UA 3A5OC 4JD2B 2F9WA 3FZKA 2E1YA 4E1JA 3UKUB 1X9JA 1YVNA 1NGJA 1P8ZA 5AQYA 1HKGA 3CETA 4JHDA 3CJAA 4JAXA 3U4LA 3FLCO 2DPNA 4FWOA 5BPMA 3W3DA 3SK3A 4BC4A 2A6AA 3ZX3A 1DKGD 1V4TA 4BR2A 4FWMA 5ADXA 2Q0RA 1QZ6A 3O1WA 4H03B 1XUPO 3IFRA 1ESVA 3VGMA 3VENA 5AQNA 2FF3B 3O08A 1NGDA 1R59O 2ASOA 2CGKA 2A41A 3ZX0A 5AQOA 3BEXA 2VWBA 2IVPA 3VEXA 3VETA 1TYQB 4BG8A 3ZX2A 3ULEA 3QMLA 2P9UB 2GELA 3VGLA 3ZETA 4BREA 4ISGA 3MCPA 3O80A 5AQHA 5F0XA 3C0BA 1LCUA 5EX5A 4CJ7A 3FZHA 5CE3A 4H0YB 3D2EB 2J4RA 3QBXA 4FSVA 3JS6A 2P9PA 3UKRA 5FPMA 3M3ZA 3DAWA 3P4IA 4Y0WA 3CJ7A 2HOEA 5LJVA 1NM1A 3LDLA 4IWVA 2FSJA 1RDWX 4CZEA 5EVZA 1QQOA 5F2RA 4M7YA 1TUUA 3C7NB 2CH6A 5JLFA 4H5TA 4HWIA 3LDOA 3ZEUB 2ZF5O 3TU5A 4BR5A 1SAZA 2AA4A 4PKIA 4FPAA 1BG3A 3QFUA 2FF6A 5FPDA 4IO8A 1RFQA 1MWMA 1ZC6A 4CZLA 4A62A 5AZIA 1Y64A 2P9NB 3O4WA 3EZWA 2P9KA 3MN6A 2E2NA 2YI1A 1DEJA 2ZGZA 4BRAA 3DXMB 1HKCA 4BRCA 4J8FA 2QWLA 2YJFA 4PKGA 3GOIA 4BRQA 4CBUA 5AQIA 5AFUH 3CJ9A 5AQUA 3L4IA 4NB4A 2Q97A 2A42A 3MN9A 3AARA 4BR7A 2WUSA 4BC3A 4MLHA 4DQ8A 5TKYA 2HMPA 4MO5A 2E2OA 3TPQA 3L6QA 3A0IX 4IZ9A 4BROA 4CZHA 1X3NA 5EY4A 4BVPA 3ATVA 4I6MA 1XQSC 3MDQA 4CBWA 3U8XA 1JCGA 2W41A 3HM8A 2D4WA 3QBWA 1BOTO 2ASMA 2W40A 5EXWA 4BRMA 3KVGA 2E8AA 4FWKA 4CZFA 4JHDB 2GWKA 3EKSA 4MLEA 2QXLA 4RWTA 1NGHA 1NGFA 5AQQA 1NGEA 4GNIA 1IG8A 3H46O 5AQWA 1BA1A 4BQZA 2HF3A 4H0PA 4BRKA 4CZKA 4RCHA 3WEEA 2P9IB 3LDPA 4FL9A 3H1QA 1GLEG 3WXIA 3MN7A 1ATNA 2IVNA 5JICA 3CJBA 2IVOA 3H3OB 3UE5A 3ULEB 5LJWA 3A5LC 1JCFA 5BREA 4AM7A 2P9LA 3IDHA 3ZETB 1K8KA 1SZ2A 3CQYA 3BF3A 2FSKA 5AQTA 3VF6A 1BU6O 1C0GA 4IJNA 3M6GA 1OKJA 4BRGA 4BR0A 4WQ5A 1BUPA 2P9SA 1ATRA 1CZAN 1RGIA 2P9PB 5KPTA 3UKRB 2Q2RA 5BR9A 3FZLA 3WQUA 1ZXOA 4CD3A 3KHYA 5AQSA 3EL2A 4XH4A 3VF4A 3HBTA 2V51B 1U2VA 3HZ6A 1Q18A 3SMSA 4WYBA 4JN4A 2PBDA 4DHYA 3SLCA 1GLFO 4EIAA 4B1YB 3MN5A 2PAVA 4EHUA 2FXUA 3WUHA 2CGLA 4CZGA 3BF1A 1DGKN 3F9MA 2Q1NA 4XEIA 2HF4A 2Q31A 5AQZA 1E4FT 2IIRA 