3L2RA

Crystal structure of the prototype foamy virus (pfv) intasome in complex with magnesium
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
AELDQLLQGHYIKGYPKQYTYFLEDGKVKVSRPEGVKIIPPQSDRQKIVLQAHNLAHTGREATLLKIANLYWWPNMRKDVVKQLGRCQQCLITNASNKASGPILRPDRPQKPFDKFFIDYIGPLPPSQGYLYVLVVVDGMTGFTWLYPTKAPSTSATVKSLNVLTSIAIPKVIHSDQGAAFTSSTFAEWAKERGIHLEFSTPYHPQSSGKVERKNSDIKRLLTKLLVGRPTKWYDLLPVVQLALNNTYSPVLKYTPHQLLFGIDSNTPFANQDTLDLTREEELSLLQEIRTSLYHPSTPPASSRSWSPVVGQLVQERVARPASLRPRWHKPSTVLKVLNPRTVVILDHLGNNRTVSIDNLKPTSH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Recombination/dna
molecule keywords Integrase
publication title Retroviral intasome assembly and inhibition of DNA strand transfer
pubmed doi rcsb
source organism Human spumaretrovirus
total genus 100
structure length 365
sequence length 365
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.7.49: RNA-directed DNA polymerase.
pdb deposition date 2009-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00665 rve Integrase core domain
A PF17921 Integrase_H2C2 Integrase zinc binding domain
A PF18103 SH3_11 Retroviral integrase C-terminal SH3 domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.10.2300 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Arc Repressor Mutant, subunit A Arc Repressor Mutant, subunit A 3l2rA04
1.10.340.70 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Endonuclease III; domain 1 Endonuclease III; domain 1 3l2rA01
2.30.30.140 Mainly Beta Roll SH3 type barrels. SH3 type barrels. 3l2rA02
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 3l2rA03
3QJ6A 3SUQA 2PYLA 1C1CA 4M3YA 1D8YA 4B8AB 2L89A 3RMCA 3O4QA 5D6WA 1WLJA 3ZT3A 4A4FA 3C94A 3AO4A 4M3TA 3V9XA 1TV6A 4J2EA 4JS4A 3DMJA 3F73A 1RBVA 2G8WA 3SZ2A 2X4WA 1Z26A 1S5JA 3KKSA 3TARA 2X78A 2X74A 1TK5A 4Z4EA 2HHUA 3ALYA 3L2UA 2X6NA 4MQ3A 2NUBA 1S1TA 4EP4A 3META 4QQDA 2VWKA 2JLEA 4PLIA 4CFCA 1BCMA 5IAYA 4N4GA 1C1BA 4QOZB 2IS3A 1JXBA 3OQ5A 5CY4A 4Q0BA 2QQRA 2B8AA 1TAQA 3TAMA 4CF9A 3KK3A 1WN7A 3TAEA 1S9EA 4DFJA 4O0IA 2E6MA 1RDAA 3BDPA 2XY5A 1J9AA 3P83D 4M3WA 4CJTA 4R5PA 4E7KA 1L3UA 4AHSA 3WNFA 3RR8A 4FJLA 5J2PA 4KHWA 4KI6A 2WOMA 2XO7A 4OGEA 3DB3A 2IG0A 2OYQA 3AA3A 2GUIA 