3KVMA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with amino-benzoic acid inhibitor 951 at 2.00a resolution
Total Genus 138
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
138
sequence length
366
structure length
366
Chain Sequence
ATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial
publication title Discovery of novel inhibitors for DHODH via virtual screening and X-ray crystallographic structures.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 138
structure length 366
sequence length 366
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2009-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3kvmA00
5HUOA 5AHMA 5IM51 4IX0A 1ML1A 3PF3A 2DORA 4QJ1A 3FKKA 4P61A 4MZ1A 3THAA 3LRLA 2X16A 3W2MA 2QUVA 3TQVA 1A53A 1A50A 1G69A 3C52A 1DL3A 4NX0A 4QQ3A 1YADA 2J9ZA 4FXSA 4XTDA 1H7OA 3NZRA 1GJPA 5CPOA 2VEKA 1SO3A 3NM1A 5KINA 3P5YA 3TUUA 3WFAA 3W1PA 4ZQNA 2Q8ZA 1SQ7A 4UMCA 4I7WA 4O11A 2R94A 1QFEA 1FCVA 3HG3A 1LDCA 1W37A 4M7TA 5L6UA 1WYIA 3LHWA 1RVGA 1SSGA 5HINA 2V2CA 3IIPA 3W7MA 3C3NA 3LHUA 1ME8A 1VZWA 2NV1A 3G1HA 4DF0A 4DF1A 3LCGA 4ICNA 4QIUA 5I3KA 1TPB1 3IVTA 4RR4A 1UASA 4H6KA 1KM0A 4O17A 1L6SA 3QQ1A 4GUFA 4AXKA 4PH6A 1QO2A 1L2UA 3ATZA 1W5PA 3QEZA 3UWWA 3LHTA 3MHFA 1GVFA 4R33A 5EBUA 3KVLA 1ZHAA 2I14A 3DFTA 3LB0A 2CLMA 3T44A 3OVRA 3L2IA 3HPSA 5H2ZA 3QSRA 4ZQRA 4S2BA 2WJZA 5D04C 3C61A 1B3OA 5FF4A 4YWIA 3RLVA 5AHIA 2ALDA 1FX6A 1U83A 2QCEA 1KBJA 5D2WA 2ZQ0A 4AWTA 5EYWA 3W7NA 4DO4A 5F2MA 1I45A 4UCGA 1DQWA 3NQEA 5G1TA 1TREA 2DU2A 4AWUA 4IMFA 1IXQA 3GB6A 3CTLA 4IOTA 2WV8A 4E2DA 3MWAA 3IGSA 2P10A 3NQFA 4XUGA 3LBCA 4UFLA 3NO5A 2CZFA 4O1BA 2NLIA 4M7SA 1DQXA 3K30A 2OJPA 3V75A 4N9DA 1LZOA 1DV7A 1Q6RA 1ZENA 3M6YA 1A5BA 2V30A 1TQJA 5AYZA 3LOTA 1F7BA 4UMAA 4FB7A 1WXJA 2DZVA 3FEMA 5C6MA 4K8EA 4XWUA 3DENA 3A5FA 4YLWA 1C8VA 