3LCTA

Crystal structure of the anaplastic lymphoma kinase catalytic domain
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
NPNYCFAGKTSSISDLKEVPRKNITLIRGLGHGAFGEVYEGQVSGMPNDPSPLQVAVKTLPEVCSEQDELDFLMEALIISKFNHQNIVRCIGVSLQSLPRFILLELMAGGDLKSFLRETRPRPSQPSSLAMLDLLHVARDIACGCQYLEENHFIHRDIAARNCLLTCPGPGRVAKIGDFGMARDIYRAGYYRKGGCAMLPVKWMPPEAFMEGIFTSKTDTWSFGVLLWEIFSLGYMPYPSKSNQEVLEFVTSGGRMDPPKNCPGPVYRIMTQCWQHQPEDRPNFAIILERIEYCTQDPDVINTALPIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords ALK tyrosine kinase receptor
publication title Crystal structure of the ALK (anaplastic lymphoma kinase) catalytic domain.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 102
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2010-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 3lctA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 3lctA01
3BGZA 4YHTA 2RKUA 2JKKA 3HA8A 3C4CA 3IOPA 4USDA 4ZZNA 5FUTA 3DK6A 5D11A 5FBOA 4MBIA 4RX8A 5CEMA 2Y4IC 5CSXA 3W2PA 3MJ1A 2PZPA 4A06A 5CALA 4PL3A 4FOBA 5HIEA 5DWRA 2C69A 3R9NA 2GSFA 2BZJA 3EN7A 3W8LA 4AZTA 2J7TA 3CY2A 4CFFA 4LQMA 2H6DA 4PL5A 5K0KA 2CLXA 3CY3A 3ERKA 3HNGA 3RK7A 2BIYA 3IQ7A 4BCHA 2XEZA 4FK6A 3ZDUA 3F3WA 4UMPA 1F3MC 5M56A 3I0OA 2E9UA 1UVRA 1YOMA 2WNTA 3QA0A 4JS8A 3I79A 3V51A 2XJ2A 4UBAA 3T3VA 4CG8A 5DVRA 4BI0A 3FL4A 5BNJA 1QPDA 2YZAA 3MESA 3CBLA 4GG7A 3I5ZA 3R28A 4EONA 3PVGA 3EQCA 3TCPA 2HY0A 2UW3A 3K5VA 2WO6A 3BE9A 3GU6A 4QOXA 4EH3A 4GIIA 4K8AA 4YC8A 4GK2A 5E8ZA 3R7EA 3MFUA 4YTHA 2YWVA 2GNJA 4ZJIA 3L1SA 5HNGA 4MXOA 4RJ6A 1WVWA 1M14A 5AP0A 3HX4A 2QOCA 5A6OA 1REJA 4DEAA 3KVXA 4FSNA 4RIYA 5FTOA 2QODA 4LUEA 3BU3A 2W9FB 3DK7A 3G6HA 5EI6A 3U6JA 4ACCA 2P0CA 1BMKA 4KKHA 3KRLA 3P9JA 4YC6A 4WSYA 3TKIA 1PMUA 5IH5A 4TW9A 2HXQA 3EQGA 4H05A 5IQEA 3N4UA 5DI1A 5AA8A 2FYSA 4RRVA 4IWQA 4R3RA 4BL1A 2VTQA 4GJ3A 5HE0A 1BLXA 2BIKB 3R01A 2ITVA 4OTFA 2JKOA 3AC3A 5DHJA 2V22A 2YISA 3I60A 2RG5A 5EOBA 3TUDA 4QTDA 4Q5EA 4BWXA 2WTVA 4IVBA 5IQGA 5L8KA 5B2KA 3LLAA 5E8WA 2YM7A 4KIOA 4A9UA 4RIWA 4IIRA 4FSWA 3SC1A 3TV6A 2PVFA 4IFCA 