3KRSA

Structure of triosephosphate isomerase from cryptosporidium parvum at 1.55a resolution
Total Genus 99
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
99
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SRKYFVGGNFKCNGTKESLKTLIDSFKQVESSNSEVYVFPTSLHISLVKEFFGNDHPGVFKIGSQNISCTGNGAFTGEVSCEMLKDMDVDCSLVGHSERRQYYSETDQIVNNKVKKGLENGLKIVLCIGESLSERETGKTNDVIQKQLTEALKDVSDLSNLVIAYEPIWAIGTGVVATPGQAQEAHAFIREYVTRMYNPQVSSNLRIIYGGSVTPDNCNELIKCADIDGFLVGGASLKPTFAKIIESAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
molecule keywords Triosephosphate isomerase
publication title Structure of triosephosphate isomerase from Cryptosporidium parvum.
pubmed doi rcsb
source organism Cryptosporidium parvum iowa ii
total genus 99
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2009-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3krsA00
2YW3A 3C61A 1TYGA 4JYEA 5HMSA 2WNQA 3B0UX 1C8VA 4TMCA 4FXSA 3TQ0A 4UNLA 1SZGA 3HBLA 4LS2A 1B3OA 4NJKA 4WUIA 3MP4A 3QSRA 4NJIA 1AW2A 1NF7A 2H6RA 3FIGA 1SR9A 1KM0A 1UB3A 1OYAA 2ABAA 3LTYA 1I2QA 1OFBA 3V75A 1W5OA 1DQWA 1VHCA 2ZRZA 1FDJA 2FTPA 5AHNA 1VRDA 3PF3A 3HGSA 5I3KA 4AB4A 4JD4A 2QUTA 3H53A 2DJLA 4IMFA 5D2XA 4RJEA 4WXZA 4N9EA 4JR5A 1JCLA 3U2OA 2TRSA 3RNDA 3HOJA 4LOCA 1MEIA 1CW2A 5AYXA 5AC8A 4L4LA 1GG1A 4LVAA 2GPTA 3BGJA 4Y90A 4ZQRA 3KAOA 4M6VA 1MEWA 1Q3NA 1YTDA 3GZ3A 1R46A 3HPSA 1W5NA 3R12A 5D38A 4JDBA 3AJXA 4GJ1A 1ZAJA 2CU0A 4M5PA 5D09A 4ZQPA 2F7FA 2A1YA 2QUVA 5EBUA 1IGSA 4KFPA 1YTKA 3CIXA 1TRDA 3RF9A 1G4EA 3E0IA 2ZZ6A 1SQ7A 3W7RA 3G22A 4RR4A 4LVDA 1GT8A 3DGRA 1TCDA 3LB0A 3GNDA 2V8ZA 4XKYB 3UWUA 3W1XA 1ZJIA 1XKYA 2ALDA 3IVTA 2QCDA 4EF8A 3NNTA 1PHQA 3EWBX 2H8ZA 1P4CA 3MBFA 1A5CA 1IXOA 3CWOX 4HNVA 1M7PA 5ABTA 1GYNA 4ALDA 1GYLA 2TMDA 3MBDA 1D3GA 1O60A 1TV8A 3W7CA 1KBIA 3DENA 4EVZA 2NXHA 4IOTA 3W1QA 3GX9A 5HUOA 2E5DA 2PURA 3NL5A 4PL2A 3W6YA 3LRKA 1TPWA 3QMTA 2A4AA 3HG5A 3KVKA 3ABSA 2D73A 3W7PA 3OVQA 4AH7A 4MJZA 2A7PA 3G1HA 3FJLA 1K8ZA 3NA8A 2Y89A 1A50A 4OV9A 1R2TA 3DU0A 4O4WA 1A5AA 2CZ5A 4UTMA 1OFRA 3PUEA 4R53A 3HG2A 