The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
20
|
sequence length |
90
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structure length |
90
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Chain Sequence |
TRYIPDEADFLLGMATVNNCVSYRNPAEGTWYIQSLCQSLRERCPRGDDILTILTEVNYEVSNKDDKKNMGKQMPQPTFTLRKKLVFPSD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
|
| molecule keywords |
Caspase-8
|
| publication title |
Kinetic and structural characterization of caspase-3 and caspase-8 inhibition by a novel class of irreversible inhibitors.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
20
|
| structure length |
90
|
| sequence length |
90
|
| ec nomenclature |
ec
3.4.22.61: Caspase-8. |
| pdb deposition date | 2009-11-03 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Alpha-Beta Plaits | Caspase-like |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GJS B; 2QLB B; 2H5I B; 2CDR B; 4DCJ B; 2QL7 B; 3D6H B; 1BMQ B; 1RWK B; 1I3O B; 1RWV B; 1RHR B; 2DKO B; 3GJT B; 1PAU B; 4JB8 B; 5IC4 B; 1RWX B; 2CNN B; 2Y1L B; 2QLJ B; 2HBR B; 4ZVU B; 4DCP B; 4LSZ B; 4ZVQ B; 4DCO B; 1RWO B; 3KJN B; 3R7B B; 3EDQ B; 2H51 B; 2H5J B; 2CNO B; 3D6M B; 1RWP B; 1RHM B; 1RHJ B; 3IBC B; 2C2M B; 2P2C B; 4ZVR B; 3P45 B; 1SC1 B; 2XYG B; 3QNW B; 1NME B; 5IC6 B; 2CJY B; 1RWW B; 1RHU B; 4ZVS B; 3EDR B; 2HBQ B; 3R6G B; 3SIP B; 1GFW B; 2HBY B; 2C2O B; 1RE1 B; 1IBC B; 3IBF B; 2QL5 B; 3P4U B; 3R6L B; 1QDU B; 2XYH B; 3RJM B; 2H4Y B; 2H65 B; 1RWN B; 2XZT B; 3R7S B; 3KJF B; 2CNK B; 2QL9 B; 1QTN B; 3R5J B; 2C2K B; 3KJQ B; 3GJR B; 2H54 B; 3NS7 B; 1ICE B; 3GJQ B; 5K20 B; 2QLF B; 1I51 B; 2H48 B; 3D6F B; 2C2Z B; 2XYP B; 1SC3 B; 2CJX B; 2Y0B B; 2H4W B; 1PYO B; 4ZVT B; 1SC4 B; 4ZVO B; 1RHK B; 2HBZ B; 3R7N B; 2XZD B; 4ZVP B; 1RHQ B; 1F9E B; 2CNL B; 2FQQ B; 1RWM B; 2C1E B; #chains in the Genus database with same CATH