The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
31
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sequence length |
82
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structure length |
82
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Chain Sequence |
VPATRILLLVLAVIIYGTAGFHFIEGESWTVSLYWTFVTIATVGYGDYSPHTPLGMYFTCTLIVLGIGTFAVAVERLLEFLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Transport protein
|
| molecule keywords |
Calcium-gated potassium channel mthK
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| publication title |
Novel insights into K(+) selectivity from high-resolution structures of an open K(+) channel pore.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Methanothermobacter thermautotrophicus
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| total genus |
31
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| structure length |
82
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| sequence length |
82
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2010-01-12 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Helix Hairpins | Helix Hairpins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WG7 C; 2WLN A; 4X88 A; 4HZ3 A; 4X89 A; 3SPI A; 3E89 A; 2Q67 A; 4X8A A; 2DYS C; 4R8C A; 3FB7 C; 3ABK C; 5CBH A; 4F4L A; 2K1E A; 3LUT B; 5EBM C; 2X6C A; 3E8B A; 3SYP A; 4H37 A; 4H33 A; 3RW0 A; 3T4Z A; 3ZJZ A; 4MVM A; 2A0L A; 3ABM C; 4MVU A; 5EC2 C; 4PA4 A; 3RBZ A; 5J9P C; 4OXS A; 1J95 A; 1M56 C; 3K06 A; 4LBE C; 4WFH A; 2QKS A; 2IH1 C; 2X6A A; 3K0D A; 4PA7 A; 3T2M A; 2ZD9 A; 2AHZ A; 3FB5 C; 4GX1 A; 4HYO A; 1V54 C; 2IH3 C; 4RAI A; 2HVK C; 2Q69 A; 3X2Q C; 2W0F C; 5B3S C; 1OCC C; 1OCZ C; 3LDC A; 4MW8 A; 4MS2 A; 5IY5 C; 2DWE C; 1S5H C; 3E8H A; 2QTO A; 2Q68 A; 3HPL C; 4JTC B; 3OUS A; 4J9Y B; 3OR6 C; 5B1A C; 4MTG A; 3STL C; 2EIL C; 1G4Y B; 4R50 A; 3F7Y C; 2WLL A; 3SYO A; 4WFF A; 1QLE C; 4RUE A; 4QNH B; 1K4C C; 5KUM A; 2R9R B; 5B1B C; 1R3K C; 4EKW A; 3ASN C; 4RUF A; 4XDK A; 5CBF A; 2JK5 C; 2BOB C; 2HJF C; 3IFX A; 5EBW C; 4P30 A; 3ABL C; 3SJQ C; 3BEH A; 1LNQ A; 