3KQ7A

Structure of human p38alpha with n-[4-methyl-3-(6-{[2-(1-methylpyrrolidin-2-yl)ethyl]amino}pyridine-3-amido)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)pyridine-4-carboxamide
Total Genus 112
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
112
sequence length
348
structure length
348
Chain Sequence
RPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVGTPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Mitogen-activated protein kinase p38 alpha
publication title Structure of human p38alpha with N-[4-methyl-3-(6-{[2-(1-methylpyrrolidin-2-yl)ethyl]amino}pyridine-3-amido)phenyl]-2-(morpholin-4-yl)pyridine-4-carboxamide
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 112
structure length 348
sequence length 348
ec nomenclature ec 2.7.11.24: Mitogen-activated protein kinase.
pdb deposition date 2009-11-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3kq7A02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3kq7A01
3DLZA 3OVVA 4X3FB 1W98A 3RPVA 4E6AA 4CXAA 4CLJA 1XHAA 4Y8DA 3UG2A 4E1ZA 5TF9A 2WFYA 4EK3A 4XOZA 4ZZMA 4K77A 2BRBA 1LUFA 2BILB 4YC3A 2OXDA 3D94A 2C1AA 3FXZA 5EM7A 4D0XA 4D1XA 3O23A 2IW8A 4DITA 1YXTA 2YM8A 4AFJA 2QHNA 3NMUF 1YI4A 3DB8A 4E6DA 2FUMA 3GOPA 4RA4A 3TZ9A 4QMOA 3H0YA 4AZSA 3RPYA 3TJCA 3EQIA 4JBVA 2GNHA 2OJFE 3MA6A 2EU9A 5ACBC 2Z7QA 4H3PA 5DWRA 5HG8A 1GIJA 2F2UA 2CCIA 4QMTA 2O63A 5DRBA 3HEGA 1LR4A 2VO0A 4IB0A 3GU7A 4M66A 4QP4A 3ZDUA 5BVOA 5A4QA 4YLJA 3Q5ZA 5HOAA 4YO4A 4K11A 3R8ZA 2OXXA 2QOBA 5IEVA 4TWPA 3CE3A 4F0GA 2IW9A 5M56A 3I0OA 4E8AA 5I9WA 3DLSA 4CFMA 3M2WA 3LFFA 2FYSA 4RJ7A 4C38A 2XBAA 3EKKA 4DEEA 3SOAA 2W5AA 4FL3A 4QYFA 4YJUA 4FSQA 3F5UA 3OUKA 2F2CB 4X21A 3SG8A 2CSNA 5E91A 3HL7A 1JKSA 2OK1A 3TIYA 4H58A 4CLIA 5KZ0A 4KIQA 4WT6A 4BGQA 4CZYB 5C27A 4JDHA 4ONAA 4RZVA 4BCKA 5FDXA 2BR1A 3GXLA 5HZNA 4ZIMA 3R7IA 1YVJA 3VBXA 5E9EA 3F69A 3KA0A 2OWBA 1FGKA 4O6LA 3V04A 4DYMA 2PUIA 