1T7PA 4FK0A 1RT6A 4C5GA 1S1XA 1TKTA 3OYNA 4FYDA 4F8RA 3TAFA 1NOYA 4KHNA 1QHTA 1RT1A 3L8BA 4DSLA 3SUNA 1A5XA 5J39A 4LSLA 3NH2A 1RT7A 2F96A 2KTQA 3VQCA 1HNVA 1BI4A 4DLEA 4CGDA 4FCYA 5D6YA 5KI6A 3I0SA 4CJ5A 3TR8A 1U49A 2FBTA 3MEUA 4JRQA 3VQ7A 1RBUA 1C6VA 2GF7A 4C8NA 5J2NA 2GFAA 3LYIA 4LH4A 1RT3A 4KTQA 3OYIA 3VQ5A 2RN2A 4NYFA 2EHGA 4BDZA 4YNQA 4PL6A 1KVCA 2B4JA 1RILA 5KCOA 4QQ6A 3AA4A 3OYDA 3VQ9A 1JLFA 3TI0A 2HHSA 2D0AA 4ZTJA 4CEQA 3OVNA 4BWJA 5HRPA 4DQQA 1WGSA 3ULDA 2ETJA 5EU7A 4FM2A 2RKIA 1L3VA 5JS1A 1T8EA 4N5SA 1HPZA 1UWBA 1GOBA 3LLRA 1BISA 4DG1A 4CJWA 3ZSQA 4AHUA 4IURA 4B9UA 3QO9A 1D5AA 5SZTA 1BQMA 3EYZA 2HVIA 4FLWA 1S1VA 3CM5A 4CF1A 4E1MA 2XY6A 4Z4GA 4KTWA 2R5MA 4FJIA 3H08A 3DLRA 1BCOA 4Z0UA 1WSFA 1T03A 4RW4A 3K2PA 1X9SA 4E1NA 2JGUA 3MEAA 2KZZA 3FFIA 1C0MA 4K8ZA 3P8DA 1UAXA 2D0BA 2YNFA 3TABA 1CXQA 5FRMA 4DTNA 2YHAA 2KFZA 4IUVA 3TANA 1ZYQA 1F21A 5FROA 4RW8A 3OJUA 2G8KA 3V6DA 4I9LA 2YKMA 1IKVA 2L8DA 4HUFA 2G8IA 1IKXA 2VG5A 4F3TA 1RTIA 1N27A 4LD6A 4A4HA 4J2DA 3LP3A 4CGJA 3V9WA 4KFBA 3QETA 3SUPA 1IG9A 2PZSA 1L3TA 1BI4B 1JLEA 1Q8IA 1QSSA 1NJYA 4FL6A 4FW2A 3SI6A 1QSLA 4FK4A 4QQGA 4HCBA 2G8UA 4KHUA 4IFYA 4DFPA 1SV5A 2EX3A 1HMVA 1S6PA 4HHTA 2HMIA 1B9FA 3HP6A 3AVAA 4F2RA 4CRIA 1RDBA 5HRNA 2HNDA 2OPRA 3QEXA 5HROA 2EKOA 5T7BA 1RI0A 3RMDA 5J2QA 4N4IA 3SD4A 2Y1IA 1EETA 4PY5A 4KAZA 4CIGA 4CJPA 1BQNA 1Q9YA 2K3YA 3MO8A 2YNIA 4FLVA 2HNYA 2B6AA 4DTRA 1NJXA 1OZ2A 1HQUA 4KHQA 2M1HA 3V4IA 2VG6A 4CESA 1L3SA 4LSNA 3QNNA 2HHTA 1IH7A 3VA3A 1U47A 1BIZA 4ZHRA 2KZMA 4DTMA 1CZBA 3L2WA 3RMBA 5FRNA 3C6TA 3K5LA 2FHDA 5I42A 3V81A 3KLGA 4Q5VA 4LD0A 4E89A 4OLAA 4FLTA 3B6PA 1NKCA 3V9UA 4I9QA 3HP9A 1WJSA 4ID1A 3MECA 5K14A 5DK5A 4PQUA 1R0AA 3ZSXA 4DTXA 4C8OA 4E19A 3CFRA 4DTPA 3P5JA 3V9ZA 3HPGA 3TWHA 3OYFA 3RRHA 2BANA 4FZYA 2BE2A 3ITHA 2O4GA 1RTDA 4KO0A 3I8DA 4Z4IA 4DS4A 3AVBA 4CK1A 3MEGA 1KTQA 4FU6A 4OKJA 3KLEA 2YNHA 1SKWA 2DIQA 5KRSA 4KV8A 3CEYA 2RF2A 4KREA 4Z4HA 4NCAA 1U45A 3DOLA 3PX6A 4DTSA 2B5JA 3M8SA 1I3AA 4N4HA 4Q5WA 1VRTA 1XC9A 4AH9A 3RMAA 3VN5A 4CEOA 4AHRA 2FBYA 3SQ1A 3LP1A 1ZBIA 4B08A 4M45A 3K59A 3KIOA 3NAEA 3LDSA 4DMNA 5C24A 3KLFA 2E4LA 1A5WA 4HUGA 1Y97A 4NCGA 1RDCA 2RHUA 5D3GA 3QLHA 3JSMA 4I7FA 3PMIA 2P51A 2ZQBA 3DB4A 1SL0A 1JLGA 4O4GA 