1I4NA 1YDVA 2V0TA 4ONVA 1KM1A 4Y96A 4Z1AA 1BWLA 2YXGA 1B9BA 1LBFA 1CX9A 2QCDA 3DKLA 5D30A 5LKYA 4IMCA 1TPUA 3JRKA 5FF3A 1XDLA 3W7GA 3UWUA 3AJXA 1GVRA 4WX2A 1PCKA 1H7RA 2PRHA 3NPUA 1L9WA 5LNWA 2Y7GA 3LI1A 1OFRA 4MY1A 4UC5A 3STFA 3EB2A 1FBAA 2QUTA 3EWBX 3TCEA 2Y7DA 1K03A 1C9DA 5EMUA 2YYUA 1TJPA 3PULA 3F4NA 3PS7A 3INPA 1H60A 2CLKA 4WY0B 3B0UX 4UXDA 1ICPA 4PC8A 2RHGA 2TMDA 3OG3A 1KV5A 1VYPX 2FLIA 1C29A 3MI6A 4CNPA 3W1QA 5AHEA 4DXVA 3TW7A 2ZTKA 5D03A 2A7RA 4CCDA 1VRDA 4DO5A 3EX4A 3QF0A 2P1FA 4IMGA 4UTTA 2YZRA 1KBIA 2A5HA 5CSSA 5F2IA 4EWND 3OBKA 3NXFA 4UTLA 5BRBA 1GWJA 2R8WA 4L4MA 2V5LA 3W7RA 4X2RA 1O60A 1R2SA 2ZBTA 3UWYA 1YXDA 4A2SA 3W1LA 1G7VA 1A5SA 2A0NA 3BLFA 3GDMA 5G4WA 2RDWA 3NQGA 3M47A 3N73A 3DFOA 3TU9A 3NR0A 2VXNA 5A8GA 3KXQA 1OYBA 1O5XA 4AWSA 2QDHA 3M41A 3Q37A 4Z0SA 3TC7A 3W7QA 4ORIA 2WSYA 3S1UA 2QDGA 3A9IA 1ME7A 4LW7A 3VCRA 4A2RA 4CQ9A 1PHQA 2NV2A 3E0IA 2Y6ZA 4OHQA 4O50A 3TXVA 4NJGA 3R8RA 4TU1A 4POCA 1QPRA 4UTMA 2XN2A 1D9EA 1TSIA 1MEHA 5EA9A 4IX2A 3TQKA 4X22A 2QJGA 2CLHA 3O6CA 1SZFA 3LCIA 1NEYA 2JK2A 4UFIA 2E09A 3WJYA 3UPBA 1X6UA 1LYXA 4MFEA 1F74A 4RV8A 3TAOA 4A21A 4Z08A 1RD5A 3WJWA 1SO6A 2NWRA 1M5WA 4LVDA 3MI2A 3UZ5A 5F1UA 1XFBA 2QCMA 2QEZA 3MW7A 3UQNA 1SW3A 2CFFA 4XZ9A 2GPTA 5LGZA 1TO3A 1L6WA 4O4WA 3SIZA 3HQ1A 4NX5A 3G1YA 3CHVA 4FNTA 3BG9A 1AL8A 2B0MA 3A21A 4LT9A 3JR2A 1GEQA 1JUKA 4KFNA 2QAPA 5AN7A 5K4ZA 3SFKA 3RNDA 3UNDA 4MZYA 3FOKA 3R89A 5D02A 3W7CA 1DBTA 3NDOA 1KLZA 4BI5A 3MYOA 4M6VA 5D33A 3EX6A 5FEXA 2JKEA 4O57A 2E6YA 3DFPA 3HG5A 1P4CA 1JRBA 5LNSA 1CW2A 3GDKA 3SI9A 3QMSA 1FWTA 5TBOA 3EKZA 4MZ8A 3S1XA 3T4CA 4YCOA 1LOSA 1RQEA 3PUEA 3O15A 5I3IA 4JTTA 2WSRA 1I2OA 4GUGA 1FWSA 3W1UA 3B8DA 1TJRA 4P2VA 4WOZA 2JGYA 1PL9A 4LS0A 4WJEA 5D2YA 3L0NA 2QJHA 1WQ5A 1Z48A 5MHBA 1B57A 1ZY9A 4FIRA 5E0KA 3FJ6A 3G1XA 4MOZA 4OV9A 2C14A 