4JN6A 1KM4A 1EB3A 4TR9A 5K4XA 1J2WA 3B06A 1PVNA 4CQAA 3SI9A 3HGOA 3WK0A 1EX5A 4RZ5A 4XWUA 2ABBA 2JGYA 1SSGA 3WK1A 2X30A 3EWYA 8TIMA 5K9DA 1H5YA 4LVGA 2ZDRA 3QF0A 4FX8A 3THAA 1E51A 3RLVA 3TC7A 4A21A 3A5FA 4LS1A 4KWWA 1W37A 2VEIA 2F84A 1H51A 3OHIA 3P61A 1FCQA 1FWNA 2RHGA 1B57A 3NQ8A 7TIMA 2XFWA 5K7JA 3QC3A 5TQLA 1SO3A 3LCLA 3P82A 3W7NA 3B0VC 3EX2A 2LLEA 1JCMP 1XCFA 1KFJA 1GVFA 3T4CA 3A22A 1TTQA 1DVJA 4OWGA 1VLIA 5HNRA 5FEZA 2V2HA 1KFLA 4E2DA 3GDKA 3R5EA 3TSDA 2ISSA 3NR0A 1O5XA 2BZNA 1DORA 1YDVA 4HPJA 4PEKA 5K9CA 1FBAA 1GVRA 4UMCA 3C2RA 3QMRA 1WX0A 5D2YA 5BOOA 3CEUA 3S1UA 1Z42A 4WY0F 3SIZA 1TRIA 4EOUA 1YDOA 5KSWA 3OA3A 4WXYA 4WY0B 3GIYA 3F03K 1JQVA 1VZWA 4JX4A 1H7XA 1R47A 4WJEA 1IXQA 4FNQA 3FJ6A 1WOAA 1JCXA 3INPA 4TMBA 3M0ZA 4MIMA 3WFAA 3MMTA 3BW2A 5L6UA 1I2OA 1KM5A 2V81A 2RDTA 2X2GA 2B7QA 3NQ6A 5FF0A 3UPWA 5AHIA 3BPWA 4IX0A 4HN4A 2VEKA 4MY8A 4YMZA 1YLVA 3S9YA 1T8XA 2NX9A 1RVGA 2AQWA 1DQXA 3PBUA 2TPSA 4O16A 3GDTA 3P7YA 3DFOA 3GDRA 1RR2A 1T96A 2A2IA 5F4XA 3PB0A 3RK8A 4BFAA 5LNSA 3G0XA 5DLCA 3G0SA 4C1KA 4JTEA 3I68A 5FEPA 1QOQA 3LHUA 4YL2A 2GVJA 1DHPA 2YW4A 2VFFA 2ZRWA 2Y62A 1QPQA 4O12A 2Y7EA 2Y63A 1QDSA 4IGHA 2ZRXA 2FB3A 4N4PA 3UQNA 4K7VA 2P1FA 5FF7A 1LOSA 5AB3A 1LRTA 2GOUA 3S5ZA 5J5RA 1GTEA 1JVNA 2YYUA 3EWXA 3N14A 4UMBA 1H7OA 4IQLA 4X22A 3O16A 4N02A 4FNRA 3R13A 5AHMA 2X1UA 4I9AA 1HO1A 2QDHA 4FB7A 2OT0A 3WJZA 4AMAA 2CW6A 3L9CA 4Q4KA 1GTHA 1F2JA 4HIBA 4K7YA 2EF9A 3W84A 3KXQA 2EGZA 2A21A 1WA3A 3P67A 2Q3OA 1EA0A 3HIJA 3NG3A 3LHWA 1C9DA 3GR7A 5T26A 3DFQA 1HL2A 3GDMA 2YFOA 3NL2A 3C52A 1EP1A 2GQAA 1WBHA 5FF4A 4CQ9A 1MZHA 3UWVA 3OIXA 1XXXA 1G6CA 1KFCA 5I3HA 3O06A 4RLIA 2R94A 3P62A 2I14A 1S5VA 1W31A 3N2MA 4Y8FA 3JR2A 1JCYA 1AW5A 3UPBA 3MO7A 1G4SA 2WSYA 3PBYA 1R2RA 2VFGA 4GFSA 4XKYA 4AWSA 4NQ1A 4O4VA 4U28A 4RCXA 1R30A 2FB2A 2H8XA 2QAPA 4PODA 1EP3A 2G5WA 1D3HA 5FF2A 3W87A 1EP2A 1SO5A 2CLFA 3EX4A 3G1XA 4ADUA 3FEMA 4O19A 1PCKA 4E38A 3SFKA 4RZ6A 4BI5A 3W1LA 2QCMA 3R2GA 3VCRA 3IV3A 1WBJA 3W1UA 3GKAA 2J9YA 3IIPA 4PC8A 2W6RA 3NZRA 2VEMA 3W1TA 4OE7A 4PL1A 3W1RA 3N2XA 