1WBTA 3QTUA 2UZTA 3TG1A 4F1TA 1YWVA 5JRSA 4GIHA 2OBJA 3F66A 3DKFA 3MVJA 4JX3A 2ESMA 4IVAA 4FSUA 3AT4A 3LFDA 2CN5A 2BFYA 5L6OA 4TYEA 2PL0A 4FT7A 2BPMA 1OL2A 2FH9A 4MD7E 5CQWA 3R8MA 4E3CA 4N4SA 4WO5A 2J9MA 3MH3A 5DH3A 2OSCA 4CG9A 1PXKA 3LJ1A 5I3OA 4MHAA 4KABA 2NRUA 4FKUA 3VS1A 4RJ4A 2UW7A 2B52A 2WIPA 3UNZA 4HW7A 4YZ9A 1H8FA 2DS1A 2WGJA 3G5DA 4IADA 4RC2A 4PMTA 4ENYA 4CGAA 2W1CA 3GT8A 3IDPA 4KUJA 4LG4A 3U4UA 3V5LA 2QOHA 4RPVA 4BTFA 4WG4A 3RMFA 3GFEA 4D1ZA 5LJJA 3C0GA 4I5PA 3TDVA 5FTQA 3TKUA 5K9IA 1YXSA 5HX8A 4BBMA 1ZOEA 4XNEA 2J90A 5B0XA 2PVLA 3PP1A 4IHPA 4PQNA 5DBXA 3W2SA 5KMLA 2WZJA 4U9AA 4USFA 4LGGA 1PF8A 1BLXA 2I0EA 3C5UA 2ZB0A 4O2ZA 4P5QA 5EOBA 5CS6A 5DFPA 2F7ZE 3R1SA 4G9RA 3IPHA 4QTDA 3E93A 5CU4A 4KBAA 3P7CA 4ANMA 2O0UA 3QQGA 3MV5A 4R5SA 3R7EA 4YTCA 1H27A 3VVHA 5IDNA 5HBHA 3U4WA 2C5VA 5FBNC 4QMQA 1WZYA 1XBBA 4FNXA 4PMMA 2IZTA 4BZOA 4QMZA 5I3RA 4XEYA 2XIZA 1P14A 2BFXA 4HPTE 4QMMA 5BYYA 2E2BA 4FTLA 3GC8A 3IGGA 3ZSGA 4AS0A 3EKNA 4QP9A 2ITZA 2X2KA 4BKJA 5JSMA 2IZRA 4UV0A 2VTNA 3VUDA 3OT3A 3QYZA 5KBQA 2QVSE 5L2WA 4Q5EA 3A99A 3G0FA 3PXZA 4FIJA 5GZAA 3RKBA 5KKRC 2ONLA 4CQGA 3RM7A 1W84A 3GEQA 3ODYX 4YJPA 5EHLA 5HGIA 2HOGA 4ACGA 5JMSA 3LQ3A 5LVNA 3VS0A 5A9UA 1MQBA 3BX5A 3MYGA 4R7HA 4S30A 2QQ7A 5KMJA 4LV5A 4AF3A 4BDFA 4FYNA 3W8LA 3UO5A 3PSBA 4TPTA 3WZKA 3HMIA 2WTCA 2UV2A 3NAYA 1VJYA 4TRLA 4W8EA 4A9TA 4EK5A 2BKKA 2IZUA 3TNQB 4E20A 2PMNX 1YW2A 1Q62A 3ZBXA 1CDKA 3PYYA 4FV8A 3TTJA 4ID7A 4K0YA 4MXZA 3BI6A 1UWJA 4C34A 3JR1A 4C8BA 4O7SA 1M14A 3QD4A 3QL8A 1OIQA 4J97A 4U3YA 5CAVA 2BRNA 3E3PA 3JYAA 4MVFA 4ZJIA 5M55A 4HVGA 4FE2A 3ZEPA 3O96A 4I4EA 4EOPA 3DJ5A 3R83A 2OJIA 4PDPA 5JFWA 1ZMWA 5KZIA 4DFXE 3U6JA 2J0LA 2J4ZA 2YM4A 3OT8A 4QPMA 2YWVA 1Y8YA 3ETAA 3KRLA 2RKUA 4MX9A 4Y85A 4EC8A 2V5QA 2XM8A 1Y91A 3QTSA 4U42A 4QQTA 5E8XA 4YTHA 5FEDA 3WF8A 4LV8A 2X2LA 2WMRA 4JJRA 1Y6BA 2H8HA 2ZYBA 5CALA 3ZRMA 3DBQA 2Z7SA 5GIOE 1FQ1B 4FX3A 1T45A 3D14A 3KXZA 3P1AA 