3KXOA

An orally active inhibitor bound at the active site of hpgds
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
198
structure length
198
Chain Sequence
PNYKLTYFNMRGRAEIIRYIFAYLDIQYEDHRIEQADWPEIKSTLPFGKIPILEVDGLTLHQSLAIARYLTKNTDLAGNTEMEQCHVDAIVDTLDDFMSCFPWAEKKQDVKEQMFNELLTYNAPHLMQDLDTYLGGREWLIGNSVTWADFYWEICSTTLLVFKPDLLDNHPRLVTLRKKVQAIPAVANWIKRRPQTKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Isomerase
molecule keywords Glutathione-requiring prostaglandin D synthase
publication title Discovery of an oral potent selective inhibitor of hematopoietic prostaglandin D synthase
rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 198
sequence length 198
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2009-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 3kxoA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3kxoA01
1YJ6A 3PGTA 2L57A 4OD7A 5D96A 5ABRA 1MTCA 3FZAA 1SK1A 4WBRD 2L4CA 3BD2A 3TJFA 5CYYA 4RUVA 3JCML 2L5OA 2JSZA 2C0GA 1X5DA 1I5GA 1M2AA 2GZZA 2H6XA 1WE0A 4KCEA 1QK8A 2CV4A 1F3BA 3KTLA 3HD5A 1J9BA 2WB9A 4NAXA 2FUG2 3DXBA 3GRXA 5DCGA 4F9ZA 3KEBA 3LXTA 4V2NA 1MDJA 3D21A 4KH7A 3GV1A 3ZIJA 4ZIJA 3Q6OA 2NBSA 1O8WA 4LLRA 1DUGA 3VWXA 1OC9A 4G0IA 3LG6A 4G0KA 3TRQA 5HFIA 3VPTA 1YKCA 1ERUA 2GS3A 1X9MB 2OADA 3BBYA 3QFAC 4X43A 2VCTA 2JADA 3GKNA 2GVPA 1TI1A 4POMA 1B4PA 1TDIA 4ISDA 4IP6A 5ECHB 2VOCA 2VL9A 2VLVA 4ZL9A 1PD21 5J9CA 3LXZA 2N5BA 3M8NA 4XIHA 1SYXA 1F37A 1FHEA 2PN8A 3A2WA 5C00A 4ZL7A 13GSA 5ECRB 2X8HA 3GUSA 3F6DA 1IYIA 4PQHA 3L0HA 2PVQA 2I1UA 2UZ8A 4Q5NA 4ML1A 2CA8A 1GTIA 2LS5A 3EMPA 1BAYA 3A5WA 3QAWA 2YV7A 4EDYA 3TJGA 2D2ZA 4PGTA 1F2EA 1HYUA 4H86A 2DBCA 3ERGA 4JEDA 5IIZA 2HT9A 5B8AA 2LEGA 3TKSA 1EV4A 