3L2IA

1.85 angstrom crystal structure of the 3-dehydroquinate dehydratase (arod) from salmonella typhimurium lt2.
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
259
structure length
256
Chain Sequence
NLYFQSNAMKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKEGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKAPGQISVADLRTVLTILHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
publication title A conserved surface loop in type I dehydroquinate dehydratases positions an active site arginine and functions in substrate binding.
pubmed doi rcsb
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 89
structure length 256
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2009-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l2iA00
1KM2A 4LT9A 4LVFA 1L6SA 2X1RA 4UFJA 1H7OA 3W1PA 2YGYA 1EB3A 4H3DA 2UV8G 5F1VA 3W2KA 2V8ZA 4Z0JA 2A6LA 5CPOA 3A23A 3M16A 1BWKA 5CPLA 1OYAA 3PM6A 1KV5A 3O63A 5D04C 2NUXA 4GE8A 5KITA 3NXFA 1JULA 1P0KA 3BW3A 4XQ6A 4DBEA 5D2VA 2C13A 5KTLA 3E96A 3O6CA 3A5VA 1XBXA 4K36A 5F4WA 5C2XA 1TTJA 1KBJA 5F4SA 4TX9A 3LI1A 1PHQA 1KLZA 1OX5A 1HFBA 3LB0A 4AHPA 1ZJIA 4UTMA 1TJPA 3M0ZA 4EWND 1KFEA 3P67A 1GZGA 4ADSA 4QNEA 2X1UA 1OFAA 4Z1AA 3MBDA 5EY5A 1DBTA 3ZS4A 3HG4A 5CKSA 3HGJA 3LXCA 3UWVA 5CGQA 4XUGA 1KTCA 3EWUA 1WDWA 2YW3A 4Z0SA 3B05A 2X30A 2WSRA 2PRHA 3P84A 1GTHA 3NGJA 3W6YA 3BPWA 1YPFA 4N6FA 3BLIA 2AAMA 3TSBA 3BW4A 2Y62A 3PUOA 4YWIA 1ZY9A 4JX4A 3M1ZA 4G1KA 3OVQA 2B4GA 3PR2A 3EX6A 5FEXA 1W3TA 3GR8A 2DZXA 5HQEA 1NSJA 2RDWA 4YLWA 4E2BA 4IMCA 1QPQA 2WKJA 4AF0A 2PRLA 1FDYA 2CLFA 1TIMA 1KV8A 1OX4A 4O4VA 3C0JA 3R8RA 1GEQA 4O10A 3TC7A 5HWMA 1F7BA 1XBVA 3UWWA 4BI5A 2R14A 4Z1CA 1OK6A 5LNWA 1UB3A 1G7VA 5LZLA 4NVTA 1JUBA 1Q6LA 3C2EA 3TCEA 4UTTC 2X1TA 2C0AA 5AC8A 3U8GA 1EX5A 1JCLA 3P60A 2ZRYA 1OFEA 3CIXA 1SZEA 4CLMA 4I9AA 1SUXA 2GVJA 1IF2A 4JTFA 5F1UA 3NL5A 3W1UA 4A22A 3BLFA 5H2ZA 2DZUA 3UWZA 3W1NA 2RKXA 1MEWA 3M5XA 1L9WA 1ZHAA 3G3DA 3GX9A 1SZGA 3G22A 3W7OA 4LVGA 3B0UX 4GUJA 3EXSA 2A7NA 3HPXA 4KFNA 4LTSA 