2WLK A; 2A79 B; 4QE7 A; 5EK0 A; 2DYR C; 1OCO C; 3E83 A; 4MVO A; 1K4D C; 3FB6 C; 4JTA B; 3JYC A; 3SPH A; 3STZ C; 4LCU C; 3LNM B; 2ATK C; 2HVJ C; 1OCR C; 3K03 A; 2WLI B; 3AG2 C; 4G27 B; 3E86 A; 4WFE A; 3UM7 A; 2OCC C; 3ASO C; 4MW3 A; 3K0G A; 4MVS A; 4P9P A; 4KFM A; 4TWK A; 3ZRS A; 4GX0 A; 2EIN C; 1R3L C; 4PA6 A; 5KUK A; 2EIK C; 4P2Z A; 1KKD A; 3E8F A; 4R6Z A; 2DWD C; 1BL8 A; 1XL6 A; 4WFG A; 3T4D A; 3OUF A; 3TET A; 4PDR A; 1JVM A; 2P7T C; 3E8G A; 2WLJ A; 4RO2 A; 4QE9 A; 4DXW A; 3K08 A; 3KG2 A; 4MTF A; 3RVZ A; 2WLH A; 3OGC C; 3OR7 C; 2ZXW C; 4MVQ A; 3RVY A; 1ZWI C; 4GX2 A; 4PDL A; 3AG4 C; 3FB8 C; 1ORQ C; 2AHY A; 3T1C A; 4XDL A; 4PA3 A; 4XDJ A; 5EC1 C; 3K04 A; 4ZBM A; 2ITC C; 3SYQ A; 2X6B A; 2H8P C; 4PA9 A; 3VOU A; 4BW5 A; 4MVZ A; 5EBL C; 3EFF K; 2EIM C; 3PJS K; 1R3J C; 4MTO A; 2HG5 C; 4UUJ C; 3LDE A; 4PDM A; 3R65 A; 4MSW C; 5E1A C; 1R3I C; 2WLI A; 4R7C A; 3TCU A; 2EIJ C; 1V55 C; 3AG3 C; 4GX5 A; 4I9W A; 1M57 C; 3AG1 C; 3SYA A; 5BZB A; 3LDD A; 3SPC A; 2BOC C; 3F5W C; 4CBC A; 2A9H A; 4JTD B; 1XL4 A; 4MVR A; 4P9O A; 2KB1 A; 4J9Z B; 2NLJ C; 3IGA C; 4PDV A; 2WLL B; 2Q6A A; 2WLM A; 4G28 B; 4LP8 A; 2ITD C; 3UKM A; 1P7B A; 2HFE C; 3SPG A; 3SYC A; 5CBG A; 2Y69 C; 3SPJ A; 2YEV A; 3F7V C; 3GB7 C; #chains in the Genus database with same CATH topology 1CP9 A; 1BGY H; 5CBH A; 4MTX A; 3T4Z A; 1COW G; 1XMO B; 3DXR B; 3QF7 A; 5BMV B; 3S3X A; 4FLV A; 4FLZ A; 3APO A; 1L0N H; 4O2B A; 2OTJ V; 5CA3 A; 1XMQ O; 3OE7 G; 2EIK B; 3JAW B; 5DM6 V; 3CCE V; 5IY5 C; 2RN9 A; 4I4T A; 3ETE A; 1V9P A; 4CC6 A; 3LSQ A; 5A9G A; 3H1K H; 1GN2 A; 3R66 A; 1K5Q A; 5CB4 A; 3OMI B; 5KHJ A; 5LMU O; 2DYR C; 4X65 B; 2GUZ A; 2M7W A; 5FPO A; 3ZIA G; 3ZCC A; 1SQB H; 1PM9 A; 1DTO A; 3B2E E; 2RDC A; 3K5L A; 3HKD B; 2EIN C; 4GX0 A; 1R73 A; 1E1Q G; 1S0V A; 1BL8 A; 1R6N A; 3T4D A; 4JI5 O; 3JCZ A; 3U10 A; 1OCZ B; 3FYI B; 1QNM A; 1JFF A; 1XNR B; 3ZRW A; 5LP6 B; 1XQ8 A; 2CUG A; 2R70 A; 4UB6 Z; 1QLE B; 4BIO A; 3CRM A; 1Q82 W; 1XNQ B; 2F23 A; 1F4N A; 1DF5 A; 1JOY A; 5HFM A; 4JI4 B; 2XTA A; 4YJ2 B; 5L3G A; 2DQ0 A; 4PDM A; 1W2B U; 1N33 B; 1BS3 A; 1H2S B; 2CTQ A; 4RQF A; 2XAH A; 2BOC