4DSSA 4MJBA 3U6VA 4MDCA 3FR6A 1HD2A 5E4WA 1G6WA 3HKRA 5EY6A 1V57A 1G7EA 3GSTA 4KNDA 4OMVA 1XW6A 1KNGA 3SBCA 2HSHA 4ML6A 4TXOA 1DBYA 3KP8A 2AYTA 1XOBA 5IM9A 5DJMA 5D93A 1JFUA 2HRAA 3CSHA 1X9WB 3WGXA 2L6DA 4G0LA 1M2BA 1BX9A 4HZ4A 4RQXA 4LMWA 1R5PA 4YH2A 3IRAA 2VAFA 4ZB8A 5GAND 3H4KA 1XCCA 1YEPA 3BCKA 3N5OA 3GH6A 1T4YA 3DGQA 3MWHA 2H76A 3K8NA 4KGIA 3ZLPA 1Z9HA 3ZFLA 2GZPA 2OBKA 2KLXA 4TW5A 1TRUA 3VI7A 3GMFA 3D4MA 1TU7A 1SK0A 3CTGA 4YAPA 1OVNA 3TRXA 2WZ9A 1K0DA 1S3AA 2WS2A 4ACSA 3F8UA 2IFQA 3NOFA 3QD9A 4IW9A 1OE7A 2VCQA 3VURA 5DDLA 1GNWA 4JZQA 4USSA 4N0ZA 3IHQA 4G2EA 1VF3A 3R2QA 3IBHA 3L78A 9GSSA 5JCUA 3WD6A 5DBQA 4HJ2A 2PUKC 5ENUA 3ZL5A 1K3LA 4GSNA 5ECSA 2CVDA 4MJCA 3EC3A 1BG5A 2KP1A 2PERA 5GSTA 1XPVA 4GLTA 4MABA 4MK3A 1WRYA 2X8CA 5GZZB 1SKSB 3WT1A 3W8SA 3N9JA 2NPBA 2HZEB 4FQUA 3VFIA 1OYJA 2H1AA 1ABAA 5AIXA 1J08A 5E59A 4EL1A 3HVSA 4KB3A 2XPDA 1YKAA 3PR8A 4JU5A 4TR4A 1EZKA 2H30A 3CTFA 3TGZA 4J57E 4HJMA 4BL7A 3HHVA 1V58A 1GTUA 1A24A 1VF4A 1UC7A 4YQMA 4BWSA 4LL1B 2EIRA 1M9AA 1OC8A 3E3EA 4J56E 1ERVA 2C3NA 1TRSA 3GL3A 4WXTA 3LORA 2VCZA 2LRNA 4RI6A 1VF2A 1EGOA 2FD3A 3PINA 2C0DA 4OFMA 1OC9B 3MDKA 6GSVA 2CVKA 1M2DA 2HRFA 1W4VA 5DQYA 3LGCA 3EINA 5FWGA 3M0FA 1U6TA 3GYKA 2TRXA 3V1WA 4EC0A 1O73A 1NM3A 1PKZA 2I3YA 3HVVA 1JZRA 3FR9A 1PL1A 2IL3A 1XVQA 3HYPA 2GQKA 2DIZA 4ECCA 3TOUA 1TOFA 4L0UA 4PXOA 3H93A 1OC3A 4F82A 1IYHA 2XC2A 4XRAA 2IMFA 2HRNA 2VLTA 1FVJA 14GSA 2GT5A 3M9JA 2OBIA 3IOSA 4G19A 5G1LA 5LNKe 4QQ7A 2JZTA 2YJHA 2R4VA 3H8QA 2GSTA 3W6GA 2R37A 2H73A 5G30A 4CDOA 1TRWA 5LCZA 1MD4A 3AY8A 3FY7A 2FGXA 3KH9A 5A4VA 5AISA 2LJKA 2B5YA 2MYGA 5A4WA 1R7HA 4NHZA 2VO4A 2OKAA 1RK4A 4FIWA 1EOHA 22GSA 3VLNA 2IMKA 1X5EA 4L8EA 5L71A 4KDYA 3F4SA 3TUEA 