4M6PA 3MBDA 3E49A 3P61A 3DZ1A 4WXYA 5CZTA 3QMTA 1RPXA 5CGQA 1DVJA 3W7KA 5DBTA 2NZLA 2KZHA 4WD0A 4JTIA 1K3UA 3LX9A 1TTQA 5DXXA 4N02A 1FY6A 3OHIA 1K7EA 4K6AA 3L21A 1W31A 2NXIA 3NA8A 3UWZA 3DHDA 3HB9A 3GNNA 2A4AA 3B03A 3EX1A 4GNJA 5TIMA 4AF0B 3S5NA 2BX7A 1W54A 4MJMA 2V81A 3EKLA 3W23A 1LROA 5AC6A 3G1SA 3G1DA 1YTEA 4NJHA 4PL2A 5C54A 2A2IA 5CPNA 5SWUA 4WZHA 3C4UA 3IV3A 2Y61A 3GXNA 4PL1A 3GX9A 1YXCA 2YPIA 3S5YA 1XUUA 3NNTA 1F2JA 4UFHA 1N8FA 2QCDB 3TSMA 1TV5A 3T78A 3PSWA 1FCQA 1HTIA 3EXTA 4JX6A 1G4TA 4JNMA 3I6RA 3PSVA 3DHFA 1H1YA 3P81A 1VGAA 1I2NA 3VFLA 4O1DA 5F4WA 4RZ6A 1TPWA 1VH7A 3L5AA 2BZNA 4HHPA 5FEWA 2B7PA 4Y8FA 1MEWA 3GLCA 5BMWA 3KVJA 3HGSA 2CU0A 3MUXA 1JCLA 3SGZA 1BKSA 3A5VA 4XTIA 4XKYA 4OU1A 3W2LA 4O18A 4O10A 3F1QA 4Y9AA 5I3FA 1VHCA 4FX7A 1OX4A 1IXOA 3TXZA 3MMTA 1EP1A 3DFQA 3P74A 5LHFA 5D09A 4FF7A 1W3IA 1K7XA 2ZA2A 3IIXA 1G6CA 3CT7A 8TIMA 1TRIA 3GDLA 3E02A 1VPXA 4AB4A 4LY8A 1AW2A 3HIJA 3G3DA 1TV8A 4O1CA 4RLIA 2E6FA 4UFKA 1SZNA 2WQPA 4JY8A 3LXCA 5HQEA 4IUOA 3E9AA 1Q3NA 1AW5A 3M44A 5EPDA 1LTDA 3QW3A 2G5WA 4LC8A 3W2JA 3SR7A 1EB3A 4QITA 3JS3A 3TFXA 1I2PA 5G1YA 3G8RA 1K8XA 1F6PA 1QAPA 2X30A 5FEZA 1QWGA 3DXIA 5KZMA 1ZCOA 2F7FA 4RZ5A 5EY5A 3R12A 5K9XA 4LOCA 5AC7A 1TCDA 1J5TA 1XM3A 3ABOA 4N9BA 1XKYA 4MIMA 3KVKA 3I68A 5D37A 4MY9A 1O5KA 2DJLA 3QC3A 1JVNA 1DJNA 4DPPA 4UMBA 4BI7A 1ONRA 3B05A 2LLEA 5D2XA 4FNQA 3W7IA 4BI6A 3W70A 2WNQA 3B4UA 4AMAA 1XXXA 2BXVA 5AOUA 3PG9A 1AMKA 2CLOA 2VEMA 2B7QA 4N9CA 3O06A 4G1KA 4NUWA 4HNTA 3GDTA 4JICA 3S0CA 2QJIA 4WOQA 1SO4A 5C5YA 2R14A 3ANYA 3L0GA 3W1MA 3F03K 4M5PA 1KM2A 1LP6A 3N2MA 5DY3A 3GK0A 4NNAA 3LBMA 4FHAA 5DELA 4HPXA 3M1ZA 1M7OA 3HGRA 4YL2A 5DY2A 3CEUA 2ZRWA 2Z2UA 3P62A 4UTHA 3W2UA 3W83A 2QCLA 3N14A 1ZAHA 3BK0A 1GYNA 3GIYA 3B04A 3CM4A 2H90A 3KX6A 3MHUA 3TROA 1TTJA 1H50A 3BW4A 4NXKA 4NT0A 3HBLA 