3L5AA

Crystal structure of a probable nadh-dependent flavin oxidoreductase from staphylococcus aureus
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
MYRYKPLLQSIHLPNGIKISNRFVLSPMTVNASTKEGYITKADLAYAARRSNSAGMQVTGAAYIEPYGKLFEYGFNIDHDACIPGLTNMASTMKQHGSLAIIQLAHAGRFSNQAILNFGKVYGPSPMTLHSPIEHVVIAMSHEKINSIIQQYRDATLRAIKAGFDGVEISIAQRLLIQTFFSTFSNRRTDHYGADSLKNRARLCLEVMRAVQEVIDKEAPDNFILGFRATPEETRGSDLGYTIDEFNQLIDWVMDVSNIQYLAIASWGRHIYQNTSRTPGDHFGRPVNQIVYEHLAGRIPLIASGGINSPESALDALQHADMVGMSSPFVTEPDFVHKLAEQRPHDINLEFSMADLEDLAIPHAAFKDIVKMMDYGEGLKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords NADH/flavin oxidoreductase/NADH oxidase
publication title Crystal structure of a probable NADH-dependent flavin oxidoreductase from Staphylococcus aureus
rcsb
source organism Staphylococcus aureus
total genus 125
structure length 381
sequence length 381
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-21
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l5aA00
3STEA 2VENA 1TPWA 1WA3A 4HSOA 3G3DA 4IXHA 5BRBA 3LRMA 1KBIA 4IWWA 1QOPA 2YPIA 1RQHA 2WJZA 1K03A 2Y89A 3NDOA 3M43A 5CPLA 2ZTJA 5G5IA 1K8YA 4EOUA 4DO6A 4Z0JA 2F7FA 3CLMA 3PSVA 3PR2A 4K6AA 3INPA 3LV5A 5IBXA 4NNCA 3GDKA 3I6RA 4LOCA 3LHWA 3W7RA 1TPFA 1PCKA 4FHAA 3HPSA 3ATZA 5F1UA 4EVZA 3IVUA 1AMKA 1WOBA 4OQVA 3HO8A 2A21A 3CT7A 3LX9A 2O7SA 4O8RA 1YTEA 3P5YA 3TR2A 3TJLA 1SZFA 4WY0B 4LS2A 4DO4A 2OJPA 2QCDB 5KSWA 4JS3A 3TMQA 3W83A 3NPVA 4HSNA 1Q6RA 4AB4A 3QSTA 2H8XA 3PWAA 1KM5A 4KFOA 4RXFA 3L5LA 4BI7A 5F2LA 1JCJA 3CWOX 4MJZA 2JKEA 1W8SA 4TIMA 4Z1AA 2B4GA 3BLEA 1VCFA 3KVLA 3P67A 5D30A 4WJEA 4A29A 3BLFA 4IXXA 4RLIA 1OYBA 5AHLA 2D73A 2RHGA 3TCEA 5BNKA 1DORA 2NZLA 4DF0A 1BWLA 1J4EA 4N4PA 3W7IA 4TO8A 5AN7A 3IIOA 1DV7A 4DELA 4ORMA 1P0KA 2XN1A 1WBJA 4RZ4A 3TK7A 2ISVA 2DJXA 4Z1CA 1VRDA 4UIOA 3UPBA 4JYFA 3V75A 3W7KA 4UCGA 3EXTA 3G24A 4JTSA 4Q33A 3FYOA 4TX9A 4TMCA 1ME9A 1G4EA 5LGXA 1R2RA 3HG5A 4OV4A 4MZYA 3RMJA 2FQIA 3WJZA 3GDMA 1H7XA 1JQXA 2GQAA 1SPQA 1HUVA 1Z44A 3S5OA 2QF7A 2VFHA 1TTJA 3G0SA 4MY8A 4O57A 4MKNA 5LSMA 4QSHA 2YW4A 1WV2A 3NQGA 4DF1A 