1YTUA 3K5NA 3QESA 4CJLA 3G10A 1TK0A 3F9KA 4FJHA 3LGLA 4FLZA 1NK4A 1NK6A 3L42A 3DRRA 1H3ZA 2VWJA 4PA1A 3L2RA 5CYMA 1VSHA 2MWOA 1NJWA 1VSFA 4CEFA 3TAPA 3VQEA 3LWMA 4BACA 3L3VA 4OLBA 1RCHA 2O4XB 2G8VA 4DLGA 1NKEA 1SKSA 2RPIA 1VSMA 3DM2A 2X35A 1TVRA 4OVLA 1GOAA 2HHQA 3SQ2A 4EDUA 1O1WA 3V1QA 3OS1A 3OYHA 2HNZA 3D0PA 3KK2A 1UOCA 4FLUA 3ZSYA 4C5HA 1WJQA 3HXMA 5FDLA 4CJUA 4CGFA 3S3NA 3ZT1A 1JLQA 4FW1A 4FJKA 3VQDA 3LAMA 2YHBA 4DSIA 3A2FA 1HRHA 3HVTA 3VQBA 1LV5A 2RI3A 3O8VA 2RHXA 4B9WA 2O4IA 4ELVA 3DLMA 2K3XA 4JLHA 1KFDA 1TK8A 4CJSA 5CZ1A 3NGYA 4FJ9A 2X4YA 3C95A 4Z02A 3DLBA 1HNIA 4QW2A 4N47A 4IUPA 4HVJA 2JZ2A 2R58A 3MEEA 4DQSA 2R7YA 2OZSA 1BL3A 3S6WA 1YTAA 4PLLA 3WNGA 3HPHA 4GVMA 4E7LA 1FKPA 2BGGA 4B9NA 2XK0A 3S9HA 1HYVA 2F5KA 1OI1A 2RHYA 3EY1A 3PO4A 4C8MA 5HRSA 1A5VA 3RTVA 1JLCA 4L59A 3TAQA 4E3SA 3T3FA 3QEVA 3QIIA 3HO1A 5J1EA 1JL2A 1RBTA 1ASWA 1LAVA 4GW6A 1J53A 2Z1JA 3DRSA 3T19A 1RBSA 3LWLA 1KFSA 2Q3SA 3OB9A 1OZ3A 4DF8A 4ID5A 2LSNA 1WSJA 3L3UA 5KGXA 4NS5A 3SYZA 4C8KA 1SSFA 1NOZA 4PWDA 1HQEA 1DLOA 3ZEHA 2XY7A 2OPQA 4C5IA 3THVA 4J2AA 1REVA 3HK2A 4CIEA 4BDYA 4CHNA 1YVUA 3V1OA 3AVCA 2M16A 2JTFA 2OZMA 1G5VA 3Q1JA 3UIQA 1BGXT 2DIGA 1VSEA 4AHTA 3UT1A 3NF9A 4A4GA 4QAGA 3P1GA 4Y1CA 3ZT2A 4M3ZA 2XY8A 3CM6A 3LPTA 4KHYA 4M3UA 3RR7A 1LW2A 4CF8A 4M42A 2IOCA 1K6YA 2KFNA 2FBXA 4HTUA 2Y1JA 4RG8A 3E9FA 1ZBHA 3C6UA 3TAGA 4QVZA 1WSHA 1RT4A 3LX7A 1U48A 3QEPA 3V1RA 3SUOA 4FLXA 1QTMA 4KI4A 1RTJA 4IFVA 4X34A 1VSIA 2QQSA 3PMTA 4AHVA 3ISNC 3FC3A 2HQEA 4CFAA 3DRPA 3OYKA 4FK2A 4DTOA 1TAUA 1BIUA 4N41A 3NBPA 2VG7A 4YFUA 4OJRA 3CFPA 2IC3A 5IN1A 3NFAA 3MXMA 4CJVA 2GBZA 4CCHA 1NK0A 3CFOA 2LDMA 2IDOA 4AHCA 5C42A 4CK2A 4G1QA 3OYAA 4B8CA 4W5OA 1HJRA 3OMCA 2HW3A 4M3RA 4CJRA 3EZ5A 3AVFA 2YRVA 2ATQA 1J54A 1RT5A 3IG1A 4CGGA 4NCBA 1DTTA 1IKYA 1FKOA 1RNHA 4MFBA 1CXUA 3ZT4A 2Z1HA 3KTQA 2EQJA 3K5OA 1X9WA 1GOCA 1NK5A 3SQ0A 4OPKA 3H6ZA 3MP8A 4ICLA 1QSYA 2M0OA 3LZIA 4NYNA 3QIOA 2WONA 1KLMA 2MWPA 2Z1IA 4DQPA 1TKXA 3G0ZA 3AO5A 2BDPA 4EP5A 3ZSOA 5SWMA 4H4MA 2DTUA 4CJFA 3IS9A 4FJMA 4IG0A 1UA1A 4W5TA 2AJQA 3AVMA 1CLQA 1SL1A 3DLEA 1G15A 3LGFA 3BDLA 3NF6A 1NKBA 2DY4A 3AO3A 1LW0A 4BE2A 1L5UA 2HVHA 1HYSA 4LY7A 3AVHA 4DSJA 2W42A 5KTQA 2BUDA 4FVMA 3IAYA 1Q9XA 4DSFA 5C25A 3MP1A 