3L5MA

Xenobiotic reductase a - coumarin bound
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
359
structure length
359
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGYLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords Xenobiotic reductase A
publication title Cysteine as a modulator residue in the active site of xenobiotic reductase A: a structural, thermodynamic and kinetic study
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas putida
total genus 121
structure length 359
sequence length 359
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2009-12-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3l5mA00
3EWWA 4MUZA 4BFAA 4UTTA 3SZ8A 4MY1A 2WNQA 1TPDA 4UFMA 5I3KA 2F84A 4UTMA 1FWWA 1F6KA 5A5WA 4ZQCA 4RK8A 1IIGA 3F1QA 3G1YA 4AB4A 1K03A 2CZ5A 3P84A 4LUJA 3LOTA 5C55A 4Z1DA 4XTIA 5BMWA 1O5XA 3BLEA 2RH9A 4ORIA 3PM6A 5D09A 1Z48A 3JRKA 2VOMA 1SO5A 3ATYA 1GWJA 1F7BA 2YCEA 4XQ6A 2VEMA 2J27A 4FIRA 4YCPA 4RR4A 2ZZ5A 4KFPA 5LGXA 2JBMA 4BWLA 4CCDA 2VFFA 2QKFA 2A0NA 4L4LA 3W1LA 3G1VA 3G1XA 3MJYA 2BXVA 2D73A 1I2PA 4N4PA 5G1YA 3AO0A 1LROA 3P81A 3EX3A 4JTTA 2A7RA 3FKKA 1VCGA 3A22A 1A5SA 3NAVA 1KBJA 5AC7A 1IXPA 1WAUA 3GDKA 5D02A 5ABTA 3KFTA 4LC6A 1GTEA 4OBTA 4MVAA 2G95A 2ZFAA 2PURA 4TX9A 3P67A 1LBMA 1C9DA 5AYXA 3SY5A 2Y88A 2QAFA 3LI0A 5KZEA 1OFRA 3R12A 1SSDA 4M7TA 4UTLA 3QSTA 3TKFA 3JR2A 1EP1A 5AHLA 4DELA 1EEPA 1O5KA 4AEOA 3TW7A 3W2UA 5G5IA 1WQ5A 1KM1A 4DO4A 1OYCA 2HS6A 4HSOA 4PL2A 2FFCA 4QNEA 5K9XA 2ZA3A 1JQXA 3PF3A 3W1MA 3SECA 3W1NA 1RD5A 4WY0B 4M7SA 4E2DA 5DLCA 4JTSA 5TQLA 1JUEA 2GQ9A 3TUUA 3T55A 1LRNA 3W84A 2ZZ6A 5AC8A 5FF2A 3VE7A 4JEQA 1XC4A 3FIGA 3DGRA 3QFEA 3O6YX 3QJAA 1SW3A 4WXYA 2R14A 1TPC1 1HG3A 1QOQA 1HTIA 4N2YA 5E0KA 3W7QA 2VFEA 2R8WA 1F05A 1H7PA 4XKYA 3W23A 3WJYA 1LCOA 5FF3A 1T96A 1TSIA 2Y7FA 2KZHA 3B04A 3QYQA 4A21A 3FJLA 5A8GA 5CZ0A 3W1RA 2ZA2A 3P61A 3NPUA 3NQ8A 3M5VA 3QPZA 2DU2A 3IIPA 3W75A 1EPXA 3N9RA 5I3JA 4RKAA 1WXJA 1YYAA 2TYSA 1SW7A 3DI1A 3IVSA 3NPXA 4MOZA 4NVTA 