3KOIA

Crystal structure of cobalt (iii) human carbonic anhydrase ii at ph 6.0
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Comparison of solution and crystal properties of Co(II)-substituted human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 256
sequence length 256
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2009-11-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 3koiA00
1YO2A 4ITPA 1IF4A 3N4BA 1Y7WA 5DSPA 5FLRA 1ZGFA 3GZ0A 4COQA 4CNXA 3RZ1B 1CNBA 1BN3A 1I9LA 4MTYA 1RZDA 3B1BA 2CBEA 4FVOA 4Q7WA 4FU5A 5FNMA 1V9IC 2X7SA 1G4OA 4ZAOA 1CNHA 5DSRA 4QJWA 4LU3A 4MO8A 4QSBA 3ZP9A 3M3XA 1FSQA 3T82A 1BNQA 3HKNA 5LMDA 3P5LA 3B4FA 4YHAA 1CINA 4Q07A 1J9WA 2CBCA 4QY3A 4K1QA 4E5QA 2Q1QA 4YX4A 3M96A 5BRWA 3F7UA 4JSWA 4QK1A 3KS3A 1BCDA 3QYKA 3F7BA 3T85A 3RYVB 3MZCA 4Q7SA 1CVAA 3M1WA 4HBAA 1ZGEA 3DVBA 3MHLA 1LG5A 2NWYA 2FMGA 2WD2A 1BZMA 4JSSA 4PQ7A 4CNWA 1CAYA 4YYTA 1CAKA 3MHIA 4MLTA 3U7CA 4Z0QA 1THKA 1UGDA 3ML2A 3FFPX 5EZTX 1F2WA 5CA2A 1CCSA 3KWAA 1FLJA 1MOOA 1LGDA 1CVFA 3M67A 1FQRA 4K0SA 3P3JA 4Y0JA 3SBIA 2FNNA 3EFTA 4YXOA 5DOHA 3V2JA 5EHVA 1CNGA 1I9QA 4QJOA 4L5UA 4G7AA 5E2MA 4YGLA 4BF1A 3F4XA 1CVHA 4QIZA 5JGSB 1G54A 1CZMA 3S97A 5JG5B 5DRSA 3KLDB 4CACA 4TWMA 4YGNA 5FLQA 3IGPA 1I9MA 5EIJA 3OY0A 2EU3A 4RUZA 3UYQA 1BNNA 3S78B 1DCBA 2FOSA 5DSMA 7CA2A 1BN4A 1CNIA 1YO0A 1OKMA 3F8EA 5G0BA 1JV0A 1Z97A 4UOVA 4E3GA 3S74B 1ZSBA 2POWA 4XE1A 9CA2A 1TG3A 3MYQA 1H4NA 5FNLA 3C7PA 4Q7VA 1CCTA 3BL0A 4QTLA 4WL4A 4Z1NA 4IDRX 5CJFA 5DSIA 3IEOA 1HEBA 4Q99A 1UGAA 1UGEA 2EZ7A 4Q49A 1CAZA 4Q9YA 4KNMA 1CRMA 1AVNA 4XZ5A 1XQ0A 1RJ5A 1G48A 2NWPA 5G01A 3P55A 2NN1A 4JSZA 4ITOA 1YDCA 2CBBA 5DSQA 1CRAA 1T9NA 2CBAA 2FOVA 5AMLA 3P5AA 5CACA 1TH9A 1V9EA 1IF7A 5FDIA 5E2RA 4CA2A 2CA2A 2FOYA 2OSFA 3RYYA 4MDLA 1MUAA 1JCZA 4LHIA 1URTA 3D9ZA 3S72B 4K0TA 1DMXA 1FQNA 2HOCA 3RZ8A 3T5UA 4Q81A 4ZX1A 4WUQA 1UGFA 2FNKA 1I9NA 1CVEA 1HEDA 1CILA 1G6VA 1YDBA 1G0FA 3PYKA 4QEFA 1CAHA 5FLTA 3M2NA 3IBNA 4XFWA 3U45X 3RZ5A 1HEAA 2IT4A 3PJJA 5IPZA 1TG9A 4RFDA 5FL5A 3M1QA 1ZFKA 2CBDA 4KUWA 4JSAA 4XIXA 5G03A 4RIVA 4E3DA 