2IWTA 3GTUA 1AQWA 3S9FA 4O92A 1SD9A 2P31A 1U3AA 3CRUA 2GLRA 17GSA 4TXOB 4AF2A 3QR6A 4QL9A 1H75A 3QMXA 2O8VB 4PNFA 2IPAA 3F63A 4MZWA 2E2MA 3ZMKA 4TR1B 2MMNA 3GIXA 5C04A 4PUFC 3D4TA 3UAPA 1GH2A 4WF5A 1O8XA 4AJ8A 1R5AA 1O6JA 1Y6EA 4OO4A 1VGLA 5CP1A 1GWCA 4ID0A 1Q98A 2KOKA 3KD0A 5ECKB 3DYRA 4GQFA 1MDIA 2HSMA 1WJKA 4POLA 1PSQA 2DJ0A 2YOIA 1YF0A 2YCDA 4IN0A 5HR1A 1A0FA 5G2ZA 3ERFA 3BCIA 3P90A 2WFCA 1MDKA 3KH7A 1JZWA 2QSIA 2FWGA 3PH9A 3RHBA 3TJKA 4JR6A 2JL4A 4AGSA 2IFQB 3KMOA 6GSSA 4WEYA 1AC1A 4JRRA 2C0EA 4OCFA 3WGEA 4HZ2A 1ILOA 3RPNA 3I9V2 3E0UA 4PTSA 1TJDA 2H70A 2RLIA 4XCSA 1YDKA 1BEDA 1JHBA 3LWAA 3IV4A 4KE3A 2F8FA 1W89A 4FYCA 3LSZA 5DCHA 2LRTA 1THOA 3I43A 4OWYA 1YY7A 3Q74A 11GSA 1THXA 1HNBA 2H0IA 2L6CA 3US3A 4YQUA 2FWHA 1FO5A 1GNEA 2OACA 19GSA 2ZUPA 2V6KA 3IK9A 5IOWA 2H1GA 1N8JA 1QFNA 2HE3A 2IN3A 3RBTA 2DC5A 2YV9A 1M99A 4NWYA 4KDUA 4ZL8A 1ZYEA 5CRGA 3ZFBA 1KEBA 2LKUA 1K0BA 3GN3A 3UJ1A 3J7Yk 3ZREA 4RQRA 4NXIA 4BL7B 5AIVA 3P2AA 2V32A 3E9JB 1A8YA 5IO2A 2TIRA 3HJOA 1A8LA 2YZHA 3C7MA 4GWRA 4MZCA 5IMDA 3Q19A 1T4ZA 1K3YA 2RM5A 4JBBA 1AW9A 5IPGA 2WULA 1XWBA 1AIUA 2H01A 5EPFA 1ZL9A 2PBJA 2CZ3A 4GRFA 2E2GA 1A2MA 4L0WA 3M1GA 1AXDA 3HZ4A 1ZZYA 3L4NA 2DJ2A 1G0TA 4TKYA 4CW9A 3C1SA 6GSUA 3IAM2 1ZGNA 5G5EA 4I6XA 5F8BA 2YP6A 1EWXA 3GURA 2NVLA 1XWAA 2DJ3A 1UVZA 1Z6NA 3G7YA 2J9HA 3EVIA 4JR4A 4OFTA 2F9SA 2Z9SA 1XZOA 4MMMA 3DMLA 3QCPA 5DALB 3IR4A 3ZYWA 2YANA 1ERTA 4TRXA 1UN2A 2PVOC 3QFBC 3ZIVA 2I81A 2A2RA 4I5QA 1JZDA 4PQ1A 3KGKA 3KP9A 2C0FA 7GSSA 1T8EB 2CX3A 1SYRA 2OJLA 1XWGA 5INYA 4TVEA 1EEMA 3CBUA 3ISOA 1OE8A 4K2DA 2VL2A 2WCIA 1OKTA 5D9TA 5IMAA 1C72A 5GSSA 4F2IA 1GLQA 2N5FA 3G7JA 2RM6A 1E2YA 4TR1A 3DRNA 1SU9A 3F0IA 2VIMA 2LJRA 4FO5A 3F6FA 5CREA 1LJRA 