3KHYA

Crystal structure of a propionate kinase from francisella tularensis subsp. tularensis schu s4
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
384
structure length
384
Chain Sequence
MSEILVLNCGSSSVKFALINPHTSQSLVTGLAENIATKNCKVVFKAEHKIVKYLENGSYKDVFEMLKDFLVENKHLEKIVAIGHRVVHGGQYFSKSVLINADSLEKIKACIALAPLHNPAHIEGIRFCQQIFPELPQVAVFDTAFHQTMPSYIAEYAIPYELTHKHNIRKYGAHGTSHKYVSEQAAKILTQQKANVIVAHLGNGCSITAVVDGKSIDTSMGLTPLDGLVMGTRSGCIDPSIFAYISDNLGWSVTEITNMLNKQSGLLGICGHNDMREVSQLAAKGDSLAKLAIEIFSHRVAKFVASYMIYFNKLDALVFTGGIGENAANIRKNIISKLANLGFMIDHQKNSNSETFINSKNSHNIMVIATNEELMIAQETQNLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Propionate kinase
publication title Crystal Structure of a propionate kinase from Francisella tularensis subsp. tularensis SCHU S4
rcsb
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 123
structure length 384
sequence length 384
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.2.-:
pdb deposition date 2009-10-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3khyA02
3WQUA 2Q31A 2VYPA 1HPMA 3QMLA 4BG9A 5AQGA 3BP8A 3AARA 2QWNA 3VPZA 5TKYA 3WEEB 4YDUA 2YHXA 1T6CA 4O8KA 4B1ZA 3VF6A 3DXMB 2D1KA 4JD2A 2I7PA 2FSKA 3FLCO 4GNIA 3CQXA 4FSVA 2ZWHA 3GDQA 4FWMA 4J8FA 3O08A 2QWLA 3M3ZA 1X3NA 1HUXA 2YJFA 1YVNA 5AZJB 1YXQA 2WUSA 4CBXA 1S22A 4DHYA 4PL7A 2ASMA 3DWLA 5EX5A 3MDQA 4BRMA 5EOYA 3VERA 2Q36A 2P9IA 1EQYA 1NGJA 3P4IA 2Q97A 4BRHA 3VEYA 5AZIA 4H0XB 4BGAA 4CZKA 5BRDA 3LM9A 4FO0A 4BRIA 4RCHA 4QS9A 5KQ8A 1ESVA 3CJ1A 4ISEA 3EKUA 2VWBA 2F9TA 3CJCA 5CE3A 2BTFA 3RSEB 4JNEA 2KHOA 1KAYA 3DJCA 3UE5A 2Q0RA 2D0OA 2QWQA 3GG4A 2UYTA 3AAPA 5BPLA 3AAQA 2NRHA 3MMVA 1NGIA 1LOTB 1X9JA 3O8MA 3IFRA 5BREA 4DCHA 1KAXA 1ZXOA 3QFUA 3ENHA 1Q18A 4H0TB 4XH4A 4CBUA 4CI6A 1ATSA 3R8EA 1BUPA 3H46O 3VF2A 1TUUA 4H0VB 2IVNA 1K8KB 1BDGA 3FZFA 3O80A 1KAZA 5BPNA 4BQLA 5B8HA 2I7NA 4H0OA 3R9PA 1G99A 3U9DA 2QXLA 4BC2A 1IJJA 1DEJA 3ATVA 3ULEB 5BN9A 3FGUA 3H45C 1C0FA 3QBWA 4EFHA 4CZGA 3VGKA 4EIAA 1GLEG 5KPTA 3SMPA 1Y64A 1QQNA 3MN6A 2P9PB 3BUZB 4EHUA 2CGKA 3FFKB 3FR0A 4BRAA 1BG3A 2J4RA 2FF3B 2P9UB 4AM6A 3EO3A 5E84A 3EL2A 2QM1A 4A62A 4JHDA 5JLFA 