3KN6A

Crystal structure of the c-terminal kinase domain of msk1
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
315
structure length
282
Chain Sequence
KDSPFYQHYDLDLKDKPLGEGSFSICRKCVHKKSNQAFAVKIISKRMEANTQKEITALKLCEGHPNIVKLHEVFHDQLHTFLVMELLNGGELFERIKKKKHFSETEASYIMRKLVSAVSHMHDVGVVHRDLKPENLLFTDLEIKIIDFGFARLKPPNGYDESCDLWSLGVILYTMLSGQVPFQCTSAVEIMKKIKKGDFSFEGEAWKNVSQEAKDLIQGLLTVDPNKRLKMSGLRYNEWLQDGSQLSSNPLMTPDILGSSGAAVHTCVKATFHAFNKYKREG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Ribosomal protein S6 kinase alpha-5
publication title The crystal structure of the active form of the C-terminal kinase domain of mitogen- and stress-activated protein kinase 1.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 93
structure length 282
sequence length 315
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2009-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kn6A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kn6A01
1JVPP 4QP7A 3W2CA 3QX4A 3GOKA 4WRSA 3V51A 4YO4A 2WU7A 4RIXB 1ZYDA 2QD9A 4FKSA 1Q8UA 4UXQA 3GCVA 3O8PA 3QLFA 4O96A 4W9XA 5BUIA 4FTNA 5HG8A 3UPXA 4M7IA 4R78A 4TY1A 2OJ9A 3KQ7A 2YLEA 2VWWA 4CT2A 3DCVA 3EYHA 3K5UA 4ENXA 2PL0A 5LCKA 5CSPA 4Y85A 4V0GA 5IU2A 1REJA 3L8SA 3ZEWA 4UMUA 5IUGA 2QODA 2UUEA 4I22A 4OTWA 1YDSE 3CE3A 4WNPA 5KKRB 3UVQA 3ZO2A 4DH8A 3ROYA 4JQ8A 3FI4A 3GB2A 4LL0A 2QOIA 2W99B 3PXRA 2ETRA 2ZDTA 5I9WA 3E93A 3Q32A 2ZM3A 3HMOA 4YJVA 3SC1A 5LOHA 4G16A 4ANNA 4CFMA 4LGGA 1H1WA 2JDOA 2OZAB 2YCSA 2QOFA 3FC2A 1BKXA 4HYHA 4P90A 5JGBA 3U9NA 4RFZA 1WMKA 4FEUA 4CKRA 1PY5A 3I5ZA 1BI8A 5H8GA 3PXKA 4TN6A 1S9IA 5EW8A 5IH6A 4YGAA 4WA9A 4AN9A 3KRXA 2ONLC 2OGVA 5HVYA 2VV9A 4RZWA 2UZVA 3A62A 3GXLA 3KB7A 1KOAA 5EQPA 4HVGA 3BHTA 4NT4A 2CKEA 2XKCA 1YWVA 2V7OA 4PX6A 4G3DA 4NCTC 2WFYA 4XOYA 5ANIA 1BUHA 4QMNA 5HBJA 4V05A 1UU8A 3QQLA 3UG1A 3NZ0A 4H1JA 5A9UA 5AAGA 3P1AA 3DKCA 2PPQA 2YABA 5B0XA 3FY0A 1ZYCA 4JBOA 3LCTA 3MIYA 4C61A 1ZLTA 4FV2A 4ZMEA 2C6OA 4G3CA 4ZSEA 1B6CB 3DLZA 1LPUA 2X8EA 3CR0A 2W7XA 2UW3A 3E63A 3PIYA 4YJQA 2CGXA 2OJJA 2EU9A 4ZJIA 5C1QB 2WGJA 2OFVA 