3L0GA

Crystal structure of nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from ehrlichia chaffeensis at 2.05a resolution
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
ISFSEIIHNALKEDLGDKGDITTNSILINEKVNFAINTRENLVVCGIPILEEVFNMNKEHVKYEIHKKDGDITGKNSTLVSGEALAIYLLPIERVILNFIQHASGIASITRQFVDEVSGTKVKIRSTRKTTPGLRMLDKYSVCIGGGESYRDNLCDGVLIKDNHIASCGSITLAIQRLRKNLKNEYIAIECDNISQVEESLSNNVDMILLDNMSISEIKKAVDIVNGKSVLEVSGCVNIRNVRNIALTGVDYISIGCITNSFQNKDIGLDIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
publication title Crystal structure of Nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase from Ehrlichia chaffeensis at 2.05A resolution
rcsb
source organism Ehrlichia chaffeensis
total genus 97
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2009-12-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l0gA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 3l0gA01
4O4VA 3QQ0A 5EYWA 4O57A 4LUJA 3P7YA 4FXRA 1TPC1 1TMHA 2OJPA 2QCCA 1OX4A 4JY8A 5CSRA 3B4UA 3KFTA 4MZYA 1JQVA 2JBMA 3O6CA 4FNTA 1ZFJA 3SGZA 2NXGA 2V30A 2FJKA 3MP4A 2QCEA 3DENA 3KOFA 2GQAA 4JXCA 4JTSA 4ONVA 3P74A 4NJIA 3QMTA 1RV8A 2GPTA 3LHWA 4UMBA 3KHJA 2TYSA 3TXZA 4O10A 2J88A 2QCNA 2ZYFA 3QPYA 4BWLA 5DLCA 3W7IA 1SO5A 3O06A 1EUAA 1H7NA 4DO6A 5KSWA 2TRSA 4A2RA 3LHVA 4JYDA 2CLEA 3W75A 4XZ9A 1SW0A 2VOMA 2A4AA 4O12A 4O54A 3LTYA 1LTDA 1YPIA 5DCBA 2Z6IA 2X1SA 3GXPA 4GJ1A 3UZJA 3A23A 4BWLC 4JY9A 3LM7A 4QNEA 5I3IA 5C6MA 1W37A 3W71A 2A6NA 3FYPA 1JCMP 5T26A 5K4ZA 4O1CA 3ABRA 3P81A 3R12A 3DFPA 3P60A 4O8RA 1F6PA 2C14A 3UXAA 1KM1A 5KZMA 3O8AA 1S5WA 1QDSA 3TH6A 1L2UA 4QAIA 5F2IA 5G1YA 5FF2A 3LHZA 1N7KA 3OG3A 4LU0A 1WYIA 1KM5A 4NZFA 4AWUA 3M7WA 4ORIA 4O53A 3QSRA 3QM3A 4RKAA 3HPXA 4C1KA 3O16A 4AHQA 3WK0A 1M6JA 3M0ZA 1I8JA 2QCDB 3GDKA 2ZDRA 5I3FA 4BF9A 1TQJA 3N2XA 4MFDA 3W7DA 3NAVA 3GXTA 2YR1A 4MLRA 2NX9A 4BI7A 4LS1A 