3LDNA 5FPNA 4PL7A 5AQVA 3JXUA 3VERA 2A40A 2QWRA 3VESA 1NMDA 1Z05A 3H6EA 2QWQA 3WXLA 4H5RA 3CQXA 3GBTA 4IJAA 2QW9A 2A5XA 5KPZA 3GE1A 2BUPA 4FO0A 3WT0A 2FSNA 2QWNA 3S41A 3VEYA 5KQDA 5AQLA 1TYQA 4B1ZA 1QHAA 3BP8A 4YDUC 3B8AX 1NGGA 2P9UA 3CJCA 1BA0A 2NRHA 4KBOA 2YJEA 1HUXA 2AP1A 4I6MB 1BWFO 2I7NA 1NGCA 2UYTA 2YHWA 4B1XB 5AZJA 5BN9A 3WXJA 4BGBA 4BGAA 4DCHA 2GWJA 3EN9A 4WQ5C 5BRHA 2E2PA 3VEOA 4BRHA 4QS9A 1X3MA 3CERA 3D2FA 3WXKA 4JNEA 4H5WA 1E4GT 2CH5A 1EQYA 1D4XA 2D0PA 2ITMA 4WQ4A 3GL1A 4M7XA 5AQXA 1KAYA 3ATUA 5AQFA 4AM6A 3VOVA 4BRDA 3WEEB 2E88A 3FZMA 4XH5A 1GLBG 1J6ZA 4FWSA 3SMPA 3A8YA 2QWOA 2F9TA 3M1FA 3OHRA 4FWRA 1HLUA 4CD1A 2P9LB 3DXMA 4K42A 1K8KB 4CZJA 1NGAA 3QB0A 4BC5A 1HPMA 4H0VB 2QWMA 3VF2A 3EO3A 1QZ5A 2P9SB 4K25A 4C23A 3J8AA 4K41A 4H0XB 5BRDA 3R8EA 5AQRA 1BDGA 5E26A 2QWPA 2VCPA 1G99A 5ADXH 3IUCA 4L3QA 4YDUA 5BRFA 1NGIA 3H45C 3R6MA 4A2BA 1KAXA 4IXCA 4PL8A 4BQLA 2KHOA 1U2VB 4EAHD 4GY2B 3QFPA 3R9PA 3HTVA 5BPLA 3GG4A 5BPNA 2ZGYA 3DXKA 3O6WA 1MA9B 4A61A 4K43A 3RSEA 4H0TB 1MWKA 1S3XA 3HSCA 3O1BA 2FLOA 2I7PA 3A5MC 4BRFA 1XC3A 3G25A 2YHXA 3FGUA 3HI0A 5F1XA 1T6DA 3QICA 3LL3A 2H3GX 1YAGA 4BG9A 4QS7A 4B1VA 4CI6A 2GTDA 2V52B 2OANA 1GLJO 5KPRA 1ATSA 1C0FA 1JCEA 2Q36A 1LOTB 4JD2A 4WQ4C 2V7ZA 4ISEA 3A5NC 3LDQA 2E1ZA 4O8KA 1IJJA 4CBXA 2E20A 5BN8A 3UKUA 2P9IA 5AZIB 3D7EO 2P9KB 3DJCA 2A3ZA 4LC9B 1Z6RA 3BUZB 1NLVA 1MDUB 1QQMA 1S22A 3GDQA 3AAQA 3VPZA 1T6CA 5AQGA 1NWKA 1SQKA 5AZJB 1H1VA 4BRLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJ1A 4CJPA 4BR9A 4E72A 4MO4A 4OLAA 4FWQA 4DS4A 1VSDA 3CIPA 1JLBA 3VEWA 5HRNA 4M3YA 3SCXA 3O8MA 1GLAG 3I8DA 2QTDA 4HTLA 2LY5A 4BE7B 1T7AA 2YX6A 3IMXA 3SZ2A 4JI6K 1KFSA 1I2UA 2X6SA 4CK3A 3D2EA 4FLUA 1T3VA 1BCMA 2YIPA 3I0SA 3LPUA 1K73O 3T1AA 1C6VA 2GX9A 2ASPA 4EHTA 4M3UA 3BY5A 5AQMA 1AHOA 5DMRA 3CCQN 2JDQD 3LM2A 3L56A 3P31A 1SKWA 1OZZA 4PKHA 3CM6A 1QSSA 3KK2A 3THXA 3EKUA 4EFHA 1RTIA 1BQMA 4KO0A 5FPEA 