3WE8A 5CF8A 2O3PA 1P14A 2XNMA 3R7OA 4K6ZA 3TNWA 4DEAA 5M08A 1AGWA 3BBWA 4CXAA 2CCIA 4FSTA 2VX0A 4JDKA 5IQIA 3DBDA 4I0SA 4WNKA 4M69B 4BDCA 5HCZA 4BICA 4FKPA 4DEDA 3E8EA 4RFMA 2H9VA 4H3PA 3VS6A 2HENA 3MA3A 3QL8A 3DK7A 4FC0A 5KMMA 1KSWA 1UA2A 2YM3A 3A7HA 2PMNX 5J8IA 4DGMA 4AFEA 2J50A 2QNJA 5L8LA 4EOSA 5ANGA 3NW5A 4W4VA 3VQUA 5CXHA 3AG9A 4IWQA 3QALE 4O91A 5HBHA 2YIYA 4L3PA 4EEVA 2PVRA 4O21A 4DFBA 1APME 3MH2A 5ANJA 4PL5A 4Q5HA 2VTQA 1MRUA 3OZ6A 3CTHA 2YCRA 2BRGA 4K18A 5CF4A 2OSCA 4C0TA 3DJ7A 1ZMWA 2GPHA 4FIEA 2YM5A 4RVKA 1WBWA 4AE6A 5FXRA 2ERKA 1T46A 4OBQA 3RNYA 3ORKA 3DU8A 2WELA 3I6WA 4IACA 3LHJA 5J5SA 1VR2A 1ZMVA 4U3ZA 3MH1A 4ZEGA 4MWIA 2C0OA 3TZMA 2R64A 4AGDA 4E7WA 5HHWA 4U6RA 4E6AA 1OB3A 5HO7A 4CG9A 3RNIA 4ZS4A 1R78A 4TZRA 5GZ9A 4FR4A 4L3LA 4FIGA 3HRCA 5HOAA 3Q4TA 3V5PA 4K77A 4D2WA 3VBWA 1PMUA 5CI7A 4BKYA 4MXCA 3OF0A 3AD5A 3RAIA 1O9UA 2XEYA 1J7UA 4FK6A 3LMGA 3UQCA 2X81A 4CMUA 4BCKA 2GNIA 3MY5A 4BCIA 4FKRA 4FKTA 3QZFA 2XK7A 4GCJA 5DRBA 3VHEA 5CU0A 1YXSA 3GENA 3WF5A 4MNEA 2DQ7X 2XJ2A 2IVTA 3QCYA 1IEPA 3BYUA 5IZFA 5EYMA 5FBNC 4EC8A 3S95A 2QKWB 3DJ5A 4TWCA 1Y57A 1MRVA 1UVRA 1XQZA 4O7TA 4APCA 1OL1A 4B99A 3AC4A 2OIDA 4IVAA 4D4SA 2A1AB 5E9EA 3PTGA 3PXQA 4I4FA 4BGQA 3MJ2A 3OW4A 5I3OA 5ICPA 3QTXA 3ID6C 3A61A 4W8EA 3BHUA 3DNDA 4Y95A 4RGJA 3R8UA 4QTCA 3BE9A 3FQHA 1GAGA 3LZBA 4FTLA 3O50A 4DH7A 4DTBA 2WPAA 4X2NA 2UW6A 5M07A 2UZTA 2GNFA 4IDTA 4KINA 3CD8A 3FQSA 3ORTA 3RVGA 4GS6A 3NVKI 4X21A 3VJNA 4PL4A 2HWPA 2WHBA 3P08A 4QMMA 3OROA 3HP5A 3LAUA 4JDHA 2CN5A 3IONA 4NM5A 2IG7A 1HCLA 2BROA 3LMHA 4FZ7A 5HGIA 2XIRA 2ETKA 1PJKA 4A06A 2XK6A 1U5QA 1OMWA 4RFYA 2GFCA 5AUWA 3Q04A 3FEGA 2VTIA 2J6MA 5AIKA 4EOJA 2YITA 4MCVA 1OBDA 4W9WA 5AR4A 5A3XA 3ALOA 3R8MA 3DT1A 2X2MA 3VF9A 4FI1A 3EFKA 4D2RA 4JX7A 4E4MA 2VRXA 2W05A 1MQBA 2XBAA 3PPJA 4XV3A 3G15A 4U41A 3C5IA 1A48A 4EHEA 5FGKA 4O7RA 3KXXA 4YP8A 4O7NA 5HLNA 2RSVA 3K3IA 2CKPA 4IB5A 3ZM9A 4HJOA 4PMTA 5HVKA 3DA6A 3HDNA 1Q8TA 3QFVA 3MI9A 1ZAOA 4CCBA 2UW7A 3OVVA 4I6HA 5FQDC 5DT0A 3FZRA 4O27B 5HU9A 3PJ3A 1YOMA 3F61A 4EL9A 2PVYA 3FDNA 3ITZA 5FBOA 5FP6A 1YQJA 