3KKXA

Neutron structure of human carbonic anhydrase ii
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Neutron structure of human carbonic anhydrase II: implications for proton transfer.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 73
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3kkxA00
4RH2A 4KNJA 4E3FA 4Q49A 4Q87A 4R5BA 1HUGA 2WEOA 3KIGA 5JGSB 1IF9A 3RGEA 3DVDA 6CA2A 3P5LA 4FIKA 1I9MA 9CA2A 2FNNA 3S71B 5CJFA 4YXOA 3K2FA 1FQRA 3D93A 3KNEA 3SAXA 1CAKA 1CAHA 5SZ6A 4WR7A 2Q38A 3OKVA 1TEUX 4Q6EA 5DSPA 5FNKA 4QJOA 4E3DA 3PYKA 3TMJA 1Z97A 3DCCA 3M3XA 4CNWA 3MWOA 5JDVB 3S8XA 1CNCA 4FU5A 4UOVA 4XFWA 3T5UA 3B4FA 4IWZA 3V3HB 2EU2A 4E5QA 1UGDA 3DCSA 4WUQA 5EHVA 2OSFA 1BN4A 3M2NA 3MNKA 2NNGA 1H4NA 1HUHA 3KOIA 4MLTA 3OILA 4FPTA 1ZSBA 2AW1A 2NN1A 4K0SA 2NXSA 1YDDA 3V5GA 1BNMA 3M5EA 4CNXA 3D0NA 4ETQC 2CABA 4FVOA 5JQTA 5EHWA 5EHEA 3OYQA 3S78B 1MUAA 4C3TA 4QJWA 5EH5A 5EIJA 1HEDA 4RFCA 2CBAA 5FDIA 4QJPA 1BNNA 4ZWZA 1H9NA 1UGAA 4HEWA 1IF5A 4RN4A 3T82A 1CVEA 3T84A 4CA2A 1CCTA 1AVNA 4Q90A 1TB0X 4K0TA 3F7BA 3RLDA 4FL7A 1AZMA 3OIMA 4WUPA 1DMXA 5DSOA 3S73B 3HKTA 4Q09A 5G0BA 1CAZA 1CILA 1MOOA 1IF8A 2WEJA 3DVCA 5CACA 3HKNA 1T9NA 3S76A 1FLJA 1I9NA 1I9PA 5LMDA 1XPZA 3KWAA 4MO8A 3DC9A 2HFWA 3IGPA 3CA2A 4YGLA 3P55A 4RIVA 1CVCA 2Q1QA 1FSNA 3MNHA 2CA2A 2CBEA 4E3HA 5BYIA 5AMLA 1HCBA 3M04A 1I90A 3F8EA 5BRVA 2X7UA 3V3GB 1ZGEA 1HCAA 1BNTA 5DVXA 4YXIA 1THKA 2O4ZA 3MHMA 5BRWA 4QTLA 3RYVB 4HF3A 3K7KA 3IBLA 2AX2A 2GEHA 4QSIA 3V3JA 5DSIA 1UGFA 4ITPA 5E2MA 1CA2A 3RG3A 1G54A 3S74B 2NXTA 1BZMA 2NNOA 5JESB 5SZ7A 1Z93A 1CCUA 5L6KA 5EKJA 1YDBA 3KONA 4PQ7A 4Q06A 3V3IB 3MZCA 1CAIA 1I9OA 4FRCA 4CQ0A 4DZ7A 1DMYA 2HNCA 4ZAOA 4MLXA 3N0NA 3M2XA 1TTMA 1YO1A 1CVFA 2NWPA 5JEHB 3RYXB 2POUA 3CYUA 3M5TA 4JSWA 5EKHA 4YX4A 5CLUA 3RYZA 4Q7PA 3JXFA 2EZ7A 4CACA 1ZH9A 4HU1A 3RG4A 3RZ8A 1CVHA 3MMFA 2EU3A 4XE1A 4XZ5A 1CRAA 1IF4A 1BNWA 3IEOA 1JD0A 5AMDA 5FL6A 3OY0A 2Q1BA 4QY3A 3V7XA 4KUWA 3RZ0B 3TVOX 5JQ0A 4XIWA 3NB5A 4FVNA 4KUYA 1BCDA 1LGDA 4PZHA 3P5AA 5E2RA 1LG5A 4E9OX 