3KWGA

X-ray structure of ns1 effector domain w187a mutant
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
122
structure length
122
Chain Sequence
TPASRYITDMTIEELSRDWFMLMPKQKVEGPLCIRIDQAIMDKNIMLKANFSVIFDRLETLILLRAFTEEGAIVGEISPLPSFPGHTIEDVKNAIGVLIGGLEANDNTVRVSKTLQRFAWGS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Viral protein
molecule keywords Non-structural protein 1
publication title X-ray structures of NS1 effector domain mutants.
pubmed doi rcsb
source organism Influenza a virus
total genus 35
structure length 122
sequence length 122
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.330 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3kwgA00
2KKZA 3L4QA 3RVCA 3D6RA 3OA9A 4OPAA 3F5TA 3P31A 2RHKA 3O9SA 3O9QA 3O9UA 3EE8A 3P39A 3M5RA 3EE9A 4OPHA 3P38A 3O9TA 3O9RA 2GX9A 3KWIA 3KWGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3H08A 2IVPA 2E4LA 2P5GA 3ATUA 4DUYK 3R1XA 4JI2K 4OVLA 3VN5A 4H5TA 3J7YP 1U4BA 4HWIA 2P9NA 3AVLA 4CF9A 1F21A 4CF8A 4C1NI 4KTZA 2O8CA 3M8QA 2VGNA 3NF8A 1KFDA 4BRKA 3F9MA 1B9DA 3RWUA 4CJUA 3QNNA 3I0SA 2HHHK 1YHQN 3IRXA 1C0TA 4LFBK 1EP4A 4DR1K 4BQLA 4FSVA 5M1FA 3VEYA 1OH6A 3L8BA 2E1ZA 1UWBA 2QWLA 3CC2N 4CGGA 3CMAN 3O9QA 4X64K 1NJIO 5I42A 4H4OA 3CXCM 3EZWA 5J1EA 5A2QO 1IBMK 5KQ8A 2D4WA 4GKKK 1DKGD 4DR4K 3OYNA 1KRPA 3F9KA 4M42A 5HBMA 1P8ZA 1XNRK 4PL7A 4CZFA 3MX2A 4DQ8A 4AH9A 3DRPA 1BA1A 1HR0K 3TAPA 3TTCA 3P4IA 2IVOA 4BRAA 1QQCA 4A57A 2P9SA 4OPHA 4W5NA 1QZ6A 3VOVA 1JLGA 5SZTA 4DR2K 4JK8A 1DT9A 4NCBA 1HJOA 4JI6K 1JXEA 3D6RA 4JKHA 1SKWA 4KH6A 3FZKA 3I56N 4BC5A 3WUHA 4DQQA 3AO1A 2D5RA 5ADXH 4NYNA 4H0XB 4DSLA 3EKSA 2CH6A 2YHYA 3A5MC 4KHSA 2P9IA 2XRIA 4Z4GA 1E3MA 3JS6A 4FJ9A 5JLHA 4B9QA 1J9AA 4DV4K 3D7EO 4CF0A 3A5OC 1IH7A 3TAQA 1IBKK 4ISGA 