3QTRA 3GQIA 3R1YA 3VS6A 4ASZA 2Y0AA 4MQ1A 4TWOA 5CI7A 3CQWA 5AV0A 3NNUA 2X7GA 2JDOA 4IBMA 3TCPA 1KV1A 4L7SA 5DGZA 5HKMA 1H0WA 1WBNA 3ZUTA 2B0QA 4W9XA 4BWPA 3FEGA 1VEBA 1P4FA 3MIAA 4BCJA 2QKWB 4ZTNA 3ZFYA 2QLUA 2VWBA 3PA4A 4FEVA 2W1FA 4UN0C 5A4TA 4YNOA 2AUHA 2XBJA 2WMVA 2R3JA 1K9AA 1W8CA 5KMMA 5HIBA 4BCFA 2VWWA 2PVHA 2Y4IC 4H1JA 3WZDA 1PMVA 4HVIA 4AW2A 4AG8A 3ZC5A 3QU0A 4L44A 4OUCA 3FMHA 1KE6A 4HPUE 4UWCA 5E8ZA 4CFFA 2QOOA 4D5KA 3KY2A 4FTUA 1MQ4A 4FV0A 4GVJA 1PMNA 2PY3A 3LM0A 2YM6A 5L6WL 3BLRA 3MI9A 3ENMA 4OGRA 2HY81 4Z7HA 5KMIA 2ITOA 3MS9A 3Q4CA 3Q3BA 5LMBA 1WBOA 4DEIA 1URWA 5HD7A 4FKJA 4YMJA 2IVUA 4ACMA 2RG5A 2VTQA 5KBRA 3H30A 4ZTQA 3QWKA 4OAVB 4O0WA 4D5HA 1NT2A 3E7VA 4FVQA 5HIDA 3WBLA 4CSVA 3TUCA 3ATTA 4FIEA 4JG6A 4AGWA 3Q4TA 3Q9XA 4EQMA 4GG7A 1SVGA 2BALA 4BBFA 3C7QA 2XK8A 3BHHA 2FSTX 2EB2A 2W17A 1RQQA 3DTCA 4EOOA 3UO4A 2B55A 5HNGA 2WTKC 5FM3A 3VRYA 4OTDA 3W55A 3V5PA 5ETAA 3UDBA 5AR7A 3GU5A 1FMKA 3R28A 2HW6A 4FKVA 2XCKA 4LRJA 4YJTA 2ITVA 1UVRA 4QYGA 4MNEA 4ASDA 4PDOA 1F3MC 3Q9YA 4EK4A 4I6HA 3PVWA 3RK7A 4LQMA 1OPKA 2O65A 1CMKE 2OLCA 4KSQA 4MBIA 3KK8A 4L01A 4ALWA 2IVTA 2WQEA 4F64A 4APCA 4PMPA 3IO7A 2YLEA 3VRZA 5M08A 4WHZA 2UW5A 1OUKA 5HCXA 4A7CA 4J8MA 2BROA 4UWYA 4ZLZA 2DYLA 1YWNA 2B54A 3F2NA 3FZPA 3FMMA 3EQRA 4O27B 5EM5A 3V6RA 2C5NA 4O1PA 4EBVA 2ZOQA 3OZ6A 1JQHA 2Y4IB 4QMUA 2UW9A 3RAWA 4ORKA 2SRCA 3C4EA 2VGPA 3FXWA 4Y5HA 3OY3A 4R77A 1AGWA 3R1QA 2PZIA 3M1SA 3W16A 1Q8YA 3QXOA 5IQEA 4PX6A 3KCFA 4X2JA 4D4VA 3HMNA 4AGCA 4ANOA 3ORKA 2YABA 3QX4A 2ETKA 4RIOA 4N57A 3G6GA 3ANQA 4IM0A 4IC8A 3UO6A 5HU9A 3FL4A 1ZZLA 4S2ZA 5T3QA 3OTVA 3IECA 1K3AA 3AC2A 2C30A 2YLFA 1M7NA 3FLSA 3S2PA 2V0DA 2WMWA 4HNIA 2WU7A 2NNWB 4UZHA 3BBWA 1V0BA 1XH7A 5BUEA 1M2PA 4IMYA 4WSYA 2J7TA 5CSVA 2V22A 5F95A 4TL0A 1M52A 3ZOSA 4IZ7A 4S34A 4IAIA 5IQGA 3Q9ZA 4ALVA 3ZFMA 2WU6A 2Y4PA 2QR8A 4GJ2A 4I0RA 4PF4A 2CKPA 4KAOA 3PVBA 3F9NA 2ZM1A 2C47A 3E7OA 5HD4A 3OBJA 4UMUA 3DAEA 