4NX5A 4FX8A 4K7YA 1U5JA 3INPA 4NXKA 1GG1A 2RH9A 2TYSA 1RZMA 3GXTA 4WY0A 3MP4A 1XBZA 3EKLA 5L9FA 2A1YA 2I9EA 1XUZA 1F6PA 4MZ1A 4N9BA 1QWGA 3OVPA 5K4XA 3THQA 1D9EA 3VCRA 1GPWA 1W5OA 1F6KA 4GBUA 4P2VA 5HUOA 1B3OA 3LLFA 4FXRA 3GAKA 3LTSA 4HN4A 1LBMA 4E2DA 1CW2A 1TV7A 2QAPA 3BG3A 2V81A 5FF2A 3L0KA 1TMHA 1K8XA 4ZQPA 1G4PA 2B7QA 4WXYA 2F84A 3LGEA 3MP5A 1VLWA 3EWZA 4IGHA 1IXQA 3G1VA 3HBLA 2A2IA 3SFKA 3W7IA 2VFFA 3VNDA 3QRHA 5D33A 3GXPA 4K8HA 1WX0A 5G1YA 1E51A 2OCZA 3MHFA 1Q6QA 4LOCA 3TQ0A 1S3HA 3DFSA 4UTUA 1XDLA 1A5SA 2Z0IA 3QQ0A 5I3KA 1GOXA 3TQKA 4CQ8A 3W7KA 3BW2A 2DORA 1VQTA 3IGXA 5D38A 3LHUA 3S5OA 1H1ZA 3A9IA 3VI2A 2DU2A 3CPRA 4PH6A 3W1RA 2YSWA 2Q3RA 1MO0A 3HPSA 3MO7A 4UUIA 3MI2A 3W7HA 2H3DA 4O11A 4A2RA 3W1LA 1QNVA 3DU0A 1YADA 3O15A 1WOBA 2JGQA 3L67A 3EX2A 3LERA 4XKYA 2TSYA 2WSYA 3TXVA 1YTDA 2FQIA 1JUEA 3PBVA 4L4LA 3DFTA 3B4UA 1P1XA 1XC4A 4OHQA 3QC3A 3QW4B 3DFOA 1VCVA 1KM3A 3JS3A 1QCWA 2W6RA 3CU2A 4JTGA 4NX0A 4CNNA 1WBJA 3NPWA 4DF2A 4H4IA 3P80A 4UIOA 1TRIA 3RK8A 3KAOA 3R2GA 5HNRA 3QH2A 1KM1A 4FHAA 1W1ZA 2BX7A 1FCUA 1TTQA 4LW7A 4QNWA 4JNMA 2OMAA 1LROA 1YXCA 4UMBA 1AMKA 3SR7A 3OBKA 3TJXA 2ZZ1A 3NEVA 4FO4A 5FF0A 5HJLA 3H53A 4N6EA 4QAIA 4FX6M 1S5VA 4RCXA 4TMBA 1TV8A 3GDMA 1JCJA 1LP6A 1KFLA 3M44A 3G3MA 5K7JA 3STEA 2QKFA 3L68A 5I3FA 1B57A 5D02A 3WK0A 4AB4A 2XFWA 2C15A 4A3UA 3SGUA 2Z6JA 7TIMA 3KVKA 1H7PA 2VFIA 4HHPA 4KFOA 1VS1A 3QM3A 5FEWA 4GUGA 2FB2A 2NX3A 2CW6A 1R2SA 3JRKA 1JVNA 2QCMA 2G95A 2WO5A 3W87A 3A21A 2VEMA 4LVBA 4PODA 3S1UA 3C2OA 1LYXA 4HIBA 1IXNA 3Q94A 3PVFA 4D2JA 3C3NA 3NL2A 4KWVA 1H7WA 1SPQA 4POCA 1RQBA 3YPIA 4BI6A 4RV8A 2OZ0A 3IIPA 1X1OA 1XUUA 1X8FA 3BLEA 2GJLA 4DEFA 2ZRVA 4O53A 2HSAA 5C6MA 4RZ4A 1FWNA 4OV9A 1SSDA 3WK2A 4N4PA 3OVRA 4N9DA 5A8GA 3O8AA 1GTEA 3NQCA 3P8JA 4JR5A 2QCCA 3NA8A 1DOSA 3LHZA 3RFAA 4I7VA 4OU1A 4N02A 2ZRXA 3EX1A 1Q45A 3QPYA 1THFD 3CT7A 2FPTA 1Q6OA 4E38A 3GVGA 5HULA 3LCHA 3W7MA 3OG3A 1MXSA 2FDSA 3I7SA 2P0OA 1LBFA 2YFNA 2BSLA 3L5LA 3TMQA 1IXOA 3ANYA 3RLUA 4FB7A 1ME9A 3WJYA 1G67A 2ZRWA 3W84A 2G96A 4RK8A 2NV2A 