3K9KA

Transposase domain of metnase
Total Genus 64
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
64
sequence length
233
structure length
211
Chain Sequence
KVKKLDKWVPHELTENQKNRRFEVSSSLILRNHNEPFLDRIVTCDEKWILYDNRPKKVMVTIWWSAAGLIHYSFLNPGETITSEKYAQEIDEMNQKLQRLQLALVRRKRPILLHDNARPHVAQPTLQKLNELGYEVLPHPPYSPDLLPTNYHVFKHLNNFLQGKRFHNQQDAENAFQEFVESQSTDFYWTGINQLISRWQKCVDCNGSYFD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Histone-lysine N-methyltransferase SETMAR
publication title Crystal structure of the human Hsmar1-derived transposase domain in the DNA repair enzyme Metnase.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 64
structure length 211
sequence length 233
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.1.1.43: Histone-lysine N-methyltransferase.
pdb deposition date 2009-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01359 Transposase_1 Transposase (partial DDE domain)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.470 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3k9kA00
3K9KA 2F7TA 5CR4A 3K9JA 4MDBA 4U7BA 4R79A 3HOTA 3F2KA 5HOOA 3HOSA 4MDAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4TSXA 3VMFB 1JLCA 1JCEA 4A2AA 3SBGA 1RT6A 3AA2A 1KVBA 2E6LA 1I3AA 2W40A 3I8DA 4BRPA 2AA4A 3MECA 1HNZK 4YFUA 4NO7A 3HM9A 1VSHA 3JYTA 4FVUA 4Z4FA 4OGEA 2F7TA 4WFNL 3J80O 1M1KO 3OVNA 3P5JA 3NMUA 1CLQA 4HHTA 1DTQA 1IO2A 4GV6A 3M5RA 1X9JA 1MU2A 1K6YA 3N4QA 4DF4A 4K8ZA 4ISEA 1HNVA 4OPJA 4RG8A 3SPZA 3IDHA 4CF1A 3CG7A 3VQEA 1SKSA 1CXUA 3TAQA 3ZETA 2OYQA 2Q0UA 5AQWA 3HP6A 2HBKA 3BY5A 4CE9A 2NRVA 4KHYA 4BG8A 3EN9A 2BGGA 4CJPA 2QM1A 2QA4N 3NDKA 1EXQA 1KQSM 1EKEA 4A62A 1TK5A 3BP8A 1IKYA 3SQ1A 4FJ9A 1RGIA 3MXMA 4FZXC 3WNGA 5KI6A 3EZWA 1U04A 3EE9A 3CF5L 1C0FA 4I9QA 1RCHA 3O3GA 1WOQA 4CW7B 3SJHA 3TTFA 3J7ZO 3FZHA 1N33K 1ATRA 1EWQA 4DR3K 4WE1A 1NOZA 2F8SA 4O8UA 4N56A 1QQMA 1YI2N 4CFAA 2WTUA 4O4GA 3O4WA 4J2AA 5FLXO 2P9SB 2HNDA 3AO5A 3BF1A 4BR9A 1IJJA 4C23A 1C0UA 4DSFA 3CPWM 1EETA 1ASUA 5JS2A 1KSPA 1NGJA 1SS6A 1OH7A 4IO9L 1NG9A 2I5JA 1UA1A 1P8ZA 3H08A 3CJ1A 3H1QA 3ZT4A 3DLEA 1VQ5N 2CH6A 5BRDA 1VSMA 3U8XA 1NGDA 3R8EA 3L2WA 3Q7CA 4BE0A 3V6DA 3EEQA 