3T3UA 3V8SA 4CRLA 5EYDA 4IX3A 2ZM3A 5AR5A 5CVHA 3QGWA 3IW8A 2QLQA 5TO8A 3OWPA 5C4KA 3SLSA 2WMBA 3QRUA 4ANLA 4TZRA 4RC3A 2B7AA 3AC8A 3ZLXA 2XNNA 3Q6UA 2RFDA 4OTIA 3F61A 4P4CA 4YBJA 4KNBA 4G3EA 4RWJA 2VX3A 2ERKA 2YFXA 4XS2A 4BDJA 4IZYA 2VZ6A 5AR8A 5ANKA 3VNTA 1OM1A 4EUUA 3DBDA 3LOKA 4DG2E 5A4EA 1J3HA 3CBLA 4L9IA 3CY2A 2ZJWA 3MW1A 3F7WA 5TT7A 3MESA 3Q52A 4FIFA 5CSXA 3GENA 1ND4A 1YQJA 4BKYA 2VTSA 4IWOA 4H3QA 3UOLA 3PE2A 4ZS0A 3Q2MA 5CF6A 2J0IA 1OKZA 3MFTA 2P55A 3Q6WA 4MNEB 2XK4A 3R02A 4CYIA 4FT0A 4YZNA 2HELA 3GGFA 3COMA 1URCA 4F7JA 4TKSA 3OY1A 4USEA 3MSSA 4DBNA 5CVGA 3TDWA 3T9IA 3HRCA 4C37A 3PE1A 4G5JA 4AW1A 4NEUA 4AAAA 1H1WA 2WAJA 3ACJA 3PSCA 3HRBA 4TN6A 5BVDA 5D10A 2V7OA 4TTHB 4GFGA 2R7BA 4FIHA 4UBAA 4AOTA 1REJA 2LGCA 4OT6A 3U51A 4LRKA 2JITA 2IJMA 1Q99A 1WMKA 2XM9A 4DTKA 5JRQA 2X9EA 3MVLA 4RGJA 5DN3A 1H01A 4AN3A 4U7ZA 1JPAA 1R78A 2AC3A 2FSOX 1OKYA 4KIKA 5LMAA 3CEKA 1H0VA 2H6DA 4L3LA 3UMWA 4FODA 2QOIA 4IVBA 3ZRKA 4BDGA 4HVSA 3O71A 4HJOA 4L46A 2C0OA 2GCDA 3QHWA 4BCMA 4L52A 5IUIA 3A7FA 4M3QA 5AP7A 3QCXA 5L2QA 5C4LA 1KE9A 2Z7LA 3QD3A 4RX9A 3PP0A 4UYAA 4BWKA 4PPAA 3AMYA 5I0BA 3W10A 3BYVA 3V6SA 2DUVA 5AA9A 5LVLA 5M4UA 2XKCA 4U6RA 3IW7A 3KL8A 2GQSA 1QPEA 3E88A 4DH7A 4QMNA 5T68A 3QUEA 1OI9A 5E7RA 1BL7A 4QPAA 3LFEA 2Q83A 4EJ7A 5JKGA 1QPCA 3D5XA 4RIXA 4O0UA 2X6EA 1Y57A 3L9NA 3BCEA 4ASEA 5HG7A 3A4PA 1O9UA 3PXRA 2VWVA 3QRIA 2WTIA 5CZIA 4CQEA 4ANSA 4F99A 3BYOA 5K5NA 4QQJA 1LEZA 3QAME 3VULA 2QG5A 3UOHA 5KHXA 3U54A 1NW1A 5AR3A 4F9WA 3ZM9A 5DR9A 4XG2A 2G2HA 2XS0A 3QQJA 2P3GX 2PYWA 4DGMA 1UU7A 4MD9E 2J50A 3NIEA 2WQMA 3GBZA 3E62A 5ITAA 4CKJA 4YJNA 2VV9A 4EYMA 4F09A 3I4BA 4DCAA 5CNOA 3GC0A 2HAKA 2GPHA 3F3TA 3FY2A 2BDWA 3O7LD 4I24A 4AUAA 3ORLA 3RZBA 4NZWB 1GY3A 3AQVA 1Q41A 3BGPA 3WE4A 4QO9A 4EOSA 4UMPA 2VTRA 4IZAA 4MF1A 2C5OA 4RJ6A 2PUNA 4IB1A 4O0SA 2XKDA 2XA4A 3BV2A 3KVXA 1W82A 4LFIA 5DVRA 5FEQA 1RW8A 4RX7A 3PLSA 2FSLX 4EH8A 2CGUA 4FKPA 1K2PA 4EH2A 