3NZ1A 1FQ0A 1H63A 3NZRA 5A5WA 1N7KA 1OF6A 1W56A 4HNTA 2E5CA 3ABRA 5LHEA 1OX6A 1H7NA 1OG0A 5K9XA 1YDVA 4HSOA 1PS9A 3L5MA 2Y63A 4M19A 5CZJA 1EA0A 4IOTA 3BG9A 4A29A 3NNTA 3NPUA 3TUUA 3S5NA 1QDSA 3A5FA 3TX9A 5KINA 3MP3A 4GC4A 1RQHA 3W72A 4L4MA 1P5BA 1K8YA 4ORIA 1BTMA 3KRUA 3LDVA 4XBSA 4EIVA 1JUKA 3C52A 1K8ZA 1NFBA 4FIRA 2V2HA 2O7QA 3PSWA 4Z08A 2ZYFA 1JRBA 1SW0A 3N9RA 4O13A 2J9XA 1WOAA 5FESA 1G4EA 3EWWA 1YXDA 2E6YA 3PBUA 4QISA 4O50A 2NUWA 3M41A 3PBWA 3DKJA 3UD6A 5I3GA 1TTIA 3OA3A 1DORA 3GDLA 3HMJG 1SW7A 2DZVA 2J9YA 4GXMA 5LNVA 4DPQA 4MJZA 5C5YA 2QEZA 1B4KA 1VYSX 1ZAHA 4H6KA 3A22A 3HGRA 5HR7A 2J24A 1O95A 1O94A 1SO3A 2WNNA 4JGDA 3LM7A 3UNDA 3VE9A 3LBMA 2DJLA 2QCGA 3DBPA 3C2RA 4NZFA 1SR9A 3W7GA 3T44A 2ZA3A 2VEKA 2GOUA 1KA9F 3S5YA 1I4NA 4IXHA 1QPRA 4IMDA 4NT0A 4O16A 5TIMA 2WOQA 2Y85A 4AVFA 5D2YA 1TV5A 4YCPA 3R89A 2QDHA 4NXSA 1W31A 4JTJA 3NR0A 3HB9A 4O17A 1UUMA 1A50A 2H8XA 2CLOA 3MI6A 4QQ3A 3BV4A 1EEPA 2A85A 2EPHA 1VYPX 4ICNA 1TJRA 4PL2A 1H62A 3W76A 3RF9A 4M7SA 3I7QA 5DCBA 3LCLA 1ONRA 1W5NA 1JCYA 3F03K 3TJLA 3W7RA 2ZQ0A 1LRQA 3DHDA 2ATSA 1VJIA 3CIWA 3IRDA 4M5PA 3O05A 3WK1A 1NVMA 1QPNA 3LTYA 3Q58A 4PC8A 4IMFA 3QMRA 3C8FA 1ZALA 4O1BA 4IMEA 4UXDA 3TROA 1NAL1 1FCQA 2HS8A 1EWEA 5I3HA 5U4NA 3SW6A 3NL6A 3GDRA 3LCIA 5D09A 2VFEA 2RHGA 4UR8A 1K7FA 2E6FA 3L0GA 1M7PA 3S8HA 4UFIA 3KRSA 4PA8A 5AYZA 3ZFHA 4JD4A 1TPEA 4ZQOA 5J5RA 4MYXA 3B06A 3TV8A 2F7FA 2Z1BA 4UFMA 3VFLA 1YXYA 3NQMA 3ZWSA 2BXVA 2LLEA 3BGJA 3W1MA 3W1TA 4LUIA 3GAYA 3O16A 2A7RA 3MHGA 3EWYA 3GKAA 4N4QA 1KFBA 3L65A 1TYGA 3F4NA 3W23A 3FEMA 3UZ5A 2Y88A 1H51A 2JKPA 3LOTA 1J4EA 3MUXA 3NOEA 2DZWA 3GNDA 1OK4A 1SO6A 3N9SA 3Q2DA 2DP3A 1QMLA 2C19A 1Q6RA 2YYUA 1QOPA 1C9DA 4N2YA 3MBFA 3G1DA 3EEGA 2QCLA 3KXQA 2R8WA 3C2VA 1S5WA 3UPBA 2Y89A 1KFJA 3TH6A 3QF0A 5K9CA 5E0KA 2E5DA 3CHVA 3BG5A 2NXGA 3S1XA 1EUAA 5CZTA 2CU0A 4R33A 4NJJA 1NF7A 1WBHA 2G97A 4Y6GA 5G4EA 2CLEA 3TA6A 3U2OA 6TIMA 1PCKA 4BF9A 3M6YA 2WSQA 3W71A 5BMXA 3JR2A 2BLEA 3QMTA 4HSNA 5CZSA 4GWEA 3QW3A 5AYYA 3W74A 1JQVA 3CB8A 4E0CA 4LC8A 4CCCA 4W9TA 