4ECJA 5J3RA 3UOMA 3GTUB 1BJXA 4GSSA 3GKKA 1AQXA 4PX1A 5FHIA 2OA7A 3APQA 4ZBAA 2H19A 3O3TA 4N10A 2KUCA 1M9BA 2H6ZA 4IJIA 2B7JA 4QL7A 4ULXA 4N11A 2M72A 5JWQB 5J5NA 5D9WA 1QGVA 2IMEA 1YF1A 3TKSE 5ECMB 4K7IA 4MF7A 4OCEA 1GSUA 1A2JA 5CRHA 1OAZA 3ERWA 1SL1B 1F6MC 3PPUA 2VM1A 2GT6A 4I97A 1TK0B 2JU5A 2HSMB 3LQ7A 3EMXA 1TK5B 3DEXA 3GKXA 3KXOA 4ZBBA 5IOXA 2X8GA 1Z7RA 4IBPA 1UA5A 5DAKA 1PRXA 4MH2A 1SKWB 3RHCA 2HXKA 2H75A 1FB6A 3UVHA 1XWKA 1GP1A 3SWLA 4TR0A 2K6VA 2V41A 3TJJA 1GULA 5EL8A 5G1KA 3NIVA 3IC4A 4OO5A 2LJAA 2C3QA 2V6OA 1BYEA 5CRWA 2RUEA 1ACVA 3EYTA 1QUWA 2I9HA 1GUMA 3MAKA 1PGTA 5ECOB 1XXUA 2F3MA 2CT6A 4DSQA 4K0GA 2QKEA 3D5JA 5IMVA 3D0ZA 5IO0A 1O81A 5CNWA 1GSQA 4KW6A 4XS1A 4K7OA 1XVWA 1YQ1A 3GL5A 2QC7A 5ECPB 5IQYA 2B3SA 3VK9A 2FWEA 4GSTA 1K0NA 2GQMA 1PKWA 2MMAA 3F4RA 4BPYA 5HR0A 3TOTA 2H1BA 2AJQB 3VPQA 5CRDA 3F9UA 3MSZA 1DE2A 3FYGA 2PU9C 3P7XA 1YZXA 2C4JA 1KTEA 3MNGA 1N2AA 4PQIA 3WGDA 5D9XA 4HQSA 3FKFA 1WPIA 1V2AA 2B5XA 4ILFA 5ECLB 3TKPA 1MEKA 1R26A 3CSIA 1GL8A 4ECBA 1WMJA 2EC4A 5DALA 2CVBA 5BMUA 4DSRA 1XBSA 1X0RA 4WBJA 1BQ7A 1V98A 2EIQA 2LQOA 3CSJA 3IA1A 1SENA 1GUKA 2AB6A 3HZ8A 4FYBA 2AUVA 3I6AA 3LFLA 4MF5A 4WR5A 1K0OA 2IJYA 4NMUA 2YNXA 2PWJA 1XW9A 2HFDA 3QPMA 3GNJA 4EUYA 4HI7A 2GSQA 1WIKA 1K0MA 2NTOA 3KMNA 1O85A 3GHAA 1LU4A 3HCZA 1TW9A 1SL2B 2DJJA 1EP7A 5B8BA 3VWUA 4BA7A 5D8IA 4BVXA 8GSSA 4MJEA 5HFGA 2P5RA 1ERWA 4BVYA 2VCVA 1MD3A 3O6TA 3ZTLA 4XS4A 4XS6A 4POKA 3HJPA 4LL4B 20GSA 1X5CA 5H5SA 1T3BA 4HQZA 2TRCP 1ZCPA 3GX0A 1KBNA 2DMMA 2P0GA 1Z5YE 1PX6A 4F0BA 3DVXA 2HSYA 2LRCA 12GSA 2YWIA 2B1KA 5HR3A 2V2GA 4DVCA 1K0CA 2C8UA 3UMAA 5KN1A 4V2LA 1EGRA 1TI3A 3FW2A 3H79A 4G10A 1CQGA 3EWLA 2PPTA 2FA4A 3FZ5A 1DE1A 4I2TA 3QAGA 2LUSA 3FR3A 