4KPYA 4BWMA 4FJ8A 3M8PA 1X9MA 3MEDA 1FK9A 4CEAA 4DS5A 4DTJA 1KHCA 4A4EA 3AO1A 4FJ7A 1YT3A 1EKEA 1QE1A 3AVGA 5KCHA 2HHXA 4O55A 4RG2A 4CEEA 3OYBA 1C0TA 1ASUA 4E0DA 1TL3A 3MXIA 1TKZA 1VSKA 3NGIA 4M3XA 4QCLA 1NK8A 3LPUA 5D6XA 5C6SA 2YNGA 4KTZA 3VQQA 3OYEA 4CIFA 2WACA 1Z25A 3PV8A 1UA0A 4UC4A 3KLIA 1C1AA 3C4SA 3KUFA 4JS5A 3E01A 1SUQA 4JRPA 3SCXA 1TKDA 3D45A 3OS2A 3HPOA 2RHIA 4CF0A 2GV9A 3EAEA 3AO2A 4B9VA 2RO0A 4HCZA 4IUQA 3OYJA 5HLFA 4FXDA 4L8RB 2PQWA 1WAJA 4HCCA 1RT2A 1D9FA 1NK9A 5J2MA 3ZCMA 3KD1E 3OYGA 1NJZA 3ASKA 3ZT0A 4IBNA 4FJNA 3OS0A 1SL2A 3PUFA 4ELUA 2OA8A 4CGHA 1ASVA 3HSTB 1S1UA 3DI6A 3PX0A 1JLBA 5KH6A 2FC0A 4OPJA 4DFKA 3AA2A 3M8QA 4E7JA 3LP2A 4DU4A 4E7HA 3NTIA 1BHLA 1U4BA 4LH5A 1N6QA 3MEWA 4CJ4A 4DQIA 4AILC 3BGRA 4DTUA 3K58A 3WNEA 1VSLA 3LANA 3E9GA 1JKHA 4FJGA 3U6FA 5DMRA 4CJKA 3QEIA 2G3RA 1I39A 4B9MA 5KE3A 3F70A 1C0UA 2P5GA 3JYTA 1T05A 1WSEA 5HBMA 3KKRA 4OKEA 3SPYA 2RHZA 1XWLA 1KCFA 3DOKA 3NH1A 4GMJB 1SKRA 4CEBA 1CZ9A 3QINA 4RW9A 3AVIA 3RWUA 2D9TA 1KSPA 1LWFA 2HHWA 2QKBA 4XIUA 3OMGA 4N56A 4CFBA 2I5JA 3U3GA 2X4XA 4BD3A 4M41A 3OJSA 3HVRA 1U04A 2E5QA 1EP4A 1ZBLA 3VQ6A 2HB5A 1VSJA 2D5RA 3VA0A 1S1WA 2RJEA 5CYQA 3SQ4A 3O3FA 3I0RA 2P5OA 2EQKA 3NF8A 3NF7A 3NCIA 3B6OA 4DFMA 1XHZA 1IO2A 3ZSZA 4CGIA 2L3RA 4CERA 4CJQA 5KRTA 3NDKA 3ZSVA 3O3GA 4W5NA 1RDDA 2D0CA 5JS2A 4DWIA 4NZGA 2ZE2A 1QS4A 3S3OA 1B9DA 5CIUA 4F2SA 3QBYA 1S9GA 4BDPA 3NTKA 5KE2A 1ITGA 5KGWA 2XRIA 1JLAA 2BKDN 5CZ2A 1WNSA 4FJXA 2R57A 3ASMA 4RW6A 4B9LA 1XNIA 4O5BA 3PY8A 4B9SA 3VQAA 1RTHA 1TGOA 1D9DA 1B92A 1NK7A 5C0MA 2F8TA 4EZ6A 3SV3A 4IKFA 3QKJA 2PY5A 2HHVA 2DFHA 1LAWA 2IGIA 4C8LA 2KW4A 1ZBFA 4Z4CA 2ITGA 4O44A 1W0HA 4IUTA 3KD5E 3DLGA 4B9XA 2QK9A 1KVAA 1LWEA 3PO5A 4FZXC 3LALA 4GY5A 2CKKA 1KVBA 4Z4FA 4RW7A 3AVLA 4FZZA 3VQPA 3L2QA 1LWCA 4W5RA 4CHPA 4CE9A 3QEWA 4UQGA 1JL1A 4IUUA 2DFEA 3VQ8A 2NLUA 1EXQA 3DLKA 3O4NA 2XDPA 1ZBUA 2G8FA 4FM1A 2PYJA 1X1PA 3K5MA 3OYMA 4IDKA 3HYFA 3KK1A 3CYMA 2R5AA 3ZSRA 4OGCA 1FXXA 3NHGA 3SNNA 3NGZA 3SV4A 2A1SA 4E7IA 3CG7A 1EX4A 2OPPA 2RJFA 3NE6A 1WJRA 2YV0X 1J5OA 4CHOA 2OPSA 5HRRA 4CEDA 4KKOA 1WSGA 1N5YA 2F8SA 3NH0A 3AA5X 3HT3A 4CHYA 4EZ9A 1W9HA 1HYZA 1JXEA 1WAFA 2KQ2A 4I2PA 2LCCA 3SPZA 1MU2A 2QKKA 2EQMA 4DU3A 1VSDA 3HJFA 3HM9A 