3TI0A 1NOYA 3QFPA 3T3FA 3OYBA 4YOTA 1J5OA 3VPZA 3AO3A 2OTJN 4DLEA 4F9OA 3VEVA 1HJRA 5CYMA 5F0XA 1IG9A 1WLJA 2A40A 4E7HA 4M3YA 3T69A 2QWQA 4BGBA 4NCBA 1OVQA 5AZIA 5FPNA 1NKEA 3AVMA 3QEWA 4O0IA 1NJWA 4JKGB 1SL1A 1C0MA 4JI8K 3QNOA 3PSIA 2HF3A 1KVCA 2HHSA 1NGAA 3VQAA 2DFEA 3VQ8A 2KZZA 1JCFA 3M3ZA 3VQCA 4H4OA 2O8CA 1RT2A 4FO0A 3TWHA 2Y1IA 2KTQA 4H5RA 3ULEB 2PFUA 4QS9A 3WXIA 3I55N 5AQQA 3NF7A 4OLBA 1VQ7N 2OPSA 4CEZA 2E8AA 2NRXA 3G71N 4LF8K 3VGKA 5C25A 2GWJA 2VWBA 1S6PA 2AJQA 3LDLA 3MEDA 3CFOA 5AZJB 1YF5L 4LF9K 5EOYA 1S22A 4ID1A 2D1KA 5BN8A 5ADXH 2BH1A 4IZ9A 4FK2A 4BR7A 4K8XA 3P38A 4ZHRA 4CJLA 4U7BA 3DXMB 1TKTA 1ASWA 3MWTA 3CJCA 1NMDA 3RMCA 3DLBA 2P5OA 4IEEA 4RW7A 3CCEN 3ZT0A 3K5NA 5C15A 4H0TB 3OS1A 1HNIA 1ITGA 4M45A 5HROA 1K8KB 4KFBA 4O0JA 4DTPA 4CJ3A 3HT3A 4IFVA 1RTIA 4MQ3A 1KRPA 3TAMA 1YVUA 2E2QA 3NH0A 3MN5A 3PO5A 4FLVA 2FBXA 2XY8A 1VQKN 4CGFA 4DV2K 3CD6N 3C95A 4Z94A 4DSEA 5AFUH 3LANA 4OPKA 4Y0WA 2B4JA 3NE6A 1BA1A 3BEXA 3M8SA 2A6AA 3QDKA 2YNHA 5EY4A 4B1ZA 4R5PA 4FXDA 3LPUA 1DLOA 3W0LA 5HRSA 3AAQA 3ZSZA 3ZT2A 1EQYA 3OYHA 1UOCA 4CJVA 4BC3A 1A5XA 5EX5A 5CY4A 4DU3A 2P9PB 2NNWA 1ILYA 4HWIA 4JLHA 4NXNK 3MCPA 3C94A 2O4IA 2HB5A 2D5RA 3SAHA 3AY9A 2IIRA 3F9KA 2YI1A 1QS4A 1Q18A 1X9SA 1VRTA 3BDPA 3THWB 3CCVN 4OPAA 2QWRA 2V51B 2NRWA 3M6GA 4IJAA 2GELA 4H4MA 4FM2A 1JLQA 4BWMA 2RHKA 4JKBA 4J2DA 4LH5A 3C6AA 3LAMA 4FW2A 1N6QA 4KI4A 3G6EN 5LJWA 1RT3A 4WQ4A 5LMUK 4JI3K 2WOMA 3DLKA 3KKRA 4DV3K 2HOEA 3NBPA 4X66K 4H0XB 2UU9K 3QEVA 3OS2A 4XEIA 2QW9A 3LAKA 3CCRN 1JLBA 4DS4A 3C6UA 1TVRA 4RTFD 1YTAA 1C1BA 3IKMA 1NK8A 1REVA 1CZBA 4DV6K 3C7NB 3SUPA 1OKJA 5DMRA 4F8RA 1KAXA 3M8PA 4CF0A 4DQIA 5AQHA 1BWFO 3ZCMA 3KLFA 2QWLA 2WFBA 3D2FB 3AVKA 4B3OA 3V9XA 1A5WA 3L3VA 4CGDA 3THXA 4CK2A 3P31A 4KI6A 3CI5A 3TARA 4EFHA 3QEIA 3ZSVA 4MDAA 2FSNA 2VQFK 3LDNA 3V1RA 4IO8A 3HPOA 4KRFA 2JWKA 4JS4A 3OTOK 3QEXA 3MXIA 1YAGA 2ASPA 4DR1K 2VWKA 4DTRA 5AQPA 3OYJA 4B1XB 1BA0A 3DRRA 1YITN 2YHYA 1VQNN 1SV5A 3HP9A 5AQMA 4BRDA 3U3YA 3D2EA 3A0IX 2F9TA 3EL2A 4H8KA 3WT0A 4CFCA 3MDQA 4BC5A 2KQ2A 2IVNA 1D5AA 3DM2A 4ILGB 4DHYA 3E66A 3QLHA 4CZMA 1HJOA 1X3MA 4BC4A 5GADP 3KK2A 1HMVA 4YOWA 3F2KA 5BR8K 3D7EO 4LSNA 1VQMN 4QS8A 4YOUA 5KPZA 