The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHWSAEEKQLITGLWGKVNVADCGAEALARLLIVYPWTQRFFASFGNLSSPTAILGNPMVRAHGKKVLTSFGDAVKNLDNIKNTFSQLSELHCDKLHVDPENFRLLGDILIIVLAAHFSKDFTPECQAAWQKLVRVVAHALARKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin subunit alpha-A
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| publication title |
Crystal structure of Turkey (Meleagiris gallopova)hemoglobin at 2.3 Angstrom
rcsb |
| total genus |
55
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2009-10-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1J7W A; 1AJ9 B; 1MBN A; 4MQC A; 1Y31 B; 5HU6 A; 1GDK A; 3QM5 A; 3WCV A; 1BBB A; 2R4W A; 1YEQ B; 4NK1 A; 4H2L A; 3VRG B; 1MOH A; 2ZS0 B; 1NS6 A; 2ZS1 C; 111M A; 3NL7 B; 2V1E A; 1G0B A; 108M A; 2D2N B; 1NQP A; 1LFL A; 3EU1 B; 1JL7 A; 1V9Q A; 1MYF A; 3DUT A; 1CMY A; 1JEB A; 3VRE A; 2PGH A; 3GKV A; 5EYS A; 3UHU A; 2MGG A; 5CNB A; 1MYJ A; 4L7Y A; 1DUO A; 1A3O A; 2G0R A; 4KMW A; 3S66 B; 1A01 A; 4ODC B; 4M4A B; 1JP8 A; 5JGG B; 1RTE A; 1HGC B; 1G0A B; 3ZJJ A; 4NI0 B; 1CG5 A; 1FSL A; 2QFK A; 4C0N A; 3S65 B; 2E2Y A; 1HDS B; 2R80 A; 1YHU C; 1EBT A; 1DO4 A; 1NEJ B; 2BLH A; 2V1H A; 1MLR A; 1QXE B; 2D60 B; 5KER A; 1Y5F B; 1Y01 B; 112M A; 2VRY A; 3AQ9 A; 1LFT A; 4F69 A; 1MLN A; 3EDA A; 3GQR A; 1C7B B; 4N7N A; 1Y45 B; 4MU5 A; 1FSX B; 1G09 B; 4DWU A; 1Y0A A; 2OHA A; 1YHU A; 1WVP A; 1Y4F A; 1NXF A; 2H8F A; 1J3Z B; 4ROL B; 4XS0 A; 2H35 A; 1YZI A; 1BVD A; 1YVT A; 1O1K B; 2EB8 A; 1NPF A; 1MOD A; 3DHT B; 1Y7Z B; 3UHS A; 1K0Y A; 1MLO A; 1NZ4 A; 1Y5J B; 4VHB A; 2VM0 A; 3M3B A; 2ZSX A; 3WCU C; 3H58 A; 3WCP A; 4F6D A; 1PBX A; 1EWA A; 5KKK A; 3OGB A; 2SPL A; 5AZR A; 2NSR A; 2ZLT B; 3W4U B; 1VWT A; 1YEU B; 1LFQ A; 2DC3 A; 2HHB B; 1G08 B; 3WHM B; 1DTI A; 4HRR A; 3WFT A; 3FS4 B; 3D4X B; 107M A; 1Y0D B; 1G9V B; 3PEL A; 1H97 A; 3G4V A; 1XY0 A; 1A4F A; 1YGD A; 1JF3 A; 3MJP B; 2OIF A; 2QSS A; 1A6G A; 1IDR A; 5CN4 A; 3BCQ B; 1CBM A; 1MLM A; 2OH9 A; 1SI4 A; 1CG8 A; 2Z85 A; 2MYC A; 2NSS A; 1O16 A; 1DLY A; 5C6Y A; 2V1J A; 1OFK A; 4SDH A; 5AB8 A; 5CHR A; 1ITH A; 2HBF A; 2DHB B; 1Y35 B; 3ARK A; 1C7D B; 1T1N A; 1YE2 A; 3UBV A; 1MNJ A; 4ZVA A; 4L2M A; 1LH5 A; 1HBG A; 4UIQ A; 2VLY A; 2AUO A; 1MKO A; 5EYJ A; 1HGB B; 4N8T A; 1YVQ B; 3A5G A; 4YU3 A; 4NK2 A; 1XZ7 B; 3V2Z A; 5EET A; 3P5Q B; 2O5T X; 1IWH B; 2HBE B; 4MQH A; 3MYN A; 1GLI B; 1JL6 A; 1V5H A; 2BWH A; 3FH9 B; 2V1G A; 2MGI A; 1HDB A; 1WLA A; 1HCO A; 2V1K A; 1DXU B; 1Y5K A; 2ZLU A; 3WCW D; 1I3D A; 3ZJN A; 2ZFO D; 3M39 A; 1NZ2 A; 2QU0 B; 1YIE B; 1O1P A; 2PEG B; 1DTM A; 3CY5 B; 3PT8 B; 3UHD A; 3GOU A; 4U8U D; 1Y8H B; 1Y4R A; 3OZW A; 3ARJ A; 2OH8 A; 3G46 A; 2GTL C; 5E6E B; 3UBC A; 3D1K B; 2FRF A; 5HAV A; 2HHD B; 1Y85 A; 1X9F B; 3QM6 A; 2ZLX A; 2Z6N B; 1SHR A; 2RI4 B; 3PI9 B; 3WCT B; 1HJT A; 3G4Y A; 1V75 B; 2ZT3 A; 1O1I A; 3BJ3 A; 1YH9 A; 1YCB A; 1EBC A; 1FDH A; 1GJN A; 2HBD A; 2H8D A; 1XZ5 B; 2GTL A; 3HEP A; 5JDO D; 3U3E A; 1MLU A; 4ESA B; 2HZ1 A; 1Y0W A; 1YCA A; 2BW9 M; 4MPM A; 5B85 A; 106M A; 1DO7 A; 3ZOL A; 3HXN B; 3BA2 A; 1SWM A; 3LB4 A; 2MGK A; 1MNI A; 1A9W E; 2ZSY A; 1OUU B; 1JZL A; 2SPO A; 1B0B A; 2QMB B; 1BAB B; 3HRW B; 1HSY A; 1WMU A; 4TWV A; 3S1I A; 1A6M A; 3PI8 B; 3UHE A; 3SDH A; 2GRH A; 1N9H A; 1A3N A; 3HYU A; 1YFF B; 3BJ2 A; 3UH6 A; 2MGB A; 1OUT B; 1O1M A; 1HDA A; 2Z6T A; 5C6E B; 1HV4 B; 4PQC A; 2AA1 A; 1Y7G A; 2ZSS A; 1C40 B; 4WJG A; 5CN6 A; 4AVE A; 3QJB A; 1CH7 A; 3G4Q A; 4MQI B; 4F6J A; 2OHB A; 3GYS A; 1Y0T B; 1O1L A; 3IC2 A; 1MBD A; 5F2A A; 1Y2Z B; 1CH5 A; 1V4W B; 2NRM A; 2ZS1 D; 1HBB B; 1MNK A; 2ZFO C; 1IBE A; 1RVW A; 1YEN B; 1A0Z A; 1J40 A; 5M3S A; 1LFZ A; 3K3U A; 3TM9 A; 1DXV A; 2BNL A; 1NWN A; 5CNE A; 1DUK A; 1XZ4 B; 2MB5 A; 1JPB A; 4F6G A; 2O5S X; 4MQK A; 1R1Y B; 1VHB A; 2M6Z A; 3R5I A; 1YGF A; 5MBA A; 6HBW A; 4MQJ B; 1J3F A; 1RQ3 B; 1J41 A; 1BUW A; 2MGJ A; 1NZ5 A; 3NFE A; 2HCO B; 1YHE A; 1MBS A; 2EKT A; 1Y8W B; 1MBO A; 3SZK B; 3UHW A; 2W6V B; 2W72 B; 3D7O A; 1MTJ A; 3WCW A; 3WR1 A; 5SW7 A; 3K8B A; 4NI1 B; 2ZFO A; 1J3Y B; 4B3W A; 4JYQ A; 1ABY A; 1MNH A; 5E29 A; 1SPG B; 1HAC B; 1GCV B; 2QSP B; 2OLP A; 5JDO C; 4MBA A; 1Z8U B; 1NIH B; 1LJW B; 3QQR A; 3NL7 A; 1HBS B; 1Y7C A; 4MAX A; 3MVC A; 4N7O A; 4OF9 A; 2HBC B; 1MZ0 A; 4KN3 A; 2QFN A; 1B86 A; 1N9X A; 1Y46 B; 2DXM B; 1HBH B; 1RPS B; 1IRD B; 1HBI A; 1HBR A; 1K1K A; 1RQ4 A; 3ONZ B; 3K9Z A; 1XCH A; 3UHT A; 1C7C B; 1GBV A; 3LB2 A; 1XQ5 B; 3UHZ A; 4NZI A; 3S48 C; 2ZLW A; 4XDI A; 3HF4 A; 3WCU D; 3EOK B; 