topology 3GJS B; 4ZKA A; 1RAH B; 3BH7 B; 2NSB A; 3B54 A; 3WIU A; 2JEF A; 2HLU A; 2XLK A; 4HT7 A; 4NZ6 A; 3OBI A; 3TAP A; 2NUH A; 2DNQ A; 3OVB A; 4QWD A; 1F9H A; 4LRE A; 2NCK L; 3FZB A; 4DV6 F; 2E1C A; 2DGX A; 5FJ4 A; 4O3P A; 2DR7 A; 4OFZ A; 1EET A; 2CZV C; 2AT1 B; 2ZM6 J; 1U0H B; 1KS2 A; 3TJ8 A; 1SV5 A; 2RB7 A; 1VK3 A; 2LKZ A; 3OTO F; 4N7T A; 2QGF B; 5T7L A; 4A8S A; 2CPJ A; 2L9D A; 1JB0 C; 4J9U E; 3KHG A; 4L76 A; 4F8R A; 2AJQ A; 3DRX A; 1NB7 A; 1HBU A; 4I68 A; 1VQ7 S; 4CLF A; 4ZLN A; 2V2Z A; 4P2S A; 2A6O A; 2MKH A; 1VRT B; 4K4S A; 2YX4 A; 4O23 A; 5EX0 A; 4P72 A; 2FJE B; 4NL5 A; 2EEY A; 4ED5 A; 2HQ3 A; 2B6A B; 4Q45 A; 2Q1L A; 3CCL S; 4FVC A; 2IM2 A; 3HFZ B; 2MGZ B; 3D1Q A; 1NSK L; 2OFG X; 1VC6 A; 2F3J A; 1UTA A; 2A1B A; 3AD7 C; 1TKT A; 2IAJ A; 2B4V A; 2YNH B; 1R89 A; 2MY7 A; 2BOA A; 2HS3 A; 2PMW A; 4FKY A; 3ULH A; 2C2R A; 4G6V B; 2LXF A; 3O5T B; 2ZJQ Q; 4LF4 F; 2B9E A; 2CJ9 A; 2LEC A; 2W9B B; 2DPI A; 3NL0 A; 2VQE F; 4NI2 B; 3MAH A; 4LSN B; 3IAM 9; 2I1R A; 2YKP A; 3Q8Y A; 1UKU A; 4LVN P; 3IRX A; 4O3O A; 1M5O C; 3QZ8 A; 2VZ9 A; 2KN4 A; 3R6G B; 4FVM A; 3LAN A; 1UVL A; 1APS A; 1I6J A; 2LEA A; 4XO0 A; 4KV8 A; 5BYS A; 2AZ1 A; 3UNG C; 3CCU S; 2ALZ A; 3MGJ A; 4Y34 A; 4HI1 A; 2N3L A; 4OYB A; 3D66 A; 3MD1 A; 2CQ0 A; 3PZP A; 4FYV B; 2CPD A; 3G9C A; 1QAX A; 4JBC A; 1R31 A; 3ZZO A; 4DUZ F; 1CJK B; 2XBP A; 4EI2 A; 1D0E A; 4ELT A; 4DV0 F; 2J0Q D; 5I4M A; 2GO9 A; 1OO0 B; 1GX5 A; 4MKV A; 3M6V A; 3VWS A; 1MU2 A; 3M8R A; 2BKO A; 2DTJ A; 4NCA A; 2W7O A; 3KLI B; 3B4M A; 2HBR B; 3I32 A; 1YBT A; 1XEZ A; 3N6M A; 4ZHR B; 1O51 A; 4UZC A; 2W4D A; 2DR8 A; 4QIV A; 1UA1 A; 4B3S F; 3OTB A; 2AIR B; 1OQ3 A; 5L8R C; 4ECV A; 4DR2 F; 4F4W A; 4WP8 A; 2PGC A; 2IYG A; 1U8W A; 2LXI A; 3ELH A; 2WCX A; 4LF9 J; 4DQS A; 3OW2 R; 1UZD A; 1XN9 A; 3V6K A; 3PAC A; 3R2D J; 2QL9 B; 3ZZU A; 2RDD A; 1HNZ J; 2FZG B; 3MD3 A; 4NA2 A; 3M8Y