5HROA 1WLJA 3U8XA 1C1AA 1JLEA 1CZ9A 1LAVA 3WXLA 1N36K 1JLAA 5BRHA 3ZEUB 1QQNA 3KKRA 2OANA 4MFBA 2FLOA 3TAGA 2KTQA 3L2RA 2QK9A 3SBTA 2HF4A 1OKJA 3T7ZA 4DV7K 4FWLA 1RDDA 4XH5A 2E2QA 3V6DA 5CYQA 3ENOA 2OPPA 1S6PA 2PBDA 4ICLA 3AO3A 3VA3A 1D5AA 1GLJO 5D3GA 2NRTA 1FW6A 4ZTFA 4CEQA 2RN2A 3TWHA 1KC8O 1DLOA 1CZAN 3NH2A 3THXB 2VQEK 1NGAA 2NRHA 4JN4A 3VGKA 4QS9A 3L3VA 3S3MA 4A5BA 4FLZA 3KLGA 4BVPA 3WXMB 2W41A 3RMBA 4LF7K 3G6EN 2DTUA 5HRPA 1C1CA 4FWRA 3RSEA 4LY7A 2HHQA 1VSJA 3ZSYA 1VQKN 1C0FA 3EN9A 4A2BA 4CE9A 3BUZB 5HLFA 3CJBA 1FKOA 4I9QA 3VF6A 2D0OA 2E8AA 3K2PA 2QWQA 3O4WA 2Y1IA 5EX5A 3VQDA 3C7NB 3OYAA 4FJXA 4M3RA 5JS2A 4AHUA 3VERA 2UUBK 1BOTO 2GUPA 1Z26A 4CBXA 5AQJA 3I8BA 3KKSA 2IS3A 3TSPA 3JSMA 5IT9O 5E84A 3PIOL 1KLMA 3CD6N 2P9UA 4CEDA 2YHXA 4BGAA 1KVBA 4RW4A 3MX5A 2E2PA 3TI0A 1JCFA 5BPNA 4IEIA 4IOAL 5EXWA 4E7HA 3EL2A 2QKBA 4B3OA 3AA3A 1T6DA 1MU2A 1C0UA 3AVJA 3M8PA 3OYDA 2Z1HA 4R5PA 2ZF5O 1RDUA 3HSTB 1T6CA 4AF1A 1WBDA 4FW2A 2WTUA 3O9SA 3C95A 4FJ8A 3BF3A 2GELA 4JV5K 3DWLA 3AVCA 4CJSA 1XHZA 1WB9A 4DTJA 2WONA 1C0GA 5CR4A 1YVNA 2V7ZA 3A8YA 4OLAA 3KK3A 5F0XA 4CHOA 2PY5A 3LP1A 3CIPA 3CF5L 1BI4B 4FOIA 5AR0A 4CGFA 1BUPA 3KD1E 4FZYA 4E7KA 3KVGA 3DXKA 3KD5E 3QICA 5E41A 3H1VX 4Z94A 1V4SA 1GOBA 3KLFA 2A42A 4YDUC 4OX9K 5HL7L 3CFOA 4Z4FA 3SAFA 3SMPA 1BIZA 3K5OA 3PX0A 2KFZA 4IXCA 4FJ7A 3P5JA 1BHLA 5HRNA 2G8IA 3ZT4A 3SAHA 4FWSA 2B4JA 3CJ9A 4C8LA 3TSQA 4AHSA 1S1WA 1VQ5N 4DTNA 1T8EA 4GNIA 1DTQA 3CCQN 4DV6K 5ADXA 4DTUA 2P9LA 4KREA 3DRRA 1HPZA 2FBVA 2HNDA 4O44A 1REVA 4DF8A 4FJHA 3PLAA 1XWLA 3AVAA 2Z1JA 5TKYA 4DS5A 5ELZA 4OKEA 4KH4A 2YKMA 3KK2A 1RCHA 2XY5A 2HW3A 1XC9A 1NGJA 1VHXA 4N56A 2OA8A 1GLLO 3MEDA 1QTMA 3J7AP 4KAZA 4BC2A 2ZJRL 4N5SA 3SPYA 3LZJA 1ITGA 1H1VA 1GLFO 4FWKA 5F2RA 3GOIA 4IOXA 5FPEA 2HHUA 3HXMA 