2ZRUA 4N6FA 2QUUA 4ML9A 1ZNNA 4RJEA 5KZDA 1VLWA 3W74A 2A7NA 4N9EA 5EYWA 4FF7A 4UCGA 3UWYA 5FEXA 2NWSA 3DENA 1LBFA 3PB0A 3QH2A 3LTPA 3VI2A 1B3OA 2CLHA 1D3GA 1ME9A 3LBCA 2BTMA 3O8AA 1G4TA 1FWRA 1TCDA 3TK7A 3GXPA 1SO6A 3VCRA 1AL7A 3W85A 2NV1A 5BOOA 4YWIA 2OJPA 2P1FA 4MYAA 4B5NA 1W3IA 3HGJA 3QMRA 1SR9A 4NZFA 4I7WA 4GNJA 4UFIA 1OG0A 2CZFA 1O94A 3OA3A 4Q4KA 3QZEA 3I6RA 1GT8A 3GLCA 3GR8A 3DFOA 4JYFA 3LX9A 3GNNA 3WK0A 1XUZA 5EPDA 4JTEA 2CFFA 2Q8ZA 3H55A 2QUVA 4Y96A 2ZRYA 1L9WA 3S9YA 1SSGA 3THQA 4O50A 1ONRA 1V5XA 1OK6A 1PHQA 3ANYA 3N73A 5AFDA 3S6DA 2WV8A 2WJZA 4QIUA 4ZQOA 3LRMA 4GC4A 1XM3A 2GQAA 4IQLA 5FI8A 1Q45A 1OJXA 3HOJA 2H6RA 4XBSA 3MBFA 5HUOA 2ZTKA 4UIOA 3OVPA 1DV7A 1RZMA 3KAOA 4GXMA 2B7OA 3PULA 2PCQA 5IBXA 1H51A 4MFDA 1YPIA 5L9FA 1L2UA 3SSJA 3KVMA 3GKAA 3INPA 3P82A 1K7XA 1JUKA 4IWWA 1KV5A 2HS8A 3GDRA 3DFTA 1DOSA 1G4EA 1I2OA 2VFGA 3MYPA 1YDOA 4GUFA 3O6DA 5F4SA 3TMLA 2QCHA 3CU2A 2FIQA 1H7XA 3NPWA 5U4NA 3W2LA 3LTYA 5GVJA 3W3OA 3LCWA 1NVMA 5E1QA 3TV8A 2E68A 4C1KA 4AHOA 1KM0A 2VEPA 1OVDA 3A24A 1GG0A 2R94A 1OFAA 3NQ6A 2P0OA 1H63A 5AHNA 2YX0A 4NZJA 3A9IA 1OX5A 2A4AA 1TV5A 4O1AA 3TC6A 4IMDA 3M44A 3NQDA 3R2GA 1GVSA 2Y63A 3W6YA 4HKPA 3WJSA 2V81A 3GYEA 4UTIA 4QQ3A 5C5YA 1FUYA 2ZRXA 3NL2A 3SW6A 1A5CA 2Y85A 1TQXA 2ZYFA 4LTSA 1JRBA 3UPBA 1OYBA 5BNKA 1SO3A 3DXIA 4UTHA 4KKXA 5EMUA 3THAA 3C2OA 3HPSA 4CNPA 1OFEA 2IQTA 2TSYA 3QC3A 3NG3A 5D2VA 4G1KA 3E12A 3AJXA 2Z0IA 5AHIA 3WJXA 4M6VA 1W5PA 1TPWA 4E0CA 3M1ZA 2GVJA 4JTIA 3IGSA 1F6PA 4ONVA 5MHBA 1PCKA 3LRKA 3UWQA 3TIMA 1DQWA 2NUWA 2E5DA 4JS3A 3TXZA 5D32A 3M43A 1GYLA 1AMKA 3B0UX 3NM3A 3DH7A 4Z0JA 3PC0A 4FB7A 3MWAA 2YGYA 3TU9A 3E02A 4FHAA 1K8ZA 1ME7A 2YFOA 3S1VA 1TRIA 3FEMA 2JKEA 4O1BA 5FESA 1B9BA 1GOXA 4JTJA 4X22A 2GJNA 4UFJA 1O95A 1HO1A 3O63A 3NYZA 1Q6OA 2A5HA 4FXRA 2X1RA 3CM4A 1PIIA 2E6FA 4IMGA 4O1DA 1PV8A 1LOLA 1KM5A 2QJGA 4QJ1A 3GDMA 3PUOA 2B7PA 1R47A 2B0MA 2XFWA 3RNDA 3CLMA 1OYAA 4A29A 4QISA 5FF7A 2ISWA 3HGSA 2J9YA 3W83A 3GXTA 5D33A 3O07A 3T4CA 5LNVA 3NQMA 3G0SA 4K39A 