1GG0A 3CEUA 5F4XA 2HS8A 1LLZA 4XTDA 2OCZA 1YTKA 4B5NA 2OZ0A 1XBVA 2ZZ2A 2E6AA 1VR6A 4O17A 5KINA 4I7WA 3EWYA 1KFKA 1K8YA 5G2WA 1S5VA 4CNPA 4WJEA 1WV2A 3DFNA 3H54A 5HMSA 1W5MA 4WOZA 3S8HA 3GZ3A 4K8HA 5CZTA 1OX4B 1I2RA 1RPXA 5FF0A 3C2VA 4OHQA 3W2NA 1KFBA 3M5ZA 2EPHA 4QNWA 4ZVJA 1H7XA 4GUHA 5G4EA 4Z1AA 4IPJA 4CQ8A 1Y0EA 3UXDA 3A22A 5LNSA 2PRLA 3PY2A 2X1TA 1M7PA 3L5AA 3V75A 1OF6A 2WPBA 2NV1A 4LVDA 3P5ZA 1P0NA 4UR8A 1DQXA 2E5CA 2H8XA 2G95A 2V2HA 3L65A 1LORA 3E0IA 1R2SA 3NZRA 4JN6A 8TIMA 3S0CA 4LUIA 2I1OA 2EGZA 4U28A 3QH2A 4WZHA 3Q37A 3IGXA 1HO1A 2Y7DA 3T7VA 1G69A 4LWWA 3W84A 4DPPA 3UNDA 4JTFA 3HIJA 5F4SA 5HWJA 2HSAA 3WFAA 3FFSA 4K38A 1WXJA 1WX0A 4UTUA 3EX3A 3M9YA 5LSMA 3NQ7A 5LHFA 1OFOA 1SSDA 5DBUA 2BLEA 3I7SA 3GNDA 1EEPA 1GWJA 1P5BA 3H53A 4RXGA 4W9TA 4BR1A 1YPFA 1Z42A 1BWLA 2WNQA 4CCEA 1YDNA 3TFCA 1FXQA 4C1LA 4XQ6A 3LCHA 5LNVA 1ZCOA 3L0GA 1TCDA 1YXDA 1KV5A 4XBSA 2ALDA 3VE9A 3DH7A 4HPJA 3DHDA 4H4IA 5G5IA 4NJHA 4Z1CA 1ZALA 2HTMA 1JUKA 1UBSA 3ABOA 3N2MA 4MIMA 4AHPA 4EIVA 3MUXA 2GQ9A 2EAWA 1VS1A 3IIPA 4YWIA 4IPIA 3HGSA 4O28A 5CPMA 2Z1BA 3UWZA 3HMJG 3TC7A 2BTMA 3G1FA 3BW3A 1DL3A 3LGEA 4PA8A 1G4EA 4FNUA 1OFPA 2QCFA 1FCBA 4DO5A 2Y61A 3ELFA 1J2WA 4PCFA 4UFMA 1XDLA 2E1DA 1KBJA 2RDUA 2A0NA 2DZXA 2A21A 5F2GA 3B03A 3OA3A 1IGSA 3S5NA 3LI1A 3WJXA 5D2YA 1AL7A 4GBUA 4YCPA 1TYGA 4JX5A 1KBIA 1MSSA 5BMXA 4PFMA 3L67A 2Y70A 4FX6M 4EF9A 1QO5A 3SI9A 1SO6A 4CCDA 4KWVA 1LBLA 3VNDA 2YSWA 5CPLA 2YX0A 4RX0A 3W1UA 1P1XA 5EA9A 1YDOA 3NL3A 1H60A 3EEGA 2QCGA 3M47A 2ZQ0A 2R8WA 1K7EA 2R91A 5TQLA 2G5WA 3I68A 3WK2A 3EKLA 3PR2A 1I45A 3I65A 4JTTA 5K9DA 2QDHA 3NL5A 2E68A 4OQVA 3T55A 1QR7A 5HWMA 3W7NA 3EX6A 3SZ8A 2FIQA 3PB2A 4MY8A 3TC6A 3W73A 3G1SA 1HTIA 4POCA 3INPA 2ISWA 1CI1A 2R94A 2QR6A 2BX7A 3KX6A 3NL2A 1ONRA 1EP3A 3LTPA 3F03K 3W86A 3MW7A 1GQNA 1G6CA 3P82A 3BGGA 1DQWA 2FPYA 3O6DA 4WQ6A 3TW7A 4IMDA 2AAMA 2BXVA 3MBDA 