2W6W A; 1DWS A; 1J52 A; 2NRL A; 3RGK A; 2V1I A; 4WJG 1; 2DN3 B; 1LFY A; 4FC3 A; 3ZJL A; 3QJC A; 1Y4V A; 1YOG A; 2D5Z B; 5D1V A; 3MJU B; 3UHQ A; 1BIJ A; 1V4X B; 1M9P A; 1O1J A; 1CLS B; 4PQB A; 1QI8 A; 4HHB B; 1RQA A; 1FSX A; 2AV3 A; 2HHE A; 1QSH A; 4ROL A; 1BZZ A; 1GCW A; 1UX8 A; 3DHT A; 5EQM A; 1RSE A; 1NS9 B; 1V4U A; 3KMF A; 1YEV B; 3TLD A; 1XZ2 B; 1HBA B; 1O1N A; 3HC9 A; 4ROM A; 1SDL B; 1YEU A; 1Y8K A; 3HEN A; 1FN3 A; 2MGD A; 3PIA B; 1LH1 A; 4H07 A; 2GRF A; 2ZFB A; 4FH7 A; 2ZS1 A; 3OO5 B; 1Y4Q B; 2D2M C; 1AJG A; 1LFV B; 3MJP A; 1CIO A; 1QSI B; 1SDK B; 3MKB A; 4GZG A; 1S0H A; 1XYE A; 2JHO A; 1Y0C A; 1MBI A; 1NGK A; 3RJN B; 3NML A; 103M A; 3GDJ B; 1LUE A; 4ILZ A; 3ZJP A; 1F5P A; 3ZJQ A; 3AT5 A; 2QLS B; 1HHO B; 3QJD A; 2FRJ X; 5HY8 A; 3AT6 A; 3LQD A; 3KUN A; 4N7P A; 2DN1 A; 1LA6 B; 3QJE B; 1JDO A; 1Y22 A; 3M3A A; 3OJ1 A; 3E55 A; 2ZSQ A; 2D2M A; 2IN4 A; 101M A; 1GZX B; 2GTL D; 1GBU B; 1NAZ A; 1Y4G B; 1YEO A; 1J7W B; 3H57 A; 4MQC B; 3OO4 A; 5HU6 B; 2VLX A; 1EW6 A; 3WCV B; 1BBB B; 3BJ1 A; 1CO8 A; 1I3E A; 1BZ1 A; 4F6B A; 4HSW A; 4H2L B; 2XKG A; 2LHB A; 1NS6 B; 1OBM A; 1UFJ A; 1JY7 A; 2DN2 A; 3ZJM A; 1DWT A; 1G0B B; 1LFL B; 1MLG A; 1COH A; 1X9F C; 1Y7D A; 2C0K A; 1UFP A; 1BJE A; 3DUT B; 1R1X A; 1CMY B; 1JEB B; 1Y8I A; 1MDN A; 3A0G A; 3VRE B; 2PGH B; 4YU4 A; 3MN0 A; 1LHS A; 2ZSZ A; 3PT7 A; 3E4N A; 1GDJ A; 3CIU A; 1A3O B; 1THB A; 1GDI A; 1MLH A; 3WCU A; 1NWI A; 5KDQ A; 1A01 B; 3PT8 A; 4B4Y A; 3LB1 A; 1MLQ A; 5D5R A; 1DKE A; 1CG5 B; 1ECO A; 1OFJ A; 3QZX A; 1MCY A; 5E83 A; 4NS2 A; 2EKU A; 2R80 B; 1CH9 A; 4UZV A; 5CN7 A; 3GQP A; 2G12 A; 3E5O A; 1A00 A; 1S5X A; 1BIN A; 2MGA A; 1CH4 A; 1M6M A; 1LFT B; 2B7H A; 3LB3 A; 4FWY A; 1VRF A; 3A5B A; 1O1O B; 1YIH A; 3DR9 A; 3IC0 A; 4F4O B; 3GQR B; 1VXG A; 3ZJO A; 3UH3 A; 4N7N B; 2ZSR A; 1Y0A B; 1MGN A; 3G4U A; 1YHU B; 2D5X A; 2H8F B; 1QPW A; 2HBS A; 4XS0 B; 2Z6S A; 1MLL A; 3UHK A; 3WTG A; 4MXL A; 1Y4B B; 2H35 B; 1YZI B; 1VXD A; 1YVT B; 1AJH A; 1DXT B; 2G11 A; 1K0Y B; 1LTW A; 1URY A; 3WCP B; 1PBX B; 3UHN A; 1BAB A; 3NMM A; 2GDM A; 2BMM A; 1YHR A; 3VRF A; 5ILE A; 1TU9 A; 1VWT B; 1HAB A; 3QZZ A; 2MGL A; 5HLU A; 4IRO A; 4F6I A; 1JF4 A; 4QAU A; 4HRR B; 4DC7 A; 1NZ3 A; 3DHR A; 1MTI A; 1DO1 A; 