3ROYA 3L9PA 4XUFA 4I92A 3NUAA 2WELA 3D9VA 1UU8A 3HNGA 4M8TA 3TN8A 3D7ZA 2IO6A 4V0GB 2XNPA 5HEZA 3QZIA 5BUJA 4D0WA 3C51A 4HZSA 5AM7A 1VZOA 2QNJA 2VNWA 4XOYA 4GEOA 3UP2A 3A7GA 1WVWA 5J1VA 4WBOA 5ANIA 3QRJA 4FKQA 2I1MA 4W4WA 5DIAA 3RZFA 3CLYA 1UNGA 2F57A 4D2SA 2ITUA 4HCTA 2GQRA 5AFVA 3EL8A 2HZ0A 4C62A 3TWJA 3D5WA 2OJJA 3Q5IA 4NW5A 1OIUA 2OICA 4FV3A 2UVYA 2XK9A 3CQEA 1WFCA 4PMSA 3BU3A 3KEXA 4R8QA 5IA5A 3WE8A 5L2SA 3RM6A 1YWRA 4GL9A 1B6CB 4U0IA 1BMKA 3H0ZA 1SM2A 2B1PA 1PXJA 4AA0A 5K4JA 2PVMA 2ITPA 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 3R2Y A;  4QD6 A;  3BRB A;  4G3D A;  3KF7 A;  3UC4 A;  3BHY A;  2BTR A;  3TAC A;  5EYK A;  3ULI A;  4YBK A;  3PFQ A;  4CFU A;  3H9F A;  3EFK A;  2C3J A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DLZ A;  3OVV A;  4X3F B;  1W98 A;  3RPV A;  4E6A A;  4CXA A;  4CLJ A;  1XHA A;  4Y8D A;  3UG2 A;  4E1Z A;  5TF9 A;  2WFY A;  4EK3 A;  4XOZ A;  4ZZM A;  4K77 A;  2BRB A;  1LUF A;  2BIL B;  4YC3 A;  2OXD A;  4QDV A;  3D94 A;  2C1A A;  3FXZ A;  5EM7 A;  4D0X A;  4D1X A;  3O23 A;  2IW8 A;  4DIT A;  1YXT A;  2YM8 A;  4AFJ A;  2QHN A;  3NMU F;  1YI4 A;  3DB8 A;  4E6D A;  2FUM A;  4AXE A;  3GOP A;  4RA4 A;  3TZ9 A;  4QMO A;  3H0Y A;  4AZS A;  3RPY A;  3TJC A;  3EQI A;  2XAN A;  4JBV A;  2GNH A;  2OJF E;  3MA6 A;  2EU9 A;  5ACB C;  2Z7Q A;  4H3P A;  5DWR A;  5HG8 A;  1GIJ A;  2F2U A;  2CCI A;  4QMT A;  2O63 A;  5DRB A;  3HEG A;  1LR4 A;  2VO0 A;  4IB0 A;  3GU7 A;  4M66 A;  4QP4 A;  3ZDU A;  5BVO A;  5A4Q A;  4YLJ A;  3Q5Z A;  5HOA A;  4YO4 A;  4K11 A;  3R8Z A;  2OXX A;  2QOB A;  5IEV A;  4TWP A;  3CE3 A;  4F0G A;  2IW9 A;  5M56 A;  3I0O A;  4E8A A;  5I9W A;  3DLS A;  4CFM A;  3M2W A;  3LFF A;  2FYS A;  4RJ7 A;  4C38 A;  2XBA A;  3EKK A;  4DEE A;  3SOA A;  2W5A A;  4FL3 A;  4QYF A;  4YJU A;  4FSQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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