3GOIA 3JS6A 3VGLA 3F9MA 2IIRA 2YHYA 1YUWA 1D4XA 1NGDA 5KPRA 5BN8A 3DXKA 2D0PA 2W40A 3BEXA 3VOVA 3QBXA 4BR2A 5AQHA 2Q1NA 1Z6RA 1JCFA 4CZIA 4L3QA 1U2VB 1GLBG 4A2BA 2HOEA 3FZKA 2QWRA 4CZHA 3MCPA 3CQYA 2E2PA 4CZLA 4WQ4C 3D2EB 2P9KA 4HWIA 1XC3A 2QW9A 1RFQA 1BOTO 1GLAG 3I8BA 3ZEUB 3FZLA 1NGBA 4IZ9A 2D4WA 3G25A 3BF3A 4FWKA 3LL3A 4BRFA 1E4GT 5F0XA 4MLEA 2P9SA 2P9NB 3FE1A 2A5XA 5E26A 3TPQA 4EHTA 5AQFA 3SMSA 1T6DA 3D7EO 1MDUB 1HKGA 1KXPA 2CGJA 3HZ6A 5JMVA 4BC4A 4BGBA 3U9ZA 4H5NA 4CZFA 4BR5A 1NMDA 4JN4A 3ZETA 5EY4A 5FPMA 1NM1A 3QICA 5AFUH 2IVPA 4FWLA 3EZWA 4BRNA 5LJWA 3FZHA 2E2QA 4CD1A 4HTLA 4I6MA 3HI0A 4H0YB 3KHYA 3LDLA 5ADXH 3QFPA 2E20A 4IJAA 3HBTA 5BRFA 4BVPA 1GLDG 4BQZA 2A6AA 3L6QA 3ZX2A 3CHWA 3O6WA 4BC3A 4H5RA 1QHAA 3W3DA 3D2FA 4CZEA 3LDNA 1HJOA 4JD2B 1ZBSA 5BRHA 3B8AX 4AM7A 1BA1A 4YDUC 3UKUA 3SK3A 3CJ7A 1WUAA 4Y0WA 2E2NA 4FL9A 5I9EB 1TYQA 1NGCA 4C23A 3KZBA 2E88A 5AQZA 3CJ9A 3VESA 2ZF5O 3U8XA 5KQDA 4FPAA 2ASPA 4Z94A 4LC9B 1NGFA 1BU6O 2P9IB 3L0QA 4NB4A 4BR4A 3L4IA 2FLOA 2E1YA 5AQVA 2ITMA 5AQQA 5AZIB 4BRPA 2BUPA 4BC5A 4RWTA 2FSJA 3A0IX 5AQMA 3CI5A 1J6ZA 3MN7A 4XH1A 1BO5O 4NO7A 1QQOA 4ISFA 1NWKA 4PKGA 4PKHA 4IXCA 4QS8A 3HSCA 1OKJA 2YI1A 4FWOA 2AP1A 4BROA 3GBTA 1X3MA 2NLXA 4IWVA 5AQOA 3S41A 4MLHA 4B1UB 1QZ6A 5AQTA 3WT0A 1MWMA 5LY3A 2E1ZA 1HKBA 3CETA 1S3XA 3WUHA 3MN9A 4EAHD 3GL1A 4H03B 1V4TA 3JXUA 2GUPA 4B9QA 4FWQA 4H5VA 3GE1A 4M7XA 2W41A 3QDKA 3ID8A 4K41A 2P9LA 3CJAA 1GLJO 4BVOA 1CZAN 2PAVA 3A8YA 2CGLA 3C7NA 3UKRA 3VEWA 2HF3A 4E1JA 3WXKA 3AY9A 2EWSA 3HTVA 3W0LA 5EVZA 4B1VA 5AQRA 5BR9A 3LDQA 3M1FA 2IVOA 3A5OC 3EKSA 4F9OA 1MA9B 1V4SA 3BF1A 3LDPA 3VETA 4DB3A 5AFUA 2V51B 3DAWA 3O5BA 1NBWA 1GLLO 3H1VX 1HKCA 4JHDB 3WEEA 3WXJA 4H5TA 1H1VA 5AQNA 5KPZA 1SAZA 3H3NO 5AQJA 3DXMA 3DXKB 2GELA 1XUPO 5AQWA 3M6GA 3O1BA 5LJVA 4BR0A 1RDWX 1ATNA 1RGIA 1U6ZA 3A5MC 5AZJA 1SZ2A 2FF6A 2OANA 1QQMA 2ZGYA 4GY2B 4PL8A 3TU5A 3VEXA 5AQSA 3HM8A 4B1XB 3ENOA 4XH5A 4MO4A 2P9KB 2DPNA 5AQUA 2HMPA 2V7ZA 2Q2RA 5FPEA 3CERA 4M7YA 2QWPA 4CBWA 3QB0A 4KBOA 3VENA 4FOIA 4BRCA 4K43A 1ATRA 3SLCA 5JLHA 3ZX3A 2HF4A 3R6MA 2P9SB 4FPBA 1YAGA 2V52B 3RSEA 4CJ7A 1P8ZA 3IDHA 3VGMA 5EXWA 3FZMA 3KVGA 2CH5A 4M63C 5AQLA 3UB5A 3ZETB 3SJHA 3WQTA 1MWKA 4CZJA 4A2AA 5AQPA 1TUYA 2YHWA 4BG8A 4BRKA 3OHRA 4DQ8A 1SQKA 4BREA 3C0BA 2FSNA 1K8KA 1DGKN 4WQ5A 3A5LC 4I6MB 2F9WA 1GLFO 3U4LA 2QWOA 3H1QA 1T44A 3ULEA 1LCUA 1ZC6A 3VEOA 1NGGA 3MN5A 4BR7A 3ZX0A 3A5NC 4FOEA 1NGEA 1HX1A 3D2FB 3MK6A 1JCEA 3H6EA 3CIPA 5ELZA 2P9PA 3VEVA 4BRQA 4K42A 4H5WA 2ASOA 2P9UA 5AQYA 4BRDA 1BWFO 2A40A 4IJNA 3UKUB 5FPNA 1XQSC 2H3GX 3WXIA 4BRGA 1TYQB 2A3ZA 4A61A 3ATUA 2V7YA 4FWRA 4ISGA 4QS7A 4O5FA 5F2RA 2GTDA 4FWPA 4BR9A 1QZ5A 4B1YB 5BPMA 2GWJA 1Z05A 4B1WB 4WQ4A 3I33A 1U2VA 4XEIA 1E4FT 5AQXA 1BA0A 1GLCG 1R59O 2ZGZA 4MO5A 4WQ5C 3WXLA 4FWNA 3D2EA 2E2OA 2YCHA 2NZTA 3VF4A 3H3OB 2VCPA 4RTFD 3ZEUA 1DKGD 4JAXA 3VEZA 3IMXA 3LDOA 2A42A 5FPDA 5AQKA 2P9NA 5AQIA 2FXUA 1NLVA 2YJEA 5JICA 4CZMA 2GWKA 1WOQA 5ADXA 3O1WA 2CH6A 3IUCA 1C0GA 1HLUA 1NGHA 2AA4A 4K25A 1NGAA 2Q0UA 4CD3A 5AR0A 2P9LB 2PBDA 4FWSA 3C7NB 3UKRB 3EN9A 4PKIA 2A41A 3O4WA 3CJBA 1IG8A 5F1XA 4H0PA 1JCGA 3J8AA 2QWMA 4BRLA 2E8AA 4WYBA 4IO8A 3LM2A 2GEMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2RKIA 3QMLA 3AVCA 2QWNA 3VPZA 5TKYA 2KFNA 2YHXA 5C2FA 1T6CA 4CK3A 4Y1DA 3QETA 3THWA 1M90O 4EZ9A 4JD2A 1VQON 3CQXA 4FSVA 3GDQA 4J8FA 3O08A 4N41A 3QESA 1YVNA 3I56N 1YXQA 3R3LA 2WUSA 4CBXA 1S22A 4DHYA 5M1OA 4ZHRA 2ASMA 3TAFA 1S72N 4BRMA 2P1JA 1HNZK 1M1KO 4CHYA 3VEYA 5AZIA 4FJ9A 3AGRA 4DV4K 3QNOA 4RCHA 4QS9A 4DU1A 1ESVA 5CR4A 4ISEA 3EKUA 4DTRA 4RW8A 3DJCA 3UE5A 2Q0RA 3NH2A 4FJMA 3GG4A 5BPLA 3THXA 2DY4A 3ZT3A 4JKGA 3J7YP 4M3UA 1LWCA 4CHNA 4H0TB 3RWUA 4CBUA 3CG7A 4Z0UA 3C65A 3R8EA 1BUPA 3VF2A 4DLGA 4FLVA 1BIUA 1TUUA 4FK4A 1S9EA 3BZKA 3U9DA 2QXLA 4B9VA 4RW9A 3VQBA 1DEJA 2OTJN 3ULEB 1XI1A 4W5NA 1HQUA 2QTDA 1UOCA 2ZJRL 3VGKA 3KWIA 1Y64A 4E3SA 2UUBK 3BUZB 4KI4A 2CGKA 1D9FA 1OVYA 1BG3A 2J4RA 2E6MA 4AM6A 3OTOK 1W9HA 4KHSA 4GV3A 3EL2A 4QCLA 3OA9A 2NRWA 4DMNA 1LWFA 1OH7A 3JS6A 3VGLA 3VQPA 1B9FA 2IIRA 1YUWA 3S3MA 1NGDA 5HRRA 3ZSQA 4ELUA 3QBXA 3U3YA 2OPPA 4YOXA 4FM2A 3OBYA 4CZIA 4L3QA 3E1YA 1GLBG 4Z4EA 3HPOA 4A2BA 4HUGA 3THVA 4WFAL 3VQ9A 3QEPA 4JI2K 2O8EA 4FJ7A 2NRZA 1BCMA 3VQ4A 4BE0A 3NH0A 3RTVA 1RFQA 4WFBL 3V9UA 4KTQA 3I8BA 1GOBA 