3B75 A; 2G0S A; 1GVH A; 3ZHW A; 1KD2 A; 1BZ0 A; 3PEL B; 1OUT A; 1XY0 B; 1A4F B; 2EVP A; 1YGD B; 2D2N D; 1HGA A; 1HV4 A; 1SPE A; 1MOB A; 2HZ3 A; 1D8U A; 3PI4 A; 1SI4 B; 5CNC A; 3UH5 A; 4F6F A; 3MOU A; 1MOA A; 104M A; 4X0L B; 3ARL A; 2W72 C; 3TM3 A; 1CQ2 A; 2GNV A; 2HBF B; 3UHB A; 1YG5 A; 1IRC A; 5CN5 A; 1DO3 A; 1S5Y A; 2EB9 A; 1T1N B; 1YE2 B; 2O58 X; 1PMB A; 1CIK A; 4O4Z A; 3NG6 A; 1DXC A; 1YE0 A; 1MKO B; 1ABW B; 1MYZ A; 1MBA A; 2LH7 A; 3PI3 A; 5EUI A; 3UHI A; 4N8T B; 4WCH D; 3G4R A; 3D1A A; 1XXT B; 2BK9 A; 4YU3 B; 3GQG A; 3ZJS A; 1UVX A; 1QXD A; 1JZK A; 3AQ7 A; 3GLN A; 1JZM A; 3UHR A; 1J3Y A; 1J7Y A; 4OOD A; 3HHB A; 1U7R A; 4HSX A; 1HCO B; 1Y5K B; 2ZLU B; 4G51 B; 2SPN A; 1Y83 B; 2MHB A; 1XZU A; 102M A; 1LH2 A; 1O1P B; 2MGH A; 6HBI A; 2XKH A; 1KR7 A; 2RAO B; 3GOU B; 1AZI A; 1Y4R B; 3S1J A; 3ECZ A; 1N9I A; 2R1H A; 3IA3 B; 3UHC A; 1Y09 A; 2HBG A; 1Y85 B; 4KMV A; 2ZLX B; 1SHR B; 1FAW A; 1FHJ B; 3A5A A; 2MGF A; 3A59 A; 4NXC A; 1O1I B; 3BJ3 B; 1YH9 B; 4HRT A; 4M4B A; 1MWD A; 4KJT A; 2HBD B; 2EF2 A; 2H8D B; 1DXD A; 2ZS0 C; 2GTL B; 1MYM A; 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3WCW B; 1O1K A; 2MGM A; 5JDO E; 3WR1 B; 5SW7 B; 1Y4P B; 3K8B B; 1Y7Z A; 2BLJ M; 2ZFO B; 2BLI A; 1Y5J A; 1VXC A; 1ABY B; 5E29 B; 4U8U B; 3ZJI A; 2ZSP A; 2ZLT A; 3ZJR A; 3W4U A; 1VXH A; 2HHB A; 1Y7C B; 1G08 A; 3D17 B; 3WHM A; 3ZH0 A; 4N7O B; 3GKT A; 3A2G A; 3FS4 A; 3D4X A; 1Y0D A; 1G9V A; 4HBI A; 1B86 B; 2V1F A; 1ECA A; 2D6C A; 3ODQ B; 2MYB A; 1HBR B; 1X3K A; 2LH3 A; 1K1K B; 5ILR A; 1RQ4 B; 3BCQ A; 1MYG A; 2VEE A; 1GBV B; 2XKI A; 3O89 A; 2ZLW B; 3HF4 B; 1LHT A; 3MBA A; 2DHB A; 105M A; 1Y35 A; 2FAL A; 1C7D A; 1DLW A; 3O7N A; 5CHQ A; 1LFY B; 3UI0 A; 5F0B A; 4FC3 B; 2W6X A; 1A0U B; 3QJC B; 1Y4V B; 1O1O A; 1BIJ B; 3ORD A; 1M9P B; 1O1J B; 4F4O A; 5EV5 A; 1HGB A; 1YVQ A; 1QI8 B; 2R50 A; 3ECX A; 1FDH G; 3QM8 A; 1RQA B; 1CP0 A; 1XZ7 A; 2HHE B; 3P5Q A; 1QSH B; 1IWH A; 2HBE A; 1Y4B A; 1BZZ B; 3WFU A; 1GCW B; 1DXT A; 1GLI A; 2WTG A; 4O35 A; 1YOH A; 2O5L X; 3FH9 A; 3ECL A; 3UHX A; 1NQP B; 1CQX A; 1DXU A; 1V4U B; 3WCT C; 1V07 A; 3GKV B; 2MYA A; 1O1N B; 4L7Y B; 2QU0 A; 4ROM B; 5EE4 C; 1YIE A; 1VXE A; 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