3L6QA

Crystal structure of the n-terminal domain of hsp70 from cryptosporidium parvum (cgd2_20)
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
381
structure length
381
Chain Sequence
GGPAIGIDLGTTYSCVGVWRNDTVDIVPNDQGNRTTPSYVAFTETERLIGDAAKNQVARNPENTVFDAKRLIGRKFDDQAVQSDMTHWPFKVVRGPKDKPIISVNYLGEKKEFHAEEISAMVLQKMKEISEAYLGRQIKNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGAIAGLNVMRIINEPTAAAIAYGLDKKGTGERNVLIFDLGGGTFDVSLLTIEDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVEFCVQDFKRKNRGMDLTTNARALRRLRTQCERAKRTLSSSTQATIELDSLYEGIDYSVAISRARFEELCADYFRATLAPVEKVLKDAGMDKRSVHDVVLVGGSTRIPKVQALIQEFFNGKEPCKAINPDEAVAYGAAVQAAILN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Chaperone
molecule keywords Heat shock 70 (HSP70) protein
publication title Crystal structure of the N-terminal domain of HSP70 from Cryptosporidium parvum (CGD2_20)
rcsb
source organism Cryptosporidium parvum
total genus 123
structure length 381
sequence length 381
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-12-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 3l6qA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 3l6qA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 3l6qA04
4BROA 2WUSA 3UB5A 2YCHA 5BR9A 3H3OB 2QWPA 3CJ9A 4BR5A 4ISGA 2NLXA 3EL2A 2D0OA 2ZF5O 3A5LC 4KBOA 2QWLA 4B9QA 3QFUA 3A5NC 2HMPA 1IG8A 4JAXA 4K43A 3ZX2A 3EKSA 2CH6A 1YXQA 2QW9A 4BVPA 1SZ2A 4I6MA 1JCGA 2P9SA 3D2FB 2ZWHA 4BR0A 1V4TA 5EXWA 1NGIA 3UKRA 3RSEB 5AFUA 3ULEB 2Q2RA 3W3DA 2IVNA 4CI6A 3QFPA 3R9PA 4EHUA 1RFQA 3BUZB 5AQQA 2HOEA 1GLAG 3A8YA 2Q0RA 5JLFA 3BF1A 3ZX0A 4DQ8A 3U9ZA 3QICA 1ZBSA 3U4LA 4BC3A 2BUPA 2P9IA 4JD2B 4JHDA 4BC4A 2YJEA 3FR0A 5JMVA 4FWSA 2D4WA 4CZLA 2P9UA 5KPZA 5AQYA 5BN9A 2P9KB 4FWQA 3H1QA 2YHXA 4CZEA 3LM2A 3VEVA 3DJCA 4IO8A 3C7NA 1Z05A 1WUAA 