C; 3F5W C; 4JTD B; 1S72 V; 2CH7 B; 2Q9L A; 3J7A U; 2ZQM A; 3CME V; 3PN1 A; 4PDV A; 4TSF G; 2VQF O; 2DOS A; 1SS3 A; 3RT3 C; 5IYZ A; 3HKB B; 1J5E O; 1TUB A; 4KXR A; 3B4S A; 1SER A; 5CMU A; 1AP6 A; 2DYR B; 2MW2 B; 3E8B A; 2QR4 A; 1XI1 A; 2PTM A; 1KUQ A; 2YSU B; 3QNE A; 1G6U A; 5H9C A; 1JX9 A; 2AXT Z; 2YIB A; 5H6R A; 2UUA B; 2HKO A; 4K0K B; 3G4S V; 1HNX B; 1BSM A; 3RWR D; 4B3T O; 3RYI A; 3F5T A; 2UXC O; 4JI0 B; 2IJK A; 1S5H C; 3BRC A; 1ZSP A; 5B1A C; 2QEX V; 1H2G A; 3KCY A; 1G4Y B; 1PV0 A; 5KHI A; 3ZHT A; 3B09 A; 4J11 A; 2HJD A; 1WLE A; 3A0H Z; 4X1I B; 3CX5 F; 4B7K A; 3MHH C; 4GYC B; 1I7F A; 3OEH G; 5EIB D; 1S3J A; 2AZ2 A; 3E86 A; 1AJQ A; 1KBH A; 4GCZ A; 5FPR A; 4LF8 O; 1MA1 A; 1AI4 A; 2EX3 A; 3O9O A; 2A3Q A; 3K5M A; 2OTL V; 2F93 B; 4XDJ A; 1XBL A; 2ITC C; 1DGS A; 3VOU A; 3T1H O; 3EFF K; 4AHC A; 3APQ A; 3ETG A; 2HG5 C; 4UUJ C; 4BIZ A; 3G71 V; 4JYA O; 1SQP H; 2EIJ C; 1V55 C; 5BZB A; 2GTA A; 3AG2 B; 1RPR A; 2JEX A; 3OD4 A; 4WFA V; 2QWR B; 5CA0 B; 1H8H G; 4DV5 O; 1CXZ B; 1K8A W; 2XUM A; 4KHP O; 1KP2 A; 3JD3 A; 1SET A; 2WA3 A; 2ZR2 A; 3ZHR A; 5LGU A; 4LFC O; 4JYY A; 3RYF B; 4XBF A; 2NR5 A; 5LA6 A; 2ZXW B; 3SYP A; 2A0L A; 4MVU A; 4DR2 B; 1AR5 A; 1M56 C; 4FLX A; 2PI5 A; 1SC5 B; 2IM9 A; 3Q4H A; 3C90 A; 2PGG A; 4NR1 A; 3BY6 A; 4ICG A; 3EHB B; 1L1F A; 3ZED A; 4IHJ A; 5CN0 A; 3CCL V; 1L8D A; 1ZTE A; 3AG3 B; 4JTC B; 4OX9 B; 1AI7 A; 2PYJ A; 3EXA A; 4EFE A; 1OZ0 A; 4F6E A; 1IBL B; 5KA5 A; 5KUM A; 3ZHS A; 1MSD A; 1FFX B; 4OPH A; 4YHH O; 4DR1 B; 4KUM A; 1ZL8 B; 2WLK A; 1N32 O; 4UB8 Z; 1Y66 A; 3D3Q A; 1AB3 A; 1Q6I A; 2LW7 A; 2E75 B; 3GWK C; 2OCC C; 1HR0 B; 1N0J A; 4GKJ B; 3P30 A; 2XHB A; 2K9P A; 5GON B; 2UUB O; 3FAV A; 4DUY B; 1MOF A; 4X1Y B; 1EZJ A; 4LFB B; 4ZKI A; 2P7T C; 3E8G A; 2BSK A; 4QE9 A; 1B6Q A; 2WLH A; 2G38 A; 3FD9 A; 1ZWI C; 2P22 C; 4PDL A; 4U3F H; 4LWS B; 1N4C A; 1HNW O; 2KKW A; 2H8P C; 2KG7 B; 1VQ5 V; 5KMG A; 3ICX A; 1E79 G; 5J2U A; 4AQY O; 4UV9 A; 5J2T B; 3CXH F; 1CEZ A; 1MAB G; 2FYU H; 4I9W A; 4I5S A; 4UXN A; 4B3R O; 1VF7 A; 4FZ1 A; 4D7T A; 1YCI A; 1QVF U; 3N2K A; 3CSX A; 4ZOL B; 1YZB A; 1GRJ A; 5TIS Z; 3ABT A; 4JV5 