A; 4X4N A; 4G65 A; 5HRO B; 1U0H A; 5JUM A; 4DL5 A; 3GZ7 A; 4R0E A; 2OSR A; 4LF5 F; 2Z8Q A; 1DZ5 A; 1RT6 B; 2JEJ A; 2CNL B; 1VQK S; 1L3T A; 3GIJ A; 2GC8 A; 3ILO A; 1YJ7 A; 3SCJ E; 3MOJ B; 1RWV B; 1WI8 A; 2ZE2 B; 4NXN F; 1N36 J; 1WC0 A; 2GV1 A; 4ZOS A; 4NXM F; 3QT6 A; 1VRT A; 4CT9 A; 2MPU A; 5J1P A; 2VC0 A; 2ZNZ A; 1S57 A; 2BE2 B; 1VQY A; 3UQS A; 3W2W B; 2B6A A; 1FDD A; 2HUR A; 4NWB A; 3AB2 B; 4GVL A; 3NP5 A; 5B0F A; 4A47 A; 1ZOT A; 3NWG A; 4EMD A; 1JQG A; 2YNH A; 1QY7 A; 1RTJ B; 4PQA A; 2W9A A; 2CQ1 A; 5DG8 A; 3ZZ0 A; 4I7F B; 3Q23 A; 4F0K A; 5LMN J; 3ILJ A; 4QWA A; 5E33 A; 2ZC4 A; 3EIC A; 1RT3 A; 4NI2 A; 5D0R A; 3PFO A; 1F2G A; 2HQC A; 2KKH A; 3M9N B; 1JK9 B; 1K44 A; 4ES1 A; 3HVA A; 2E44 A; 4FPI A; 4X84 A; 2FVC A; 2CA9 A; 2IC3 B; 2KXH A; 3VZH A; 2CZ9 A; 3H7H B; 3JSR A; 4DV3 J; 3N6L A; 4JV2 A; 3VAI A; 3JTN A; 2OO4 A; 3KKF A; 4KHP F; 4RR5 A; 5F0W A; 3CDB A; 2YH1 A; 2CQD A; 3IWL A; 2ZUA A; 5ETP A; 2L41 A; 4OZ0 A; 1EJ7 L; 3J7A 1; 2HKE A; 4K7Q A; 4H4M A; 2FJA B; 1B70 B; 2VL1 A; 2XNR A; 1CJK A; 4IQX A; 5KT4 A; 4D3H A; 2YX1 A; 1SH0 A; 1Z2L A; 4PR6 A; 2EBE A; 3KK1 B; 1ZAX A; 1FFS B; 2QYG A; 3IM8 A; 4ZPB A; 2MQQ A; 1IWA A; 1K1S A; 3KLI A; 4CM0 A; 4USU A; 1SL1 A; 4E2F B; 4AQY F; 2HRT A; 2K1R B; 5KFC A; 3CDA A; 3DRS B; 1Y0H A; 1MN7 A; 4DR1 J; 4ZP6 A; 4ZK7 M; 3R5J B; 2U2F A; 4C3M A; 2J76 E; 1S1X B; 2ZH3 A; 1Z2Z A; 1UWA A; 3RB4 A; 1S1V B; 2XMV A; 2UZA A; 1PYO B; 2F8M A; 2AEJ A; 4KAI A; 4DLG A; 3Q86 A; 3CCV S; 1U0S A; 1NXI A; 2CQC A; 1B64 A; 4M5D B; 4QIF A; 1F3V A; 2FJB B; 4NRT A; 4DZD A; 5HRO A; 4KFB B; 4AND A; 1RAC B; 4JYA F; 3MOZ A; 3ZZZ A; 1QAJ A; 3FUY A; 1EAR A; 1BC6 A; 4K4Y A; 1RT6 A; 1HNX F; 1B7F A; 4X65 F; 3CD6 S; 2LEB A; 3QNW B; 3V4I B; 1X4G A; 2QA4 G; 4O3R A; 4PUO A; 3FEX B; 3HSD A; 4FYY B; 1YJU A; 3HFK A; 5ETV A; 5GAD U; 1C2P A; 2OKQ A; 2WBM A; 2NXE A; 1Q8L A; 1X9W A; 2EK6 A; 2QSW A; 