4BGBA 1JCFA 4B1ZA 3G25A 4BRHA 2A40A 4LC9B 3HZ6A 3CERA 5JLHA 3R6MA 2A3ZA 3DWLA 4WQ4C 2D0PA 3VEXA 4FWRA 1TUYA 2YI1A 4FWLA 4BRQA 2VYPA 3O5BA 4CZGA 2CGKA 4H0PA 4FWNA 3I8BA 3HTVA 3KHYA 2ASOA 3LDOA 3O08A 2E2QA 4CJ7A 4EHTA 1YUWA 1XUPO 2ASPA 5AFUH 5BN8A 4QS9A 2FSJA 3VF4A 3CI5A 1GLLO 3FZKA 2FF6A 5F0XA 3HI0A 1WOQA 3WXJA 3D2FA 2QWOA 2GTDA 3S41A 4AM6A 3B8AX 3RSEA 3FZHA 1BA1A 4F9OA 5LY3A 3ULEA 5AZJB 3MN6A 4B1VA 1TUUA 3CIPA 3FGUA 1GLDG 4M63C 2VCPA 3UKUB 5BREA 2QWRA 5CE3A 3WQTA 3QBWA 5TKYA 4FPAA 1NGHA 5LJVA 5AQGA 3FZMA 2BTFA 4JD2A 3QMLA 4JNEA 2GUPA 3ATUA 4XEIA 4BRKA 2QM1A 2CH5A 3VPZA 3WQUA 3GE1A 3H6EA 4BR7A 2P9KA 3FZLA 2A6AA 4CZFA 3L0QA 2E2PA 2ZGYA 2ASMA 5FPNA 2UYTA 2A42A 3DAWA 3LL3A 1ATNA 4RTFD 3DXKB 4CBUA 1TYQB 1QQOA 3ZX3A 1RDWX 3SMPA 2Q0UA 1KAZA 3WEEB 3LDNA 1NGGA 4A2BA 4O5FA 2I7NA 5AQWA 3OHRA 4MLEA 5ELZA 3SK3A 1BOTO 3TU5A 1E4FT 2J4RA 2E1YA 3KVGA 2KHOA 1BA0A 3O80A 1BWFO 3CJBA 5B8HA 5AQMA 3O6WA 4ISEA 1HJOA 1D4XA 1T6CA 3QB0A 3BEXA 4FSVA 3WUHA 5ADXA 1BDGA 1S3XA 1BO5O 2H3GX 3GOIA 1BG3A 4H0XB 4FL9A 3UE5A 4A2AA 5JICA 5BPNA 3GDQA 2FSKA 3EKUA 1NBWA 3AAPA 3ZEUB 2AP1A 4WQ5A 1JCEA 1MDUB 3MK6A 2QWQA 4BVOA 2YHWA 5KPTA 5AZJA 4M7YA 3MN7A 2FLOA 4MO4A 3I33A 1H1VA 4QS7A 5KQDA 4FWKA 3UKUA 5I9EB 1U2VB 3M6GA 4PKIA 5AQPA 4CZJA 5FPDA 4FWPA 3VGKA 2W40A 4FOIA 4MO5A 5E84A 3LDQA 4GNIA 1XQSC 1HUXA 2F9WA 1U6ZA 3W0LA 1T44A 3HBTA 4A62A 4MLHA 2NRHA 1HLUA 4BQLA 5AQXA 3EN9A 4BRFA 3MN5A 1ZC6A 1NGJA 1QZ6A 2V7ZA 1GLCG 1X3NA 4WQ5C 5F1XA 4IWVA 1RGIA 4BRAA 1X3MA 3WXKA 3D2EB 4BRNA 5AQTA 1YAGA 1QQMA 3GG4A 3DXKA 3ID8A 1TYQA 2I7PA 1Y64A 3WEEA 2GELA 4BR4A 1GLJO 4DB3A 3ZETB 3QDKA 3GL1A 1MWMA 1LOTB 3WT0A 2V51B 5BPMA 3ENHA 4CZIA 1Q18A 1HKGA 2P9NB 5AQNA 3C0BA 5ADXH 4PKHA 5F2RA 5FPMA 3R8EA 5EVZA 2P9LB 2ITMA 4XH1A 3LM9A 3AY9A 2EWSA 5AQSA 4H0YB 1MWKA 3VOVA 4AM7A 4BRDA 4BREA 3KZBA 5AQHA 4K25A 