2EKCA 3O6YX 5DN1A 5HUPA 3P5YA 4O50A 3W7PA 3PULA 4M7SA 3DZ1A 3EXRA 3GYEA 3CLMA 2Q3OA 4UC5A 4FF7A 3CEPA 5AYZA 1MEWA 1FCUA 2OMAA 2WKJA 2E77A 1EPXA 2YZRA 2WSQA 5AHLA 3TQKA 3SW6A 1O5XA 3R5EA 2IQTA 1HL2A 3M5YA 4K39A 3DKJA 3MP3A 3HG2A 5KMYA 2CZEA 3SJ3A 1UASA 1FWWA 5KITA 4LRTA 4OBTA 2ZRVA 3DXIA 2CLLA 1SZNA 4IQLA 3P8JA 4CCCA 3CIWA 1XL9A 4KWWA 2QCHA 2CW6A 3CT7A 5IBXC 4FO4A 7TIMA 4KFPA 5HINA 4NJJA 1W5QA 5K4XA 2G97A 1FWRA 4GWEA 1TJRA 1O5KA 3P84A 1TTQA 2A7RA 1TQXA 2JGYA 1F74A 3NQMA 4Q4KA 3LLFA 1M7OA 1ZAHA 3MI3A 3NQEA 4IMCA 3B0VC 2GOUA 4MFEA 3PS7A 1Q6QA 3ZWTA 2VFEA 4U4MA 1GTEA 3GDTA 1T96A 4HN4A 4N9DA 3W76A 4N9BA 4FNQA 2JK2A 1GT8A 2NUXA 2E5DA 5K9CA 4MJMA 1LRNA 2YFNA 1TPB1 3GLCA 2NV2A 3W7GA 5CZSA 5KZEA 1GVOA 2GVLA 2V8ZA 3OVQA 3GK0A 4Q32A 3NR0A 2AGKA 1Q6LA 3HQ1A 1WQ5A 3GDMA 2ZRYA 3PAJA 3FKKA 1OYBA 1QNVA 3MWAA 1I2PA 1U83A 1F5ZA 4GUGA 2QF7A 4E2BA 3N9RA 3M1ZA 3O05A 1O95A 2J9ZA 3P61A 5KZDA 4BK9A 1ZNNA 3PSVA 4FB7A 1T8XA 4XKYB 4O15A 1M5WA 3LCXA 2ZBTA 1SZGA 3TFXA 4UTLA 3IEBA 5C54A 2YYUA 4A2SA 4QSHA 4A29A 1VPXA 1DORA 4MPQA 5TBOA 1PHWA 3ABSA 3EWWA 1X6UA 3M44A 2QUTA 2GUUA 5I3HA 1SUXA 4BI5A 3BO9A 1G4PA 1TB3A 1R30A 3T44A 3MI2A 5SWUA 4WX2A 5ABTA 1KM0A 3IGSA 4LNYA 2ISSA 1B57A 3W85A 3FKRA 3LRKA 4CNNA 2OT1A 2A5HA 2PRMA 2A7NA 2NX1A 1AMKA 3BVJA 1LBMA 4OWGA 1K8ZA 1ZHAA 2QCDA 3ATZA 3VFLA 2QJGA 4LVFA 1VH7A 5DELA 1IF2A 4PC8A 4OE7A 3FS2A 4FX7A 1OFRA 3VE7A 4J9JA 4NUWA 3THAA 3N9SA 1B4EA 1DJNA 4RR4A 3W1MA 1W3IA 1BEUA 1H7OA 3QFEA 4IX0A 1MZHA 2X2GA 4AVFA 3LBCA 4MOZA 4PEKA 4M7TA 4MKNA 4O52A 4QIUA 5EKYA 1GG1A 1J4EA 1WOBA 4HSNA 2H90A 3JR2A 3UWVA 3TSBA 3ZR4A 3EWZA 4HIBA 3NO5A 4Y8FA 2JKEA 4CQ9A 3CWOX 4UTIA 1XKYA 1ME9A 4Y9AA 3W2JA 4HNVA 3PBYA 4RK8A 3GR7A 1QPRA 3RLVA 1KV8A 2UV8G 4N02A 2V9DA 5FI8A 4JTEA 3EXTA 2V2CA 1R47A 3QYQA 2NWSA 1KM2A 5HR6A 1MEIA 3C8FA 3WJSA 1DBTA 1DJQA 4GXMA 1G7UA 5K3VA 3L5LA 3I6RA 1OVDA 1H62A 1A5BA 2WOQA 