O; 5BR8 B; 3UKM A; 2P5O A; 1VEW A; 2N05 A; 3WB2 A; 3GB7 C; 3ZHQ A; 2ADP A; 3IJ4 A; 4FVM A; 4DV4 B; 1WB8 A; 4GLX A; 2DYS C; 2JGD B; 3L9D A; 1KC8 W; 1NS1 A; 4O4J B; 4F6R B; 3I55 V; 3KKY A; 3L74 H; 2HVK C; 1N0N A; 1U97 A; 1WP8 A; 1Q5O A; 2QM4 A; 3CCS V; 3ZBH A; 4Q20 A; 4RUE A; 5JJJ B; 2CGN A; 4J9Y B; 1XEQ A; 2EIL C; 4TV9 B; 3BVO A; 5JH7 A; 2JJ1 G; 5C93 A; 3TXQ A; 3TXS A; 1W0K G; 5IYD O; 1VQP V; 2YIB D; 3AK1 A; 5EBW C; 2Y69 B; 4QE7 A; 3WFV A; 4JI8 O; 1AIL A; 1IBM O; 3TJT A; 4DYL A; 3CRA A; 3ABM B; 4GKK B; 1VQM V; 5L3F A; 1GKF A; 3HKE B; 2XAF A; 1LUW A; 5KUK A; 1XMQ B; 5BY1 A; 4P2Z A; 4R6Z A; 3N27 A; 2HHH O; 2FB5 A; 4AIL C; 1BQ0 A; 3THO A; 2WLJ A; 4Z2W A; 4DV2 B; 1SF9 A; 1IX9 A; 2ZT9 B; 1I94 O; 4E4E A; 4YY3 O; 3T1C A; 1MZE A; 2GBO A; 3B77 A; 1EBO A; 3PJS K; 3CCJ V; 4WF9 V; 3DC6 A; 2W6I G; 1PL0 A; 4Q6G A; 1Y74 B; 2HR3 A; 3U0Z A; 4PV1 B; 2UXD O; 3H1H H; 5FNV A; 2XAQ A; 1RM1 C; 3JAM N; 5KX5 B; 1QBZ A; 2Q7G A; 1KD1 W; 2X7R B; 3ZHU A; 3WG7 C; 1PNM A; 5LL6 Y; 2Q67 A; 4UCS A; 2Y0I A; 3FB7 C; 4LF9 O; 1Z5V A; 1ZAU A; 2E5L O; 1YTF B; 1VQ4 V; 4LFA B; 2QWN B; 2ILM A; 1NTZ H; 3K0D A; 4C7U A; 2UU9 O; 1AVM A; 4JAV A; 1WB7 A; 2W0F C; 1IBK B; 1TAE A; 4ZI7 B; 4DR5 B; 2QTO A; 1JMK C; 4YIO A; 4MTG A; 4JAA A; 1GM7 A; 2E3C A; 3A0R A; 4H44 B; 4X66 B; 1Y76 A; 1J5E B; 1P7G A; 1SA0 B; 1IXB A; 3L71 H; 3E2E A; 1RP3 B; 1K92 A; 4HNA B; 4I7Z B; 1P49 A; 1FD9 A; 4A5U B; 4RWU A; 4BR6 A; 1OCR C; 1D5A A; 1B04 A; 2YXY A; 3B8M A; 1NVP D; 2BTO A; 2GHY A; 2YI9 A; 4KFM A; 3ZS8 C; 4X20 A; 2UXC B; 2LP7 A; 3QO7 A; 4IYI A; 3JAS A; 4TQD A; 3AK3 A; 4BWA A; 2C2A A; 3HKC B; 4CZZ A; 3QO5 A; 2IJH A; 3QO8 A; 4FMT A; 4FLT A; 5IWA O; 2EJR A; 2CTR A; 1XOU A; 1HDJ A; 2IBZ H; 4YJ3 A; 2WLI A; 3JAR B; 3CCR V; 4JI7 B; 5IJ0 B; 1NBM G; 4I4T B; 3ETQ A; 1X4T A; 1K5S A; 4LP8 A; 2MK3 A; 1MSW D; 2ZE8 A; 3SPJ A; 5CB4 B; 2YXH A; 4DR6 B; 4O2A A; 2DE0 X; 1FPO A; 3ABK C; 1NKD A; 1LUV A; 3A8T A; 3ZJZ A; 1O9G A; 4EEQ A; 4X1K A; 3D36 C; 1K9M W; 1VAR A; 4LF5 B; 2IH1 C; 4JYA B; 4BIU A; 2AHZ A; 4WBN A; 2IH3 C; 4RAI A; 2OIE A; 1EN6 A; 5KHH A; 1SES A; 1OCZ C; 3M99 B; 3OW2 U; 3ZHV A; 4MW8 A; 