4QMUA 2WFYA 2J51A 4A4LA 2BTRA 2ZDTA 2PWLA 2QOFA 3Q53A 4OLIA 4LL5A 2CMWA 4EK3A 2WMRA 1YOJA 4FZAB 3VRYA 4YURA 5LOHA 4BTJA 3HGKA 1MQ4A 1ZOGA 3TV7A 4DGMA 2WQOA 4EK5A 5B0XA 2YABA 5CVGA 2F7EE 3V6RA 3ZSHA 1STCE 5IISA 4O7TA 4JQ7A 5DT3A 2BKKA 5I9VA 4BDJA 5IA3A 4O81A 4EH8A 1JNKA 3OMVA 3UIMA 4DN5A 2GNLA 3E7OA 5JFWA 2R4BA 4LV8A 1PJKA 3ALOA 5CEQA 2ONLA 2XYUA 3ALNA 4FTIA 4P4CA 3SXRA 2PL0A 5LMKC 1PY5A 1R1WA 3MY5A 3PIYA 2OLCA 3PA4A 2VO3A 4O82A 4XG6A 1K2PA 4MXYA 4ZK5A 5KZIA 2P2HA 3LM5A 1Q8WA 4HGTA 4EK4A 4EHVA 2ERKA 2ZYBA 3D83A 3MY1A 2PE1A 4RZVA 5DA3A 3LQ3A 3BLRA 5TF9A 1GIJA 3VIDA 4LGHA 3AT3A 4FT9A 3VS0A 3UO6A 2RG6A 3VUGA 4ARKA 1WAKA 4UMTA 3KULA 4EUTA 3SGCA 2B54A 1U59A 5HX8A 2CKQA 2I0VA 4EHEA 3R8MA 5DN3A 4DH5A 2J0KA 5EM6A 5LVPA 4FA2A 4U6RA 1ZYLA 4F64A 3NSZA 3UOJA 2RFDA 3VN9A 4EBVA 2WHBA 3L9PA 3BQRA 5AR4A 3FY0A 1Y8GA 2PZYA 3Q4TA 3HLLA 3QC4A 3LOKA 1H1SA 4OBQA 3O2MA 3LJ0A 3S4QA 2XNBA 5A4QA 1OKVA 4O91A 4YJQA 3PJ1A 4DFYA 3BPRA 5C4KA 4ZSEA 4X2NA 4KIQA 3VBWA 2W9ZB 5J5SA 4KBKA 5FDPA 3P4KA 4HVSA 3GC0A 5AP4A 2C0IA 3NR9A 5A46A 1JVPP 5ACBC 4G2FA 4QP4A 4XP3A 4F1MA 4FT7A 4EHZA 1WZYA 2JC6A 5D9HA 4AGWA 4D58A 4Z3VA 5J7HA 3FMJA 2J0LA 2JITA 3EN6A 3KXHA 2ITWA 3RWQA 4AW1A 5AP6A 3EFJA 4XLIA 3UC4A 3KXXA 3DAKA 4U8ZA 5DR2A 2XNMA 1PXMA 4E4MA 4L52A 5KMNA 1XWSA 5E91A 3ULZA 5CT0A 4KABA 4ZJVA 3TIYA 1SNXA 1VJYA 3NUAA 3DPKA 4PDOA 1AD5A 4UY9A 5JRSA 1ZMUA 3ZM4A 1FVTA 4TWOA 1M2PA 2CNVA 3OW3A 4O7SA 2BDWA 3O51A 1FPUA 5H8GA 1TQMA 4D4VA 3QHWA 1URWA 2J9MA 4ZOGA 1GZNA 2WIHA 4F09A 4E1ZA 2P3GX 2PUPA 5BVOA 4LOPA 4IVDA 4XOYA 5I5ZA 3D5VA 3JPVA 4QMYA 4BIEA 1FQ1B 2YLFA 4DA5A 2HZNA 5JQ5A 3C50A 5AV4A 3R7GA 1OB3A 3FMEA 4QYYA 4K0YA 3AOXA 3IONA 4FBXA 4EHGA 4PPBA 1FBNA 3SX9A 5HLPA 4E8AA 5H8EA 5F9EA 4DINA 3NNVA 3UQCA 1WBOA 4MXXA 5KBRA 5AAFA 3BHUA 4OTPA 4Y46A 4E6CA 5HCZA 3F6XA 4I5PA 5DNRA 4DHFA 3C5IA 2O3PA 4GVJA 4C61A 4FKUA 3VS5A 3VWAA 4JQ8A 3DKGA 1BI7A 2Z8CA 4FTTA 3R8VA 2OZAB 4H3BA 3LE6A 5CU3A 3NZ0A 3ORXA 5A6NA 5LMKA 1H00A 3WZDA 2FVDA 4S30A 1P14A 4ZSGA 3NUNA 3VBXA 4CZTA 1UU7A 4R5YA 4ACMA 5A14A 1O6YA 4QMMA 3U9NA 4CQEA 1RQQA 