1OYAA 5E93A 2VFEA 4PA8A 2V5LA 1F76A 3LXAA 3GR8A 3TC6A 5FF4A 2TMDA 3UYCA 4O1BA 3G0XA 2ALDA 4UXDA 1YADA 2A6NA 3AJXA 1RZMA 3W76A 1FQ0A 4HPXA 1FX6A 4M6PA 4AF0B 1N8FA 2UV8G 3OA3A 3BW4A 3FS2A 3KRUA 5AYXA 5J5RA 3MMTA 3JRKA 2EHHA 3NL3A 2CW6A 3P60A 3IIXA 3HGJA 2QAPA 4JTGA 1XBVA 2QDGA 2JGQA 1FCUA 3TW6A 3KRSA 4Z0SA 1C8VA 1YTDA 3Q37A 4FX6M 1O5KA 2NV1A 1NEYA 5G2HA 3T44A 2B7OA 1X6UA 2R91A 3E96A 3L9CA 3TIMA 4NX0A 2Z6IA 3N2XA 2RDTA 4JX6A 2BLEA 4XTIA 1VCVA 5DY3A 2G96A 1GZGA 3NQ2A 3NQMA 1F7BA 2XN2A 4QNEA 1TJRA 3UXAA 3CHVA 5FEWA 1TRIA 2R14A 4ADUA 2NX3A 1BTMA 5DCBA 1R2TA 4ZZ9A 2JK2A 5F2IA 4XZ9A 3THAA 1JRCA 3A5FA 2C3ZA 3UZJA 1B4EA 5AC8A 1W3TA 3EX2A 4M7SA 5CZ0A 5AHMA 2V81A 1DHPA 4YMZA 3SJ3A 5HUPA 3GAKA 1PHWA 1EX5A 2YGYA 3S5ZA 2ZZ6A 5GVJA 1SZNA 2RKXA 1H7WA 1W0MA 1O4UA 1OK4A 3UNDA 4N2YA 3BG5A 1WDWA 2JKAA 4ONVA 3SY5A 2QCHA 1JVNA 1VHNA 2C18A 2ZTKA 3HJZA 3M7WA 1H62A 5D32A 3UWVA 4UFMA 3OEXA 3NM1A 4ZQOA 2RDUA 1WAUA 3LCFA 2BX7A 2I9EA 1U83A 4LVGA 4OV9A 1RV8A 3MP5A 1XXXA 1JJKA 2WSRA 4RCXA 1YTKA 2PRHA 3M44A 3GNDA 3LCWA 4MOZA 1K7EA 1VLWA 2DJLA 2GVGA 3LCXA 1G4TA 4DBEA 4BF9A 5FESA 3S1UA 1FWSA 1SQ7A 1PVNA 2ZRWA 1TB3A 2NUXA 3ZWTA 3DI1A 3QMSA 4JX4A 2Z2UA 3G1VA 3PB0A 2FFCA 3C4UA 3LGEA 5AYZA 1LLWA 4UTKA 2QJGA 3VE7A 3EWUA 2CZDA 1JRBA 3W73A 3W85A 3PSWA 4CCCA 1THFD 2Q8ZA 1NAL1 4O11A 2V2HA 1RR2A 3ABQA 4QAIA 1FCQA 4BWLA 1TIMA 4JYEA 1IIHA 4JTTA 1KM3A 1CW2A 2EAWA 3O07A 5DBUA 4MFDA 1KFCA 3O15A 4OWGA 1C9DA 3LERA 3TW7A 1I2NA 4HNTA 2HMCA 3JS3A 1JUBA 1OX5A 4JDBA 2E6DA 5F1VA 3N19B 1Q6OA 3P62A 3SR7A 3W1XA 3P74A 2B0MA 1IXNA 3M6YA 3T4CA 3QMTA 2YZRA 3NO5A 3L5AA 1JCXA 4HNUA 4X3ZA 3T40A 1PV8A 3PULA 4KFNA 3C61A 3W07A 3AO0A 3FOKA 2G97A 5G2WA 1DVJA 3W1TA 1O60A 1T8XA 5LGZA 3LRKA 1OFPA 2ZZ5A 5K7JA 3VNDA 3C2OA 4XQ6A 3W2LA 2A6LA 3STFA 2BXVA 3MP3A 2QJIA 4FX8A 4BWLC 2NXIA 2ZA2A 5EA9A 1T99A 5KMYA 4YL2A 5D2XA 3W7NA 2ZRZA 2WSQA 3OG3A 4DO5A 3O6DA 5CGQA 4LWWA 2W0UA 2DZUA 3PBUA 5I3JA 3MUXA 3N9RA 3QW4B 1HTIA 2Y7EA 4FNPA 2FJKA 2GPTA 5HQEA 3SI9A 1YDOA 2PE4A 1PHQA 3PF3A 3M9YA 2HSAA 4I9AA 3DENA 2FPVA 3VKJA 1QCWA 1TQJA 3GXTA 5D05A 4H6KA 2VFIA 5KZMA 4CNNA 