4IFEA 3UKUA 4J8FA 4KFBA 2ZE2A 1OVYA 1X9MA 3C6TA 1XQSC 1SKSA 4RW9A 4B9MA 2D0AA 4BRCA 3DAWA 5M1QA 1W7AA 1ZYQA 2I7PA 4OGEA 1P90A 2OCEA 3KLEA 2QA4N 1Q81O 3JYTA 4IDHA 4O0IA 4NB4A 1VQNN 3ZSZA 3V1RA 1J5EK 1SUQA 4DTXA 3O4QA 5KRSA 1RGIA 4BRIA 4E1MA 2I7NA 3OW2M 4CHQA 3ZSVA 2P9KA 2G8FA 4I6MA 4IWVA 1D9FA 4RWTA 5LJWA 3EYZA 1X9SA 4OJRA 2KW4A 3OJUA 1EQYA 3SQ4A 1C0MA 1XI1A 3HRGA 2NNWA 3T1YK 4O8KA 3P83D 4NLBA 4JI8K 3EKUA 4CEZA 2JWLA 3WXIA 1VSEA 4AHRA 1NGIA 2LSNA 5CY4A 5J2QA 5AQNA 3O6WA 3H1QA 4X62K 4CVNE 3AVHA 3SQ1A 4NLCA 4AHTA 4LF8K 3VQCA 4M3WA 1NLVA 1X3NA 3L0QA 4LF6K 3U3YA 2KFNA 1ESVA 1VSDA 5FDLA 4FJ5A 3AO5A 4CJKA 1J6ZA 3IAYA 1YTUA 2YJEA 4FXDA 3CJCA 2IAJA 3QFPA 4EP5A 3C94A 4BQZA 3MEGA 1HX1A 3SBGA 4PUOA 2O8FA 4JKFA 3HT3A 3UE5A 5KGXA 5MLCQ 3THWB 1IKYA 1N32K 1QQOA 2FSNA 3SI6A 2UXDK 3TTFA 3AVIA 2GX9A 3J7ZO 4HCBA 1S1VA 2HMIA 1HJRA 5J2NA 4OPJA 5AQQA 3VA0A 2O4GA 4CBUA 2YI1A 1U47A 4BR2A 4J2AA 1Y64A 2E2OA 2ZJPL 1KCFA 5J2MA 3VQ7A 1TKXA 3V4IA 1RNHA 4H0OA 5M1NA 4C8NA 3Q7BA 3PSFA 5KI6A 3HSCA 3C0BA 5C10A 4DTPA 2BUPA 2O8CB 2A1RA 3A5NC 4K25A 2QEXN 4FL9A 4M7YA 3HOTA 3LL3A 2V51B 3L4QA 1QVGM 2VWBA 3ZX0A 4B9VA 1RT4A 4WQ5C 4YOUA 1TKTA 2HB5A 2G8HA 1X9JA 3C6UA 3W3DA 3OYLA 1J5OA 1BCMA 4WQ4C 4WCEL 1NOZA 4OKJA 3AV9A 1E4GT 3VTHA 4FJIA 4EHUA 4DQRA 5J2PA 5C25A 3QLHA 4H5WA 1BQNA 1GOCA 3SUOA 1VSLA 3CFRA 3MXJA 1NMNA 4LC9B 5HRRA 3VQ8A 1WBBA 1BISA 4E0DA 5AQHA 1ATNA 3CJ1A 3ZT3A 3HPGA 3V9XA 2CGLA 4IFYA 4B3SK 4JKBA 4CGJA 3TANA 3EEQA 2DFFA 3CCEN 3N4QA 2YKNA 4JKAA 4MQ3A 1CZBA 4JHDA 2EHGA 2WC9A 4HHTA 5C24A 4C8KA 2KZZA 3NFAA 3IG1A 2YNFA 3QESA 3IDHA 4E1JA 3AY9A 3RMCA 3V9WA 4B1XB 1WSFA 4FO0A 4LFCK 4O8UA 2P9IB 4Z4CA 1WAFA 2NRWA 2YHAA 3EZ5A 4DFPA 3ID6A 3OS2A 3BP8A 4X66K 4A61A 4BRGA 1SL0A 4H0TB 1B92A 2ZGYA 5AQWA 1XNQK 2QW9A 4OPAA 4JLHA 5AQKA 