4NPBA 4Q5QA 1TK8B 5J4UA 3ZVJA 5J41A 3DWVA 3DIEA 4WF4A 3GKMA 2CX4A 2HRKB 2HI7A 1X9SB 1E6BA 2B6MA 2DLXA 2JACA 2OE1A 5B6MA 2VD0A 4HEA2 4TN8A 2C1YA 3KCMA 4NHWA 2N5AA 4P3YB 4IVFA 3IPZA 4KSMA 2B7KA 4J2FA 4MZBA 1F9MA 3TB2A 2FLSA 5COHA 1GLPA 4L5OA 2H66A 3TKQA 1U88A 1VRSD 2G0FA 4F03A 1Y25A 2VCXA 4LA1A 3APOA 3UIWA 3HDCA 2HNLA 2BTOT 5DAKB 1OKDA 2YZUA 5ECNB 4MA9A 2FWFA 2O89A 3GA4A 2AV4A 2GTUA 3IK7A 2GGTA 3A2VA 1J0FA 2XBIA 4K0NA 4F0CA 2X64A 4HS1A 2KP2A 2NDOA 6GSXA 4D73A 2CZ2A 4ECIA 4FH8A 3GH9A 1WWJA 5IMFA 4ZXGA 2AAWA 5IMCA 2BMXA 4YQVA 1NSWA 3L9VA 5F0GA 4K8MA 4IKHA 2J23A 4IGJA 4MPFA 4YAVA 3EU4A 4E8HA 1F3AA 2O87A 2H74A 3HVXA 5ID2A 3NZNA 1FG4A 3HJMA 1LBKA 3IAS2 2QGVA 5JCWA 2FA8A 3L9UA 2ON5A 2FNOA 4X0XA 1RW1A 2WRTA 2G2QA 1TTZA 5KN0A 4L5LA 3L9SA 3WYWA 4IP1A 2F8AA 5A5KA 2JZSA 3C8EA 3UBKA 2VL3A 4WKWA 2ES7A 3KTBA 1AAZA 1ZOFA 1QXHA 3FRCA 4BWQA 4EO3A 3CMIA 1ST9A 3VWWA 3D22A 2IIYA 3OR5A 4GXZA 3LEFA 2OE0A 1GSYA 3ZITA 3TRPA 2FY6A 3J7Yb 2LTKA 2YPMA 5KEJA 1QMVA 4FYUA 3FZ9A 4JE1A 2XPEA 4TXVA 1A23A 2DSAA 2HQTA 3ME7A 3BOAA 2RIIA 3UBLA 4OFNA 4HU9A 3VWVA 1GTAA 4MPGA 3QOUA 3ZRDA 2GSRA 3TCOA 4CHSA 1GSFA 1PQNA 1FW1A 4O5RA 2KHPA 3UVTA 1XW5A 2H1DA 4ZB6A 2DIYA 2HYXA 2ZCTA 5H5RA 3GX8A 5D9VA 2IMDA 3A2XA 4KX4A 1GSEA 4MCUA 3C71A 1B9XC 4BVXB 4KAEA 1ON4A 1B48A 3GFKA 3F4TA 1VF1A 2K8SA 1Q4JA 4IQAA 1GUHA 1GSSA 3DD3A 4ZB9A 10GSA 4BVYB 4EE0A 4IHUA 1SJZA 1T00A 1JLWA 3FHKA 4XS4B 2VCWA 4E8EA 1B9YC 5ECIB 4IQ1A 1Z7PA 4GTUA 4V1Ap 5GAPD 4MJAA 4KF9A 2YN1A 4G9HA 1QQ2A 4GQCA 4LMVA 2M46A 3HY2A 2DJKA 5B6NA 4IJ3A 3EURA 1O7UA 5A4UA 2GQLA 2HRKA 4K6XA 2GDRA 4IELA 2JZRA 3TKSC 2R5GA 2VM2A 2XBQA 3TKRA 3HXSA 3HA9A 2GSSA 1V9WA 3IDVA 2LSTA 1R4WA 2WDUA 1I9DA 3A3TA 4EVMA 3LJRA 2DMLA 3TJBA 4MH3A 2PGTA 