1BMKA 2J51A 2HELA 2HXQA 3EQRA 3QU0A 5FTOA 5AAFA 3SXRA 4ZLOA 3UOJA 3ZLYA 1JSUA 2J7TA 2JDSA 3LXNA 5KMOA 3W2SA 3TDVA 3R6XA 4YTHA 4M68A 3CC6A 4L67A 4LRKA 4ZLZA 1PF8A 1M2QA 1SM2A 2HWOA 5CAQA 2YIQA 2V5QA 4GT5A 3TWJA 4O7WA 1YHVA 3IDCA 1YKRA 4QMVA 4E93A 4GK2A 4M13A 4DN5A 3PG1A 5A4QA 3L9NA 1JAMA 3PSBA 2C5YA 4CSVA 4YZBA 3DQWA 5TT7A 1Q3DA 4BDKA 4UBAA 3MESA 2UW4A 4YBJA 4IM3A 1PXOA 3PLAE 4YLKA 4BBFA 3SA0A 1FMKA 1JWHA 3TJDA 5J7BA 2P55A 4F99A 3FZ1A 4FTTA 2QO9A 4K8AA 4UX9A 1V0OA 2I1MA 4FKWA 4BCMA 2UZNA 3CPBA 3ZC6A 4RX7A 2BIYA 3FPMA 4IB0A 3TZ7A 5DNRA 3F3ZA 4DTKA 3SV0A 4PNIA 4M97A 4AACA 5EOLA 3QRTA 3ROCA 4TWPA 4IFGA 3TJCA 3FYKX 3KMUA 2R0UA 3O17A 4Z7GA 5AA9A 2C6DA 5AV4A 3U6HA 4QNYA 5ITAA 4O83A 4MXZA 3W2PA 2ITOA 5CAVA 3SHEA 1J91A 5KX8A 3GU6A 4NTTA 4FUXA 3ZZWA 1W0XC 4W8DA 5CU6A 4BDBA 3UQFA 2C0TA 1Y8YA 4IBMA 3F88A 2GDOA 2JDTA 3COIA 3E87A 3NUXA 3NIZA 1CM8A 4EZ5A 3ZM4A 2JIIA 3QC4A 4CGAA 1PXKA 4S30A 2XCKA 3HP2A 4YHTA 2AC3A 5HG9A 5J5TA 1M7NA 2QOOA 3ENHA 3KRRA 3CQWA 2PVKA 4CRLA 3PDTA 3VN9A 1U59A 5M4CA 3VF8A 4HNFA 4KKGA 3LW0A 4F9AA 5FEDA 4WIHA 3LFEA 4QP6A 4FYNA 1E1VA 2ONLA 3BYMA 3GU7A 4BZNA 3EL8A 3IO7A 1PYEA 2QU5A 3RM6A 3HRFA 5D10A 4AS0A 5BVFA 3F5PA 2YZAA 5HIBA 4FBXA 1BL6A 2QO2A 2VO0A 3ULIA 3UO6A 3V5JA 1VZOA 3NX8A 4AT3A 4D0XA 4JIAA 3HV3A 3R0TA 3D15A 3FKOA 4XG7A 3WARA 5CSVA 4CFXA 4RVLA 2PMIA 2XIYA 3KVXA 2PMLX 2QOQA 2R3PA 4GEOA 1A9UA 3PA3A 2PZYA 3R30A 4IJPA 2VZ6A 4NTSA 4P7EA 5HE2A 2OXYA 2VTSA 4FKJA 5AJQA 5JQ5A 1TKIA 3R9RA 5EM8A 4DCEA 2Y4PA 4E3CA 4F6UA 2GHMA 3LKMA 3B2TA 5ETFA 4G5PA 3TNHA 4OUCA 2YLFA 4QMZA 4YPDA 3ERKA 1R0PA 4QMYA 2VX3A 4UMQA 4LOPA 3BU5A 2BFXA 4KIKB 2O0UA 5E8WA 4Y72A 5K4IA 4R6VA 3KC3A 3QQJA 2FSOX 4V04A 2BCJA 3FJQE 4KIQA 3RP9A 3TNPC 4C4FA 3EJ1A 5L6PA 3E8DA 4CFUA 3D0EA 3FL5A 4YJTA 3V01A 3MVLA 3FKNA 5L2QA 4Y5HA 3LCSA 1OL7A 3TV7A 5CASA 3Q5IA 3R7IA 4O84A 5HVJA 2VO3A 4HOKA 1UWHA 3IW6A 3NYOA 4A4XA 3SGCA 5DH3A 4RLKA 3C4ZA 1WBSA 5EM5A 4MXXA 3U4WA 1MQ4A 2F7XE 4U42A 4DHFA 2Z02A 4XH6A 3T3UA 4JAIA 3DQXA 2C5NA 3NGAA 3TEIA 2B1PA 3ZBXA 5K3YA 1MUOA 4I4EA 5J9ZA 4DEIA 3MDYA 3NUSA 5AV1A 5GJGA 3I60A 4FKQA 