4JV5K 3TTFA 4CHPA 3G25A 4KKOA 3DLGA 4BRFA 4MLEA 3FE1A 5TKWA 4M3RA 3LP3A 3TI0A 4NCAA 2BANA 4PA1A 4R79A 5KGXA 3D7EO 2WOMA 4N47A 4FCYA 3LAMA 4BC4A 5KRSA 4H5NA 4O5BA 2O4GA 5FPMA 3MECA 1ASVA 3NE6A 4W5OA 5AFUH 1YTUA 1WBDA 4HHTA 2OTLN 4NCGA 4M45A 4CD1A 4GKKK 1BISA 4I6MA 1VRTA 2OA8A 3CM5A 2BGGA 1JLAA 4DTNA 3RMBA 4DV7K 4BQZA 4JRQA 1QHAA 4V19S 2OPQA 3VQCA 1HNWK 3LDNA 1RT4A 4MFBA 1RBSA 4JKCA 4YDUC 5I42A 3SK3A 3CJ7A 1WUAA 5I9EB 1YF5L 4HUEA 3JSMA 4M41A 3CJ9A 4E7LA 2F8TA 2ZF5O 1C1CA 4QOZB 4LC9B 2O8CA 4JS5A 1ASUA 4KPYA 1BU6O 2P9IB 3L0QA 4NB4A 4BDYA 2FLOA 4CJPA 4DR3K 3KLFA 4DSFA 2ITMA 3G4SN 4E0DA 3ALYA 4BC5A 3OYFA 3A0IX 2OPSA 2B6AA 4XH1A 3MN7A 3PUFA 4CGJA 4KB0A 4QS8A 2UUCK 4IXCA 3O3HA 1K6YA 3NVKA 1X1PA 1RILA 4BDZA 2UXCK 3SUPA 3S41A 1EP4A 4LFBK 4O8UA 4LF4K 5J2NA 5LY3A 3IAYA 1HKBA 4CJ4A 4LSLA 5HOOA 2Z1HA 3BGRA 1HNXK 2G8WA 4M7XA 2P5OA 3TTDA 3CJAA 1WAJA 3UKRA 1XHXA 3HPHA 3HTVA 4KO0A 5EVZA 3IKMA 4B1VA 3DLRA 5CY4A 4IBNA 1J5EK 4DB3A 5AFUA 4FJJA 3DAWA 4FJ5A 3RMAA 4CF9A 1NBWA 1N33K 1GLLO 1HKCA 4JHDB 4FJKA 1H1VA 4E7JA 5AQNA 3N4QA 1SAZA 4JK8A 1XMQK 3CD6N 3CCUN 4FM0A 2VG5A 3O1BA 4DR1K 3NFAA 1RDWX 1ATNA 4DQPA 4QAGA 3A5MC 3O4QA 3NF6A 4GY2B 3TU5A 5AQSA 3HM8A 4M42A 3OYIA 3TANA 1RTDA 1RBVA 3M8RA 2Q2RA 4AHTA 4EP5A 1ZBIA 2GUIA 3VENA 2QK9A 3H08A 1L3UA 4KH5A 3SLCA 4JI1K 2HF4A 4KHUA 4LFCK 4F4KA 4CJ7A 3OYAA 5EU7A 4G1QA 3SQ1A 2B5JA 4CGDA 3UB5A 1SL1A 4AH9A 5DMRA 3OYGA 5C25A 5LMNK 3ZETB 3SJHA 1MU2A 1VRUA 1MWKA 1VSEA 3HYFA 4CZJA 1BGXT 3OHRA 3NF7A 3OYEA 1SQKA 1QSLA 4KREA 4DS5A 4ZTFA 4CGFA 4E7KA 1CZBA 1X9MA 4DU3A 4IKFA 1C0MA 1A5VA 1IKVA 4YOVA 3PLAA 2R7YA 1T44A 3ULEA 3VEOA 3EYZA 3MN5A 4UQGA 4CF0A 4CHZA 4YOWA 1NGEA 3D2FB 3TAQA 5ELZA 4IDHA 3VEVA 2DFEA 5AQYA 4BRDA 2IC3A 3TR8A 3UKUB 4DQQA 5FPNA 2G8UA 5M1FA 3RR7A 1TYQB 1CXQA 3C95A 3ATUA 2V7YA 2ZQBA 4C8LA 2XO7A 4BR9A 5M1PA 4AHVA 4B1YB 2GWJA 2XY7A 3D6RA 4WQ4A 4XEIA 1VSMA 1R59O 4MO5A 3U6FA 3Q7CA 4DFJA 3LWLA 1JLBA 3ULDA 4IG0A 4FWNA 1YHQN 3G0ZA 4R5PA 2NZTA 3VF4A 3LP0A 3L4QA 4RTFD 3HVRA 1LAWA 3IMXA 3LDOA 2KQ2A 5GIPA 1YIJN 4K8XA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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