2ZBTA 1PVNA 1O60A 1A5BA 2NX9A 1U83A 5AHMA 4Q4KA 3G18A 2QCEA 4K38A 3TAKA 3PS7A 1UBSA 5EPDA 3P8IA 4X9SA 3CM4A 4AMAA 1EP1A 1FXQA 1L2UA 1JCMP 2V2CA 3E9AA 1L6WA 3TDFA 5U7SA 3W1AA 1WV2A 1L6YA 5I3IA 2B7OA 3VE7A 4DELA 2E6DA 5D03A 2QJHA 3NM3A 2I14A 1JJKA 3DZ1A 5F2IA 5DCEA 2QR6A 2V9DA 3T55A 1QO5A 4XWUA 3B03A 1T99A 1K02A 4ZVJA 1F05A 3DFQA 4MOZA 1WAUA 3SIZA 1D3HA 3W7LA 1F76A 5D2XA 1GJPA 4O54A 1OYCA 2X1SA 1ZAIA 3B0PA 1NF0A 2ZTKA 3HG5A 4FEZA 8TIMA 5EYWA 3QQ1A 3TAOA 4IJBA 4WZHA 4CQAA 3HPZA 4UTTA 2NV1A 1W5QA 4BWLC 5HR6A 4Y8FA 4AH7A 2QJGA 1JQXA 3ABOA 5G2WA 4GRSA 4CQ9A 4S2BA 3ATZA 3DXIA 2DZPA 4RX0A 5IBXC 3ZWTA 1DJNA 3PBYA 1KM6A 1F2JA 4YCOA 4JEQA 3DI1A 1G4SA 1KW1A 5F2MA 1GVRA 4M6VA 3W2JA 5D2WA 3W88A 4KFPA 1I2PA 1SZFA 2QCNA 4JIQA 5G5IA 2I1OA 1AW5A 3LCFA 1TTPA 1KFKA 4ZQMA 4JY8A 3WJZA 2E68A 4UMCA 3C4UA 4XTDA 2VFHA 2ZZ2A 2HMCA 4NUWA 1OFBA 3ZR4A 5HWNA 1HTIA 1UASA 4LV4A 4O19A 2JKAA 5AHEA 4ZL1A 1ME7A 2YZRA 4JIPA 5SWUA 4UTJA 2YPIA 2E1DA 1PCWA 3UQNA 3FIGA 4KWWA 4BWLA 3ABQA 2P10A 3STFA 3EX3A 1GVOA 4UTLA 4LWWA 3F1QA 2A5HA 3IIZA 1B9BA 3G0SA 4O57A 3S1WA 1SFLA 1H1YA 3I68A 3NQVA 5IBXA 4WQ6A 4UCGA 1VHNA 2RDUA 3M43A 3G1SA 4AHQA 1PE1A 4QJ1A 5LHFA 5LKYA 5CPNA 4Z1BA 3W7DA 1GT8A 2V0TA 4J9JA 5C55A 1FDJA 4X3ZA 3G8RA 3GXNA 3V1PA 3DFPA 3OIXA 1OFPA 1X7FA 3IIVA 3OEXA 3RNDA 2WV8A 2QJIA 3SSJA 5HUPA 1YDNA 3MJYA 1TQJA 2QCHA 4FNPA 5D32A 4QIUA 3HQ1A 3G1XA 4LS2A 3OHIA 2FPYA 3TC6A 4TMCA 2JKEA 4ADUA 2OJPA 4A2SA 1QR7A 3NQEA 5LGZA 4IX2A 4DO6A 1G6CA 4MLRA 1GVFA 1Z44A 4QM1A 3F4WA 4EF9A 4UNLA 1T0OA 1XFBA 4UC5A 4Z1DA 3G1AA 2Y6ZA 4O0ZA 3W9ZA 1OJXA 1VPXA 4GUFA 4WUIA 5HMSA 1R47A 2PURA 4UFLA 5EMUA 1FWRA 4P61A 3HIJA 4DBDA 1FUYA 3MYPA 1KTBA 4RKAA 3S5ZA 3MWAA 1EP2A 4LNYA 2R91A 1RPXA 2NXIA 4IPJA 3W7CA 1DL3A 2FLIA 2C6QA 3O6DA 3A24A 2WQPA 1OVDA 1K7XA 2E5BA 2HTMA 2ISVA 3G0XA 3HGSA 3FYOA 3LCXA 3RU6A 3L66A 1NEYA 2VENA 4K37A 3CC1A 1Y0EA 3IEBA 3BGGA 1LRTA 3QZEA 1LORA 3RMJA 1TB3A 3M47A 5K4ZA 4LVDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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