4PH6A 2ZRXA 3FJLA 1S5WA 4ZVJA 3P81A 3QH2A 2A85A 3M5VA 2CZEA 1F6KA 2NWRA 3W1MA 3DAQA 5LNUA 3RLUA 5K9DA 4GXMA 3KFTA 4QISA 2A2IA 1WXJA 1FCBA 5K2ZA 3EXRA 3BARA 3W86A 4C1KA 1CX9A 5J5DA 3TX9A 3PB2A 1BWKA 3A21A 4UMBA 3TJXA 3A24A 1VJIA 5DXYA 4ICNA 2FTPA 1OFAA 4OU1A 2HS8A 4UMCA 3L0NA 3LBMA 1LM1A 5U4NA 2GJLA 1FXPA 5G4EA 4FNTA 1AW5A 4UTTA 4O1AA 4LC8A 3THQA 4K36A 3GDRA 3GX9A 4JYDA 5D2TA 2P1FA 3SIZA 1G7VA 2VXNA 5KZDA 3EKZA 4O50A 1LOSA 5F2GA 2X16A 2YX0A 3N73A 3EWBX 2WNNA 3BO9A 5D38A 4UFLA 1EB3A 2ISSA 3DHDA 1OFQA 1LOQA 2OT1A 2X1TA 4HNNA 5DCDA 4GJ1A 3HMJG 5EPDA 2B7NA 1UUOA 1KM4A 2CLIA 2A5HA 2I1OA 3WJSA 3SECA 1O94A 1W54A 5D04C 5LNVA 1NF0A 1JCMP 1KFKA 4JY9A 5IM51 1VH7A 4JR5A 5K9XA 3NQFA 1VC4A 3M41A 4M7TA 4LS1A 3QEZA 2V82A 3HPXA 5AYYA 1KV8A 2GUUA 2G5WA 3IGSA 2J9ZA 3PUDA 4UTTC 3QC3A 3NQ8A 2ZDRA 4FF7A 4GNJA 4FEZA 3E49A 3QW3A 5D33A 1MXSA 1QDSA 4CCDA 1M7OA 1W31A 4CCEA 2Y61A 1VYSX 2QCFA 4O4WA 3IIVA 2EKCA 2CZ5A 1K8XA 2Z1BA 3NL6A 2GJNA 3HGOA 1O95A 4NJGA 5CG7A 1KM0A 2Y7GA 3P7YA 2A1YA 1KBJA 1DBTA 3TAOA 3YPIA 4JTUA 5AHEA 3OVQA 1F6PA 3PC0A 4ZQCA 1BKSA 1UUMA 4EWND 4O10A 4IMGA 4E2BA 5AHIA 1SO5A 5KTLA 3UWWA 3PG8A 4O15A 2PURA 1H61A 1OJXA 1TREA 3BG9A 3EX6A 3CPRA 3LV6A 1RQBA 3FEMA 2QCGA 3MBFA 3UWYA 2A7NA 1R30A 4QIUA 1LRNA 3DU0A 4MYXA 3W7JA 3TSDA 4NZFA 2QKFA 4R34A 2BWGA 4ZQMA 2AAMA 1TMHA 2ABAA 4P61A 5D02A 2CLMA 3EX3A 4KWWA 1KM1A 5C54A 1P1XA 4P2VA 3L21A 1FWRA 1NVMA 2ZQ0A 1IXPA 3G8RA 4GBUA 3TROA 3HQ1A 4O53A 3LI1A 4O0KA 4K37A 3EB2A 1LCOA 1H60A 4RZ6A 3M5ZA 4LUIA 3HIJA 1YYAA 4IX0A 2J24A 3NQEA 1MEIA 3W2UA 3D0CA 4H3DA 1I45A 1ZALA 4MZ8A 1OX4A 4QM1A 5BOOA 1G7UA 6TIMA 4RK8A 1XBYA 3TAKA 4DF2A 1QMLA 3N2MA 3W75A 3SGUA 4GC4A 3WK3A 1LOLA 1EPXA 2H3BA 3U2OA 3P5ZA 3RF9A 3TFCA 3QPYA 2ZA1A 3SW6A 3GB6A 3QZEA 3GKFA 1LTDA 2H90A 2C16A 1BEUA 3I7RA 5FEPA 2V30A 4LVDA 3BV4A 1W5OA 4FXSA 3HPZA 4OE7A 1B9BA 5BMXA 1H50A 3LM7A 2OCZA 3L66A 3C2FA 3TV8A 1CI1A 1VLIA 3PM6A 2ZFAA 3O16A 1F74A 2PRMA 3H55A 4J9JA 4ZMGA 3IVTA 1YLVA 4MYAA 2ZZ7A 1W5NA 2FPYA 1ML1A 2I14A 3P61A 4K38A 3EX1A 1FDZA 4WZHA 1AL7A 3KAOA 3SGZA 4DXVA 1GYLA 3DFPA 2QDHA 3W7CA 5G1TA 3UWUA 