1ZJIA 1RZMA 1EA0A 2DZWA 4KKXA 5AYXA 1O94A 1T99A 3SGUA 3MYPA 3W3OA 3GIYA 3HPZA 3TSDA 1TIMA 5AC6A 3TW6A 5A8GA 2F7FA 4IXXA 1UB3A 3IVSA 2CZFA 1KFJA 1TTPA 5FF4A 2V0TA 4GUJA 3QZEA 1HUVA 3CU2A 5CPOA 3WK1A 3N3MA 5J5DA 1PVNA 3GDRA 1YXYA 4M6PA 3O63A 2DZVA 3TAKA 4LT9A 5HR7A 1PHQA 2VFFA 1NVMA 3P67A 4ALDA 4ML9A 3N73A 1DKWA 3LXAA 1H51A 2DZPA 5LGZA 4YCOA 4O13A 1W31A 1JCYA 3VI2A 2X1RA 5HWNA 2XN2A 4G1KA 3GB6A 5GVJA 1L6SA 5AHEA 1XBXA 1O4UA 4N4QA 3LI0A 3EB2A 3S9YA 3DFQA 5FF3A 3RF9A 3NEVA 2E6FA 3NQCA 3K30A 3MO7A 3DFTA 5CSSA 5I3JA 2WSRA 3NDOA 1JULA 3G0XA 4AEOA 2J6XA 3OVRA 3W7KA 3Q2DA 1GVSA 3PF3A 5HQEA 4RZ5A 3DAQA 4AAJA 4AWTA 3G3MA 4WOQA 4MUZA 4QJ1A 4HNNA 5AC8A 1KTCA 1XUUA 3HG5A 2Y7GA 1NEYA 1OABA 3SECA 4LVBA 3DI0A 5U4NA 3W07A 1L6WA 5D2WA 1SO4A 4PL1A 4IX2A 4ADSA 4X3ZA 3UPWA 4JYEA 2ABBA 3W2LA 4CLMA 4PL2A 2E09A 1OF8A 4MY1A 4EOUA 4RCXA 1W8SA 1PCKA 4DF0A 4RJEA 2PURA 1OJXA 1RR2A 1FCQA 1QOPA 3PC0A 3NXFA 4RXFA 1MXSA 4UFIA 4OT7A 2H8ZA 1V5XA 1KTNA 1VLWA 1ADOA 2VEPA 3G1VA 3HGOA 3HG3A 1B9BA 4HHPA 3TK7A 1OX6A 2D73A 1C29A 5G1TA 4E38A 2C0AA 3PBUA 3W7QA 2ATMA 2QJHA 4WXZA 2B7QA 5F1VA 2V5BA 4HSOA 4D2JA 2V2DA 4NVTA 3E12A 1H1YA 1VQTA 3WJZA 2DJXA 3TJLA 1SQ7A 2ZRZA 3G0SA 1JVNA 4H6KA 2G96A 2HMCA 1H1ZA 1RVGA 3C56A 4FEZA 1N55A 3U2OA 5D2TA 3UY8A 4MYAA 3C4UA 3B04A 1NAL1 1LDCA 2YXGA 4PODA 1G4SA 1JR1A 4A22A 1UUOA 1XBYA 2JKPA 2TSYA 5LZLA 3QW3A 2Y7EA 4Y96A 5G2HA 3OIXA 4GUIA 3B0UX 3L0NA 2B7PA 5D03A 2X1UA 3DKLA 5AYYA 3W2UA 2CZDA 3FJLA 1P4CA 3OBKA 1PE1A 5LNRA 3RU6A 1FCVA 1WBHA 3EWBX 5F2MA 4ADTA 2C18A 3F1QA 1RQEA 1XCFA 1N8FA 2YPIA 4FIQA 4Q33A 1JJKA 3STGA 2XN1A 5D2XA 1DVJA 1YXCA 3DFOA 3HO8A 3HGRA 5EY5A 4K36A 1LOSA 1QCWA 3TKFA 4S2CA 4UTJA 5FEWA 1EP2A 2EF9A 4I7UA 1OK6A 1SW7A 3W1NA 4YMZA 3WJWA 1QPNA 3R13A 1AL8A 1OG0A 4MYXA 5LKYA 1SZEA 1H50A 1XDMA 1VJIA 5K2ZA 2ZTJA 4OU1A 2XN0A 3W2MA 1KTBA 3MI6A 2Y7FA 2RKXA 2VFGA 5L6UA 3TR2A 4XBKA 3U6WA 