1Z41A 3KVJA 3JS3A 2NUWA 5CZJA 1W1ZA 2EHHA 4E2BA 2C14A 5IBXC 3KHJA 3VE9A 3UWWA 2ZQ0A 2J24A 3D0CA 1NFBA 1ME9A 4DF0A 3VNDA 1TPFA 3L0KA 2EPHA 4EIVA 5EY5A 4NJGA 3WJXA 4IXHA 4NXKA 4IMCA 1LOLA 1QPOA 3LLDA 4JTFA 4MYAA 2VFIA 3V1PA 3W76A 4NU7A 4O54A 3G8RA 5G4WA 5LKYA 3P8IA 4FF7A 3QYQA 3M6YA 1KFEA 2EAWA 2CZDA 2ZA1A 1SZEA 4ADSA 3JRKA 2ISWA 2RDWA 3LCIA 1YXDA 1VLWA 4AF0A 2JK2A 4PH6A 1DV7A 3QM3A 2Q3RA 3NQ2A 3NPUA 2YXGA 3U8GA 4ML9A 2OZ0A 2CLLA 3M5YA 1DJQA 1SZNA 1OX4B 1B9BA 5AC6A 3LDVA 3GK0A 3GXTA 1G4TA 4POCA 2A6NA 3TQVA 4FO4A 1VR6A 6TIMA 1Z48A 3PB2A 4N6EA 1XI3A 3VE7A 3L21A 3TKFA 1YXYA 3L67A 3P5ZA 4JTLA 3P74A 1LOQA 3LERA 2WSRA 3Q58A 5CPLA 1N55A 2YX0A 3W1MA 2Y70A 1I2PA 4MLRA 4UMAA 3A9IA 4BWLA 2Y7GA 3BK0A 3G1VA 3W7GA 2Z6IA 2UV8G 4OHQA 1LLZA 4WY0A 4JS3A 5F4SA 3EX6A 3NPVA 2VFHA 2ZZ1A 2DZVA 3BVJA 2QCGA 3G1AA 3BV4A 2DP3A 4ZQOA 3PBVA 4NNBA 4UTJA 1YPFA 4FX6M 2IQTA 2GVLA 1MO0A 1RZMA 2FFCA 2ZTJA 3W88A 2C18A 4W9TA 1YXCA 4ZZ9A 5E0KA 3QW3A 3W2KA 3BGGA 1THFD 1HTIA 3TSBA 1XBXA 1K8YA 1S3HA 1S5TA 4CNNA 1CI1A 4ZQMA 2JKAA 1V5XA 4GBUA 4O1CA 3L68A 2E1DA 5F1UA 2GJLA 2C19A 3CU2A 3SSJA 3NQFA 4O15A 4UCGA 4BWLC 3TDFA 3W22A 1FDZA 3I7RA 4QM1A 4DF2A 2X16A 3L0GA 4AHPA 1KFBA 1FCBA 4ZQNA 4AAJA 2OCZA 1OFEA 3PR2A 4O18A 3G1DA 4NVTA 5I3JA 1FX6A 3TK7A 1ICSA 3KRUA 2JKPA 1I8JA 3W7IA 1B4KA 4WZHA 5AHLA 4MY1A 3BARA 4OU1A 4RXGA 4Z1CA 3C8FA 1ZAIA 3UYCA 4MVAA 1LROA 4WX2A 2DZWA 4CNOA 1SUXA 2XN1A 4EF9A 4MJMA 1GPWA 2YR1A 3IEBA 2DZUA 2YZRA 2QDGA 5D2WA 3TXZA 3OVRA 3TV8A 5LHEA 1OX6A 5FESA 3G1FA 4O53A 3W86A 5TIMA 5LNUA 2NUYA 1AW1A 5KITA 1M7OA 1LZOA 2QCLA 3TR2A 3NQDA 1G4PA 1L9WA 5KZDA 2R91A 3SZ8A 4H3DA 2QJHA 3CLMA 4Z1BA 1KM6A 3P5YA 3LXBA 5AC7A 4ORIA 2QCHA 5DBUA 3DXIA 4UFMA 4RK8A 2R14A 1KA9F 2W0UA 2PRLA 3R89A 4CLMA 3NQAA 2BTMA 1H1YA 4JTSA 4HNNA 3DI0A 1F6KA 1FQ0A 1I2RA 4LUJA 1SW0A 1L2UA 1JQXA 3W2MA 1JCJA 4M19A 2YCEA 3I7QA 5U7SA 5HWNA 1Z44A 4X9SA 3Q94A 2JGQA 5D05A 1TTIA 1RV8A 2A6LA 4FNPA 2Z6JA 1VYPX 1WV2A 2RFGA 1QR7A 2DZTA 3IIVA 5EA9A 1T99A 3G3DA 4LC8A 3TFXA 4M6PA 3IIOA 1IIHA 3ATYA 3FKRA 4JTIA 3CWNA 1FCUA 5DXXA 1T0OA 