4B9TA 4FJ5A 4CF2A 5I3UA 3QERA 1KLNA 3LP0A 3T1AA 4PUOA 4CHQA 3P8HA 4B3OA 5M9OA 3ME9A 2YKNA 3HL8A 4Y1DA 1S6QA 2E6LA 1IKWA 3PNWC 3K57A 3M9QA 2Z1GA 2O4XA 2HQXA 3MAQA 4I2QA 3LZJA 3NNQA 3FDRA 5J26A 3FEOA 1QQCA 3M8RA 2RJCA 2EQUA 4CHZA 4KB0A 4N76A 3LAKA 3SJJA 1RBRA 2A1RA 4CECA 4OKKA 2LRQA 3AVNA 4FLYA 3QNOA 4F4KA 4TSXA 4CK3A 4KRFA 3OYCA 4DSEA 3OYLA 4O0JA 4CJ3A 3NTHA 4F3OA 4W5QA 4FJJA 3H8ZA 2X6SA 3IRXA 4DU1A 3CQ8A 4HUEA 2DAQA 4KB1A 3GOXA 4KHSA 3DYAA 1OYXA 3AVKA 4CFDA 2G8HA 1VK0A 3OA6A 2BIVA 4J2BA 2IAJA 5HP1A 2LVMA 3FLGA 3AVJA 2GFUA 3AV9A 2QXFA 1WSIA 4DSKA 4CJEA 2P0KA 4DF4A 2LTOA 2ZD1A 3DLHA 3V9SA 4II1A 2XHBA 3PX4A 3WNHA 2E6NA 3MXJA 1DTQA 1XI1A 3MEVA 4IG3A 4BE0A 3KJVA 1MHNA 3O3HA 4DQRA 4FM0A 4H8KA 2P1JA 3LH0A 1VRUA 4K8XA 3L2VA 3QIPA 2RI5A 1TL1A 2DFFA 5E41A 2VYTA 4BE1A 3UWNA 3RRGA 2FBVA 3ZSWA 3U3YA 4ZTFA 4ELTA 3OY9A 3PFSA 1KRPA 4H4OA 4WE1A 4OVAA 3MP6A 2EFIA 2RJDA 3S3MA 4CEZA 3KLHA 3VQ4A 2RI2A 4C5EA 1XHXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3JV3A 4F7UA 1UJ0A 3FISA 2LCLA 2F9TA 3FZKA 4EMGA 3B6AA 1IBMK 4DBFA 1ACIA 1D8YA 2ID3A 4KIBA 3DBLB 3O4QA 4QS9A 5D6WA 4G7HF 2RQRA 4A4FA 2DLLA 2O03A 3VS0A 3C1DA 2JZYA 1YO5C 1Z05A 1SFOJ 2LNHB 4JS4A 1BOTO 1R22A 4M3EA 3JRHA 1YJNQ 2DETA 5ICCA 1NK2P 5ECAA 3KKSA 2OTLI 4GV3A 1MBKA 2QEXA 5LJ5j 3S1QJ 2CGKA 3GTQJ 3GP8A 4KUDK 3UA6A 3B6CA 1I5ZA 4LK0F 1PWTA 2LREA 4E9GA 2A5WA 3O80A 4EP4A 5DM7L 1TWFJ 2XGCA 3H6EA 3RI4A 4O6JA 4FWRA 2IS2A 4CFCA 3R0AA 4FOIA 3RDIA 1HCRA 4XLFA 1MV3A 2R0QC 2NVQJ 5CVUA 1JXBA 2HZDA 3RKYA 2R7OA 1YG2A 2L3SA 4Q0BA 2DNUA 2QWOA 2QQRA 5HOOA 5HY6A 1YJ9N 3KEOA 4KA4A 4N0AC 1TAQA 1MMNA 3TAMA 3TAEA 1C0FA 3PO3J 5LJ5e 1S9EA 2ED1A 3N5BB 2W1OA 2KY9A 4DFJA 2HBPA 4FISA 1KIKA 1RDAA 4H0XB 3VF4A 2ELHA 4BC4A 1J9AA 1P59A 4R5PA 4E7KA 1HNXK 4BEHA 3RR8A 4FJLA 3WQUA 4KI6A 2HSEB 2WOMA 4OGEA 2IG0A 2ABLA 1TWAJ 3QG1A 3MDQA 1NGEA 2ZXIA 2F5EA 1EF4A 2KR3A 1BJAA 1FJLA 1VQ5N 1WH7A 2QGUA 1RT6A 1OKRA 4C5GA 4HTLA 1S1XA 3WTUC 1TKTA 3OYNA 1QLYA 4FYDA 3LDPA 2M0CA 3M5AA 3L8BA 1X6BA 2G0EA 2HS5A 4A5BA 4LSLA 2UXCK 2CUEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3TAG A;  4QVZ A;  1WSH A;  1RT4 A;  3LX7 A;  1U48 A;  3QEP A;  3V1R A;  3SUO A;  4FLX A;  1QTM A;  4KI4 A;  1RTJ A;  4IFV A;  4X34 A;  1VSI A;  