2BE2 A; 2DK2 A; 4BDP A; 1Z1Z A; 3W2W A; 1FNX H; 4LRD A; 3PDN A; 4C4W A; 2G4B A; 4OL8 A; 2LDI A; 4HHJ A; 5IFM A; 3NNC A; 3F44 A; 1KVK A; 1LNQ A; 3MEE B; 1PIL A; 4WXO A; 2QJ3 A; 2WVD A; 2X3G A; 2R8K A; 1KNZ A; 1RTJ A; 2YQ3 A; 5C24 B; 2XCP A; 1EHW A; 4PAB A; 4RNN A; 5G4D A; 4I7F A; 3UFC X; 3MMJ A; 1L3S A; 4URS A; 2GVD B; 1SJF A; 2V9W A; 1ARO P; 4PPD A; 3OUY B; 1N32 F; 1F5A A; 2AYB A; 3EVW A; 3FEZ A; 5CH7 B; 4JI3 F; 3A1Y G; 4J37 A; 4YR3 A; 2XG8 A; 4XIU A; 1K1Q A; 1ZM9 A; 1FTR A; 1WF2 A; 3OFG A; 1RT1 B; 2JSX A; 4DV2 J; 3K5N A; 4DPX A; 2HHH J; 5F9L A; 4I0W A; 1MMN A; 1TUW A; 5DQH A; 1P8G A; 3L95 X; 4ED0 A; 4YB6 A; 5ETL A; 2RT3 A; 2RUG A; 2UXC J; 4CO0 A; 4PZV A; 4V1A k; 3THT A; 3BR9 A; 1ZS6 A; 3VHQ A; 2P6T A; 4ZIT A; 2K1R A; 2AQ4 A; 4AUK A; 3IN5 A; 2WVE A; 2DH8 A; 3GWC A; 1SQE A; 5K8P A; 1WOP A; 4JV5 F; 1NEE A; 3UN3 A; 1NO8 A; 4U95 A; 1S1X A; 2J7K A; 2XSJ B; 1WEX A; 4TY8 B; 5KAK A; 1J5O B; 4DSJ A; 1E6V B; 1H74 A; 4X4S A; 5DGA A; 2YBV A; 4ANC A; 3MTK A; 1FWL A; 2G0I A; 1CLF A; 4P75 A; 3TI0 A; 4JI4 J; 5I3P A; 4EYH B; 1CJU B; 3GFH A; 2NPF A; 2MKY A; 3SDE B; 1X4F A; 4M5H A; 1SB6 A; 2Z2Z A; 4F67 A; 2CJK A; 4PWW A; 3TUP A; 1TV6 A; 2QFI A; 1R0C B; 4KGV B; 4MYT A; 4HTI A; 4KFB A; 4MTP A; 4KJI A; 4NZ7 A; 2XY5 A; 2EWH A; 2BZ2 A; 3WC2 A; 1UFL A; 4RWX A; 4F0M A; 2J7U A; 1VLO A; 4P2X A; 1LFP A; 1YJ9 S; 3N5B A; 3PHT A; 3V4I A; 4LF7 F; 3TA0 A; 3NOG A; 4QQB A; 4KB7 A; 4CH7 A; 3CJ0 A; 3UDC A; 2DNP A; 4DSK A; 3GV5 B; 4DQI A; 2I2Y A; 2EC0 A; 1CBK A; 2H5I B; 2KJV A; 2VG5 B; 2A2C A; 2QSF A; 3ZTS A; 3ISN D; 3AHP A; 1Q95 G; 1PAE X; 2VFR A; 4Q8E A; 2RRB A; 5F3Z A; 2F8H A; 1XR6 A; 4WP9 A; 5B0D A; 3DCA A; 1W2B R; 3DU6 A; 3MEE A; 4F36 A; 2YWW A; 1CQN A; 2BA9 A; 3IBC B; 3TJ9 A; 2D3U A; 3H4D A; 1JLF A; 5C24 A; 5GMK a; 3KUH A; 1SJR A; 5HVF A; 2AX0 A; 2K3I A; 2DNK A; 2UUB F; 1URN A; 2RVJ A; 2GVD A; 2BE9 B; 1TK8 A; 3RB3 A; 