1HUVA 1ZNNA 1QO5A 3G3MA 3U6WA 4CCDA 4HNUA 1XFBA 4K8HA 3SGUA 2PRMA 1GG0A 3DFNA 1BWLA 3N73A 4PFMA 1K8XA 3TH6A 3STEA 3WJWA 3C2VA 3NEVA 1H7NA 1QPNA 4DEFA 2NLIA 2WSQA 3RLUA 2E6AA 4KWVA 1GWJA 4GE8A 1OG0A 1OFAA 3STCA 3M7WA 4Z1DA 1PV8A 1TO3A 1LCOA 1ZAHA 3CQ0A 4CNPA 2CZEA 2Z0IA 3W83A 5F4WA 4NT0A 1JCNA 1XUZA 5D03A 3O07A 4K8EA 2QEZA 5CG7A 3ABRA 3W1AA 3M16A 3KRZA 3ZWSA 2E5BA 3IGSA 4YXGA 1KLYA 4XTIA 2Q8ZA 3B8DA 5K9XA 4YCOA 3Q37A 4UTTA 3QPZA 2B7OA 4AF0B 4O13A 5K3VA 5KINA 1YTEA 4O1AA 3UY7A 3W7HA 1XUUA 1GJPA 3QQ0A 2RH9A 5DBTA 1TPC1 3WJYA 1KW1A 1AL8A 3N9SA 2A85A 1PIIA 4UR8A 4LC6A 5EYWA 3W7KA 5D37A 4O0ZA 3MJYA 3G1YA 1OYCA 3TUUA 3TNOA 1FWWA 3EWZA 3W9ZA 4UTWA 5FEXA 4N6FA 1VJIA 2H3BA 2WV8A 1OX4A 4FXRA 4MUZA 5H91A 2ZZ5A 4TIMA 3MP3A 4QIUA 1ZENA 4GUIA 2J88A 3CT7A 5K4ZA 1AMKA 1QPRA 3L66A 2CLOA 3LLFA 5CPNA 1S5WA 3HG4A 3HQ1A 4NX5A 5G2WA 1L6SA 3QFEA 1P0NA 3IGXA 2C13A 4XZ9A 1V7YA 2CZFA 3CTLA 3L5LA 3LRMA 4JYFA 2QUUA 5C6MA 3NQCA 1H63A 4O8RA 4LRSA 3TW6A 2FJKA 1LRNA 3LXCA 4UTTC 3B4UA 1FDYA 1ZY9A 2JBMA 3MW7A 1OFPA 4CCEA 2CLIA 1VPXA 4IMGA 2QCFA 4NZFA 4AVFA 5LHFA 3LHYA 3N3MA 3QEZA 3LTPA 4Q33A 5CZ0A 2FDSA 4Y96A 3O8AA 1OK4A 3P80A 3W72A 3TAKA 5C2XA 1NVMA 3LBCA 4XUGA 3TMLA 4R33A 3R8RA 1UBSA 2Z2UA 4X3ZA 3NQMA 4RZ4A 4XBKA 4H6KA 4RX0A 2CFFA 4NJHA 3UNDA 3MI2A 4N2YA 1W54A 4LRTA 2OMAA 3UWYA 1FWTA 1A53A 2HS8A 3UXDA 4XBSA 2KZHA 5CPOA 1F7BA 4HT3A 4K36A 1W0MA 1ICQA 4MPQA 3DHDA 2BXVA 5FI8A 5BMWA 3TE9A 3G1SA 2DJXA 3C56A 3TA6A 4N9CA 3P8JA 1XL9A 3G24A 3IVSA 4D2JA 2ZYFA 2W79A 4DQWA 3NXFA 3E02A 2VKZG 4IMEA 1YYAA 2E77A 1LM1A 2ZZ3A 5LNRA 1L6WA 1SO6A 2YYTA 2ZZ7A 3TCEA 4N4QA 1JUKA 2DZSA 4A29A 1G7UA 4FIQA 3VFLA 3DHFA 6ALDA 3W3OA 1PE1A 2Y88A 4Y6GA 2H90A 1H7PA 3KFTA 5DELA 3EXSA 1QAPA 3S42A 3L65A 5F2GA 4XTDA 3I65A 3W85A 3H54A 3OEXA 3O05A 4IWWA 5MHBA 3GYEA 1M6JA 1TQXA 4EWND 3GLCA 2ZRUA 2O7SA 2QJGA 3BLIA 1P5BA 1LBFA 4HKPA 1NSJA 2E6DA 5DN1A 2PRHA 2VENA 5BRBA 3SR7A 4IMDA 3QJAA 3CC1A 2BWGA 1QCWA 2WKJA 3LXAA 3QZEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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