3CJCA 2P9PB 4FWMA 1NGBA 4A61A 4B1YB 1NGCA 2PAVA 3VGLA 4B1XB 4EAHD 4FWOA 5AQVA 2GWKA 1K8KB 3VEOA 2E1ZA 3AAQA 2FXUA 3HM8A 4H0OA 3ZEUA 2YHYA 2Q1NA 5EOYA 3VF2A 2PBDA 4K42A 4BRCA 3U8XA 5LJWA 5AQUA 3CJAA 4GY2B 3TPQA 3CJ1A 3CQXA 2E2OA 2P9UB 3JXUA 3IMXA 1U2VA 4CD3A 5AR0A 4H5WA 1YVNA 1IJJA 2Q36A 1GLEG 2FSNA 4RWTA 4FO0A 4BQZA 4H03B 2VWBA 4JN4A 2ZGZA 3BP8A 3MDQA 4CD1A 5AQFA 3LDLA 2QWNA 3WXLA 4CBWA 1E4GT 3P4IA 3CHWA 1LCUA 4BR2A 3HSCA 3O4WA 2IVOA 2D1KA 5E26A 5AZIB 1GLFO 1NWKA 2OANA 3VF6A 3IUCA 4BRGA 3SJHA 4XH5A 3D2EA 4H0VB 3D7EO 5AQOA 3JS6A 4DHYA 1BUPA 4B1UB 4BC5A 2YJFA 3ZETA 2E88A 3BF3A 5EY4A 1KAXA 4XH4A 4CBXA 3FFKB 4L3QA 4NB4A 1NM1A 3O8MA 4YDUA 1DGKN 2P9NA 2FF3B 3A5MC 3QBXA 3DXMB 2P9LA 2V52B 1SQKA 5FPEA 4BR9A 1NLVA 1G99A 1X9JA 3SMSA 1ATRA 3U9DA 3IFRA 4NO7A 4CZHA 1QZ5A 4H0TB 4B1WB 3VGMA 2P9PA 3FZFA 3F9MA 3MN9A 4CZMA 4H5RA 2CGLA 4DCHA 5BRDA 3SLCA 2E2NA 1NGAA 4H5VA 2GEMA 2Q97A 5BRFA 5EX5A 1K8KA 5BRHA 1NGDA 1QHAA 4BC2A 4IJAA 3M1FA 1BU6O 3H3NO 4HTLA 4YDUC 1ESVA 4M7XA 5AQLA 2AA4A 2W41A 1HKBA 3MMVA 4Z94A 4WQ4A 1OKJA 3MCPA 3H45C 4EIAA 3CQYA 3GBTA 4HWIA 1SAZA 4WYBA 1C0FA 4PL8A 1NGEA 2QXLA 2A41A 3EZWA 4EFHA 2E8AA 3VENA 3A0IX 4BG9A 4BG8A 4BRPA 5AQKA 1J6ZA 2QWMA 3ENOA 3VERA 5AZIA 2IVPA 1DEJA 1CZAN 4BRLA 4K41A 5BPLA 1NGFA 1DKGD 1MA9B 2DPNA 4PKGA 4I6MB 5KPRA 2CGJA 2GWJA 3VEYA 2F9TA 2P9SB 4BRIA 4PL7A 4FOEA 3WXIA 3FE1A 1HPMA 3UKRB 1GLBG 2A5XA 4E1JA 3O1WA 1QQNA 3VESA 5AQRA 4RCHA 4BGAA 3DXMA 4O8KA 3H46O 3L4IA 1XC3A 4Y0WA 2NZTA 3VEWA 1P8ZA 2Q31A 5AQJA 1S22A 1HX1A 3CJ7A 2P9IB 1KAYA 4FPBA 1V4SA 1ZXOA 4JHDB 1C0GA 4BRMA 4QS8A 3ATVA 3M3ZA 3J8AA 1T6DA 3VETA 3EO3A 3AARA 5AQIA 2V7YA 4IZ9A 3O1BA 3A5OC 4C23A 4H5TA 3H1VX 4CZKA 3IDHA 5KQ8A 1ATSA 4ISFA 2E20A 3L6QA 5AQZA 2HF4A 4J8FA 3C7NB 2HF3A 3CETA 1R59O 1Z6RA 3LDPA 1NMDA 4IJNA 1KXPA 3FLCO 1EQYA 2IIRA 4H5NA 3VEZA 