2D73A 3O05A 4UFMA 2O7SA 3HG4A 1N7KA 4RZ4A 1AW1A 4LV9A 5C55A 4QM1A 3U8GA 4AHPA 4DBEA 5D05A 3G18A 6TIMA 2VELA 5FF0A 2QKFA 2A85A 5IBXA 4Q32A 1ZAIA 1FWRA 3KHJA 4JYFA 2Y7EA 3BGJA 3WK1A 5F2GA 3IGXA 2HTMA 2PC4A 3UPWA 2Y85A 2ZCGA 4TO8A 4BFAA 1F6KA 3G1FA 1QOPA 3HMJG 3ZR4A 4ALDA 2I9EA 4JR5A 3M5ZA 5LSMA 4DPQA 3O1NA 1YDNA 1Y0EA 5CPMA 4EIVA 5J5RA 4LVAA 1SFJA 1HUVA 4NNBA 3W07A 3NQCA 3T40A 1W3TA 1SSDA 3LCFA 4CNNA 4MUZA 5HUPA 1T0OA 5F4SA 3BARA 1TPEA 1GVSA 5EL1A 4D2JA 3NG3A 4AVFA 3QRHA 4M6QA 3LGEA 4IQLA 4PCFA 2DZXA 1NFBA 1KTBA 1JULA 3W74A 4AHOA 1QDSA 3ZS4A 4LRTA 4ZVJA 1YTDA 3IIZA 3PY2A 5LZLA 1WX0A 2ZRXA 1B4KA 3CB8A 3LHZA 3FYPA 4JTEA 4CCEA 3P8IA 2QAFA 3RLUA 1G4PA 4EVZA 2EKCA 1XI3A 1Z41A 5F1VA 3L68A 1UUOA 3NQ8A 3LCXA 4KWVA 1KA9F 1EP3A 3FJLA 3MP5A 4OV4A 3VE7A 1TRDA 3W73A 4OBTA 3GXTA 3NPWA 4IXXA 4LWWA 3C56A 5U4NA 2E5CA 3M7WA 1XBZA 3PG8A 1DKWA 2JKAA 1OFPA 1WA3A 3BGGA 4O16A 1JJKA 1LORA 1ZJIA 4O54A 1OG0A 4TMCA 2H3DA 5E1QA 1Z44A 2HS6A 4GJ1A 4CCCA 1LRQA 1G4SA 2YSWA 1VCVA 1YYAA 3I65A 4XKYB 1LOLA 1BWKA 4IPJA 4JN6A 2VFEA 1W1ZA 3W7DA 4XBKA 4UTJA 2FB2A 4C1LA 4UTWC 4O28A 3IGUA 1OFBA 3TSBA 1ZALA 3PBWA 2TYSA 3ZWTA 4UR8A 2CLEA 2FPVA 2WKJA 3CQ0A 4O0ZA 4DELA 3W22A 1GVQA 2C1HA 2J27A 3OEXA 4FXRA 2Y63A 2ZFAA 3SSJA 3LDVA 2RDTA 2E5DA 3PC0A 3QZEA 1NAL1 4NJJA 1JUBA 2W0UA 3TC6A 3TMLA 3NL2A 2BLEA 3CPRA 3G1AA 2Y88A 4OQVA 2OZ0A 1H7XA 4N2YA 5CPLA 2WSQA 2YYTA 4LV4A 1VCGA 2AAMA 1IGSA 5DXYA 5F2LA 4JDBA 3TK7A 3W1TA 4O0KA 1QO5A 3EWXA 5KMYA 5D2TA 4WUIA 4BWLA 4ZQOA 4IXHA 1A5CA 1DORA 5K9DA 1FUYA 2ISWA 3QQ0A 2BSLA 1H7NA 1YPIA 2WOQA 2WPBA 4RK8A 3O6DA 2RFGA 3DKJA 1TQXA 2VENA 4O12A 2X1TA 2EPHA 3BV4A 1EA0A 4GRSA 3NL6A 5I3JA 4YMZA 2FPYA 2QCGA 3LI0A 2QCCA 1VR6A 3BW2A 2DZWA 4LC6A 3W72A 3ATYA 3C2OA 4JTLA 1VC4A 1H63A 1O94A 2F84A 4AHQA 5BNKA 1FDZA 2DZPA 3EX2A 5T26A 1THFD 2QR6A 4LNYA 1BTMA 3ZFHA 