1T05A 4H0YB 2YKNA 4IDHA 4LF7K 3O3HA 3ZT3A 4N76A 3O9RA 4BREA 4QOZB 1S5JA 3G10A 4OPHA 4JRQA 4DFKA 2BUPA 1S1VA 4DR7K 5AQOA 4CF9A 3F73A 5BR9A 4OVLA 2P9NB 5GAGP 4FM1A 3CJ7A 1QQOA 1VK0A 5CR4A 2HMPA 2F4VK 1HPMA 4CIEA 4JKFA 4GNIA 1I94K 2X78A 2P9KA 2D4WA 4K42A 3ZX0A 1CZAN 3VQPA 3ITHA 4RW8A 5CZ1A 1XNRK 3A5NC 3LWMA 1Q82O 4MO4A 4NB4A 1U45A 2I7PA 2HHXA 4KTZA 1HKBA 2D0OA 3LPTA 4JI7K 1J9AA 2FBYA 4BRLA 5FPMA 3O3FA 1QVFM 1JKHA 1D9FA 2D0BA 3UKUA 4BQZA 4HTUA 2X6SA 1WNSA 2GWKA 1UA0A 1WAFA 1LWFA 4CF2A 1S72N 2IVOA 3CJ9A 3DOLA 5BREA 3O9TA 1KLNA 5J2PA 4F4KA 3I8BA 4F2RA 3FZFA 5HOOA 4FYDA 4DR2K 4H5WA 3QERA 4PUOA 3ZT1A 3J7AP 1ZC6A 4M3ZA 4DR5K 5T7BA 2F96A 2O8DA 5H1SQ 2DFHA 3DAWA 5HRRA 4CEEA 1QTMA 3P4IA 4HUGA 1YT3A 1BUPA 2P9UB 2RKIA 2G8HA 4DG1A 1FXXA 5AQIA 3HO1A 3I56N 4X64K 2OPQA 4W5RA 3VGMA 4BRQA 4FJ8A 5DM6L 4LSLA 1S1UA 1C0GA 3MMVA 3NCIA 3HM8A 4CGHA 2VCPA 1LCUA 4JD2B 2YJFA 4JV5K 3M8RA 4FZZA 1JL1A 3WXJA 1Y64A 1V4TA 4IFYA 4I6MB 3ENOA 3FZLA 1YJNN 3U3GA 1Z05A 1VQ4N 4ZTJA 1NK6A 3CCLN 3J7YP 3ZSQA 1KC8O 1B9FA 4JKHA 1EP4A 3T1HK 1HYSA 4LFBK 4BROA 4BR4A 3F5TA 2E2NA 1BOTO 1QE1A 4CGGA 3KJVA 3VA0A 3K5OA 4B8CA 1BG3A 1NGHA 4CZKA 4FW1A 3MX2A 2D0CA 1W97L 2A5XA 1KFSA 2P9LB 2FF3B 3S9HA 4YOXA 1E4GT 2QWOA 4JK7A 5TKYA 3OYIA 3OJSA 1ZBIA 1HKGA 4AHVA 3ZX2A 4PKHA 1GOAA 2O8EB 4Q0BA 5D3GA 3SAGA 3SV4A 4KHNA 2Y1JA 3QBWA 4JI6K 4ELUA 2E1ZA 3OYFA 3ZSRA 2G8VA 4B9MA 3TAEA 1OH8A 3DLGA 4A5BA 4DSKA 3IS9A 2BE2A 4CJ7A 3O4NA 1KD1O 3TSPA 4JKGA 4G9ZA 4M3RA 3RVCA 1WSGA 1QHAA 3ID8A 4BRHA 1SKWA 4YOVA 2WUSA 3C6TA 4DV7K 1GLDG 4EHUA 3OY9A 3CQ8A 2O8FB 4O5FA 3AGRA 1RNHA 3GG4A 3OYLA 4QAGA 4FLWA 1LWEA 3CM5A 3H46O 5JICA 3MAQA 2KFZA 3VOVA 3MEGA 3ISNC 2Q36A 5AJ3K 3FR0A 4DSLA 3QESA 4JK8A 1QHTA 2IS3A 3RSEA 3SI6A 4FSVA 3CERA 4LC9B 5KGWA 1BIZA 1TV6A 1RBUA 2Q97A 4FPBA 3LDOA 4GVEA 4RW9A 5M1PA 4Z4HA 1IKXA 3V9UA 1IBKK 4W5TA 2E88A 4GV9A 3THYB 4DUZK 4M63C 2GTDA 3BZCA 1S1WA 2X74A 1GLBG 3B6PA 2XHBA 4UY8O 1G15A 2ZGZA 2GBZA 3A8YA 4C8MA 3O4QA 4DMNA 4Z4IA 4WQ5A 4FWMA 1NLVA 1VHXA 5EU7A 3WXMB 4IDKA 1G99A 2QKKA 2VG6A 1B92A 4O5BA 1GLAG 1NK4A 3PX6A 5I3UA 3O8MA 3JS6A 1YJ9N 2P5GA 3K59A 4A61A 3MWPA 1HYVA 2HNYA 2P9IA 2Q1NA 3HI0A 4AHCA 4B8AB 2A42A 1VSLA 4B3MK 1CXQA 