1AUCA 2VL2C 4V2MA 5JWRB 4EXJA 4XTSA 1NHYA 4DEJA 2XHFA 5G31A 5EVOA 1K0AA 3M3MA 1RQMA 1V40A 3KJYA 4PUAA 3APSA 4KA0A 2HLSA 4HUAA 1TU8A 2ON7A 1WOUA 2L59A 1M7TA 5AGYA 2L4QA 1EV9A 1PL2A 3KM6A 3ZZXA 3C73A 3ME8A 1U87A 1ZYQB 4Z7XA 3Q18A 3RPPA 1GSDA 1Z6MA 3R3EA 2RUFA 1EOGA 3CYNA 4KCAA 2MMZA 1TKDB 1EEJA 2E7PA 4TR3A 2K8VA 3DVWA 4O32A 4EKZA 1USBA 3EU3A 5CO3A 4HU7A 4WETA 4AJ6A 3UEMA 4X1UA 3U5RE 2GZYA 6GSWA 5FT3A 5DQSA 3FZ4A 1JLVA 2H0GA 2YWMA 5LD0A 4WR4A 2C80A 4TOPA 4D73B 3DKSA 1K3OA 1T1VA 2LNSA 3LYKA 4Q5FA 5DVBA 4O7HA 2WGRA 2REMA 1WP0A 2H8LA 5G5FA 5B7CA 2O7KA 4NV2A 1GRXA 2V1MA 2O85A 3W8JA 1AQVA 1SK2A 2MBSA 4PURA 5D73A 3UL3A 1ML6A 1H4OA 2YJ7A 2MMOA 2A2SA 4PNGA 1URMA 2YWNA 4KDXA 5ID2B 3I69A 2B5EA 1HQOA 6GSYA 3ZVJD 5F06A 1TXXA 5AN1A 5JWOB 1A2LA 1B8XA 1XOAA 1S3CA 2MBTA 3QAVA 1FVKA 2H0HA 2EIOA 3CRTA 4MLYA 2P5QA 16GSA 4KUNA 1FB0A 1Z3EA 5HFKA 1SJIA 2BJXA 4POBA 2L5LA 1XIYA 5KN3A 1PN9A 3RDWA 2K18A 1U3IA 4ZBDA 1YEXA 1SKRB 2H71A 3RAZA 3CXGA 3QDNA 1FOVA 3G7IA 4MF6A 2LNTA 2R3XA 3F3RA 4RI7A 2VUPA 2IMIA 2FHEA 4N30A 3BJ5A 3VI5A 2CQ9A 2R2JA 3G9BA 3P8WA 5JCGA 2HSNB 1A0RP 1TP9A 4K9ZA 2E0QA 2FCHA 2VD1A 4GF0A 2WJUA 4K7NA 5DJLA 1XFLA 4DSSB 5CAXA 2OE3A 3C1RA 1S3DA 2K9FA 4V1Ag 5ECQB 2JSYA 2R6KA 3FK8A 3ZMLA 1HNAA 4MP4A 4XRDA 3GSSA 1DSBA 4Q5RA 1PX7A 3UARA 2H6YA 5KN2A 5HR2A 3KZQA 4N0VA 4I2UA 5HQPA 2M80A 3ED3A 2DJ1A 2PMTA 2I4AA 1SJ6A 3IE3A 2LQQA 3WT2A 2LV3A 2CAQA 2B1LA 2F51A 1XWCA 5IPHA 4NV5A 1FAAA 2YWOA 1NHOA 3F3QA 3KIJA 2MZCA 3FEUA 3M9KA 2HZFA 4AJ7A 4I8BA 3IXRA 5J9BA 1B4QA 1NW2A 1G6YA 4HOJA 1CQHA 4ZILA 4XHMA 2C3TA 6GSTA 1PA3A 18GSA 2H72A 4GCIA 1M0UA 2X99A 1PMTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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