2WQPA 3PY2A 3I7QA 4MY1A 1ZAHA 1A53A 3LHUA 4O16A 2VFGA 1QNVA 3TSMA 1RD5A 1PL9A 3LHVA 4LRSA 2ZYFA 4Y9AA 1TTQA 4CLMA 2A7PA 3DHFA 3LHZA 5D2WA 4YCOA 1EUNA 4HPJA 4WXZA 3W74A 4KWVA 4A22A 4I7WA 1JCYA 1OVDA 3DXIA 3DFSA 2V9DA 5E0KA 2DZPA 3B8DA 3LHTA 5AHFA 2QEZA 4A21A 3CIWA 3MYOA 2YFOA 3C2VA 3LLFA 5I3FA 2R94A 1F73A 2BSLA 2OX1A 3S1XA 4MLRA 1OFBA 5U7SA 5KINA 1VYRA 1TV7A 2V2DA 4XTDA 5DCEA 2X1RA 4WY0A 1YDVA 1IF2A 2CFFA 2QCDA 3NPUA 1QR7A 1DL3A 1UASA 3KRZA 3C8FA 1SR9A 2CLHA 3HOJA 4O13A 1FCVA 4NNAA 2CLEA 3LRLA 3GLCA 3SFKA 5D2VA 1G67A 4NQ1A 4JTFA 5G4WA 3VCRA 3CC1A 2DORA 1SUXA 4OBTA 5K9CA 1QO5A 3CB8A 3E12A 2NLIA 1NSJA 3W1NA 2VEPA 4NJHA 3ABSA 2C13A 1LBMA 3K30A 4AH7A 3G0UA 2RFGA 2EPHA 2CU0A 1H1YA 3TFXA 4PTNA 2ZBTA 1TRDA 4JEQA 3HBLA 3IV3A 3ZR4A 3C2EA 2GOUA 3BGGA 4RJEA 1W5PA 1TSIA 4QQ3A 3L2IA 1R46A 1S3HA 1GG0A 1KTCA 1XDMA 4LUJA 3R89A 1UBSA 4HNVA 1F2JA 5D09A 1XBZA 3F4NA 3U8GA 3GNNA 1GT8A 3L0GA 2NUYA 1QPNA 8TIMA 3IVSA 1I2QA 5TQLA 4CQ8A 2AGKA 3HG2A 3A23A 3TC7A 2WO5A 4AWUA 3MBDA 4E0CA 4AVFA 1LROA 4XUGA 1G4PA 3O05A 2HS6A 4UFKA 2PC4A 4POCA 1DKWA 1SFLA 4JX5A 2DZXA 4O28A 1TQXA 4NU7A 3LCLA 3RFAA 3F03K 1MO0A 3G1SA 1FDYA 2RH9A 3GIYA 1TPEA 5CZSA 2Q8LA 3GAYA 3IIZA 1R2SA 3L5MA 3NA8A 3M47A 1G4SA 1I8JA 4M6QA 3CEUA 4MUZA 3W71A 4IUOA 1SO3A 2E6FA 3MP4A 2WKJA 4Z1BA 4AF0A 1JUKA 2KZHA 3M5XA 4NX5A 4R33A 2NV2A 1LORA 1JQVA 1V7YA 4FIQA 4LV9A 4LV4A 1TPC1 3NL5A 3DGRA 1EEPA 1KTNA 3C3NA 2E1DA 3EWWA 1LRTA 3W2JA 4RKAA 5F4WA 4FIRA 4EF9A 1SFJA 4E38A 3CU2A 4K39A 4QNWA 5DXXA 1QFEA 3MI3A 3S42A 1V5XA 4NJKA 1JULA 3WK0A 4DEFA 3L67A 1TCDA 3B05A 4IMCA 1HO1A 3RK8A 1OFEA 1WYIA 1VYPX 3U6WA 3W3OA 5DELA 1K02A 2Z0IA 1R47A 3W7HA 4WOZA 4AMAA 1JCLA 3NQCA 1U5JA 2CLLA 5L6UA 3W72A 1QOQA 3GK0A 2V2CA 5KITA 3ABRA 1YXYA 5LNSA 2P0OA 2ATMA 3ANYA 3STCA 3W88A 4UMAA 4JTJA 2OMAA 4UFIA 1QAPA 5LNWA 2LLEA 3G1XA 2WOQA 3F4WA 3DZ1A 3VFLA 4FNUA 4JXCA 4PEKA 4D2JA 1GJPA 2E6YA 4C1LA 3LCHA 1W3NA 4N4QA 4Q4KA 2VEMA 4Y6GA 1WX0A 3G22A 4R53A 2O7QA 1VS1A 5C6MA 1A5AA 1LYXA 3QSRA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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