1HKCA 4IXCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WFNL 3TTCA 3ZSZA 3PSIA 5BR9A 3LP0A 1RTDA 2QWPA 1DTTA 1TL1A 4GMJB 3CJ9A 3DLKA 4ISGA 1BMRA 3QEIA 2OPSA 2HNDA 1SNBA 3ZSYA 3AA5X 2QWLA 4B9QA 1FW6A 4JYAK 3ASMA 2HMPA 3DOLA 4K43A 2CH6A 4BVPA 1EP4A 1NK5A 1GOCA 3SUOA 4Z4GA 3CYGA 3J7YP 1MU2A 1RCHA 4DFPA 4H8KA 5KGWA 5EXWA 1ZYVA 1WAJA 3AVJA 3OYEA 3ULEB 2Q2RA 4CI6A 4CJ5A 1B7DA 3F9KA 4NCBA 3QFPA 1GLAG 5HP1A 3ZX0A 4DQ8A 5KGXA 1ZBSA 3AO3A 2BUPA 1KV0A 3TAQA 2O8BB 4DQRA 4YOXA 2IC3A 3BY5A 4Q0BA 3E9OA 4WFBL 2A7TA 5CY4A 4HUEA 3OA9A 3M8RA 3OYFA 4DR2K 3THWB 1C0UA 3LM2A 3VEVA 4FLZA 2O4IA 4N5SA 1TV6A 1NK7A 3CD6N 4OGCA 4AHRA 2QKKA 5I42A 3RWUA 4JKBA 4BEBA 2VY6A 2YBRC 3ITHA 2A40A 1UOCA 3V9ZA 2YC1C 1BK8A 3DWLA 2NNWA 1RILA 3OJSA 4CHOA 4FLYA 3DI6A 4PHTX 3N4PA 2KW4A 3C94A 2OYQA 1HR0K 2KFNA 1JJ2M 4DV3K 4DU3A 3MWTA 3BGRA 2E2QA 4QS9A 1GLLO 1RDUA 2FF6A 4EP4A 4UAFE 4NLCA 1T03A 3GKUA 1VSLA 3VQDA 3FZHA 5LY3A 3ULEA 3L2WA 4FJIA 3KWIA 2OZSA 3HXMA 1GLDG 3O9TA 2QWRA 4IOAL 3QBWA 3M8PA 1TI5A 1TK0A 1VRTA 3JYTA 2BTFA 3QMLA 4JNEA 4YOWA 2O8BA 3ATUA 1NNEA 2CH5A 3VPZA 1GOAA 1KLNA 3E9LA 2HSTA 3L0QA 4FYDA 4CJSA 4RG8A 4YFUA 2ZGYA 2ASMA 3RMDA 4E1MA 1WSGA 3THWA 5D3GA 1ATNA 2YHAA 1TYQB 3SMPA 5C2DA 3UIQA 4MDBA 1NGGA 4O5FA 1EXQA 4B3RK 5ELZA 4I2QA 4CF9A 3L8BA 1KVAA 1RT7A 2VG7A 4PWDA 3TU5A 4I9LA 1ZVEA 3QERA 3ALYA 4V1DC 1RBTA 1I6FA 2KHOA 1W0HA 5B8HA 4YOUA 4FJHA 4LD0A 2LKBA 3O6WA 1T6CA 2WTUA 4CF8A 1NKBA 4FSVA 2H3GX 4O0JA 1BG3A 2IOCA 4CGIA 1HYSA 4CHNA 3OYGA 4BDPA 1VQ9N 2KFZA 1NBWA 1HQUA 1RT2A 4K8ZA 4FK2A 1JCEA 3MK6A 2QKBA 2QWQA 4BVOA 3K57A 1LWCA 1EO1A 1HRHA 4H4MA 4QS7A 1JKZA 5KQDA 2KZMA 4C8OA 1TAQA 3M6GA 3AGKA 2RKIA 5AQPA 4XIUA 4MO5A 1X9MA 3I55N 2F9WA 3SQ2A 3RMCA 1IV0A 2YEOA 4A62A 4FJLA 1VQLN 4CJFA 2YHBA 3LANA 3G71N 1ZC6A 4CJPA 1QZ6A 2OPPA 1X3NA 4WQ5C 4AB0A 5F1XA 1Q8IA 3QINA 3VQ6A 