3HKUA 3UYNA 1JV0A 5G03A 2CBCA 5DSNA 4QSBA 5L3OA 5E5UA 3M1JA 5JEPB 5FNHA 3ML5A 5FNIA 3N4BA 5FL4A 1CAJA 1CNIA 2WD3A 4HT0A 2FMGA 5FNMA 4PYXA 3MHOA 1HEAA 4QJ0A 5DOHA 3TVNX 4G7AA 3DD8A 3LXEA 2QP6A 2HKKA 4ILXA 1CINA 5A6HA 4HT2A 4QIZA 1XQ0A 3EFTA 3M40A 4TWMA 4YHAA 1CANA 3RZ5A 3BETA 2HOCA 2FMZA 2OSMA 3IBUA 1V9IC 1RZDA 4JSZA 4QSJA 1LZVA 3U47A 3KS3A 4N16A 1ZE8A 3NJ9A 4Q7VA 3MNIA 1CNBA 3MHLA 1CNWA 3DBUA 1FSRA 4RUXA 1CNKA 4L5VA 3HKQA 4KV0A 1FQLA 4K0ZA 3M14A 3VBDA 3M1KA 2ILIA 1G45A 4L5UA 5DSMA 3S9TA 1FR4A 1ZSCA 3V3FA 2NWZA 1RAZA 4QSAA 1YO2A 3MDZA 4ITOA 3Q31A 3D8WA 4QK2A 3P3JA 3V2MA 2IT4A 1V9EA 1ZFKA 1FQNA 2HD6A 2QOAA 4QEFA 1BNUA 1KWQA 1RJ6A 4YGNA 5BRUA 5FDCA 3DAZA 4KP5A 1IF7A 3RJ7A 1KEQA 4MTYA 1RZAA 1KWRA 2X7TA 1ZNCA 1UGCA 3B1BA 4R59A 1IF6A 3PJJA 1G53A 2POWA 5G0CA 1CNXA 7CA2A 1H9QA 4Q08A 1FSQA 1CNJA 4M2WA 3IBNA 3K34A 4KNMA 5G01A 3BL0A 2FOQA 4R5AA 4LP6A 3GZ0A 3CZVA 1G46A 4LHIA 5E5RA 3S97A 3SBIA 3SAPA 1FR7A 3EFIA 2VVAX 2POVA 4CNVA 3R17B 3M96A 4QJXA 1A42A 1G52A 5EKMA 5SZ3A 4TWLA 3M98A 5EH8A 3W6HA 2FOVA 4KNIA 3M5SA 2NWYA 5JEGB 2WEGA 3CAJA 3OKUA 4CNRA 3HLJA 3ML2A 4Q81A 4Y0JA 4M2UA 4QJMA 4Q8XA 1Y7WA 5SZ2A 1CRMA 2ZNCA 4YYTA 1I9QA 1UGEA 1YDAA 1CAYA 3UYQA 4E4AA 2F14A 1I9LA 1BNQA 3JXGA 5FL5A 4K1QA 3HS4A 4YGJA 1CAOA 1CZMA 5DSRA 3F4XA 1JCZA 1YO0A 5DSKA 2NMXA 5FLOA 4HBAA 1OKMA 4PYYA 3KOKA 4ZWXA 3MNJA 4MDGA 1G6VA 4KUVA 3KKXA 5FLQA 1OKNA 3RZ7A 1CAMA 2NN7A 4E49A 1XEVA 4ZWYA 3SBHA 8CA2A 3T5ZA 5FNGA 4Z1EA 2FNMA 4ZX1A 5JG5B 3MHIA 4MDMA 4JSSA 3DD0A 4KP8A 3RZ1B 3U7CA 1CCSA 3S72B 3PO6A 1BICA 3MYQA 3R16A 1Z9YA 4RIUA 4Z0QA 3DCWA 3U3AX 3BL1A 3RYYA 2WEHA 3P3HA 3MNAA 5IPZA 3DA2A 4QK3A 2QO8A 2VVBX 4RUYA 12CAA 5HPJA 3OIKA 3M2ZA 5DRSA 4ZWIA 3ZNCA 3KLDB 1RZCA 5J8ZA 5DSJA 4KAPA 2NWOA 1HECA 3FFPX 3OYSA 3U45X 4Q99A 3M1WA 3N2PA 1UGBA 1CALA 4COQA 3MHCA 1RZEA 1LUGA 1CVAA 5FLSA 5DSLA 1RJ5A 4Q7WA 5SZ0A 2NXRA 1G4JA 1G1DA 1KOPA 1BV3A 5SZ1A 3ZP9A 1TEQX 5E2KA 4QK1A 4IDRX 1I91A 3S77B 2GD8A 4ZX0A 2NNSA 1BN1A 1HVAA 3C7PA 5FNLA 5FLRA 3T85A 4JS6A 5CA2A 1ZSAA 1G48A 1CVBA 5E2NA 3NI5A 