2QQS A;  3PMT A;  4AHV A;  3ISN C;  3FC3 A;  2HQE A;  4CFA A;  3DRP A;  3OYK A;  4FK2 A;  4DTO A;  1TAU A;  1BIU A;  4N41 A;  3NBP A;  2VG7 A;  4YFU A;  4OJR A;  3CFP A;  2IC3 A;  5IN1 A;  3NFA A;  3MXM A;  4CJV A;  2GBZ A;  4CCH A;  1NK0 A;  3CFO A;  2LDM A;  2IDO A;  4AHC A;  5C42 A;  4CK2 A;  4G1Q A;  3OYA A;  4B8C A;  4W5O A;  1HJR A;  3OMC A;  2HW3 A;  4M3R A;  4CJR A;  3EZ5 A;  3AVF A;  2YRV A;  2ATQ A;  1J54 A;  1RT5 A;  3IG1 A;  4CGG A;  4NCB A;  1DTT A;  1IKY A;  1FKO A;  1RNH A;  4MFB A;  1CXU A;  3ZT4 A;  2Z1H A;  3KTQ A;  2EQJ A;  3K5O A;  1X9W A;  1GOC A;  1NK5 A;  3SQ0 A;  4OPK A;  3H6Z A;  3MP8 A;  4ICL A;  1QSY A;  2M0O A;  3LZI A;  4NYN A;  3QIO A;  2WON A;  1KLM A;  2MWP A;  2Z1I A;  4DQP A;  1TKX A;  3G0Z A;  3AO5 A;  2BDP A;  4EP5 A;  3ZSO A;  5SWM A;  4H4M A;  2DTU A;  4CJF A;  3IS9 A;  4FJM A;  4IG0 A;  1UA1 A;  4W5T A;  2AJQ A; 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 3HYF A;  3KK1 A;  3CYM A;  2R5A A;  3ZSR A;  4OGC A;  1FXX A;  3NHG A;  3SNN A;  3NGZ A;  3SV4 A;  2A1S A;  4E7I A;  3CG7 A;  1EX4 A;  2OPP A;  2RJF A;  3NE6 A;  1WJR A;  2YV0 X;  1J5O A;  4CHO A;  2OPS A;  5HRR A;  4CED A;  4KKO A;  1WSG A;  1N5Y A;  2F8S A;  3NH0 A;  3AA5 X;  3HT3 A;  4CHY A;  4EZ9 A;  1W9H A;  1HYZ A;  1JXE A;  1WAF A;  2KQ2 A;  4I2P A;  2LCC A;  3SPZ A;  1MU2 A;  2QKK A;  2EQM A;  4DU3 A;  1VSD A;  3HJF A;  3HM9 A;  4B9T A;  4FJ5 A;  4CF2 A;  5I3U A;  3QER A;  1KLN A;  3LP0 A;  3T1A A;  4PUO A;  4CHQ A;  3P8H A;  4B3O A;  5M9O A;  3ME9 A;  2YKN A;  3HL8 A;  4Y1D A;  1S6Q A;  2E6L A;  1IKW A;  3PNW C;  3K57 A;  3M9Q A;  2Z1G A;  2O4X A;  2HQX A;  3MAQ A;  4I2Q A;  3LZJ A;  3NNQ A;  3FDR A;  5J26 A;  3FEO A;  1QQC A;  3M8R A;  2RJC A;  2EQU A;  4CHZ A;  4KB0 A;  4N76 A;  3LAK A;  3SJJ A;  1RBR A;  2A1R A;  4CEC A;  4OKK A;  2LRQ A;  3AVN A;  4FLY A;  3QNO A;  4F4K A;  4TSX A;  4CK3 A;  4KRF A;  3OYC A;  4DSE A;  3OYL A;  4O0J A;  4CJ3 A;  3NTH A;  4F3O A;  4W5Q A;  4FJJ A;  3H8Z A;  2X6S A;  3IRX A;  4DU1 A;  3CQ8 A;  4HUE A;  2DAQ A;  4KB1 A;  3GOX A;  4KHS A;  3DYA A;  1OYX A;  3AVK A;  4CFD A;  2G8H A;  1VK0 A;  3OA6 A;  2BIV A;  4J2B A;  2IAJ A;  5HP1 A;  2LVM A;  3FLG A;  3AVJ A;  2GFU