2QM1A 3TR8A 2HBJA 1FW6A 5E84A 1P00A 4PY5A 2V7YA 1J5OA 1U6ZA 2PY5A 3SF4D 5AR0A 1NGBA 3CHWA 2YC1C 3MWPA 4IFEA 1ZBSA 2UUCK 4FOIA 4F2RA 3OS2A 2GUIA 2B6AA 3TAQA 3BZCA 4NO7A 4LSNA 4FM0A 2NRTA 4H5VA 2KJAA 3WNGA 1ICAA 4RTFD 4DFKA 1CZ9A 4LH4A 3K5MA 2AJQA 3AY9A 4V1DC 5AQPA 3AVIA 1YTAA 4DSEA 3E7UX 2OZMA 3I33A 4K0KK 3WQTA 4CE9A 3LALA 4HUEA 1XWLA 4KH6A 3KIOA 4CGGA 1E3MA 1Q81O 2F9WA 4JKDA 2XRIA 2E1YA 3T7ZA 3SUNA 1P8ZA 2OCEA 2KLAA 2E4LA 1Z25A 1VQLN 4JAXA 1KLMA 3FLCO 2DPNA 5BPMA 3OYEA 4CEAA 2A6AA 3HSTB 4CK2A 4B8CA 4I2QA 4BR2A 5ADXA 1NKCA 1QZ6A 4H03B 4C8LA 1GPSA 1QSYA 3TAPA 3O08A 4JKGB 2ASOA 3VETA 4BG8A 3OYLA 1RT4A 2P9UB 1O1WA 1OH7A 3TI0A 4ISGA 4JRPA 3K9JA 5AQHA 1N34K 5EX5A 4NYFA 4ZTFA 1C1CA 2KTQA 4H0YB 2J4RA 1LAWA 3QBXA 1VQNN 4FSVA 2F96A 4BE1A 2HW3A 4JLHA 2OPPA 3DAWA 3VQ7A 4CJSA 1RBTA 4EP4A 2PYLA 3SAFA 3ZLJA 3VQ5A 1FKPA 4KRFA 1QQOA 1TUUA 2LSNA 4R5PA 4FJKA 4H5TA 2W6KA 3C65A 4M42A 3ZEUB 2ZF5O 4M41A 1K9MO 4BR5A 2AA4A 1TK5A 5M1QA 4WCEL 1BG3A 2FF6A 1MWMA 1ASUA 1HNIA 5AZIA 4AHUA 4W5RA 2YI1A 2ZGZA 4AILC 4E7HA 3DXMB 2D5RA 2E2FA 1TKZA 4FLWA 2KBJA 1Q9XA 3CG7A 5AQUA 3L4IA 2Z1GA 4CFCA 4NB4A 4GVMA 4DV6K 1JLFA 3OY9A 2A42A 3OYMA 1HMVA 1P90A 4BC3A 4BACA 3L3UA 3PO5A 4MLHA 1HQUA 3AVCA 3L8BA 2BGGA 4CFAA 2E2OA 4YNQA 4B3SK 1ZBIA 3KOXA 1NK4A 4KH5A 1OH6A 3CCRN 4C8OA 4YY3K 3LZIA 5KTQA 4YFUA 1X3NA 3VQEA 4BVPA 3ATVA 5HRRA 1LV5A 1UGLA 2O4IA 1H1VA 4DQQA 2W40A 3LWLA 3KVGA 2O8DB 2ATBA 1ZVGA 3EKSA 4RWTA 1BRZA 1NGHA 5AQQA 1OVYA 4GNIA 1IG8A 1W9HA 2YHBA 3HPGA 4BQZA 4E7LA 4H0PA 4CEQA 2P9IB 3R3LA 4DMNA 1NG9A 2IVNA 4LFCK 4W5TA 4DV7K 4AM7A 3E9PA 3ZETB 4CF0A 4CK1A 1W0HA 4K8XA 3PSIA 2QEXN 1CHZA 4KTQA 4OX9K 3TANA 2FSKA 3C6UA 3ZT4A 4DTJA 1WBDA 3VF6A 1ASWA 1QQCA 4IFVA 3ENBA 4KYPA 4WQ5A 4BRGA 4BR0A 4DU4A 1VQ5N 2ZD1A 4UAEF 2P9PB 4PA1A 1NJWA 1VAZA 1OMYA 4E89A 4B9NA 4IBNA 5AJ3K 1ZXOA 1EWQA 4CD3A 3KHYA 1S1TA 1EP4A 2V51B 4FJ9A 2PZSA 4JN4A 3K0SA 3ALYA 4CF2A 4JK7A 3HL8A 3SLCA 5H1SQ 