2ZGZA 4KHWA 1S5JA 3PUFA 3VETA 1L3UA 1EWRA 1T03A 4EP4A 4HCCA 1LWEA 3U4LA 3CM6A 4CIGA 2YV0X 4EIAA 3KK1A 2P51A 2X6NA 1ASWA 1GLAG 4FLTA 1XMQK 2GV9A 2KHOA 3CCRN 4UQGA 4HUEA 4DFKA 4GY2B 2QKKA 3V9SA 4BY9C 3G25A 3V9ZA 4ID5A 2NRVA 1TL1A 1NGDA 2F8TA 2BDPA 3HO1A 2G8WA 4KBOA 1NKBA 3MWPA 2GBZA 5BN8A 4FWPA 4Z4EA 4H0YB 1TK5A 2UU9K 1NK9A 5BPMA 5KPZA 4O5BA 3O80A 3LDOA 1Q18A 2VG7A 1N34K 2R7YA 3ENHA 3RVCA 1U04A 4PKGA 4FOEA 4DWIA 1VQMN 4MLEA 3D2EA 3M1FA 1XHXA 2FBTA 4GVEA 4MO5A 4RW8A 3FR0A 3MK6A 3RSEB 3WNGA 3E01A 4YNQA 1SZ2A 3AA2A 3T19A 3VMFB 1C1BA 3NGIA 1KAZA 3HP6A 2YHBA 2BANA 3C65A 2HVHA 3AVNA 3M8SA 2HF3A 1G99A 5GIOA 4B3TK 1K8KB 3DLRA 4E7JA 4LSLA 3WQUA 4BC4A 3V1OA 4KPYA 4CEBA 3IUCA 2RE2A 2CGKA 3EE8A 4ILJA 2DFHA 2G8VA 3QMLA 4BRQA 4FLVA 1NGFA 1RILA 4BREA 4N41A 3L4IA 4I2PA 4JKCA 1VQ9N 3MN9A 2A6AA 2A41A 1RTJA 3CG7A 4B9LA 3AVBA 4CF2A 2H3GX 1HMVA 1N6QA 4E89A 4DTSA 3THYA 3P1GA 4FPBA 3ATVA 4AILC 4E7IA 3NDKA 4CEAA 5DM7L 5GAEP 4LF4K 3A2FA 3MCPA 5AZIA 4GKJK 1O13A 4NCAA 1Q9XA 1VSFA 3NHGA 3FZFA 1NG9A 2KKZA 3N4PA 4I9LA 3K57A 3D2FA 1KLNA 1RTHA 3O1WA 2WFBA 4Q0BA 3BY5A 4CJ7A 1XMOK 3WEEA 3FFKB 2FF6A 4CBWA 3NH1A 3HK2A 3ZSRA 3ULEA 1NM1A 3HPHA 2P5OA 3ZETA 1JL2A 3QO9A 3R3LA 4O55A 3TAMA 4DLEA 4BE0A 5I3UA 1Y97A 4KV8A 2Q97A 2Q0RA 4O5FA 4CJLA 2FBXA 1IO2A 1QS4A 3WXKA 1S1UA 4CZEA 1CXUA 1KQSM 1GOAA 5AFUH 4M3XA 3K59A 3FZLA 3FLCO 3LDPA 2QWPA 4F9OA 3S9HA 3NAEA 3D0PA 1LW0A 3MN5A 4M45A 2FSJA 3FZHA 3RR8A 3HM8A 2P9LB 2GEMA 3RR7A 2IDOA 3QIPA 4JD2A 2ZM6K 3W0LA 4CHPA 2W42A 3L6QA 4FWOA 4M63C 2GTDA 3KIOA 4HTLA 4N76A 5K14A 4IOCL 3OBWA 3H6EA 1NK4A 4CIEA 5DK5A 2JWKA 4CFCA 1WUAA 2EWSA 2A5XA 4L8RB 4BRLA 1K6YA 3VQPA 4B1UB 3KZBA 3CYMA 5FROA 3TARA 4ELVA 5C0YA 4DU3A 3AGRA 1YJNN 2W6KA 3UKUB 1RDAA 4DSEA 4K42A 1MWKA 4RG8A 4CD1A 4DG1A 1XC3A 4EFHA 1WSJA 