1H7WA 2CLHA 3TDFA 4O0ZA 1CW2A 1F76A 5K7JA 3LBMA 3E49A 3IVUA 3ZS4A 1JCLA 3MYOA 2NXHA 4HT3A 3AJXA 4M6VA 4NXKA 1VHNA 3W1LA 3CPRA 1H7PA 3PUEA 3FA5A 1D3HA 2RDTA 1KM4A 1S3HA 1VZWA 1UJPA 3P80A 3BW4A 3EXSA 2A6LA 1W3TA 4O1DA 1O60A 5DY3A 5D2VA 3W7LA 3S1VA 2ZRUA 1SU5A 2V81A 3GVGA 2J27A 4ZZ9A 1JCXA 2WQPA 4UFLA 1YTEA 2ZA1A 3L9CA 1S5TA 6TIMA 4XKYA 2Q8LA 3BLFA 1K3UA 3S42A 1TREA 5BNKA 5LGXA 3RNDA 3LERA 1EX5A 3E96A 4EWND 3L68A 3NG3A 1C8VA 4KFOA 4GRSA 4GNJA 3LHUA 3UYCA 1XM3A 4IMFA 2C16A 4NJKA 5C2XA 1OFQA 2C19A 3I7QA 3W1PA 5FESA 1EUNA 4QISA 4LC6A 1E51A 2CZ5A 1T0OA 3BK0A 2QDGA 3Q94A 3CM4A 1TO3A 2P10A 2J24A 3KVMA 3W83A 1D9EA 1NF7A 3QJAA 4LTSA 4E2DA 1QPQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1QXL A;  3HPX A;  3O16 A;  5RUB A;  1P6C A;  1I8J A;  2ZX9 A;  4BF9 A;  1W3K A;  2XWE A;  4CVW A;  4US6 A;  4MGG A;  4PEE A;  3MVT A;  2YR1 A;  4MKS A;  3GNO A;  4QCF A;  5F4X A;  2ZIC A;  2RGL A;  4JFU A;  4F40 A;  1YTK A;  1UIO A;  3QKE A;  4J4K A;  4DN1 A;  1K8A J;  1R3V A;  4PMQ A;  1WO2 A;  3QR1 A;  3PN8 A;  4GXP A;  4PBF A;  1VR6 A;  5A94 A;  1A5O C;  3EWY A;  3G5E A;  2INE A;  1K8Y A;  4CNP A;  1P0E A;  1ODU A;  3H54 A;  4HOZ A;  3C2Y A;  2DSW A;  4KIR A;  3GZ3 A;  3NUR A;  3C2V A;  3RPD A;  2PDF A;  1DTU A;  1TR9 A;  2ZXA A;  3M5Z A;  4D71 A;  5G4E A;  4NZ4 A;  1IZC A;  2P50 A;  3PY2 A;  2X1T A;  1UPM B;  3EB3 A;  4Q7N A;  1OF6 A;  3LUT A;  3V75 A;  4NZ3 A;  2NV1 A;  3AHV A;  3KL3 A;  2H8X A;  4INF A;  4GYJ A;  4DWS A;  1VBJ A;  3E0I A;  4EPB C;  3WX7 A;  4JN6 A;  2D2O A;  8TIM A;  4AY7 A;  3N4F A;  1Q6D A;  1R38 A;  2FGL A;  2I1O A;  2J7F A;  4XG1 A;  4BQ2 A;  3CGT A;  3NIY A;  4WZH A;  3ZLF A;  4O8A A;  2E25 A;  3GRI A;  1E9I A;  3T7V A;  4DUX A;  3PWG A;  5B80 A;  1HKK A;  2R1L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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