3FMDA 1M14A 3UODA 2FA2A 4R7HA 5LVMA 4DG3E 1KE7A 1V0BA 4ITHA 1V0PA 5F1ZA 2VAGA 3GBZA 3BV3A 2VNWA 5AIRA 5K5NA 2XM8A 3QD4A 4FVQA 3CLYA 4C36A 4BWXA 3EFJA 3TUBA 3COHA 4BKJA 3ZLXA 4DGLC 2E9NA 5JMSA 1DI8A 4DFLA 4OAUC 1PXIA 3AXWA 4LM5A 3OOMA 1NW1A 4U81A 3NW7A 5EH0A 3DAEA 3HL7A 5BVEA 4LUDA 5CT7A 3VRZA 4E1ZA 3GC9A 4FKVA 3KRWA 2WU6A 5M44A 3ZHPC 2WMAA 4U5JA 3ZOSA 3LFNA 2OH4A 2IVVA 2YAAA 3MH3A 5AV3A 4AZVA 2GU8A 4Z55A 3F82A 3IW8A 2EB3A 4XBUA 4AW0A 4IX6A 1FVRA 2CJMA 3KREA 5LVPA 3PJ1A 4WBOA 2R3IA 1KE6A 1XBAA 2HW6A 3UP2A 5KBRA 4QMUA 3R02A 4ASEA 5BVDA 2X7OA 3R7UA 4DCAA 1REKA 3LIJA 4NUSA 4NIFB 4JOAA 3VUDA 4B0GA 2XNNA 5CU2A 3QA8A 4NM3A 2I7QA 2Q0NA 2VN9A 3ZMMA 3W8QA 3RWQA 3ZUUA 4J71A 3NLBA 3OT3A 5M51A 3R1YA 4FV3A 2A19B 2BTSA 3MFTA 3LQ3A 1CKIA 3TKHA 3R83A 1P4OA 3C51A 3ORNA 4C59A 4O7YA 1NVQA 3LE6A 3NRMA 3PIXA 2ZOQA 5M57A 3R1QA 4MXOA 1G5SA 5L8JA 4BGHA 4CFNA 5E8VA 4EK6A 4FSYA 3U6IA 2C69A 3TNIA 5E92A 3C4CA 4D4RA 3DZOA 3DBQA 2VU3A 2PSQA 3KMWA 3O8TA 3UIMA 1SMHA 3KA0A 3QD3A 1X8BA 4P4CA 3ELJA 2IW6A 4RWIA 4KABA 2E9VA 5EYCA 5D1JA 2PVFA 4OTGA 4EOLA 4GH2A 4IAZA 4MWHA 3N9XA 4D5KA 1IAHA 3UBDA 5I9YA 3DK3A 4GK4A 1XH6A 3ZS5A 3R2YA 4BBMA 4Y83A 4CYJA 2QOHA 4L7FA 4X3JA 4HCUA 4OTPA 2UZLA 3FMHA 4F1OA 4IAKA 5KMKA 4YURA 2W1FA 5E8YA 3IECA 5CXZA 2UZUE 3BYOA 1WBVA 3NNVA 4C4HA 3DXNA 3PXYA 3P5KA 5CTPA 3MV5A 5E8TA 5HICA 4F6WA 5IG1A 3HVCA 3U55A 3BHHA 3IOKA 5DR6A 3F3UA 3QGYA 4NW6A 4FEVA 3TIYA 2UW5A 4J95A 5HG7A 1H00A 2P4IA 2ITNA 4RIYB 1Q8YA 4DT9A 5AUYA 1I09A 2HCKA 3R8LA 3PJ2A 5HNGA 2BRHA 4YJSA 3OWJA 1YXUA 4DEGA 2XCHA 5HQ0A 4XG3A 4YJPA 3H0ZA 3MS9A 3D7TB 1ZARA 4GJ2A 5IKWA 1Y6AA 3EQFA 5I9UA 4C3FA 3TIZA 1H8FA 2FH9A 4FVPA 4UEUA 4RX8A 2UV2A 3AQVA 3VUTA 3UPZA 1Q3WA 5CWZA 4MXYA 2WTVA 4J97A 4FL2A 4FV8A 3UIBA 5AP4A 3WYYA 5CT0A 1FVTA 4AU8A 1MP8A 2PK9A 4Y73A 2IZRA 4NFMA 3SLSA 3LLAA 1UU3A 3MVJA 4MXAA 4ZIMA 3ATTA 2J5EA 4IM2A 4BDEA 5EDRA 3M2WA 2O65A 4GL9A 4GG5A 1UKHA 1FBNA 4N70A 3U8WA 4M0ZA 3ZDUA 3UYTA 3FI8A 1Y91A 2P0CA 3BV2A 3PA4A 3FMLA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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