2Y8Y A; 2BJ7 A; 4DL7 A; 3W8G A; 3ILI A; 1RT5 B; 3R7S B; 2CPY A; 2DBB A; 4IRK A; 2BKP A; 4ZIW A; 2V4R A; 3F73 A; 1HBN B; 1RT1 A; 3ZZP A; 4IR9 A; 1ZA2 B; 4G1P A; 3EUN A; 1SJ3 P; 1WC6 A; 4USK A; 4DQP A; 4RBV A; 1RHQ B; 4DHV A; 5KFM A; 1PC5 A; 2HQI A; 2FHJ A; 3NAH A; 2HVZ A; 4ER8 A; 4F04 B; 1IBM F; 4NLU A; 1T9Y A; 2DEI A; 2H3E B; 4OYM A; 2ZH1 A; 1CSJ A; 1FKO B; 3H98 A; 4L3N A; 2FUG 9; 2IM3 A; 2V67 A; 3RAQ A; 4UW2 A; 2WB4 A; 5KFZ A; 2R7S A; 5EUH A; 3VAM A; 4ZPD A; 1G6B A; 4LT6 A; 1T05 B; 4A8M P; 1TK5 A; 2VBZ A; 3UDE A; 4CH1 A; 1UMJ A; 1XR5 A; 3TEH B; 2CPE A; 4DQR A; 2HBQ B; 2E5H A; 4RW4 A; 7FDR A; 2W2P P; 2XSJ A; 3C2P A; 4TY8 A; 1J5O A; 1EQM A; 2HFN A; 4ECW A; 1E6V A; 1IKW B; 1PKU A; 4DPY A; 1SCJ B; 2DRD A; 1FNM A; 3M2R B; 2HVE A; 2KU7 A; 3CC2 S; 3Q8P B; 5AT1 B; 4C8M A; 4N8O A; 4TU9 A; 3MFH A; 3MMB B; 2W01 A; 2EKN A; 5K20 B; 2HRU A; 2BJ9 A; 2FYX A; 1A0O B; 3SDE A; 3SSR A; 4ZIV A; 3DC2 A; 3OVS A; 1S49 A; 3HD2 A; 5KFS A; 1FVQ A; 3NLC A; 4WK3 A; 1F3F A; 3EM1 A; 3MUM P; 3UDL A; 1U45 A; 1RT2 B; 1X0F A; 4HT5 A; 4NAS A; 3FDS A; 1FRI A; 2HQD A; 4J9P A; 1OYE A; 3H59 A; 2PEB A; 3VCD A; 1TVR A; 4ZPT R; 3DXB A; 4CTA A; 3QBC A; 2FC9 A; 2ZWP A; 1WKJ A; 4OHW A; 4QPX A; 1RHJ B; 5KG0 A; 4YY3 J; 4WBF A; 1NJX A; 4NYZ A; 2VG5 A; 3HUL A; 1HPZ B; 3T1Y F; 5GVQ A; 4NLR A; 4FN5 A; 3W5Z A; 2HFU A; 2ZC3 A; 4KIA A; 1S97 A; 1T7P A; 3IGN A; 4DV4 F; 2KHD A; 4K2J A; 3POT B; 2H54 B; 2EPI A; 2CJB A; 1A6L A; 4CLW A; 2VIC A; 2AWZ A; 2P9C A; 3GV7 B; 1FWK A; 3EVM A; 4WFB Q; 3CB4 A; 3OV7 A; 3U1L A; 4ECU A; 3GCX P; 3H90 A; 1RT5 A; 2HWT A; 1F1B B; 1N48 A; 3CD0 A; 3QWU A; 2XNQ A; 2WVC A; 4LFB F; 2P5V A; 4DV5 J; 1N4L A; 1FT8 A; 1HBN A; 2X3D A; 2OJ3 A; 2W24 A; 5B0E A; 1XK8 A; 2E5L J; 1KVJ A; 2CWX A; 5E3Q A; 1NAQ A; 2NLW A; 1FJE B; 1WG4 A; 1C1C B; 4FXW A; 2B9W A; 2LDY A; 4B02 A; 1FKO A; 3W60 A; 4LFA J; 2NXN A; 3W9I A; 5KOW A; 5IM0 B; 