3D2EB 1U4BA 3DMJA 5H1SQ 1TYQA 2KZZA 1L3UA 3CG7A 1D9FA 4A5AA 3QDKA 1MWMA 2V51B 3IRXA 3ENHA 4CZIA 2F96A 1POIA 2LN8A 4B3MK 5F2RA 2HNYA 2ZQBA 3R8EA 3VQPA 5EVZA 3VQ4A 4E89A 1CHZA 5GIPA 1NPIA 2EWSA 5AQSA 4RW8A 3AA4A 4BRDA 3KZBA 4EP5A 5AQHA 4K25A 4B3OA 4DTJA 3KHWA 2P9PB 4DF8A 1NGBA 4U7BA 2NUBA 5M1NA 3VGLA 1JKHA 5AQVA 2GWKA 1K8KB 1J5EK 3AVAA 5SWMA 5HBMA 3CCMN 1IO2A 1JL2A 5CHIA 4KHQA 4M3ZA 4K42A 1DTQA 2AJQA 4BRCA 5LJWA 3CJAA 4CJEA 3NH0A 2E2OA 4DR5K 4OJRA 3HM9A 1VQ8N 4DSJA 5J1EA 1SV5A 4BY9C 2MN5A 4DQSA 1JZBA 3CCSN 2Q36A 4CEBA 3HL8A 1RT4A 2OZMA 4JK9A 4JN4A 4KPYA 3MDQA 5HRNA 1T7EA 3LDLA 4CBWA 2OCEA 4OPHA 4CJ4A 3LZJA 4BR2A 3HSCA 3CFPA 1XHZA 3O4WA 1DLOA 5AZIB 1NWKA 2OANA 3D2EA 3OJUA 4BDYA 4KHUA 3JS6A 4DG1A 1NH5A 4C8MA 1N8RO 1P00A 5FDLA 4B1UB 4JKHA 1KFDA 1HQEA 3FFKB 1RTJA 2XHBA 2ZJPL 1DGKN 3A5MC 4IG3A 3QBXA 3O4QA 3D45A 4MFBA 2KSKA 1K6YA 4IDHA 5J2PA 1VQNN 1RBVA 2V52B 1KRPA 5FPEA 3P39A 1S6PA 1G99A 1UAXA 2B5JA 3SMSA 4W5RA 2XY5A 1U49A 1UA1A 4CZHA 2BGGA 2NRXA 1KSPA 2P9PA 3FZFA 4Z0UA 5BR8K 5CYMA 4CGHA 4GKKK 4CEDA 5FLXO 5BRDA 5C2FA 3DLBA 1MYNA 5DM7L 4DV2K 2GEMA 2Q97A 4CHPA 1K8KA 5BRFA 4B9UA 3NMUA 1J5OA 4JI7K 3M1FA 3P31A 1Q7YO 4O55A 3VTHA 1P90A 4JS5A 4FLUA 4HTLA 5M1PA 4LSNA 5AQLA 1X9WA 3PIOL 1HKBA 4OLBA 3MMVA 3AVIA 1JLQA 4EIAA 4E1NA 5HRRA 3U3GA 3N4QA 3VQ5A 3GBTA 1TAUA 1CXUA 2HMIA 1NGEA 1OZZA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3GBT A;  4HWI A;  1SAZ A;  4WYB A;  1C0F A;  4PL8 A;  1NGE A;  2QXL A;  2A41 A;  3EZW A;  4EFH A;  2E8A A;  3VEN A;  3A0I X;  4BG9 A;  4BG8 A;  4BRP A;  5AQK A;  1J6Z A;  2QWM A;  3ENO A;  3VER A;  5AZI A;  2IVP A;  1DEJ A;  1CZA N;  4BRL A;  4K41 A;  5BPL A;  1NGF A;  1DKG D;  1MA9 B;  2DPN A;  4PKG A;  4I6M B;  5KPR A;  2CGJ A;  2GWJ A;  3VEY A;  2F9T A;  2P9S B;  4BRI A;  4PL7 A;  4FOE A;  3WXI A;  3FE1 A;  