4WFAL 3NF6A 3U6FA 4CJ4A 4FJIA 1WSHA 5HRNA 3CM6A 3K9JA 3K5LA 4ISFA 3HOTA 4DFPA 1HYZA 4FWNA 5AQSA 5J2NA 4A57A 3CC4N 2HMIA 5E26A 2YNIA 1NKCA 3PX0A 2ITGA 4Z4GA 1KXPA 3PUFA 4NYNA 4ICLA 4H0OA 3M8QA 3SQ2A 1JXEA 1VSIA 3E9OA 3VEYA 1RTJA 4NLCA 4E1NA 4JYAK 4BWJA 1FKOA 1SZ2A 2FSJA 3E9LA 4A2BA 4CD1A 3G4SN 2QK9A 3CCUN 1O1WA 1TK8A 5AQJA 4AHSA 4DV5K 3LDPA 4CI6A 4LF5K 4DS5A 3WEEA 3ZSWA 1WSFA 3MEEA 3NGZA 3LZIA 1BIUA 1X3NA 1BI4B 1TYQA 2Z1IA 4J8FA 1E4FT 5AQZA 1C1AA 3OA9A 1XC3A 3DI6A 4QS7A 3KWGA 1JL2A 2GEMA 1N32K 5ADXA 3AA4A 2B5JA 4B9NA 2YKMA 2J4RA 3H45C 3VF4A 4JHDA 3L3UA 1N36K 1ZBFA 4E1MA 3L4QA 3NVKA 1WSJA 3DLRA 3TAFA 3OYEA 3CFRA 5HRPA 3T7ZA 1IV0A 3SUNA 3AVBA 4Z4EA 3AVAA 2OPRA 2ZM6K 3AV9A 1L3VA 4KTQA 4XH4A 1NU0A 4AF1A 3QIPA 4AHUA 4BVOA 2QEXN 5MLCQ 2FLOA 3V4IA 4IEIA 3HVRA 2PAVA 3NGIA 3AVFA 4C1NK 4KHUA 1RT5A 4Y1CA 1X9WA 4FJXA 3IRXA 1HNXK 2FSKA 5EXWA 5AFUA 2XY5A 3MN6A 4MFBA 3DLHA 2HHTA 3AVHA 1OVYA 1QZ5A 4BRMA 2HVHA 3HBTA 5C12A 1H1VA 1IH7A 4B3RK 2KHOA 4U67L 4EP5A 1DEJA 1RILA 4X65K 1JJ2M 4DUYK 3C65A 4CJQA 5FRNA 1BQMA 3ZETB 4PHTX 2NRHA 1HKCA 2CH5A 4LFCK 4H5VA 1XNQK 4BRKA 3UKRA 4YOYA 2P9NA 4CFBA 2ZWHA 4L8RB 1YTUA 3ENHA 4PY5A 2O8BA 4XIUA 3DRSA 3S3OA 1TUUA 2QWPA 4EZ6A 3KLHA 2RE2A 1WB9A 1ZBHA 3MXJA 4KO0A 4N5SA 4KBOA 5M1KA 4E1JA 1RT1A 1BQNA 4CEQA 2Q2RA 4JNEA 1HLUA 2UXBK 2HBLA 4BY9C 1WSEA 3LP2A 3SV3A 2F8TA 3KK7A 2DPNA 4FK4A 4A5AA 1J53A 1UWBA 3KHYA 3P1GA 4BRCA 5E41A 4JN4A 3EKUA 3P39A 5LY3A 4BR5A 1XHZA 1V4SA 2VQEK 2EWSA 4E7LA 4O8KA 3VGLA 4CJWA 3KD5E 3WXLA 4FOEA 4YHHK 1S9GA 4F3TA 3GBTA 3Q7BA 2XO7A 4BE2A 4C8LA 4DQPA 2XY7A 4CZIA 3J81O 4ID5A 4BRFA 2OANA 3S3MA 3VQ9A 5GAHP 5E84A 2IGIA 3CMAN 2F9WA 3K9KA 3C6HA 2IDOA 4HCBA 3GOIA 3SMSA 2Q0RA 2QXLA 4EAHD 2G8IA 1NGFA 5BRHA 4BRAA 3L2QA 3J8AA 5AZIB 1VQPN 4I6MA 3CQXA 3O9UA 4CGJA 3VQBA 1XI1A 1XUPO 4LD0A 1YVNA 1HNWK 3S3NA 3QO9A 1HQEA 5KTQA 5M1NA 1NJXA 2W6KA 4DU1A 4RWTA 2O8CB 4DCHA 4YDUC 5DM7L 2I7NA 4BG9A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K9K A;  2F7T A;  5CR4 A;  3K9J A;  4MDB A;  4U7B A;  4R79 A;  3HOT A;  3F2K A;  5HOO A;  3HOS A;  4MDA A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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