4IG3A 2O4IA 2E1YA 1YUWA 4RCHA 3O9UA 4W5RA 3G71N 1S9EA 4CFBA 2O8DB 5AQIA 3UB5A 4DTOA 5AQMA 1HRHA 1WSEA 4MDAA 4V19S 4FYDA 3QIOA 3ID8A 2UXBK 4DR6K 1LWFA 3ZYYX 1NJWA 3MMVA 4R79A 4CIFA 3CERA 4I6MB 2HHXA 1VSMA 3EE9A 3LALA 5FRNA 4JAXA 1UAXA 1EETA 4GVMA 3NCIA 4B9UA 1B9FA 3DXMB 4BGBA 2Q36A 3OYIA 3LAKA 2IVNA 3DI6A 3SLCA 2JLEA 3T1HK 1U2VA 4KHUA 4MO4A 2HNYA 2FXUA 1LWCA 3MN7A 3OYBA 1C6VA 4BR4A 4L3QA 3ZX3A 4DUZK 3TU5A 1IKVA 1Z6RA 3ZT0A 4JI5K 1HNVA 2D1KA 3RRHA 3T1AA 5I9EB 2XO7A 2EX3A 3T3FA 3DLLL 4FWQA 1WNSA 5LJVA 3O08A 4CJQA 4GV6A 1BWFO 3UKRA 3HYFA 3OYKA 1CLQA 1ZC6A 1GLCG 3GG4A 3HVRA 2PYJA 4G9ZA 2O8EA 5M1PA 3CCJN 2O8FB 2O8BA 3TAEA 1N33K 3QDKA 5AQOA 1YXQA 2F9WA 3DLGA 4KI4A 2JGUA 4BVOA 2Z1GA 4C23A 4LF9K 3CQ8A 4Z4IA 2F4VK 3CC7N 3LDSA 3O8MA 4K0KK 1S1TA 3CJ7A 4WE1A 1JLCA 1GLBG 1RT1A 3OBYA 1ZBSA 1LAWA 3LP2A 4CGIA 4KO0A 1WSIA 4AQYK 3QEVA 1LCUA 5LL6Z 3GDQA 3HVTA 5GINA 3J80O 4DR3K 3O9TA 3QEXA 5HRSA 3TPQA 1JXBA 5M1OA 2Y1JA 4FZZA 3DMJA 4QOZB 4CD3A 1BCOA 1NK7A 1OVQA 4IDKA 3OTOK 4B3RK 1J54A 3SUQA 4DV3K 3QNOA 3SQ2A 2P9PA 1BA0A 3C7NA 1VSHA 3E9PA 3PX4A 5AFUA 2NRRA 4F3TA 2AP1A 1VRUA 1RT2A 2KLAA 3ZT2A 4YOYA 3DRSA 3L2QA 4CJVA 1Q82O 1UA1A 4FVMA 4JK9A 4YOVA 4IBNA 3O4NA 5AQRA 3MXMA 1JLFA 2VYPA 3SAGA 2ZQBA 3VF2A 4KI6A 4FLWA 3G4SN 4CK2A 4IJNA 1CXQA 4H8KA 4BRFA 3B8AX 4Z0UA 3MEEA 1I3AA 5AQYA 2E5LK 4Y1CA 1X3MA 2PAVA 1KTQA 4QS8A 2OTJN 1ASUA 3S3NA 4CEFA 4LH4A 1JJ2M 5AQLA 1D8YA 2Q3SA 5DMRA 4JI7K 1WAJA 3CMEN 1UA0A 2ZWHA 2OPQA 4JRQA 3P39A 2HOEA 1SL1A 1Z05A 2G8KA 1HUXA 2IGIA 2VWJA 1T3VA 3I33A 2HSTA 4C1NK 2FBYA 1HYSA 3QEIA 3B6PA 1ZBHA 3LDLA 1EO1A 4PL8A 4MDBA 3CHWA 3FFIA 4J2BA 5H1SQ 5KTQA 1NKCA 3VEWA 1TUUA 4DFMA 3SQ0A 3BZCA 1IG8A 4NXNK 5AQGA 4ZHRA 2CGJA 3GE1A 4FLXA 5EVZA 4BG9A 4Z4HA 4JK7A 1D9DA 4B1ZA 3GL1A 4NXMK 1QVFM 3VQQA 3ULDA 