4O1CA 1W0MA 3B8DA 2Q3OA 5TBOA 1TIMA 3C2RA 2A21A 2CLLA 1H7WA 2QCGA 3TQKA 3EB2A 3T7VA 4YXGA 2C15A 1LTDA 1BWKA 3P8IA 4LV9A 4AWTA 2FPYA 3MHGA 3L67A 3Q2DA 5DXYA 3G1DA 1TRDA 3QMTA 1G4PA 3DKLA 2VKZG 1M6JA 3P74A 2ZZ4A 5D38A 3NQVA 4O54A 1FCQA 3LRLA 3M5XA 1K3UA 3BO9A 1H60A 5G4WA 3UZJA 5C54A 5LKYA 4Y8FA 1H1YA 2ZZ2A 3DAQA 2G97A 4HPJA 1VCFA 3GK0A 3GIYA 5K9CA 1VS1A 1OF6A 4HNVA 2PRLA 3GZ3A 1ADOA 1SPQA 3P62A 2ZZ3A 3CIWA 1TPVA 4RCXA 4EOUA 4MFEA 2ZA1A 4X2RA 1YLVA 3IVTA 2W0UA 4ZZ9A 3W71A 4R53A 1AW2A 4OGZA 3L0GA 1HUVA 3LHZA 3PAJA 1KFCA 3S5NA 3RF9A 4LRSA 3PWAA 4R33A 1Q6RA 4IGHA 2BX7A 4RZ6A 4LS2A 3LHYA 4P61A 1SUXA 4UR8A 4AF0A 1XI3A 2VENA 1KFBA 3C2FA 3S1WA 4UFLA 3FOKA 4AHPA 3LV6A 3U6WA 1LORA 5LNWA 3W1AA 1DJNA 5CPMA 3RFAA 3BW4A 3W7PA 2G5WA 4O12A 3DHFA 3N19B 1FX6A 1TPEA 5C6MA 2J24A 3N34A 4CQAA 1LYXA 1JCNA 1IGSA 4POCA 4XTDA 4JX6A 5D30A 1X6UA 1ZENA 1XDLA 1EUNA 1ZAIA 2EHHA 1NSJA 3B0VC 2X1UA 3BG9A 3ZWSA 1EP3A 3ELFA 1KM2A 4ADUA 2ZTJA 2CU0A 2C0AA 2H8ZA 4R34A 1KFEA 4NX5A 5F2MA 4QM1A 5CPOA 3W2KA 3G22A 3KRSA 4Y9AA 4UC5A 3QPYA 1XBYA 4NJIA 4HT3A 4CLMA 2X30A 3G3MA 4TR9A 2GOUA 3TJLA 2CWNA 5AYYA 4EIVA 5AHFA 4EF9A 3W1XA 1OX4A 3HF3A 4NUWA 1Z41A 3EX6A 3HG2A 1TYGA 3L68A 1ICSA 4L4MA 1KFJA 3FFSA 2A2IA 2FTPA 1W8SA 3HB9A 1IF2A 4M5PA 3CT7A 5HMSA 3LLFA 1YADA 4PL1A 5AOUA 3O6CA 2W6RA 1K02A 3BW3A 3HQ1A 1DVJA 2X2GA 3PBYA 3QM3A 3MYOA 5CG7A 4HPXA 1YDNA 2C18A 3R8RA 6TIMA 5F1VA 4DXVA 4ZVJA 5LHFA 2I14A 2CLIA 3CHVA 3E96A 1GJPA 3L21A 3TFXA 4FNQA 2B7NA 4M6QA 3QSRA 2DZTA 1BWLA 1LDCA 3HG3A 3M0ZA 1M7OA 2ISSA 1GTHA 2WQPA 2C3ZA 2V2HA 4QAIA 5K4XA 4XBKA 3QEZA 2Y89A 4JGDA 3UWUA 5I3HA 4YLWA 4UMBA 3W1TA 3BK0A 3WJZA 4MYXA 1SFJA 1KM6A 1OFPA 3TC7A 3LV5A 4MY8A 2CLEA 2DORA 3NZ1A 3PG8A 4MLRA 4BI5A 4KWWA 4X3ZA 4NJHA 3NPVA 1RQHA 2C6QA 3KVJA 1K7EA 4JTFA 4TMCA 5I3IA 5DCBA 4CNOA 1ZAJA 2YR1A 3LLDA 4ZQNA 1T8XA 4OQVA 1EIXA 3TQ0A 3G1AA 3Q94A 1VQTA 2PC4A 3GR7A 3BARA 3I7SA 3P8JA 3R5EA 4CCCA 3STFA 1AW5A 3IIZA 4HNNA 1C29A 3B06A 3W9ZA 1UB3A 3N3MA 1KFKA 1G7VA 4IMFA 4S2CA 3MHFA 2V30A 3LBMA 