A;  3AV9 A;  2QXF A;  1WSI A;  4DSK A;  4CJE A;  2P0K A;  4DF4 A;  2LTO A;  2ZD1 A;  3DLH A;  3V9S A;  4II1 A;  2XHB A;  3PX4 A;  3WNH A;  2E6N A;  3MXJ A;  1DTQ A;  1XI1 A;  3MEV A;  4IG3 A;  4BE0 A;  3KJV A;  1MHN A;  3O3H A;  4DQR A;  4FM0 A;  4H8K A;  2P1J A;  3LH0 A;  1VRU A;  4K8X A;  3L2V A;  3QIP A;  2RI5 A;  1TL1 A;  2DFF A;  5E41 A;  2VYT A;  4BE1 A;  3UWN A;  3RRG A;  2FBV A;  3ZSW A;  3U3Y A;  4ZTF A;  4ELT A;  3OY9 A;  3PFS A;  1KRP A;  4H4O A;  4WE1 A;  4OVA A;  3MP6 A;  2EFI A;  2RJD A;  3S3M A;  4CEZ A;  3KLH A;  3VQ4 A;  2RI2 A;  4C5E A;  1XHX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1RDA A;  4H0X B;  3VF4 A;  2ELH A;  4BC4 A;  1J9A A;  1P59 A;  4R5P A;  4E7K A;  1HNX K;  4BEH A;  3RR8 A;  4FJL A;  3WQU A;  4KI6 A;  2HSE B;  2WOM A;  4OGE A;  2IG0 A;  2ABL A;  1TWA J;  3QG1 A;  3MDQ A;  1NGE A;  2ZXI A;  2F5E A;  1EF4 A;  2KR3 A;  1BJA A;  1FJL A;  1VQ5 N;  1WH7 A;  2QGU A;  1RT6 A;  1OKR A;  4C5G A;  4HTL A;  1S1X A;  3WTU C;  1TKT A;  3OYN A;  1QLY A;  4FYD A;  3LDP A;  2M0C A;  3M5A A;  3L8B A;  1X6B A;  2G0E A;  2HS5 A;  4A5B A;  4LSL A;  2UXC K;  2CUE A;  2ZCF B;  1WSU A;  2DCE A;  4EJY A;  2P5L C;  1SQK A;  2QWW A;  1HNV A;  4DLE A;  4L9N A;  5K7H A;  5L8R E;  3I0S A;  2EJF A;  4AIJ A;  1LWW A;  4WTO B;  3AGK A;  2EZH A;  4HYE A;  4EW0 A;  2O8K A;  3QP5 A;  1I6X A;  3CCJ N;  1FIA A;  1V5F A;  2DMP A;  1C6V A;  4OB1 B;  1HA8 A;  4BR9 A;  4HRI A;  4C92 E;  3T0Y A;  2BZY A;  3LYI A;  1VQ7 Q;  3UKU A;  2X85 A;  2KJC A;  2LKP A;  1RT3 A;  3OYI A;  4OMN A;  3VQ5 A;  1OUL A;  4BB7 A;  3H3V K;  3QU6 A;  2HEQ A;  4PSW A;  5GIP A;  4PL6 A;  1NLV A;  1OVY A;  3K4C A;  2B4J A; 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 1LMZ A;  2XDP A;  1R00 A;  4DEY A;  2X1E A;  1EH7 A;  4IOA F;  2PYJ A;  3IWF A;  3GFL A;  2BH1 A;  1S8N A;  3MHX A;  1ZGW A;  2W24 A;  3ZSR A;  4OGC A;  5E17 F;  2NLX A;  1ZKG A;  4UY8 O;  2P9L A;  4E9F A;  4FO0 A;  5L3C A;  3DKW A;  1KQ8 A;  1FXX A;  4LLG F;  1YI2 T;  3Q0W A;  2E4H A;  4KT6 A;  3NMZ C;  4JK7 A;  3LSJ A;  1WQ2 A;  2YV0 X;  2H27 A;  3JR9 A;  2H1L A;  2HZY A;  1J3T A;  3CC7 T;  1D5V A;  5GAO q;  2O5R A;  3LSH A;  1X1B A;  5GAG P;  1JGS A;  2IAI A;  