2Z1JA 4B1YB 1L3SA 3VA0A 3F9MA 4DU3A 3RR8A 2O8FB 1JL1A 2IIRA 2OPSA 3LDNA 4JK8A 4PL7A 5AQVA 4OGEA 3NF8A 3NVMA 5D3GA 1NMDA 4JKFA 1C0TA 1Z05A 4DFMA 4KB1A 3N4QA 3H6EA 2XHBA 4FW1A 3WXLA 4H5RA 1RTHA 3CQ8A 3BDPA 1VRUA 4J2EA 4DTPA 2QW9A 4LFAK 1T7BA 4DTMA 3GE1A 2GBZA 2HMIA 1L5UA 4DF4A 1YF5L 5HP1A 3KK3A 3S41A 2VWJA 1QHAA 3TSQA 5GAGP 1B3CA 1OH5A 4YOUA 2EHGA 2VQEK 3CJCA 1BA0A 4CJKA 1VSEA 3TWHA 2YHWA 2I7NA 2ZQBA 4B1XB 2KGQA 3GKUA 4FJHA 1NK0A 1K8AO 1Q7YO 2GWJA 3B6PA 3ZT0A 4LFBK 2KYQA 4X65K 3QEIA 1X3MA 3T1YK 4B3MK 5C42A 3CERA 2UUAK 4HE7A 1E4GT 3VQ6A 2D0PA 1WB9A 1NJZA 5CZ1A 4DSJA 4XIUA 3E9OA 3GL1A 3K5LA 3VOVA 4BRDA 3ASMA 1F21A 2GV9A 4XH5A 1KVAA 4DTNA 1BI4B 3OJSA 3OHRA 4RW9A 1HLUA 3VA3A 1T7PA 1VQ8N 2LJ7A 1X9MA 4DV0K 1K8KB 1J54A 3IG1A 3KHWA 4BC5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3CJ1 A;  4CJP A;  4BR9 A;  4E72 A;  4MO4 A;  4OLA A;  4FWQ A;  4DS4 A;  1VSD A;  3CIP A;  1JLB A;  3VEW A;  5HRN A;  4M3Y A;  3SCX A;  3O8M A;  1GLA G;  3I8D A;  2QTD A;  4HTL A;  2LY5 A;  4BE7 B;  1T7A A;  2YX6 A;  3IMX A;  3SZ2 A;  4JI6 K;  1KFS A;  1I2U A;  2X6S A;  4CK3 A;  3D2E A;  4FLU A;  1T3V A;  1BCM A;  2YIP A;  3I0S A;  3LPU A;  1K73 O;  3T1A A;  1C6V A;  2GX9 A;  2ASP A;  4EHT A;  4M3U A;  3BY5 A;  5AQM A;  1AHO A;  5DMR A;  3CCQ N;  2JDQ D;  3LM2 A;  3L56 A;  3P31 A;  1SKW A;  1OZZ A;  4PKH A;  3CM6 A;  1QSS A;  3KK2 A;  3THX A;  3EKU A;  4EFH A;  1RTI A;  1BQM A;  4KO0 A;  5FPE A;  2QM1 A;  3TR8 A;  2HBJ A;  1FW6 A;  5E84 A;  1P00 A;  4PY5 A;  2V7Y A;  1J5O A;  1U6Z A;  2PY5 A;  3SF4 D;  5AR0 A;  1NGB A;  3CHW A;  2YC1 C;  3MWP A;  4IFE A;  1ZBS A;  2UUC K;  4FOI A;  4F2R A;  3OS2 A;  2GUI A;  2B6A A;  3TAQ A;  3BZC A;  4NO7 A;  4LSN A;  4FM0 A;  2NRT A;  4H5V A;  2KJA A;  3WNG A;  1ICA A;  4RTF D;  4DFK A;  1CZ9 A;  4LH4 A;  3K5M A;  2AJQ A;  3AY9 A;  4V1D C;  5AQP A;  3AVI A; 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