1HPM A;  3UKR B;  1GLB G;  2A5X A;  4E1J A;  3O1W A;  1QQN A;  3VES A;  5AQR A;  4RCH A;  4BGA A;  3DXM A;  4O8K A;  3H46 O;  3L4I A;  1XC3 A;  4Y0W A;  2NZT A;  3VEW A;  1P8Z A;  2Q31 A;  5AQJ A;  1S22 A;  1HX1 A;  3CJ7 A;  2P9I B;  1KAY A;  4FPB A;  1V4S A;  1ZXO A;  4JHD B;  1C0G A;  4BRM A;  4QS8 A;  3ATV A;  3M3Z A;  3J8A A;  1T6D A;  3VET A;  3EO3 A;  3AAR A;  5AQI A;  2V7Y A;  4IZ9 A;  3O1B A;  3A5O C;  4C23 A;  4H5T A;  3H1V X;  4CZK A;  3IDH A;  5KQ8 A;  1ATS A;  4ISF A;  2E20 A;  3L6Q A;  5AQZ A;  2HF4 A;  4J8F A;  3C7N B;  2HF3 A;  3CET A;  1R59 O;  1Z6R A;  3LDP A;  1NMD A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4WFN L;  3TTC A;  3ZSZ A;  3PSI A;  5BR9 A;  3LP0 A;  1RTD A;  2QWP A;  1DTT A;  1TL1 A;  4GMJ B;  3CJ9 A;  3DLK A;  4ISG A;  1BMR A;  3QEI A;  2OPS A;  2HND A;  1SNB A;  3ZSY A;  3AA5 X;  2QWL A;  4B9Q A;  1FW6 A;  4JYA K;  3ASM A;  2HMP A;  3DOL A;  4K43 A;  2CH6 A;  4BVP A;  1EP4 A;  1NK5 A;  1GOC A;  3SUO A;  4Z4G A;  3CYG A;  3J7Y P;  1MU2 A;  1RCH A;  4DFP A;  4H8K A;  5KGW A;  5EXW A;  1ZYV A;  1WAJ A;  3AVJ A;  3OYE A;  3ULE B;  2Q2R A;  4CI6 A;  4CJ5 A;  1B7D A;  3F9K A;  4NCB A;  3QFP A;  1GLA G;  5HP1 A;  3ZX0 A;  4DQ8 A;  5KGX A;  1ZBS A;  3AO3 A;  2BUP A;  1KV0 A;  3TAQ A;  2O8B B;  4DQR A;  4YOX A;  2IC3 A;  3BY5 A;  4Q0B A;  3E9O A;  4WFB L;  2A7T A;  5CY4 A;  4HUE A;  3OA9 A;  3M8R A;  3OYF A;  4DR2 K;  3THW B;  1C0U A;  3LM2 A;  3VEV A;  4FLZ A;  2O4I A;  4N5S A;  1TV6 A;  1NK7 A;  3CD6 N;  4OGC A;  4AHR A;  2QKK A;  5I42 A;  3RWU A;  4JKB A;  4BEB A;  2VY6 A;  2YBR C;  3ITH A;  2A40 A;  1UOC A;  3V9Z A;  2YC1 C;  1BK8 A;  3DWL A;  2NNW A;  1RIL A;  3OJS A;  4CHO A;  4FLY A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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