3W6IA 3M67A 2H15A 2NNVA 1CNHA 2CBDA 2X7SA 4Q6DA 4Q78A 1UGGA 4RUZA 4Z1KA 1TH9A 3P44A 1CA3A 2ABEA 1EOUA 1CIMA 1CNYA 3DVBA 1LG6A 4Q7SA 5DSQA 5BNLA 4N0XB 5E28A 5A25A 1KOQA 4BCWA 3T83A 3P4VA 1CNGA 4DZ9A 2FW4A 3IAIA 1CVDA 1BN3A 3RYJB 4Q8ZA 5AMGA 4K13A 5E2SA 2W2JA 4QIYA 1G3ZA 1G0FA 1DCAA 4BF6A 4Z1JA 4KNNA 2FOYA 4XIXA 1BNVA 3DV7A 4X5SA 4MDLA 3QYKA 5JG3B 1OKLA 1XEGA 4L5WA 4YGFA 5C8IA 4Q8YA 4Q83A 4YWPA 5EOIA 1RZBA 1G0EA 5EH7A 5EZTX 2FOUA 4Q07A 5FLTA 3N3JA 4M2VA 5JGTB 1TE3X 4HEZA 4BF1A 1G4OA 3DC3A 3M2YA 3P58A 4WW8A 3D9ZA 3FE4A 1AM6A 3D92A 1ZGFA 4YXUA 3IBIA 4Z1NA 1RAYA 4RFDA 3L14A 1TG9A 2CBBA 3V2JA 2FNKA 3MNUA 1DCBA 4G0CA 4M2RA 1HEBA 4Q9YA 3S75B 4YVYA 1J9WA 3JXHC 5SZ4A 1TBTX 5FNJA 4PXXA 5SZ5A 4E3GA 1TG3A 4YGKA 2H4NA 4Q0LA 3M1QA 1ZFQA 1OQ5A 4GL1X 1URTA 3FW3A 1FQMA 1YDCA 2FOSA 4HEYA 4JSAA 5DOGA 2WD2A 2HL4A 4LU3A 1F2WA 3F7UA 3HFPA 4WL4A 5FLPA 4WW6A 1I8ZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RH2 A;  4KNJ A;  4E3F A;  4Q49 A;  4Q87 A;  4R5B A;  1HUG A;  2WEO A;  3KIG A;  5JGS B;  1IF9 A;  3RGE A;  3DVD A;  6CA2 A;  3P5L A;  4FIK A;  1I9M A;  9CA2 A;  2FNN A;  3S71 B;  5CJF A;  4YXO A;  3K2F A;  1FQR A;  3D93 A;  3KNE A;  3SAX A;  1CAK A;  1CAH A;  5SZ6 A;  4WR7 A;  2Q38 A;  3OKV A;  1TEU X;  4Q6E A;  5DSP A;  5FNK A;  4QJO A;  4E3D A;  3PYK A;  3TMJ A;  1Z97 A;  3DCC A;  3M3X A;  4CNW A;  3MWO A;  5JDV B;  3S8X A;  1CNC A;  4FU5 A;  4UOV A;  4XFW A;  3T5U A;  3B4F A;  4IWZ A;  3V3H B;  2EU2 A;  4E5Q A;  1UGD A;  3DCS A;  4WUQ A;  5EHV A;  2OSF A;  1BN4 A;  3M2N A;  3MNK A;  2NNG A;  1H4N A;  1HUH A;  3KOI A;  4MLT A;  3OIL A;  4FPT A;  1ZSB A;  2AW1 A;  2NN1 A;  4K0S A;  2NXS A;  1YDD A;  3V5G A;  1BNM A;  3M5E A;  4CNX A;  3D0N A;  4ETQ C;  2CAB A;  4FVO A;  5JQT A;  5EHW A;  5EHE A;  3OYQ A;  3S78 B;  1MUA A;  4C3T A;  4QJW A;  5EH5 A;  5EIJ A;  1HED A;  4RFC A;  2CBA A;  5FDI A;  4QJP A;  1BNN A;  4ZWZ A;  1H9N A;  1UGA A;  4HEW A;  1IF5 A;  4RN4 A;  3T82 A;  1CVE A;  3T84 A; 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