1Z9XA 4F7NA 3PDTA 3CS9A 4FSTA 4G16A 5CLPA 3HV5A 1W7HA 3FL5A 3AMYA 5GJGA 3RNIA 4CCBA 3CJFA 3E92A 1OKYA 3TNHA 4AW2A 3IECA 4YZMA 3WF7A 4PX6A 3ZM9A 2CSNA 1CTPE 3PLSA 2C5YA 2WB8A 3DZQA 4AWIA 3HAVA 2XBJA 3SRVA 4CG9A 3DKCA 4IWOA 4M68A 1V0OA 1WBPA 2OIBA 3KXNA 2VNYA 5IEXA 1YHVA 3BBWA 3NS9A 4B0GA 1J7UA 2VN9A 4DBXA 4HCUA 4FSYA 4AE6A 3PXQA 3BWJA 4FI1A 4NK9A 4FUXA 4KIKA 2XIKA 2GPHA 4ALUA 4R78A 4JBVA 4NCTC 5IF1A 3UNZA 3FZTA 3LQ8A 2IW6A 3U55A 4EOLA 4DEHA 3O8TA 4RJ4A 4UB7A 3P5KA 1OGUA 2XKEA 2R0IA 3WIKA 3UZPA 2E9PA 4QD6A 5J7BA 3COIA 1SVHA 3A7HA 4HYUA 5KHXA 5AP3A 2OJGA 2RF9A 4FKJA 4BCIA 4FEXA 1IG1A 4O0SA 5CSWA 4M97A 2R3NA 3RAIA 3ZC5A 4C4IA 2V5QA 4AOIA 1PXJA 2VWYA 1ZMVA 3GCPA 3GU5A 4AQCA 3LKMA 4DTKA 4O7WA 3HP5A 3Q52A 2E9OA 1YKRA 1W83A 4OR5A 2YA9A 4DTAA 3DV3A 5LJJA 1XQZA 4PP9A 2ZV9A 5K9IA 3GCVA 3A7FA 3TNPC 2YIXA 5EOLA 4JVGA 3DBQA 2IN6A 3PSDA 4B9DA 3VUKA 3RHKA 3MH2A 4EORA 4YSJA 4FZ6A 3SXFA 1P5EA 3MPTA 4PNKA 4C2WA 5DBXA 4GW8A 4AA0A 5HZNA 3KFAA 2Z7RA 4J1RA 4EH5A 4RA4A 4LYNA 5CSVA 4BDBA 4EBWA 3RWPA 4DG0E 4RQKA 4PMPA 4IAZA 2PMIA 3BZ3A 3LFCA 2OF2A 2WQNA 4TZRA 4QP6A 3HZTA 2XZSA 1MP8A 3E63A 1Q41A 1OKWA 5A3XA 4LRJA 2QKWB 5CAPA 3ORMA 5L4QA 4PY1A 4RWKA 5C01A 3GC8A 2ETMA 3R04A 4ASZA 5KCVA 3IW8A 5FG8A 3BU5A 2QVSE 3OUKA 2HCKA 3KRWA 3PWDA 4FF8A 3N4VA 1JKSA 3KF4A 3B2TA 4FT3A 4IZ5A 5F4NA 3OTUA 4UMUA 3GEQA 3MB7A 1GJOA 3II5A 1KOBA 1MRVA 2Z7QA 5AUWA 1OUKA 4YPDA 5KHWA 4C2VA 4NWMA 5KO1A 5IH6A 3W2QA 3MJ2A 2UW6A 3GC9A 2WAJA 1REKA 3CPBA 4I41A 4O0TA 5FRIA 4CFNA 3O8UA 4KSQA 5BVDA 2PULA 2PVYA 3KB7A 1XBAA 5EM8A 2GCDA 4ZJJA 3W2CA 4BB4A 2IG7A 4RIOA 1G5SA 3ZH8A 4L42A 4RC3A 1LEWA 4R6VA 4UXQA 3UP7A 3AGLA 2QO9A 3QZHA 2YM3A 4S2ZA 3A7GA 2VX0A 3OY1A 3W16A 3WE4A 4EK8A 4Q2AA 3OF0A 1BI8A 4GSBA 2XNGA 4TTHB 4X3FA 4BCKA 4JX7A 3Q6UA 3PY3A 3UOKA 4ZMEA 4C59A 3R7VA 2PVKA 4XBRA 3PXYA 3V5JA 5AV3A 4H1JA 3F5PA 4J71A 1ZAOA 2RFSA 5FXSA 4I21A 4AN9A 4ITIA 5CAVA 2UZTA 4LL0A 2R7IA 3COKA 1O6KA 1RJBA 1YXSA 2XM8A 4NIFB 4TYJA 4NT4A 4AW0A 4FSRA 3DAJA 4PP7A 1FVVA 5EW9A 3E87A 2XJ1A 3MS9A 5HCYA 5HO6A 5FTGA 1ZYCA 3C1XA 1S9JA 2OXDA 