2ZZ2A 4UTUA 3U6WA 4WXZA 3G22A 3BVJA 3FFSA 2H3BA 2CW6A 3LCHA 4A22A 1HFBA 1LCOA 2CZEA 2ZZ4A 3DI1A 5KZDA 2B7NA 3PB2A 3EWZA 2CZDA 3LXBA 3NYZA 3BG5A 4ML9A 2PURA 1BEUA 1OFOA 4QSHA 4UTIA 1GT8A 2DZTA 1JQVA 1I8JA 1JCJA 4JGDA 3U2OA 1J4EA 4O8RA 1LBMA 2FIQA 3MBFA 3R13A 3NQAA 1A5AA 3KAOA 1QCWA 2A1YA 4XBSA 2NUWA 3GVGA 3S5ZA 3KRSA 4JXCA 1P0KA 1MSSA 3PR2A 1PIIA 1JCMP 4HNNA 2CLLA 3UD6A 2NX1A 3BO9A 1KTCA 4QNWA 4NQ1A 4ZL1A 1GPWA 1LM1A 3LV5A 3W7HA 4PODA 3STGA 4RCXA 2PRMA 3SJ3A 1V5XA 1NVMA 3BW3A 3WK0A 4X3ZA 4NZJA 3KOFA 2W6RA 3D0CA 1FDYA 1D3GA 1YXYA 3G0SA 1EWDA 3I7QA 1WOAA 1M6JA 2NX9A 3TDFA 4MKNA 3W2KA 3NAVA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XIH A;  5AHM A;  1W6T A;  3EPO A;  4DHG A;  5GJN A;  1JD7 A;  3UT0 A;  2HEJ A;  1HJW A;  3THA A;  5M03 A;  3LRL A;  3RO6 A;  1GKP A;  4PUW A;  1A50 A;  1X97 A;  1UPP A;  4YVX A;  4W7U A;  3N2B A;  4QQ3 A;  1K6A A;  4XD6 A;  3LEP A;  3NZR A;  1XIE A;  2VEK A;  1HKJ A;  3VA8 A;  1CEO A;  4IFK B;  3U48 A;  3SUT A;  3WQ8 A;  1H2J A;  3P5Y A;  1UZD A;  2JFE X;  1QAS A;  4W88 A;  1RY0 A;  3OZM A;  2R94 A;  1LDC A;  4AC7 C;  1E9Z B;  4JIE A;  4LJ3 A;  3LHW A;  1RVG A;  3SEP A;  4CEX C;  2V2C A;  1MUM A;  3W7M A;  2CBJ A;  1ME8 A;  2W63 A;  3AIB A;  1O68 A;  1TA3 A;  3FEQ A;  3IVT A;  4L6D A;  3SCW A;  1X6L A;  3QQ1 A;  2D24 A;  2ISF A;  3B8T A;  2V5D A;  4MWA A;  1XII A;  1JD9 A;  1L2U A;  1W5P A;  2ZUU A;  3MDW A;  3QEZ A;  3UWW A;  1GVF A;  4FZI A;  4R33 A;  5EBU A;  1ZUA X;  2I14 A;  3BZJ A;  3OVR A;  3ANV A;  1BYC A;  2WJZ A;  1YIX A;  4NHV A;  5LIK X;  2P88 A;  3W01 A;  2ALD A;  1W1P A;  3A4W A;  3U3H A;  2ZQ0 A;  2F9R A;  5FL0 A;  3VIF A;  1K9F A;  5EYW A;  3W7N A;  4F0H A;  3FVM A;  1DHK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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