2L54 A;  4CHY A;  2E19 A;  1LQ1 A;  3HRU A;  1JXE A;  1WAF A;  1M1G A;  4B8X A;  3A0H C;  4LIT A;  1FBS A;  2EQM A;  5GAN 7;  5FKN A;  4DU3 A;  5AZI A;  4Y15 A;  3HJF A;  3NQO A;  3TED A;  5AQH A;  5I3U A;  4JOM A;  3JCM b;  1KA8 A;  3CME Q;  1WI9 A;  4C3I J;  5B1B H;  3G2B A;  4DZJ A;  4LNP A;  3N5N X;  2DMU A;  3U1D A;  4FT8 A;  1X2N A;  1WI7 A;  4FSV A;  2KDO A;  4MGR A;  2CU7 A;  1IG8 A;  4PZJ A;  3VEP A;  2CWE A;  3FJP A;  1X1C A;  2NRX A;  1MMG A;  3HOZ J;  2JS2 A;  2P7C B;  4H5N A;  3JRC A;  3VPZ A;  3QZ5 B;  3M9Q A;  4KIF A; 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 4EJT A;  1TL1 A;  1N77 A;  4CBX A;  2DEU A;  1VUB A;  1SD7 A;  3BR0 A;  3RRG A;  3ZSW A;  1LEB A;  3U3Y A;  4ZTF A;  2TDX A;  4JDS A;  4OF1 A;  4ELT A;  1BBZ A;  1E6G A;  3J7A P;  1M2V A;  4WE1 A;  5A0D A;  1HNW K;  1RKT A;  2JTE A;  2RJD A;  2LYC A;  1EQY A;  1U1T A;  4C3H J;  2R7W A;  1S72 I;  4IWV A;  4XLE A;  3MZH A;  3VEX A;  3VQ4 A;  3CPE A;  2HTJ A;  2KKZ A;  5AZI B;  1VQK Q; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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 4QOZ B;  1AA7 A;  3WVD B;  1JXB A;  2IS3 A;  3OQ5 A;  2HZD A;  3RKY A;  2R7O A;  2YLC A;  5CY4 A;  3K10 A;  2ZPF B;  4Q0B A;  2QQR A;  5HOO A;  5HY6 A;  2B8A A;  5CKH A;  4N0A C;  1TAQ A;  1MMN A;  2VB6 A;  2JUF A;  3A8L B;  3TAM A;  3OSS C;  2DOA A;  4CF9 A;  4M77 B;  3KK3 A;  1WN7 A;  3TAE A;  5LJ5 e;  1M9S A;  1S9E A;  1U8R A;  2CUZ A;  3N5B B;  3I9V 2;  2W1O A;  2KY9 A;  4DFJ A;  2HBP A;  4O0I A;  3G71 A;  1RDA A;  2E6M A;  3BDP A;  2XY5 A;  4LDX A;  3A8M B;  1J9A A;  3P83 D;  4M3W A;  2DXI A;  4CJT A;  4XL9 A;  4R5P A;  4E7K A;  5I21 A;  1L3U A;  4BEH A;  4AHS A;  3HC7 A;  3WNF A;  3RR8 A;  4FJL A;  3K4K A;  2V26 A;  5J2P A;  4KHW A;  4KI6 A;  2WOM A;  3K4M A;  3J7A Y;  4J6X A;  2GOM A;  2CV2 A;  2W82 A;  5GAN f;  4OGE A;  1ZBX A;  2XO7 A;  3DB3 A;  2IG0 A;  2ZPG B;  4M7A E;  2OV7 A;  1DQU A;  3QG1 A;  4M7D A;  2OYQ A;  3AA3 A;  2ZXI A;  1MMA A;  2P0P A;  2GUI A;  1T7P A;  2WBM A;  4LG3 A;  2OC6 A;  4J00 A;  4M78 C;  4FK0 A;  1RT6 A;  4C5G A;  4J5Y A;  1S1X A;  1TKT A;  3OYN A;  4FYD A; 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