3EFIA 3MHOA 4YVYA 3MNUA 5FL4A 2POVA 3P4VA 3RYZA 3OIMA 4E49A 4KP8A 1CVCA 1ZSAA 1RZCA 1I9OA 4IWZA 1G3ZA 4E3FA 1HUHA 2NWZA 3CA2A 1CAOA 5FLOA 1I91A 1CCUA 4M2WA 1G52A 4QJMA 3UYNA 3ML5A 3V3GB 3BL1A 3T5ZA 4Q6DA 4PZHA 3MNAA 3M5EA 4ETQC 3KONA 3NI5A 4HU1A 1FQLA 5EKJA 4Z1KA 2GEHA 2GD8A 2NNSA 3RZ0B 5E2NA 4QJ0A 4YWPA 5JQTA 1I8ZA 3M2ZA 3DAZA 3V3FA 3DC3A 3HS4A 4Q8YA 3M1JA 2VVBX 1BNWA 1I90A 3M1KA 4Q8ZA 2NWOA 4HT2A 2NNVA 2ILIA 1FR7A 3KKXA 5FNHA 5C8IA 2WEHA 4GL1X 4KAPA 4YGFA 3KIGA 3IBIA 2HL4A 3S77B 3S76A 3DD0A 3SAXA 5BNLA 3DVCA 2WEJA 4Q83A 5E28A 3D92A 4Q78A 4KNIA 3KOKA 1ZNCA 5DSKA 5JEHB 4KNJA 5A6HA 4KV0A 3TMJA 3MNIA 2O4ZA 4MDMA 1FSNA 4YXIA 4ZWYA 3OYSA 2H4NA 3M04A 4N16A 1A42A 1XEVA 5JEGB 1G53A 3BETA 3MHMA 4RIUA 3SAPA 5L6KA 4RUXA 2QO8A 3DD8A 2FMZA 5SZ3A 2NNOA 1KOPA 4E3HA 5E5UA 3V3HB 4BCWA 4G0CA 4TWLA 4L5VA 3RJ7A 1LZVA 1G1DA 2VVAX 3P58A 4L5WA 1KOQA 1CAJA 1TEUX 3DC9A 4BF6A 3RZ7A 3IBUA 3N3JA 3JXGA 4QIYA 2POUA 2WEGA 3K7KA 4Q90A 1HECA 5SZ6A 3MNKA 1BICA 3M5SA 4KP5A 4KNNA 4ZX0A 4FRCA 1ZFQA 4WW8A 3MNHA 1TE3X 1UGBA 3JXHC 4CQ0A 5FL6A 3D0NA 4N0XB 4HF3A 1CNCA 3HKQA 3S8XA 1DMYA 2HD6A 4CNRA 1CA2A 1OKLA 3KNEA 3S73B 1G4JA 2WEOA 1KWQA 2ABEA 5JGTB 1ZH9A 1HCAA 3P44A 3SBHA 4PYYA 4QJPA 4HEZA 2X7TA 5EH5A 1CVBA 3TVNX 5DOGA 3OYQA 4FVNA 4Q08A 1CAMA 2HKKA 3HKTA 5EH7A 1CNJA 4FL7A 1BNMA 1H9NA 1CNYA 3T83A 4QSIA 3D93A 2FNMA 4RFCA 4YXUA 3HFPA 4Q7PA 1H9QA 3K2FA 5A25A 2FOQA 4Z1EA 1Z9YA 3DA2A 3R16A 1CAIA 3M98A 3MHCA 4K0ZA 4CNVA 5JDVB 5BYIA 1RZAA 5EKHA 5FNKA 1FQMA 4Q09A 4HT0A 1LG6A 3DV7A 5E5RA 1TB0X 3MMFA 5FNGA 5FNIA 2FOUA 4YGJA 4QSAA 3U47A 3V3IB 1KWRA 3M5TA 3W6IA 1EOUA 2CABA 3MNJA 3V5GA 2HFWA 5AMDA 3W6HA 4X5SA 4WUPA 1KEQA 2FW4A 3OIKA 5DSJA 3FW3A 1I9PA 3Q31A 4E4AA 4Q8XA 4HEWA 3L14A 4QK3A 1TTMA 5E2KA 1IF9A 4FIKA 4R59A 3M40A 3MWOA 4ILXA 2WD3A 6CA2A 3DCSA 5EHEA 1BV3A 3RG4A 4RH2A 4M2UA 4ZWIA 4WW6A 4RN4A 3DBUA 1RAZA 4E9OX 8CA2A 2NN7A 4HEYA 4MLXA 4R5AA 3IBLA 1DCAA 2ZNCA 2HNCA 4Z1JA 4Q0LA 3OKUA 2Q1BA 1CNWA 3M14A 5SZ0A 1G46A 5EKMA 1CALA 1OQ5A 4RUYA 1CNXA 3V3JA 3N0NA 1LUGA 12CAA 5SZ5A 3OILA 1HUGA 3R17B 2NXTA 3U3AX 5EHWA 2AX2A 5JG3B 1G0EA 