4FLW A; 2E74 B; 4UCV A; 4CS2 A; 4TUY B; 5LP6 C; 3ETD A; 1JFF B; 4KHP B; 1QLE C; 3ZRW B; 3UT5 A; 4KP4 A; 2LFR A; 3LSU A; 1Q81 W; 1Q8I A; 4K3A A; 2A79 B; 4JI6 O; 2EUL A; 1RPO A; 1TVK A; 5LHI A; 4O4H B; 1VMG A; 3K9A A; 4NVP A; 1N36 O; 2VRZ A; 4NXN B; 4O4I A; 4I9Q A; 2ZM6 O; 4DV6 O; 2QKA A; 1WP7 A; 5LMN O; 2FKX A; 4B3S O; 5IYZ B; 4DXW A; 1TUB B; 3K08 A; 3RVZ A; 1EN5 A; 4J42 A; 2JRI A; 4YXW G; 1YJN V; 4DUZ O; 2DMX A; 3FB8 C; 2Q0O C; 5LXT A; 4PA3 A; 1N32 B; 3ABK B; 1H2L A; 5JQG B; 2X6B A; 5H5N A; 4ZHQ A; 3A0B Z; 4MTO A; 4MSW C; 5IDJ A; 3RYI B; 3C3S A; 3SYA A; 4AI8 A; 1M5I A; 2UUB B; 3EVK A; 2KB1 A; 5L3C A; 4EB6 A; 1VQK V; 2Y0P A; 2Q6A A; 4DR3 O; 4JI2 B; 1KB9 F; 1U96 A; 3L75 H; 3RYH A; 4B3M O; 1US6 A; 1P7B A; 1YDX A; 1BT8 A; 3F7V C; 2EBO A; 4X88 A; 3ZMZ A; 1FYJ A; 2L35 A; 1H8E G; 3KZI Z; 4J10 A; 4N21 A; 4I50 A; 3B40 A; 2RJZ A; 5KAI Z; 1I5X A; 4GX1 A; 4LF4 B; 1O9H A; 1RSO B; 2B1I A; 1NR1 A; 3JAK A; 1TA8 A; 4CS3 A; 1SQF A; 4FLU A; 4L8J A; 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3STZ C; 3ZN1 A; 2E76 B; 3LNM B; 2ATK C; 1L0L H; 3SDL A; 5B66 Z; 1EM1 A; 3IAY A; 1UFI A; 2ZE5 A; 1S5J A; 1XMO O; 1ENV A; 1FXK B; 3OT7 A; 4DR7 B; 4NTY A; 4WFB V; 1FS0 G; 4YIP A; 3W7S A; 2UXB O; 2PUS A; 1NJI W; 2P67 A; 2IU0 A; 3OM3 B; 2JJ2 G; 1Q86 W; 3AK2 A; 4LR3 A; 1GN6 A; 1SQG A; 1GM9 A; 3H9V A; 2OCH A; 5B1B B; 3T1Y O; 5LGN A; 4X65 O; 2EJ7 A; 3CE2 A; 4U3J A; 3MDS A; 4B08 A; 1M90 W; 1Z5W A; 4PI2 A; 3LDD A; 5JH7 B; 2Z3Y A; 2EZP A; 1WAZ A; 3SJA C; 2ITD C; 2Y69 C; 3FB5 C; 1H38 A; 5CA0 A; 4MS2 A; 4KL1 A; 2ZKO A; 5EZY B; 3BA9 A; 3E89 A; 5IYC O; 2CGO A; 4X8A A; 4R8C A; 5IWA B; 5K1P A; 5JVD A; 5LYJ A; 3ZMU A; 4H33 A; 3ABM C; 2P4V A; 4OXS A; 3RYF A; 4WFH A; 1K34 A; 1XNQ O; 1SQX H; 3BCC H; 4GUN A; 3OTF A; 2B9Z A; 4LH7 A; 4FFB B; 5H6Q A; 5LOV B; 1N33 O; 2JS5 A; 1BMF G; 4DV3 O; 3JAT A; 2A7W A; 1FKA O; 4I0X B; 4R50 A; 2WLL A; 3JAL B; 3BA8 A; 1VQN V; 4DRX A; 1AI6 A; 2WSS G; 4UVB A; 1FJG O; 3UO2 A; 4LF7 O; 2HJF C; 4W4K A; 1RFY A; 2HEP A; 4TV8 A; 4QIW F; 1OV9 A; 1N8R W; 2GSM B; 1FFX A; 5F2V O; 3FYE B; 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