2WO5A 3W88A 5SWUA 3ATZA 1JCLA 3SI9A 1TJRA 2C1HA 3C56A 3NL3A 3LXCA 3C6CA 4FO4A 1MEWA 2Z6IA 2A85A 3DFNA 1I2QA 1YDVA 3HPZA 4O57A 2E6AA 2HMCA 3PR2A 2QDHA 1G67A 4UMCA 5AHMA 4E2BA 1J4EA 4A2SA 4OHQA 3KRZA 2FLIA 1PHWA 1LLZA 4K6AA 3W7MA 4LWWA 5BW6A 2E77A 4LOCA 3OVRA 1RPXA 2CZEA 4O14A 2FB3A 4K7YA 4O19A 1J5TA 2YXGA 1U83A 4UMAA 2H8XA 5J5DA 5LZLA 1B57A 3W76A 3NGJA 1RVGA 3NVTA 3W7NA 4AWSA 3LHVA 3W73A 1XL9A 5F4WA 1W5OA 4ADTA 2J9ZA 1KM3A 4JDYA 3A21A 5IM51 3PBUA 1MZHA 3LTSA 4AXKA 1FQ0A 4JNMA 3G1HA 3FS2A 3EWZA 3EKLA 3C61A 1RQEA 1OX4B 3C52A 4IMCA 1P4CA 3L0KA 5G1TA 3UNDA 2VFIA 2TPSA 3FJ6A 4O17A 3W22A 1S3HA 4U4MA 4FIQA 2AGKA 2QAPA 1WDWA 1NAL1 2V82A 1AG1O 3NM1A 2FPTA 2A1YA 5G2WA 2DJXA 4TO8A 2QCDA 3GB6A 5KINA 1FWSA 1X8FA 4BF9A 1OF8A 5F4XA 3D0CA 2AQWA 1GVOA 3NNTA 1IXOA 5H91A 1RV8A 3NQCA 1TO3A 4DBDA 1H7NA 3M5YA 3G0XA 2JKPA 1EWEA 1LZOA 2BSLA 3LCIA 4TU1A 1SU5A 3CIXA 2UV8G 3TSDA 3A5FA 4O15A 4Y90A 4LRTA 4DPPA 1GEQA 3B03A 4RZ4A 1H1ZA 3QMSA 1R30A 1JUBA 3SFKA 4GUJA 1TTJA 4WX2A 4H3DA 2J88A 2QCLA 3RLVA 4FNPA 4YL2A 3QRHA 3B4UA 3T44A 2FQIA 3HPXA 1BEUA 1ZJIA 2WSYA 3KHJA 3EXRA 1MO0A 1VGAA 4NXSA 1GPWA 1SO4A 4O4VA 3LGEA 1VHNA 3LB0A 1VRDA 1UUOA 4HSNA 3L5AA 3UY8A 4WOZA 4RV8A 3SR7A 3TFCA 4WD0A 1K8YA 2DZWA 3DKJA 4Y6GA 3NQAA 2J6XA 1VR6A 4FXSA 5CSRA 4MJZA 4I7UA 1MEIA 3MP5A 1FDJA 4NT0A 3KX6A 3LCHA 3W72A 2OT0A 3M41A 1N7KA 1H7OA 1CW2A 3PG9A 3GKFA 1TTIA 3M47A 2NV2A 4K7VA 1WA3A 1ME8A 1A5BA 1GVRA 4O11A 4KFNA 4KWVA 4YMZA 2QEZA 2CLKA 4UFHA 1SFLA 2B4GA 2C16A 1PE1A 3W7LA 4NQ1A 1XKYA 3M9YA 2YZRA 3HBLA 1XFBA 4XKYB 4XWUA 3TSMA 2NZLA 3EEGA 4LV4A 2EF9A 1TJPA 2VEIA 3PBVA 3PS7A 3WK2A 3I65A 2QJIA 4O28A 3T78A 4MZYA 5EBUA 3HIJA 3NA8A 5DELA 3GAYA 1S5WA 3Q58A 1XBZA 2WOQA 3MO7A 5DY3A 4PCFA 4JICA 1SZFA 4Z08A 3V75A 1I2NA 1B4EA 1VC4A 1Y0EA 1GVFA 2YYUA 2QF7A 1DORA 1TPUA 3TXVA 4U28A 1MEHA 4H4IA 4N9DA 3PSVA 1VPXA 3OG3A 4N4QA 4O16A 1KFLA 4NJJA 3DI0A 4NNBA 1XCFA 2E09A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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