5DSLA 3RYXB 4QK2A 3KOIA 1ZSCA 3K34A 1RZEA 2H15A 2QOAA 3CZVA 3DVDA 2OSMA 4KUVA 4YGKA 1BNUA 4Q06A 4M2RA 3S75B 1TEQX 1RJ6A 4R5BA 1HCBA 3CAJA 4K13A 1YO1A 5EOIA 1CNKA 1XEGA 5DSNA 5G0CA 3DCWA 1YDAA 1AZMA 1AM6A 3HKUA 1UGCA 1FR4A 3D8WA 5CLUA 1TBTX 1FSRA 3HLJA 3OKVA 3T84A 1YDDA 1G45A 3TVOX 4M2VA 2X7UA 4MDGA 5DVXA 3RGEA 5FLPA 5SZ1A 3S71B 1XPZA 4DZ7A 3V7XA 1RZBA 1Z93A 3P3HA 3MDZA 3RG3A 5BRUA 4JS6A 2F14A 3IAIA 1UGGA 4XIWA 5J8ZA 3PO6A 1IF6A 2NMXA 3NB5A 5BRVA 2AW1A 3V2MA 4WR7A 5FDCA 3LXEA 1IF8A 3M2YA 4C3TA 3CYUA 5JESB 4QJXA 1JD0A 2NXRA 3JXFA 3NJ9A 1CA3A 3DCCA 3RLDA 4Q87A 2NNGA 4DZ9A 5SZ4A 3S9TA 5SZ7A 4LP6A 3N2PA 4ZWXA 2EU2A 3FE4A 1CVDA 1BNTA 5JQ0A 5JEPB 5EH8A 3VBDA 4PYXA 3RYJB 1IF5A 5E2SA 4ZWZA 1OKNA 3ZNCA 1CIMA 5HPJA 2W2JA 1BNVA 3M2XA 5DSOA 5SZ2A 4FPTA 4PXXA 4Q6EA 5FLSA 1RAYA 1ZE8A 2Q38A 5L3OA 2NXSA 2QP6A 4KUYA 4QSJA 1CANA 1BN1A 1HVAA 5FNJA 5AMGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1YO2 A;  4ITP A;  1IF4 A;  3N4B A;  1Y7W A;  5DSP A;  5FLR A;  1ZGF A;  3GZ0 A;  4COQ A;  4CNX A;  3RZ1 B;  1CNB A;  1BN3 A;  1I9L A;  4MTY A;  1RZD A;  3B1B A;  2CBE A;  4FVO A;  4Q7W A;  4FU5 A;  5FNM A;  1V9I C;  2X7S A;  1G4O A;  4ZAO A;  1CNH A;  5DSR A;  4QJW A;  4LU3 A;  4MO8 A;  4QSB A;  3ZP9 A;  3M3X A;  1FSQ A;  3T82 A;  1BNQ A;  3HKN A;  5LMD A;  3P5L A;  3B4F A;  4YHA A;  1CIN A;  4Q07 A;  1J9W A;  2CBC A;  4QY3 A;  4K1Q A;  4E5Q A;  2Q1Q A;  4YX4 A;  3M96 A;  5BRW A;  3F7U A;  4JSW A;  4QK1 A;  3KS3 A;  1BCD A;  3QYK A;  3F7B A;  3T85 A;  3RYV B;  3MZC A;  4Q7S A;  1CVA A;  3M1W A;  4HBA A;  1ZGE A;  3DVB A;  3MHL A;  1LG5 A;  2NWY A;  2FMG A;  2WD2 A;  1BZM A;  4JSS A;  4PQ7 A;  4CNW A;  1CAY A;  4YYT A;  1CAK A;  3MHI A;  4MLT A;  3U7C A;  4Z0Q A;  1THK A;  1UGD A;  3ML2 A;  3FFP X;  5EZT X;  1F2W A;  5CA2 A;  1CCS A;  3KWA A;  1FLJ A;  1MOO A;  1LGD A;  1CVF A;  3M67 A;  1FQR A;  4K0S A;  3P3J A;  4Y0J A;  3SBI A;  2FNN A;  3EFT A;  4YXO A;  5DOH A;  3V2J A;  5EHV A;  1CNG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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