4DH3A 3ZCLA 3CTQA 1NA7A 1YDSE 4P2KA 3QTXA 3QTZA 3RPSA 4ZZOA 4LG4A 3FLSA 3FLNC 4EKKA 5LVLA 1K9AA 4RLKA 4EZ7A 3GBZA 3M42A 4KA3A 3SLSA 3DZOA 3ULIA 3UYTA 4ANBA 4IVAA 3LCOA 3R1SA 3VF8A 4QMSA 5JMSA 3D7TA 1OIRA 5KUPA 5LWNA 2XIYA 4FIHA 5JZJA 4DEGA 4XRJA 3I6WA 3MDYA 5CI7A 4JR3A 2AC3A 4IX3A 3VO3A 4F9WA 5L2SA 4HNIA 3A60A 3KGAA 3F5UA 4FEVA 4BGQA 4LMUA 1H24A 4XV2A 3TXOA 2VTNA 4BCGA 2XA4A 3HP2A 4D5KA 2X81A 5HTBA 1X8BA 3D14A 2PVLA 3C7QA 5CEOA 4FTMA 4B8MA 3B8RA 1W0XC 1TQPA 4M13A 4QMOA 1LUFA 1R78A 3BHTA 3CD3A 3DBEA 4OTHA 3ZXTA 4JX3A 2VWZA 4O1PA 4EH4A 4EH6A 4DT8A 5FP5A 3W2RA 3F3VA 3SV0A 2C1AA 2W1FA 2WTDA 4E93A 1DI9A 4CT2A 3GCQA 2VGOA 1A48A 5FEDA 3ZRKA 3PPJA 2CKEA 2SRCA 3GCSA 3WYXA 1Y6AA 4D2WA 4EOKA 3TJDA 3QXPA 3P7CA 1WBNA 1DM2A 4M84A 1Q62A 3O0GA 4XG9A 4E73A 5B2LA 4LOOA 3HUBA 4AOTA 5CF5A 4BCNA 2UZOA 3OP5A 4J52A 5E1SA 1B6CB 4FL1A 3CCNA 3OD6X 5CVHA 4NH1A 4NM3A 2BHEA 5HBHA 3MV5A 1U54A 5HVYA 3HL7A 3C51A 3WZKA 4EEVA 3EKKA 2OF4A 4LGDA 4R7BA 2PUIA 4YLLA 2FA2A 1JSTA 2V0DA 2X2MA 4MXCA 4AZWA 4EH9A 4G3DA 4UMQA 3I4BA 4MBJA 1XBCA 3LIJA 3QTQA 1KE5A 3IGGA 4JLCA 4F63A 3ZSIA 4ALWA 1IRKA 1XJDA 2VTSA 3FMNA 3Q9YA 4IWPA 3KXGA 4Y72A 4CMOA 3V5QA 1JLUE 4FV0A 4CZYB 2W1ZA 4ZTMA 5AUVA 3K3IA 4XBUA 3I0QA 5IA4A 2HZ0A 5DE2A 1OITA 4XG8A 3IS5A 1PMVA 2JDVA 4FOCA 5L2WA 1AGWA 3Q4UA 2P55A 2Z2WA 3VW8A 4GUEA 2V55A 4AZEA 5KBQA 3ZFXA 3R2YA 2ZVAA 1JSVA 3QRKA 3P7AA 2OIDA 3LFAA 4QYHA 3P7BA 3L8XA 4ZTSA 3R7OA 3GU8A 2C0TA 4G1WA 2WELA 3UG2A 3F9NA 2OFUA 5E7RA 5HOAA 4RFMA 4YJUA 3OT3A 1R39A 4O21A 3LAUA 4GU6A 2WD1A 3L9NA 2IVSA 5KKRC 4BY9E 3OXIA 3WOWA 2R3IA 4L7SA 4NYEA 4M0ZA 4EUUA 4BHZA 4K9YA 4DITA 1AQ1A 4YGAA 2VV9A 4E6AA 4RBLA 4RX7A 1MRYA 4YJPA 1OMWA 3GP0A 4DYMA 3OOMA 1M7NA 2BZHB 4WNOA 4EC8A 5GIPE 3QYZA 1UWJA 4IDTA 3W33A 4NL0A 4QMPA 5HVJA 4PWNA 2G1TA 1L3RE 3NIZA 2VD5A 3D2KA 1OL1A 1JKTA 1UNLA 2C68A 4L43A 2FSLX 4S33A 3L9MA 3CKXA 1H08A 5IKWA 4O7LA 2C6KA 3ROYA 1I44A 4HGSA 4F7LA 3GU7A 4FMQA 3LQ5A 1PXIA 4P7EA 1ZXEA 2W1GA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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