1HW9 A; 4IH7 A; 4KPY A; 3IS9 B; 2GO8 A; 3CED A; 3T1H F; 3H2U B; 2MB0 B; 4J9S A; 3KLG A; 3GFZ A; 3LA0 A; 1VIO A; 4JI0 F; 1T05 A; 3O8W A; 4C9D A; 1NHV A; 3G86 A; 4X4V A; 1DQ9 A; 1UW9 A; 3D1H A; 1WJ9 A; 3VV2 B; 4CLS A; 3UCG A; 1IKW A; 4OI3 A; 3C19 A; 2DNG A; 3M2R A; 3BSC A; 3SZ2 A; 1JJ4 A; 3T5J A; 2Y1L B; 2FVS A; 1OIA A; 3MMB A; 4OLP A; 2GHP A; 4DUY J; 5A8W B; 2GJ2 A; 2IJR A; 2V4J B; 2AU0 A; 2DIU A; 1EKS A; 3PKM A; 4KTQ A; 4WJB A; 1S72 S; 3GSI A; 2ROE A; 4IQM A; 3Q24 A; 3FRY A; 3HP6 A; 3QID A; 3A8K A; 4M5K A; 3NAI A; 4U7U K; 1RT2 A; 1QVG R; 3HLU A; 2V2V A; 3JYT B; 1YWX A; 3PHE A; 3LGN A; 3CGI A; 3MCM A; 3FZ2 A; 2FLO A; 5EN1 A; 4KKO B; 1MWZ A; 2CFX A; 2VDI A; 2B9Y A; 3H5X A; 3KJQ B; 3R5C A; 2GIF A; 3Q8R B; 1DJ0 A; 5C5J A; 1ZTT A; 1HPZ A; 2UUA J; 5BXI A; 2HBZ B; 2GAH C; 3JQK A; 2YKM B; 3HM9 A; 3J7Z 5; 1RTZ A; 1CUL B; 2AZ3 A; 1X4C A; 4LJM A; 4B3M F; 2O1P A; 3AQP A; 3BM7 A; 1HHT P; 1R6Y A; 3RBX A; 2VPY B; 4FS1 A; 2KL8 A; 4MKB A; 1VYA A; 2HW3 A; 4DCP B; 3E51 A; 4Y28 C; 1H2V Z; 3LWM A; 1N5Y B; 1AA1 B; 4RW7 B; 2PEH A; 5E3R A; 3H5S A; 3TX8 A; 1YJT A; 1QSY A; 1XBW A; 1FVS A; 3VAH A; 1S0V A; 3DLK B; 1S10 A; 3OQ2 A; 2ROP A; 4PWU A; 1NKE A; 2FHO B; 3QAT A; 1Q53 A; 4LBI A; 1YX2 A; 2CWK A; 3T5H A; 4YUD A; 3JTO A; 4JI8 J; 3K7R A; 3PX0 A; 2R7R A; 4Q0B B; 2LQJ A; 2OPP A; 5D4P A; 1SXL A; 3QJL A; 2ACM A; 4O0I A; 3TEG A; 3PJ9 A; 4DWI A; 2X1G A; 2OD4 A; 4U96 A; 4OHZ A; 2LU2 A; 3G8T A; 1H0H B; 3BBF A; 4UY8 5; 4ZLP A; 3HJF A; 4PEO A; 1N33 F; 5IM0 A; 1N52 B; 5D0E A; 1N0U A; 4G1Q B; 2OEM A; 3IS9 A; 1O0P A; 4R5P A; 3K59 A; 1QTM A; 3BSN A; 2YH0 A; 4K0K F; 4ECY A; 1CC7 A; 1KFS A; 2WW4 A; 4KPC A; 4C0B A; 5DLF A; 1ULR A; 3MEG B; 3MM5 B; 1AFI A; 2PD1 A; 2PI4 A; 2RQ4 A; 2ZH8 A; 3EVO A; 3P45 B; 5HAO A; 4O3S A; 5DQG A; 3I55 S; 3KJV B; 2RKI A; 2DY9 A; 3LAK A; 3MMC B; 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