4BR9A 5C15A 2J4RA 2V7YA 5GAGP 1QE1A 3AO2A 4E1NA 3WQTA 4CZIA 3NH0A 2XY6A 1IKXA 4CW7B 3SJJA 2WBNA 4ILGB 4CJPA 4GW6A 1EX4A 3VQ4A 4EZ6A 4CJTA 2ASOA 1NK6A 4ZTJA 2IOCA 2P9NB 3K5NA 4PY5A 2BGGA 1NK0A 3HP9A 2HBKA 4E7LA 2E2NA 3QEPA 4JKDA 3DLBA 1YF5L 4EZ9A 4KKOA 4CZHA 1JLQA 4C8MA 1A5WA 4E19A 5AQVA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2KKZ A;  3L4Q A;  3RVC A;  3D6R A;  3OA9 A;  4OPA A;  3F5T A;  3P31 A;  2RHK A;  3O9S A;  3O9Q A;  3O9U A;  3EE8 A;  3P39 A;  3M5R A;  3EE9 A;  4OPH A;  3P38 A;  3O9T A;  3O9R A;  2GX9 A;  3KWI A;  3KWG A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3H08 A;  2IVP A;  2E4L A;  2P5G A;  3ATU A;  4DUY K;  3R1X A;  4JI2 K;  4OVL A;  3VN5 A;  4H5T A;  3J7Y P;  1U4B A;  4HWI A;  2P9N A;  3AVL A;  4CF9 A;  1F21 A;  4CF8 A;  4C1N I;  4KTZ A;  2O8C A;  3M8Q A;  2VGN A;  3NF8 A;  1KFD A;  4BRK A;  3F9M A;  1B9D A;  3RWU A;  4CJU A;  3QNN A;  3I0S A;  2HHH K;  1YHQ N;  3IRX A;  1C0T A;  4LFB K;  1EP4 A;  4DR1 K;  4BQL A;  4FSV A;  5M1F A;  3VEY A;  1OH6 A;  3L8B A;  2E1Z A;  1UWB A;  2QWL A;  3CC2 N;  4CGG A;  3CMA N;  3O9Q A;  4X64 K;  1NJI O;  5I42 A;  4H4O A;  3CXC M;  3EZW A;  5J1E A;  5A2Q O;  1IBM K;  5KQ8 A;  2D4W A;  4GKK K;  1DKG D;  4DR4 K;  3OYN A;  1KRP A;  3F9K A;  4M42 A;  5HBM A;  1P8Z A;  1XNR K;  4PL7 A;  4CZF A;  3MX2 A;  4DQ8 A;  4AH9 A;  3DRP A;  1BA1 A;  1HR0 K;  3TAP A;  3TTC A;  3P4I A;  2IVO A;  4BRA A;  1QQC A;  4A57 A;  2P9S A;  4OPH A;  4W5N A;  1QZ6 A;  3VOV A;  1JLG A;  5SZT A;  4DR2 K;  4JK8 A;  1DT9 A;  4NCB A;  1HJO A;  4JI6 K;  1JXE A;  3D6R A;  4JKH A;  1SKW A;  4KH6 A;  3FZK A;  3I56 N;  4BC5 A;  3WUH A;  4DQQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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